FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3718, 2471 aa 1>>>pF1KE3718 2471 - 2471 aa - 2471 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4485+/-0.00192; mu= -1.0525+/- 0.116 mean_var=538.6481+/-107.588, 0's: 0 Z-trim(110.6): 293 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.055261 statistics sampled from 11438 (11720) to 11438 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.36), width: 16 Scan time: 6.370 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1 (2471) 18249 1472.7 0 CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9 (2555) 6850 563.9 3.6e-159 CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19 (2321) 5232 434.9 2.3e-120 CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6 (2003) 3253 277.0 6.5e-73 CCDS47445.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3144) 1714 154.6 7.4e-36 CCDS78156.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3165) 1714 154.6 7.4e-36 CCDS72880.1 NOTCH2NL gene_id:388677|Hs108|chr1 ( 236) 1641 147.4 8.1e-35 CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20 (1218) 1395 128.6 1.8e-28 CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1238) 1209 113.8 5.4e-24 CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1200) 1179 111.4 2.8e-23 CCDS12196.1 FBN3 gene_id:84467|Hs108|chr19 (2809) 1168 111.0 8.8e-23 CCDS58052.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 ( 870) 1114 106.1 8.3e-22 CCDS1390.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 (1406) 1100 105.2 2.4e-21 CCDS33390.1 DNER gene_id:92737|Hs108|chr2 ( 737) 1069 102.4 8.9e-21 CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9 (3571) 1027 99.9 2.5e-19 CCDS58053.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 (1382) 1013 98.3 2.9e-19 CCDS6852.2 CRB2 gene_id:286204|Hs108|chr9 (1285) 966 94.5 3.8e-18 CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6 ( 723) 954 93.2 5.1e-18 CCDS45232.1 DLL4 gene_id:54567|Hs108|chr15 ( 685) 933 91.5 1.6e-17 CCDS10213.2 MEGF11 gene_id:84465|Hs108|chr15 (1044) 895 88.7 1.7e-16 CCDS34222.1 FBN2 gene_id:2201|Hs108|chr5 (2912) 899 89.6 2.6e-16 CCDS4142.1 MEGF10 gene_id:84466|Hs108|chr5 (1140) 880 87.5 4e-16 CCDS32232.1 FBN1 gene_id:2200|Hs108|chr15 (2871) 885 88.4 5.5e-16 CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534) 774 79.3 1.7e-13 CCDS53454.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 (1294) 748 77.1 6.5e-13 CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1521) 741 76.6 1.1e-12 CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1525) 741 76.6 1.1e-12 CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1529) 741 76.6 1.1e-12 CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 732 75.9 1.7e-12 CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 726 75.4 2.4e-12 CCDS46562.1 SNED1 gene_id:25992|Hs108|chr2 (1413) 685 72.1 2.2e-11 CCDS74370.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1557) 683 72.0 2.6e-11 CCDS7113.1 CUBN gene_id:8029|Hs108|chr10 (3623) 689 72.9 3.2e-11 CCDS4897.1 DLK2 gene_id:65989|Hs108|chr6 ( 383) 663 69.7 3.3e-11 CCDS74368.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1587) 670 71.0 5.5e-11 CCDS74369.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1624) 670 71.0 5.6e-11 CCDS44647.1 LTBP3 gene_id:4054|Hs108|chr11 (1303) 666 70.6 6e-11 >>CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1 (2471 aa) initn: 18249 init1: 18249 opt: 18249 Z-score: 7882.8 bits: 1472.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 18249; 100.0% identity (100.0% similar) in 2471 aa overlap (1-2471:1-2471) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MPALRPALLWALLALWLCCAAPAHALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 MPALRPALLWALLALWLCCAAPAHALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 YCQHRDPCEKNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 YCQHRDPCEKNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 CHMLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 CHMLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 TDVNECDIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 TDVNECDIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 DFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 DFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVD 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 ECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 ECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASF 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 SCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 SCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 MANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 MANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTC 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 LCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 LCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTP 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 CLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQCQDGIDSYTCICNPGYM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 CLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQCQDGIDSYTCICNPGYM 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 GAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHGICM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 GAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHGICM 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 DGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 DGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQ 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 VNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNGGTCDNLVNGYR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 VNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNGGTCDNLVNGYR 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 CTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPN :::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 CTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCFDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPN 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 PCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMCECP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 PCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMCECP 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 PGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMDGVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEPCKN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 PGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMDGVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEPCKN 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE3 GGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGFTGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 GGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGFTGS 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE3 FCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 FCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQ 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE3 KKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 KKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLG 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE3 YTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFIGGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 YTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFIGGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGG 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE3 TCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDCARGPHCLNGGQCMDRIGGYSCRCLPGFAGER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 TCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDCARGPHCLNGGQCMDRIGGYSCRCLPGFAGER 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE3 CEGDINECLSNPCSSEGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 CEGDINECLSNPCSSEGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCA 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KE3 VASNMPDGFICRCPPGFSGARCQSSCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCFCPSPRDCESGCAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 VASNMPDGFICRCPPGFSGARCQSSCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCFCPSPRDCESGCAS 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KE3 SPCQHGGSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCELYTAPPSTPPATCLSQYCADKARDGVCD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 SPCQHGGSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCELYTAPPSTPPATCLSQYCADKARDGVCD 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KE3 EACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSPLPCWDYINNQCDELCNTVECLFDNFECQGNS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 EACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSPLPCWDYINNQCDELCNTVECLFDNFECQGNS 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KE3 KTCKYDKYCADHFKDNHCDQGCNSEECGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 KTCKYDKYCADHFKDNHCDQGCNSEECGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQ 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KE3 DARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGELMVYPYYGEKSAAMKKQRMTRRSLPGEQEQEVAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 DARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGELMVYPYYGEKSAAMKKQRMTRRSLPGEQEQEVAG 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KE3 SKVFLEIDNRQCVQDSDHCFKNTDAAAALLASHAIQGTLSYPLVSVVSESLTPERTQLLY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 SKVFLEIDNRQCVQDSDHCFKNTDAAAALLASHAIQGTLSYPLVSVVSESLTPERTQLLY 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 pF1KE3 LLAVAVVIILFIILLGVIMAKRKRKHGSLWLPEGFTLRRDASNHKRREPVGQDAVGLKNL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 LLAVAVVIILFIILLGVIMAKRKRKHGSLWLPEGFTLRRDASNHKRREPVGQDAVGLKNL 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 pF1KE3 SVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDRRPWTQQHLEAADIR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 SVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDRRPWTQQHLEAADIR 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 pF1KE3 RTPSLALTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSDLSDEDEDAEDSSANIIT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 RTPSLALTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSDLSDEDEDAEDSSANIIT 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KE3 DLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRCPLHAAVAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 DLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRCPLHAAVAA 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KE3 DAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVDDHGKSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 DAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVDDHGKSA 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 2030 2040 pF1KE3 LHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDHFANRDITD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 LHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDHFANRDITD 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2100 pF1KE3 HMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTSALSPVICGPNRSFLSLKHTPMG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 HMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTSALSPVICGPNRSFLSLKHTPMG 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 pF1KE3 KKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSESSVTLSPVDSLESPHTY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 KKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSESSVTLSPVDSLESPHTY 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2170 2180 2190 2200 2210 2220 pF1KE3 VSDTTSSPMITSPGILQASPNPMLATAAPPAPVHAQHALSFSNLHEMQPLAHGASTVLPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 VSDTTSSPMITSPGILQASPNPMLATAAPPAPVHAQHALSFSNLHEMQPLAHGASTVLPS 2170 2180 2190 2200 2210 2220 2230 2240 2250 2260 2270 2280 pF1KE3 VSQLLSHHHIVSPGSGSAGSLSRLHPVPVPADWMNRMEVNETQYNEMFGMVLAPAEGTHP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 VSQLLSHHHIVSPGSGSAGSLSRLHPVPVPADWMNRMEVNETQYNEMFGMVLAPAEGTHP 2230 2240 2250 2260 2270 2280 2290 2300 2310 2320 2330 2340 pF1KE3 GIAPQSRPPEGKHITTPREPLPPIVTFQLIPKGSIAQPAGAPQPQSTCPPAVAGPLPTMY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 GIAPQSRPPEGKHITTPREPLPPIVTFQLIPKGSIAQPAGAPQPQSTCPPAVAGPLPTMY 2290 2300 2310 2320 2330 2340 2350 2360 2370 2380 2390 2400 pF1KE3 QIPEMARLPSVAFPTAMMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYPTPPSQHSYASSNAAER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 QIPEMARLPSVAFPTAMMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYPTPPSQHSYASSNAAER 2350 2360 2370 2380 2390 2400 2410 2420 2430 2440 2450 2460 pF1KE3 TPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVTTSPTPGGAGGGQRGPGTHMS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 TPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVTTSPTPGGAGGGQRGPGTHMS 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2470 pF1KE3 EPPHNNMQVYA ::::::::::: CCDS90 EPPHNNMQVYA 2470 >>CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9 (2555 aa) initn: 7355 init1: 4381 opt: 6850 Z-score: 2971.2 bits: 563.9 E(32554): 3.6e-159 Smith-Waterman score: 9945; 53.7% identity (74.2% similar) in 2522 aa overlap (6-2403:2-2499) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MPALRPALLWALLALWLCCAAPAHALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGE : :: :: : : : :.. .: . : :.: : : ::: : : .:.: CCDS43 MPPLLAPLLCLALLPALAARGPRCSQPGETCLNGGKC-EAANGTEACVCGGAFVGP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE3 YCQHRDPCEKNRCQNGGTC--VAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNG :: .:: .. :.:.::: : . .. .: :: ::.: : .. :. . :: :: CCDS43 RCQDPNPCLSTPCKNAGTCHVVDRRGVADYACSCALGFSGPLCLTPLDNACL-TNPCRNG 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 GTCHMLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQK ::: .:. :.: : :..:: :: .: : :.:::::. : .. :.: .: : CCDS43 GTCDLLTLTEYKCRCPPGWSGKSCQQADPCASNPCANGGQCLPFEASYICHCPPSFHGPT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 CETDVNEC-DIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCR :. ::::: . :: :.::::: : :::.: : :: :. ::::.:::: :::::: CCDS43 CRQDVNECGQKPGLCRHGGTCHNEVGSYRCVCRATHTGPNCERPYVPCSPSPCQNGGTCR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 QTGDFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTE ::: : :: ::::: :..::.::::::.. :.:::.::::::::::::::.::::.::: CCDS43 PTGDVTHECACLPGFTGQNCEENIDDCPGNNCKNGGACVDGVNTYNCRCPPEWTGQYCTE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 DVDECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRV ::::: :.:::::::::: : .:::.:::::::.:.:::::::::: :.: :.:: ::: CCDS43 DVDECQLMPNACQNGGTCHNTHGGYNCVCVNGWTGEDCSENIDDCASAACFHGATCHDRV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 ASFSCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVD ::: : ::.:..::::::.::::::::..:. :::::.::. :::::.:: : :..::: CCDS43 ASFYCECPHGRTGLLCHLNDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYTGPACSQDVD 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 ECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGG ::... .:::::::::.:: :.:.:.::.::.:::::.:.::: :.::::::::::.:: CCDS43 ECSLG-ANPCEHAGKCINTLGSFECQCLQGYTGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGE 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 FTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCS : :.::::..:::::.. .:: :.::..::.:.::.:.::: :: :::: .:: :.:.:. CCDS43 FQCICMPGYEGVHCEVNTDECASSPCLHNGRCLDKINEFQCECPTGFTGHLCQYDVDECA 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 STPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQCQDGIDSYTCICNP :::: :::::.: :: : : :. :.::. :: .::.:::::::.:.:.::. ..::.: : CCDS43 STPCKNGAKCLDGPNTYTCVCTEGYTGTHCEVDIDECDPDPCHYGSCKDGVATFTCLCRP 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 GYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHG :: : : .:.:: :.:: . : : : :.: : : ::.: :::::.:::::.:: : CCDS43 GYTGHHCETNINECSSQPCRHGGTCQDRDNAYLCFCLKGTTGPNCEINLDDCASSPCDSG 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 ICMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSC :.: :. : :.: ::.::. :::.:::::.:::..:.:: .:.::: : :::: : :.: CCDS43 TCLDKIDGYECACEPGYTGSMCNINIDECAGNPCHNGGTCEDGINGFTCRCPEGYHDPTC 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 YSQVNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNGGTCDNLVN :.:::: ::::.:: : .:.:::: :: :: : ::....::: :::: ::::: .... CCDS43 LSEVNECNSNPCVHGACRDSLNGYKCDCDPGWSGTNCDINNNECESNPCVNGGTCKDMTS 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KE3 GYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPC :: :::..::.: :::.::.::::::::::::: ::..:: :.:.::::: .:..::::: CCDS43 GYVCTCREGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGATCEVVLAPC 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KE3 SPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMC .:.::.:.. :..: ..::..:.: ::::: : .::.::. .:: . . :.::.:.: : CCDS43 APSPCRNGGECRQSEDYESFSCVCPTGWQGQTCEVDINECVLSPCRHGASCQNTHGGYRC 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 pF1KE3 ECPPGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMDGVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEP .: :.:: .:: ::::: :::.::::: ::.:: : ::::: : :. :.::: :.: CCDS43 HCQAGYSGRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAFCDCLPGFRGTFCEEDINECASDP 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE3 CKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGF :.::..:.: :.:::: : :::.:.::::: .:::::::::::::::::::.:::: :: CCDS43 CRNGANCTDCVDSYTCTCPAGFSGIHCENNTPDCTESSCFNGGTCVDGINSFTCLCPPGF 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE3 TGSFCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGT :::.: :..:::.:.:::. ::: :: :.:::.:: :::: :::.::. :. ::::: : CCDS43 TGSYCQHDVNECDSQPCLHGGTCQDGCGSYRCTCPQGYTGPNCQNLVHWCDSSPCKNGGK 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE3 CVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQC : : ... .: :::::.: :::::.:::..::.:.:: : .::::.:.:..:::::.:.: CCDS43 CWQTHTQYRCECPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARLCQHGGLCVDAGNTHHCRC 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE3 PLGYTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFIGGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQ ::::::::. .:::. .:::.::::.:..::: :.:: ::.:::: :.::: ..::: CCDS43 QAGYTGSYCEDLVDECSPSPCQNGATCTDYLGGYSCKCVAGYHGVNCSEEIDECLSHPCQ 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE3 NGGTCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDC-------ARGPHCLNGGQCMDRIGGYSC :::::.:: : .::::: ::.:. :: :.::: .:.:.:.:.: :.:..::::: CCDS43 NGGTCLDLPNTYKCSCPRGTQGVHCEINVDDCNPPVDPVSRSPKCFNNGTCVDQVGGYSC 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE3 RCLPGFAGERCEGDINECLSNPCSSEGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQ : :::.:::::::.::::::::...:. .:.: .::. : ::.. :::.::. .. : CCDS43 TCPPGFVGERCEGDVNECLSNPCDARGTQNCVQRVNDFHCECRAGHTGRRCESVINGCKG 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KE3 MPCLNGGTCAVASNMPDGFICRCPPGFSGARCQS---SCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCF :: :::::::::: ::::.:: :: :: :.. .::...: .: :. .: :. CCDS43 KPCKNGGTCAVASNTARGFICKCPAGFEGATCENDARTCGSLRCLNGGTCISGPRSPTCL 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KE3 CPSPR---DCE----SGC-ASSPCQHGGSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCEL--YT-- : .: .:. : : ...:: . :.:.: . :.: : : :.: :.. :. CCDS43 CLGPFTGPECQFPASSPCLGGNPCYNQGTCEPTSESPFYRCLCPAKFNGLLCHILDYSFG 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KE3 ------APPSTPPATCLSQYCADKARDGVCDEACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSP :: .: : . : . ::. ::.::: ::::::::....:: ::.. CCDS43 GGAGRDIPPPLIEEACELPECQEDAGNKVCSLQCNNHACGWDGGDCSLNFNDPWKNCTQS 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1470 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KE3 LPCWDYINN-QCDELCNTVECLFDNFECQGNSKTCK--YDKYCADHFKDNHCDQGCNSEE : :: :... .:: ::.. ::::.:.:: :. ::.:: :::.:.:::::::: : CCDS43 LQCWKYFSDGHCDSQCNSAGCLFDGFDCQRAEGQCNPLYDQYCKDHFSDGHCDQGCNSAE 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1530 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KE3 CGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQDARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGE : ::::::: :: :: ::::.::::::::: ... ::: :. .::::. .:::..:. CCDS43 CEWDGLDCAEHVPERLAAGTLVVVVLMPPEQLRNSSFHFLRELSRVLHTNVVFKRDAHGQ 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1590 1600 1610 pF1KE3 LMVYPYYGEKSAAMKKQRMTRRS-----------------LPGEQE----------QEVA :..:::: . ..:. . : . ::: .: ..: CCDS43 QMIFPYYG-REEELRKHPIKRAAEGWAAPDALLGQVKASLLPGGSEGGRRRRELDPMDVR 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KE3 GSKVFLEIDNRQCVQDSDHCFKNTDAAAALLASHAIQGTLSYP--LVSVVSESLTPERTQ :: :.:::::::::: :..::... .::.:.. : :.:. : . .: ::.. : CCDS43 GSIVYLEIDNRQCVQASSQCFQSATDVAAFLGALASLGSLNIPYKIEAVQSETVEPPPPA 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1680 1690 1700 1710 1720 1730 pF1KE3 LLYLL--AVAVVIILFIILLGVIMA-KRKRKHGSLWLPEGFTLRRDASNHKRREPVGQDA :... :.:. ..::.. ::... ::.:.::.::.:::: . .::..:::::.:.:. CCDS43 QLHFMYVAAAAFVLLFFVGCGVLLSRKRRRQHGQLWFPEGFKVS-EASKKKRREPLGEDS 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1740 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KE3 VGLKNLSVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDRRPWTQQHL :::: :. ..:.. :. . .: : :: . :: . :. ..: . :: :.: :::::: CCDS43 VGLKPLK-NASDGALMDDNQNE-W-GDEDLETKKFRFEEPVVLPDLDDQTDHRQWTQQHL 1800 1810 1820 1830 1840 1800 1810 1820 1830 1840 1850 pF1KE3 EAADIRRTPSLALTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSDLSDEDEDAEDS .:::.: . ..: ::::.: ..: .::::::::: ::::.:: ::. . .. .:. ::. CCDS43 DAADLRMS-AMAPTPPQGEVDADCMDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLETGNSEEE-EDA 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1860 1870 1880 1890 1900 1910 pF1KE3 SANIITDLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRCPL : .:.:..::::::. ::::::: ::::::::::.:::::::.:.:::: :::::: :: CCDS43 PA-VISDFIYQGASLHNQTDRTGETALHLAARYSRSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPL 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1920 1930 1940 1950 1960 1970 pF1KE3 HAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVD ::::.::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::. .::: .::::::: CCDS43 HAAVSADAQGVFQILIRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMLEDLINSHADVNAVD 1970 1980 1990 2000 2010 2020 1980 1990 2000 2010 2020 2030 pF1KE3 DHGKSALHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDHFA : ::::::::::::::.:...:::::::.:::.:.:::::::::::::::.::.:::::: CCDS43 DLGKSALHWAAAVNNVDAAVVLLKNGANKDMQNNREETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFA 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2040 2050 2060 2070 2080 2090 pF1KE3 NRDITDHMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPP--GTVL--TSALSPVICGPNRS ::::::::::::::.:..::::::::::::::.. :: :. : : .::: .:.:: CCDS43 NRDITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVRLLDEYNLVRSPQLHGAPLGGTPTLSPPLCSPNGY 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2100 2110 2120 2130 2140 2150 pF1KE3 FLSLKHTPMGKKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSESSVTLSP . ::: .::: :.::.:. : .::::: : .::::: . : : .:: ::: CCDS43 LGSLKPGVQGKKVRKPSSKG-----LACGSKEAKDLK-ARRKKSQDGKGCLLDSSGMLSP 2150 2160 2170 2180 2190 2160 2170 2180 2190 2200 pF1KE3 VDSLESPHTYVSDTTSSPMITSPGILQASPN-PMLATAAPPAPVHAQHALSFSNLHEMQP :::::::: :.::..: :.. :: .: ::. :. . : . :. . :: CCDS43 VDSLESPHGYLSDVASPPLLPSP--FQQSPSVPLNHLPGMPDTHLGIGHLNVAAKPEMAA 2200 2210 2220 2230 2240 2250 2210 2220 2230 2240 2250 2260 pF1KE3 LAHGASTVLPSVSQLLSHHHIVSP-----GSGSAGSLSRL----HPVPVPADWMNRMEVN :. :. .. . ::: ..: ::.:.:.:. . .:..:.. . CCDS43 LGGGGRLAFETGPPRLSHLPVASGTSTVLGSSSGGALNFTVGGSTSLNGQCEWLSRLQSG 2260 2270 2280 2290 2300 2310 2270 2280 2290 pF1KE3 --ETQYNEMFGMVL-------APA--EGT----HPGIA-------------PQSRPPEGK .::: . : : ::. .: : ..: :..: CCDS43 MVPNQYNPLRGSVAPGPLSTQAPSLQHGMVGPLHSSLAASALSQMMSYQGLPSTRLATQP 2320 2330 2340 2350 2360 2370 2300 2310 2320 2330 pF1KE3 HITTPREPLPPIVTFQ---LIP-----KGSIAQPAGAPQPQSTCPPAVAGPL-------- :.. .. : . .: : : . :. : :::. :..: : CCDS43 HLVQTQQVQPQNLQMQQQNLQPANIQQQQSLQPPPPPPQPHLGVSSAASGHLGRSFLSGE 2380 2390 2400 2410 2420 2430 2340 2350 2360 2370 2380 2390 pF1KE3 PTMYQIPEMARLPSVAFPTAMMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYPTPPSQHSYASSN :.. .. .. :: ...::.. . : ::. :...... ::::::::.: CCDS43 PSQADVQPLG--PSSLAVHTILPQESPALP-TSLPSSLVPPVTAAQFLTPPSQHSYSSP- 2440 2450 2460 2470 2480 2490 2400 2410 2420 2430 2440 2450 pF1KE3 AAERTPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVTTSPTPGGAGGGQRGPG .. ::: CCDS43 -VDNTPSHQLQVPEHPFLTPSPESPDQWSSSSPHSNVSDWSEGVSSPPTSMQSQIARIPE 2500 2510 2520 2530 2540 2550 >>CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19 (2321 aa) initn: 5367 init1: 2004 opt: 5232 Z-score: 2274.5 bits: 434.9 E(32554): 2.3e-120 Smith-Waterman score: 8769; 50.6% identity (70.7% similar) in 2436 aa overlap (67-2450:42-2278) 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 NEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGEYCQHRDPC-EKNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASG :: . . : ::: :. : .:.: : : CCDS12 RRPMSPPPPPPPVRALPLLLLLAGPGAAAPPCLDGSPCANGGRCT-QLPSREAACLCPPG 20 30 40 50 60 70 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 FTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCH---MLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHP ..:: :: :: : :: . :.:. . . . : : :: : .:. : ::: : CCDS12 WVGERCQLED--PCH-SGPCAGRGVCQSSVVAGTARFSCRCPRGFRGPDCSLPDPCLSSP 80 90 100 110 120 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 CANGSTCTTVAN-QFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQ ::.:. :.. . .: :.: :. :..:..::.:: . :.::::::: :::..:::: CCDS12 CAHGARCSVGPDGRFLCSCPPGYQGRSCRSDVDECRVGEPCRHGGTCLNTPGSFRCQCPA 130 140 150 160 170 180 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 GFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQN :.:: :.. :::::::: :::::::.::.:..: :::::::..:: :.::::.::: : CCDS12 GYTGPLCENPAVPCAPSPCRNGGTCRQSGDLTYDCACLPGFEGQNCEVNVDDCPGHRCLN 190 200 210 220 230 240 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 GGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWS ::.::::::::::.:::.::::::::::::: ::::::.::::: : ::..:::::::. CCDS12 GGTCVDGVNTYNCQCPPEWTGQFCTEDVDECQLQPNACHNGGTCFNTLGGHSCVCVNGWT 250 260 270 280 290 300 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 GDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCD :..::.:::::: : : :.:: :::::: : :: ::.::::::::::.:::::. :.:: CCDS12 GESCSQNIDDCATAVCFHGATCHDRVASFYCACPMGKTGLLCHLDDACVSNPCHEDAICD 310 320 330 340 350 360 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 TNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGP :::.::. ::::: :. :. : .:::::... .::::: :.::::.:.: :.: .::.:: CCDS12 TNPVNGRAICTCPPGFTGGACDQDVDECSIG-ANPCEHLGRCVNTQGSFLCQCGRGYTGP 370 380 390 400 410 420 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 RCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVD ::: :.::: : ::.:.:::::.:: :::.:: :: :..::..:.::::.::::.: : : CCDS12 RCETDVNECLSGPCRNQATCLDRIGQFTCICMAGFTGTYCEVDIDECQSSPCVNGGVCKD 430 440 450 460 470 480 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 KVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENI .:: :.: :: ::.: .::.:.:.:.:::: :::::.:.:.::::.:: :: :.::..:. CCDS12 RVNGFSCTCPSGFSGSTCQLDVDECASTPCRNGAKCVDQPDGYECRCAEGFEGTLCDRNV 490 500 510 520 530 540 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 DNCDPDPCHHGQCQDGIDSYTCICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQC :.:.:::::::.: ::: :..: : ::: :. : .:.::: :.:: . :.:.:::. : : CCDS12 DDCSPDPCHHGRCVDGIASFSCACAPGYTGTRCESQVDECRSQPCRHGGKCLDLVDKYLC 550 560 570 580 590 600 640 650 660 670 680 690 pF1KE3 NCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHGICMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPC : ::.:::::.:.:::::::: :.: ::::::.:::.::::: ::..:.::::.:: CCDS12 RCPSGTTGVNCEVNIDDCASNPCTFGVCRDGINRYDCVCQPGFTGPLCNVEINECASSPC 610 620 630 640 650 660 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 RKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVG .:..:..: :::::.:: : : : . : .:: :: : . .:..:.:. :: : CCDS12 GEGGSCVDGENGFRCLCPPGSLPPLCLPPSHPCAHEPCSHGICYDAPGGFRCVCEPGWSG 670 680 690 700 710 720 760 770 780 790 800 pF1KE3 INCE--VDKNECLSNPCQNGGTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGT : . .. : :.::. ::::.. :..::: : .: .:.. CCDS12 PRCSQSLARDACESQPCRAGGTCSSDGMGFHCTCPPGVQGRQCEL--------------- 730 740 750 760 770 810 820 830 840 850 860 pF1KE3 CSDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQR :.::.:::::... :. .:. . .: : :::: : CCDS12 ------------------------LSPCTPNPCEHGGRCESAPG-QLPVCSCPQGWQGPR 780 790 800 870 880 890 900 910 920 pF1KE3 CTIDIDECISK-PCMNHGLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMD : :.::: . :: ::.: : ::. : : :..: .:..::.:: ::: :::::.: CCDS12 CQQDVDECAGPAPCGPHGICTNLAGSFSCTCHGGYTGPSCDQDINDCDPNPCLNGGSCQD 810 820 830 840 850 860 930 940 950 960 970 980 pF1KE3 GVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNI ::..::: :::::.: .: :..::::.:: . :::.:.: :.:: : :. : :::... CCDS12 GVGSFSCSCLPGFAGPRCARDVDECLSNPC-GPGTCTDHVASFTCTCPPGYGGFHCEQDL 870 880 890 900 910 920 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE3 NECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGFTGSFCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYR .:. ::::::::::::.::::::: :.::. : :: . : :.:::. :.: . .: CCDS12 PDCSPSSCFNGGTCVDGVNSFSCLCRPGYTGAHCQHEADPCLSRPCLHGGVCSAAHPGFR 930 940 950 960 970 980 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE3 CSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIA :.: ..:: .:::::. :::.::.: : ::: : :::: ::.: ::. .. : : CCDS12 CTCLESFTGPQCQTLVDWCSRQPCQNGGRCVQTGA--YCLCPPGWSGRLCDIRSLPCREA 990 1000 1010 1020 1030 1040 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE3 ASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLGYTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFI :.. :: .:.::: .: :.. ..::: :: : :::.::...: : ..:::::.:: .. CCDS12 AAQIGVRLEQLCQAGGQCVDEDSSHYCVCPEGRTGSHCEQEVDPCLAQPCQHGGTCRGYM 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE3 GGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGGTCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDD ::: :::.:::.: ::: .:::: .::::.::.::::: .. ::::::: :.::: : :: CCDS12 GGYMCECLPGYNGDNCEDDVDECASQPCQHGGSCIDLVARYLCSCPPGTLGVLCEINEDD 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE3 CA------RGPHCLNGGQCMDRIGGYSCRCLPGFAGERCEGDINECLSNPCSSEGSLDCI :. ::.::..: :.: .::. : : ::..: :::.::::: :. : . . ::. CCDS12 CGPGPPLDSGPRCLHNGTCVDLVGGFRCTCPPGYTGLRCEADINECRSGACHAAHTRDCL 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KE3 QLTND-YLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCAVASNMPDG---FICRCPPGFS : . . :.:...:.: .:.: .. : ..:: .:: : : : : : :.: : CCDS12 QDPGGGFRCLCHAGFSGPRCQTVLSPCESQPCQHGGQCR-PSPGPGGGLTFTCHCAQPFW 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KE3 GARCQS---SCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCFCP---SPRDCES-----------GCASS : ::. :: ...: : : .: :::: :: : .:.: .::.. CCDS12 GPRCERVARSCRELQCPVGVPCQQTPRGPRCACPPGLSGPSCRSFPGSPPGASNASCAAA 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE3 PCQHGGSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCELYTAPP--STPPATCLSQYCADKARDGVC :: :::::.: :.. : :: ..: ::: .: : : : : : : : : CCDS12 PCLHGGSCRPAPLAPFFRCACAQGWTGPRCEAPAAAPEVSEEP-RCPRAACQAKRGDQRC 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KE3 DEACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSPLPCWDYINN-QCDELCNTVECLFDNFECQ- :. ::: .: ::::::::.. .:: .: . : :: .:: .:: :.. ::.:::.:. CCDS12 DRECNSPGCGWDGGDCSLSVGDPWRQCEA-LQCWRLFNNSRCDPACSSPACLYDNFDCHA 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KE3 -GNSKTCK--YDKYCADHFKDNHCDQGCNSEECGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMP : .::. :.::::::: :..::::::.:::::::::::.. : ::.:.::..::.: CCDS12 GGRERTCNPVYEKYCADHFADGRCDQGCNTEECGWDGLDCASEVPALLARGVLVLTVLLP 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KE3 PEQLLQDARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGELMVYPYYGEKSAAMKKQRMTRRSLPGEQ ::.::... .::. :...:.:.::.. :..:. ::.::. . . .. : :. : CCDS12 PEELLRSSADFLQRLSAILRTSLRFRLDAHGQAMVFPYH--RPSPGSEPRARRELAP--- 1530 1540 1550 1560 1570 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KE3 EQEVAGSKVFLEIDNRQCVQ--DSDHCFKNTDAAAALL-ASHAIQGT-LSYPLVSVVSES :: :: :.:::::: :.: ..:::: ....:: : : :.. . ::: .: .: CCDS12 --EVIGSVVMLEIDNRLCLQSPENDHCFPDAQSAADYLGALSAVERLDFPYPLRDVRGEP 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KE3 LTPERTQ--LLYLLAVAVVIILFIILLGVIMAKRKRKHGSLWLPEGFTLRRD-ASNHK-R : : . . :: ::....:..: :..:::..:.:::.:..::.::::.:..: ::.:: : CCDS12 LEPPEPSVPLLPLLVAGAVLLLVILVLGVMVARRKREHSTLWFPEGFSLHKDVASGHKGR 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KE3 REPVGQDAVGLKNLSVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDR ::::::::.:.::.. : :.: ... :.: : :. :..:.:. .. .:: .: CCDS12 REPVGQDALGMKNMAKGES---LMGEVATD-WMDTECPEAKRLKVEEPGMGAEE--AVDC 1700 1710 1720 1730 1740 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KE3 RPWTQQHLEAADIRRTPSLALTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSD-LS : :::.:: ::::: .:..::::::.. ..: .::::::::: :::::::. ::. . . CCDS12 RQWTQHHLVAADIRVAPAMALTPPQGDADADGMDVNVRGPDGFTPLMLASFCGGALEPMP 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1850 1860 1870 1880 1890 1900 pF1KE3 DEDEDAEDSSANIITDLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANA :...:.:.::.::.::. :::.: :.:::::: ::::::::.::::::::::::::.:: CCDS12 TEEDEADDTSASIISDLICQGAQLGARTDRTGETALHLAARYARADAAKRLLDAGADTNA 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1910 1920 1930 1940 1950 1960 pF1KE3 QDNMGRCPLHAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELIN ::. :: :::.::.:::::::::::::: ::::::: ::.: ::::::::::::: ::: CCDS12 QDHSGRTPLHTAVTADAQGVFQILIRNRSTDLDARMADGSTALILAARLAVEGMVEELIA 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1970 1980 1990 2000 2010 2020 pF1KE3 CQADVNAVDDHGKSALHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEA .:::::::. :::::::::::::::::: :::::::.::::.::::::::::::::::: CCDS12 SHADVNAVDELGKSALHWAAAVNNVEATLALLKNGANKDMQDSKEETPLFLAAREGSYEA 1930 1940 1950 1960 1970 1980 2030 2040 2050 2060 2070 2080 pF1KE3 AKILLDHFANRDITDHMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTSALSPVIC ::.::::::::.::::.::::::::..:.:.:::::::. . :::: .:.:..: CCDS12 AKLLLDHFANREITDHLDRLPRDVAQERLHQDIVRLLDQPSGPRSPPGP---HGLGPLLC 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2090 2100 2110 2120 2130 2140 pF1KE3 GPNRSFLSLKHTPMG-KKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSES :. . .:: . : :::::: .:. . . : .: .: .:. :..: CCDS12 PPGAFLPGLKAAQSGSKKSRRPPGKAGLGPQGP---------RGRGKKLTLACPGPLADS 2050 2060 2070 2080 2090 2150 2160 2170 2180 2190 2200 pF1KE3 SVTLSPVDSLESPHTYVSDTTSSPMITSPGILQASPNPMLATAAPPAPVHAQHALSFSNL ::::::::::.::. . ..: .::: . :. .: : . : :.:...: CCDS12 SVTLSPVDSLDSPRPF-----GGPP-ASPGGF-----PL---EGPYAAATAT-AVSLAQL 2100 2110 2120 2130 2140 2210 2220 2230 2240 2250 2260 pF1KE3 HEMQPLAHGASTVLPSVSQLLSHHHIVSPGSGSAGSLSRLHPVPVPADWMNRMEVNETQY :. :. . : . : .: . ::. :.:: :: :: :. CCDS12 --------GG----PGRAGLGRQ-----PPGGCVLSLGLLNPVAVPLDWA-RL------- 2150 2160 2170 2270 2280 2290 2300 2310 2320 pF1KE3 NEMFGMVLAPAEGTHPGIAPQSRPPEGKHITTPREPLPPIVTFQLIPKGSIAQPAGAPQP :: : :: .: :.: :: : CCDS12 -----------------------PP----------PAPPGPSF-LLPL--------APGP 2180 2190 2330 2340 2350 2360 2370 2380 pF1KE3 QSTCPPAVAGPLPTMYQIPEMARLPSVAFPTAMMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYP : : . :. . . : : .: : :. .::. : . CCDS12 QLLNP---GTPVSPQERPP-----PYLAVPG------HGE----------EYPAA-GAHS 2200 2210 2220 2390 2400 2410 2420 2430 2440 pF1KE3 TPPSQHSYASSNAAERTPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVTTSPT .::. . :.:: ::::::::::::..:.: :: : ::::. ..:. CCDS12 SPPKARFL-------RVPS-------EHPYLTPSPESPEHWASPSPPSLSDWSE--STPS 2230 2240 2250 2260 2270 2450 2460 2470 pF1KE3 PGGAGGGQRGPGTHMSEPPHNNMQVYA :. : : CCDS12 PATATGAMATTTGALPAQPLPLSVPSSLAQAQTQLGPQPEVTPKRQVLA 2280 2290 2300 2310 2320 >>CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6 (2003 aa) initn: 2794 init1: 835 opt: 3253 Z-score: 1422.5 bits: 277.0 E(32554): 6.5e-73 Smith-Waterman score: 5205; 38.8% identity (57.9% similar) in 2126 aa overlap (6-2063:4-1820) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MPALRPALLWALLALWLCCAAPAH--ALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFL :.:: :: : : :.. .. .: : . :::.: : :.. : : :.: ::: CCDS34 MQPPSLLLLLLLLLLLCVSVVRPRGLLCGSFPEPCANGGTCLSLSLGQGTCQCAPGFL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 GEYCQHRDPCEKNR-CQNGGTCVA--QAMLGKAT----------CRCASGFTGEDCQYST :: :: :::.. . :::::.: : : :: . : : ::::: :: . CCDS34 GETCQFPDPCQNAQLCQNGGSCQALLPAPLGLPSSPSPLTPSFLCTCLPGFTGERCQAKL 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 SHPCFVSRPCLNGGTCHMLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQ :: : : . : ::. . .:.:. :.::..:: : : ..::.::..: .. : CCDS34 EDPCPPSF-CSKRGRCHIQASGRPQCSCMPGWTGEQCQLRDFCSANPCVNGGVCLATYPQ 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 FSCKCLTGFTGQKCETDVNEC-DIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVP ..:.: :: :. :: ::::: . :: : .: .: : ::.:: :: : : :. : CCDS34 IQCHCPPGFEGHACERDVNECFQDPGPCPKGTSCHNTLGSFQCLCPVGQEGPRCELRAGP 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 CAPSPCVNGGTCR--QTGDFTFE-CNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNT : : : :::::. : ::. : : ::: : :: : :.: .:.:::::.: ::..: CCDS34 CPPRGCSNGGTCQLMPEKDSTFHLCLCPPGFIGPDCEVNPDNCVSHQCQNGGTCQDGLDT 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 YNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQ-PNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWSGDDCSENID :.: :: ::: :.:::::: : : :.::::: : :.. ::::.::.: .: ::.: CCDS34 YTCLCPETWTGWDCSEDVDECETQGPPHCRNGGTCQNSAGSFHCVCVSGWGGTSCEENLD 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 DCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYI :: :.:.:::::::::.::::.:: :..::::::.: :.:.::: : :.::::.:. . CCDS34 DCIAATCAPGSTCIDRVGSFSCLCPPGRTGLLCHLEDMCLSQPCHGDAQCSTNPLTGSTL 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 pF1KE3 CTCPQGYKGADCTEDVDECAMANS--NPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDIN : : ::.: : .:.::: ::.. .::::.:.:.:: :.:.: : ::.: ::: : : CCDS34 CLCQPGYSGPTCHQDLDECLMAQQGPSPCEHGGSCLNTPGSFNCLCPPGYTGSRCEADHN 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 ECHSDPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQC :: :.::. .:::: .. : ::: ::..: ::.: ::: : ::.:...: : .: ::: CCDS34 ECLSQPCHPGSTCLDLLATFHCLCPPGLEGQLCEVETNECASAPCLNHADCHDLLNGFQC 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 LCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDP .: :::.: :. :::.: :.:: ::..: :.:....:.: CCDS34 ICLPGFSGTRCEEDIDECRSSPCANGGQCQDQPGAFHCKCL------------------- 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 CHHGQCQDGIDSYTCICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTS ::. : :. ..::: :.:: . :.:: ::. CCDS34 ------------------PGFEGPRCQTEVDECLSDPCPVGASCLDL---------PGA- 580 590 600 610 640 650 660 670 680 690 pF1KE3 GVNCEINFDDCASNPCIHGICMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCI . :.: ::::: :.. . :: : :. : CCDS34 ---------------------------FFCLCPSGFTGQLCEVPL--CAPNLCQPKQICK 620 630 640 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 NGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDK . . :.::.: :.: ..: : ::.: . .:.::.::.: .::.. CCDS34 DQKDKANCLCPDGS--PGCAPPEDNCT---CHHGHCQRS----SCVCDVGWTGPECEAEL 650 660 670 680 690 760 770 780 790 800 810 pF1KE3 NECLSNPCQNGGTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCSDDISGYT . :.: :: .:::: .:: ::: :. : .:. .. : :.:::: :.: CCDS34 GGCISAPCAHGGTCYPQPSGYNCTCPTGYTGPTCSEEMTACHSGPCLNGGSC-------- 700 710 720 730 740 820 830 840 850 860 870 pF1KE3 CHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECI :: :: CCDS34 ---------------------NP---------SP-------------------------- 880 890 900 910 920 930 pF1KE3 SKPCMNHGLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMDGVNTFSCLCL :.:.: :::. CCDS34 --------------GGYYCTCPPSH----------------------------------- 750 940 950 960 970 980 990 pF1KE3 PGFTGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFN :: .:::. . :.: :: :: CCDS34 ---TGPQCQTSTDYCVSAPC--------------------------------------FN 760 770 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE3 GGTCVDGINSFSCLCPVGFTGSFCLHEINE-CSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTG :::::. ..::::: .:: : : .. :.. :: :..:: :. :: :: :::: CCDS34 GGTCVNRPGTFSCLCAMGFQGPRCEGKLRPSCADSPCRNRATCQDSPQGPRCLCPTGYTG 780 790 800 810 820 830 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE3 KNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVE .::::..::...:: .. :.: .::: .::.: :..: ::. :: .:. : CCDS34 GSCQTLMDLCAQKPCPRNSHCLQTGPSFHCLCLQGWTGPLCNLPLSSCQKAALSQGIDVS 840 850 860 870 880 890 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KE3 HLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLGYTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFIGGYRCECVP ::...:.:...: ...:.:: :. :: :..... : : :::.:::: .:: :.:.: CCDS34 SLCHNGGLCVDSGPSYFCHCPPGFQGSLCQDHVNPCESRPCQNGATCMAQPSGYLCQCAP 900 910 920 930 940 950 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KE3 GYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGGTCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDCARGPHCLN ::.: :: :.: ::.:::.: ::: : CCDS34 GYDGQNCSKELDACQSQPCHNHGTCT----------P----------------------- 960 970 980 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KE3 GGQCMDRIGGYSCRCLPGFAGERCEGDINECLSNPCSSEGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFT . ::. : : :::.: :::::..:::..:: :. : .:.: . : : . : CCDS34 ------KPGGFHCACPPGFVGLRCEGDVDECLDQPCHPTGTAACHSLANAFYCQCLPGHT 990 1000 1010 1020 1030 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KE3 GRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCAVASNMPDGFICRCPPGFSGARCQS---SCGQVKCRKG :. ::. .: : ..::..:::: .... : ::::.:: :: : :. ::: .:..: CCDS34 GQWCEVEIDPCHSQPCFHGGTCEATAGSPLGFICHCPKGFEGPTCSHRAPSCGFHHCHHG 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KE3 EQCVHTASG---PRCFCPSPR---DCES-----GCAS-SPCQHGGSCHPQRQ--PPYYSC :. . . ::: : : :: . ::. ::: ..::: : . : CCDS34 GLCLPSPKPGFPPRCACLSGYGGPDCLTPPAPKGCGPPSPCLYNGSCSETTGLGGPGFRC 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KE3 QCAPPFSGSRCELYTAPPSTPPATCLSQYCADKARDGVCDEACNSHACQWDGGDCSLTME .: : ::. : : . : .. ::.:: .:.. . .:::::::: . CCDS34 SCPHSSPGPRCQ-------KPGA----KGCEGRSGDGACDAGCSGPGGNWDGGDCSLGVP 1160 1170 1180 1190 1200 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KE3 NPWANCSSPLPCWD-YINNQCDELCNTVECLFDNFECQGNSKTCK--YDKYCADHFKDNH .:: .: : :: . ..:: :.. :::::...:. . .: ::.:: :::...: CCDS34 DPWKGCPSHSRCWLLFRDGQCHPQCDSEECLFDGYDCE-TPPACTPAYDQYCHDHFHNGH 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1520 1530 1540 1550 1560 1570 pF1KE3 CDQGCNSEECGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQDARSFLRALGTLLHTNL :..:::. :::::: :: .. . .:...:.. : : :. .. :.:. :...: CCDS34 CEKGCNTAECGWDGGDCRPEDGDPEWGPSLALLVVLSPPALDQQLFALARVLSLTLRVGL 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KE3 RIKRDSQGELMVYPYYG----EKSAAMKKQRMTRRSLPGEQE--QEV----AGSKVFLEI ...: .:. ::::: : :: .. . . .:. : : .:. :: : . . CCDS34 WVRKDRDGRDMVYPYPGARAEEKLGGTRDPTYQERAAPQTQPLGKETDSLSAGFVVVMGV 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1630 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KE3 DNRQCVQD--SDHCFKNTDAA----AALLASHAIQGTLSYPLVSVVSESLT-PERTQLLY : .: : ...: . ::. : :.. : ::..: .. : : .:: . CCDS34 DLSRCGPDHPASRCPWDPGLLLRFLAAMAAVGALEPLLPGPLLAVHPHAGTAPPANQLPW 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1690 1700 1710 1720 1730 pF1KE3 LLAVAVVIILFIILLGVIMA-----KRKRKHGSLWLPEGFTLR-RDASN-HKRREPVGQD . . : .... ::.... .:.:.::.:::: ::: : : : :.:: :.:.: CCDS34 PVLCSPVAGVILLALGALLVLQLIRRRRREHGALWLPPGFTRRPRTQSAPHRRRPPLGED 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1740 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KE3 AVGLKNLSVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDRRPWTQQH ..::: :. . .:.. :. : ::. ..:. . : : . :. . CCDS34 SIGLKALKPK-AEVDEDGV------VMCSGPE----EGEEVGQAEETGPPSTCQLWSLSG 1510 1520 1530 1540 1550 1800 1810 1820 1830 1840 1850 pF1KE3 LEAADIRRTPSLA-LTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSDLSDEDEDAE .: :. : ::::: :.:... :...::::: :::: : : . : . : CCDS34 GCGA----LPQAAMLTPPQ-ESEMEAPDLDTRGPDGVTPLMSAVCCGEVQ--SGTFQGAW 1560 1570 1580 1590 1600 1860 1870 1880 1890 1900 1910 pF1KE3 DSSANIITDLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRC . . :. :: ::.: ::: ::::::.:: ::.:::.:::. : : :: CCDS34 LGCPEPWEPLLDGGACPQAHTVGTGETPLHLAARFSRPTAARRLLEAGANPNQPDRAGRT 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1920 1930 1940 1950 1960 1970 pF1KE3 PLHAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNA ::::::::::. : :.:.:.: : .::: .::::::.:::::::: .: ::: ::::.: CCDS34 PLHAAVAADAREVCQLLLRSRQTAVDARTEDGTTPLMLAARLAVEDLVEELIAAQADVGA 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1980 1990 2000 2010 2020 2030 pF1KE3 VDDHGKSALHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDH : ::.::::::::::..:. ::. ::..: :::.:.::::::::::. :.:..:: CCDS34 RDKWGKTALHWAAAVNNARAARSLLQAGADKDAQDNREQTPLFLAAREGAVEVAQLLLGL 1730 1740 1750 1760 1770 1780 2040 2050 2060 2070 2080 2090 pF1KE3 FANRDITDHMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTSALSPVICGPNRSFL : :.. :. : :::..: : :.. ::. CCDS34 GAARELRDQAGLAPADVAHQRNHWDLLTLLEGAGPPEARHKATPGREAGPFPRARTVSVS 1790 1800 1810 1820 1830 1840 2100 2110 2120 2130 2140 2150 pF1KE3 SLKHTPMGKKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSESSVTLSPVD CCDS34 VPPHGGGALPRCRTLSAGAGPRGGGACLQARTWSVDLAARGGGAYSHCRSLSGVGAGGGP 1850 1860 1870 1880 1890 1900 >>CCDS47445.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3144 aa) initn: 1551 init1: 802 opt: 1714 Z-score: 757.2 bits: 154.6 E(32554): 7.4e-36 Smith-Waterman score: 2021; 34.1% identity (57.3% similar) in 911 aa overlap (177-1035:403-1246) 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 ACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPG-HCQHGGTCLNLPGSY ..:: ...: . . .: . :.:. : . CCDS47 SCESFPLRNNATCKKCEKDYPCSCISGFTEKNCEKAIDHCKLLSINCLNEEWCFNIIGRF 380 390 400 410 420 430 210 220 230 240 250 pF1KE3 QCQCPQGFTGQYC---DSLYVPCAPSPCVNG----GTCRQTGDFTFECNCLPGF---EGS . : : : . : ..:. : : : :.. : :: :: :: CCDS47 KYVCIPGCTKNPCWFLKNVYL-IHQHLCYCGVTFHGICQDKGPAQFEYVWQLGFAGSEGE 440 450 460 470 480 490 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 TCERNIDD--CPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGG :. :: : . .. :. . : : : . :... : :: CCDS47 KCQGVIDAYFFLAANCTEDATYVNDPEDNNSSC---WFPHEGTKEI---------CANGC 500 510 520 530 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 TCANRNGG--YGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGL .: ... . : .: :.:. :: : : ..: :.. : : . : CCDS47 SCLSEEDSQEYRYLCFLRWAGNMYLENTTDDQENECQHEAVCKDEINRPRCSCSLSYIGR 540 550 560 570 580 590 380 390 400 410 420 pF1KE3 LCHLD-DACISNPCHK-GALCDTNPLNGQYICTCP--QGYKGADCTEDVDECAMANSNPC :: .. : :..: . .:: : .. :.: : :. : :...: .: : CCDS47 LCVVNVDYCLGNHSISVHGLC----LALSHNCNCSGLQRYERNICEIDTEDC---KSASC 600 610 620 630 640 650 430 440 450 460 470 pF1KE3 EHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIG----------- ... .. : : .:. :. : .::.::.:: : ::.: :::.:. : CCDS47 KNGTTSTHLRGYFFRKCVPGFKGTQCEIDIDECASHPCKNGATCIDQPGNYFCQCVPPFK 660 670 680 690 700 710 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 ---GFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDI ::.::: ::. :..:: .:..: : : .:. : : .::.: . : :. . CCDS47 VVDGFSCLCNPGYVGIRCEQDIDDCILNACEHNSTCKDLHLSYQCVCLSDWEGNFCEQES 720 730 740 750 760 770 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 DDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQ-CQDGI--DS ..:. .:: :.. : : ..:.:.:..:.:: : :.:..:: ::: .: :... . CCDS47 NECKMNPCKNNSTCTDLYKSYRCECTSGWTGQNCSEEINECDSDPCMNGGLCHESTIPGQ 780 790 800 810 820 830 600 610 620 630 640 pF1KE3 YTCICNPGYMGAICSDQIDEC--YSSPCLNDGRCIDLVNGYQ-CNCQPGTSGVNCEINFD ..:.: : : : .: .. . : .:: :.. :. ::.. : : :. : ::::. CCDS47 FVCLCPPLYTGQFCHQRYNLCDLLHNPCRNNSTCLALVDANQHCICREEFEGKNCEIDVK 840 850 860 870 880 890 650 660 670 680 690 700 pF1KE3 DCASNPCI-HGICMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRC :: : .: : : .: . :.: :::.:. :.:.:.::.:.::....::.. .: : : CCDS47 DCLFLSCQDYGDCEDMVNNFRCICRPGFSGSLCEIEINECSSEPCKNNGTCVDLTNRFFC 900 910 920 930 940 950 710 720 730 740 750 760 pF1KE3 ICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPCI-HGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNP : : : : .::.: .::. . ::. .::.::: :..:::::.. .::::.: CCDS47 NCEPEYHGPFCELDVNKCKISPCLDEENCVYRTDGYNCLCAPGYTGINCEINLDECLSEP 960 970 980 990 1000 1010 770 780 790 800 810 820 pF1KE3 CQNGGTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPY : . :.: . .: : : ::.:: : .:..: ..: :::::. : :.. :. : CCDS47 CLHDGVCIDGINHYTCDCKSGFFGTHCETNANDCLSNPCLH-GRCTELINEY-------- 1020 1030 1040 1050 1060 830 840 850 860 870 880 pF1KE3 TGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNH ::: :. : : . : : : :..: : ::::. CCDS47 ----------PCS---CD------------------ADGTSTQ-CKIKINDCTSIPCMNE 1070 1080 1090 890 900 910 920 930 pF1KE3 GLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDCLANP------CQNGGSCMDGV-NTFSCLCL :.:... .. : :: :..: ::..::.: :.: : ::: :.:: .::.: :: CCDS47 GFCQKSAHGFTCICPRGYTGAYCEKSIDNC-AEPELNSVICLNGGICVDGPGHTFDCRCL 1100 1110 1120 1130 1140 1150 940 950 960 970 980 990 pF1KE3 PGFTGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFN :::.:. :. ..::: : :: .:. : :..:.:.:::: :..: ::::.. :: .:: . CCDS47 PGFSGQFCEININECSSSPCLHGADCEDHINGYVCKCQPGWSGHHCENEL-ECIPNSCVH 1160 1170 1180 1190 1200 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE3 GGTCVDGINSFSCLCPVGFT----GSFCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLG :... . .::: :: : .: :: . . :: CCDS47 E-LCMENEPGSTCLCTPGFMTCSIGLLCGDEIRRIT---CLTPIFQRTDPISTQTYTIPP 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE3 YTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGV CCDS47 SETLVSSFPSIKATRIPAIMDTYPVDQGPKQTGIVKHDILPTTGLATLRISTPLESYLLQ 1270 1280 1290 1300 1310 1320 >>CCDS78156.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3165 aa) initn: 1551 init1: 802 opt: 1714 Z-score: 757.2 bits: 154.6 E(32554): 7.4e-36 Smith-Waterman score: 2021; 34.1% identity (57.3% similar) in 911 aa overlap (177-1035:403-1246) 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 ACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPG-HCQHGGTCLNLPGSY ..:: ...: . . .: . :.:. : . CCDS78 SCESFPLRNNATCKKCEKDYPCSCISGFTEKNCEKAIDHCKLLSINCLNEEWCFNIIGRF 380 390 400 410 420 430 210 220 230 240 250 pF1KE3 QCQCPQGFTGQYC---DSLYVPCAPSPCVNG----GTCRQTGDFTFECNCLPGF---EGS . : : : . : ..:. : : : :.. : :: :: :: CCDS78 KYVCIPGCTKNPCWFLKNVYL-IHQHLCYCGVTFHGICQDKGPAQFEYVWQLGFAGSEGE 440 450 460 470 480 490 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 TCERNIDD--CPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGG :. :: : . .. :. . : : : . :... : :: CCDS78 KCQGVIDAYFFLAANCTEDATYVNDPEDNNSSC---WFPHEGTKEI---------CANGC 500 510 520 530 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 TCANRNGG--YGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGL .: ... . : .: :.:. :: : : ..: :.. : : . : CCDS78 SCLSEEDSQEYRYLCFLRWAGNMYLENTTDDQENECQHEAVCKDEINRPRCSCSLSYIGR 540 550 560 570 580 590 380 390 400 410 420 pF1KE3 LCHLD-DACISNPCHK-GALCDTNPLNGQYICTCP--QGYKGADCTEDVDECAMANSNPC :: .. : :..: . .:: : .. :.: : :. : :...: .: : CCDS78 LCVVNVDYCLGNHSISVHGLC----LALSHNCNCSGLQRYERNICEIDTEDC---KSASC 600 610 620 630 640 650 430 440 450 460 470 pF1KE3 EHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIG----------- ... .. : : .:. :. : .::.::.:: : ::.: :::.:. : CCDS78 KNGTTSTHLRGYFFRKCVPGFKGTQCEIDIDECASHPCKNGATCIDQPGNYFCQCVPPFK 660 670 680 690 700 710 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 ---GFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDI ::.::: ::. :..:: .:..: : : .:. : : .::.: . : :. . CCDS78 VVDGFSCLCNPGYVGIRCEQDIDDCILNACEHNSTCKDLHLSYQCVCLSDWEGNFCEQES 720 730 740 750 760 770 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 DDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQ-CQDGI--DS ..:. .:: :.. : : ..:.:.:..:.:: : :.:..:: ::: .: :... . CCDS78 NECKMNPCKNNSTCTDLYKSYRCECTSGWTGQNCSEEINECDSDPCMNGGLCHESTIPGQ 780 790 800 810 820 830 600 610 620 630 640 pF1KE3 YTCICNPGYMGAICSDQIDEC--YSSPCLNDGRCIDLVNGYQ-CNCQPGTSGVNCEINFD ..:.: : : : .: .. . : .:: :.. :. ::.. : : :. : ::::. CCDS78 FVCLCPPLYTGQFCHQRYNLCDLLHNPCRNNSTCLALVDANQHCICREEFEGKNCEIDVK 840 850 860 870 880 890 650 660 670 680 690 700 pF1KE3 DCASNPCI-HGICMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRC :: : .: : : .: . :.: :::.:. :.:.:.::.:.::....::.. .: : : CCDS78 DCLFLSCQDYGDCEDMVNNFRCICRPGFSGSLCEIEINECSSEPCKNNGTCVDLTNRFFC 900 910 920 930 940 950 710 720 730 740 750 760 pF1KE3 ICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPCI-HGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNP : : : : .::.: .::. . ::. .::.::: :..:::::.. .::::.: CCDS78 NCEPEYHGPFCELDVNKCKISPCLDEENCVYRTDGYNCLCAPGYTGINCEINLDECLSEP 960 970 980 990 1000 1010 770 780 790 800 810 820 pF1KE3 CQNGGTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPY : . :.: . .: : : ::.:: : .:..: ..: :::::. : :.. :. : CCDS78 CLHDGVCIDGINHYTCDCKSGFFGTHCETNANDCLSNPCLH-GRCTELINEY-------- 1020 1030 1040 1050 1060 830 840 850 860 870 880 pF1KE3 TGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNH ::: :. : : . : : : :..: : ::::. CCDS78 ----------PCS---CD------------------ADGTSTQ-CKIKINDCTSIPCMNE 1070 1080 1090 890 900 910 920 930 pF1KE3 GLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDCLANP------CQNGGSCMDGV-NTFSCLCL :.:... .. : :: :..: ::..::.: :.: : ::: :.:: .::.: :: CCDS78 GFCQKSAHGFTCICPRGYTGAYCEKSIDNC-AEPELNSVICLNGGICVDGPGHTFDCRCL 1100 1110 1120 1130 1140 1150 940 950 960 970 980 990 pF1KE3 PGFTGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFN :::.:. :. ..::: : :: .:. : :..:.:.:::: :..: ::::.. :: .:: . CCDS78 PGFSGQFCEININECSSSPCLHGADCEDHINGYVCKCQPGWSGHHCENEL-ECIPNSCVH 1160 1170 1180 1190 1200 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE3 GGTCVDGINSFSCLCPVGFT----GSFCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLG :... . .::: :: : .: :: . . :: CCDS78 E-LCMENEPGSTCLCTPGFMTCSIGLLCGDEIRRIT---CLTPIFQRTDPISTQTYTIPP 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE3 YTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGV CCDS78 SETLVSSFPSIKATRIPAIMDTYPVDQGPKQTGIVKHDILPTTGLATLRISTPLESYLLQ 1270 1280 1290 1300 1310 1320 >>CCDS72880.1 NOTCH2NL gene_id:388677|Hs108|chr1 (236 aa) initn: 1641 init1: 1641 opt: 1641 Z-score: 738.5 bits: 147.4 E(32554): 8.1e-35 Smith-Waterman score: 1641; 99.5% identity (99.5% similar) in 211 aa overlap (40-250:1-211) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 WALLALWLCCAAPAHALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGEYCQHRDPCE :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS72 MCVTYHNGTGYCKCPEGFLGEYCQHRDPCE 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 KNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCHMLSRDTY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS72 KNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCHMLSRDTY 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 ECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS72 ECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIP 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 GHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECNCL :::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS72 GHCQHGGTCLNLPGSYQCQCLQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECNCL 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 PGFEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNAC : CCDS72 PETVRRGTELWERDREVWNGKEHDEN 220 230 >>CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20 (1218 aa) initn: 2044 init1: 790 opt: 1395 Z-score: 624.4 bits: 128.6 E(32554): 1.8e-28 Smith-Waterman score: 2031; 34.0% identity (57.5% similar) in 892 aa overlap (117-989:173-960) 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 KATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCHMLSRDTYECT-CQVGF-TGKECQW : :. :. . : :: .: :. CCDS13 NDTVQPDSIIEKASHSGMINPSRQWQTLKQNTGVAHFEYQIRVTCDDYYYGFGCNKFCRP 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 TDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPGHCQHGGTCLNLPGS : ..: .: .:. :. :. : .:. . : : . :.: .:::. CCDS13 RDDFFGH-----YACDQNGNK---TCMEGWMGPECNRAI--CR-QGCSPKHGSC-KLPGD 210 220 230 240 250 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 YQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSP-CVNGGTCRQTGDFTFECNCLPGFEGSTCERNIDD :.: :. : :::. : : : ::.: : . ..: : .. :. :..... CCDS13 --CRCQYGWQGLYCDK----CIPHPGCVHG-ICNEP----WQCLCETNWGGQLCDKDLNY 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 CPNHR-CQNGGVCVD-GVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGGTCANRNGG : .:. : :::.: . : . :.: :: ..: : :: .: :.: :.: . . : CCDS13 CGTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDP--CHNRGSCKETSLG 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 YGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGLLCHLDDACIS . : : ::.: :: :::::. .:. :.:: : : .:.:.:: CCDS13 FECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCP---------------- 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 NPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFH :: . : : :..:: ...:: .: .: : .... CCDS13 ----------------------PQ-WTGKTCQLDANEC---EAKPCVNAKSCKNLIASYY 410 420 430 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 CECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSN :.:: :. : :...::.: .. :::::.: : ..:. :.: ::. : ::: .:.:: :: CCDS13 CDCLPGWMGQNCDININDCLGQ-CQNDASCRDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDECASN 440 450 460 470 480 490 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 PCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATG ::.:.:.: ...:::::::: ::.: .::.::: : .:: :::.: .. . : :.: CCDS13 PCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPED 500 510 520 530 540 550 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 FTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQCQDGIDSYTCICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGR . : : . :.: :: . ::: :. .. . . . :. : :. CCDS13 YEGKNCSHLKDHCRTTPC------EVIDS----CTVAMASNDTPEGVRYISSNVCGPHGK 560 570 580 590 600 630 640 650 660 670 pF1KE3 CIDLVNG-YQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHG-ICMDGINRYSCVCSPGFTGQRC : . .: . :.:. : .:. :. :..:: :::: .: :.::.: :.:.:: :. : : CCDS13 CKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWEGAYC 610 620 630 640 650 660 680 690 700 710 720 730 pF1KE3 NIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPCIHGN-CTGGL . .:..:..:::..:.:: . :: : : : .: . .:.:. ..: : .:. : CCDS13 ETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTCYDEG 670 680 690 700 710 720 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 SGYKCLCDAGWVGINCEVDKNE-CLSNPCQNGGTCDNLVNG--YRCTCKKGFKGYNCQVN ...::.: .:: : .:.. .: :: :::.::::: .::: . :.::.:..: : : CCDS13 DAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTC--VVNGESFTCVCKEGWEGPICAQN 730 740 750 760 770 780 800 810 820 830 840 850 pF1KE3 IDECASNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFE ..:. .:: :.::: : . : :.:. ..: .:. . :. .:: .:.: . : CCDS13 TNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDEIN-- 790 800 810 820 830 840 860 870 880 890 900 910 pF1KE3 SYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDC .: :.: :: .: .: .: ..::. :.:: . : : . : ::: CCDS13 GYRCVCPPGHSGAKC----QEVSGRPCI-------TMGSVI---PDG-AKWD-----DDC 850 860 870 880 920 930 940 950 960 pF1KE3 LANPCQNGGSCMDGV--NTFSCLCLPGFT----GDKCQTDMNE-CLSEPCKNGGTC-SDY . : :: . : . :: : . :..: ... :. .:: . : : :. CCDS13 NTCQCLNGRIACSKVWCGPRPCLLHKGHSECPSGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSSS 890 900 910 920 930 940 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE3 VNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGFTGSFCLHEIN .. :: . :. . .: : CCDS13 LQPVKTKCTS--DSYYQDNCANITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEYSI 950 960 970 980 990 >>CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1238 aa) initn: 2407 init1: 755 opt: 1209 Z-score: 544.2 bits: 113.8 E(32554): 5.4e-24 Smith-Waterman score: 2006; 33.9% identity (58.1% similar) in 908 aa overlap (183-1070:172-1017) 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 CANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQG .: : . .: .: . . .: .. CCDS99 FTLIVEAWDWDNDTTPNEELLIERVSHAGMINPEDRWKSLHFSGHVAHLELQIRVRCDEN 150 160 170 180 190 200 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 FTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGG-TCRQTGDFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQ- . . :... : : : :: : :. . :. :. :. :.. . : .. :. CCDS99 YYSATCNKF---CRPRNDFFGHYTCDQYGNKA----CMDGWMGKECKEAV--C-KQGCNL 210 220 230 240 250 280 290 300 310 320 pF1KE3 -NGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNG .:: : : .::: : :.:: :::. :. : .: .:.. . : : .. CCDS99 LHGGCTVPG----ECRCSYGWQGRFC----DECVPYPG-CVHG-SCVE---PWQCNCETN 260 270 280 290 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 WSGDDCSENIDDC-AFASCTPGSTCID-RVASFSCMCPEGKAGLLCH-LDDACISNPCHK :.: :..... : . :: :.:::. . .. : ::.: .: :. . :: :::: . CCDS99 WGGLLCDKDLNYCGSHHPCTNGGTCINAEPDQYRCTCPDGYSGRNCEKAEHACTSNPCAN 300 310 320 330 340 350 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 GALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLK :. : : .: . : ::.:..: :. :.:::: :::: .: ::. .:.: : . CCDS99 GGSCHEVP-SG-FECHCPSGWSGPTCALDIDECA---SNPCAAGGTCVDQVDGFECICPE 360 370 380 390 400 410 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 GYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNN ..: :..: :::.. :: : .: . :::. : :.::.::..:....:.:... : .. CCDS99 QWVGATCQLDANECEGKPCLNAFSCKNLIGGYYCDCIPGWKGINCHINVNDCRGQ-CQHG 420 430 440 450 460 470 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 GQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVL : : : :: .::.:: :: : :... :.:.:.:: .:. : : .:..:.: ::.: : CCDS99 GTCKDLVNGYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGGLCEDLADGFHCHCPQGFSGPL 480 490 500 510 520 530 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 CEENIDNCDPDPCHHG-QCQDGIDSYTCICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDL :: ..: :.:.::..: .: . .: : : . : :: . : .. : : :: CCDS99 CEVDVDLCEPSPCRNGARCYNLEGDYYCACPDDFGGKNCSVPREPCPGGAC----RVID- 540 550 560 570 580 630 640 650 660 670 680 pF1KE3 VNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPC-IHGICMD--GINRYSCVCSPGFTGQRCNID : . :: :. ::. : :: :.. : : .::.:. :::: :. . CCDS99 --GCGSDAGPGMPGTA--------ASGVCGPHGRCVSQPGGN-FSCICDSGFTGTYCHEN 590 600 610 620 630 690 700 710 720 730 740 pF1KE3 IDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPC-IHGNCTGGLSGY ::.: ..:::.:.:::. :..:::.:: : . : .. :.:: .:: .: : .. . CCDS99 IDDCLGQPCRNGGTCIDEVDAFRCFCPSGWEGELCDTNPNDCLPDPCHSRGRCYDLVNDF 640 650 660 670 680 690 750 760 770 780 790 800 pF1KE3 KCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNGGTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDE-CA : :: :: : .:. . .: . :.::::: . . .::.: :.:: .: : . : CCDS99 YCACDDGWKGKTCHSREFQCDAYTCSNGGTCYDSGDTFRCACPPGWKGSTCAVAKNSSCL 700 710 720 730 740 750 810 820 830 840 850 860 pF1KE3 SNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCL :::.: ::: . ....: : . :..: :.: :: :...: .. :. . : CCDS99 PNPCVNGGTCVGSGASFSCICRDGWEGRTCTHNTNDCNPLPCYNGGICVDGVNW--FRCE 760 770 780 790 800 810 870 880 890 900 910 pF1KE3 CAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDID---DCLA ::::. : : :.:::: :.:: . : . ..: : :::: .: :.: : .: . CCDS99 CAPGFAGPDCRINIDECQSSPCAYGATCVDEINGYRCSCPPGRAGPRCQEVIGFGRSCWS 820 830 840 850 860 870 920 930 940 950 960 970 pF1KE3 --NPCQNGGSCMDGVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKC .: .:.: .. : :: :: : :. : .:: .: .. . .: CCDS99 RGTPFPHGSSWVEDCN--SCRCLDGRRD--CSKVW--CGWKPCLLAGQ----PEALSAQC 880 890 900 910 920 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE3 QAGFDGVHC-ENNINECTESSCFNGGTC-VDGINSFSCLCPVGFTGSFCLH-EINECSSH : .: :. ..: . : : : .. : :: : . : . .. .: CCDS99 PLG---QRCLEKAPGQCLRPPCEAWGECGAEEPPSTPCLPRSGHLDNNCARLTLHFNRDH 930 940 950 960 970 980 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE3 PCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSG . .:: : .. . : : . . :: ::.:. CCDS99 --VPQGTTVGAICSGIRSLPATRAVARDRLLVLLCDRASSGASAVEVAVSFSPARDLPDS 990 1000 1010 1020 1030 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE3 WAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLGYTGSYCEEQLDE CCDS99 SLIQGAAHAIVAAITQRGNSSLLLAVTEVKVETVVTGGSSTGLLVPVLCGAFSVLWLACV 1040 1050 1060 1070 1080 1090 >>CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1200 aa) initn: 1784 init1: 634 opt: 1179 Z-score: 531.4 bits: 111.4 E(32554): 2.8e-23 Smith-Waterman score: 1877; 34.5% identity (58.1% similar) in 809 aa overlap (52-838:197-955) 30 40 50 60 70 80 pF1KE3 PAHALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGEYCQHRDPCE-KNRCQNGGTCV .: :.. . :.. :. .: . :: CCDS99 SHAGMINPEDRWKSLHFSGHVAHLELQIRVRCDENYYSATCNKF--CRPRNDFFGHYTC- 170 180 190 200 210 220 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 AQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCHMLSRDTYECTCQVGFTGK . . .:: : .:. :..:. .. : . :.:: : . . :: :. :. :. CCDS99 -DQYGNKA---CMDGWMGKECKEAV---CKQGCNLLHGG-CTVPG----ECRCSYGWQGR 230 240 250 260 270 150 160 170 180 190 pF1KE3 ECQWTDACLSHP-CANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPGHCQHGGTCL : : :. .: :..:: :. . ..:.: :.. : :. :.: : : .::::. CCDS99 FC---DECVPYPGCVHGS-CV---EPWQCNCETNWGGLLCDKDLNYCGSHHPCTNGGTCI 280 290 300 310 320 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 NL-PGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECNCLPGFEGSTCE : : .:.: ::.:..:. :.. :. .::.:::.:... . :::.: :. : :: CCDS99 NAEPDQYRCTCPDGYSGRNCEKAEHACTSNPCANGGSCHEVPS-GFECHCPSGWSGPTCA 330 340 350 360 370 380 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 RNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGGTCANR .::.: .. : ::.::: :. ..: :: ::.: : ::..: : ::.:::: . CCDS99 LDIDECASNPCAAGGTCVDQVDGFECICPEQWVGATCQLDVNDCRGQ---CQHGGTCKDL 390 400 410 420 430 440 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 NGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGLLCHLD-D .:: ::: :..: : . :.:: . : :. : : . .: : ::.: .: ::..: : CCDS99 VNGYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGGLCEDLADGFHCHCPQGFSGPLCEVDVD 450 460 470 480 490 500 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 ACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTD : .::..:: : . :.:.: :.::. . : .:. . .:: .: : : CCDS99 LCEPSPCRNGARCYN--LEGDYYCACPDDFGGKNCS--------VPREPCP-GGACRVID 510 520 530 540 440 450 460 470 480 490 pF1KE3 GAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGG-FTCLCMPGFKGVHCELEIN : : : . : . : : . :... :: :.:.: :: :..:. .:. CCDS99 G---CGSDAGPGMP------GTAASGVCGPHGRCVSQPGGNFSCICDSGFTGTYCHENID 550 560 570 580 590 600 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 ECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYEC .: ..:: :.: :.:.:. :.:.:: :. : .:. . .:: :: . ..: : : . : CCDS99 DCLGQPCRNGGTCIDEVDAFRCFCPSGWEGELCDTNPNDCLPDPCHSRGRCYDLVNDFYC 610 620 630 640 650 660 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 QCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHG-QCQDGIDSYTCICNPGYMGAICS-DQIDECYSS : :. : :. .:: : .: : :. :.. : : ::. :. :. . . : . CCDS99 ACDDGWKGKTCHSREFQCDAYTCSNGGTCYDSGDTFRCACPPGWKGSTCAVAKNSSCLPN 670 680 690 700 710 720 620 630 640 650 660 670 pF1KE3 PCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHG-ICMDGINRYSCVCSPG ::.: : :. ...: :. : : .: : .:: :: .: ::.::.: . : :.:: CCDS99 PCVNGGTCVGSGASFSCICRDGWEGRTCTHNTNDCNPLPCYNGGICVDGVNWFRCECAPG 730 740 750 760 770 780 680 690 700 710 720 pF1KE3 FTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQVN---ECLS--NP :.: : :.:::: :.:: ::::.. .::.:: :: : : : .. : : .: CCDS99 FAGPDCRINIDECQSSPCAYGATCVDEINGYRCSCPPGRAGPRCQEVIGFGRSCWSRGTP 790 800 810 820 830 840 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 CIHGNC-TGGLSGYKCL-----CDAGWVGIN-CEV-DKNECLSNPCQNGGTCDNLVNGYR ::. . .. .:: :. : : . : . . : :: : : : . . : . CCDS99 FPHGSSWVEDCNSCRCLDGRRDCSKVWCGWKPCLLAGQPEALSAQCPLGQRCLEKAPG-Q 850 860 870 880 890 790 800 810 820 830 pF1KE3 CTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQ-GTCSDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSP : .: . .: :.::: . : ... . : : .. .. :: : :: CCDS99 CLRPPCEAWGEC--GAEEPPSTPCLPRSGHLDNNCARLTLHFNRDHVPQGT-TVGAICSG 900 910 920 930 940 950 840 850 860 870 880 890 pF1KE3 NPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMCEC CCDS99 IRSLPATRAVARDRLLVLLCDRASSGASAVEVAVSFSPARDLPDSSLIQGAAHAIVAAIT 960 970 980 990 1000 1010 2471 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 03:30:18 2016 done: Tue Nov 8 03:30:19 2016 Total Scan time: 6.370 Total Display time: 1.460 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]