FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3662, 976 aa 1>>>pF1KE3662 976 - 976 aa - 976 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 64369986 residues in 92320 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.5052+/-0.000637; mu= -13.2228+/- 0.038 mean_var=814.1399+/-184.441, 0's: 0 Z-trim(116.0): 1216 B-trim: 1546 in 1/55 Lambda= 0.044949 statistics sampled from 26329 (28009) to 26329 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.303), width: 16 Scan time: 6.910 The best scores are: opt bits E(92320) NP_004422 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A rece ( 976) 6628 447.5 1.7e-124 NP_001316019 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A r ( 922) 6253 423.2 3.5e-117 XP_016856026 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A r ( 577) 3875 268.6 7e-71 XP_016865854 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor ( 989) 3390 237.5 2.8e-61 NP_004429 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor 4 ( 986) 3324 233.3 5.4e-60 NP_001291465 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 986) 3324 233.3 5.4e-60 NP_001350677 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 949) 3261 229.1 9e-59 NP_001291466 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 935) 3231 227.2 3.4e-58 NP_005223 (OMIM: 179610) ephrin type-A receptor 1 ( 976) 2932 207.8 2.4e-52 NP_872272 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 (1015) 2829 201.2 2.5e-50 NP_001268695 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1016) 2817 200.4 4.3e-50 XP_005264772 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor ( 982) 2700 192.8 8.2e-48 NP_005224 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3 ( 983) 2651 189.6 7.4e-47 XP_005264773 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor ( 918) 2516 180.8 3.1e-44 NP_004435 (OMIM: 600011,617300,618196) ephrin type ( 987) 2298 166.7 5.8e-40 XP_016863369 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 852) 2039 149.8 6e-35 XP_016863367 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 904) 2035 149.6 7.5e-35 NP_004434 (OMIM: 601839) ephrin type-B receptor 3 ( 998) 1991 146.8 5.7e-34 XP_016863370 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 817) 1945 143.7 4e-33 XP_016863368 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 869) 1944 143.7 4.4e-33 NP_001275558 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor ( 993) 1888 140.1 5.8e-32 XP_005248726 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor ( 994) 1881 139.7 8e-32 XP_005265710 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 874) 1850 137.6 3e-31 XP_011530037 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 926) 1850 137.6 3.1e-31 NP_001305690 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 969) 1850 137.7 3.2e-31 NP_004430 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 (1037) 1850 137.7 3.3e-31 NP_001268694 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1038) 1850 137.7 3.3e-31 NP_004432 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor 1 ( 984) 1830 136.4 7.9e-31 XP_024309158 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor (1016) 1830 136.4 8e-31 XP_024309157 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor (1016) 1830 136.4 8e-31 XP_016861356 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor (1032) 1830 136.4 8.1e-31 XP_016861355 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor (1038) 1830 136.4 8.1e-31 XP_024309663 (OMIM: 600997,603688,618462) ephrin t ( 545) 1796 133.8 2.6e-30 XP_016867305 (OMIM: 600011,617300,618196) ephrin t (1005) 1799 134.4 3.2e-30 NP_059145 (OMIM: 600997,603688,618462) ephrin type ( 986) 1796 134.2 3.6e-30 NP_001296122 (OMIM: 600997,603688,618462) ephrin t (1055) 1796 134.2 3.8e-30 NP_004431 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor 7 ( 998) 1787 133.6 5.5e-30 XP_006710505 (OMIM: 600997,603688,618462) ephrin t ( 956) 1771 132.5 1.1e-29 XP_006710504 (OMIM: 600997,603688,618462) ephrin t ( 980) 1771 132.5 1.1e-29 NP_004433 (OMIM: 600997,603688,618462) ephrin type ( 987) 1771 132.5 1.1e-29 NP_001268696 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1004) 1756 131.6 2.2e-29 XP_016861699 (OMIM: 600066) ephrin type-A receptor (1104) 1754 131.5 2.6e-29 NP_001296121 (OMIM: 600997,603688,618462) ephrin t ( 928) 1743 130.7 3.8e-29 XP_006715943 (OMIM: 179610) ephrin type-A receptor ( 861) 1737 130.3 4.8e-29 XP_005248728 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor ( 610) 1659 125.0 1.3e-27 NP_872585 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3 ( 539) 1616 122.1 8.5e-27 XP_011539277 (OMIM: 176945) ephrin type-A receptor ( 600) 1598 121.0 2e-26 XP_024309660 (OMIM: 176945) ephrin type-A receptor ( 600) 1598 121.0 2e-26 XP_011539275 (OMIM: 176945) ephrin type-A receptor ( 930) 1598 121.3 2.6e-26 XP_011539271 (OMIM: 176945) ephrin type-A receptor ( 930) 1598 121.3 2.6e-26 >>NP_004422 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A receptor (976 aa) initn: 6628 init1: 6628 opt: 6628 Z-score: 2356.7 bits: 447.5 E(92320): 1.7e-124 Smith-Waterman score: 6628; 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XP_016 DMSNQDVIKAIEEGYRLPAPMDCPAGLHQLMLDCWQKERAERPKFEQIVGILDKMIRNPN 830 840 850 860 870 880 880 890 900 910 920 930 pF1KE3 SLKT-LADFDPRVSIRLPSTSGSEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKVVQ :::: :. . .: : ... . . : .:.:::..:::..: ..: ::::...:.:.. XP_016 SLKTPLGTCSRPISPLLDQNT-PDFTTFCSVGEWLQAIKMERYKDNFTAAGYNSLESVAR 890 900 910 920 930 940 940 950 960 970 pF1KE3 MTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTVGIPI :: .:. .:. : ::::.: :. .. :. XP_016 MTIEDVMSLGITLVGHQKKIMSSIQTMRAQMLHLHGTGIQV 950 960 970 980 >>NP_004429 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor 4 isof (986 aa) initn: 3194 init1: 1526 opt: 3324 Z-score: 1198.7 bits: 233.3 E(92320): 5.4e-60 Smith-Waterman score: 3324; 52.3% identity (77.1% similar) in 980 aa overlap (8-969:8-976) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MELQAARACFALLWG-C-ALAAAAAAQGKEVVLLDFAAAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNI : :. :.: : :.... . ..::.::: .. :::::.. : ::. . .: NP_004 MAGIFYFALFSCLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRSVQGELGWIASPLEGGWEEV-SI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 MND--MPIYMYSVCNVMSGDQDNWLRTNWVYRGEAERIFIELKFTVRDCNSFPGGASSCK :.. :: :.::::: .:.:::::.:. : :.:..::.:::.:::::.:: ..:: NP_004 MDEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTCK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 ETFNLYYAESDLDYGTNFQKRLFTKIDTIAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTRK ::::::: ::: : ... :.:::::: :: .. :. : .:::.: :.::::..: NP_004 ETFNLYYYESDNDKERFIRENQFVKIDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEIRDVGPLSKK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 GFYLAFQDIGACVALLSVRVYYKKCPELLQGLAHFPETIAGSDAPSLATVAGTCVDHAVV ::::::::.:::.::.::::.::::: ...::.::.::.:.:. ::. : :.::... 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NP_001 VKYYEK-DQNERSYRIVRTAARNTDIKGLNPLTSYVFHVRARTAAGYGDFSEPLEVTTNT 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 -PE---GSGNLAVIGGVAV-GVVLLLVLAGVGFFIHRRR-KNQRARQ-SPEDVYFSKSEQ : :.: ... :.: : :.:.:. ..: : ::: : ..:.: . :. ..... NP_001 VPSRIIGDGANSTVLLVSVSGSVVLVVILIAAFVISRRRSKYSKAKQEADEEKHLNQG-- 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 LKPLKTYVDPHTYEDPNQAVLKFTTEIHPSCVTRQKVIGAGEFGEVYKGMLKTSSGKKEV ..::::: ::::::::: .:. :: ::. .::::.:::::: .: ::. ::.:. NP_001 ---VRTYVDPFTYEDPNQAVREFAKEIDASCIKIEKVIGVGEFGEVCSGRLKVP-GKREI 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KE3 PVAIKTLKAGYTEKQRVDFLGEAGIMGQFSHHNIIRLEGVISKYKPMMIITEYMENGALD :::::::::::.::: :::.::.:::::.: :::.::::..: ::.::::::::::.:: NP_001 CVAIKTLKAGYTDKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYMENGSLD 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KE3 KFLREKDGEFSVLQLVGMLRGIAAGMKYLANMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLS :::..::.:.:.:::::::::..:::::..:.:::::::::::::::::::::::::.: NP_001 AFLRKNDGRFTVIQLVGMLRGIGSGMKYLSDMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGMS 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 pF1KE3 RVLEDDPEATYTTSGGKIPIRWTAPEAISYRKFTSASDVWSFGIVMWEVMTYGERPYWEL :::::::::.::: ::::::::::::::.::::::::::::.::::::::.:::::::.. NP_001 RVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDM 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 pF1KE3 SNHEVMKAINDGFRLPTPMDCPSAIYQLMMQCWQQERARRPKFADIVSILDKLIRAPDSL ::..:.:::..:.::: ::::: :..:::..:::.::. ::::..::..:::::: :.:: NP_001 SNQDVIKAIEEGYRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLIRNPNSL 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 pF1KE3 KTLADFDPRVSIRLPSTSGSEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKVVQMTN : . . : . : . :. : .:..::..:::..: ..: :::::..: ::.... NP_001 KRTGTESSRPNTALLDPSSPEFSAVVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLEAVVHVNQ 890 900 910 920 930 940 950 960 970 pF1KE3 DDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTVGIPI . NP_001 E >>NP_001291466 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor 4 i (935 aa) initn: 3113 init1: 1526 opt: 3231 Z-score: 1166.3 bits: 227.2 E(92320): 3.4e-58 Smith-Waterman score: 3231; 53.0% identity (77.5% similar) in 934 aa overlap (52-969:3-925) 30 40 50 60 70 pF1KE3 AAAQGKEVVLLDFAAAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNIMND--MPIYMYSVCNVMSGDQDN :. . .::.. :: :.::::: .:.: NP_001 MKWEEV-SIMDEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNN 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 WLRTNWVYRGEAERIFIELKFTVRDCNSFPGGASSCKETFNLYYAESDLDYGTNFQKRLF ::::.:. : :.:..::.:::.:::::.:: ..::::::::: ::: : ... : NP_001 WLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTCKETFNLYYYESDNDKERFIRENQF 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 TKIDTIAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTRKGFYLAFQDIGACVALLSVRVYYK .:::::: :: .. :. : .:::.: :.::::..:::::::::.:::.::.::::.:: NP_001 VKIDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEIRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVFYK 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 KCPELLQGLAHFPETIAGSDAPSLATVAGTCVDHAVVPPGGEEPRMHCAVDGEWLVPIGQ ::: ...::.::.::.:.:. ::. : :.::... . :.:.:..:::::::::. NP_001 KCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSCVNNS---EEKDVPKMYCGADGEWLVPIGN 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 CLCQAGYEKVEDACQACSPGFFKFEASESPCLECPEHTLPSPEGATSCECEEGFFRAPQD :::.::.:. ::::. :..: .... : .:: :. :::::: :..::::: .: NP_001 CLCNAGHEERSGECQACKIGYYKALSTDATCAKCPPHSYSVWEGATSCTCDRGFFRADND 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 PASMPCTRPPSAPHYLTAVGMGAKVELRWTPPQDSGGREDIVYSVTCEQCWP-ESGECGP :::::::::::: : . ..:.:.:. ::..:::.:: :.:.:..: . ..: : NP_001 AASMPCTRPPSAPLNLISNVNETSVNLEWSSPQNTGGRQDISYNVVCKKCGAGDPSKCRP 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 CEASVRYSEPPHGLTRTSVTVSDLEPHMNYTFTVEARNGVSGLVTSRSFRTASVSI--NQ : ..:.:. .:: :.:...:: : :::: . : :::: . . ...::.. :: NP_001 CGSGVHYTPQQNGLKTTKVSITDLLAHTNYTFEIWAVNGVSKYNPNPD-QSVSVTVTTNQ 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 pF1KE3 TEPPKVRL-EGRSTTSLSVS--WSIPPPQQSRVWKYEVTYRKKGDSN--SYNVRRTEGFS . : .. : ... .: ::. : : .. . .::: : .: :.: :: . :: . . NP_001 AAPSSIALVQAKEVTRYSVALAWLEPDRPNGVILEYEVKYYEK-DQNERSYRIVRTAARN 390 400 410 420 430 440 500 510 520 530 540 pF1KE3 VTLDDLAPDTTYLVQVQALTQEGQGAGSKVHEFQTLS-PE---GSGNLAVIGGVAV-GVV . . : : :.:. .:.: : : : :. : : . : :.: ... :.: : : NP_001 TDIKGLNPLTSYVFHVRARTAAGYGDFSEPLEVTTNTVPSRIIGDGANSTVLLVSVSGSV 450 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 LLLVLAGVGFFIHRRR-KNQRARQSPEDVYFSKSEQLKPLKTYVDPHTYEDPNQAVLKFT .:.:. ..: : ::: : ..:.: .. ... . ..::::: ::::::::: .:. NP_001 VLVVILIAAFVISRRRSKYSKAKQEADE----EKHLNQGVRTYVDPFTYEDPNQAVREFA 510 520 530 540 550 560 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 TEIHPSCVTRQKVIGAGEFGEVYKGMLKTSSGKKEVPVAIKTLKAGYTEKQRVDFLGEAG :: ::. .::::.:::::: .: ::. ::.:. :::::::::::.::: :::.::. NP_001 KEIDASCIKIEKVIGVGEFGEVCSGRLKVP-GKREICVAIKTLKAGYTDKQRRDFLSEAS 570 580 590 600 610 620 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 IMGQFSHHNIIRLEGVISKYKPMMIITEYMENGALDKFLREKDGEFSVLQLVGMLRGIAA :::::.: :::.::::..: ::.::::::::::.:: :::..::.:.:.:::::::::.. NP_001 IMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYMENGSLDAFLRKNDGRFTVIQLVGMLRGIGS 630 640 650 660 670 680 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 GMKYLANMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEATYTTSGGKIPIRWTA :::::..:.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::: :::::::::: NP_001 GMKYLSDMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGMSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTA 690 700 710 720 730 740 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 PEAISYRKFTSASDVWSFGIVMWEVMTYGERPYWELSNHEVMKAINDGFRLPTPMDCPSA ::::.::::::::::::.::::::::.:::::::..::..:.:::..:.::: ::::: : NP_001 PEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQDVIKAIEEGYRLPPPMDCPIA 750 760 770 780 790 800 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 IYQLMMQCWQQERARRPKFADIVSILDKLIRAPDSLKTLADFDPRVSIRLPSTSGSEGVP ..:::..:::.::. ::::..::..:::::: :.::: . . : . : . :. : NP_001 LHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLIRNPNSLKRTGTESSRPNTALLDPSSPEFSA 810 820 830 840 850 860 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 FRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKVVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGL .:..::..:::..: ..: :::::..: ::.....:. :::. ::..: :. .. NP_001 VVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLEAVVHVNQEDLARIGITAITHQNKILSSVQAM 870 880 890 900 910 920 970 pF1KE3 KDQVNTVGIPI . :. NP_001 RTQMQQMHGRMVPV 930 >>NP_005223 (OMIM: 179610) ephrin type-A receptor 1 prec (976 aa) initn: 2388 init1: 912 opt: 2932 Z-score: 1061.3 bits: 207.8 E(92320): 2.4e-52 Smith-Waterman score: 3173; 50.7% identity (73.4% similar) in 977 aa overlap (16-967:16-976) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MELQAARACFALLWGCALAAAAAAQGKEVVLLDFAAAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNIMN :: .:..:::.:.: . : :::::: : ::. .:.:.: NP_005 MERRWPLGLGLVLLLCA-PLPPGARAKEVTLMDTSKAQGELGWLLDPPKDGWSEQQQILN 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE3 DMPIYMYSVCNVMSG--DQDNWLRTNWVYRGE-AERIFIELKFTVRDCNSFPGGAS--SC :.:::. : :.: : :.:::.::.:::: : :. .::.::::::.::::::. .: NP_005 GTPLYMYQDCP-MQGRRDTDHWLRSNWIYRGEEASRVHVELQFTVRDCKSFPGGAGPLGC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 KETFNLYYAESDLDYGTNFQKRLFTKIDTIAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTR :::::: : ::: : : .... :: :. :.: :. . :. . ::::::. :.: ::: NP_005 KETFNLLYMESDQDVGIQLRRPLFQKVTTVAADQSFTIRDLVSGSVKLNVERCSLGRLTR 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 KGFYLAFQDIGACVALLSVRVYYKKCPELLQGLAHFPETIAGSDAPSLATVAGTCVDHA- .:.::::.. ::::::.::::.:..::: :.:::.::.:. : .:. :::::. :: NP_005 RGLYLAFHNPGACVALVSVRVFYQRCPETLNGLAQFPDTLPG--PAGLVEVAGTCLPHAR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 VVP-PGGEEPRMHCAVDGEWLVPIGQCLCQAGYEK--VEDACQACSPGFFKFEASESPCL . : :.: :::::. :::::::.:.: :. :::. .:: :: : .... . :: NP_005 ASPRPSGA-PRMHCSPDGEWLVPVGRCHCEPGYEEGGSGEACVACPSGSYRMDMDTPHCL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 ECPEHTLPSPEGATSCECEEGFFRAPQDPASMPCTRPPSAPHYLTAVGMGAKVELRWTPP ::... :::: : :: : .::: . .. :: :::::. :. . :... ::: :: NP_005 TCPQQSTAESEGATICTCESGHYRAPGEGPQVACTGPPSAPRNLSFSASGTQLSLRWEPP 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 QDSGGREDIVYSVTCEQCW---PESGECGPCEASVRYSEPPHGLTRTSVTVSDLEPHMNY :.:::.:. ::: : :: ..: : :: ..:..: .::: .: :. :::. :: NP_005 ADTGGRQDVRYSVRCSQCQGTAQDGGPCQPCGVGVHFSPGARGLTTPAVHVNGLEPYANY 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 TFTVEARNGVSGLVTS-RSFRTASVSINQTEPPK---VRLEGRSTTSLSVSWSIPPPQQS ::.:::.:::::: .: .. ..:.:....: . .:: . .: ..:. :.. NP_005 TFNVEAQNGVSGLGSSGHASTSVSISMGHAESLSGLSLRLVKKEPRQLELTWAGSRPRSP 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 RV-WKYEVTYRKKGDSNSYNVRRTEGFSVTLDDLAPDTTYLVQVQALTQEGQGAGSKVHE . ::. .. : . :.. : : .: :::::.:.:. :: : : : :: NP_005 GANLTYELHVLNQ-DEERYQMVLEP--RVLLTELQPDTTYIVRVRMLTPLGPGPFSPDHE 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 pF1KE3 FQTLSPEGSGNLAVIGGVAVGVVLLLVLAG---VGFFIHRRRKNQRARQSPE-----DVY :.: : . : . :: :.:.. :.:.. .:... : :. :: ::. . :: NP_005 FRTSPPVSRG---LTGGEIVAVIFGLLLGAALLLGILVFRSRRAQRQRQQRQRDRATDVD 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 FSKSEQLKPLKTYVDPHTYEDPNQAVLKFTTEIHPSCVTRQKVIGAGEFGEVYKGMLKTS . ::: ::: ..:::: :..: :: :. :. . . ::: :::::::.: :. NP_005 REDKLWLKP---YVDLQAYEDPAQGALDFTRELDPAWLMVDTVIGEGEFGEVYRGTLRLP 590 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 pF1KE3 SGKKEVPVAIKTLKAGYTEKQRVDFLGEAGIMGQFSHHNIIRLEGVISKYKPMMIITEYM : .. ::::::: : .:: :: ::::::: .:..::::..: ::.:::::.: NP_005 SQDCKT-VAIKTLKDTSPGGQWWNFLREATIMGQFSHPHILHLEGVVTKRKPIMIITEFM 650 660 670 680 690 700 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 ENGALDKFLREKDGEFSVLQLVGMLRGIAAGMKYLANMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKV :::::: ::::.. .. :::.::.:::.::.::.: :::::::::::::::.:: ::: NP_005 ENGALDAFLREREDQLVPGQLVAMLQGIASGMNYLSNHNYVHRDLAARNILVNQNLCCKV 710 720 730 740 750 760 760 770 780 790 800 810 pF1KE3 SDFGLSRVLEDDPEATYTTSGGKIPIRWTAPEAISYRKFTSASDVWSFGIVMWEVMTYGE :::::.:.: :: ..:: :.::::::::::::::..: ::.::::::::::::::...:. NP_005 SDFGLTRLL-DDFDGTYETQGGKIPIRWTAPEAIAHRIFTTASDVWSFGIVMWEVLSFGD 770 780 790 800 810 820 820 830 840 850 860 870 pF1KE3 RPYWELSNHEVMKAINDGFRLPTPMDCPSAIYQLMMQCWQQERARRPKFADIVSILDKLI .:: :.::.::::.:.::.::: :.:::. .:.:: .:: .:::::.: . . :..:. NP_005 KPYGEMSNQEVMKSIEDGYRLPPPVDCPAPLYELMKNCWAYDRARRPHFQKLQAHLEQLL 830 840 850 860 870 880 880 890 900 910 920 930 pF1KE3 RAPDSLKTLADFDPRVSIRLPSTSGSEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEK : ::.:.:.::::...:::: :::.:.:.::::::::::.:..: :: .:: ..: NP_005 ANPHSLRTIANFDPRMTLRLPSLSGSDGIPYRTVSEWLESIRMKRYILHFHSAGLDTMEC 890 900 910 920 930 940 940 950 960 970 pF1KE3 VVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTVGIPI :...: .:. ..:. :::::::: :. :.:: NP_005 VLELTAEDLTQMGITLPGHQKRILCSIQGFKD 950 960 970 >>NP_872272 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 isof (1015 aa) initn: 3362 init1: 1595 opt: 2829 Z-score: 1025.1 bits: 201.2 E(92320): 2.5e-50 Smith-Waterman score: 3505; 53.4% identity (77.1% similar) in 984 aa overlap (11-976:38-1015) 10 20 30 pF1KE3 MELQAARACFALLWGCALAAAA-----AAQGKEVVLLDFA : :: : : :: :. ..:: ::: NP_872 GAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLASPSNEVNLLDSR 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 AAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNI-MNDMPIYMYSVCNVMSGDQDNWLRTNWVYRGEAERI .. :.:::.. : . ::. . .. : ::. :.::.:: .:.::: :.:. : :: NP_872 TVMGDLGWIAFPKN-GWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISNEGASRI 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 FIELKFTVRDCNSFPGGASSCKETFNLYYAESDLDYGTNFQKRLFTKIDTIAPDEITVSS :::::::.:::::.::: ..::::::.:: ::: . : :... . :::::: :: . NP_872 FIELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAADESFTEL 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 DFEARHVKLNVEERSVGPLTRKGFYLAFQDIGACVALLSVRVYYKKCPELLQGLAHFPET :. : .:::.: :.::::..:::::::::.:::.::.:::::::::: ... :: ::.: NP_872 DLGDRVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVFPDT 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 IAGSDAPSLATVAGTCVDHAVVPPGGEEPRMHCAVDGEWLVPIGQCLCQAGYEKVEDACQ :.:.:. .: :.:.::.:.:. : :.:::...::::::::.:.:.::::. . .:: NP_872 ITGADSSQLLEVSGSCVNHSVT---DEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNGTCQ 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 ACSPGFFKFEASESPCLECPEHTLPSPEGATSCECEEGFFRAPQDPASMPCTRPPSAPHY .: ::::: . : .:: :. :..::: ::. .:: .:: .: ::::::::. 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