Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3426
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3426, 593 aa
1>>>pF1KE3426 593 - 593 aa - 593 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1575+/-0.000767; mu= 16.1100+/- 0.046
mean_var=102.9840+/-20.673, 0's: 0 Z-trim(111.4): 76 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.126383
statistics sampled from 12270 (12347) to 12270 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.727), E-opt: 0.2 (0.379), width: 16
Scan time: 3.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2747.1 PTH1R gene_id:5745|Hs108|chr3 ( 593) 4040 747.2 1.4e-215
CCDS2383.1 PTH2R gene_id:5746|Hs108|chr2 ( 550) 1684 317.6 2.7e-86
CCDS82565.1 PTH2R gene_id:5746|Hs108|chr2 ( 439) 1413 268.1 1.7e-71
CCDS58827.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 409) 736 144.6 2.3e-34
CCDS58828.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 416) 736 144.6 2.3e-34
CCDS2698.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 457) 736 144.7 2.5e-34
CCDS2127.1 SCTR gene_id:6344|Hs108|chr2 ( 440) 734 144.3 3.1e-34
CCDS5433.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 468) 688 135.9 1.1e-31
CCDS56481.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 447) 674 133.4 6.2e-31
CCDS45712.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 444) 670 132.6 1e-30
CCDS54177.1 GCGR gene_id:2642|Hs108|chr17 ( 477) 594 118.8 1.6e-26
CCDS55125.1 CALCR gene_id:799|Hs108|chr7 ( 508) 588 117.7 3.6e-26
CCDS5631.1 CALCR gene_id:799|Hs108|chr7 ( 474) 570 114.4 3.3e-25
CCDS11150.1 GLP2R gene_id:9340|Hs108|chr17 ( 553) 559 112.5 1.5e-24
CCDS4839.1 GLP1R gene_id:2740|Hs108|chr6 ( 463) 557 112.0 1.7e-24
CCDS5432.1 GHRHR gene_id:2692|Hs108|chr7 ( 423) 540 108.9 1.3e-23
CCDS77049.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 314) 520 105.2 1.3e-22
CCDS45714.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 375) 520 105.2 1.5e-22
CCDS2293.1 CALCRL gene_id:10203|Hs108|chr2 ( 461) 521 105.5 1.6e-22
CCDS56477.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 397) 520 105.2 1.6e-22
CCDS5429.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 411) 520 105.2 1.7e-22
CCDS42350.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 415) 520 105.2 1.7e-22
CCDS56478.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 438) 520 105.3 1.7e-22
CCDS58556.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 240) 516 104.3 1.8e-22
CCDS58829.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 247) 501 101.6 1.2e-21
CCDS75576.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 387) 466 95.4 1.4e-19
CCDS56480.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 496) 410 85.2 2.1e-16
CCDS12671.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 ( 466) 400 83.4 7e-16
CCDS45713.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 401) 390 81.5 2.2e-15
CCDS5950.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs108|chr7 ( 438) 387 81.0 3.5e-15
CCDS82367.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 ( 430) 326 69.9 7.6e-12
CCDS9272.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 874) 319 68.8 3.2e-11
CCDS81753.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 906) 319 68.8 3.3e-11
>>CCDS2747.1 PTH1R gene_id:5745|Hs108|chr3 (593 aa)
initn: 4040 init1: 4040 opt: 4040 Z-score: 3984.0 bits: 747.2 E(32554): 1.4e-215
Smith-Waterman score: 4040; 100.0% identity (100.0% similar) in 593 aa overlap (1-593:1-593)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGTARIAPGLALLLCCPVLSSAYALVDADDVMTKEEQIFLLHRAQAQCEKRLKEVLQRPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MGTARIAPGLALLLCCPVLSSAYALVDADDVMTKEEQIFLLHRAQAQCEKRLKEVLQRPA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 SIMESDKGWTSASTSGKPRKDKASGKLYPESEEDKEAPTGSRYRGRPCLPEWDHILCWPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SIMESDKGWTSASTSGKPRKDKASGKLYPESEEDKEAPTGSRYRGRPCLPEWDHILCWPL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 GAPGEVVAVPCPDYIYDFNHKGHAYRRCDRNGSWELVPGHNRTWANYSECVKFLTNETRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 GAPGEVVAVPCPDYIYDFNHKGHAYRRCDRNGSWELVPGHNRTWANYSECVKFLTNETRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 REVFDRLGMIYTVGYSVSLASLTVAVLILAYFRRLHCTRNYIHMHLFLSFMLRAVSIFVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 REVFDRLGMIYTVGYSVSLASLTVAVLILAYFRRLHCTRNYIHMHLFLSFMLRAVSIFVK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DAVLYSGATLDEAERLTEEELRAIAQAPPPPATAAAGYAGCRVAVTFFLYFLATNYYWIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 DAVLYSGATLDEAERLTEEELRAIAQAPPPPATAAAGYAGCRVAVTFFLYFLATNYYWIL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 VEGLYLHSLIFMAFFSEKKYLWGFTVFGWGLPAVFVAVWVSVRATLANTGCWDLSSGNKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 VEGLYLHSLIFMAFFSEKKYLWGFTVFGWGLPAVFVAVWVSVRATLANTGCWDLSSGNKK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 WIIQVPILASIVLNFILFINIVRVLATKLRETNAGRCDTRQQYRKLLKSTLVLMPLFGVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 WIIQVPILASIVLNFILFINIVRVLATKLRETNAGRCDTRQQYRKLLKSTLVLMPLFGVH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 YIVFMATPYTEVSGTLWQVQMHYEMLFNSFQGFFVAIIYCFCNGEVQAEIKKSWSRWTLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 YIVFMATPYTEVSGTLWQVQMHYEMLFNSFQGFFVAIIYCFCNGEVQAEIKKSWSRWTLA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 LDFKRKARSGSSSYSYGPMVSHTSVTNVGPRVGLGLPLSPRLLPTATTNGHPQLPGHAKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LDFKRKARSGSSSYSYGPMVSHTSVTNVGPRVGLGLPLSPRLLPTATTNGHPQLPGHAKP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE3 GTPALETLETTPPAMAAPKDDGFLNGSCSGLDEEASGPERPPALLQEEWETVM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 GTPALETLETTPPAMAAPKDDGFLNGSCSGLDEEASGPERPPALLQEEWETVM
550 560 570 580 590
>>CCDS2383.1 PTH2R gene_id:5746|Hs108|chr2 (550 aa)
initn: 1384 init1: 1022 opt: 1684 Z-score: 1662.8 bits: 317.6 E(32554): 2.7e-86
Smith-Waterman score: 1684; 56.6% identity (78.3% similar) in 442 aa overlap (108-537:63-495)
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 PRKDKASGKLYPESEEDKEAPTGSRYRGRPCLPEWDHILCWPLGAPGEVVAVPCPDYIYD
:.:::: ..::: :. :.. ::::: ::::
CCDS23 TIEEQIVLVLKAKVQCELNITAQLQEGEGNCFPEWDGLICWPRGTVGKISAVPCPPYIYD
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 FNHKGHAYRRCDRNGSWELVPGHNRTWANYSECVKFLTNETR--EREVFDRLGMIYTVGY
::::: :.:.:. ::.:... . :.::::::.:..:: . ..: :.:: ..:::::
CCDS23 FNHKGVAFRHCNPNGTWDFMHSLNKTWANYSDCLRFLQPDISIGKQEFFERLYVMYTVGY
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 SVSLASLTVAVLILAYFRRLHCTRNYIHMHLFLSFMLRAVSIFVKDAVLYSGATLDEAER
:.:..::.::.::..:::::::::::::::::.::::::.:::::: :... . : :
CCDS23 SISFGSLAVAILIIGYFRRLHCTRNYIHMHLFVSFMLRATSIFVKDRVVHAHIGVKELES
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 LTEEELRAIAQAPPPPATAAAG-----YAGCRVAVTFFLYFLATNYYWILVEGLYLHSLI
: : : : . :.. : ::..::..:.::::::::::::::::::.::
CCDS23 L-------IMQDDPQNSIEATSVDKSQYIGCKIAVVMFIYFLATNYYWILVEGLYLHNLI
220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 FMAFFSEKKYLWGFTVFGWGLPAVFVAVWVSVRATLANTGCWDLSSGNKKWIIQVPILAS
:.::::. :::::: ..:::.::.:::.:. .:::::.. ::.::.:. ::: :.::::.
CCDS23 FVAFFSDTKYLWGFILIGWGFPAAFVAAWAVARATLADARCWELSAGDIKWIYQAPILAA
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 IVLNFILFINIVRVLATKLRETNAGRCDTRQQYRKLLKSTLVLMPLFGVHYIVFMATPYT
: ::::::.: :::::::. :::: :::.::::: ::::::. .::::::::. :..
CCDS23 IGLNFILFLNTVRVLATKIWETNAVGHDTRKQYRKLAKSTLVLVLVFGVHYIVFVCLPHS
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 EVSGTLWQVQMHYEMLFNSFQGFFVAIIYCFCNGEVQAEIKKSWSRWTLALDFKRKARSG
.: :...:: :..:::::::::.::::.::::::::.:: ::::.:..:.:: :
CCDS23 -FTGLGWEIRMHCELFFNSFQGFFVSIIYCYCNGEVQAEVKKMWSRWNLSVDWKRTPPCG
390 400 410 420 430 440
500 510 520 530 540
pF1KE3 SSSY-SYGPMVSHT--SVTNVGPRVGLGLPLSPRLLPTATT--NGHPQLPGHAKPGTPAL
: : :.:. : ..:. . . : .: . :. ..: :::.
CCDS23 SRRCGSVLTTVTHSTSSQSQVAASTRMVL-ISGKAAKIASRQPDSHITLPGYVWSNSEQD
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590
pF1KE3 ETLETTPPAMAAPKDDGFLNGSCSGLDEEASGPERPPALLQEEWETVM
CCDS23 CLPHSFHEETKEDSGRQGDDILMEKPSRPMESNPDTEGCQGETEDVL
510 520 530 540 550
>>CCDS82565.1 PTH2R gene_id:5746|Hs108|chr2 (439 aa)
initn: 1032 init1: 751 opt: 1413 Z-score: 1397.1 bits: 268.1 E(32554): 1.7e-71
Smith-Waterman score: 1413; 56.6% identity (77.6% similar) in 389 aa overlap (161-537:5-384)
140 150 160 170 180
pF1KE3 CPDYIYDFNHKGHAYRRCDRNGSWELVPGHNRTWANYSECVKFLTNETR--EREVFDRLG
:.::::::.:..:: . ..: :.::
CCDS82 MHSLNKTWANYSDCLRFLQPDISIGKQEFFERLY
10 20 30
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 MIYTVGYSVSLASLTVAVLILAYFRRLHCTRNYIHMHLFLSFMLRAVSIFVKDAVLYSGA
..::::::.:..::.::.::..:::::::::::::::::.::::::.:::::: :...
CCDS82 VMYTVGYSISFGSLAVAILIIGYFRRLHCTRNYIHMHLFVSFMLRATSIFVKDRVVHAHI
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 TLDEAERLTEEELRAIAQAPPPPATAAAG-----YAGCRVAVTFFLYFLATNYYWILVEG
. : : : : : : . :.. : ::..::..:.::::::::::::::
CCDS82 GVKELESL-------IMQDDPQNSIEATSVDKSQYIGCKIAVVMFIYFLATNYYWILVEG
100 110 120 130 140
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LYLHSLIFMAFFSEKKYLWGFTVFGWGLPAVFVAVWVSVRATLANTGCWDLSSGNKKWII
::::.:::.::::. :::::: ..:::.::.:::.:. .:::::.. ::.::.:. :::
CCDS82 LYLHNLIFVAFFSDTKYLWGFILIGWGFPAAFVAAWAVARATLADARCWELSAGDIKWIY
150 160 170 180 190 200
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 QVPILASIVLNFILFINIVRVLATKLRETNAGRCDTRQQYRKLLKSTLVLMPLFGVHYIV
:.::::.: ::::::.: :::::::. :::: :::.::::: ::::::. .:::::::
CCDS82 QAPILAAIGLNFILFLNTVRVLATKIWETNAVGHDTRKQYRKLAKSTLVLVLVFGVHYIV
210 220 230 240 250 260
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 FMATPYTEVSGTLWQVQMHYEMLFNSFQGFFVAIIYCFCNGEVQAEIKKSWSRWTLALDF
:. :.. .: :...:: :..:::::::::.::::.::::::::.:: ::::.:..:.
CCDS82 FVCLPHS-FTGLGWEIRMHCELFFNSFQGFFVSIIYCYCNGEVQAEVKKMWSRWNLSVDW
270 280 290 300 310 320
490 500 510 520 530
pF1KE3 KRKARSGSSSY-SYGPMVSHT--SVTNVGPRVGLGLPLSPRLLPTATT--NGHPQLPGHA
:: :: : :.:. : ..:. . . : .: . :. ..: :::.
CCDS82 KRTPPCGSRRCGSVLTTVTHSTSSQSQVAASTRMVL-ISGKAAKIASRQPDSHITLPGYV
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 KPGTPALETLETTPPAMAAPKDDGFLNGSCSGLDEEASGPERPPALLQEEWETVM
CCDS82 WSNSEQDCLPHSFHEETKEDSGRQGDDILMEKPSRPMESNPDTEGCQGETEDVL
390 400 410 420 430
>>CCDS58827.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 (409 aa)
initn: 956 init1: 461 opt: 736 Z-score: 730.5 bits: 144.6 E(32554): 2.3e-34
Smith-Waterman score: 1050; 40.4% identity (67.1% similar) in 423 aa overlap (100-511:4-397)
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TSASTSGKPRKDKASGKLYPESEEDKEAPTGSRYRGRP----CLPEWDHILCWPLGAPGE
: : : : : ::.. ::: :.
CCDS58 MRAGRRPRLGPWAGGCSKMWDNLTCWPATPRGQ
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VVAVPCPDYIYDFNH-KG-HAYRRCDRNGSWELVPGHNRTWANYSECVKFLTNETREREV
::.. :: . :. .: .. : : .: .: :: . .. . : ..:
CCDS58 VVVLACPLIFKLFSSIQGRNVSRSCTDEGWTHLEPGPYPIACGLDDKAASLDEQTM---F
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 FDRLGMIYTVGYSVSLASLTVAVLILAYFRRLHCTRNYIHMHLFLSFMLRAVSIFVKDAV
. . ::.::..:::.: ::. ::. ::.:::::::::::::.::.:::...:.:: .
CCDS58 YGSVKTGYTIGYGLSLATLLVATAILSLFRKLHCTRNYIHMHLFISFILRAAAVFIKDLA
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LYSGATLDEAERLTEEELRAIAQAPPPPATAAAGYAGCRVAVTFFLYFLATNYYWILVEG
:.... :... .: : .::..:..:: : . .:..:.::::
CCDS58 LFDSG---ESDQCSE------------------GSVGCKAAMVFFQYCVMANFFWLLVEG
160 170 180
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LYLHSLIFMAFFSEKKYLWGFTVFGWGLPAVFVAVWVSVRATLANTGCWDLSSGNKKWII
:::..:. ..::::.::.::. ..:::.:..:. ::. .: . . :::: ... :::
CCDS58 LYLYTLLAVSFFSERKYFWGYILIGWGVPSTFTMVWTIARIHFEDYGCWDTINSSLWWII
190 200 210 220 230 240
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 QVPILASIVLNFILFINIVRVLATKLRETNAGRCDTRQQYRKLLKSTLVLMPLFGVHYIV
. :::.::..:::::: :.:.: ::: . . :. . : .: .:::.:.::::::::.
CCDS58 KGPILTSILVNFILFICIIRILLQKLRPPDIRKSDS-SPYSRLARSTLLLIPLFGVHYIM
250 260 270 280 290 300
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 FMATPYTEVSGTLWQVQMHYEMLFNSFQGFFVAIIYCFCNGEVQAEIKKSWSRWTL--AL
: : .. .:.: .:.. .::::: :::.::: :::::::....: :: : .:
CCDS58 FAFFP----DNFKPEVKMVFELVVGSFQGFVVAILYCFLNGEVQAELRRKWRRWHLQGVL
310 320 330 340 350 360
490 500 510 520 530
pF1KE3 DFKRKAR---SGSSSYSYGPMVSHTSVTNVGPRVGLGLPLSPRLLPTATTNGHPQLPGHA
.. : : .::.. . . .:: . .. : :
CCDS58 GWNPKYRHPSGGSNGATCSTQVSMLTRVSPGARRSSSFQAEVSLV
370 380 390 400
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 KPGTPALETLETTPPAMAAPKDDGFLNGSCSGLDEEASGPERPPALLQEEWETVM
>>CCDS58828.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 (416 aa)
initn: 892 init1: 461 opt: 736 Z-score: 730.4 bits: 144.6 E(32554): 2.3e-34
Smith-Waterman score: 1047; 40.4% identity (68.1% similar) in 411 aa overlap (108-511:22-404)
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 PRKDKASGKLYPESEEDKEAPTGSRYRGRPCLPEWDHILCWPLGAPGEVVAVPCPDYIYD
: ::.. ::: :.::.. :: .
CCDS58 MIEVQHKQCLEEAQLENETIGCSKMWDNLTCWPATPRGQVVVLACPLIFKL
10 20 30 40 50
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 FNH-KG-HAYRRCDRNGSWELVPGHNRTWANYSECVKFLTNETREREVFDRLGMIYTVGY
:. .: .. : : .: .: :: . .. : . . .. . . ::.::
CCDS58 FSSIQGRNVSRSCTDEGWTHLEPGPYPIACGLDD--KAASLDEQQTMFYGSVKTGYTIGY
60 70 80 90 100
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 SVSLASLTVAVLILAYFRRLHCTRNYIHMHLFLSFMLRAVSIFVKDAVLYSGATLDEAER
..:::.: ::. ::. ::.:::::::::::::.::.:::...:.:: .:.... :...
CCDS58 GLSLATLLVATAILSLFRKLHCTRNYIHMHLFISFILRAAAVFIKDLALFDSG---ESDQ
110 120 130 140 150 160
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CCDS58 SNGATCSTQVSMLTRVSPGARRSSSFQAEVSLV
390 400 410
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CCDS26 GLSLATLLVATAILSLFRKLHCTRNYIHMHLFISFILRAAAVFIKDLALFDSG---ESDQ
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CCDS26 CSE------------------GSVGCKAAMVFFQYCVMANFFWLLVEGLYLYTLLAVSFF
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CCDS26 SERKYFWGYILIGWGVPSTFTMVWTIARIHFEDYGCWDTINSSLWWIIKGPILTSILVNF
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CCDS26 ILFICIIRILLQKLRPPDIRKSDS-SPYSRLARSTLLLIPLFGVHYIMFAFFP----DNF
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CCDS26 KPEVKMVFELVVGSFQGFVVAILYCFLNGEVQAELRRKWRRWHLQGVLGWNPKYRHPSGG
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:.. . . .:: . .. : :
CCDS26 SNGATCSTQVSMLTRVSPGARRSSSFQAEVSLV
430 440 450
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CCDS21 TGDLGTEQPVPGCEGMWDNISCWPSSVPGRMVEVECPRFLRMLTSRNGSLFRNCTQDGWS
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CCDS21 ETFPRPNLACGVNVNDS----SNEKRHSYLL-KLKVMYTVGYSSSLVMLLVALGILCAFR
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CCDS21 RLHCTRNYIHMHLFVSFILRALSNFIKDAVLFSSDDVTYCD-------------------
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CCDS21 --AHRAGCKLVMVLFQYCIMANYSWLLVEGLYLHTLLAISFFSERKYLQGFVAFGWGSPA
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CCDS21 IFVALWAIARHFLEDVGCWDINANASIWWIIRGPVILSILINFILFINILRILMRKLR-T
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. : . ..:..: .:::.:.::::.::::: .: . ..:. .:. ..::::
CCDS21 QETRGNEVSHYKRLARSTLLLIPLFGIHYIVFAFSPEDAM-----EIQLFFELALGSFQG
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CCDS21 LVVAVLYCFLNGEVQLEVQKKWQQWHLREFPLHPVASFSNSTKASHLEQSQGTCRTSII
390 400 410 420 430 440
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CCDS54 YESETGDQDYYYLSVKALYTVGYSTSLVTLTTAMVILCRFRKLHCTRNFIHMNLFVSFML
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CCDS54 VSNYFWLFIEGLYLFTLLVETFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFDDTGCW
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:..... : .:. :...::..::.:::.:. .:. ::. . : .. . : .: .:::
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CCDS54 LLIPLFGIHYTVFAFSP-ENVSK---RERLVFELGLGSFQGFVVAVLYCFLNGEVQAEIK
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CCDS54 RKWRSWKVNRYFAVDFKHRHPSLASSGVNGGTQLSILSKSSSQIRMS-GLPADNLAT
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CCDS56 FNPDQDMGVVSRNCTEDGWSEPFP-HYFDACGFDE----YESETGDQDYYYLSVKALYTV
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CCDS56 GYSTSLVTLTTAMVILCRFRKLHCTRNFIHMNLFVSFMLRAISVFIKDWILY-------A
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CCDS56 EQDSNHCFISTVE--------------CKAVMVFFHYCVVSNYFWLFIEGLYLFTLLVET
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pF1KE3 FFSEKKYLWGFTVFGWGLPAVFVAVWVSVRATLANTGCWDLSSGNKKW-IIQVPILASIV
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CCDS56 FFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFDDTGCWDMNDSTALWWVIKGPVVGSIM
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CCDS56 VNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMGGNES-SIYLRLARSTLLLIPLFGIHYTVFAFSP-ENV
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: . .. .:. ..::::: ::..::: :::::::::..: : . :.:::..
CCDS56 SK---RERLVFELGLGSFQGFVVAVLYCFLNGEVQAEIKRKWRSWKVNRYFAVDFKHRHP
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CCDS56 SLASSGVNGGTQLSILSKSSSQIRMS-GLPADNLAT
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CCDS45 LRLVKALLLLGLNPVSASLQDQHCESLSLASNISGLQCNASVDLIGTCWPRSPAGQLVVR
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CCDS45 RNIIHWNLISAFILRNATWFV-------------------------VQLTMSPEVHQSNV
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CCDS45 GWCRLVTAAYNYFHVTNFFWMFGEGCYLHTAIVLTYSTDRLRKWMFICIGWGVPFPIIVA
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CCDS45 WAIGKLYYDNEKCWFGKRPGVYTDYIYQGPMILVLLINFIFLFNIVRILMTKLR---AST
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CCDS45 TSETIQYRKAVKATLVLLPLLGITYMLFFVNPGEDEVSRVVF---IYFNSFLESFQGFFV
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CCDS45 SVFYCFLNSEVRSAIRKRWHRWQDKHSIRARVARAMSIPTSPTRVSFHSIKQSTAV
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593 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]