Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3386
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3386, 1207 aa
1>>>pF1KE3386 1207 - 1207 aa - 1207 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7607+/-0.00122; mu= 21.8397+/- 0.073
mean_var=158.4869+/-29.808, 0's: 0 Z-trim(106.6): 181 B-trim: 12 in 1/54
Lambda= 0.101877
statistics sampled from 8878 (9082) to 8878 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.631), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16
Scan time: 4.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3689.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4 (1207) 8547 1270.2 0
CCDS54794.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4 (1166) 6407 955.6 0
CCDS54795.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4 (1165) 6214 927.2 0
CCDS31478.1 LRP4 gene_id:4038|Hs108|chr11 (1905) 1062 170.3 4.1e-41
CCDS8932.1 LRP1 gene_id:4035|Hs108|chr12 (4544) 966 156.7 1.2e-36
CCDS580.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 ( 793) 878 142.7 3.4e-33
CCDS579.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 ( 700) 875 142.2 4.3e-33
CCDS30720.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 ( 904) 876 142.5 4.5e-33
CCDS578.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 ( 963) 876 142.5 4.6e-33
CCDS8181.1 LRP5 gene_id:4041|Hs108|chr11 (1615) 854 139.6 5.9e-32
CCDS8647.1 LRP6 gene_id:4040|Hs108|chr12 (1613) 853 139.5 6.5e-32
CCDS2232.1 LRP2 gene_id:4036|Hs108|chr2 (4655) 818 135.0 4.3e-30
CCDS56085.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 819) 802 131.6 7.9e-30
CCDS58651.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 858) 802 131.6 8.1e-30
CCDS12254.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 860) 802 131.6 8.2e-30
CCDS56084.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 692) 799 131.0 9.8e-30
CCDS34979.1 VLDLR gene_id:7436|Hs108|chr9 ( 845) 786 129.2 4.1e-29
CCDS6446.1 VLDLR gene_id:7436|Hs108|chr9 ( 873) 786 129.3 4.2e-29
CCDS56083.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 682) 758 125.0 6.3e-28
CCDS2182.1 LRP1B gene_id:53353|Hs108|chr2 (4599) 761 126.6 1.4e-27
CCDS8436.1 SORL1 gene_id:6653|Hs108|chr11 (2214) 537 93.2 7.5e-18
CCDS9706.1 NID2 gene_id:22795|Hs108|chr14 (1375) 516 89.8 4.8e-17
CCDS1608.1 NID1 gene_id:4811|Hs108|chr1 (1247) 508 88.6 1e-16
CCDS33626.1 LRP5L gene_id:91355|Hs108|chr22 ( 252) 468 81.8 2.4e-15
CCDS83309.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 915) 451 80.1 2.9e-14
CCDS55265.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 937) 438 78.2 1.1e-13
CCDS55264.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 956) 438 78.2 1.1e-13
CCDS41237.1 MEGF6 gene_id:1953|Hs108|chr1 (1541) 440 78.7 1.2e-13
CCDS13348.1 MATN4 gene_id:8785|Hs108|chr20 ( 581) 381 69.5 2.7e-11
>>CCDS3689.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4 (1207 aa)
initn: 8547 init1: 8547 opt: 8547 Z-score: 6799.3 bits: 1270.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8547; 99.8% identity (99.9% similar) in 1207 aa overlap (1-1207:1-1207)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MLLTLIILLPVVSKFSFVSLSAPQHWSCPEGTLAGNGNSTCVGPAPFLIFSHGNSIFRID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MLLTLIILLPVVSKFSFVSLSAPQHWSCPEGTLAGNGNSTCVGPAPFLIFSHGNSIFRID
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TEGTNYEQLVVDAGVSVIMDFHYNEKRIYWVDLERQLLQRVFLNGSRQERVCNIEKNVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 TEGTNYEQLVVDAGVSVIMDFHYNEKRIYWVDLERQLLQRVFLNGSRQERVCNIEKNVSG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 MAINWINEEVIWSNQQEGIITVTDMKGNNSHILLSALKYPANVAVDPVERFIFWSSEVAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MAINWINEEVIWSNQQEGIITVTDMKGNNSHILLSALKYPANVAVDPVERFIFWSSEVAG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 SLYRADLDGVGVKALLETSEKITAVSLDVLDKRLFWIQYNREGSNSLICSCDYDGGSVHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 SLYRADLDGVGVKALLETSEKITAVSLDVLDKRLFWIQYNREGSNSLICSCDYDGGSVHI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SKHPTQHNLFAMSLFGDRIFYSTWKMKTIWIANKHTGKDMVRINLHSSFVPLGELKVVHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 SKHPTQHNLFAMSLFGDRIFYSTWKMKTIWIANKHTGKDMVRINLHSSFVPLGELKVVHP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LAQPKAEDDTWEPEQKLCKLRKGNCSSTVCGQDLQSHLCMCAEGYALSRDRKYCEDVNEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 LAQPKAEDDTWEPEQKLCKLRKGNCSSTVCGQDLQSHLCMCAEGYALSRDRKYCEDVNEC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 AFWNHGCTLGCKNTPGSYYCTCPVGFVLLPDGKRCHQLVSCPRNVSECSHDCVLTSEGPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 AFWNHGCTLGCKNTPGSYYCTCPVGFVLLPDGKRCHQLVSCPRNVSECSHDCVLTSEGPL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 CFCPEGSVLERDGKTCSGCSSPDNGGCSQLCVPLSPVSWECDCFPGYDLQLDEKSCAASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 CFCPEGSVLERDGKTCSGCSSPDNGGCSQLCVPLSPVSWECDCFPGYDLQLDEKSCAASG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 PQPFLLFANSQDIRHMHFDGTDYGTLLSQQMGMVYALDHDPVENKIYFAHTALKWIERAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 PQPFLLFANSQDIRHMHFDGTDYGTLLSQQMGMVYALDHDPVENKIYFAHTALKWIERAN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 MDGSQRERLIEEGVDVPEGLAVDWIGRRFYWTDRGKSLIGRSDLNGKRSKIITKENISQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MDGSQRERLIEEGVDVPEGLAVDWIGRRFYWTDRGKSLIGRSDLNGKRSKIITKENISQP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 RGIAVHPMAKRLFWTDTGINPRIESSSLQGLGRLVIASSDLIWPSGITIDFLTDKLYWCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 RGIAVHPMAKRLFWTDTGINPRIESSSLQGLGRLVIASSDLIWPSGITIDFLTDKLYWCD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 AKQSVIEMANLDGSKRRRLTQNDVGHPFAVAVFEDYVWFSDWAMPSVIRVNKRTGKDRVR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS36 AKQSVIEMANLDGSKRRRLTQNDVGHPFAVAVFEDYVWFSDWAMPSVMRVNKRTGKDRVR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LQGSMLKPSSLVVVHPLAKPGADPCLYQNGGCEHICKKRLGTAWCSCREGFMKASDGKTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 LQGSMLKPSSLVVVHPLAKPGADPCLYQNGGCEHICKKRLGTAWCSCREGFMKASDGKTC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 LALDGHQLLAGGEVDLKNQVTPLDILSKTRVSEDNITESQHMLVAEIMVSDQDDCAPVGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 LALDGHQLLAGGEVDLKNQVTPLDILSKTRVSEDNITESQHMLVAEIMVSDQDDCAPVGC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 SMYARCISEGEDATCQCLKGFAGDGKLCSDIDECEMGVPVCPPASSKCINTEGGYVCRCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 SMYARCISEGEDATCQCLKGFAGDGKLCSDIDECEMGVPVCPPASSKCINTEGGYVCRCS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 EGYQGDGIHCLDIDECQLGVHSCGENASCTNTEGGYTCMCAGRLSEPGLICPDSTPPPHL
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 EGYQGDGIHCLDIDECQLGEHSCGENASCTNTEGGYTCMCAGRLSEPGLICPDSTPPPHL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 REDDHHYSVRNSDSECPLSHDGYCLHDGVCMYIEALDKYACNCVVGYIGERCQYRDLKWW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 REDDHHYSVRNSDSECPLSHDGYCLHDGVCMYIEALDKYACNCVVGYIGERCQYRDLKWW
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 ELRHAGHGQQQKVIVVAVCVVVLVMLLLLSLWGAHYYRTQKLLSKNPKNPYEESSRDVRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 ELRHAGHGQQQKVIVVAVCVVVLVMLLLLSLWGAHYYRTQKLLSKNPKNPYEESSRDVRS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 RRPADTEDGMSSCPQPWFVVIKEHQDLKNGGQPVAGEDGQAADGSMQPTSWRQEPQLCGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 RRPADTEDGMSSCPQPWFVVIKEHQDLKNGGQPVAGEDGQAADGSMQPTSWRQEPQLCGM
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 GTEQGCWIPVSSDKGSCPQVMERSFHMPSYGTQTLEGGVEKPHSLLSANPLWQQRALDPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 GTEQGCWIPVSSDKGSCPQVMERSFHMPSYGTQTLEGGVEKPHSLLSANPLWQQRALDPP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 HQMELTQ
:::::::
CCDS36 HQMELTQ
>>CCDS54794.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4 (1166 aa)
initn: 6404 init1: 6404 opt: 6407 Z-score: 5099.6 bits: 955.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8154; 96.5% identity (96.6% similar) in 1207 aa overlap (1-1207:1-1166)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MLLTLIILLPVVSKFSFVSLSAPQHWSCPEGTLAGNGNSTCVGPAPFLIFSHGNSIFRID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MLLTLIILLPVVSKFSFVSLSAPQHWSCPEGTLAGNGNSTCVGPAPFLIFSHGNSIFRID
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TEGTNYEQLVVDAGVSVIMDFHYNEKRIYWVDLERQLLQRVFLNGSRQERVCNIEKNVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TEGTNYEQLVVDAGVSVIMDFHYNEKRIYWVDLERQLLQRVFLNGSRQERVCNIEKNVSG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 MAINWINEEVIWSNQQEGIITVTDMKGNNSHILLSALKYPANVAVDPVERFIFWSSEVAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MAINWINEEVIWSNQQEGIITVTDMKGNNSHILLSALKYPANVAVDPVERFIFWSSEVAG
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190 200 210 220 230 240
pF1KE3 SLYRADLDGVGVKALLETSEKITAVSLDVLDKRLFWIQYNREGSNSLICSCDYDGGSVHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLYRADLDGVGVKALLETSEKITAVSLDVLDKRLFWIQYNREGSNSLICSCDYDGGSVHI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SKHPTQHNLFAMSLFGDRIFYSTWKMKTIWIANKHTGKDMVRINLHSSFVPLGELKVVHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SKHPTQHNLFAMSLFGDRIFYSTWKMKTIWIANKHTGKDMVRINLHSSFVPLGELKVVHP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LAQPKAEDDTWEPEQKLCKLRKGNCSSTVCGQDLQSHLCMCAEGYALSRDRKYCEDVNEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LAQPKAEDDTWEPEQKLCKLRKGNCSSTVCGQDLQSHLCMCAEGYALSRDRKYCEDVNEC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 AFWNHGCTLGCKNTPGSYYCTCPVGFVLLPDGKRCHQLVSCPRNVSECSHDCVLTSEGPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AFWNHGCTLGCKNTPGSYYCTCPVGFVLLPDGKRCHQLVSCPRNVSECSHDCVLTSEGPL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 CFCPEGSVLERDGKTCSGCSSPDNGGCSQLCVPLSPVSWECDCFPGYDLQLDEKSCAASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CFCPEGSVLERDGKTCSGCSSPDNGGCSQLCVPLSPVSWECDCFPGYDLQLDEKSCAASG
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pF1KE3 PQPFLLFANSQDIRHMHFDGTDYGTLLSQQMGMVYALDHDPVENKIYFAHTALKWIERAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PQPFLLFANSQDIRHMHFDGTDYGTLLSQQMGMVYALDHDPVENKIYFAHTALKWIERAN
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550 560 570 580 590 600
pF1KE3 MDGSQRERLIEEGVDVPEGLAVDWIGRRFYWTDRGKSLIGRSDLNGKRSKIITKENISQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MDGSQRERLIEEGVDVPEGLAVDWIGRRFYWTDRGKSLIGRSDLNGKRSKIITKENISQP
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610 620 630 640 650 660
pF1KE3 RGIAVHPMAKRLFWTDTGINPRIESSSLQGLGRLVIASSDLIWPSGITIDFLTDKLYWCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RGIAVHPMAKRLFWTDTGINPRIESSSLQGLGRLVIASSDLIWPSGITIDFLTDKLYWCD
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670 680 690 700 710 720
pF1KE3 AKQSVIEMANLDGSKRRRLTQNDVGHPFAVAVFEDYVWFSDWAMPSVIRVNKRTGKDRVR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS54 AKQSVIEMANLDGSKRRRLTQNDVGHPFAVAVFEDYVWFSDWAMPSVMRVNKRTGKDRVR
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730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LQGSMLKPSSLVVVHPLAKPGADPCLYQNGGCEHICKKRLGTAWCSCREGFMKASDGKTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LQGSMLKPSSLVVVHPLAKPGADPCLYQNGGCEHICKKRLGTAWCSCREGFMKASDGKTC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 LALDGHQLLAGGEVDLKNQVTPLDILSKTRVSEDNITESQHMLVAEIMVSDQDDCAPVGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LALDGHQLLAGGEVDLKNQVTPLDILSKTRVSEDNITESQHMLVAEIMVSDQDDCAPVGC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 SMYARCISEGEDATCQCLKGFAGDGKLCSDIDECEMGVPVCPPASSKCINTEGGYVCRCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SMYARCISEGEDATCQCLKGFAGDGKLCSDIDECEMGVPVCPPASSKCINTEGGYVCRCS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 EGYQGDGIHCLDIDECQLGVHSCGENASCTNTEGGYTCMCAGRLSEPGLICPDSTPPPHL
:::::::::::: :::::::
CCDS54 EGYQGDGIHCLD-----------------------------------------STPPPHL
910
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 REDDHHYSVRNSDSECPLSHDGYCLHDGVCMYIEALDKYACNCVVGYIGERCQYRDLKWW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 REDDHHYSVRNSDSECPLSHDGYCLHDGVCMYIEALDKYACNCVVGYIGERCQYRDLKWW
920 930 940 950 960 970
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 ELRHAGHGQQQKVIVVAVCVVVLVMLLLLSLWGAHYYRTQKLLSKNPKNPYEESSRDVRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ELRHAGHGQQQKVIVVAVCVVVLVMLLLLSLWGAHYYRTQKLLSKNPKNPYEESSRDVRS
980 990 1000 1010 1020 1030
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 RRPADTEDGMSSCPQPWFVVIKEHQDLKNGGQPVAGEDGQAADGSMQPTSWRQEPQLCGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RRPADTEDGMSSCPQPWFVVIKEHQDLKNGGQPVAGEDGQAADGSMQPTSWRQEPQLCGM
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 GTEQGCWIPVSSDKGSCPQVMERSFHMPSYGTQTLEGGVEKPHSLLSANPLWQQRALDPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GTEQGCWIPVSSDKGSCPQVMERSFHMPSYGTQTLEGGVEKPHSLLSANPLWQQRALDPP
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE3 HQMELTQ
:::::::
CCDS54 HQMELTQ
1160
>>CCDS54795.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4 (1165 aa)
initn: 6132 init1: 6132 opt: 6214 Z-score: 4946.3 bits: 927.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8146; 96.4% identity (96.4% similar) in 1207 aa overlap (1-1207:1-1165)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MLLTLIILLPVVSKFSFVSLSAPQHWSCPEGTLAGNGNSTCVGPAPFLIFSHGNSIFRID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MLLTLIILLPVVSKFSFVSLSAPQHWSCPEGTLAGNGNSTCVGPAPFLIFSHGNSIFRID
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TEGTNYEQLVVDAGVSVIMDFHYNEKRIYWVDLERQLLQRVFLNGSRQERVCNIEKNVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TEGTNYEQLVVDAGVSVIMDFHYNEKRIYWVDLERQLLQRVFLNGSRQERVCNIEKNVSG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 MAINWINEEVIWSNQQEGIITVTDMKGNNSHILLSALKYPANVAVDPVERFIFWSSEVAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MAINWINEEVIWSNQQEGIITVTDMKGNNSHILLSALKYPANVAVDPVERFIFWSSEVAG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 SLYRADLDGVGVKALLETSEKITAVSLDVLDKRLFWIQYNREGSNSLICSCDYDGGSVHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLYRADLDGVGVKALLETSEKITAVSLDVLDKRLFWIQYNREGSNSLICSCDYDGGSVHI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SKHPTQHNLFAMSLFGDRIFYSTWKMKTIWIANKHTGKDMVRINLHSSFVPLGELKVVHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SKHPTQHNLFAMSLFGDRIFYSTWKMKTIWIANKHTGKDMVRINLHSSFVPLGELKVVHP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LAQPKAEDDTWEPEQKLCKLRKGNCSSTVCGQDLQSHLCMCAEGYALSRDRKYCEDVNEC
::::::::::::: :::::
CCDS54 LAQPKAEDDTWEP------------------------------------------DVNEC
310
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 AFWNHGCTLGCKNTPGSYYCTCPVGFVLLPDGKRCHQLVSCPRNVSECSHDCVLTSEGPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AFWNHGCTLGCKNTPGSYYCTCPVGFVLLPDGKRCHQLVSCPRNVSECSHDCVLTSEGPL
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 CFCPEGSVLERDGKTCSGCSSPDNGGCSQLCVPLSPVSWECDCFPGYDLQLDEKSCAASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CFCPEGSVLERDGKTCSGCSSPDNGGCSQLCVPLSPVSWECDCFPGYDLQLDEKSCAASG
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 PQPFLLFANSQDIRHMHFDGTDYGTLLSQQMGMVYALDHDPVENKIYFAHTALKWIERAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PQPFLLFANSQDIRHMHFDGTDYGTLLSQQMGMVYALDHDPVENKIYFAHTALKWIERAN
440 450 460 470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 MDGSQRERLIEEGVDVPEGLAVDWIGRRFYWTDRGKSLIGRSDLNGKRSKIITKENISQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MDGSQRERLIEEGVDVPEGLAVDWIGRRFYWTDRGKSLIGRSDLNGKRSKIITKENISQP
500 510 520 530 540 550
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 RGIAVHPMAKRLFWTDTGINPRIESSSLQGLGRLVIASSDLIWPSGITIDFLTDKLYWCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RGIAVHPMAKRLFWTDTGINPRIESSSLQGLGRLVIASSDLIWPSGITIDFLTDKLYWCD
560 570 580 590 600 610
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 AKQSVIEMANLDGSKRRRLTQNDVGHPFAVAVFEDYVWFSDWAMPSVIRVNKRTGKDRVR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS54 AKQSVIEMANLDGSKRRRLTQNDVGHPFAVAVFEDYVWFSDWAMPSVMRVNKRTGKDRVR
620 630 640 650 660 670
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LQGSMLKPSSLVVVHPLAKPGADPCLYQNGGCEHICKKRLGTAWCSCREGFMKASDGKTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LQGSMLKPSSLVVVHPLAKPGADPCLYQNGGCEHICKKRLGTAWCSCREGFMKASDGKTC
680 690 700 710 720 730
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 LALDGHQLLAGGEVDLKNQVTPLDILSKTRVSEDNITESQHMLVAEIMVSDQDDCAPVGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LALDGHQLLAGGEVDLKNQVTPLDILSKTRVSEDNITESQHMLVAEIMVSDQDDCAPVGC
740 750 760 770 780 790
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 SMYARCISEGEDATCQCLKGFAGDGKLCSDIDECEMGVPVCPPASSKCINTEGGYVCRCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SMYARCISEGEDATCQCLKGFAGDGKLCSDIDECEMGVPVCPPASSKCINTEGGYVCRCS
800 810 820 830 840 850
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 EGYQGDGIHCLDIDECQLGVHSCGENASCTNTEGGYTCMCAGRLSEPGLICPDSTPPPHL
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EGYQGDGIHCLDIDECQLGEHSCGENASCTNTEGGYTCMCAGRLSEPGLICPDSTPPPHL
860 870 880 890 900 910
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 REDDHHYSVRNSDSECPLSHDGYCLHDGVCMYIEALDKYACNCVVGYIGERCQYRDLKWW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 REDDHHYSVRNSDSECPLSHDGYCLHDGVCMYIEALDKYACNCVVGYIGERCQYRDLKWW
920 930 940 950 960 970
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 ELRHAGHGQQQKVIVVAVCVVVLVMLLLLSLWGAHYYRTQKLLSKNPKNPYEESSRDVRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ELRHAGHGQQQKVIVVAVCVVVLVMLLLLSLWGAHYYRTQKLLSKNPKNPYEESSRDVRS
980 990 1000 1010 1020 1030
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 RRPADTEDGMSSCPQPWFVVIKEHQDLKNGGQPVAGEDGQAADGSMQPTSWRQEPQLCGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RRPADTEDGMSSCPQPWFVVIKEHQDLKNGGQPVAGEDGQAADGSMQPTSWRQEPQLCGM
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 GTEQGCWIPVSSDKGSCPQVMERSFHMPSYGTQTLEGGVEKPHSLLSANPLWQQRALDPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GTEQGCWIPVSSDKGSCPQVMERSFHMPSYGTQTLEGGVEKPHSLLSANPLWQQRALDPP
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE3 HQMELTQ
:::::::
CCDS54 HQMELTQ
1160
>>CCDS31478.1 LRP4 gene_id:4038|Hs108|chr11 (1905 aa)
initn: 842 init1: 694 opt: 1062 Z-score: 851.6 bits: 170.3 E(32554): 4.1e-41
Smith-Waterman score: 1067; 34.3% identity (61.2% similar) in 533 aa overlap (317-827:269-792)
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 SSFVPLGELKVVHPLAQPKAEDDTWEPEQKLCKLRKGNCSSTVCGQDLQSHLCMCAEGYA
.: .. : : : . : : . :
CCDS31 DSGLCINAGWRCDGDADCDDQSDERNCTTSMCTAEQFRCHSGRCVR--LSWRCDGEDDCA
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390
pF1KE3 LSRDRKYCEDVN--ECAF-----WNHGCTLGCKNTPGSYYCTCPVGFVLLPDGKRCHQLV
. :.. ::... .::. :: : : : : . :. . :. .
CCDS31 DNSDEENCENTGSPQCALDQFLCWNGRCIGQRKLCNG--VNDCGDNSDESPQ-QNCRPRT
300 310 320 330 340 350
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 ---SCPRNVSECSHDCVLTSEGPLCFCPEGSVLERDGKTCSGCSS-PDNGGCSQLCVPLS
.: : . :.. : .. . : : : : .::.::. . ..: ::: :. :
CCDS31 GEENCNVNNGGCAQKCQMVRGAVQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNECAEEGYCSQGCTN-S
360 370 380 390 400 410
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pF1KE3 PVSWECDCFPGYDLQLDEKSCAASGPQPFLLFANSQDIRHMHFDGTDYGTLLSQQMGMVY
...: : ::.:. :..:: : ::.: ::::: :::.. ..: ::: ... .
CCDS31 EGAFQCWCETGYELRPDRRSCKALGPEPVLLFANRIDIRQVLPHRSEY-TLLLNNLENAI
420 430 440 450 460 470
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 ALDHDPVENKIYFAHTALKWIERANMDGSQRERLIEEGVDVPEGLAVDWIGRRFYWTDRG
::: .. .... ..: : :::..::. :... :.. : ::::::. ..:::: :
CCDS31 ALDFHHRRELVFWSDVTLDRILRANLNGSNVEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSG
480 490 500 510 520 530
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 KSLIGRSDLNGKRSKIITKENISQPRGIAVHPMAKRLFWTDTGINPRIESSSLQGLGRLV
: : ..:.: . :.. .:. .::.::.::: ..::: : .::::.::..: :: .
CCDS31 TSRIEVANLDGAHRKVLLWQNLEKPRAIALHPMEGTIYWTDWGNTPRIEASSMDGSGRRI
540 550 560 570 580 590
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pF1KE3 IASSDLIWPSGITIDFLTDKLYWCDAKQSVIEMANLDGSKRRRLTQNDVGHPFAVAVFED
::.. :.::.:.:::. ..:: :::. ::: ::::::.:. . .. . ::::..::::
CCDS31 IADTHLFWPNGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVISQGLPHPFAITVFED
600 610 620 630 640 650
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 YVWFSDWAMPSVIRVNKRTGKDRVRLQGSMLKPSSLVVVHPLAKP-GADPCLYQNGGCEH
....:: :. .:: :::.. ..... : .. ..:: .: : . : .:::: :
CCDS31 SLYWTDWHTKSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGKNRCGDNNGGCTH
660 670 680 690 700 710
760 770 780 790 800
pF1KE3 ICKKRLGTAWCSCREGFMKASDGKTCLALDGHQLLAG---------GEVDLKNQVTPL-D
.: . :.: :: : :. .:: :.: ::...: :: :
CCDS31 LCLPSGQNYTCACPTGFRKISSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDVIPLAD
720 730 740 750 760 770
810 820 830 840 850 860
pF1KE3 ILSKTRVSEDNITESQHMLVAEIMVSDQDDCAPVGCSMYARCISEGEDATCQCLKGFAGD
. .. :. : ....:. ...
CCDS31 V--RSAVALDWDSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTSLESPAGLAIDWVTNK
780 790 800 810 820
>--
initn: 485 init1: 485 opt: 731 Z-score: 588.7 bits: 121.6 E(32554): 1.8e-26
Smith-Waterman score: 731; 34.9% identity (67.8% similar) in 307 aa overlap (481-785:1352-1653)
460 470 480 490 500
pF1KE3 CVPLSPVSWECDCFPGYDLQLDEKSCAASGPQPFLLFANSQDIRHMHFDGTDYGTLLSQ-
:. .:::.. .::.. .: .:. .
CCDS31 HLCLPRPSGFSCACPTGIQLKGDGKTCDPSPETYLLFSSRGSIRRISLDTSDHTDVHVPV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KE3 -QMGMVYALDHDPVENKIYFAHTALKWIERANMDGSQRERLIEEGVDVPEGLAVDWIGRR
... : .::.: :..:.:.. . : :.::...::. : .: .:. . .::::::..:
CCDS31 PELNNVISLDYDSVDGKVYYTDVFLDVIRRADLNGSNMETVIGRGLKTTDGLAVDWVARN
1390 1400 1410 1420 1430 1440
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 FYWTDRGKSLIGRSDLNGKRSKIITKENISQPRGIAVHPMAKRLFWTDTGINPRIESSSL
.:::: :.. : : :.:. :.. ......::.::: : ::::: : .:: ..:
CCDS31 LYWTDTGRNTIEASRLDGSCRKVLINNSLDEPRAIAVFPRKGYLFWTDWGHIAKIERANL
1450 1460 1470 1480 1490 1500
630 640 650 660 670 680
pF1KE3 QGLGRLVIASSDLIWPSGITIDFLTDKLYWCDAKQSVIEMANLDGSKRRRLTQNDVGHPF
.: : :. ..:: ::.:.:.:. : ..:: ::. . :: :.:.: : :.. . :.:::
CCDS31 DGSERKVLINTDLGWPNGLTLDYDTRRIYWVDAHLDRIESADLNG-KLRQVLVSHVSHPF
1510 1520 1530 1540 1550 1560
690 700 710 720 730 740
pF1KE3 AVAVFEDYVWFSDWAMPSVIRVNKRTGKDRVRLQGSMLKPSSLVVVHPLAKPGADPCLYQ
:.. . .....:: :. ::.: .:... . ... ...:: : . :.. : .
CCDS31 ALTQQDRWIYWTDWQTKSIQRVDKYSGRNKETVLANVEGLMDIIVVSPQRQTGTNACGVN
1570 1580 1590 1600 1610 1620
750 760 770 780 790 800
pF1KE3 NGGCEHICKKRLGTAWCSCREGFMKASDGKTCLALDGHQLLAGGEVDLKNQVTPLDILSK
:::: :.: : . :.: . :.. : . :
CCDS31 NGGCTHLCFARASDFVCACPD----EPDSRPCSLVPGLVPPAPRATGMSEKSPVLPNTPP
1630 1640 1650 1660 1670
810 820 830 840 850 860
pF1KE3 TRVSEDNITESQHMLVAEIMVSDQDDCAPVGCSMYARCISEGEDATCQCLKGFAGDGKLC
CCDS31 TTLYSSTTRTRTSLEEVEGRCSERDARLGLCARSNDAVPAAPGEGLHISYAIGGLLSILL
1680 1690 1700 1710 1720 1730
>--
initn: 657 init1: 648 opt: 693 Z-score: 558.5 bits: 116.1 E(32554): 8.7e-25
Smith-Waterman score: 830; 25.9% identity (54.3% similar) in 691 aa overlap (98-780:797-1348)
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QLVVDAGVSVIMDFHYNEKRIYWVDLERQLLQRVFLNGSRQERVCNIE-KNVSGMAINWI
..:. .:. :: : . .. .:.::.:.
CCDS31 IPLADVRSAVALDWDSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTSLESPAGLAIDWV
770 780 790 800 810 820
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pF1KE3 NEEVIWSNQQEGIITVTDMKGNNSHILL-SALKYPANVAVDPVERFIFWSSEVAG-SLYR
.... :.. : :.. :. .:. : : ...:.:. ...:.. :. .. :
CCDS31 TNKLYWTDAGTDRIEVANTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMYWTDWGASPKIER
830 840 850 860 870 880
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 ADLDGVGVKALLETSEKI-TAVSLDVLDKRLFWIQYNREGSNSLICSCDYDGGSVHISKH
: .:. : .... .. .....: ..::.: ... . : ::.. ..
CCDS31 AGMDASGRQVIISSNLTWPNGLAIDYGSQRLYWA----DAGMKTIEFAGLDGSKRKVLIG
890 900 910 920 930 940
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 PTQHNLFAMSLFGDRIFYSTWKMKTIWIANKHTGKDMVRINLHSSFVPLGELKVVHPLAQ
. :...:.:.::... :. :.: :.. :: : : .:. .. : ...: :
CCDS31 SQLPHPFGLTLYGERIYWTDWQTKSIQSADRLTGLD--RETLQENLENLMDIHVFHRRRP
950 960 970 980 990 1000
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 PKAEDDTWEPEQKLCKLRKGNCSSTVCGQDLQSHLCMCAEGYALSRDRKYCEDVNECAFW
: . : : ...:.:: :::. . .
CCDS31 PVST-----P----CAMENGGCS----------HLCLRSPN-------------------
1010 1020
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 NHGCTLGCKNTPGSYYCTCPVGFVLLPDGKRCHQLVSCPRNVSECSHDCVLTSEGPLCFC
:... ::::.:. :: :::
CCDS31 -----------PSGFSCTCPTGINLLSDGK------------------------------
1030 1040
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 PEGSVLERDGKTCSGCSSPDNGGCSQLCVPLSPVSWECDCFPGYDLQLDEKSCAASGPQP
::: ::..
CCDS31 -----------TCS---------------------------PGMN--------------S
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 FLLFANSQDIRHMHFDGTDYGTL---LSQQMGMVYALDHDPVENKIYFAHTALKWIERAN
::.:: ::: . .: .. . .. : . :. :: :.:.:.. ..:. : :::
CCDS31 FLIFARRIDIRMVSLDIPYFADVVVPINITMKNTIAIGVDPQEGKVYWSDSTLHRISRAN
1050 1060 1070 1080 1090 1100
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 MDGSQRERLIEEGVDVPEGLAVDWIGRRFYWTDRGKSLIGRSDLNGKRSKIITKENISQP
.::::.: .: :... .::::: :::. :::: : . : ..:.:. :... .:...:
CCDS31 LDGSQHEDIITTGLQTTDGLAVDAIGRKVYWTDTGTNRIEVGNLDGSMRKVLVWQNLDSP
1110 1120 1130 1140 1150 1160
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 RGIAVHPMAKRLFWTDTGINPRIESSSLQGLGRLVIASSDLIWPSGITIDFLTDKLYWCD
:.:... ..::: : : ..: :...: : :. ...: ::.:.:.: ...: : :
CCDS31 RAIVLYHEMGFMYWTDWGENAKLERSGMDGSDRAVLINNNLGWPNGLTVDKASSQLLWAD
1170 1180 1190 1200 1210 1220
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 AKQSVIEMANLDGSKRRRLTQNDVGHPFAVAVFEDYVWFSDWAMPSVIRVNKRTGKDRVR
:. :: :.:.:..:. :. . : ::........:....:: :. :..: ::.. .
CCDS31 AHTERIEAADLNGANRHTLV-SPVQHPYGLTLLDSYIYWTDWQTRSIHRADKGTGSNVIL
1230 1240 1250 1260 1270 1280
730 740 750 760 770
pF1KE3 LQGSMLKPSSLVVVHPLAKP-GADPCLYQNGGCEHICKKRLGTAWCSCREGFMKASDGKT
..... .. .: :.: : . : .:::: :.: : . :.: :.. .::::
CCDS31 VRSNLPGLMDMQAVDR-AQPLGFNKCGSRNGGCSHLCLPRPSGFSCACPTGIQLKGDGKT
1290 1300 1310 1320 1330 1340
780 790 800 810 820 830
pF1KE3 CLALDGHQLLAGGEVDLKNQVTPLDILSKTRVSEDNITESQHMLVAEIMVSDQDDCAPVG
:
CCDS31 CDPSPETYLLFSSRGSIRRISLDTSDHTDVHVPVPELNNVISLDYDSVDGKVYYTDVFLD
1350 1360 1370 1380 1390 1400
>>CCDS8932.1 LRP1 gene_id:4035|Hs108|chr12 (4544 aa)
initn: 1451 init1: 548 opt: 966 Z-score: 771.4 bits: 156.7 E(32554): 1.2e-36
Smith-Waterman score: 1032; 32.0% identity (57.3% similar) in 665 aa overlap (325-951:2853-3473)
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 LKVVHPLAQPKAEDDTWEPEQKLCKLRKGNCSSTVCGQDLQSHLCMCAEGYALSRDRKYC
: .:: :.. ::.: :: . :
CCDS89 FMCQNRQCIPKHFVCDHDRDCADGSDESPECEYPTCGP---SEF-RCANGRCLSSRQWEC
2830 2840 2850 2860 2870
360 370 380 390
pF1KE3 EDVNEC------AFWNHGCTLG---CKNTPGSYYCT---CPVGFVLLPDGKR--------
. :.: : : :: : :. ... :. : :. .:: .:.
CCDS89 DGENDCHDQSDEAPKNPHCTSQEHKC-NASSQFLCSSGRC-VAEALLCNGQDDCGDSSDE
2880 2890 2900 2910 2920 2930
400 410 420 430 440
pF1KE3 --CHQLVSC-PRNVSECSHDCVLTSEGPLCFCPEGSVLERDGKTCSG---CSSPDNGGCS
:: . : :..: ::.:: . : : : : :. ::.::. ::. . ::
CCDS89 RGCH-INECLSRKLSGCSQDCEDLKIGFKCRCRPGFRLKDDGRTCADVDECST--TFPCS
2940 2950 2960 2970 2980 2990
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 QLCVPLSPVSWECDCFPGYDLQL-DEKSC-AASGPQPFLLFANSQDIRHMHFDGTDYGTL
: :. . :..: : :: . : .:: :.. .:::.::: .:....::..: ::
CCDS89 QRCIN-THGSYKCLCVEGYAPRGGDPHSCKAVTDEEPFLIFANRYYLRKLNLDGSNY-TL
3000 3010 3020 3030 3040 3050
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 LSQQMGMVYALDHDPVENKIYFAHTALK--WIERANMDGSQRERLIEEGVDVPEGLAVDW
:.: .. . ::: : :. ::.. .. . :.: ...::. . : . :.. :.::::::
CCDS89 LKQGLNNAVALDFDYREQMIYWTDVTTQGSMIRRMHLNGSNVQVLHRTGLSNPDGLAVDW
3060 3070 3080 3090 3100 3110
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 IGRRFYWTDRGKSLIGRSDLNGKRSKIITKENISQPRGIAVHPMAKRLFWTDTGINPRIE
.: .:: :.:.. : : ::: .... .. .::...: . :.::: : . :
CCDS89 VGGNLYWCDKGRDTIEVSKLNGAYRTVLVSSGLREPRALVVDVQNGYLYWTDWGDHSLIG
3120 3130 3140 3150 3160 3170
630 640 650 660 670 680
pF1KE3 SSSLQGLGRLVIASSDLIWPSGITIDFLTDKLYWCDAKQSVIEMANLDGSKRRRLTQNDV
...: .: ::... . ::.:.:.:..:...:: ::... ::.:.::::.:. . ..:.
CCDS89 RIGMDGSSRSVIVDTKITWPNGLTLDYVTERIYWADAREDYIEFASLDGSNRHVVLSQDI
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pF1KE3 GHPFAVAVFEDYVWFSDWAMPSVIRVNKRTGKDRVRLQGSMLKPSSLVVVHPLAKPGAD-
: ::...:::::...:: :. :..: :: ... : ... .: .: : : : .: .
CCDS89 PHIFALTLFEDYVYWTDWETKSINRAHKTTGTNKTLLISTLHRPMDLHVFHALRQPDVPN
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pF1KE3 -PCLYQNGGCEHICKKRLGTAW-CSCREGFMKASDGKTCLALDGHQLLAGGEVDLKNQVT
:: .:::: ..: : . :.: .:. .:::.::.. . :. : ...
CCDS89 HPCKVNNGGCSNLCLLSPGGGHKCACPTNFYLGSDGRTCVS----NCTASQFVCKNDKCI
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pF1KE3 PLDILSKTRVSEDNITESQHMLVAEIMVSDQD-DCAPVGCSMYARCISEGEDATCQCLKG
:. : ::. . : ::. :: : : : : .
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: :: . :.: :: . . :: :.. :: ::. :: : ..: :.:
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: ..: : ..:. .. . : . : .:
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CCDS89 FRCKDSGRCIPARWKCDGEDDCGDGSDEPKEECDERTCEPYQFRCKNNRCVPGRWQCDYD
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.: .. :. .. : ...:. :.:.:: :.. : ..:.:.::. : :
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. . :. :.:..:......:. . .. :.:. . :. .. ....:. : ...: :..
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..:.. . .. :..:: . ..:: ...: .....: ...:.::. ..: :
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:. ::..... . :: .. :: ..
CCDS89 NRCNLDGSGLEV--------IDAMR--------------------SQLGKA-------TA
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.. .: : : .: :. :.::. :.:
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:. ...: . : :::.. . :: . .: .: . : : .. ..: .. :
CCDS89 LRSGQQACEGVGS--FLLYSVHEGIRGIPLDPNDKSDALVPVSGTSLAVGIDFHAENDTI
1880 1890 1900 1910 1920 1930
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:.. .:. : ::. : . :: .. .:. ::.:::::. .::::.: ..: . :::
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. .. ......::.:.::: ::::. : :::: : :.: :.:... .. ::.:
CCDS89 SFRYVVISQGLDKPRAITVHPEKGYLFWTEWGQYPRIERSRLDGTERVVLVNVSISWPNG
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:..:. :::::::. . :: .:. .. :. :..:.. :.:.::::....::
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: :. : .: .. : : :. : .. ... : . . :.. : ::::...: :
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:: :: . ::... .:. :. . :. . : ....:::.:.. :: : ::::
CCDS89 YWADAYLDYIEVVDYEGKGRQTIIQGILIEHLYGLTVFENYLYATNSDNANAQQKTSVIR
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CCDS89 GDESVRIDAMDVHVKAGRVYWTNWHTGTISYRSLPPAAPPTTSNRHRRQIDRGVTHLNIS
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CCDS89 GLKMPRGIAIDWVAGNVYWTDSGRDVIEVAQMKGENRKTLISGMIDEPHAIVVDPLRGTM
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CCDS89 YWSDWGNHPKIETAAMDGTLRETLVQDNIQWPTGLAVDYHNERLYWADAKLSVIGSIRLN
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CCDS89 VVLYHQHKQPEVTNPCDRKK--CEWLCLLSPSGPVCTCPNG--KRLDNGTCVPVPSPTPP
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CCDS89 PDAPRPGTCNLQCFNGGSCFLNARRQP-KCRCQPRYTGDKCELDQCWEHCRNGGTCAASP
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CCDS89 Y--CE-NFGTCQMAA------DGSRQCRCTAYFEGS--RC-EVNKCS----RCLEGACVV
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CCDS89 NKQSGDVTCNCTDGRVAPSCLTCV-----------------------------GHCSNGG
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pF1KE3 VCMYIEALDKYACNCVVGYIGERCQYRDLKWWELRHAGHGQQQKVIVVAVCVVVLVMLLL
: . . :.: . : ::. .:. .::: .... . .:..:::
CCDS89 SCTMNSKM-MPECQCPPHMTGPRCE---------EHV-FSQQQPGHIASILIPLLLLLLL
4390 4400 4410 4420 4430
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pF1KE3 LSLWGAHYYRTQKLLSKNPKNPYEESSRDVRSRRPADTEDGMSSCPQPWFVVIKEHQDLK
. . :. .. ...
CCDS89 VLVAGVVFWYKRRVQGAKGFQHQRMTNGAMNVEIGNPTYKMYEGGEPDDVGGLLDADFAL
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::: . :::: :. : : ..::..
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550 560 570 580 590 600
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:: ....:. ::.::::.: .:::: : :.. ..: . .. : . . ....::.
CCDS89 RETILKDGIHNVEGVAVDWMGDNLYWTDDGPKKTISVARLEKAAQTRKTLIEGKMTHPRA
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610 620 630 640 650
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:.: :. ..::: .: :.: . ..: : . ..:. ..::.:...:. . .
CCDS89 IVVDPLNGWMYWTDWEEDPKDSRRGRLERAWMDGSHRDIFVTSKTVLWPNGLSLDIPAGR
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660 670 680 690 700 710
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::: :: . :: :.:. :. . .. ...: :.. .:...... :: :... .
CCDS89 LYWVDAFYDRIETILLNGTDRKIVYEGPELNHAFGLCHHGNYLFWTEYRSGSVYRLERGV
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720 730 740 750 760 770
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: : : : : . .. . :.. : .:::: .: :. :.: :
CCDS89 GGAPPTVTLLRSERPPIFEIRMYDAQQQQVGTNKCRVNNGGCSSLCLATPGSRQCACAED
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780 790 800 810 820
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. .:: :::: .. :: :. . . .. :: :. :
CCDS89 QVLDADGVTCLANPSYVPPPQCQPGEFACANSRCIQERWKCDGDNDCLDNSDEAPALCHQ
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830 840 850 860 870
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: .. . ... : : :. : :: : .:::. : . :. . : :.
CCDS89 HTCPSDRFKCENNRCIPNRWLCDGDNDCGNSEDESNATCSARTCPPNQFSCASGRCIPIS
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880 890 900 910 920
pF1KE3 -ECEMGVPVCPPASSKCINTEGGY-VCRCSEGYQGDGIHCLDID-ECQLGVHSCGEN---
:.. : :.. . .: .: . .. .:..:. .:. . ..::.:
CCDS89 WTCDLDDD-CGDRSDESASC--AYPTCFPLTQFTCNNGRCININWRCD-NDNDCGDNSDE
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pF1KE3 ASCTNTEGGYTCMC-AGRLSEPGLICPDSTPPPHLREDDHHYSVRNSDSECPLS-H-DGY
:.:... .. : .:: : :. :. : . :. .. : . : : .
CCDS89 AGCSHSCSSTQFKCNSGRCIPEHWTC-DGDNDCGDYSDETHANCTNQATRPPGGCHTDEF
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pF1KE3 -CLHDGVCMYIEALDKYACNCVVGYIGERCQYRDLKWWELRHAGHGQQQKVIVVAVCVVV
: ::.:.
CCDS89 QCRLDGLCIPLRWRCDGDTDCMDSSDEKSCEGVTHVCDPSVKFGCKDSARCISKAWVCDG
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:.:.:. . :.. : :::.: ..:.
CCDS89 PVQPFEDPEHMKNVIALAFDYRAGTSPGTPNRIFFSDIHFGNIQQINDDGSRRITIVEN-
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: :::: .:::. : : : .. : . .:.. ..::....
CCDS89 VGSVEGLAYHRGWDTLYWTSYTTSTITRHTVDQTRPGAFERETVITMSGDDHPRAFVLDE
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CCDS89 CQNLMFWTNWNEQHPSIMRAALSGANVLTLIEKDIRTPNGLAIDHRAEKLYFSDATLDKI
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: . :::.: . ... :::..::. ......::. .: :.::..:.. :. ..
CCDS89 ERCEYDGSHRYVILKSEPVHPFGLAVYGEHIFWTDWVRRAVQRANKHVGSNMKLLRVDIP
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CCDS89 QQPMGIIAVANDTNSCELSPCRINNGGCQDLCLLTHQGHVNCSCRGGRI-LQDDLTCRAV
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.. . : : . : . .. . .. :.. . . :..: : :.
CCDS89 NS-SCRAQDEFECANG----ECINFS-LTCDGVPHCK----------DKSDEKPSYCNSR
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:: . . :: .: .. : :. :.: : : .. : : :: .:
CCDS89 -RC----KKTFRQCSNGRCVSNMLWCNGADDCGDGSDEIPCNKTAC----GVGEFRCRDG
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:.. .: .. .:. . . .:. :.. ..: : : : :. .:
CCDS89 TCIGNSSRCNQFVDCEDASDEMNCSATDCSSYFRLGVKGVLFQPCE-RTSLCYAPSWVCD
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.. .. .:. .:::.. .: :. .. : . : :. :
CCDS89 GANDCGDYSDERDCPGVKRP--RCPLNYFACPSGRCIPMSWTCDKEDDCEHGE--DETHC
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: . .:: .: . : :
CCDS89 NKFCSEAQFECQNHRCISKQWLCDGSDDCGDGSDEAAHCEGKTCGPSSFSCPGTHVCVPE
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: : .: :. .. : . :. .: :. :.:. : :
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CCDS58 G----ADEAGCATWLNECLHNNGGCSHICTDLKIGFECTCPAGFQLL-DQKTCGDIDECK
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.:: .:::.:: . ..:.:.:::...: :.: ::.: .: :.:.: ...:.. .
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.:. :. . . : ::: . . :.::. . . : : :: . ..: ::.: .
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::::::::. ...:::: :.. :. . ..: : . . ..:.:.::.::: :. ..:.
CCDS58 SPEGLAVDWVHKHIYWTDSGNKTISVATVDGGRRRTLFSRNLSEPRAIAVDPLRGFMYWS
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: : . .::.:.:.:. : ...:... ::.:::.:.:...::: :.: . ...:..
CCDS58 DWGDQAKIEKSGLNGVDRQTLVSDNIEWPNGITLDLLSQRLYWVDSKLHQLSSIDFSGGN
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:. : ...: ..:::..::::: :...: ... .:. .: . : .. .: ..:.
CCDS58 RKTLISSTDFLSHPFGIAVFEDKVFWTDLENEAIFSANRLNGLEISILAENLNNPHDIVI
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: : .: : : : . :::::..: ... :.: . . . : : :
CCDS58 FHELKQPRAPDACELSVQPNGGCEYLCLPAPQISSHSPKYTCACPDTMWLGPDMKRCYRA
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CCDS58 PQSTSTTTLASTMTRTVPATTRAPGTTVHRSTYQNHSTETPSLTAAVPSSVSVPRAPSIS
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:: :. : .: :: . : :: .:: :.. :. :. .
CCDS57 ---SHKCVPASWR--CDGEKDCEGGADEA----GCATSLGTCRGDEFQCGDGTCVLAIKH
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:::. : : : : .: . ::: :. . : : :: : : : :::.
CCDS57 CNQEQDCPDGSDEAGCLQGLNECLHNNGGCSHICTDLKIGFECTCPAGFQLL-DQKTCGD
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pF1KE3 ---CSSPDNGGCSQLCVPLSPVSWECDCFPGYDLQLDEKSC-AASGPQPFLLFANSQDIR
:..:: .:::.:: . ..:.:.:::...: :.: ::.: .: :.:.: ...:
CCDS57 IDECKDPD--ACSQICVNYKGY-FKCECYPGYEMDLLTKNCKAAAGKSPSLIFTNRHEVR
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.. . .:. :. . . : ::: . . :.::. . . : : :: . ..: ::
CCDS57 RIDLVKRNYSRLIPM-LKNVVALDVEVATNRIYWCDLSYRKIYSAYMDKASDPKEQEVLI
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.: . ::::::::. ...:::: :.. :. . ..: : . . ..:.:.::.::: :.
CCDS57 DEQLHSPEGLAVDWVHKHIYWTDSGNKTISVATVDGGRRRTLFSRNLSEPRAIAVDPLRG
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..:.: : . .::.:.:.:. : ...:... ::.:::.:.:...::: :.: . .
CCDS57 FMYWSDWGDQAKIEKSGLNGVDRQTLVSDNIEWPNGITLDLLSQRLYWVDSKLHQLSSID
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..:..:. : ...: ..:::..::::: :...: ... .:. .: . : .. .:
CCDS57 FSGGNRKTLISSTDFLSHPFGIAVFEDKVFWTDLENEAIFSANRLNGLEISILAENLNNP
490 500 510 520 530 540
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pF1KE3 SSLVVVHPLAKPGA-DPC---LYQNGGCEHIC------KKRLGTAWCSCREGFMKASDGK
..:. : : .: : : : . :::::..: ... :.: . . . : :
CCDS57 HDIVIFHELKQPRAPDACELSVQPNGGCEYLCLPAPQISSHSPKYTCACPDTMWLGPDMK
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pF1KE3 TCLALDGHQLLAGGEVDLKNQVTPLDILSKTRVSEDNITESQHMLVAEIMVSDQDDCAPV
:
CCDS57 RCYRDANEDSKMGSTVTAAVIGIIVPIVVIALLCMSGYLIWRNWKRKNTKSMNFDNPVYR
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pF1KE3 KDMVRINLHSSFVPLGELKVVHPLAQPKAEDDTWEPEQKLCKLRKGNCSSTV---CGQDL
.: . .:: : : .... :.
CCDS30 ACGPREFRCGGDGGGACIPERWVCDRQFDCEDRSDEAAELCG-RPGPGATSAPAACATAS
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340 350 360 370 380
pF1KE3 QSHLCMCAE----GYALSRDRKYCEDVNECAFWNHGCTLG-CKNTP---GSYYCTCPVGF
: : .: :. . :: :.: .. : : :: :.. :. :. .
CCDS30 Q-FACRSGECVHLGWRCDGDRD-CKDKSDEA----DCPLGTCRGDEFQCGDGTCVLAIKH
270 280 290 300 310
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pF1KE3 VLL----PDGKR---CHQ-LVSCPRNVSECSHDCVLTSEGPLCFCPEGSVLERDGKTCSG
:::. : : : : .: . ::: :. . : : :: : : : :::.
CCDS30 CNQEQDCPDGSDEAGCLQGLNECLHNNGGCSHICTDLKIGFECTCPAGFQLL-DQKTCGD
320 330 340 350 360 370
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pF1KE3 ---CSSPDNGGCSQLCVPLSPVSWECDCFPGYDLQLDEKSC-AASGPQPFLLFANSQDIR
:..:: .:::.:: . ..:.:.:::...: :.: ::.: .: :.:.: ...:
CCDS30 IDECKDPD--ACSQICVNYKGY-FKCECYPGYEMDLLTKNCKAAAGKSPSLIFTNRHEVR
380 390 400 410 420 430
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pF1KE3 HMHFDGTDYGTLLSQQMGMVYALDHDPVENKIYFAHTALKWIERANMDGS----QRERLI
.. . .:. :. . . : ::: . . :.::. . . : : :: . ..: ::
CCDS30 RIDLVKRNYSRLIPM-LKNVVALDVEVATNRIYWCDLSYRKIYSAYMDKASDPKEQEVLI
440 450 460 470 480 490
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pF1KE3 EEGVDVPEGLAVDWIGRRFYWTDRGKSLIGRSDLNGKRSKIITKENISQPRGIAVHPMAK
.: . ::::::::. ...:::: :.. :. . ..: : . . ..:.:.::.::: :.
CCDS30 DEQLHSPEGLAVDWVHKHIYWTDSGNKTISVATVDGGRRRTLFSRNLSEPRAIAVDPLRG
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..:.: : . .::.:.:.:. : ...:... ::.:::.:.:...::: :.: . .
CCDS30 FMYWSDWGDQAKIEKSGLNGVDRQTLVSDNIEWPNGITLDLLSQRLYWVDSKLHQLSSID
560 570 580 590 600 610
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pF1KE3 LDGSKRRRL-TQND-VGHPFAVAVFEDYVWFSDWAMPSVIRVNKRTGKDRVRLQGSMLKP
..:..:. : ...: ..:::..::::: :...: ... .:. .: . : .. .:
CCDS30 FSGGNRKTLISSTDFLSHPFGIAVFEDKVFWTDLENEAIFSANRLNGLEISILAENLNNP
620 630 640 650 660 670
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pF1KE3 SSLVVVHPLAKPGA-DPC---LYQNGGCEHIC------KKRLGTAWCSCREGFMKASDGK
..:. : : .: : : : . :::::..: ... :.: . . . : :
CCDS30 HDIVIFHELKQPRAPDACELSVQPNGGCEYLCLPAPQISSHSPKYTCACPDTMWLGPDMK
680 690 700 710 720 730
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:
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CCDS57 FSGGNRKTLISSTDFLSHPFGIAVFEDKVFWTDLENEAIFSANRLNGLEISILAENLNNP
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:
CCDS57 RCYRAPQSTSTTTLASTMTRTVPATTRAPGTTVHRSTYQNHSTETPSLTAAVPSSVSVPR
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CCDS81 CDWVGKKLYWTDSETNRIEVANLNGTSRKVLFWQDLDQPRAIALDPAHGYMYWTDWGETP
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CCDS81 RIERAGMDGSTRKIIVDSDIYWPNGLTIDLEEQKLYWA----DAKLSFIHRANLDGSFRQ
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. . . ::..: :: .... :. ..: ::.:: :.
CCDS81 KVVEGSLTHPFALTLSGDTLYWTDWQTRSIHACNKRTG---------------GK-----
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:: :. .:.: .::..:.
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: : . ::.: :.:.. .: :. .. : .. . :.:.::.:. .:.. ..
CCDS81 A-GAEEVLLLARRTDLRRISLDTPDFTDIVLQVDDIRHAIAIDYDPLEGYVYWTDDEVRA
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..: . : : . : : .. :..:: .:::: :.: .. :.: :.
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20 30 40 50 60 70
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.
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]