FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3466, 1390 aa 1>>>pF1KE3466 1390 - 1390 aa - 1390 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6933+/-0.00194; mu= 5.8434+/- 0.109 mean_var=307.1651+/-72.610, 0's: 0 Z-trim(102.8): 636 B-trim: 443 in 1/48 Lambda= 0.073179 statistics sampled from 6437 (7203) to 6437 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.545), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16 Scan time: 2.260 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs109|chr7 (1390) 9334 1002.1 0 CCDS47689.1 MET gene_id:4233|Hs109|chr7 (1408) 5103 555.4 4.1e-157 CCDS2807.1 MST1R gene_id:4486|Hs109|chr3 (1400) 2161 244.8 1.3e-63 CCDS82777.1 MST1R gene_id:4486|Hs109|chr3 (1294) 1464 171.2 1.8e-41 CCDS58833.1 MST1R gene_id:4486|Hs109|chr3 (1351) 1318 155.8 7.9e-37 CCDS2094.1 MERTK gene_id:10461|Hs109|chr2 ( 999) 847 105.9 6.1e-22 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ENIHLHSEAVLCTVPNDLLKLNSELNIEWKQAISSTVLGKVIVQPDQNFTGLIAGVVSIS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 ENIHLHSEAVLCTVPNDLLKLNSELNIEWKQAISSTVLGKVIVQPDQNFTGLIAGVVSIS 910 920 930 940 950 960 950 960 970 980 990 1000 pF1KE3 TALLLLLGFFLWLKKRKQIKDLGSELVRYDARVHTPHLDRLVSARSVSPTTEMVSNESVD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 TALLLLLGFFLWLKKRKQIKDLGSELVRYDARVHTPHLDRLVSARSVSPTTEMVSNESVD 970 980 990 1000 1010 1020 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE3 YRATFPEDQFPNSSQNGSCRQVQYPLTDMSPILTSGDSDISSPLLQNTVHIDLSALNPEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 YRATFPEDQFPNSSQNGSCRQVQYPLTDMSPILTSGDSDISSPLLQNTVHIDLSALNPEL 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE3 VQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLNRITDIGEVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 VQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLNRITDIGEVS 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1130 1140 1150 1160 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CCDS28 MELLPPLPQSFLLLLLLPAKPAAGEDWQCPRTPYAASRDFDVKYVVPSFSAGGLVQAMVT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 HEHH-----IFLGATNYIYVLNEEDLQKVAEYKTGPVLEHPDCFPCQDCSSKANLSGGVW .: .:.. : ..::. ::..: :::. . : : : :. . : CCDS28 YEGDRNESAVFVAIRNRLHVLGP-DLKSVQSLATGPAGD-PGCQTCAACGPGPHGPPG-- 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 KDNINMALVVDTYYDDQLISCGSVNRGTCQRHVFPHNHTADIQSEVHCIFSPQIEEPSQC :. . .::.: :.:::: .: : : . . :: . :.:: . ..:..: CCDS28 -DTDTKVLVLDPALP-ALVSCGSSLQGRCFLHDLEPQGTAVHLAAPACLFSAHHNRPDDC 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 PDCVVSALGAKVLSSVKDRFINFFVGNTINSSYFPDHPLHSISVRRLKETKDGFM--FLT ::::.: ::..: . . :.:....... . .:.:.:::: .:: :.. CCDS28 PDCVASPLGTRVTVVEQGQASYFYVASSLDAAVAASFSPRSVSIRRLKADASGFAPGFVA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 DQSYIDVLPEFRDSYPIKYVHAFESNNFIYFLTVQRETL--DAQTFHTRIIRFCSINSGL ..:::. :: :.:::.:... :.:::::: .. : ...:::. :. . . : CCDS28 ----LSVLPKHLVSYSIEYVHSFHTGAFVYFLTVQPASVTDDPSALHTRLARLSATEPEL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 HSYMEMPLECILTEKRKKRSTKK--EVFNILQAAYVSKPGAQLARQIGASLNDDILFGVF .: :. :.: .. ::..:.. . . . .:..:. . ::::: ... . ....::::: CCDS28 GDYRELVLDCRFAPKRRRRGAPEGGQPYPVLRVAHSAPVGAQLATELSIAEGQEVLFGVF 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 pF1KE3 AQSKPDSAEPMDRSAMCAFPIKYVNDFFNKIVNKNNVRC------------LQHFYGPNH . .: . :..::::: :... ..... :: :. : .:. CCDS28 VTGKDGGPGVGPNSVVCAFPI----DLLDTLIDEGVERCCESPVHPGLRRGLDFFQSPSF 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 EHCFNRTLLRNSSGCEARRDEYRTEFTTALQRVDLFMGQFSEVLLTSISTFIKGDLTIAN : : :. : . : .. .....::::: : .. : .:.. . ..:.:. CCDS28 --CPNPPGLEALSPNTSCR-HFPLLVSSSFSRVDLFNGLLGPVQVTALYVTRLDNVTVAH 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 LGTSEGRFMQVVVSRSGPSTPHV-NFLL-DS-HPVSPEVIVEHTLNQNGYTLVITGKKIT .:: .::..:: . :: .: :: : :: .::. .: . . : .: .. CCDS28 MGTMDGRILQVELVRSLNYLLYVSNFSLGDSGQPVQRDVS-----RLGDHLLFASGDQVF 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 KIPLNGLGCRHFQSCSQCLSAPPFVQCGWCHDKCVRSEECLSGTWTQQICLPAIYKVFPN ..:..: ::::: .:..:: : :. :::: . : ...:: :.: :. : : . . :. CCDS28 QVPIQGPGCRHFLTCGRCLRAWHFMGCGWCGNMCGQQKEC-PGSWQQDHCPPKLTEFHPH 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 SAPLEGGTRLTICGWDFGFRRNNKFDLKKTRVLLGNESCTLTLSEST----------MNT :.::.:.::::.:: .: .. .. .: .:. : ..:. .. CCDS28 SGPLRGSTRLTLCGSNFYLHPSGLVPEGTHQVTVGQSPCRPLPKDSSKLRPVPRKDFVEE 580 590 600 610 620 630 630 640 650 660 670 pF1KE3 LKCTVGPAMNKHF---NMSIIISN---GH-----GTTQYSTFSYVDPVITSISPKYGPMA ..: . : .. :.:. ..: :. ::. ::...::. ...: .:: : CCDS28 FECELEPLGTQAVGPTNVSLTVTNMPPGKHFRVDGTSVLRGFSFMEPVLIAVQPLFGPRA 640 650 660 670 680 690 680 690 700 710 720 730 pF1KE3 GGTLLTLTGNYLNSGNSRHISIGGKTCTLKSVSNSILECYTPAQTISTEFAVKLKIDLAN ::: ::: :. :. :.:: . ..: : : ::.. : : :: . . ..:.. :. CCDS28 GGTCLTLEGQSLSVGTSRAVLVNGTECLLARVSEGQLLCATPPGATVASVPLSLQVGGAQ 700 710 720 730 740 750 740 750 760 770 780 pF1KE3 RETS-IFSYREDPIVYEIHPTKSFISGGSTITGVGKNLNSVSVPRMVINVHEAGRNFTVA : :.:::::.: : :. ..:. : :: :..:.:. ..:.. :.. : CCDS28 VPGSWTFQYREDPVVLSISPNCGYIN--SHITICGQHLTSAW--HLVLSFHDGLRAVESR 760 770 780 790 800 810 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 CQHRSNSEIICCTTPSLQQLNLQLPLKTKAFFMLDGILSKYFDLIYVHNPVFKPFEKPVM :. :. : : : . : . . :: . . . : : . : CCDS28 CE-RQLPEQQLCRLPEYVVRDPQGWVAGNLSARGDGAAGFTLPGFRFLPPPHPPSANLVP 820 830 840 850 860 870 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 ISMGNENV-LEIKGNDIDPEAVKGEVLKVGNKSCENIHLHSEAVLCTVPNDLLKLNSELN .. .. . .: : . : : . ::..::.. ..... :.: .: .: .. CCDS28 LKPEEHAIKFEYIGLGAVADCV-GINVTVGGESCQH-EFRGDMVVCPLPPSLQLGQDGAP 880 890 900 910 920 930 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 IEWKQAISSTVLGKVIVQ-----PDQNFTGLIAGVVSISTALLLLLGFFLWLKKRKQIKD .. .::.:. :.... :.. .. . .:: : : : . :::. CCDS28 LQVCVDGECHILGRVVRPGPDGVPQSTLLGILLPLLLLVAALATALVFSYWWR-RKQL-- 940 950 960 970 980 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE3 LGSELVRYDARVHTPHLDRLVSARSVSPTTEM-VSNESVDYRATFPEDQFPNSSQNGSCR : :.:. :.: ... .: . . . :::. . .: . : CCDS28 -----------VLPPNLNDLASLDQTAGATPLPILYSGSDYRSGLA---LPAIDGLDSTT 990 1000 1010 1020 1030 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE3 QVQYPLTDMSPILTSGDSDISSPLLQNTVHIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNE :. . ....... :::.. :.: :. :. :. :.: ...: .. CCDS28 CVH------GASFSDSEDESCVPLLRKE-SIQLRDLDSALLAEVKDVLIPHERVVTHSDR 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE3 VIGRGHFGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSL :::.:::: :::: .:. ..:.::.:::.:::.. .: :: ::..:. ..:::::.: CCDS28 VIGKGHFGVVYHGEYIDQAQNRIQCAIKSLSRITEMQQVEAFLREGLLMRGLNHPNVLAL 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE3 LGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVH .:: : :: : :.:::: :::: .:::. .::::::::.::::::.::.::: .:::: CCDS28 IGIMLPPEGLPHVLLPYMCHGDLLQFIRSPQRNPTVKDLISFGLQVARGMEYLAEQKFVH 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE3 RDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVHNKTGAKLPVKWMALESLQTQKFTT ::::::::::::.:::::::::::::. :.:::::... :.::::::::::::: .::: CCDS28 RDLAARNCMLDESFTVKVADFGLARDILDREYYSVQQHRHARLPVKWMALESLQTYRFTT 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE3 KSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHP ::::::::::::::.::::::: .. ::.: .: ::::: ::::::: ::.:: .::. CCDS28 KSDVWSFGVLLWELLTRGAPPYRHIDPFDLTHFLAQGRRLPQPEYCPDSLYQVMQQCWEA 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KE3 KAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIGEHYVHVNATYVNVKCVAPYPSLLSSEDNADDEVDTR .::.: ::... : :...:.:::.. :::.:. CCDS28 DPAVRPTFRVLVGEVEQIVSALLGDHYVQLPATYMNLGPSTSHEMNVRPEQPQFSPMPGN 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KE3 PASFWETS CCDS28 VRRPRPLSEPPRPT 1390 1400 >>CCDS82777.1 MST1R gene_id:4486|Hs109|chr3 (1294 aa) initn: 2084 init1: 1269 opt: 1464 Z-score: 858.4 bits: 171.2 E(33420): 1.8e-41 Smith-Waterman score: 2333; 33.5% identity (58.7% similar) in 1396 aa overlap (7-1359:7-1257) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MKAPAVLAPGILVLLFTLVQRSNGE---CKEALAKSEMNVNMKYQLPNFTAETPIQNVIL : ..:.::. .. . :: : .. . . ..:: .:.:.: .: .. CCDS82 MELLPPLPQSFLLLLLLPAKPAAGEDWQCPRTPYAASRDFDVKYVVPSFSAGGLVQAMVT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 HEHH-----IFLGATNYIYVLNEEDLQKVAEYKTGPVLEHPDCFPCQDCSSKANLSGGVW .: .:.. : ..::. ::..: :::. . : : : :. . : CCDS82 YEGDRNESAVFVAIRNRLHVLGP-DLKSVQSLATGPAGD-PGCQTCAACGPGPHGPPG-- 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 KDNINMALVVDTYYDDQLISCGSVNRGTCQRHVFPHNHTADIQSEVHCIFSPQIEEPSQC :. . .::.: :.:::: .: : : . . :: . :.:: . ..:..: CCDS82 -DTDTKVLVLDPALP-ALVSCGSSLQGRCFLHDLEPQGTAVHLAAPACLFSAHHNRPDDC 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 PDCVVSALGAKVLSSVKDRFINFFVGNTINSSYFPDHPLHSISVRRLKETKDGFM--FLT ::::.: ::..: . . :.:....... . .:.:.:::: .:: :.. CCDS82 PDCVASPLGTRVTVVEQGQASYFYVASSLDAAVAASFSPRSVSIRRLKADASGFAPGFVA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 DQSYIDVLPEFRDSYPIKYVHAFESNNFIYFLTVQRETL--DAQTFHTRIIRFCSINSGL ..:::. :: :.:::.:... :.:::::: .. : ...:::. :. . . : CCDS82 ----LSVLPKHLVSYSIEYVHSFHTGAFVYFLTVQPASVTDDPSALHTRLARLSATEPEL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 HSYMEMPLECILTEKRKKRSTKK--EVFNILQAAYVSKPGAQLARQIGASLNDDILFGVF .: :. :.: .. ::..:.. . . . .:..:. . ::::: ... . ....::::: CCDS82 GDYRELVLDCRFAPKRRRRGAPEGGQPYPVLRVAHSAPVGAQLATELSIAEGQEVLFGVF 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 AQSKPDSAEPMDRSAMCAFPIKYVNDFFNKIVNKNNVRCLQHFYGPNHEHCFNRTLLRNS . .: . :..::::: :... ..... :: . .: : CCDS82 VTGKDGGPGVGPNSVVCAFPI----DLLDTLIDEGVERCCE---SPVHP----------- 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 SGCEARRDEYRTEFTTALQRVDLFMGQFSEVLLTSISTFIKGDLTIANLGTSEGRFMQVV : :: .:.:. CCDS82 -GL--RRG------------LDFFQ----------------------------------- 400 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 VSRSGPSTPHVNFLLDSHPVSPEVIVEHTLNQNGYTLVITGKKITKIPLNGLGCRHFQSC .:: . .:: ..:..: ::::: .: CCDS82 ----SPS-------FCPNPV------------------------FQVPIQGPGCRHFLTC 410 420 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 SQCLSAPPFVQCGWCHDKCVRSEECLSGTWTQQICLPAIYKVFPNSAPLEGGTRLTICGW ..:: : :. :::: . : ...:: :.: :. : : . . :.:.::.:.::::.:: CCDS82 GRCLRAWHFMGCGWCGNMCGQQKEC-PGSWQQDHCPPKLTEFHPHSGPLRGSTRLTLCGS 430 440 450 460 470 480 590 600 610 620 630 pF1KE3 DFGFRRNNKFDLKKTRVLLGNESCTLTLSEST----------MNTLKCTVGPAMNKHF-- .: .. .. .: .:. : ..:. .. ..: . : .. CCDS82 NFYLHPSGLVPEGTHQVTVGQSPCRPLPKDSSKLRPVPRKDFVEEFECELEPLGTQAVGP 490 500 510 520 530 540 640 650 660 670 680 pF1KE3 -NMSIIISN---GH-----GTTQYSTFSYVDPVITSISPKYGPMAGGTLLTLTGNYLNSG :.:. ..: :. ::. ::...::. ...: .:: :::: ::: :. :. : CCDS82 TNVSLTVTNMPPGKHFRVDGTSVLRGFSFMEPVLIAVQPLFGPRAGGTCLTLEGQSLSVG 550 560 570 580 590 600 690 700 710 720 730 740 pF1KE3 NSRHISIGGKTCTLKSVSNSILECYTPAQTISTEFAVKLKIDLANRETS-IFSYREDPIV .:: . ..: : : ::.. : : :: . . ..:.. :. : :.:::::.: CCDS82 TSRAVLVNGTECLLARVSEGQLLCATPPGATVASVPLSLQVGGAQVPGSWTFQYREDPVV 610 620 630 640 650 660 750 760 770 780 790 800 pF1KE3 YEIHPTKSFISGGSTITGVGKNLNSVSVPRMVINVHEAGRNFTVACQHRSNSEIICCTTP : :. ..:. : :: :..:.:. ..:.. :.. : :. :. : : : CCDS82 LSISPNCGYIN--SHITICGQHLTSAW--HLVLSFHDGLRAVESRCE-RQLPEQQLCRLP 670 680 690 700 710 720 810 820 830 840 850 860 pF1KE3 SLQQLNLQLPLKTKAFFMLDGILSKYFDLIYVHNPVFKPFEKPVMISMGNENV-LEIKGN . : . . :: . . . : : . : .. .. . .: : CCDS82 EYVVRDPQGWVAGNLSARGDGAAGFTLPGFRFLPPPHPPSANLVPLKPEEHAIKFEYIGL 730 740 750 760 770 780 870 880 890 900 910 920 pF1KE3 DIDPEAVKGEVLKVGNKSCENIHLHSEAVLCTVPNDLLKLNSELNIEWKQAISSTVLGKV . : : . ::..::.. ..... :.: .: .: .. .. .::.: CCDS82 GAVADCV-GINVTVGGESCQH-EFRGDMVVCPLPPSLQLGQDGAPLQVCVDGECHILGRV 790 800 810 820 830 930 940 950 960 970 pF1KE3 IVQ-----PDQNFTGLIAGVVSISTALLLLLGFFLWLKKRKQIKDLGSELVRYDARVHTP . :.... :.. .. . .:: : : : . :::. : : CCDS82 VRPGPDGVPQSTLLGILLPLLLLVAALATALVFSYWWR-RKQL-------------VLPP 840 850 860 870 880 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE3 HLDRLVSARSVSPTTEM-VSNESVDYRATFPEDQFPNSSQNGSCRQVQYPLTDMSPILTS .:. :.: ... .: . . . :::. . .: . : :. . ... CCDS82 NLNDLASLDQTAGATPLPILYSGSDYRSGLA---LPAIDGLDSTTCVH------GASFSD 890 900 910 920 930 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE3 GDSDISSPLLQNTVHIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTL .... :::.. :.: :. :. :. :.: ...: ..:::.:::: :::: CCDS82 SEDESCVPLLRKE-SIQLRDLDSALLAEVKDVLIPHERVVTHSDRVIGKGHFGVVYHGEY 940 950 960 970 980 990 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE3 LDNDGKKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVL .:. ..:.::.:::.:::.. .: :: ::..:. ..:::::.:.:: : :: : :.: CCDS82 IDQAQNRIQCAIKSLSRITEMQQVEAFLREGLLMRGLNHPNVLALIGIMLPPEGLPHVLL 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE3 PYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFT ::: :::: .:::. .::::::::.::::::.::.::: .::::::::::::::::.:: CCDS82 PYMCHGDLLQFIRSPQRNPTVKDLISFGLQVARGMEYLAEQKFVHRDLAARNCMLDESFT 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE3 VKVADFGLARDMYDKEYYSVHNKTGAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELM :::::::::::. :.:::::... :.::::::::::::: .:::::::::::::::::. CCDS82 VKVADFGLARDILDREYYSVQQHRHARLPVKWMALESLQTYRFTTKSDVWSFGVLLWELL 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KE3 TRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRI ::::::: .. ::.: .: ::::: ::::::: ::.:: .::. .::.: ::... CCDS82 TRGAPPYRHIDPFDLTHFLAQGRRLPQPEYCPDSLYQVMQQCWEADPAVRPTFRVLVGEV 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KE3 SAIFSTFIGEHYVHVNATYVNVKCVAPYPSLLSSEDNADDEVDTRPASFWETS : :...:.:::.. :::.:. CCDS82 EQIVSALLGDHYVQLPATYMNLGPSTSHEMNVRPEQPQFSPMPGNVRRPRPLSEPPRPT 1240 1250 1260 1270 1280 1290 >>CCDS58833.1 MST1R gene_id:4486|Hs109|chr3 (1351 aa) initn: 2293 init1: 1269 opt: 1318 Z-score: 774.9 bits: 155.8 E(33420): 7.9e-37 Smith-Waterman score: 2536; 35.4% identity (61.5% similar) in 1405 aa overlap (7-1359:7-1314) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MKAPAVLAPGILVLLFTLVQRSNGE---CKEALAKSEMNVNMKYQLPNFTAETPIQNVIL : ..:.::. .. . :: : .. . . ..:: .:.:.: .: .. CCDS58 MELLPPLPQSFLLLLLLPAKPAAGEDWQCPRTPYAASRDFDVKYVVPSFSAGGLVQAMVT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 HEHH-----IFLGATNYIYVLNEEDLQKVAEYKTGPVLEHPDCFPCQDCSSKANLSGGVW .: .:.. : ..::. ::..: :::. . : : : :. . : CCDS58 YEGDRNESAVFVAIRNRLHVLGP-DLKSVQSLATGPAGD-PGCQTCAACGPGPHGPPG-- 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 KDNINMALVVDTYYDDQLISCGSVNRGTCQRHVFPHNHTADIQSEVHCIFSPQIEEPSQC :. . .::.: :.:::: .: : : . . :: . :.:: . ..:..: CCDS58 -DTDTKVLVLDPALP-ALVSCGSSLQGRCFLHDLEPQGTAVHLAAPACLFSAHHNRPDDC 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 PDCVVSALGAKVLSSVKDRFINFFVGNTINSSYFPDHPLHSISVRRLKETKDGFM--FLT ::::.: ::..: . . :.:....... . .:.:.:::: .:: :.. CCDS58 PDCVASPLGTRVTVVEQGQASYFYVASSLDAAVAASFSPRSVSIRRLKADASGFAPGFVA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 DQSYIDVLPEFRDSYPIKYVHAFESNNFIYFLTVQRETL--DAQTFHTRIIRFCSINSGL ..:::. :: :.:::.:... :.:::::: .. : ...:::. :. . . : CCDS58 ----LSVLPKHLVSYSIEYVHSFHTGAFVYFLTVQPASVTDDPSALHTRLARLSATEPEL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 HSYMEMPLECILTEKRKKRSTKK--EVFNILQAAYVSKPGAQLARQIGASLNDDILFGVF .: :. :.: .. ::..:.. . . . .:..:. . ::::: ... . ....::::: CCDS58 GDYRELVLDCRFAPKRRRRGAPEGGQPYPVLRVAHSAPVGAQLATELSIAEGQEVLFGVF 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 pF1KE3 AQSKPDSAEPMDRSAMCAFPIKYVNDFFNKIVNKNNVRC------------LQHFYGPNH . .: . :..::::: :... ..... :: :. : .:. CCDS58 VTGKDGGPGVGPNSVVCAFPI----DLLDTLIDEGVERCCESPVHPGLRRGLDFFQSPSF 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 EHCFNRTLLRNSSGCEARRDEYRTEFTTALQRVDLFMGQFSEVLLTSISTFIKGDLTIAN : : :. : . : .. .....::::: : .. : .:.. . ..:.:. CCDS58 --CPNPPGLEALSPNTSCR-HFPLLVSSSFSRVDLFNGLLGPVQVTALYVTRLDNVTVAH 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 LGTSEGRFMQVVVSRSGPSTPHV-NFLL-DS-HPVSPEVIVEHTLNQNGYTLVITGKKIT .:: .::..:: . :: .: :: : :: .::. .: . . : .: .. CCDS58 MGTMDGRILQVELVRSLNYLLYVSNFSLGDSGQPVQRDVS-----RLGDHLLFASGDQVF 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 KIPLNGLGCRHFQSCSQCLSAPPFVQCGWCHDKCVRSEECLSGTWTQQICLPAIYKVFPN ..:..: ::::: .:..:: : :. :::: . : ...:: :.: :. : : . . :. CCDS58 QVPIQGPGCRHFLTCGRCLRAWHFMGCGWCGNMCGQQKEC-PGSWQQDHCPPKLTEFHPH 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 SAPLEGGTRLTICGWDFGFRRNNKFDLKKTRVLLGNESCTLTLSEST----------MNT :.::.:.::::.:: .: .. .. .: .:. : ..:. .. CCDS58 SGPLRGSTRLTLCGSNFYLHPSGLVPEGTHQVTVGQSPCRPLPKDSSKLRPVPRKDFVEE 580 590 600 610 620 630 630 640 650 660 670 pF1KE3 LKCTVGPAMNKHF---NMSIIISN---GH-----GTTQYSTFSYVDPVITSISPKYGPMA ..: . : .. :.:. ..: :. ::. ::...::. ...: .:: : CCDS58 FECELEPLGTQAVGPTNVSLTVTNMPPGKHFRVDGTSVLRGFSFMEPVLIAVQPLFGPRA 640 650 660 670 680 690 680 690 700 710 720 730 pF1KE3 GGTLLTLTGNYLNSGNSRHISIGGKTCTLKSVSNSILECYTPAQTISTEFAVKLKIDLAN ::: ::: :. :. :.:: . ..: : : ::.. : : :: . . ..:.. :. CCDS58 GGTCLTLEGQSLSVGTSRAVLVNGTECLLARVSEGQLLCATPPGATVASVPLSLQVGGAQ 700 710 720 730 740 750 740 750 760 770 780 pF1KE3 RETS-IFSYREDPIVYEIHPTKSFISGGSTITGVGKNLNSVSVPRMVINVHEAGRNFTVA : :.:::::.: : :. ..:. : :: :..:.:. ..:.. :.. : CCDS58 VPGSWTFQYREDPVVLSISPNCGYIN--SHITICGQHLTSAW--HLVLSFHDGLRAVESR 760 770 780 790 800 810 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 CQHRSNSEIICCTTPSLQQLNLQLPLKTKAFFMLDGILSKYFDLIYVHNPVFKPFEKPVM :. :. : : : . : . . :: . : : : :. . : CCDS58 CE-RQLPEQQLCRLPEYVVRDPQGWVAGNLSARGDG--AAGFTL-----PGFRFLPPPHP 820 830 840 850 860 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 ISMGNENVLEIKGNDIDPEAVKGEVLKVGNKSCENIHLHSEAVLCTVPNDLLKLNSELNI : :.. .: .. .:.: :: :. : :. ...: :. . . CCDS58 PSA---NLVPLKPEE---HAIKFEVCVDGE--C---HILGRVVR-PGPDGVPQ------- 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 EWKQAISSTVLGKVIVQPDQNFTGLIAGVVSISTALLLLLGFFLWLKKRKQIKDLGSELV ::.:: :. : :. :....:::. : : . :::. CCDS58 -------STLLG--ILLP------LLLLVAALATALV----FSYWWR-RKQL-------- 910 920 930 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE3 RYDARVHTPHLDRLVSARSVSPTTEM-VSNESVDYRATFPEDQFPNSSQNGSCRQVQYPL : :.:. :.: ... .: . . . :::. . .: . : :. CCDS58 -----VLPPNLNDLASLDQTAGATPLPILYSGSDYRSGLA---LPAIDGLDSTTCVH--- 940 950 960 970 980 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE3 TDMSPILTSGDSDISSPLLQNTVHIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGH . ....... :::.. :.: :. :. :. :.: ...: ..:::.:: CCDS58 ---GASFSDSEDESCVPLLRKE-SIQLRDLDSALLAEVKDVLIPHERVVTHSDRVIGKGH 990 1000 1010 1020 1030 1040 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE3 FGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLR :: :::: .:. ..:.::.:::.:::.. .: :: ::..:. ..:::::.:.:: : CCDS58 FGVVYHGEYIDQAQNRIQCAIKSLSRITEMQQVEAFLREGLLMRGLNHPNVLALIGIMLP 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE3 SEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAAR :: : :.:::: :::: .:::. .::::::::.::::::.::.::: .:::::::::: CCDS58 PEGLPHVLLPYMCHGDLLQFIRSPQRNPTVKDLISFGLQVARGMEYLAEQKFVHRDLAAR 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE3 NCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVHNKTGAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWS ::::::.:::::::::::::. :.:::::... :.::::::::::::: .::::::::: CCDS58 NCMLDESFTVKVADFGLARDILDREYYSVQQHRHARLPVKWMALESLQTYRFTTKSDVWS 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE3 FGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRP ::::::::.::::::: .. ::.: .: ::::: ::::::: ::.:: .::. .:: CCDS58 FGVLLWELLTRGAPPYRHIDPFDLTHFLAQGRRLPQPEYCPDSLYQVMQQCWEADPAVRP 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KE3 SFSELVSRISAIFSTFIGEHYVHVNATYVNVKCVAPYPSLLSSEDNADDEVDTRPASFWE .: ::... : :...:.:::.. :::.:. CCDS58 TFRVLVGEVEQIVSALLGDHYVQLPATYMNLGPSTSHEMNVRPEQPQFSPMPGNVRRPRP 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1390 pF1KE3 TS CCDS58 LSEPPRPT 1350 >>CCDS2094.1 MERTK gene_id:10461|Hs109|chr2 (999 aa) initn: 776 init1: 367 opt: 847 Z-score: 507.7 bits: 105.9 E(33420): 6.1e-22 Smith-Waterman score: 847; 41.0% identity (71.7% similar) in 339 aa overlap (1058-1385:569-901) 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE3 LTDMSPILTSGDSDISSPLLQNTVHIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRG .. :: . .. ::: . :: .....:.: CCDS20 TEEDSELVVNYIAKKSFCRRAIELTLHSLGVSEELQNKLEDVVIDRNLLI--LGKILGEG 540 550 560 570 580 590 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE3 HFGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLN-RITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGIC .:: :..:.: ..:: ... :::... .. :. .::.:. :::::::::. :::.: CCDS20 EFGSVMEGNLKQEDGTSLKVAVKTMKLDNSSQREIEEFLSEAACMKDFSHPNVIRLLGVC 600 610 620 630 640 650 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE3 LR--SEG--SPLVVLPYMKHGDLRNFI---RNET---HNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLA .. :.: .:.:.::.::.:::.... : :: : : .. :. : ...: ::.::. 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