Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3703
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3703, 1679 aa
1>>>pF1KE3703 1679 - 1679 aa - 1679 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.1096+/-0.00124; mu= -12.3539+/- 0.075
mean_var=651.4890+/-137.831, 0's: 0 Z-trim(117.6): 138 B-trim: 715 in 2/52
Lambda= 0.050248
statistics sampled from 18267 (18406) to 18267 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.802), E-opt: 0.2 (0.565), width: 16
Scan time: 8.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32552.1 KDM6B gene_id:23135|Hs108|chr17 (1682) 11797 871.6 0
CCDS14265.1 KDM6A gene_id:7403|Hs108|chrX (1401) 2367 187.9 2.1e-46
CCDS76073.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1264) 2344 186.2 6.2e-46
CCDS14783.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1347) 2344 186.2 6.5e-46
CCDS76075.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1363) 2344 186.2 6.5e-46
CCDS76074.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1389) 2344 186.2 6.6e-46
CCDS59184.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1392) 2344 186.2 6.6e-46
CCDS76076.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1399) 2344 186.2 6.7e-46
CCDS76079.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1444) 2344 186.2 6.8e-46
CCDS59185.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1211) 2108 169.1 8.5e-41
CCDS76078.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1335) 2108 169.1 9.1e-41
CCDS14784.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1240) 1943 157.1 3.4e-37
CCDS76077.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1367) 1562 129.5 7.6e-29
>>CCDS32552.1 KDM6B gene_id:23135|Hs108|chr17 (1682 aa)
initn: 10000 init1: 10000 opt: 11797 Z-score: 4640.1 bits: 871.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11797; 99.8% identity (99.8% similar) in 1682 aa overlap (1-1679:1-1682)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MHRAVDPPGARAAREAFALGGLSCAGAWSSCPPHPPPRSAWLPGGRCSASIGQPPLPAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MHRAVDPPGARAAREAFALGGLSCAGAWSSCPPHPPPRSAWLPGGRCSASIGQPPLPAPL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PPSHGSSSGHPSKPYYAPGAPTPRPLHGKLESLHGCVQALLREPAQPGLWEQLGQLYESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PPSHGSSSGHPSKPYYAPGAPTPRPLHGKLESLHGCVQALLREPAQPGLWEQLGQLYESE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 HDSEEATRCYHSALRYGGSFAELGPRIGRLQQAQLWNFHTGSCQHRAKVLPPLEQVWNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HDSEEATRCYHSALRYGGSFAELGPRIGRLQQAQLWNFHTGSCQHRAKVLPPLEQVWNLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 HLEHKRNYGAKRGGPPVKRAAEPPVVQPVPPAALSGPSGEEGLSPGGKRRRGCNSEQTGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HLEHKRNYGAKRGGPPVKRAAEPPVVQPVPPAALSGPSGEEGLSPGGKRRRGCNSEQTGL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE3 PPGLPLPPPPLPPPPPPPPPP---LPGLATSPPFQLTKPGLWSTLHGDAWGPERKGSAPP
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PPGLPLPPPPLPPPPPPPPPPPPPLPGLATSPPFQLTKPGLWSTLHGDAWGPERKGSAPP
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 ERQEQRHSLPHPYPYPAPAYTAHPPGHRLVPAAPPGPGPRPPGAESHGCLPATRPPGSDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ERQEQRHSLPHPYPYPAPAYTAHPPGHRLVPAAPPGPGPRPPGAESHGCLPATRPPGSDL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 RESRVQRSRMDSSVSPAATTACVPYAPSRPPGLPGTTTSSSSSSSSNTGLRGVEPNPGIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RESRVQRSRMDSSVSPAATTACVPYAPSRPPGLPGTTTSSSSSSSSNTGLRGVEPNPGIP
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 GADHYQTPALEVSHHGRLGPSAHSSRKPFLGAPAATPHLSLPPGPSSPPPPPCPRLLRPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GADHYQTPALEVSHHGRLGPSAHSSRKPFLGAPAATPHLSLPPGPSSPPPPPCPRLLRPP
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 PPPAWLKGPACRAAREDGEILEELFFGTEGPPRPAPPPLPHREGFLGPPASRFSVGTQDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PPPAWLKGPACRAAREDGEILEELFFGTEGPPRPAPPPLPHREGFLGPPASRFSVGTQDS
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 HTPPTPPTPTTSSSNSNSGSHSSSPAGPVSFPPPPYLARSIDPLPRPPSPAQNPQDPPLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HTPPTPPTPTTSSSNSNSGSHSSSPAGPVSFPPPPYLARSIDPLPRPPSPAQNPQDPPLV
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 PLTLALPPAPPSSCHQNTSGSFRRPESPRPRVSFPKTPEVGPGPPPGPLSKAPQPVPPGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PLTLALPPAPPSSCHQNTSGSFRRPESPRPRVSFPKTPEVGPGPPPGPLSKAPQPVPPGV
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 GELPARGPRLFDFPPTPLEDQFEEPAEFKILPDGLANIMKMLDESIRKEEEQQQHEAGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GELPARGPRLFDFPPTPLEDQFEEPAEFKILPDGLANIMKMLDESIRKEEEQQQHEAGVA
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE3 PQPPLKEPFASLQSPFPTDTAPTTTAPAVAVTTTTTTTTTTTATQEEEKKPPPALPPPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PQPPLKEPFASLQSPFPTDTAPTTTAPAVAVTTTTTTTTTTTATQEEEKKPPPALPPPPP
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KE3 LAKFPPPSQPQPPPPPPPSPASLLKSLASVLEGQKYCYRGTGAAVSTRPGPLPTTQYSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LAKFPPPSQPQPPPPPPPSPASLLKSLASVLEGQKYCYRGTGAAVSTRPGPLPTTQYSPG
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KE3 PPSGATALPPTSAAPSAQGSPQPSASSSSQFSTSGGPWARERRAGEEPVPGPMTPTQPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PPSGATALPPTSAAPSAQGSPQPSASSSSQFSTSGGPWARERRAGEEPVPGPMTPTQPPP
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KE3 PLSLPPARSESEVLEEISRACETLVERVGRSATDPADPVDTAEPADSGTERLLPPAQAKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PLSLPPARSESEVLEEISRACETLVERVGRSATDPADPVDTAEPADSGTERLLPPAQAKE
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE3 EAGGVAAVSGSCKRRQKEHQKEHRRHRRACKDSVGRRPREGRAKAKAKVPKEKSRRVLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EAGGVAAVSGSCKRRQKEHQKEHRRHRRACKDSVGRRPREGRAKAKAKVPKEKSRRVLGN
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE3 LDLQSEEIQGREKSRPDLGGASKAKPPTAPAPPSAPAPSAQPTPPSASVPGKKAREEAPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LDLQSEEIQGREKSRPDLGGASKAKPPTAPAPPSAPAPSAQPTPPSASVPGKKAREEAPG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE3 PPGVSRADMLKLRSLSEGPPKELKIRLIKVESGDKETFIASEVEERRLRMADLTISHCAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PPGVSRADMLKLRSLSEGPPKELKIRLIKVESGDKETFIASEVEERRLRMADLTISHCAA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE3 DVVRASRNAKVKGKFRESYLSPAQSVKPKINTEEKLPREKLNPPTPSIYLESKRDAFSPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DVVRASRNAKVKGKFRESYLSPAQSVKPKINTEEKLPREKLNPPTPSIYLESKRDAFSPV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE3 LLQFCTDPRNPITVIRGLAGSLRLNLGLFSTKTLVEASGEHTVEVRTQVQQPSDENWDLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLQFCTDPRNPITVIRGLAGSLRLNLGLFSTKTLVEASGEHTVEVRTQVQQPSDENWDLT
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE3 GTRQIWPCESSRSHTTIAKYAQYQASSFQESLQEEKESEDEESEEPDSTTGTPPSSAPDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GTRQIWPCESSRSHTTIAKYAQYQASSFQESLQEEKESEDEESEEPDSTTGTPPSSAPDP
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KE3 KNHHIIKFGTNIDLSDAKRWKPQLQELLKLPAFMRVTSTGNMLSHVGHTILGMNTVQLYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KNHHIIKFGTNIDLSDAKRWKPQLQELLKLPAFMRVTSTGNMLSHVGHTILGMNTVQLYM
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KE3 KVPGSRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFAVHEHYWETISAFCDRHGVDYLTGSWWPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVPGSRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFAVHEHYWETISAFCDRHGVDYLTGSWWPI
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KE3 LDDLYASNIPVYRFVQRPGDLVWINAGTVHWVQATGWCNNIAWNVGPLTAYQYQLALERY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LDDLYASNIPVYRFVQRPGDLVWINAGTVHWVQATGWCNNIAWNVGPLTAYQYQLALERY
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KE3 EWNEVKNVKSIVPMIHVSWNVARTVKISDPDLFKMIKFCLLQSMKHCQVQRESLVRAGKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EWNEVKNVKSIVPMIHVSWNVARTVKISDPDLFKMIKFCLLQSMKHCQVQRESLVRAGKK
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KE3 IAYQGRVKDEPAYYCNECDVEVFNILFVTSENGSRNTYLVHCEGCARRRSAGLQGVVVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IAYQGRVKDEPAYYCNECDVEVFNILFVTSENGSRNTYLVHCEGCARRRSAGLQGVVVLE
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KE3 QYRTEELAQAYDAFTLVRARRARGQRRRALGQAAGTGFGSPAAPFPEPPPAFSPQAPAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QYRTEELAQAYDAFTLVRARRARGQRRRALGQAAGTGFGSPAAPFPEPPPAFSPQAPAST
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE3 SR
::
CCDS32 SR
>>CCDS14265.1 KDM6A gene_id:7403|Hs108|chrX (1401 aa)
initn: 2341 init1: 1674 opt: 2367 Z-score: 946.6 bits: 187.9 E(32554): 2.1e-46
Smith-Waterman score: 2401; 44.4% identity (67.1% similar) in 942 aa overlap (720-1633:489-1392)
690 700 710 720 730 740
pF1KE3 DGLANIMKMLDESIRKEEEQQQHEAGVAPQPPLKEPFASLQSPFPTDTAPTTTAPAVAVT
: : . .:.: : .:: .
CCDS14 PVQQQAHSWCLTPQKLQHLEQLRANRNNLNPAQKLMLEQLESQFVLMQQHQMRPTGVAQV
460 470 480 490 500 510
750 760 770 780 790
pF1KE3 TTTTTTTTTTATQEEEKKPPPALPPPPPLAKFPPPSQP--QPPPPPPP----------SP
.: . :: . . . : :.. : ::: .: : : :
CCDS14 RSTGIPNGPTADSSLPTNSVSGQQPQLALTRVPSVSQPGVRPACPGQPLANGPFSAGHVP
520 530 540 550 560 570
800 810 820 830 840 850
pF1KE3 ASLLKSLAS---VLEGQKYCYRGTGAAVSTRPGPLPTTQYSPGP-PSGATALPPTSAAP-
: ..:.: .: :... :.:. : .: : . : . : : .. :
CCDS14 CSTSRTLGSTDTILIGNNH-ITGSGSN-----GNVPYLQRNALTLPHNRTNLTSSAEEPW
580 590 600 610 620 630
860 870 880 890 900
pF1KE3 SAQGSPQPSASSSSQFSTSGGPWARERRAGEEP-----VPGPMTPTQPPPPLSLPPAR-S
. : : . .. ..: : :.:: ... .. : . : .: : .:: .
CCDS14 KNQLSNSTQGLHKGQSSHSAGPNGERPLSSTGPSQHLQAAGSGIQNQNGHP-TLPSNSVT
640 650 660 670 680 690
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 ESEVLEEISRACETLVERVGRSATDPADPVDTAEPADSGTERLLPPAQAKEEAGGVAAVS
.. .:...: : . : . : . : ::. .: ......: . .
CCDS14 QGAALNHLSSHTATSGGQQGITLTKESKP--------SGNILTVP--ETSRHTGETPNST
700 710 720 730 740
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 GSCKRRQKEHQKEHRRHRRACKDSVGRRPREGRAKAKAKVPKEKSRRVLGNLDLQSEEI-
.: : .: .. : :.: : .: .:. . . ... . . ....
CCDS14 ASV-----EGLPNHVHQMTA--DAVCS-PSHGDSKSPGLLSSDNPQLSALLMGKANNNVG
750 760 770 780 790
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 QGREKSRPDLGGASKAKPPTAPAP-PSAPAPSAQPTPPSASVPGKKAREEAPGP-PGVSR
: . .. : ..: .. : ::. .: :.: :. .. .: :.
CCDS14 TGTCDKVNNIHPAVHTKTDNSVASSPSSAISTATPSPKSTEQTTTNSVTSLNSPHSGLHT
800 810 820 830 840 850
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 ADMLKLRSLSEGPPKELKIRLIKVESGDKETFIASEVEERRLRMADLTISHCAADVVRAS
. .. :..: .: :. :. . .: : ...: .:.:..:
CCDS14 INGEGMEE-SQSP---MKTDLLLVNHKPSPQIIPS---------MSVSIYPSSAEVLKAC
860 870 880 890 900
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 RNAKVKGKFRESYL-SPAQSVKPKINTEEKLPREKLNPPTPSIYLESKRDAFSPVLLQFC
:: .: : : . .: . ::..::::::::::::.::::: : : :::
CCDS14 RNLGKNGLSNSSILLDKCPPPRPPSSPYPPLPKDKLNPPTPSIYLENKRDAFFPPLHQFC
910 920 930 940 950 960
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 TDPRNPITVIRGLAGSLRLNLGLFSTKTLVEASGEHTVEVRTQVQQPSDENWDLTGTRQI
:.: ::.::::::::.:.:.::::::::::::..:: ::::::. ::.::::: :::..:
CCDS14 TNPNNPVTVIRGLAGALKLDLGLFSTKTLVEANNEHMVEVRTQLLQPADENWDPTGTKKI
970 980 990 1000 1010 1020
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 WPCESSRSHTTIAKYAQYQASSFQESLQEEKESEDEESEEPDSTTGTPPSSAPDPKN-HH
: :::.:::::::::::::::::::::.::.:........ :: . . .:. :. .
CCDS14 WHCESNRSHTTIAKYAQYQASSFQESLREENEKRSHHKDHSDSESTSSDNSGRRRKGPFK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 IIKFGTNIDLSDAKRWKPQLQELLKLPAFMRVTSTGNMLSHVGHTILGMNTVQLYMKVPG
::::::::::: :.:: ::.:: :::::.::.:.::.::::::::::::::::::::::
CCDS14 TIKFGTNIDLSDDKKWKLQLHELTKLPAFVRVVSAGNLLSHVGHTILGMNTVQLYMKVPG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 SRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFAVHEHYWETISAFCDRHGVDYLTGSWWPILDDL
:::::::::::::::::::::::::::.: : :: ... ::.......: ::::: :.::
CCDS14 SRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFVVPEGYWGVLNDFCEKNNLNFLMGSWWPNLEDL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE3 YASNIPVYRFVQRPGDLVWINAGTVHWVQATGWCNNIAWNVGPLTAYQYQLALERYEWNE
: .:.:::::.::::::::::::::::::: ::::::::::::::: ::.::.::::::.
CCDS14 YEANVPVYRFIQRPGDLVWINAGTVHWVQAIGWCNNIAWNVGPLTACQYKLAVERYEWNK
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE3 VKNVKSIVPMIHVSWNVARTVKISDPDLFKMIKFCLLQSMKHCQVQRESLVRAGKKIAYQ
...:::::::.:.:::.::..:.::: ::.:::.:::...:.::. ::.:. :::.: ..
CCDS14 LQSVKSIVPMVHLSWNMARNIKVSDPKLFEMIKYCLLRTLKQCQTLREALIAAGKEIIWH
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE3 GRVKDEPAYYCNECDVEVFNILFVTSENGSRNTYLVHCEGCARRRSAGLQGVVVLEQYRT
::.:.:::.::. :.::::..::::.:..::.::.:::. :::. :..:.. ::::::.
CCDS14 GRTKEEPAHYCSICEVEVFDLLFVTNESNSRKTYIVHCQDCARKTSGNLENFVVLEQYKM
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1630 1640 1650 1660 1670
pF1KE3 EELAQAYDAFTLVRARRARGQRRRALGQAAGTGFGSPAAPFPEPPPAFSPQAPASTSR
:.: :.:: :::
CCDS14 EDLMQVYDQFTLAPPLPSASS
1390 1400
>>CCDS76073.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1264 aa)
initn: 2359 init1: 1633 opt: 2344 Z-score: 938.1 bits: 186.2 E(32554): 6.2e-46
Smith-Waterman score: 2344; 58.4% identity (81.7% similar) in 591 aa overlap (1053-1633:669-1256)
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 EEIQGREKSRPDLGGASKAKPPTAPAPPSAPAPSAQPTPPSASVPGKKAREEAPGPPGVS
:: .. :: :.. .:.: ..
CCDS76 ADNPQLSALLIGKANGNVGTGTCDKVNNIHPAVHTKTDHSVASSPSSAISTATPSPKSTE
640 650 660 670 680 690
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE3 RADMLKLRSLSEGPPKELKIR----LIKVESGDKETF-IASEVEERRLRMADLTISHC--
. .. .. ::. .: . :. : : .:. : . .::. .. . ....: :
CCDS76 QRSINSVTSLN-SPHSGLHTVNGEGLGKSQSSTKVDLPLASHRSTSQI-LPSMSVSICPS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]