FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3478, 1613 aa 1>>>pF1KE3478 1613 - 1613 aa - 1613 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 64092750 residues in 91774 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7113+/-0.000487; mu= -3.1843+/- 0.030 mean_var=261.3707+/-54.242, 0's: 0 Z-trim(116.2): 117 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.079332 statistics sampled from 28036 (28151) to 28036 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16 Scan time: 8.470 The best scores are: opt bits E(91774) XP_006719141 (OMIM: 603507,610947,616724) low-dens (1613) 11148 1291.1 0 NP_002327 (OMIM: 603507,610947,616724) low-density (1613) 11148 1291.1 0 XP_011518973 (OMIM: 603507,610947,616724) low-dens (1462) 10159 1177.8 0 NP_002326 (OMIM: 133780,144750,166710,259770,60181 (1615) 7864 915.2 0 XP_011543332 (OMIM: 133780,144750,166710,259770,60 (1624) 7862 915.0 0 XP_005274051 (OMIM: 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XP_005 LEDKLPHIFGFTLLGDFIYWTDWQRRSIERVHKVKASRDVIIDQLPDLMGLKAVNVAKVV 550 560 570 580 590 600 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 GSNPCAEENGGCSHLCLYRPQGLRCACPIGFELISDMKTCIVPEAFLLFSRRADIRRISL :.::::..::::::::.. :.. ::.::::.::.:::::::::::::.:. :: :.:::: XP_005 GTNPCADRNGGCSHLCFFTPHATRCGCPIGLELLSDMKTCIVPEAFLVFTSRAAIHRISL 610 620 630 640 650 660 650 660 670 680 690 700 pF1KE3 ETNNNNVAIPLTGVKEASALDFDVTDNRIYWTDISLKTISRAFMNGSALEHVVEFGLDYP :::::.::::::::::::::::::..:.:::::.:::::::::::::..::::::::::: XP_005 ETNNNDVAIPLTGVKEASALDFDVSNNHIYWTDVSLKTISRAFMNGSSVEHVVEFGLDYP 670 680 690 700 710 720 710 720 730 740 750 760 pF1KE3 EGMAVDWLGKNLYWADTGTNRIEVSKLDGQHRQVLVWKDLDSPRALALDPAEGFMYWTEW :::::::.::::::::::::::::..:::: ::::::.:::.::.:::::..:..::::: XP_005 EGMAVDWMGKNLYWADTGTNRIEVARLDGQFRQVLVWRDLDNPRSLALDPTKGYIYWTEW 730 740 750 760 770 780 770 780 790 800 810 820 pF1KE3 GGKPKIDRAAMDGSERTTLVPNVGRANGLTIDYAKRRLYWTDLDTNLIESSNMLGLNREV ::::.: :: :::.. ::: .::::: :::::: .::::::::::.:::::::: .: : XP_005 GGKPRIVRAFMDGTNCMTLVDKVGRANDLTIDYADQRLYWTDLDTNMIESSNMLGQERVV 790 800 810 820 830 840 830 840 850 860 870 880 pF1KE3 IADDLPHPFGLTQYQDYIYWTDWSRRSIERANKTSGQNRTIIQGHLDYVMDILVFHSSRQ ::::::::::::::.::::::::. .:::::.::::.:::.::::::.:::::::::::: XP_005 IADDLPHPFGLTQYSDYIYWTDWNLHSIERADKTSGRNRTLIQGHLDFVMDILVFHSSRQ 850 860 870 880 890 900 890 900 910 920 930 940 pF1KE3 SGWNECASSNGHCSHLCLAVPVGGFVCGCPAHYSLNADNRTCSAPTTFLLFSQKSAINRM .: :.: .::.:..::::.: :: ::: .::.:. ..:.:: :::::::::::::.:: XP_005 DGLNDCMHNNGQCGQLCLAIP-GGHRCGCASHYTLDPSSRNCSPPTTFLLFSQKSAISRM 910 920 930 940 950 950 960 970 980 990 1000 pF1KE3 VIDEQQSPDIILPIHSLRNVRAIDYDPLDKQLYWIDSRQNMIRKAQEDGSQGFTVVVSSV . :.:.:::.:::.:.::::.::::::::: .::.:.::: :..:..::.: : :..: XP_005 IPDDQHSPDLILPLHGLRNVKAIDYDPLDKFIYWVDGRQN-IKRAKDDGTQPF-VLTSLS 960 970 980 990 1000 1010 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE3 PSQNLEIQPYDLSIDIYSRYIYWTCEATNVINVTRLDGRSVGVVLKGEQDRPRAIVVNPE .:: . ::.::::::::: ..:::::::.::: ::.:...::::.:..:.::::::: : XP_005 QGQNPDRQPHDLSIDIYSRTLFWTCEATNTINVHRLSGEAMGVVLRGDRDKPRAIVVNAE 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE3 KGYMYFTNLQERSPKIERAALDGTEREVLFFSGLSKPIALALDSRLGKLFWADSDLRRIE .::.::::.:.:. :::::::::::::::: .:: .:.::..:. ::::::.:.::.::: XP_005 RGYLYFTNMQDRAAKIERAALDGTEREVLFTTGLIRPVALVVDNTLGKLFWVDADLKRIE 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE3 SSDLSGANRIVLEDSNILQPVGLTVFENWLYWIDKQQQMIEKIDMTGREGRTKVQARIAQ : :::::::..:::.::.::.:::.. . :::::.::::::... : . ::..:.:.:. XP_005 SCDLSGANRLTLEDANIVQPLGLTILGKHLYWIDRQQQMIERVEKTTGDKRTRIQGRVAH 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE3 LSDIHAVKELNLQEYRQHPCAQDNGGCSHICLVKGDGTTRCSCPMHLVLLQDELSCGEPP :. ::::.:..:.:. ::::.:::::::::..::::: :::::.::::::. :.::::: XP_005 LTGIHAVEEVSLEEFSAHPCARDNGGCSHICIAKGDGTPRCSCPVHLVLLQNLLTCGEPP 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KE3 TCSPQQFTCFTGEIDCIPVAWRCDGFTECEDHSDELNCPVCSESQFQCASGQCIDGALRC ::::.::.: :::::::: ::::::: ::.:.::: .::::: .:: :: :::.: ::: XP_005 TCSPDQFACATGEIDCIPGAWRCDGFPECDDQSDEEGCPVCSAAQFPCARGQCVDLRLRC 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KE3 NGDANCQDKSDEKNCEVLCLIDQFRCANGQCIGKHKKCDHNVDCSDKSDELDCYPTEEPA .:.:.:::.::: .:...:: .:::::.:::. ...:: :: : :::: : :. :. XP_005 DGEADCQDRSDEADCDAICLPNQFRCASGQCVLIKQQCDSFPDCIDGSDELMCEITKPPS 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KE3 ---PQATNTVGSVIGVIVTIFVSGTVYFICQRMLCPRMKGDGETMTNDYVVHGPASVPLG : ....: :::.:...:: : :::.:::..: :. : . . ..:: : :::. XP_005 DDSPAHSSAIGPVIGIILSLFVMGGVYFVCQRVVCQRYAGANGPFPHEYV-SGTPHVPLN 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KE3 YVPHPSSLSGSLPGMSRGKSMISSLSIMGGSSGPP-YDRAHVTGASSSSSSSTKGTYFPA .. .: : . :.. ::::.::.:.::: .: : ::: ::::::::::::::.: .: XP_005 FIAPGGSQHGPFTGIACGKSMMSSVSLMGGRGGVPLYDRNHVTGASSSSSSSTKATLYPP 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1490 1500 pF1KE3 --------------------------------------ILNPPPSPATERSHYTMEFGYS ::::::::::. : :.:.. :: XP_005 GLGSGCMLSRMALETHISPTPFGKLHVGLGCRQWHLWKILNPPPSPATDPSLYNMDMFYS 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1510 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KE3 SNSPSTHRSYSYRPYSYRHFAPPTTPCSTDVCDSDYAPSRRMTSVATAKGYTSDLNYDSE :: :.: : : ::: : .::::::::::::::::. :: :. : ::: ::. 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XP_011 LEDKLPHIFGFTLLGDFIYWTDWQRRSIERVHKVKASRDVIIDQLPDLMGLKAVNVAKVV 550 560 570 580 590 600 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 GSNPCAEENGGCSHLCLYRPQGLRCACPIGFELISDMKTCIVPEAFLLFSRRADIRRISL :.::::..::::::::.. :.. ::.::::.::.:::::::::::::.:. :: :.:::: XP_011 GTNPCADRNGGCSHLCFFTPHATRCGCPIGLELLSDMKTCIVPEAFLVFTSRAAIHRISL 610 620 630 640 650 660 650 660 670 680 690 700 pF1KE3 ETNNNNVAIPLTGVKEASALDFDVTDNRIYWTDISLKTISRAFMNGSALEHVVEFGLDYP :::::.::::::::::::::::::..:.:::::.:::::::::::::..::::::::::: XP_011 ETNNNDVAIPLTGVKEASALDFDVSNNHIYWTDVSLKTISRAFMNGSSVEHVVEFGLDYP 670 680 690 700 710 720 710 720 730 740 750 760 pF1KE3 EGMAVDWLGKNLYWADTGTNRIEVSKLDGQHRQVLVWKDLDSPRALALDPAEGFMYWTEW :::::::.::::::::::::::::..:::: ::::::.:::.::.:::::..:..::::: XP_011 EGMAVDWMGKNLYWADTGTNRIEVARLDGQFRQVLVWRDLDNPRSLALDPTKGYIYWTEW 730 740 750 760 770 780 770 780 790 800 810 820 pF1KE3 GGKPKIDRAAMDGSERTTLVPNVGRANGLTIDYAKRRLYWTDLDTNLIESSNMLGLNREV ::::.: :: :::.. ::: .::::: :::::: .::::::::::.:::::::: .: : XP_011 GGKPRIVRAFMDGTNCMTLVDKVGRANDLTIDYADQRLYWTDLDTNMIESSNMLGQERVV 790 800 810 820 830 840 830 840 850 860 870 880 pF1KE3 IADDLPHPFGLTQYQDYIYWTDWSRRSIERANKTSGQNRTIIQGHLDYVMDILVFHSSRQ ::::::::::::::.::::::::. .:::::.::::.:::.::::::.:::::::::::: XP_011 IADDLPHPFGLTQYSDYIYWTDWNLHSIERADKTSGRNRTLIQGHLDFVMDILVFHSSRQ 850 860 870 880 890 900 890 900 910 920 930 940 pF1KE3 SGWNECASSNGHCSHLCLAVPVGGFVCGCPAHYSLNADNRTCSAPTTFLLFSQKSAINRM .: :.: .::.:..::::.: :: ::: .::.:. ..:.:: :::::::::::::.:: XP_011 DGLNDCMHNNGQCGQLCLAIP-GGHRCGCASHYTLDPSSRNCSPPTTFLLFSQKSAISRM 910 920 930 940 950 960 950 960 970 980 990 1000 pF1KE3 VIDEQQSPDIILPIHSLRNVRAIDYDPLDKQLYWIDSRQNMIRKAQEDGSQGFTVVVSSV . :.:.:::.:::.:.::::.::::::::: .::.:.::: :..:..::.: : :..: XP_011 IPDDQHSPDLILPLHGLRNVKAIDYDPLDKFIYWVDGRQN-IKRAKDDGTQPF-VLTSLS 970 980 990 1000 1010 1020 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE3 PSQNLEIQPYDLSIDIYSRYIYWTCEATNVINVTRLDGRSVGVVLKGEQDRPRAIVVNPE .:: . ::.::::::::: ..:::::::.::: ::.:...::::.:..:.::::::: : XP_011 QGQNPDRQPHDLSIDIYSRTLFWTCEATNTINVHRLSGEAMGVVLRGDRDKPRAIVVNAE 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE3 KGYMYFTNLQERSPKIERAALDGTEREVLFFSGLSKPIALALDSRLGKLFWADSDLRRIE .::.::::.:.:. :::::::::::::::: .:: .:.::..:. ::::::.:.::.::: XP_011 RGYLYFTNMQDRAAKIERAALDGTEREVLFTTGLIRPVALVVDNTLGKLFWVDADLKRIE 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE3 SSDLSGANRIVLEDSNILQPVGLTVFENWLYWIDKQQQMIEKIDMTGREGRTKVQARIAQ : :::::::..:::.::.::.:::.. . :::::.::::::... : . ::..:.:.:. 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