FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3378, 1130 aa
1>>>pF1KE3378 1130 - 1130 aa - 1130 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.4418+/-0.0013; mu= -34.0355+/- 0.078
mean_var=731.7507+/-159.218, 0's: 0 Z-trim(114.3): 192 B-trim: 910 in 1/52
Lambda= 0.047412
statistics sampled from 14698 (14874) to 14698 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.743), E-opt: 0.2 (0.457), width: 16
Scan time: 5.600
The best scores are: opt bits E(32554)
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>>CCDS34551.1 LATS1 gene_id:9113|Hs108|chr6 (1130 aa)
initn: 7771 init1: 7771 opt: 7771 Z-score: 2896.1 bits: 547.7 E(32554): 5.4e-155
Smith-Waterman score: 7771; 100.0% identity (100.0% similar) in 1130 aa overlap (1-1130:1-1130)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MKRSEKPEGYRQMRPKTFPASNYTVSSRQMLQEIRESLRNLSKPSDAAKAEHNMSKMSTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MKRSEKPEGYRQMRPKTFPASNYTVSSRQMLQEIRESLRNLSKPSDAAKAEHNMSKMSTE
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DPRQVRNPPKFGTHHKALQEIRNSLLPFANETNSSRSTSEVNPQMLQDLQAAGFDEDMVI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QALQKTNNRSIEAAIEFISKMSYQDPRREQMAAAAARPINASMKPGNVQQSVNRKQSWKG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SKESLVPQRHGPPLGESVAYHSESPNSQTDVGRPLSGSGISAFVQAHPSNGQRVNPPPPP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QVRSVTPPPPPRGQTPPPRGTTPPPPSWEPNSQTKRYSGNMEYVISRISPVPPGAWQEGY
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PPPPLNTSPMNPPNQGQRGISSVPVGRQPIIMQSSSKFNFPSGRPGMQNGTGQTDFMIHQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NVVPAGTVNRQPPPPYPLTAANGQSPSALQTGGSAAPSSYTNGSIPQSMMVPNRNSHNME
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LYNISVPGLQTNWPQSSSAPAQSSPSSGHEIPTWQPNIPVRSNSFNNPLGNRASHSANSQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PSATTVTAITPAPIQQPVKSMRVLKPELQTALAPTHPSWIPQPIQTVQPSPFPEGTASNV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TVMPPVAEAPNYQGPPPPYPKHLLHQNPSVPPYESISKPSKEDQPSLPKEDESEKSYENV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 DSGDKEKKQITTSPITVRKNKKDEERRESRIQSYSPQAFKFFMEQHVENVLKSHQQRLHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DSGDKEKKQITTSPITVRKNKKDEERRESRIQSYSPQAFKFFMEQHVENVLKSHQQRLHR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 KKQLENEMMRVGLSQDAQDQMRKMLCQKESNYIRLKRAKMDKSMFVKIKTLGIGAFGEVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KKQLENEMMRVGLSQDAQDQMRKMLCQKESNYIRLKRAKMDKSMFVKIKTLGIGAFGEVC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LARKVDTKALYATKTLRKKDVLLRNQVAHVKAERDILAEADNEWVVRLYYSFQDKDNLYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LARKVDTKALYATKTLRKKDVLLRNQVAHVKAERDILAEADNEWVVRLYYSFQDKDNLYF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 VMDYIPGGDMMSLLIRMGIFPESLARFYIAELTCAVESVHKMGFIHRDIKPDNILIDRDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VMDYIPGGDMMSLLIRMGIFPESLARFYIAELTCAVESVHKMGFIHRDIKPDNILIDRDG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 HIKLTDFGLCTGFRWTHDSKYYQSGDHPRQDSMDFSNEWGDPSSCRCGDRLKPLERRAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HIKLTDFGLCTGFRWTHDSKYYQSGDHPRQDSMDFSNEWGDPSSCRCGDRLKPLERRAAR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 QHQRCLAHSLVGTPNYIAPEVLLRTGYTQLCDWWSVGVILFEMLVGQPPFLAQTPLETQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QHQRCLAHSLVGTPNYIAPEVLLRTGYTQLCDWWSVGVILFEMLVGQPPFLAQTPLETQM
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 KVINWQTSLHIPPQAKLSPEASDLIIKLCRGPEDRLGKNGADEIKAHPFFKTIDFSSDLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KVINWQTSLHIPPQAKLSPEASDLIIKLCRGPEDRLGKNGADEIKAHPFFKTIDFSSDLR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 QQSASYIPKITHPTDTSNFDPVDPDKLWSDDNEEENVNDTLNGWYKNGKHPEHAFYEFTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QQSASYIPKITHPTDTSNFDPVDPDKLWSDDNEEENVNDTLNGWYKNGKHPEHAFYEFTF
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE3 RRFFDDNGYPYNYPKPIEYEYINSQGSEQQSDEDDQNTGSEIKNRDLVYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RRFFDDNGYPYNYPKPIEYEYINSQGSEQQSDEDDQNTGSEIKNRDLVYV
1090 1100 1110 1120 1130
>>CCDS59040.1 LATS1 gene_id:9113|Hs108|chr6 (690 aa)
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Smith-Waterman score: 4596; 100.0% identity (100.0% similar) in 671 aa overlap (1-671:1-671)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MKRSEKPEGYRQMRPKTFPASNYTVSSRQMLQEIRESLRNLSKPSDAAKAEHNMSKMSTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MKRSEKPEGYRQMRPKTFPASNYTVSSRQMLQEIRESLRNLSKPSDAAKAEHNMSKMSTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DPRQVRNPPKFGTHHKALQEIRNSLLPFANETNSSRSTSEVNPQMLQDLQAAGFDEDMVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DPRQVRNPPKFGTHHKALQEIRNSLLPFANETNSSRSTSEVNPQMLQDLQAAGFDEDMVI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 QALQKTNNRSIEAAIEFISKMSYQDPRREQMAAAAARPINASMKPGNVQQSVNRKQSWKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QALQKTNNRSIEAAIEFISKMSYQDPRREQMAAAAARPINASMKPGNVQQSVNRKQSWKG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 SKESLVPQRHGPPLGESVAYHSESPNSQTDVGRPLSGSGISAFVQAHPSNGQRVNPPPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SKESLVPQRHGPPLGESVAYHSESPNSQTDVGRPLSGSGISAFVQAHPSNGQRVNPPPPP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QVRSVTPPPPPRGQTPPPRGTTPPPPSWEPNSQTKRYSGNMEYVISRISPVPPGAWQEGY
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310 320 330 340 350 360
pF1KE3 PPPPLNTSPMNPPNQGQRGISSVPVGRQPIIMQSSSKFNFPSGRPGMQNGTGQTDFMIHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PPPPLNTSPMNPPNQGQRGISSVPVGRQPIIMQSSSKFNFPSGRPGMQNGTGQTDFMIHQ
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370 380 390 400 410 420
pF1KE3 NVVPAGTVNRQPPPPYPLTAANGQSPSALQTGGSAAPSSYTNGSIPQSMMVPNRNSHNME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NVVPAGTVNRQPPPPYPLTAANGQSPSALQTGGSAAPSSYTNGSIPQSMMVPNRNSHNME
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 LYNISVPGLQTNWPQSSSAPAQSSPSSGHEIPTWQPNIPVRSNSFNNPLGNRASHSANSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LYNISVPGLQTNWPQSSSAPAQSSPSSGHEIPTWQPNIPVRSNSFNNPLGNRASHSANSQ
430 440 450 460 470 480
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pF1KE3 PSATTVTAITPAPIQQPVKSMRVLKPELQTALAPTHPSWIPQPIQTVQPSPFPEGTASNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PSATTVTAITPAPIQQPVKSMRVLKPELQTALAPTHPSWIPQPIQTVQPSPFPEGTASNV
490 500 510 520 530 540
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pF1KE3 TVMPPVAEAPNYQGPPPPYPKHLLHQNPSVPPYESISKPSKEDQPSLPKEDESEKSYENV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TVMPPVAEAPNYQGPPPPYPKHLLHQNPSVPPYESISKPSKEDQPSLPKEDESEKSYENV
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610 620 630 640 650 660
pF1KE3 DSGDKEKKQITTSPITVRKNKKDEERRESRIQSYSPQAFKFFMEQHVENVLKSHQQRLHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DSGDKEKKQITTSPITVRKNKKDEERRESRIQSYSPQAFKFFMEQHVENVLKSHQQRLHR
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670 680 690 700 710 720
pF1KE3 KKQLENEMMRVGLSQDAQDQMRKMLCQKESNYIRLKRAKMDKSMFVKIKTLGIGAFGEVC
:::::::::::
CCDS59 KKQLENEMMRVKPFKMSIFILNHLFAWCLF
670 680 690
>>CCDS9294.1 LATS2 gene_id:26524|Hs108|chr13 (1088 aa)
initn: 3451 init1: 2484 opt: 2830 Z-score: 1069.8 bits: 209.8 E(32554): 2.9e-53
Smith-Waterman score: 3553; 52.8% identity (72.3% similar) in 1157 aa overlap (13-1121:1-1084)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MKRSEKPEGYRQMRPKTFPASNYTVSSRQMLQEIRESLRNLSK---------PSDAAKAE
::::::::..:. .::: ::::::.:.. :: :.. .. .
CCDS92 MRPKTFPATTYSGNSRQRLQEIREGLKQPSKSSVQGLPAGPNSDTSLD
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KE3 HNM--SKMSTEDPRQVRNPPKFGTHHKALQEIRNSLLPFANETNSSRSTSEVNPQMLQDL
.. :: .:.. .:.: :::: ..:::.::: ::::::::...: ...::: ::::.:
CCDS92 AKVLGSKDATRQQQQMRATPKFGPYQKALREIRYSLLPFANESGTS-AAAEVNRQMLQEL
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110 120 130 140 150 160
pF1KE3 QAAGFDEDMVIQALQKTNNRSIEAAIEFISKMSYQDPRREQMAAAAARPINASMKPGN--
:: :..:. .::..:..::::::.:.::::.: ::: ::.. : :. . .::.
CCDS92 VNAGCDQEMAGRALKQTGSRSIEAALEYISKMGYLDPRNEQIV----RVIKQT-SPGKGL
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 VQQSVNRKQSWKGSKESLVPQRHGPPLGESVAYHSESPNSQTDVGRPLSGSGISAFVQAH
. :.:. :..:. .:.. .::. : : : : ...:
CCDS92 MPTPVTRRPSFEGTGDSFA------------SYHQLS-------GTPYEGPSFGA---DG
170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 PSNGQRVNPPPPPQVRSVTPPPPPRGQTPPPRGTTPPPPSWEPNSQTKRYSGNMEYVISR
:. ... : : : . : :.: : . :: : :....: . ..
CCDS92 PTALEEM---PRPYVDYLFPGVGPHG--PGHQHQHPP----------KGYGASVEAAGAH
210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 ISPVPPGAWQEGYPPPPLNTSPMNPPNQGQRGISSVPVGRQPIIMQSSSKFNFPSGRPGM
. :. :: : : : : .: . : : :.: .: : :
CCDS92 F-PLQ-GA---HYGRPHL-LVPGEPLGYG--------VQRSP---------SFQSKTPP-
250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 QNGTGQTDFMIHQNVVPAGTVNRQPPP------PYPLTAANGQSPSALQTGGSAAPSSYT
..: : ... . . : :. ::: :.: : . :.. :: . . ..
CCDS92 ETG-GYASLPTKGQGGPPGAGLAFPPPAAGLYVPHPHHKQAGPAAHQLHVLGSRS-QVFA
290 300 310 320 330
410 420 430 440 450
pF1KE3 NGSIPQSMMVPNRNSHNMELYNISVPGLQTNWPQSSSAPAQSSPSSGHEIP-----TWQP
. : :::...:.::: :..::... ..: .:: .. : .: . : : : ...:
CCDS92 SDSPPQSLLTPSRNSLNVDLYELGSTSVQ-QWPAATLARRDSLQKPGLEAPPRAHVAFRP
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 NIPV--RSNSFNN--PLGNRASHSANSQPSATTVTAITPAPIQQPVKSMRVLKPELQTAL
. :: :.::::. : . ... : :. .::::.: : : .::::.:::.:: :::.
CCDS92 DCPVPSRTNSFNSHQPRPGPPGKAEPSLPAPNTVTAVTAAHILHPVKSVRVLRPEPQTAV
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550
pF1KE3 APTHPSWIPQPIQTVQPSPFP--EGTASN---------VTVMPPVAE--APNYQGPPPPY
.:.::.:.: : . :.: : :: .. . ..: .: .:. . :::::
CCDS92 GPSHPAWVPAPAPAPAPAPAPAAEGLDAKEEHALALGGAGAFPLDVEYGGPDRRCPPPPY
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KE3 PKHLLHQNPSVP-PYESISKPSKEDQPSLPKE----DESEKSYENVDSGDKEKKQITTSP
::::: .. : .:. ... . :.: :.:.:: .. :.: :.:::: :::
CCDS92 PKHLLLRSKSEQYDLDSLCAGMEQSLRAGPNEPEGGDKSRKSAKG-DKGGKDKKQIQTSP
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KE3 ITVRKNKKDEERRESRIQSYSPQAFKFFMEQHVENVLKSHQQRLHRKKQLENEMMRVGLS
. ::::..:::.:::::.:::: :::::::::::::.:..::...:. :::.:: ..::
CCDS92 VPVRKNSRDEEKRESRIKSYSPYAFKFFMEQHVENVIKTYQQKVNRRLQLEQEMAKAGLC
580 590 600 610 620 630
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 QDAQDQMRKMLCQKESNYIRLKRAKMDKSMFVKIKTLGIGAFGEVCLARKVDTKALYATK
. :.::::.: :::::: ::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::: :
CCDS92 EAEQEQMRKILYQKESNYNRLKRAKMDKSMFVKIKTLGIGAFGEVCLACKVDTHALYAMK
640 650 660 670 680 690
740 750 760 770 780 790
pF1KE3 TLRKKDVLLRNQVAHVKAERDILAEADNEWVVRLYYSFQDKDNLYFVMDYIPGGDMMSLL
:::::::: :::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::
CCDS92 TLRKKDVLNRNQVAHVKAERDILAEADNEWVVKLYYSFQDKDSLYFVMDYIPGGDMMSLL
700 710 720 730 740 750
800 810 820 830 840 850
pF1KE3 IRMGIFPESLARFYIAELTCAVESVHKMGFIHRDIKPDNILIDRDGHIKLTDFGLCTGFR
::: .::: :::::::::: :.::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS92 IRMEVFPEHLARFYIAELTLAIESVHKMGFIHRDIKPDNILIDLDGHIKLTDFGLCTGFR
760 770 780 790 800 810
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pF1KE3 WTHDSKYYQSGDHPRQDSMDFSNEWGDPSSCRCGDRLKPLERRAARQHQRCLAHSLVGTP
:::.:::::.:.: :::::. :. : : :.:::::::: ::.:: .::::::::::::::
CCDS92 WTHNSKYYQKGSHVRQDSMEPSDLWDDVSNCRCGDRLKTLEQRARKQHQRCLAHSLVGTP
820 830 840 850 860 870
920 930 940 950 960 970
pF1KE3 NYIAPEVLLRTGYTQLCDWWSVGVILFEMLVGQPPFLAQTPLETQMKVINWQTSLHIPPQ
:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::: :: :::.:::::...:::: :
CCDS92 NYIAPEVLLRKGYTQLCDWWSVGVILFEMLVGQPPFLAPTPTETQLKVINWENTLHIPAQ
880 890 900 910 920 930
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KE3 AKLSPEASDLIIKLCRGPEDRLGKNGADEIKAHPFFKTIDFSSDLRQQSASYIPKITHPT
.:::::: ::: ::: . . :::.::::..::::::..::::::.:.: : :.: :.::
CCDS92 VKLSPEARDLITKLCCSADHRLGRNGADDLKAHPFFSAIDFSSDIRKQPAPYVPTISHPM
940 950 960 970 980 990
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE3 DTSNFDPVDPDKLWSDDNE-EENVNDTLNGWYKNGKHPEHAFYEFTFRRFFDDNGYPYNY
::::::::: .. :.: .: .. :::.. :.::::::::::::::::::::::.
CCDS92 DTSNFDPVDEESPWNDASEGSTKAWDTLTS--PNNKHPEHAFYEFTFRRFFDDNGYPFRC
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1100 1110 1120 1130
pF1KE3 PKPIEYEYINSQGSE-QQSDEDDQNTGSEIKNRDLVYV
::: : ....:. ..:: ::. : .
CCDS92 PKPSGAEASQAESSDLESSDLVDQTEGCQPVYV
1060 1070 1080
>>CCDS31761.1 STK38L gene_id:23012|Hs108|chr12 (464 aa)
initn: 1292 init1: 758 opt: 792 Z-score: 321.9 bits: 70.1 E(32554): 1.3e-11
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610 620 630 640 650 660
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CCDS48 EEGLKDEEKRLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGH
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CCDS48 VYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIMEFLPGGD
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CCDS48 MMTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGL
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CCDS48 CTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNM----NSKRKAETWK----RNRRQ----LAFS
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CCDS48 TVGTPDYIAPEVFMQTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWKETL
290 300 310 320 330 340
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pF1KE3 HIPPQAKLSPEASDLIIKLCRGPEDRLGKNGADEIKAHPFFKTIDFSSDLRQQSASYIPK
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CCDS48 TFPPEVPISEKAKDLILRFCCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEH-IRERPAAISIE
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CCDS48 GAIPSYMKAAK
460
1130 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 01:41:29 2016 done: Sun Nov 6 01:41:30 2016
Total Scan time: 5.600 Total Display time: 0.160
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]