FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3526, 1036 aa 1>>>pF1KE3526 1036 - 1036 aa - 1036 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.0430+/-0.0011; mu= -17.3663+/- 0.067 mean_var=450.7420+/-91.862, 0's: 0 Z-trim(114.6): 13 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.060410 statistics sampled from 15334 (15346) to 15334 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.753), E-opt: 0.2 (0.459), width: 16 Scan time: 3.180 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS6833.2 DAB2IP gene_id:153090|Hs109|chr9 (1132) 6851 612.1 2.1e-174 CCDS6832.1 DAB2IP gene_id:153090|Hs109|chr9 (1065) 6829 610.2 7.6e-174 CCDS1322.1 RASAL2 gene_id:9462|Hs109|chr1 (1139) 3742 341.2 7.9e-93 CCDS1321.2 RASAL2 gene_id:9462|Hs109|chr1 (1280) 3110 286.1 3.3e-76 CCDS34434.2 SYNGAP1 gene_id:8831|Hs109|chr6 (1343) 1727 165.6 6.7e-40 CCDS46006.1 RASAL3 gene_id:64926|Hs109|chr19 (1011) 1506 146.3 3.3e-34 CCDS47243.1 RASA1 gene_id:5921|Hs109|chr5 ( 870) 635 70.3 2.1e-11 CCDS34200.1 RASA1 gene_id:5921|Hs109|chr5 (1047) 635 70.3 2.4e-11 >>CCDS6833.2 DAB2IP gene_id:153090|Hs109|chr9 (1132 aa) initn: 6851 init1: 6851 opt: 6851 Z-score: 3244.7 bits: 612.1 E(33420): 2.1e-174 Smith-Waterman score: 6851; 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CCDS13 VSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMENLRRTVQPNKDNCRRAENV 120 130 140 150 160 170 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 LKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVH :.::.:::::: ::::.:::::::.:.::::.: :.::.:::::::: .::::...::: CCDS13 LRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFWGEHFEFFSLPPLHSITVH 180 190 200 210 220 230 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 LYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARY .:....:::::..:.:.:::..:.:::.::::::::::: ::.:. :: :: ::::.:. CCDS13 IYKDVEKKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTPNKGKTGGPSIRIKSRF 240 250 260 270 280 290 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 QTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLT :::::::::.:::::: .:..: ::..:::..:...:::.: ::::::::::..::::: CCDS13 QTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELACALVHILQSTGRAKDFLT 300 310 320 330 340 350 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 DLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEV ::.::::::::... :::::::.:::.::::::::::.::.::::::::::::::::::: CCDS13 DLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHDALGEFIKALYESDENCEV 360 370 380 390 400 410 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 DPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISE ::::::...: .::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:.: .::. :::: CCDS13 DPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWKQQCLNRGKQDISE 420 430 440 450 460 470 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 RLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYM ::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::: ::::::::::.::::: CCDS13 RLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAKVIQNLANFAKFGNKEEYM 480 490 500 510 520 530 460 470 480 490 500 pF1KE3 SFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLE-- .:::.:::::: .:.:::::::::.:.::: ::.:::::::::: :::::::.::::. CCDS13 AFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRELSVLHSLLWEVVSQLDKG 540 550 560 570 580 590 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 -----QSIVSKLGPLPRILRDVHTALS--TPGSGQLPGTNDLASTPGSGSSSISAGLQKM :. :.:::::::.: :. .:. :: . :: .. :.:. :.:.:.:::: CCDS13 ENSFLQATVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNSSPNV-SGSLSSGLQK- 600 610 620 630 640 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 VIENDLSGLIDFTRLPSPTPENKDLFFVTRSSG-VQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGK ..:. .. :. .: ::. .: : .: .. :: . ..: .::: .: . .. :: . CCDS13 IFEDPTDS--DLHKLKSPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSMTYSEKDERESSLPNG-R 650 660 670 680 690 700 630 640 650 660 670 pF1KE3 SLSMVDLQDARTLDGEAGSPAGPDVLP---TDGQAAAAQLVAGWPARATPVNLAGLATVR :.:..::::... . : .: . :: : : .: . .:... : : . . :: CCDS13 SVSLMDLQDTHAAQVEHAS-VMLDV-PIRLTGSQLSITQVASIKQLRETQSTPQSAPQVR 710 720 730 740 750 760 680 690 700 710 720 730 pF1KE3 RAGQTPTTPGTSEGAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSS-- : : :. .. :: : :::::::::.. .: :.. ::. :. :. :: CCDS13 R----PLHPALNQ--PGG---LQPLSFQNPVYHLNNPIPAMPKASIDSSLENLSTASSRS 770 780 790 800 810 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 HSNSEELAAAAKLGSFSTAAEELARRP--GELARRQMSLTEKGGQPTVPRQNSAGPQ--R .::::.. . : ... :....: .: :. .. .. ..:::::.: : CCDS13 QSNSEDFKLS---GPSNSSMEDFTKRSTQSEDFSRRHTVPDRHIPLALPRQNSTGQAQIR 820 830 840 850 860 870 800 810 820 830 840 pF1KE3 RIDQPPPPPPPPPPAPRGRTPPNLLSTLQYPRPSSGTLASAS--PDWVGPSTRLRQQSSS ..:: . :...::.: . . .: ...::. . : ..: :::::: CCDS13 KVDQGGL-------GARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSVVSAALVAEPVQNGSRSRQQSSS 880 890 900 910 920 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 SKGDSPELKPRAVHKQGP----SPVSPNAL---DRTAAWLLTMNAQLLEDEGLGPDPPHR :. .:: : ::...: :::. .. .:::::.:. :.: :: . CCDS13 SR-ESPVPKVRAIQRQQTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLN-NGQYEEDV--------E 930 940 950 960 970 910 920 930 940 950 pF1KE3 DRLRSKDELSQAEK---DLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEE . .. :: ..::: ... :...::.:...::::: . ::. :::.:::.::::. CCDS13 ETEQNLDEAKHAEKYEQEITKLKERLRVSSRRLEEYERRLLVQEQQMQKLLLEYKARLED 980 990 1000 1010 1020 1030 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE3 GEERLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVEEELKKDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRIASLDA .:::::::::.:: :::.::::::.::::::::::::::..:.::::::::::::.:::. CCDS13 SEERLRRQQEEKDSQMKSIISRLMAVEEELKKDHAEMQAVIDAKQKIIDAQEKRIVSLDS 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1020 1030 pF1KE3 ANARLMSALTQLKESMH ::.::::::::.:: CCDS13 ANTRLMSALTQVKERYSMQVRNGISPTNPTKLSITENGEFKNSSC 1100 1110 1120 1130 >>CCDS1321.2 RASAL2 gene_id:9462|Hs109|chr1 (1280 aa) initn: 3504 init1: 2842 opt: 3110 Z-score: 1481.8 bits: 286.1 E(33420): 3.3e-76 Smith-Waterman score: 3781; 58.2% identity (79.9% similar) in 1057 aa overlap (1-1033:229-1249) 10 20 30 pF1KE3 MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEE .:.::::::::::::: :.:: :::. : CCDS13 IKRTKSQSKLDRNTSFRLPSLRSTDDRSRGLPKLKESRSHESLLSPCSTVECLDLGRGEP 200 210 220 230 240 250 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 VVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHI : .::.::::::::.::::: :::::::: ::.:::::::::::.:.::::: ::.:.. CCDS13 VSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMENLRRTVQPNKDNCRRAENV 260 270 280 290 300 310 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 LKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVH :.::.:::::: ::::.:::::::.:.::::.: :.::.:::::::: .::::...::: CCDS13 LRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFWGEHFEFFSLPPLHSITVH 320 330 340 350 360 370 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 LYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARY .:....:::::..:.:.:::..:.:::.::::::::::: ::.:. :: :: ::::.:. CCDS13 IYKDVEKKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTPNKGKTGGPSIRIKSRF 380 390 400 410 420 430 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 QTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLT :::::::::.:::::: .:..: ::..:::..:...:::.: ::::::::::..::::: CCDS13 QTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELACALVHILQSTGRAKDFLT 440 450 460 470 480 490 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 DLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEV ::.::::::::... :::::::.:::.::::::::::.::.::::::::::::::::::: CCDS13 DLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHDALGEFIKALYESDENCEV 500 510 520 530 540 550 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 DPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISE ::::::...: .::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:.: .::. :::: CCDS13 DPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWKQQCLNRGKQDISE 560 570 580 590 600 610 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 RLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYM ::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::: ::::::::::.::::: CCDS13 RLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAKVIQNLANFAKFGNKEEYM 620 630 640 650 660 670 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 SFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQS .:::.:::::: .:.:::::::::.:.::: ::.:::::::::: :::::::.::::... CCDS13 AFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRELSVLHSLLWEVVSQLDKA 680 690 700 710 720 730 520 530 540 550 560 pF1KE3 IVSKLGPLPRILRDVHTALS--TPGSGQLPGTNDLASTPGSGSSSISAGLQKMVIENDLS :.:::::::.: :. .:. :: . :: .. :.:. :.:.:.:::: ..:. . CCDS13 TVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNSSPNV-SGSLSSGLQK-IFEDPTD 740 750 760 770 780 790 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 GLIDFTRLPSPTPENKDLFFVTRSSG-VQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDL . :. .: ::. .: : .: .. :: . ..: .::: .: . .. :: .:.:..:: CCDS13 S--DLHKLKSPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSMTYSEKDERESSLPNG-RSVSLMDL 800 810 820 830 840 850 630 640 650 660 670 680 pF1KE3 QDARTLDGEAGSPAGPDVLP---TDGQAAAAQLVAGWPARATPVNLAGLATVRRAGQTPT ::... . : .: . :: : : .: . .:... : : . . ::: : CCDS13 QDTHAAQVEHAS-VMLDV-PIRLTGSQLSITQVASIKQLRETQSTPQSAPQVRR----PL 860 870 880 890 900 690 700 710 720 730 740 pF1KE3 TPGTSEGAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSS--HSNSEEL :. .. :: : :::::::::.. .: :.. ::. :. :. :: .::::.. CCDS13 HPALNQ--PGG---LQPLSFQNPVYHLNNPIPAMPKASIDSSLENLSTASSRSQSNSEDF 910 920 930 940 950 960 750 760 770 780 790 pF1KE3 AAAAKLGSFSTAAEELARRP--GELARRQMSLTEKGGQPTVPRQNSAGPQ--RRIDQPPP . : ... :....: .: :. .. .. ..:::::.: :..:: CCDS13 KLS---GPSNSSMEDFTKRSTQSEDFSRRHTVPDRHIPLALPRQNSTGQAQIRKVDQGGL 970 980 990 1000 1010 800 810 820 830 840 850 pF1KE3 PPPPPPPAPRGRTPPNLLSTLQYPRPSSGTLASAS--PDWVGPSTRLRQQSSSSKGDSPE . :...::.: . . .: ...::. . : ..: :::::::. .:: CCDS13 -------GARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSVVSAALVAEPVQNGSRSRQQSSSSR-ESPV 1020 1030 1040 1050 1060 1070 860 870 880 890 900 pF1KE3 LKPRAVHKQGP----SPVSPNAL---DRTAAWLLTMNAQLLEDEGLGPDPPHRDRLRSKD : ::...: :::. .. .:::::.:. :.: :: .. .. : CCDS13 PKVRAIQRQQTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLN-NGQYEEDV--------EETEQNLD 1080 1090 1100 1110 1120 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 ELSQAEK---DLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEGEERLRR : ..::: ... :...::.:...::::: . ::. :::.:::.::::..:::::: CCDS13 EAKHAEKYEQEITKLKERLRVSSRRLEEYERRLLVQEQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRR 1130 1140 1150 1160 1170 1180 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE3 QQEDKDIQMKGIISRLMSVEEELKKDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRIASLDAANARLMS :::.:: :::.::::::.::::::::::::::..:.::::::::::::.:::.::.:::: CCDS13 QQEEKDSQMKSIISRLMAVEEELKKDHAEMQAVIDAKQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMS 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1030 pF1KE3 ALTQLKESMH ::::.:: CCDS13 ALTQVKERYSMQVRNGISPTNPTKLSITENGEFKNSSC 1250 1260 1270 1280 >>CCDS34434.2 SYNGAP1 gene_id:8831|Hs109|chr6 (1343 aa) initn: 2969 init1: 1706 opt: 1727 Z-score: 830.1 bits: 165.6 E(33420): 6.7e-40 Smith-Waterman score: 3255; 50.1% identity (72.4% similar) in 1103 aa overlap (1-979:174-1263) 10 20 30 pF1KE3 MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEE : .:::.:::::::::::.:::.:...:. CCDS34 TKSQPKLDRTSSFRQILPRFRSADHDRARLMQSFKESHSHESLLSPSSAAEALELNLDED 150 160 170 180 190 200 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 VVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHI .:::::::::::..:::::::::.:::.::::::::::.:::.:::.:::::::::... CCDS34 SIIKPVHSSILGQEFCFEVTTSSGTKCFACRSAAERDKWIENLQRAVKPNKDNSRRVDNV 210 220 230 240 250 260 100 110 120 130 140 pF1KE3 LKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKT---DNVFWGEHFEFHNLPPLRTV ::::.:::..:: ::.: :::::::.::::::.: .. :.:::::::::.::: .:.. CCDS34 LKLWIIEARELPPKKRYYCELCLDDMLYARTTSKPRSASGDTVFWGEHFEFNNLPAVRAL 270 280 290 300 310 320 150 160 170 180 190 pF1KE3 TVHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGG---------- .::::..:::.::.. .:.:::..:.:..:::.:.:.::::. :. .:: CCDS34 RLHLYRDSDKKRKKDKAGYVGLVTVPVATLAGRHFTEQWYPVTLPTGSGGSGGMGSGGGG 330 340 350 360 370 380 200 210 220 230 240 pF1KE3 --------KGPG--PMIRIKARYQTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKT :: : : .:.::::::..:::::.::::::..:::: :::.::: :..: CCDS34 GSGGGSGGKGKGGCPAVRLKARYQTMSILPMELYKEFAEYVTNHYRMLCAVLEPALNVKG 390 400 410 420 430 440 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 KEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQ :::.:::::::::::::.::::.:. :::::: . ::::::::::::::::::..:.:: CCDS34 KEEVASALVHILQSTGKAKDFLSDMAMSEVDRFMEREHLIFRENTLATKAIEEYMRLIGQ 450 460 470 480 490 500 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 KYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPR :::.::.::::.:::::.::::::: ::.:..: :::.::.::::::.::..::.::::: CCDS34 KYLKDAIGEFIRALYESEENCEVDPIKCTASSLAEHQANLRMCCELALCKVVNSHCVFPR 510 520 530 540 550 560 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 ELKEVFASWRQECSSRGRPDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTL :::::::::: .:. ::: ::..::::::::::::::::::::::.:.:::::..:.::: CCDS34 ELKEVFASWRLRCAERGREDIADRLISASLFLRFLCPAIMSPSLFGLMQEYPDEQTSRTL 570 580 590 600 610 620 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 TLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYI :::::: ::::::.:: :::....:::.::: :: .::.:: :::: .::.:...::::: CCDS34 TLIAKVIQNLANFSKFTSKEDFLGFMNEFLELEWGSMQQFLYEISNLDTLTNSSSFEGYI 630 640 650 660 670 680 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 DLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIVSKLGPLPRILRDVHTALSTPGSGQLPGTNDLASTP :::::::.::.::::.. :: . . :::::::.: :. ::: .:. . :. .. : CCDS34 DLGRELSTLHALLWEVLPQLSKEALLKLGPLPRLLNDISTALRNPNIQRQPSRQSERPRP 690 700 710 720 730 740 550 560 570 580 pF1KE3 GSGS-SSISAGLQKMVIEN-----DLS-----GL---IDFTRLPSPTPEN---------K . :: .: ..... ::. :: .:..:::::: :. : CCDS34 QPVVLRGPSAEMQGYMMRDLNSSIDLQSFMARGLNSSMDMARLPSPTKEKPPPPPPGGGK 750 760 770 780 790 800 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 DLFFVTRSSGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDLQDARTLDGEAGSPAGPD :::.:.: .. ::: .: :. .::. .: . .::.::.::: :: .: . . CCDS34 DLFYVSRPPLARSSPAYCTSSSDITEPEQKMLSVNKSVSMLDLQG----DGPGGRLNSSS 810 820 830 840 850 650 660 670 680 690 pF1KE3 V--LPTDG---QAAAAQLVAGWPARATP---VNLAGLATVRRAGQTPTTPG-TSEGAPGR : : . : ... :.:.:. : .: .. .. ... ::. . : :..:.:.. CCDS34 VSNLAAVGDLLHSSQASLTAALGLRPAPAGRLSQGSGSSITAAGMRLSQMGVTTDGVPAQ 860 870 880 890 900 910 700 710 720 730 pF1KE3 PQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSSH------------------- :: :::::::...::: : : : : .: ::. ::: CCDS34 -QLRIPLSFQNPLFHMAADGPGPPGGHGGGG--GHGPPSSHHHHHHHHHHRGGEPPGDTF 920 930 940 950 960 970 740 750 760 770 780 pF1KE3 ------SNSEELAA------AAKLGSFSTAAEELARRPGELARRQMSLTEKGGQPTVPRQ :.::.:.. ::.. . ..:.. ...:::.:: .. . : : CCDS34 APFHGYSKSEDLSSGVPKPPAASILHSHSYSDEFGPSGTDFTRRQLSLQDNLQHMLSPPQ 980 990 1000 1010 1020 1030 790 800 810 820 830 pF1KE3 NSAGPQRRIDQPPPPPP--------------PPPPAPRGRTPPNLLSTLQYPRPSSGTLA . :::: : : : ::: ::.. .:. : ::::::.: CCDS34 ITIGPQR----PAPSGPGGGSGGGSGGGGGGQPPPLQRGKSQQLTVSAAQKPRPSSGNLL 1040 1050 1060 1070 1080 1090 840 850 860 870 pF1KE3 SASPDWVGPSTRLRQQSSSSKGD-----------SPELKPRAV--HKQGPSPVSPN--AL .. ::. : :::: :..:. . ::: . :.: :: ..:. : CCDS34 QSPEPSYGPA-RPRQQSLSKEGSIGGSGGSGGGGGGGLKPSITKQHSQTPSTLNPTMPAS 1100 1110 1120 1130 1140 1150 880 890 900 910 920 pF1KE3 DRTAAWLLTM--------NAQLLEDE-GLGPDPPHRDRLRSKDELSQAEKDLAVLQDKLR .::.::. .: .:.. ..: : :. : :.... :... :...:. CCDS34 ERTVAWVSNMPHLSADIESAHIEREEYKLKEYSKSMDESRL-DRVKEYEEEIHSLKERLH 1160 1170 1180 1190 1200 1210 930 940 950 960 970 980 pF1KE3 ISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEGEERLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVE .:..:::::: . ::: :.:....::::::..:.:::.:: .:: :.:.:: CCDS34 MSNRKLEEYERRLLSQEEQTSKILMQYQARLEQSEKRLRQQQAEKDSQIKSIIGRLMLVE 1220 1230 1240 1250 1260 1270 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE3 EELKKDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRIASLDAANARLMSALTQLKESMH CCDS34 EELRRDHPAMAEPLPEPKKRLLDAQERQLPPLGPTNPRVTLAPPWNGLAPPAPPPPPRLQ 1280 1290 1300 1310 1320 1330 >>CCDS46006.1 RASAL3 gene_id:64926|Hs109|chr19 (1011 aa) initn: 1549 init1: 1082 opt: 1506 Z-score: 727.8 bits: 146.3 E(33420): 3.3e-34 Smith-Waterman score: 1530; 44.6% identity (67.1% similar) in 605 aa overlap (9-599:228-802) 10 20 30 pF1KE3 MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEEVVIKPVHS :.::: . : :::. :..: : :.: CCDS46 VHNVRGLLKRLKEKKKARLEPRDGPPSALGSRESLATLS----ELDLGAERDVRIWPLHP 200 210 220 230 240 250 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 SILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHILKLWVIEA :.::. .::.:: ..::.:::::::::::.:.:.::: .:..:: .: : :..:: :: CCDS46 SLLGEPHCFQVTWTGGSRCFSCRSAAERDRWIEDLRRQFQPTQDNVEREETWLSVWVHEA 260 270 280 290 300 310 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 KDLP----AKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVHLYRE : :: . :: :: .: :::. . ..::.:.:.:. ::: : ....: : CCDS46 KGLPRAAAGAPGVRAELWLDGALLARTAPRAGPGQLFWAERFHFEALPPARRLSLRL-RG 320 330 340 350 360 370 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 TDKKKKKERNSYLGLVSL--PAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARYQT . :.: : : : .:: .:.:.:.. : : .: . : . CCDS46 LGPGSAVLGRVALALEELDAPRAPAAG---LERWFPLL------GAPAGAALRARIRARR 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 ITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDL . .:: : :::.:: .: :: ::.:::: : :..:::.:.:.:..:..::... ..::: CCDS46 LRVLPSERYKELAEFLTFHYARLCGALEPALPAQAKEELAAAMVRVLRATGRAQALVTDL 430 440 450 460 470 480 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 MMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEVDP .:. ::: : :.:::::::::::.::.:::.: :::..::. .. : : :.::::: CCDS46 GTAELARCGGREALLFRENTLATKAIDEYMKLVAQDYLQETLGQVVRRLCASTEDCEVDP 490 500 510 520 530 540 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 SKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISERL ::: :..:::::. :. :: .: ::.:: :: :: ::.:::. :. :: .. :: CCDS46 SKCPASELPEHQARLRNSCEEVFETIIHSYDWFPAELGIVFSSWREACKERGSEVLGPRL 550 560 570 580 590 600 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 ISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSF . ::::::.:::::..::::.: ..: :::::::::: ::::: : :: :: ::.: CCDS46 VCASLFLRLLCPAILAPSLFGLAPDHPAPGPARTLTLIAKVIQNLANRAPFGEKEAYMGF 610 620 630 640 650 660 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 MNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIV ::.:::.. :: :: ... .. . .:..: ::. .:. ::. : ..:.:. CCDS46 MNSFLEEHGPAMQCFLDQVAMVDVDAAPSGYQGSGDLALQLAVLHAQLCTIFAELDQTTR 670 680 690 700 710 720 520 530 540 550 560 pF1KE3 SKLGPLPRILRDVHTA----LSTPGSGQLPGTNDLASTPGSGSSSISAGLQKMVIENDLS . : ::: ::: .. . .:.: :: :.. ::.::: . 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CCDS47 EEYSEFKELILQKELHVVYALSHV-CGQDRTLLASILLRIFLHE-KLESLLLCTLNDREI 550 560 570 580 590 600 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 RCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKC-SA :. .:: .:::. .:.:.: .. .... :: . : ..:: ..::..::: . CCDS47 SMEDEATTLFRATTLASTLMEQYMKATATQFVHHALKDSILKIMESKQSCELSPSKLEKN 610 620 630 640 650 660 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 ADLPEHQGNL-KMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDIS--ERLIS :. . .: .. ::. ::. . ..: :. ... .. . . . . :..: CCDS47 EDVNTNLTHLLNILSELVE-KIFMASEILPPTLRYIYGCLQKSVQHKWPTNTTMRTRVVS 670 680 690 700 710 720 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 ASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMN . .:::..::::..: .::.... :. .:::: :.:: .:::::...::.:: :: .: CCDS47 GFVFLRLICPAILNPRMFNIISDSPSPIAARTLILVAKSVQNLANLVEFGAKEPYMEGVN 730 740 750 760 770 780 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 QFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIVSK :.. . : :: :..: : .:. .. ::.:.:..:: . ..: ... .. CCDS47 PFIKSNKHRMIMFLDELGNVPELPDTTE-HSRTDLSRDLAALHEICVAHSDEL-RTLSNE 790 800 810 820 830 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 LGPLPRILRDVH--TALSTPGSGQLPGTNDLASTPGSGSSSISAGLQKMVIENDLSGLID : ..:. . : : ..: :::. CCDS47 RGAQQHVLKKLLAITELLQQKQNQYTKTNDVR 840 850 860 870 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 FTRLPSPTPENKDLFFVTRSSGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDLQDART >>CCDS34200.1 RASA1 gene_id:5921|Hs109|chr5 (1047 aa) initn: 379 init1: 264 opt: 635 Z-score: 317.3 bits: 70.3 E(33420): 2.4e-11 Smith-Waterman score: 671; 28.1% identity (60.4% similar) in 541 aa overlap (23-543:520-1046) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEEVVIKPVHSSILGQDYCFEVTTS .:::. : ::.:..:. ::..... 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CCDS34 EEYSEFKELILQKELHVVYALSHV-CGQDRTLLASILLRIFLHE-KLESLLLCTLNDREI 730 740 750 760 770 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 RCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKC-SA :. .:: .:::. .:.:.: .. .... :: . : ..:: ..::..::: . CCDS34 SMEDEATTLFRATTLASTLMEQYMKATATQFVHHALKDSILKIMESKQSCELSPSKLEKN 780 790 800 810 820 830 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 ADLPEHQGNL-KMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDIS--ERLIS :. . .: .. ::. ::. . ..: :. ... .. . . . . :..: CCDS34 EDVNTNLTHLLNILSELVE-KIFMASEILPPTLRYIYGCLQKSVQHKWPTNTTMRTRVVS 840 850 860 870 880 890 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 ASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMN . .:::..::::..: .::.... :. .:::: :.:: .:::::...::.:: :: .: CCDS34 GFVFLRLICPAILNPRMFNIISDSPSPIAARTLILVAKSVQNLANLVEFGAKEPYMEGVN 900 910 920 930 940 950 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 QFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIVSK :.. . : :: :..: : .:. .. ::.:.:..:: . ..: ... .. 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