Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3393
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3393, 1188 aa
1>>>pF1KE3393 1188 - 1188 aa - 1188 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5827+/-0.00125; mu= 3.4843+/- 0.076
mean_var=270.2130+/-52.721, 0's: 0 Z-trim(109.8): 61 B-trim: 9 in 1/54
Lambda= 0.078023
statistics sampled from 11106 (11149) to 11106 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.342), width: 16
Scan time: 5.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9733.1 ARID4A gene_id:5926|Hs108|chr14 (1188) 7675 878.7 0
CCDS45114.1 ARID4A gene_id:5926|Hs108|chr14 (1203) 7159 820.6 0
CCDS9732.1 ARID4A gene_id:5926|Hs108|chr14 (1257) 7153 820.0 0
CCDS31061.1 ARID4B gene_id:51742|Hs108|chr1 (1312) 2442 289.7 3.2e-77
CCDS31060.1 ARID4B gene_id:51742|Hs108|chr1 (1226) 1937 232.8 3.9e-60
>>CCDS9733.1 ARID4A gene_id:5926|Hs108|chr14 (1188 aa)
initn: 7675 init1: 7675 opt: 7675 Z-score: 4684.0 bits: 878.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7675; 100.0% identity (100.0% similar) in 1188 aa overlap (1-1188:1-1188)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 RVGAIVETRTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 RVGAIVETRTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 DQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSSLPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSSLPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VVSATERTEWYPALVISPSCNDDITVKKDQCLVRSFIDSKFYSIARKDIKEVDILNLPES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 VVSATERTEWYPALVISPSCNDDITVKKDQCLVRSFIDSKFYSIARKDIKEVDILNLPES
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ELSTKPGLQKASIFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKTEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 ELSTKPGLQKASIFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKTEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 EVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNID
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTVHHHEPKVKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTVHHHEPKVKEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 KKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIARDVNSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 KKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIARDVNSI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 KKEIEEEKTEDKLKDNDTENKDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKKQEDSDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 KKEIEEEKTEDKLKDNDTENKDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKKQEDSDK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 DSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKTQKIYEASIKSTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKTQKIYEASIKSTE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 IDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNKEDSEKDEKRDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 IDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNKEDSEKDEKRDEE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 RQKSKRGRPPLKSTLSSNMPYGLSKTANSEGKSDSCSSDSETEDALEKNLINEELSLKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 RQKSKRGRPPLKSTLSSNMPYGLSKTANSEGKSDSCSSDSETEDALEKNLINEELSLKDE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LEKNENLNDDKLDEENPKISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEKTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LEKNENLNDDKLDEENPKISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEKTE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 EVKKEAEKSPKGKGRRSKTKDLSLEIIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSSLDNKNFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EVKKEAEKSPKGKGRRSKTKDLSLEIIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSSLDNKNFSS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 ATEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGSEGMKNLNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 ATEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGSEGMKNLNF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 EQHFERENEGMPSLIAESNQCIQQLTSERFDSPAEETVNIPLKEDEDAMPLIGPETLVCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EQHFERENEGMPSLIAESNQCIQQLTSERFDSPAEETVNIPLKEDEDAMPLIGPETLVCH
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 EVDLDDLDEKDKTSIEDVAVESSESNSLVSIPPALPPVVQHNFSVASPLTLSQDESRSVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EVDLDDLDEKDKTSIEDVAVESSESNSLVSIPPALPPVVQHNFSVASPLTLSQDESRSVK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 SESDITIEVDSIAEESQEGLCERESANGFETNVASGTCSIIVQERESREKGQKRPSDGNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SESDITIEVDSIAEESQEGLCERESANGFETNVASGTCSIIVQERESREKGQKRPSDGNS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 GLMAKKQKRTPKRTSAAAKNEKNGTDELDNMNSTERISFLQEKLQEIRKYYMSLKSEVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 GLMAKKQKRTPKRTSAAAKNEKNGTDELDNMNSTERISFLQEKLQEIRKYYMSLKSEVAT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180
pF1KE3 IDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSSASSDTGMSPSSSSPPQNVLAVECR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 IDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSSASSDTGMSPSSSSPPQNVLAVECR
1150 1160 1170 1180
>>CCDS45114.1 ARID4A gene_id:5926|Hs108|chr14 (1203 aa)
initn: 7245 init1: 7153 opt: 7159 Z-score: 4370.0 bits: 820.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7629; 98.7% identity (98.8% similar) in 1203 aa overlap (1-1188:1-1203)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 RVGAIVETRTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RVGAIVETRTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 DQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSSLPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSSLPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VVSATERTEWYPALVISPSCNDDITVKKDQCLVRSFIDSKFYSIARKDIKEVDILNLPES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VVSATERTEWYPALVISPSCNDDITVKKDQCLVRSFIDSKFYSIARKDIKEVDILNLPES
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ELSTKPGLQKASIFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKTEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ELSTKPGLQKASIFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKTEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 EVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNID
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTVHHHEPKVKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTVHHHEPKVKEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 KKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIARDVNSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIARDVNSI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 KKEIEEEKTEDKLKDNDTENKDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKKQEDSDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KKEIEEEKTEDKLKDNDTENKDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKKQEDSDK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 DSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKTQKIYEASIKSTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKTQKIYEASIKSTE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 IDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNKEDSEKDEKRDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNKEDSEKDEKRDEE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 RQKSKRGRPPLKSTLSSNMPYGLSKTANSEGKSDSCSSDSETEDALEKNLINEELSLKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RQKSKRGRPPLKSTLSSNMPYGLSKTANSEGKSDSCSSDSETEDALEKNLINEELSLKDE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LEKNENLNDDKLDEENPKISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEKTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LEKNENLNDDKLDEENPKISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEKTE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 EVKKEAEKSPKGKGRRSKTKDLSLEIIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSSLDNKNFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EVKKEAEKSPKGKGRRSKTKDLSLEIIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSSLDNKNFSS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 ATEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGSEGMKNLNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ATEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGSEGMKNLNF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 EQHFERENEGMPSLIAESNQCIQQLTSERFDSPAEETVNIPLKEDEDAMPLIGPETLVCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EQHFERENEGMPSLIAESNQCIQQLTSERFDSPAEETVNIPLKEDEDAMPLIGPETLVCH
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 EVDLDDLDEKDKTSIEDVAVESSESNSLVSIPPALPPVVQHNFSVASPLTLSQDESRSVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EVDLDDLDEKDKTSIEDVAVESSESNSLVSIPPALPPVVQHNFSVASPLTLSQDESRSVK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 SESDITIEVDSIAEESQEGLCERESANGFETNVASGTCSIIVQERESREKGQKRPSDGNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SESDITIEVDSIAEESQEGLCERESANGFETNVASGTCSIIVQERESREKGQKRPSDGNS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120
pF1KE3 GLMAKKQKRTPKRTSAAAKNEKNGT---------------DELDNMNSTERISFLQEKLQ
::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::::::
CCDS45 GLMAKKQKRTPKRTSAAAKNEKNGTGQSSDSEDLPVLDNSNELDNMNSTERISFLQEKLQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE3 EIRKYYMSLKSEVATIDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSSASSDTGMSPSSSSPPQNVLAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EIRKYYMSLKSEVATIDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSSASSDTGMSPSSSSPPQNVLAV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 ECR
:::
CCDS45 ECR
>>CCDS9732.1 ARID4A gene_id:5926|Hs108|chr14 (1257 aa)
initn: 7153 init1: 7153 opt: 7153 Z-score: 4366.1 bits: 820.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7282; 94.3% identity (94.3% similar) in 1220 aa overlap (1-1151:1-1220)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 RVGAIVETRTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 RVGAIVETRTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 DQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSSLPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSSLPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VVSATERTEWYPALVISPSCNDDITVKKDQCLVRSFIDSKFYSIARKDIKEVDILNLPES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 VVSATERTEWYPALVISPSCNDDITVKKDQCLVRSFIDSKFYSIARKDIKEVDILNLPES
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ELSTKPGLQKASIFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKTEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 ELSTKPGLQKASIFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKTEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 EVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNID
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTVHHHEPKVKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTVHHHEPKVKEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 KKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIARDVNSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 KKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIARDVNSI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 KKEIEEEKTEDKLKDNDTENKDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKKQEDSDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 KKEIEEEKTEDKLKDNDTENKDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKKQEDSDK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 DSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKTQKIYEASIKSTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKTQKIYEASIKSTE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 IDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNKEDSEKDEKRDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 IDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNKEDSEKDEKRDEE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 RQKSKRGRPPLKSTLSSNMPYGLSKTANSEGKSDSCSSDSETEDALEKNLINEELSLKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 RQKSKRGRPPLKSTLSSNMPYGLSKTANSEGKSDSCSSDSETEDALEKNLINEELSLKDE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LEKNENLNDDKLDEENPKISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEKTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LEKNENLNDDKLDEENPKISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEKTE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 EVKKEAEKSPKGKGRRSKTKDLSLEIIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSSLDNKNFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EVKKEAEKSPKGKGRRSKTKDLSLEIIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSSLDNKNFSS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 ATEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGSEGMKNLNF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EQHFERENEGMPSLIAESNQCIQQLTSERFDSPAEETVNIPLKEDEDAMPLIGPETLVCH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EVDLDDLDEKDKTSIEDVAVESSESNSLVSIPPALPPVVQHNFSVASPLTLSQDESRSVK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SESDITIEVDSIAEESQEGLCERESANGFETNVASGTCSIIVQERESREKGQKRPSDGNS
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1090 1100
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:::::::::::::::::::::::::
CCDS97 GLMAKKQKRTPKRTSAAAKNEKNGTGQSSDSEDLPVLDNSSKCTPVKHLNVSKPQKLARS
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1110 1120 1130
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.:::::::::::::::::::::::::
CCDS97 PARISPHIKDGEKDKHREKHPNSSPRTYKWSFQLNELDNMNSTERISFLQEKLQEIRKYY
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::::::::::::::::::::
CCDS97 MSLKSEVATIDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSSASSDTGMSPSSSSPPQNVLAVECR
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CCDS31 APKPDAVLKQAFEQALEFHKSRTIPANWKTELKE--DSSSSEAEE-EEEEEDDEKEKEDN
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CCDS31 GFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVKCAYKKYLYGFEEYCRSANIEFQMALP-E
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pF1KE3 PKVKEEKKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESERE-EIE----LKSPRG
:... :. :. : .: ..: . :.: : :.:: :. : ::: .: :
CCDS31 KVVNKQCKECENVKEIKVKEENETEIKEIKMEEERNIIPREEKPIEDEIERKENIKPSLG
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pF1KE3 RRRIARDVNSIKKEIEEEKTEDKLKDNDTEN-KDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQK
.. ..:: . ..:: . : .:.:: : ::: .... : . .... :.
CCDS31 SKKNL--LESIPTHSDQEKEVNIKKPEDNENLDDKDDDTTRVDESLNIKVEAEEEKAKSG
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pF1KE3 EKKIKKQEDSDKDSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKT
.. .:.:: : . ::::. .:.:: :. :.. ::. : . : : ::.:.:::::.
CCDS31 DET-NKEEDEDDEEAEEEEEEEEEEEDEDDDDNNEEEEFECYPP---GMKVQVRYGRGKN
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pF1KE3 QKIYEASIKSTEIDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNK
::.::::::..... ::::::::: :::::::::.:::.:. : ::. :: :..:: :::
CCDS31 QKMYEASIKDSDVEGGEVLYLVHYCGWNVRYDEWIKADKIVRPADKNVPKIKHRKKIKNK
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pF1KE3 EDSEKD--EKRDEERQKSKR-GRPPLKSTLSSNM--PYGLSKTANSEGK-----------
:.::: :: . . : .: ..::.... : .: :. . ::.
CCDS31 LDKEKDKDEKYSPKNCKLRRLSKPPFQTNPSPEMVSKLDLTDAKNSDTAHIKSIEITSIL
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pF1KE3 -----SDSCSSDSETED---ALEKNLINEELSLKDELEKNEN-------LNDDKLDEENP
:.: . ::: :: : . . ..: : :.: .:.: :...: :::
CCDS31 NGLQASESSAEDSEQEDERGAQDMDNNGKEESKIDHLTNNRNDLISKEEQNSSSLLEENK
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pF1KE3 K-----ISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEKTEEVKKEA-EKSPK
:: . : .: . . .:.:. .. .:. : .: ..:::.. .:: :
CCDS31 VHADLVISKPVSKSPERLR-KDIEVLSEDTDYEEDEVT------KKRKDVKKDTTDKSSK
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pF1KE3 GKGRRSKTKDLSLE-IIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSSLDNKNFSSATEDEIDQCV
. .:.: . . : .: .: :..: .:.. : ..:.. ::. ::: . .
CCDS31 PQIKRGKRRYCNTEECLKTGSPGKKEE------KAKNKESLCMENSSNSSSDEDEEETKA
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pF1KE3 KEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGSEGMKNLNFEQHFERENEG
: : : : .:..: . . . :...: . .:. . :. . .:..
CCDS31 KMTPTK-KYNGLEEKRKSLRTTGFYSGFSEVAEKRIKLLNNSD--ERLQNSRAKDRKDVW
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pF1KE3 MPSLIAESNQCIQQLTSERFDSPAEETVNIPLKED---EDAMPLIGPETLVCHEVDLD--
.. ...: :. :. : . : :. :... .. : :.:.
CCDS31 SSIQGQWPKKTLKELFSDS-DTEAAASPPHPAPEEGVAEESLQTVAEEESCSPSVELEKP
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970 980 990 1000
pF1KE3 ---DLDEK---DKT-SIEDVAVE--SSESNSLVSIPPALP--PVV---------QHNFSV
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CCDS31 PPVNVDSKPIEEKTVEVNDRKAEFPSSGSNSVLNTPPTTPESPSSVTVTEGSRQQSSVTV
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1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE3 ASPLTLSQDESRSVKSESDITIEVDSIAEESQEGLCERESA-NGFETNVASGTCSIIVQE
. ::. .:.: ::.:::.: ::::::.: : :. : .:. ::...:.:.. . :
CCDS31 SEPLAPNQEEVRSIKSETDSTIEVDSVAGELQDLQSEGNSSPAGFDASVSSSSSNQPEPE
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1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE3 R-ESREKGQKRPSDGNSG-LMAKKQKRTPKRTSAAAKNEKNGTDELDN--MNSTERISFL
. :. :::: .:...: .:::::. : : . :.. .::. :. ... : :.
CCDS31 HPEKACTGQKRVKDAQGGGSSSKKQKRSHKATVVNNKKKGKGTNSSDSEELSAGESIT--
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pF1KE3 QEKLQEIRKYYMSLKSEVATIDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSSASSDTGMSPSSSSPPQ
: : ... ..::
CCDS31 --KSQPVKSVSTGMKSHSTKSPARTQSPGKCGKNGDKDPDLKEPSNRLPKVYKWSFQMSD
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CCDS31 MKALDEPPYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTAKRLVKVKVTFRHDSSTVEVQDDHIKGPL
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CCDS31 KVGAIVEVKNLDGAYQEAVINKLTDASWYTVVFDDGDEKTLRRSSLCLKGERHFAESETL
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CCDS31 CVDYISLDKKKALWFPALVVCPDCSDEIAVKKDNILVRSFKDGKFTSVPRKDVHEITSDT
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CCDS31 APKPDAVLKQAFEQALEFHKSRTIPANWKTELKE--DSSSSEAEE-EEEEEDDEKEKEDN
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pF1KE3 PKVKEEKKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIA
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CCDS31 KVVNKQCKECENVKEIKVKEENETEIKEIKMEEERNI---------------------IP
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pF1KE3 RDVNSIKKEIEEEKTEDKLKDNDTENKDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKK
:. . :. :::.. ...: . .:.. .. : .. ..:: .:::
CCDS31 REEKPIEDEIERK---ENIKPSLGSKKNLLESIPT-------------HSDQEKEVNIKK
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pF1KE3 QEDSDKDSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKTQKIYEA
::... .:.... .. : . : ..: : :.: :
CCDS31 PEDNENLDDKDDDTTRVDESLNIKVEAEEE---------------KAKSG----------
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pF1KE3 SIKSTEIDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNKEDSEKD
::::.:::.:. : ::. :: :..:: ::: :.:::
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pF1KE3 --EKRDEERQKSKR-GRPPLKSTLSSNMPYGL-------SKTA-----------NSEGKS
:: . . : .: ..::.... : .: : : :: :. :
CCDS31 KDEKYSPKNCKLRRLSKPPFQTNPSPEMVSKLDLTDAKNSDTAHIKSIEITSILNGLQAS
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pF1KE3 DSCSSDSETED---ALEKNLINEELSLKDELEKNEN-------LNDDKLDEENPK-----
.: . ::: :: : . . ..: : :.: .:.: :...: :::
CCDS31 ESSAEDSEQEDERGAQDMDNNGKEESKIDHLTNNRNDLISKEEQNSSSLLEENKVHADLV
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pF1KE3 ISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEKTEEVKKEA-EKSPKGKGRRS
:: . : .: . . .:.:. .. .:. : .: ..:::.. .:: : . .:.
CCDS31 ISKPVSKSPERLR-KDIEVLSEDTDYEEDEVT------KKRKDVKKDTTDKSSKPQIKRG
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pF1KE3 KTKDLSLE-IIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSSLDNKNFSSATEDEIDQCVKEKKLK
: . . : .: .: :..: .:.. : ..:.. ::. ::: . .: :
CCDS31 KRRYCNTEECLKTGSPGKKEE------KAKNKESLCMENSSNSSSDEDEEETKAKMTPTK
740 750 760 770 780 790
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pF1KE3 RKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGSEGMKNLNFEQHFERENEGMPSLIA
: : .:..: . . . :...: . .:. . :. . .:..
CCDS31 -KYNGLEEKRKSLRTTGFYSGFSEVAEKRIKLLNNSD--ERLQNSRAKDRKDVWSSIQGQ
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.. ...: :. :. : . : :. :... .. : :.:. ..:
CCDS31 WPKKTLKELFSDS-DTEAAASPPHPAPEEGVAEESLQTVAEEESCSPSVELEKPPPVNVD
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pF1KE3 EK---DKT-SIEDVAVE--SSESNSLVSIPPALP--PVV---------QHNFSVASPLTL
: .:: ..: .: :: :::... ::. : : : . .:. ::.
CCDS31 SKPIEEKTVEVNDRKAEFPSSGSNSVLNTPPTTPESPSSVTVTEGSRQQSSVTVSEPLAP
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.:.: ::.:::.: ::::::.: : :. : .:. ::...:.:.. . :. :.
CCDS31 NQEEVRSIKSETDSTIEVDSVAGELQDLQSEGNSSPAGFDASVSSSSSNQPEPEHPEKAC
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:::: .:...: .:::::.
CCDS31 TGQKRVKDAQGGGSSSKKQKRSHKATVVNNKKKGKGTNSSDSEELSAGESITKSQPVKSV
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pF1KE3 -----------PKRTSAAAKNEKNGT----------------------DELDNMNSTERI
: ::.. .: ::: ..:.::.:.:::
CCDS31 STGMKSHSTKSPARTQSPGKCGKNGDKDPDLKEPSNRLPKVYKWSFQMSDLENMTSAERI
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pF1KE3 SFLQEKLQEIRKYYMSLKSEVATIDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSSASSDTGMSPSSSS
..::::::::::.:.:::::::.:::::::::::.:: :.:.:... ::::::
CCDS31 TILQEKLQEIRKHYLSLKSEVASIDRRRKRLKKKERE--------SAATSSSSSSPSSSS
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1180
pF1KE3 PPQNVLAVECR
:.
CCDS31 ITAAVMLTLAEPSMSSASQNGMSVECR
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]