Result of FASTA (ccds) for pF1KE3718
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3718, 2471 aa
  1>>>pF1KE3718 2471 - 2471 aa - 2471 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4485+/-0.00192; mu= -1.0525+/- 0.116
 mean_var=538.6481+/-107.588, 0's: 0 Z-trim(110.6): 293  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.055261
 statistics sampled from 11438 (11720) to 11438 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.36), width:  16
 Scan time:  6.370

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1           (2471) 18249 1472.7       0
CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9         (2555) 6850 563.9 3.6e-159
CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19        (2321) 5232 434.9 2.3e-120
CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6         (2003) 3253 277.0 6.5e-73
CCDS47445.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6          (3144) 1714 154.6 7.4e-36
CCDS78156.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6          (3165) 1714 154.6 7.4e-36
CCDS72880.1 NOTCH2NL gene_id:388677|Hs108|chr1     ( 236) 1641 147.4 8.1e-35
CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20           (1218) 1395 128.6 1.8e-28
CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14           (1238) 1209 113.8 5.4e-24
CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14           (1200) 1179 111.4 2.8e-23
CCDS12196.1 FBN3 gene_id:84467|Hs108|chr19         (2809) 1168 111.0 8.8e-23
CCDS58052.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1          ( 870) 1114 106.1 8.3e-22
CCDS1390.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1           (1406) 1100 105.2 2.4e-21
CCDS33390.1 DNER gene_id:92737|Hs108|chr2          ( 737) 1069 102.4 8.9e-21
CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9         (3571) 1027 99.9 2.5e-19
CCDS58053.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1          (1382) 1013 98.3 2.9e-19
CCDS6852.2 CRB2 gene_id:286204|Hs108|chr9          (1285)  966 94.5 3.8e-18
CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6           ( 723)  954 93.2 5.1e-18
CCDS45232.1 DLL4 gene_id:54567|Hs108|chr15         ( 685)  933 91.5 1.6e-17
CCDS10213.2 MEGF11 gene_id:84465|Hs108|chr15       (1044)  895 88.7 1.7e-16
CCDS34222.1 FBN2 gene_id:2201|Hs108|chr5           (2912)  899 89.6 2.6e-16
CCDS4142.1 MEGF10 gene_id:84466|Hs108|chr5         (1140)  880 87.5   4e-16
CCDS32232.1 FBN1 gene_id:2200|Hs108|chr15          (2871)  885 88.4 5.5e-16
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10          (1534)  774 79.3 1.7e-13
CCDS53454.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1          (1294)  748 77.1 6.5e-13
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4          (1521)  741 76.6 1.1e-12
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4          (1525)  741 76.6 1.1e-12
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4           (1529)  741 76.6 1.1e-12
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5          (1530)  732 75.9 1.7e-12
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5           (1523)  726 75.4 2.4e-12
CCDS46562.1 SNED1 gene_id:25992|Hs108|chr2         (1413)  685 72.1 2.2e-11
CCDS74370.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19         (1557)  683 72.0 2.6e-11
CCDS7113.1 CUBN gene_id:8029|Hs108|chr10           (3623)  689 72.9 3.2e-11
CCDS4897.1 DLK2 gene_id:65989|Hs108|chr6           ( 383)  663 69.7 3.3e-11
CCDS74368.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19         (1587)  670 71.0 5.5e-11
CCDS74369.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19         (1624)  670 71.0 5.6e-11
CCDS44647.1 LTBP3 gene_id:4054|Hs108|chr11         (1303)  666 70.6   6e-11


>>CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1                (2471 aa)
 initn: 18249 init1: 18249 opt: 18249  Z-score: 7882.8  bits: 1472.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 18249; 100.0% identity (100.0% similar) in 2471 aa overlap (1-2471:1-2471)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MPALRPALLWALLALWLCCAAPAHALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MPALRPALLWALLALWLCCAAPAHALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 YCQHRDPCEKNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 YCQHRDPCEKNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 CHMLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 CHMLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 TDVNECDIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 TDVNECDIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 DFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 DFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 ECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 ECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 SCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 SCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 MANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTC
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 LCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 CLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQCQDGIDSYTCICNPGYM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 CLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQCQDGIDSYTCICNPGYM
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 GAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHGICM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 GAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHGICM
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 DGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 DGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 VNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNGGTCDNLVNGYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNGGTCDNLVNGYR
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 CTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPN
       :::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 CTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCFDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPN
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 PCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMCECP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 PCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMCECP
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 PGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMDGVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEPCKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 PGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMDGVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEPCKN
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 GGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGFTGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 GGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGFTGS
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE3 FCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 FCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQ
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE3 KKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 KKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLG
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE3 YTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFIGGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 YTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFIGGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGG
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE3 TCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDCARGPHCLNGGQCMDRIGGYSCRCLPGFAGER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 TCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDCARGPHCLNGGQCMDRIGGYSCRCLPGFAGER
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE3 CEGDINECLSNPCSSEGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 CEGDINECLSNPCSSEGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCA
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE3 VASNMPDGFICRCPPGFSGARCQSSCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCFCPSPRDCESGCAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VASNMPDGFICRCPPGFSGARCQSSCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCFCPSPRDCESGCAS
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

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pF1KE3 SPCQHGGSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCELYTAPPSTPPATCLSQYCADKARDGVCD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 SPCQHGGSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCELYTAPPSTPPATCLSQYCADKARDGVCD
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

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pF1KE3 EACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSPLPCWDYINNQCDELCNTVECLFDNFECQGNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 EACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSPLPCWDYINNQCDELCNTVECLFDNFECQGNS
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

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pF1KE3 KTCKYDKYCADHFKDNHCDQGCNSEECGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 KTCKYDKYCADHFKDNHCDQGCNSEECGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQ
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pF1KE3 DARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGELMVYPYYGEKSAAMKKQRMTRRSLPGEQEQEVAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 DARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGELMVYPYYGEKSAAMKKQRMTRRSLPGEQEQEVAG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 SKVFLEIDNRQCVQDSDHCFKNTDAAAALLASHAIQGTLSYPLVSVVSESLTPERTQLLY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LLAVAVVIILFIILLGVIMAKRKRKHGSLWLPEGFTLRRDASNHKRREPVGQDAVGLKNL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 SVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDRRPWTQQHLEAADIR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 RTPSLALTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSDLSDEDEDAEDSSANIIT
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pF1KE3 DLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRCPLHAAVAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 DLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRCPLHAAVAA
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pF1KE3 DAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVDDHGKSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 DAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVDDHGKSA
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             1990      2000      2010      2020      2030      2040
pF1KE3 LHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDHFANRDITD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDHFANRDITD
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

             2050      2060      2070      2080      2090      2100
pF1KE3 HMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTSALSPVICGPNRSFLSLKHTPMG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 HMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTSALSPVICGPNRSFLSLKHTPMG
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pF1KE3 KKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSESSVTLSPVDSLESPHTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 KKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSESSVTLSPVDSLESPHTY
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pF1KE3 VSDTTSSPMITSPGILQASPNPMLATAAPPAPVHAQHALSFSNLHEMQPLAHGASTVLPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VSDTTSSPMITSPGILQASPNPMLATAAPPAPVHAQHALSFSNLHEMQPLAHGASTVLPS
             2170      2180      2190      2200      2210      2220

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pF1KE3 VSQLLSHHHIVSPGSGSAGSLSRLHPVPVPADWMNRMEVNETQYNEMFGMVLAPAEGTHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VSQLLSHHHIVSPGSGSAGSLSRLHPVPVPADWMNRMEVNETQYNEMFGMVLAPAEGTHP
             2230      2240      2250      2260      2270      2280

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pF1KE3 GIAPQSRPPEGKHITTPREPLPPIVTFQLIPKGSIAQPAGAPQPQSTCPPAVAGPLPTMY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 GIAPQSRPPEGKHITTPREPLPPIVTFQLIPKGSIAQPAGAPQPQSTCPPAVAGPLPTMY
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pF1KE3 QIPEMARLPSVAFPTAMMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYPTPPSQHSYASSNAAER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 QIPEMARLPSVAFPTAMMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYPTPPSQHSYASSNAAER
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pF1KE3 TPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVTTSPTPGGAGGGQRGPGTHMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 TPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVTTSPTPGGAGGGQRGPGTHMS
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             2470 
pF1KE3 EPPHNNMQVYA
       :::::::::::
CCDS90 EPPHNNMQVYA
             2470 

>>CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9              (2555 aa)
 initn: 7355 init1: 4381 opt: 6850  Z-score: 2971.2  bits: 563.9 E(32554): 3.6e-159
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pF1KE3 MPALRPALLWALLALWLCCAAPAHALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGE
            : ::  :: : :  :  :.. .: .  : :.: : :    :::  : :  .:.: 
CCDS43     MPPLLAPLLCLALLPALAARGPRCSQPGETCLNGGKC-EAANGTEACVCGGAFVGP
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pF1KE3 YCQHRDPCEKNRCQNGGTC--VAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNG
        ::  .:: .. :.:.:::  : .  ..  .: :: ::.:  :    .. :. . :: ::
CCDS43 RCQDPNPCLSTPCKNAGTCHVVDRRGVADYACSCALGFSGPLCLTPLDNACL-TNPCRNG
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pF1KE3 GTCHMLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQK
       ::: .:.   :.: :  :..:: :: .: : :.:::::. :     .. :.:  .: :  
CCDS43 GTCDLLTLTEYKCRCPPGWSGKSCQQADPCASNPCANGGQCLPFEASYICHCPPSFHGPT
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pF1KE3 CETDVNEC-DIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCR
       :. ::::: . :: :.::::: :  :::.: :    ::  :.  ::::.:::: ::::::
CCDS43 CRQDVNECGQKPGLCRHGGTCHNEVGSYRCVCRATHTGPNCERPYVPCSPSPCQNGGTCR
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pF1KE3 QTGDFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTE
        ::: : :: ::::: :..::.::::::.. :.:::.::::::::::::::.::::.:::
CCDS43 PTGDVTHECACLPGFTGQNCEENIDDCPGNNCKNGGACVDGVNTYNCRCPPEWTGQYCTE
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pF1KE3 DVDECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRV
       ::::: :.:::::::::: : .:::.:::::::.:.:::::::::: :.:  :.:: :::
CCDS43 DVDECQLMPNACQNGGTCHNTHGGYNCVCVNGWTGEDCSENIDDCASAACFHGATCHDRV
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pF1KE3 ASFSCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVD
       ::: : ::.:..::::::.::::::::..:. :::::.::. :::::.:: :  :..:::
CCDS43 ASFYCECPHGRTGLLCHLNDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYTGPACSQDVD
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pF1KE3 ECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGG
       ::... .:::::::::.:: :.:.:.::.::.:::::.:.::: :.::::::::::.:: 
CCDS43 ECSLG-ANPCEHAGKCINTLGSFECQCLQGYTGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGE
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pF1KE3 FTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCS
       : :.::::..:::::.. .:: :.::..::.:.::.:.::: :: :::: .:: :.:.:.
CCDS43 FQCICMPGYEGVHCEVNTDECASSPCLHNGRCLDKINEFQCECPTGFTGHLCQYDVDECA
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pF1KE3 STPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQCQDGIDSYTCICNP
       :::: :::::.: :: : : :. :.::. :: .::.:::::::.:.:.::. ..::.: :
CCDS43 STPCKNGAKCLDGPNTYTCVCTEGYTGTHCEVDIDECDPDPCHYGSCKDGVATFTCLCRP
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pF1KE3 GYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHG
       :: :  :  .:.:: :.:: . : : :  :.: : :  ::.: :::::.:::::.::  :
CCDS43 GYTGHHCETNINECSSQPCRHGGTCQDRDNAYLCFCLKGTTGPNCEINLDDCASSPCDSG
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pF1KE3 ICMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSC
        :.: :. : :.: ::.::. :::.:::::.:::..:.:: .:.::: : :::: : :.:
CCDS43 TCLDKIDGYECACEPGYTGSMCNINIDECAGNPCHNGGTCEDGINGFTCRCPEGYHDPTC
           660       670       680       690       700       710   

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pF1KE3 YSQVNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNGGTCDNLVN
        :.:::: ::::.:: :  .:.:::: :: :: : ::....::: :::: ::::: ....
CCDS43 LSEVNECNSNPCVHGACRDSLNGYKCDCDPGWSGTNCDINNNECESNPCVNGGTCKDMTS
           720       730       740       750       760       770   

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pF1KE3 GYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPC
       :: :::..::.: :::.::.::::::::::::: ::..:: :.:.::::: .:..:::::
CCDS43 GYVCTCREGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGATCEVVLAPC
           780       790       800       810       820       830   

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pF1KE3 SPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMC
       .:.::.:.. :..: ..::..:.:  ::::: : .::.::. .:: . . :.::.:.: :
CCDS43 APSPCRNGGECRQSEDYESFSCVCPTGWQGQTCEVDINECVLSPCRHGASCQNTHGGYRC
           840       850       860       870       880       890   

       900       910       920       930       940       950       
pF1KE3 ECPPGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMDGVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEP
       .:  :.:: .:: :::::  :::.::::: ::.::  : ::::: :  :. :.::: :.:
CCDS43 HCQAGYSGRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAFCDCLPGFRGTFCEEDINECASDP
           900       910       920       930       940       950   

       960       970       980       990      1000      1010       
pF1KE3 CKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGF
       :.::..:.: :.:::: : :::.:.:::::  .:::::::::::::::::::.:::: ::
CCDS43 CRNGANCTDCVDSYTCTCPAGFSGIHCENNTPDCTESSCFNGGTCVDGINSFTCLCPPGF
           960       970       980       990      1000      1010   

      1020      1030      1040      1050      1060      1070       
pF1KE3 TGSFCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGT
       :::.: :..:::.:.:::. ::: :: :.:::.:: :::: :::.::. :. ::::: : 
CCDS43 TGSYCQHDVNECDSQPCLHGGTCQDGCGSYRCTCPQGYTGPNCQNLVHWCDSSPCKNGGK
          1020      1030      1040      1050      1060      1070   

      1080      1090      1100      1110      1120      1130       
pF1KE3 CVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQC
       : : ... .: :::::.: :::::.:::..::.:.:: : .::::.:.:..:::::.:.:
CCDS43 CWQTHTQYRCECPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARLCQHGGLCVDAGNTHHCRC
          1080      1090      1100      1110      1120      1130   

      1140      1150      1160      1170      1180      1190       
pF1KE3 PLGYTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFIGGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQ
         ::::::::. .:::. .:::.::::.:..::: :.:: ::.::::  :.::: ..:::
CCDS43 QAGYTGSYCEDLVDECSPSPCQNGATCTDYLGGYSCKCVAGYHGVNCSEEIDECLSHPCQ
          1140      1150      1160      1170      1180      1190   

      1200      1210      1220             1230      1240      1250
pF1KE3 NGGTCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDC-------ARGPHCLNGGQCMDRIGGYSC
       :::::.:: : .::::: ::.:. :: :.:::       .:.:.:.:.: :.:..:::::
CCDS43 NGGTCLDLPNTYKCSCPRGTQGVHCEINVDDCNPPVDPVSRSPKCFNNGTCVDQVGGYSC
          1200      1210      1220      1230      1240      1250   

             1260      1270      1280      1290      1300      1310
pF1KE3 RCLPGFAGERCEGDINECLSNPCSSEGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQ
        : :::.:::::::.::::::::...:. .:.: .::. : ::.. :::.::. .. :  
CCDS43 TCPPGFVGERCEGDVNECLSNPCDARGTQNCVQRVNDFHCECRAGHTGRRCESVINGCKG
          1260      1270      1280      1290      1300      1310   

             1320      1330      1340         1350      1360       
pF1KE3 MPCLNGGTCAVASNMPDGFICRCPPGFSGARCQS---SCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCF
        :: ::::::::::   ::::.:: :: :: :..   .::...: .:  :.    .: :.
CCDS43 KPCKNGGTCAVASNTARGFICKCPAGFEGATCENDARTCGSLRCLNGGTCISGPRSPTCL
          1320      1330      1340      1350      1360      1370   

      1370              1380      1390      1400      1410         
pF1KE3 CPSPR---DCE----SGC-ASSPCQHGGSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCEL--YT--
       : .:    .:.    : : ...:: . :.:.:  . :.: : :   :.:  :..  :.  
CCDS43 CLGPFTGPECQFPASSPCLGGNPCYNQGTCEPTSESPFYRCLCPAKFNGLLCHILDYSFG
          1380      1390      1400      1410      1420      1430   

              1420      1430      1440      1450      1460         
pF1KE3 ------APPSTPPATCLSQYCADKARDGVCDEACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSP
              ::     .:    : . : . ::.  ::.::: ::::::::....:: ::.. 
CCDS43 GGAGRDIPPPLIEEACELPECQEDAGNKVCSLQCNNHACGWDGGDCSLNFNDPWKNCTQS
          1440      1450      1460      1470      1480      1490   

    1470       1480      1490      1500        1510      1520      
pF1KE3 LPCWDYINN-QCDELCNTVECLFDNFECQGNSKTCK--YDKYCADHFKDNHCDQGCNSEE
       : :: :... .::  ::.. ::::.:.::     :.  ::.:: :::.:.:::::::: :
CCDS43 LQCWKYFSDGHCDSQCNSAGCLFDGFDCQRAEGQCNPLYDQYCKDHFSDGHCDQGCNSAE
          1500      1510      1520      1530      1540      1550   

       1530      1540      1550      1560      1570      1580      
pF1KE3 CGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQDARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGE
       : :::::::   :: :: ::::.::::::::: ...  ::: :. .::::. .:::..:.
CCDS43 CEWDGLDCAEHVPERLAAGTLVVVVLMPPEQLRNSSFHFLRELSRVLHTNVVFKRDAHGQ
          1560      1570      1580      1590      1600      1610   

       1590      1600                       1610                   
pF1KE3 LMVYPYYGEKSAAMKKQRMTRRS-----------------LPGEQE----------QEVA
        :..:::: .   ..:. . : .                 ::: .:          ..: 
CCDS43 QMIFPYYG-REEELRKHPIKRAAEGWAAPDALLGQVKASLLPGGSEGGRRRRELDPMDVR
          1620       1630      1640      1650      1660      1670  

    1620      1630      1640      1650      1660        1670       
pF1KE3 GSKVFLEIDNRQCVQDSDHCFKNTDAAAALLASHAIQGTLSYP--LVSVVSESLTPERTQ
       :: :.:::::::::: :..::...  .::.:.. :  :.:. :  . .: ::.. :    
CCDS43 GSIVYLEIDNRQCVQASSQCFQSATDVAAFLGALASLGSLNIPYKIEAVQSETVEPPPPA
           1680      1690      1700      1710      1720      1730  

      1680        1690      1700       1710      1720      1730    
pF1KE3 LLYLL--AVAVVIILFIILLGVIMA-KRKRKHGSLWLPEGFTLRRDASNHKRREPVGQDA
        :...  :.:. ..::..  ::... ::.:.::.::.:::: .  .::..:::::.:.:.
CCDS43 QLHFMYVAAAAFVLLFFVGCGVLLSRKRRRQHGQLWFPEGFKVS-EASKKKRREPLGEDS
           1740      1750      1760      1770       1780      1790 

         1740      1750      1760      1770      1780      1790    
pF1KE3 VGLKNLSVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDRRPWTQQHL
       :::: :. ..:.. :.  . .: :  ::  . :: . :. ..: . ::  :.: ::::::
CCDS43 VGLKPLK-NASDGALMDDNQNE-W-GDEDLETKKFRFEEPVVLPDLDDQTDHRQWTQQHL
             1800      1810        1820      1830      1840        

         1800      1810      1820      1830      1840      1850    
pF1KE3 EAADIRRTPSLALTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSDLSDEDEDAEDS
       .:::.: . ..: ::::.: ..: .::::::::: ::::.::  ::. . .. .:. ::.
CCDS43 DAADLRMS-AMAPTPPQGEVDADCMDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLETGNSEEE-EDA
     1850       1860      1870      1880      1890      1900       

         1860      1870      1880      1890      1900      1910    
pF1KE3 SANIITDLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRCPL
        : .:.:..::::::. ::::::: ::::::::::.:::::::.:.:::: :::::: ::
CCDS43 PA-VISDFIYQGASLHNQTDRTGETALHLAARYSRSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPL
        1910      1920      1930      1940      1950      1960     

         1920      1930      1940      1950      1960      1970    
pF1KE3 HAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVD
       ::::.::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::. .::: .:::::::
CCDS43 HAAVSADAQGVFQILIRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMLEDLINSHADVNAVD
        1970      1980      1990      2000      2010      2020     

         1980      1990      2000      2010      2020      2030    
pF1KE3 DHGKSALHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDHFA
       : ::::::::::::::.:...:::::::.:::.:.:::::::::::::::.::.::::::
CCDS43 DLGKSALHWAAAVNNVDAAVVLLKNGANKDMQNNREETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFA
        2030      2040      2050      2060      2070      2080     

         2040      2050      2060      2070          2080      2090
pF1KE3 NRDITDHMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPP--GTVL--TSALSPVICGPNRS
       ::::::::::::::.:..::::::::::::::.. ::   :. :  : .::: .:.::  
CCDS43 NRDITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVRLLDEYNLVRSPQLHGAPLGGTPTLSPPLCSPNGY
        2090      2100      2110      2120      2130      2140     

             2100      2110      2120      2130      2140      2150
pF1KE3 FLSLKHTPMGKKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSESSVTLSP
       . :::   .::: :.::.:.     :   .::::: : .::::: . :  : .::  :::
CCDS43 LGSLKPGVQGKKVRKPSSKG-----LACGSKEAKDLK-ARRKKSQDGKGCLLDSSGMLSP
        2150      2160           2170       2180      2190         

             2160      2170      2180       2190      2200         
pF1KE3 VDSLESPHTYVSDTTSSPMITSPGILQASPN-PMLATAAPPAPVHAQHALSFSNLHEMQP
       :::::::: :.::..: :.. ::  .: ::. :.    . :    .   :. .   ::  
CCDS43 VDSLESPHGYLSDVASPPLLPSP--FQQSPSVPLNHLPGMPDTHLGIGHLNVAAKPEMAA
    2200      2210      2220        2230      2240      2250       

    2210      2220      2230           2240          2250      2260
pF1KE3 LAHGASTVLPSVSQLLSHHHIVSP-----GSGSAGSLSRL----HPVPVPADWMNRMEVN
       :. :.  .. .    :::  ..:      ::.:.:.:.        .    .:..:.. .
CCDS43 LGGGGRLAFETGPPRLSHLPVASGTSTVLGSSSGGALNFTVGGSTSLNGQCEWLSRLQSG
      2260      2270      2280      2290      2300      2310       

               2270                   2280                   2290  
pF1KE3 --ETQYNEMFGMVL-------APA--EGT----HPGIA-------------PQSRPPEGK
          .::: . : :        ::.  .:     : ..:             :..:     
CCDS43 MVPNQYNPLRGSVAPGPLSTQAPSLQHGMVGPLHSSLAASALSQMMSYQGLPSTRLATQP
      2320      2330      2340      2350      2360      2370       

           2300         2310           2320      2330              
pF1KE3 HITTPREPLPPIVTFQ---LIP-----KGSIAQPAGAPQPQSTCPPAVAGPL--------
       :..  ..  :  . .:   : :     . :.  :   :::.     :..: :        
CCDS43 HLVQTQQVQPQNLQMQQQNLQPANIQQQQSLQPPPPPPQPHLGVSSAASGHLGRSFLSGE
      2380      2390      2400      2410      2420      2430       

       2340      2350      2360      2370      2380      2390      
pF1KE3 PTMYQIPEMARLPSVAFPTAMMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYPTPPSQHSYASSN
       :.. ..  ..  ::     ...::..  .  : ::.    :...... ::::::::.:  
CCDS43 PSQADVQPLG--PSSLAVHTILPQESPALP-TSLPSSLVPPVTAAQFLTPPSQHSYSSP-
      2440        2450      2460       2470      2480      2490    

       2400      2410      2420      2430      2440      2450      
pF1KE3 AAERTPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVTTSPTPGGAGGGQRGPG
        .. :::                                                     
CCDS43 -VDNTPSHQLQVPEHPFLTPSPESPDQWSSSSPHSNVSDWSEGVSSPPTSMQSQIARIPE
           2500      2510      2520      2530      2540      2550  

>>CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19             (2321 aa)
 initn: 5367 init1: 2004 opt: 5232  Z-score: 2274.5  bits: 434.9 E(32554): 2.3e-120
Smith-Waterman score: 8769; 50.6% identity (70.7% similar) in 2436 aa overlap (67-2450:42-2278)

         40        50        60         70        80        90     
pF1KE3 NEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGEYCQHRDPC-EKNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASG
                                     :: . . : ::: :. :    .:.: :  :
CCDS12 RRPMSPPPPPPPVRALPLLLLLAGPGAAAPPCLDGSPCANGGRCT-QLPSREAACLCPPG
              20        30        40        50         60        70

         100       110       120          130       140       150  
pF1KE3 FTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCH---MLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHP
       ..:: ::     ::  : :: . :.:.   . .   . : :  :: : .:.  : ::: :
CCDS12 WVGERCQLED--PCH-SGPCAGRGVCQSSVVAGTARFSCRCPRGFRGPDCSLPDPCLSSP
               80           90       100       110       120       

            160        170       180       190       200       210 
pF1KE3 CANGSTCTTVAN-QFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQ
       ::.:. :..  . .: :.:  :. :..:..::.:: .   :.::::::: :::..:::: 
CCDS12 CAHGARCSVGPDGRFLCSCPPGYQGRSCRSDVDECRVGEPCRHGGTCLNTPGSFRCQCPA
       130       140       150       160       170       180       

             220       230       240       250       260       270 
pF1KE3 GFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQN
       :.::  :..  :::::::: :::::::.::.:..: :::::::..:: :.::::.::: :
CCDS12 GYTGPLCENPAVPCAPSPCRNGGTCRQSGDLTYDCACLPGFEGQNCEVNVDDCPGHRCLN
       190       200       210       220       230       240       

             280       290       300       310       320       330 
pF1KE3 GGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWS
       ::.::::::::::.:::.::::::::::::: ::::::.::::: :  ::..:::::::.
CCDS12 GGTCVDGVNTYNCQCPPEWTGQFCTEDVDECQLQPNACHNGGTCFNTLGGHSCVCVNGWT
       250       260       270       280       290       300       

             340       350       360       370       380       390 
pF1KE3 GDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCD
       :..::.:::::: : :  :.:: :::::: : :: ::.::::::::::.:::::. :.::
CCDS12 GESCSQNIDDCATAVCFHGATCHDRVASFYCACPMGKTGLLCHLDDACVSNPCHEDAICD
       310       320       330       340       350       360       

             400       410       420       430       440       450 
pF1KE3 TNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGP
       :::.::. ::::: :. :. : .:::::... .::::: :.::::.:.: :.: .::.::
CCDS12 TNPVNGRAICTCPPGFTGGACDQDVDECSIG-ANPCEHLGRCVNTQGSFLCQCGRGYTGP
       370       380       390        400       410       420      

             460       470       480       490       500       510 
pF1KE3 RCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVD
       ::: :.::: : ::.:.:::::.:: :::.:: :: :..::..:.::::.::::.: : :
CCDS12 RCETDVNECLSGPCRNQATCLDRIGQFTCICMAGFTGTYCEVDIDECQSSPCVNGGVCKD
        430       440       450       460       470       480      

             520       530       540       550       560       570 
pF1KE3 KVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENI
       .:: :.: :: ::.: .::.:.:.:.:::: :::::.:.:.::::.:: :: :.::..:.
CCDS12 RVNGFSCTCPSGFSGSTCQLDVDECASTPCRNGAKCVDQPDGYECRCAEGFEGTLCDRNV
        490       500       510       520       530       540      

             580       590       600       610       620       630 
pF1KE3 DNCDPDPCHHGQCQDGIDSYTCICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQC
       :.:.:::::::.: ::: :..: : ::: :. : .:.::: :.:: . :.:.:::. : :
CCDS12 DDCSPDPCHHGRCVDGIASFSCACAPGYTGTRCESQVDECRSQPCRHGGKCLDLVDKYLC
        550       560       570       580       590       600      

             640       650       660       670       680       690 
pF1KE3 NCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHGICMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPC
        :  ::.:::::.:.::::::::  :.: ::::::.:::.:::::  ::..:.::::.::
CCDS12 RCPSGTTGVNCEVNIDDCASNPCTFGVCRDGINRYDCVCQPGFTGPLCNVEINECASSPC
        610       620       630       640       650       660      

             700       710       720       730       740       750 
pF1KE3 RKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVG
        .:..:..: :::::.:: :   : :    . :  .:: :: :  . .:..:.:. :: :
CCDS12 GEGGSCVDGENGFRCLCPPGSLPPLCLPPSHPCAHEPCSHGICYDAPGGFRCVCEPGWSG
        670       680       690       700       710       720      

               760       770       780       790       800         
pF1KE3 INCE--VDKNECLSNPCQNGGTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGT
         :   . .. : :.::. ::::..   :..:::  : .: .:..               
CCDS12 PRCSQSLARDACESQPCRAGGTCSSDGMGFHCTCPPGVQGRQCEL---------------
        730       740       750       760       770                

     810       820       830       840       850       860         
pF1KE3 CSDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQR
                               :.::.:::::... :. .:. .  .: :  :::: :
CCDS12 ------------------------LSPCTPNPCEHGGRCESAPG-QLPVCSCPQGWQGPR
                                     780       790        800      

     870       880        890       900       910       920        
pF1KE3 CTIDIDECISK-PCMNHGLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMD
       :  :.::: .  ::  ::.: :  ::. : :  :..: .:..::.::  ::: :::::.:
CCDS12 CQQDVDECAGPAPCGPHGICTNLAGSFSCTCHGGYTGPSCDQDINDCDPNPCLNGGSCQD
        810       820       830       840       850       860      

      930       940       950       960       970       980        
pF1KE3 GVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNI
       ::..::: :::::.: .:  :..::::.:: . :::.:.: :.:: :  :. : :::...
CCDS12 GVGSFSCSCLPGFAGPRCARDVDECLSNPC-GPGTCTDHVASFTCTCPPGYGGFHCEQDL
        870       880       890        900       910       920     

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pF1KE3 NECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGFTGSFCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYR
        .:. ::::::::::::.:::::::  :.::. : :: . : :.:::. :.:  .   .:
CCDS12 PDCSPSSCFNGGTCVDGVNSFSCLCRPGYTGAHCQHEADPCLSRPCLHGGVCSAAHPGFR
         930       940       950       960       970       980     

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pF1KE3 CSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIA
       :.:  ..:: .:::::. :::.::.: : :::  :   :::: ::.:  ::. .. :  :
CCDS12 CTCLESFTGPQCQTLVDWCSRQPCQNGGRCVQTGA--YCLCPPGWSGRLCDIRSLPCREA
         990      1000      1010      1020        1030      1040   

     1110      1120      1130      1140      1150      1160        
pF1KE3 ASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLGYTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFI
       :.. :: .:.::: .: :..  ..::: :: : :::.::...: : ..:::::.::  ..
CCDS12 AAQIGVRLEQLCQAGGQCVDEDSSHYCVCPEGRTGSHCEQEVDPCLAQPCQHGGTCRGYM
          1050      1060      1070      1080      1090      1100   

     1170      1180      1190      1200      1210      1220        
pF1KE3 GGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGGTCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDD
       ::: :::.:::.: ::: .:::: .::::.::.::::: .. ::::::: :.::: : ::
CCDS12 GGYMCECLPGYNGDNCEDDVDECASQPCQHGGSCIDLVARYLCSCPPGTLGVLCEINEDD
          1110      1120      1130      1140      1150      1160   

     1230            1240      1250      1260      1270      1280  
pF1KE3 CA------RGPHCLNGGQCMDRIGGYSCRCLPGFAGERCEGDINECLSNPCSSEGSLDCI
       :.       ::.::..: :.: .::. : : ::..: :::.::::: :. : .  . ::.
CCDS12 CGPGPPLDSGPRCLHNGTCVDLVGGFRCTCPPGYTGLRCEADINECRSGACHAAHTRDCL
          1170      1180      1190      1200      1210      1220   

            1290      1300      1310      1320         1330        
pF1KE3 QLTND-YLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCAVASNMPDG---FICRCPPGFS
       :  .  . :.:...:.: .:.: .. : ..:: .:: :   :  : :   : :.:   : 
CCDS12 QDPGGGFRCLCHAGFSGPRCQTVLSPCESQPCQHGGQCR-PSPGPGGGLTFTCHCAQPFW
          1230      1240      1250      1260       1270      1280  

     1340         1350      1360         1370                 1380 
pF1KE3 GARCQS---SCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCFCP---SPRDCES-----------GCASS
       : ::.    :: ...:  :  : .:  :::: ::   :  .:.:           .::..
CCDS12 GPRCERVARSCRELQCPVGVPCQQTPRGPRCACPPGLSGPSCRSFPGSPPGASNASCAAA
           1290      1300      1310      1320      1330      1340  

            1390      1400      1410        1420      1430         
pF1KE3 PCQHGGSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCELYTAPP--STPPATCLSQYCADKARDGVC
       :: :::::.:    :.. : ::  ..: :::  .: :  :  :  :    :  :  :  :
CCDS12 PCLHGGSCRPAPLAPFFRCACAQGWTGPRCEAPAAAPEVSEEP-RCPRAACQAKRGDQRC
           1350      1360      1370      1380       1390      1400 

    1440      1450      1460      1470       1480      1490        
pF1KE3 DEACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSPLPCWDYINN-QCDELCNTVECLFDNFECQ-
       :. ::: .: ::::::::.. .:: .: . : ::  .:: .::  :..  ::.:::.:. 
CCDS12 DRECNSPGCGWDGGDCSLSVGDPWRQCEA-LQCWRLFNNSRCDPACSSPACLYDNFDCHA
            1410      1420      1430       1440      1450      1460

       1500        1510      1520      1530      1540      1550    
pF1KE3 -GNSKTCK--YDKYCADHFKDNHCDQGCNSEECGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMP
        :  .::.  :.::::::: :..::::::.:::::::::::.. :  ::.:.::..::.:
CCDS12 GGRERTCNPVYEKYCADHFADGRCDQGCNTEECGWDGLDCASEVPALLARGVLVLTVLLP
             1470      1480      1490      1500      1510      1520

         1560      1570      1580      1590      1600      1610    
pF1KE3 PEQLLQDARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGELMVYPYYGEKSAAMKKQRMTRRSLPGEQ
       ::.::... .::. :...:.:.::.. :..:. ::.::.  . .  .. :  :.  :   
CCDS12 PEELLRSSADFLQRLSAILRTSLRFRLDAHGQAMVFPYH--RPSPGSEPRARRELAP---
             1530      1540      1550        1560      1570        

         1620      1630        1640      1650        1660      1670
pF1KE3 EQEVAGSKVFLEIDNRQCVQ--DSDHCFKNTDAAAALL-ASHAIQGT-LSYPLVSVVSES
         :: :: :.:::::: :.:  ..:::: ....::  : :  :..   . ::: .: .: 
CCDS12 --EVIGSVVMLEIDNRLCLQSPENDHCFPDAQSAADYLGALSAVERLDFPYPLRDVRGEP
          1580      1590      1600      1610      1620      1630   

               1680      1690      1700      1710      1720        
pF1KE3 LTPERTQ--LLYLLAVAVVIILFIILLGVIMAKRKRKHGSLWLPEGFTLRRD-ASNHK-R
       : : . .  :: ::....:..: :..:::..:.:::.:..::.::::.:..: ::.:: :
CCDS12 LEPPEPSVPLLPLLVAGAVLLLVILVLGVMVARRKREHSTLWFPEGFSLHKDVASGHKGR
          1640      1650      1660      1670      1680      1690   

       1730      1740      1750      1760      1770      1780      
pF1KE3 REPVGQDAVGLKNLSVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDR
       ::::::::.:.::..   :   :.:  ... :.: : :. :..:.:. .. .::   .: 
CCDS12 REPVGQDALGMKNMAKGES---LMGEVATD-WMDTECPEAKRLKVEEPGMGAEE--AVDC
          1700      1710         1720       1730      1740         

       1790      1800      1810      1820      1830      1840      
pF1KE3 RPWTQQHLEAADIRRTPSLALTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSD-LS
       : :::.:: ::::: .:..::::::.. ..: .::::::::: :::::::. ::. . . 
CCDS12 RQWTQHHLVAADIRVAPAMALTPPQGDADADGMDVNVRGPDGFTPLMLASFCGGALEPMP
      1750      1760      1770      1780      1790      1800       

        1850      1860      1870      1880      1890      1900     
pF1KE3 DEDEDAEDSSANIITDLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANA
        :...:.:.::.::.::. :::.: :.:::::: ::::::::.::::::::::::::.::
CCDS12 TEEDEADDTSASIISDLICQGAQLGARTDRTGETALHLAARYARADAAKRLLDAGADTNA
      1810      1820      1830      1840      1850      1860       

        1910      1920      1930      1940      1950      1960     
pF1KE3 QDNMGRCPLHAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELIN
       ::. :: :::.::.:::::::::::::: ::::::: ::.: ::::::::::::: ::: 
CCDS12 QDHSGRTPLHTAVTADAQGVFQILIRNRSTDLDARMADGSTALILAARLAVEGMVEELIA
      1870      1880      1890      1900      1910      1920       

        1970      1980      1990      2000      2010      2020     
pF1KE3 CQADVNAVDDHGKSALHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEA
        .:::::::. :::::::::::::::::: :::::::.::::.:::::::::::::::::
CCDS12 SHADVNAVDELGKSALHWAAAVNNVEATLALLKNGANKDMQDSKEETPLFLAAREGSYEA
      1930      1940      1950      1960      1970      1980       

        2030      2040      2050      2060      2070      2080     
pF1KE3 AKILLDHFANRDITDHMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTSALSPVIC
       ::.::::::::.::::.::::::::..:.:.:::::::. .   ::::     .:.:..:
CCDS12 AKLLLDHFANREITDHLDRLPRDVAQERLHQDIVRLLDQPSGPRSPPGP---HGLGPLLC
      1990      2000      2010      2020      2030         2040    

        2090      2100       2110      2120      2130      2140    
pF1KE3 GPNRSFLSLKHTPMG-KKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSES
        :.  . .:: .  : :::::: .:. .  . :         .:  .: .:.    :..:
CCDS12 PPGAFLPGLKAAQSGSKKSRRPPGKAGLGPQGP---------RGRGKKLTLACPGPLADS
         2050      2060      2070               2080      2090     

         2150      2160      2170      2180      2190      2200    
pF1KE3 SVTLSPVDSLESPHTYVSDTTSSPMITSPGILQASPNPMLATAAPPAPVHAQHALSFSNL
       ::::::::::.::. .     ..:  .::: .     :.    .: : . :  :.:...:
CCDS12 SVTLSPVDSLDSPRPF-----GGPP-ASPGGF-----PL---EGPYAAATAT-AVSLAQL
        2100      2110            2120              2130       2140

         2210      2220      2230      2240      2250      2260    
pF1KE3 HEMQPLAHGASTVLPSVSQLLSHHHIVSPGSGSAGSLSRLHPVPVPADWMNRMEVNETQY
               :.    :. . :  .     : .: . ::. :.:: :: ::  :.       
CCDS12 --------GG----PGRAGLGRQ-----PPGGCVLSLGLLNPVAVPLDWA-RL-------
                         2150           2160      2170             

         2270      2280      2290      2300      2310      2320    
pF1KE3 NEMFGMVLAPAEGTHPGIAPQSRPPEGKHITTPREPLPPIVTFQLIPKGSIAQPAGAPQP
                              ::          : ::  .: :.:         :: :
CCDS12 -----------------------PP----------PAPPGPSF-LLPL--------APGP
                                         2180               2190   

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pF1KE3 QSTCPPAVAGPLPTMYQIPEMARLPSVAFPTAMMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYP
       :   :   . :.  . . :     : .: :        :.           .::. : . 
CCDS12 QLLNP---GTPVSPQERPP-----PYLAVPG------HGE----------EYPAA-GAHS
             2200           2210                      2220         

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pF1KE3 TPPSQHSYASSNAAERTPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVTTSPT
       .::. .         :.::       ::::::::::::..:.: :: : ::::.  ..:.
CCDS12 SPPKARFL-------RVPS-------EHPYLTPSPESPEHWASPSPPSLSDWSE--STPS
     2230             2240             2250      2260        2270  

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pF1KE3 PGGAGGGQRGPGTHMSEPPHNNMQVYA                      
       :. : :                                           
CCDS12 PATATGAMATTTGALPAQPLPLSVPSSLAQAQTQLGPQPEVTPKRQVLA
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            :.::  :: : : :.. ..  .: : .  :::.: : :..   : : :.:  :::
CCDS34   MQPPSLLLLLLLLLLLCVSVVRPRGLLCGSFPEPCANGGTCLSLSLGQGTCQCAPGFL
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pF1KE3 GEYCQHRDPCEKNR-CQNGGTCVA--QAMLGKAT----------CRCASGFTGEDCQYST
       :: ::  :::.. . :::::.: :   : ::  .          : :  ::::: :: . 
CCDS34 GETCQFPDPCQNAQLCQNGGSCQALLPAPLGLPSSPSPLTPSFLCTCLPGFTGERCQAKL
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pF1KE3 SHPCFVSRPCLNGGTCHMLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQ
         ::  :  : . : ::. .    .:.:. :.::..::  : : ..::.::..: ..  :
CCDS34 EDPCPPSF-CSKRGRCHIQASGRPQCSCMPGWTGEQCQLRDFCSANPCVNGGVCLATYPQ
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pF1KE3 FSCKCLTGFTGQKCETDVNEC-DIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVP
       ..:.:  :: :. :: ::::: . :: : .: .: :  ::.:: :: :  :  :.    :
CCDS34 IQCHCPPGFEGHACERDVNECFQDPGPCPKGTSCHNTLGSFQCLCPVGQEGPRCELRAGP
       180       190       200       210       220       230       

          230         240        250       260       270       280 
pF1KE3 CAPSPCVNGGTCR--QTGDFTFE-CNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNT
       : :  : :::::.     : ::. : : ::: :  :: : :.: .:.:::::.: ::..:
CCDS34 CPPRGCSNGGTCQLMPEKDSTFHLCLCPPGFIGPDCEVNPDNCVSHQCQNGGTCQDGLDT
       240       250       260       270       280       290       

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pF1KE3 YNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQ-PNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWSGDDCSENID
       :.: ::  :::  :.::::::  : :  :.::::: :  :.. ::::.::.: .: ::.:
CCDS34 YTCLCPETWTGWDCSEDVDECETQGPPHCRNGGTCQNSAGSFHCVCVSGWGGTSCEENLD
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pF1KE3 DCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYI
       ::  :.:.:::::::::.::::.:: :..::::::.: :.:.:::  : :.::::.:. .
CCDS34 DCIAATCAPGSTCIDRVGSFSCLCPPGRTGLLCHLEDMCLSQPCHGDAQCSTNPLTGSTL
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pF1KE3 CTCPQGYKGADCTEDVDECAMANS--NPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDIN
       : :  ::.:  : .:.::: ::..  .::::.:.:.:: :.:.: :  ::.: ::: : :
CCDS34 CLCQPGYSGPTCHQDLDECLMAQQGPSPCEHGGSCLNTPGSFNCLCPPGYTGSRCEADHN
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pF1KE3 ECHSDPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQC
       :: :.::.  .:::: .. : ::: ::..:  ::.: ::: : ::.:...: : .: :::
CCDS34 ECLSQPCHPGSTCLDLLATFHCLCPPGLEGQLCEVETNECASAPCLNHADCHDLLNGFQC
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pF1KE3 LCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDP
       .: :::.:  :. :::.: :.:: ::..: :.:....:.:                    
CCDS34 ICLPGFSGTRCEEDIDECRSSPCANGGQCQDQPGAFHCKCL-------------------
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pF1KE3 CHHGQCQDGIDSYTCICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTS
                         ::. :  :. ..::: :.::   . :.::         ::. 
CCDS34 ------------------PGFEGPRCQTEVDECLSDPCPVGASCLDL---------PGA-
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                                  . :.:  ::::: :.. .  :: : :.    : 
CCDS34 ---------------------------FFCLCPSGFTGQLCEVPL--CAPNLCQPKQICK
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       .  .   :.::.:   :.:    ..:    : ::.:  .    .:.::.::.: .::.. 
CCDS34 DQKDKANCLCPDGS--PGCAPPEDNCT---CHHGHCQRS----SCVCDVGWTGPECEAEL
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pF1KE3 NECLSNPCQNGGTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCSDDISGYT
       . :.: :: .::::    .:: :::  :. : .:. ..  : :.:::: :.:        
CCDS34 GGCISAPCAHGGTCYPQPSGYNCTCPTGYTGPTCSEEMTACHSGPCLNGGSC--------
            700       710       720       730       740            

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pF1KE3 CHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECI
                            ::         ::                          
CCDS34 ---------------------NP---------SP--------------------------
                                                                   

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pF1KE3 SKPCMNHGLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMDGVNTFSCLCL
                     :.:.: :::.                                    
CCDS34 --------------GGYYCTCPPSH-----------------------------------
                    750                                            

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pF1KE3 PGFTGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFN
          :: .:::. . :.: ::                                      ::
CCDS34 ---TGPQCQTSTDYCVSAPC--------------------------------------FN
        760       770                                              

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pF1KE3 GGTCVDGINSFSCLCPVGFTGSFCLHEINE-CSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTG
       :::::.  ..::::: .:: :  :  ..   :.. :: :..:: :.    :: :: ::::
CCDS34 GGTCVNRPGTFSCLCAMGFQGPRCEGKLRPSCADSPCRNRATCQDSPQGPRCLCPTGYTG
      780       790       800       810       820       830        

      1060      1070      1080      1090      1100      1110       
pF1KE3 KNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVE
        .::::..::...::  .. :.:     .::: .::.:  :..:  ::. ::  .:. : 
CCDS34 GSCQTLMDLCAQKPCPRNSHCLQTGPSFHCLCLQGWTGPLCNLPLSSCQKAALSQGIDVS
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      1120      1130      1140      1150      1160      1170       
pF1KE3 HLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLGYTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFIGGYRCECVP
        ::...:.:...: ...:.:: :. :: :..... : : :::.::::    .:: :.:.:
CCDS34 SLCHNGGLCVDSGPSYFCHCPPGFQGSLCQDHVNPCESRPCQNGATCMAQPSGYLCQCAP
      900       910       920       930       940       950        

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pF1KE3 GYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGGTCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDCARGPHCLN
       ::.: ::  :.: ::.:::.: :::           :                       
CCDS34 GYDGQNCSKELDACQSQPCHNHGTCT----------P-----------------------
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pF1KE3 GGQCMDRIGGYSCRCLPGFAGERCEGDINECLSNPCSSEGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFT
             . ::. : : :::.: :::::..:::..::   :.  : .:.: . : :  . :
CCDS34 ------KPGGFHCACPPGFVGLRCEGDVDECLDQPCHPTGTAACHSLANAFYCQCLPGHT
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      1300      1310      1320      1330      1340         1350    
pF1KE3 GRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCAVASNMPDGFICRCPPGFSGARCQS---SCGQVKCRKG
       :. ::. .: : ..::..:::: .... : ::::.:: :: :  :.    :::  .:..:
CCDS34 GQWCEVEIDPCHSQPCFHGGTCEATAGSPLGFICHCPKGFEGPTCSHRAPSCGFHHCHHG
    1040      1050      1060      1070      1080      1090         

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pF1KE3 EQCVHTASG---PRCFCPSPR---DCES-----GCAS-SPCQHGGSCHPQRQ--PPYYSC
         :. . .    ::: : :     :: .     ::.  ::: ..:::        : . :
CCDS34 GLCLPSPKPGFPPRCACLSGYGGPDCLTPPAPKGCGPPSPCLYNGSCSETTGLGGPGFRC
    1100      1110      1120      1130      1140      1150         

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pF1KE3 QCAPPFSGSRCELYTAPPSTPPATCLSQYCADKARDGVCDEACNSHACQWDGGDCSLTME
       .:     : ::.        : :    . :  .. ::.:: .:.. . .:::::::: . 
CCDS34 SCPHSSPGPRCQ-------KPGA----KGCEGRSGDGACDAGCSGPGGNWDGGDCSLGVP
    1160      1170                 1180      1190      1200        

             1470       1480      1490      1500        1510       
pF1KE3 NPWANCSSPLPCWD-YINNQCDELCNTVECLFDNFECQGNSKTCK--YDKYCADHFKDNH
       .:: .: :   ::  . ..::   :.. :::::...:. .  .:   ::.:: :::...:
CCDS34 DPWKGCPSHSRCWLLFRDGQCHPQCDSEECLFDGYDCE-TPPACTPAYDQYCHDHFHNGH
     1210      1220      1230      1240       1250      1260       

      1520      1530      1540      1550      1560      1570       
pF1KE3 CDQGCNSEECGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQDARSFLRALGTLLHTNL
       :..:::. :::::: ::  .. .     .:...:.. :  : :.  .. :.:.  :...:
CCDS34 CEKGCNTAECGWDGGDCRPEDGDPEWGPSLALLVVLSPPALDQQLFALARVLSLTLRVGL
      1270      1280      1290      1300      1310      1320       

      1580      1590          1600      1610            1620       
pF1KE3 RIKRDSQGELMVYPYYG----EKSAAMKKQRMTRRSLPGEQE--QEV----AGSKVFLEI
        ...: .:. ::::: :    :: .. .   . .:. :  :   .:.    ::  : . .
CCDS34 WVRKDRDGRDMVYPYPGARAEEKLGGTRDPTYQERAAPQTQPLGKETDSLSAGFVVVMGV
      1330      1340      1350      1360      1370      1380       

      1630        1640          1650      1660      1670       1680
pF1KE3 DNRQCVQD--SDHCFKNTDAA----AALLASHAIQGTLSYPLVSVVSESLT-PERTQLLY
       :  .:  :  ...:  .        ::. :  :..  :  ::..:  .. : :  .:: .
CCDS34 DLSRCGPDHPASRCPWDPGLLLRFLAAMAAVGALEPLLPGPLLAVHPHAGTAPPANQLPW
      1390      1400      1410      1420      1430      1440       

             1690      1700           1710       1720       1730   
pF1KE3 LLAVAVVIILFIILLGVIMA-----KRKRKHGSLWLPEGFTLR-RDASN-HKRREPVGQD
        .  . :  .... ::....     .:.:.::.:::: ::: : :  :  :.:: :.:.:
CCDS34 PVLCSPVAGVILLALGALLVLQLIRRRRREHGALWLPPGFTRRPRTQSAPHRRRPPLGED
      1450      1460      1470      1480      1490      1500       

          1740      1750      1760      1770      1780      1790   
pF1KE3 AVGLKNLSVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDRRPWTQQH
       ..::: :. . .:..  :.      :   ::.    ..:. .   :   :   . :. . 
CCDS34 SIGLKALKPK-AEVDEDGV------VMCSGPE----EGEEVGQAEETGPPSTCQLWSLSG
      1510       1520            1530          1540      1550      

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pF1KE3 LEAADIRRTPSLA-LTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSDLSDEDEDAE
         .:     :. : ::::: :.:... :...::::: :::: :   :  .  :   . : 
CCDS34 GCGA----LPQAAMLTPPQ-ESEMEAPDLDTRGPDGVTPLMSAVCCGEVQ--SGTFQGAW
       1560          1570       1580      1590      1600           

           1860      1870      1880      1890      1900      1910  
pF1KE3 DSSANIITDLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRC
        .  .    :.  ::  ::.:  :::  ::::::.::  ::.:::.:::. :  :  :: 
CCDS34 LGCPEPWEPLLDGGACPQAHTVGTGETPLHLAARFSRPTAARRLLEAGANPNQPDRAGRT
    1610      1620      1630      1640      1650      1660         

           1920      1930      1940      1950      1960      1970  
pF1KE3 PLHAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNA
       ::::::::::. : :.:.:.: : .::: .::::::.:::::::: .: :::  ::::.:
CCDS34 PLHAAVAADAREVCQLLLRSRQTAVDARTEDGTTPLMLAARLAVEDLVEELIAAQADVGA
    1670      1680      1690      1700      1710      1720         

           1980      1990      2000      2010      2020      2030  
pF1KE3 VDDHGKSALHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDH
        :  ::.::::::::::..:.  ::. ::..: :::.:.::::::::::. :.:..::  
CCDS34 RDKWGKTALHWAAAVNNARAARSLLQAGADKDAQDNREQTPLFLAAREGAVEVAQLLLGL
    1730      1740      1750      1760      1770      1780         

           2040      2050      2060      2070      2080      2090  
pF1KE3 FANRDITDHMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTSALSPVICGPNRSFL
        : :.. :.    : :::..: : :.. ::.                             
CCDS34 GAARELRDQAGLAPADVAHQRNHWDLLTLLEGAGPPEARHKATPGREAGPFPRARTVSVS
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pF1KE3 SLKHTPMGKKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSESSVTLSPVD
                                                                   
CCDS34 VPPHGGGALPRCRTLSAGAGPRGGGACLQARTWSVDLAARGGGAYSHCRSLSGVGAGGGP
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CCDS47 SCESFPLRNNATCKKCEKDYPCSCISGFTEKNCEKAIDHCKLLSINCLNEEWCFNIIGRF
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pF1KE3 QCQCPQGFTGQYC---DSLYVPCAPSPCVNG----GTCRQTGDFTFECNCLPGF---EGS
       .  :  : : . :    ..:.      :  :    : :.. :   ::     ::   :: 
CCDS47 KYVCIPGCTKNPCWFLKNVYL-IHQHLCYCGVTFHGICQDKGPAQFEYVWQLGFAGSEGE
            440       450        460       470       480       490 

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pF1KE3 TCERNIDD--CPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGG
        :.  ::        : . .. :.  .  :  :   :  .  :...         : :: 
CCDS47 KCQGVIDAYFFLAANCTEDATYVNDPEDNNSSC---WFPHEGTKEI---------CANGC
             500       510       520          530                  

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pF1KE3 TCANRNGG--YGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGL
       .: ... .  :  .:   :.:.   ::  :     :   ..: :..    : :  .  : 
CCDS47 SCLSEEDSQEYRYLCFLRWAGNMYLENTTDDQENECQHEAVCKDEINRPRCSCSLSYIGR
     540       550       560       570       580       590         

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pF1KE3 LCHLD-DACISNPCHK-GALCDTNPLNGQYICTCP--QGYKGADCTEDVDECAMANSNPC
       :: .. : :..:   .  .::    :  .. :.:   : :.   :  :...:   .:  :
CCDS47 LCVVNVDYCLGNHSISVHGLC----LALSHNCNCSGLQRYERNICEIDTEDC---KSASC
     600       610       620           630       640          650  

       430       440       450       460       470                 
pF1KE3 EHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIG-----------
       ...   ..  : :  .:. :. : .::.::.:: : ::.: :::.:. :           
CCDS47 KNGTTSTHLRGYFFRKCVPGFKGTQCEIDIDECASHPCKNGATCIDQPGNYFCQCVPPFK
            660       670       680       690       700       710  

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pF1KE3 ---GFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDI
          ::.::: ::. :..:: .:..:  : : .:. : :    .::.:   . :  :. . 
CCDS47 VVDGFSCLCNPGYVGIRCEQDIDDCILNACEHNSTCKDLHLSYQCVCLSDWEGNFCEQES
            720       730       740       750       760       770  

           540       550       560       570       580          590
pF1KE3 DDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQ-CQDGI--DS
       ..:. .:: :.. : :  ..:.:.:..:.::  : :.:..:: ::: .:  :...    .
CCDS47 NECKMNPCKNNSTCTDLYKSYRCECTSGWTGQNCSEEINECDSDPCMNGGLCHESTIPGQ
            780       790       800       810       820       830  

              600       610         620       630        640       
pF1KE3 YTCICNPGYMGAICSDQIDEC--YSSPCLNDGRCIDLVNGYQ-CNCQPGTSGVNCEINFD
       ..:.: : : : .: .. . :    .:: :.. :. ::.. : : :.    : ::::.  
CCDS47 FVCLCPPLYTGQFCHQRYNLCDLLHNPCRNNSTCLALVDANQHCICREEFEGKNCEIDVK
            840       850       860       870       880       890  

       650        660       670       680       690       700      
pF1KE3 DCASNPCI-HGICMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRC
       ::    :  .: : : .: . :.: :::.:. :.:.:.::.:.::....::.. .: : :
CCDS47 DCLFLSCQDYGDCEDMVNNFRCICRPGFSGSLCEIEINECSSEPCKNNGTCVDLTNRFFC
            900       910       920       930       940       950  

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pF1KE3 ICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPCI-HGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNP
        :    : : :  .::.:  .::. . ::.   .::.:::  :..:::::.. .::::.:
CCDS47 NCEPEYHGPFCELDVNKCKISPCLDEENCVYRTDGYNCLCAPGYTGINCEINLDECLSEP
            960       970       980       990      1000      1010  

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pF1KE3 CQNGGTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPY
       : . :.: . .: : : ::.:: : .:..: ..: :::::. : :.. :. :        
CCDS47 CLHDGVCIDGINHYTCDCKSGFFGTHCETNANDCLSNPCLH-GRCTELINEY--------
           1020      1030      1040      1050       1060           

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pF1KE3 TGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNH
                 :::   :.                  : : . : : : :..: : ::::.
CCDS47 ----------PCS---CD------------------ADGTSTQ-CKIKINDCTSIPCMNE
                                         1070       1080      1090 

         890       900       910             920       930         
pF1KE3 GLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDCLANP------CQNGGSCMDGV-NTFSCLCL
       :.:...  .. : :: :..:  ::..::.: :.:      : ::: :.::  .::.: ::
CCDS47 GFCQKSAHGFTCICPRGYTGAYCEKSIDNC-AEPELNSVICLNGGICVDGPGHTFDCRCL
            1100      1110      1120       1130      1140      1150

      940       950       960       970       980       990        
pF1KE3 PGFTGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFN
       :::.:. :. ..::: : :: .:. : :..:.:.:::: :..: ::::.. ::  .:: .
CCDS47 PGFSGQFCEININECSSSPCLHGADCEDHINGYVCKCQPGWSGHHCENEL-ECIPNSCVH
             1160      1170      1180      1190      1200          

     1000      1010          1020      1030      1040      1050    
pF1KE3 GGTCVDGINSFSCLCPVGFT----GSFCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLG
          :...  . .:::  ::     : .:  :: . .   ::                   
CCDS47 E-LCMENEPGSTCLCTPGFMTCSIGLLCGDEIRRIT---CLTPIFQRTDPISTQTYTIPP
    1210       1220      1230      1240         1250      1260     

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pF1KE3 YTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGV
                                                                   
CCDS47 SETLVSSFPSIKATRIPAIMDTYPVDQGPKQTGIVKHDILPTTGLATLRISTPLESYLLQ
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>>CCDS78156.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6               (3165 aa)
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        150       160       170       180       190        200     
pF1KE3 ACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPG-HCQHGGTCLNLPGSY
                                     ..::  ...: . . .: .   :.:. : .
CCDS78 SCESFPLRNNATCKKCEKDYPCSCISGFTEKNCEKAIDHCKLLSINCLNEEWCFNIIGRF
            380       390       400       410       420       430  

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pF1KE3 QCQCPQGFTGQYC---DSLYVPCAPSPCVNG----GTCRQTGDFTFECNCLPGF---EGS
       .  :  : : . :    ..:.      :  :    : :.. :   ::     ::   :: 
CCDS78 KYVCIPGCTKNPCWFLKNVYL-IHQHLCYCGVTFHGICQDKGPAQFEYVWQLGFAGSEGE
            440       450        460       470       480       490 

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pF1KE3 TCERNIDD--CPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGG
        :.  ::        : . .. :.  .  :  :   :  .  :...         : :: 
CCDS78 KCQGVIDAYFFLAANCTEDATYVNDPEDNNSSC---WFPHEGTKEI---------CANGC
             500       510       520          530                  

           320         330       340       350       360       370 
pF1KE3 TCANRNGG--YGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGL
       .: ... .  :  .:   :.:.   ::  :     :   ..: :..    : :  .  : 
CCDS78 SCLSEEDSQEYRYLCFLRWAGNMYLENTTDDQENECQHEAVCKDEINRPRCSCSLSYIGR
     540       550       560       570       580       590         

              380        390       400         410       420       
pF1KE3 LCHLD-DACISNPCHK-GALCDTNPLNGQYICTCP--QGYKGADCTEDVDECAMANSNPC
       :: .. : :..:   .  .::    :  .. :.:   : :.   :  :...:   .:  :
CCDS78 LCVVNVDYCLGNHSISVHGLC----LALSHNCNCSGLQRYERNICEIDTEDC---KSASC
     600       610       620           630       640          650  

       430       440       450       460       470                 
pF1KE3 EHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIG-----------
       ...   ..  : :  .:. :. : .::.::.:: : ::.: :::.:. :           
CCDS78 KNGTTSTHLRGYFFRKCVPGFKGTQCEIDIDECASHPCKNGATCIDQPGNYFCQCVPPFK
            660       670       680       690       700       710  

           480       490       500       510       520       530   
pF1KE3 ---GFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDI
          ::.::: ::. :..:: .:..:  : : .:. : :    .::.:   . :  :. . 
CCDS78 VVDGFSCLCNPGYVGIRCEQDIDDCILNACEHNSTCKDLHLSYQCVCLSDWEGNFCEQES
            720       730       740       750       760       770  

           540       550       560       570       580          590
pF1KE3 DDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQ-CQDGI--DS
       ..:. .:: :.. : :  ..:.:.:..:.::  : :.:..:: ::: .:  :...    .
CCDS78 NECKMNPCKNNSTCTDLYKSYRCECTSGWTGQNCSEEINECDSDPCMNGGLCHESTIPGQ
            780       790       800       810       820       830  

              600       610         620       630        640       
pF1KE3 YTCICNPGYMGAICSDQIDEC--YSSPCLNDGRCIDLVNGYQ-CNCQPGTSGVNCEINFD
       ..:.: : : : .: .. . :    .:: :.. :. ::.. : : :.    : ::::.  
CCDS78 FVCLCPPLYTGQFCHQRYNLCDLLHNPCRNNSTCLALVDANQHCICREEFEGKNCEIDVK
            840       850       860       870       880       890  

       650        660       670       680       690       700      
pF1KE3 DCASNPCI-HGICMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRC
       ::    :  .: : : .: . :.: :::.:. :.:.:.::.:.::....::.. .: : :
CCDS78 DCLFLSCQDYGDCEDMVNNFRCICRPGFSGSLCEIEINECSSEPCKNNGTCVDLTNRFFC
            900       910       920       930       940       950  

        710       720       730        740       750       760     
pF1KE3 ICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPCI-HGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNP
        :    : : :  .::.:  .::. . ::.   .::.:::  :..:::::.. .::::.:
CCDS78 NCEPEYHGPFCELDVNKCKISPCLDEENCVYRTDGYNCLCAPGYTGINCEINLDECLSEP
            960       970       980       990      1000      1010  

         770       780       790       800       810       820     
pF1KE3 CQNGGTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPY
       : . :.: . .: : : ::.:: : .:..: ..: :::::. : :.. :. :        
CCDS78 CLHDGVCIDGINHYTCDCKSGFFGTHCETNANDCLSNPCLH-GRCTELINEY--------
           1020      1030      1040      1050       1060           

         830       840       850       860       870       880     
pF1KE3 TGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNH
                 :::   :.                  : : . : : : :..: : ::::.
CCDS78 ----------PCS---CD------------------ADGTSTQ-CKIKINDCTSIPCMNE
                                         1070       1080      1090 

         890       900       910             920       930         
pF1KE3 GLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDCLANP------CQNGGSCMDGV-NTFSCLCL
       :.:...  .. : :: :..:  ::..::.: :.:      : ::: :.::  .::.: ::
CCDS78 GFCQKSAHGFTCICPRGYTGAYCEKSIDNC-AEPELNSVICLNGGICVDGPGHTFDCRCL
            1100      1110      1120       1130      1140      1150

      940       950       960       970       980       990        
pF1KE3 PGFTGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFN
       :::.:. :. ..::: : :: .:. : :..:.:.:::: :..: ::::.. ::  .:: .
CCDS78 PGFSGQFCEININECSSSPCLHGADCEDHINGYVCKCQPGWSGHHCENEL-ECIPNSCVH
             1160      1170      1180      1190      1200          

     1000      1010          1020      1030      1040      1050    
pF1KE3 GGTCVDGINSFSCLCPVGFT----GSFCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLG
          :...  . .:::  ::     : .:  :: . .   ::                   
CCDS78 E-LCMENEPGSTCLCTPGFMTCSIGLLCGDEIRRIT---CLTPIFQRTDPISTQTYTIPP
    1210       1220      1230      1240         1250      1260     

         1060      1070      1080      1090      1100      1110    
pF1KE3 YTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGV
                                                                   
CCDS78 SETLVSSFPSIKATRIPAIMDTYPVDQGPKQTGIVKHDILPTTGLATLRISTPLESYLLQ
        1270      1280      1290      1300      1310      1320     

>>CCDS72880.1 NOTCH2NL gene_id:388677|Hs108|chr1          (236 aa)
 initn: 1641 init1: 1641 opt: 1641  Z-score: 738.5  bits: 147.4 E(32554): 8.1e-35
Smith-Waterman score: 1641; 99.5% identity (99.5% similar) in 211 aa overlap (40-250:1-211)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KE3 WALLALWLCCAAPAHALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGEYCQHRDPCE
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72                               MCVTYHNGTGYCKCPEGFLGEYCQHRDPCE
                                             10        20        30

      70        80        90       100       110       120         
pF1KE3 KNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCHMLSRDTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCHMLSRDTY
               40        50        60        70        80        90

     130       140       150       160       170       180         
pF1KE3 ECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIP
              100       110       120       130       140       150

     190       200       210       220       230       240         
pF1KE3 GHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECNCL
       :::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GHCQHGGTCLNLPGSYQCQCLQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECNCL
              160       170       180       190       200       210

     250       260       270       280       290       300         
pF1KE3 PGFEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNAC
       :                                                           
CCDS72 PETVRRGTELWERDREVWNGKEHDEN                                  
              220       230                                        

>>CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20                (1218 aa)
 initn: 2044 init1: 790 opt: 1395  Z-score: 624.4  bits: 128.6 E(32554): 1.8e-28
Smith-Waterman score: 2031; 34.0% identity (57.5% similar) in 892 aa overlap (117-989:173-960)

         90       100       110       120       130         140    
pF1KE3 KATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCHMLSRDTYECT-CQVGF-TGKECQW
                                     : :. :.  .    :     ::  .: :. 
CCDS13 NDTVQPDSIIEKASHSGMINPSRQWQTLKQNTGVAHFEYQIRVTCDDYYYGFGCNKFCRP
            150       160       170       180       190       200  

          150       160       170       180       190       200    
pF1KE3 TDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPGHCQHGGTCLNLPGS
        :  ..:      .:   .:.    :. :. : .:.  .  :   :   . :.: .:::.
CCDS13 RDDFFGH-----YACDQNGNK---TCMEGWMGPECNRAI--CR-QGCSPKHGSC-KLPGD
                 210          220       230          240        250

          210       220        230       240       250       260   
pF1KE3 YQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSP-CVNGGTCRQTGDFTFECNCLPGFEGSTCERNIDD
         :.:  :. : :::.    : : : ::.:  : .     ..: :  .. :. :..... 
CCDS13 --CRCQYGWQGLYCDK----CIPHPGCVHG-ICNEP----WQCLCETNWGGQLCDKDLNY
                260           270            280       290         

            270        280       290       300       310       320 
pF1KE3 CPNHR-CQNGGVCVD-GVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGGTCANRNGG
       : .:. : :::.: . : . :.: ::  ..:  :      :: .:  :.: :.: . . :
CCDS13 CGTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDP--CHNRGSCKETSLG
     300       310       320       330       340         350       

             330       340       350       360       370       380 
pF1KE3 YGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGLLCHLDDACIS
       . : :  ::.:  :: :::::.  .:. :.:: : : .:.:.::                
CCDS13 FECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCP----------------
       360       370       380       390       400                 

             390       400       410       420       430       440 
pF1KE3 NPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFH
                             :: . :  :  :..::   ...:: .: .: :  ....
CCDS13 ----------------------PQ-WTGKTCQLDANEC---EAKPCVNAKSCKNLIASYY
                                    410          420       430     

             450       460       470       480       490       500 
pF1KE3 CECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSN
       :.:: :. :  :...::.: .. :::::.: : ..:. :.: ::. : ::: .:.:: ::
CCDS13 CDCLPGWMGQNCDININDCLGQ-CQNDASCRDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDECASN
         440       450        460       470       480       490    

             510       520       530       540       550       560 
pF1KE3 PCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATG
       ::.:.:.: ...:::::::: ::.: .::.::: :  .:: :::.: .. . : :.:   
CCDS13 PCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPED
          500       510       520       530       540       550    

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pF1KE3 FTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQCQDGIDSYTCICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGR
       . :  : .  :.:   ::      . :::    :. .. .    . .    :. :   :.
CCDS13 YEGKNCSHLKDHCRTTPC------EVIDS----CTVAMASNDTPEGVRYISSNVCGPHGK
          560       570                 580       590       600    

              630       640       650        660       670         
pF1KE3 CIDLVNG-YQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHG-ICMDGINRYSCVCSPGFTGQRC
       : .  .: . :.:. : .:. :. :..:: :::: .:  :.::.: :.:.:: :. :  :
CCDS13 CKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWEGAYC
          610       620       630       640       650       660    

     680       690       700       710       720       730         
pF1KE3 NIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPCIHGN-CTGGL
       . .:..:..:::..:.:: . :: : : : .: .  .:.:. ..:    : .:. :    
CCDS13 ETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTCYDEG
          670       680       690       700       710       720    

      740       750       760        770         780       790     
pF1KE3 SGYKCLCDAGWVGINCEVDKNE-CLSNPCQNGGTCDNLVNG--YRCTCKKGFKGYNCQVN
       ...::.: .:: : .:.. .:  :: :::.:::::  .:::  . :.::.:..:  :  :
CCDS13 DAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTC--VVNGESFTCVCKEGWEGPICAQN
          730       740       750         760       770       780  

         800       810       820       830       840       850     
pF1KE3 IDECASNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFE
        ..:. .:: :.::: :  . : :.:.  ..: .:.  .  :. .::  .:.: .  :  
CCDS13 TNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDEIN--
            790       800       810       820       830       840  

         860       870       880       890       900       910     
pF1KE3 SYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDC
       .: :.: :: .: .:    .:  ..::.       :.:: .   : : .  :     :::
CCDS13 GYRCVCPPGHSGAKC----QEVSGRPCI-------TMGSVI---PDG-AKWD-----DDC
              850           860              870                880

         920       930         940           950        960        
pF1KE3 LANPCQNGGSCMDGV--NTFSCLCLPGFT----GDKCQTDMNE-CLSEPCKNGGTC-SDY
        .  : ::    . :  .   ::   : .    :..:   ... :. .:: . : : :. 
CCDS13 NTCQCLNGRIACSKVWCGPRPCLLHKGHSECPSGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSSS
              890       900       910       920       930       940

       970       980       990      1000      1010      1020       
pF1KE3 VNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGFTGSFCLHEIN
       ..    :: .  :. . .:  :                                      
CCDS13 LQPVKTKCTS--DSYYQDNCANITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEYSI
              950         960       970       980       990        

>>CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14                (1238 aa)
 initn: 2407 init1: 755 opt: 1209  Z-score: 544.2  bits: 113.8 E(32554): 5.4e-24
Smith-Waterman score: 2006; 33.9% identity (58.1% similar) in 908 aa overlap (183-1070:172-1017)

            160       170       180       190       200       210  
pF1KE3 CANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQG
                                     .:  :     . .:   .:  . . .: ..
CCDS99 FTLIVEAWDWDNDTTPNEELLIERVSHAGMINPEDRWKSLHFSGHVAHLELQIRVRCDEN
             150       160       170       180       190       200 

            220       230        240       250       260       270 
pF1KE3 FTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGG-TCRQTGDFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQ-
       . .  :...   : :     :  :: : :. .    :. :. :. :.. .  : .. :. 
CCDS99 YYSATCNKF---CRPRNDFFGHYTCDQYGNKA----CMDGWMGKECKEAV--C-KQGCNL
             210          220       230           240          250 

               280       290       300       310       320         
pF1KE3 -NGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNG
        .::  : :    .:::   : :.::    :::.  :. : .: .:..    . : : ..
CCDS99 LHGGCTVPG----ECRCSYGWQGRFC----DECVPYPG-CVHG-SCVE---PWQCNCETN
             260           270           280            290        

     330       340        350        360       370        380      
pF1KE3 WSGDDCSENIDDC-AFASCTPGSTCID-RVASFSCMCPEGKAGLLCH-LDDACISNPCHK
       :.:  :..... : .   :: :.:::. .  .. : ::.: .:  :.  . :: :::: .
CCDS99 WGGLLCDKDLNYCGSHHPCTNGGTCINAEPDQYRCTCPDGYSGRNCEKAEHACTSNPCAN
      300       310       320       330       340       350        

        390       400       410       420       430       440      
pF1KE3 GALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLK
       :. :   : .: . : ::.:..:  :. :.::::   ::::  .: ::.   .:.: : .
CCDS99 GGSCHEVP-SG-FECHCPSGWSGPTCALDIDECA---SNPCAAGGTCVDQVDGFECICPE
      360         370       380       390          400       410   

        450       460       470       480       490       500      
pF1KE3 GYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNN
        ..:  :..: :::.. :: :  .: . :::. : :.::.::..:....:.:... : ..
CCDS99 QWVGATCQLDANECEGKPCLNAFSCKNLIGGYYCDCIPGWKGINCHINVNDCRGQ-CQHG
           420       430       440       450       460        470  

        510       520       530       540       550       560      
pF1KE3 GQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVL
       : : : :: .::.:: :: :  :... :.:.:.:: .:. : :  .:..:.:  ::.: :
CCDS99 GTCKDLVNGYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGGLCEDLADGFHCHCPQGFSGPL
            480       490       500       510       520       530  

        570       580        590       600       610       620     
pF1KE3 CEENIDNCDPDPCHHG-QCQDGIDSYTCICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDL
       :: ..: :.:.::..: .: .   .: : :   . :  ::   . : .. :    : :: 
CCDS99 CEVDVDLCEPSPCRNGARCYNLEGDYYCACPDDFGGKNCSVPREPCPGGAC----RVID-
            540       550       560       570       580            

         630       640       650        660         670       680  
pF1KE3 VNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPC-IHGICMD--GINRYSCVCSPGFTGQRCNID
         :   .  ::  :.         ::. :  :: :..  : : .::.:. ::::  :. .
CCDS99 --GCGSDAGPGMPGTA--------ASGVCGPHGRCVSQPGGN-FSCICDSGFTGTYCHEN
         590       600               610        620       630      

            690       700       710       720        730       740 
pF1KE3 IDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPC-IHGNCTGGLSGY
       ::.: ..:::.:.:::. :..:::.:: : .   : .. :.:: .::  .: :   .. .
CCDS99 IDDCLGQPCRNGGTCIDEVDAFRCFCPSGWEGELCDTNPNDCLPDPCHSRGRCYDLVNDF
        640       650       660       670       680       690      

             750       760       770       780       790        800
pF1KE3 KCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNGGTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDE-CA
        : :: :: : .:.  . .: .  :.::::: .  . .::.:  :.:: .: :  .  : 
CCDS99 YCACDDGWKGKTCHSREFQCDAYTCSNGGTCYDSGDTFRCACPPGWKGSTCAVAKNSSCL
        700       710       720       730       740       750      

              810       820       830       840       850       860
pF1KE3 SNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCL
        :::.: :::  . ....: :   . :..:      :.: :: :...: .. :.  . : 
CCDS99 PNPCVNGGTCVGSGASFSCICRDGWEGRTCTHNTNDCNPLPCYNGGICVDGVNW--FRCE
        760       770       780       790       800       810      

              870       880       890       900       910          
pF1KE3 CAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDID---DCLA
       ::::. :  : :.:::: :.::   . : .  ..: : :::: .:  :.: :    .: .
CCDS99 CAPGFAGPDCRINIDECQSSPCAYGATCVDEINGYRCSCPPGRAGPRCQEVIGFGRSCWS
          820       830       840       850       860       870    

         920       930       940       950       960       970     
pF1KE3 --NPCQNGGSCMDGVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKC
         .:  .:.: ..  :  :: :: :     :.     :  .::  .:      .. . .:
CCDS99 RGTPFPHGSSWVEDCN--SCRCLDGRRD--CSKVW--CGWKPCLLAGQ----PEALSAQC
          880       890         900           910           920    

         980        990      1000       1010      1020       1030  
pF1KE3 QAGFDGVHC-ENNINECTESSCFNGGTC-VDGINSFSCLCPVGFTGSFCLH-EINECSSH
         :    .: :.  ..: .  :   : : ..   :  ::   :   . : .  ..   .:
CCDS99 PLG---QRCLEKAPGQCLRPPCEAWGECGAEEPPSTPCLPRSGHLDNNCARLTLHFNRDH
             930       940       950       960       970       980 

           1040      1050      1060      1070      1080      1090  
pF1KE3 PCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSG
         . .:: : .. .   : :   .    . :: ::.:.                      
CCDS99 --VPQGTTVGAICSGIRSLPATRAVARDRLLVLLCDRASSGASAVEVAVSFSPARDLPDS
               990      1000      1010      1020      1030         

           1100      1110      1120      1130      1140      1150  
pF1KE3 WAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLGYTGSYCEEQLDE
                                                                   
CCDS99 SLIQGAAHAIVAAITQRGNSSLLLAVTEVKVETVVTGGSSTGLLVPVLCGAFSVLWLACV
    1040      1050      1060      1070      1080      1090         

>>CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14                (1200 aa)
 initn: 1784 init1: 634 opt: 1179  Z-score: 531.4  bits: 111.4 E(32554): 2.8e-23
Smith-Waterman score: 1877; 34.5% identity (58.1% similar) in 809 aa overlap (52-838:197-955)

              30        40        50        60         70        80
pF1KE3 PAHALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGEYCQHRDPCE-KNRCQNGGTCV
                                     .: :.. .  :..   :. .:   .  :: 
CCDS99 SHAGMINPEDRWKSLHFSGHVAHLELQIRVRCDENYYSATCNKF--CRPRNDFFGHYTC-
        170       180       190       200       210         220    

               90       100       110       120       130       140
pF1KE3 AQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCHMLSRDTYECTCQVGFTGK
        . . .::   : .:. :..:. ..   :  .   :.:: : . .    :: :. :. :.
CCDS99 -DQYGNKA---CMDGWMGKECKEAV---CKQGCNLLHGG-CTVPG----ECRCSYGWQGR
            230          240          250        260           270 

              150        160       170       180       190         
pF1KE3 ECQWTDACLSHP-CANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPGHCQHGGTCL
        :   : :. .: :..:: :.   . ..:.: :.. :  :. :.: :     : .::::.
CCDS99 FC---DECVPYPGCVHGS-CV---EPWQCNCETNWGGLLCDKDLNYCGSHHPCTNGGTCI
                280           290       300       310       320    

     200        210       220       230       240       250        
pF1KE3 NL-PGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECNCLPGFEGSTCE
       :  : .:.: ::.:..:. :..    :. .::.:::.:... .  :::.:  :. : :: 
CCDS99 NAEPDQYRCTCPDGYSGRNCEKAEHACTSNPCANGGSCHEVPS-GFECHCPSGWSGPTCA
          330       340       350       360        370       380   

      260       270       280       290       300       310        
pF1KE3 RNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGGTCANR
        .::.: .. :  ::.::: :. ..: :: ::.:  :  ::..:  :   ::.:::: . 
CCDS99 LDIDECASNPCAAGGTCVDQVDGFECICPEQWVGATCQLDVNDCRGQ---CQHGGTCKDL
           390       400       410       420       430          440

      320       330       340       350       360       370        
pF1KE3 NGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGLLCHLD-D
        .:: :::  :..:  :  . :.:: . :  :. : : . .: : ::.: .: ::..: :
CCDS99 VNGYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGGLCEDLADGFHCHCPQGFSGPLCEVDVD
              450       460       470       480       490       500

       380       390       400       410       420       430       
pF1KE3 ACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTD
        :  .::..:: : .  :.:.: :.::. . : .:.        .  .::  .: :   :
CCDS99 LCEPSPCRNGARCYN--LEGDYYCACPDDFGGKNCS--------VPREPCP-GGACRVID
              510         520       530               540          

       440       450       460       470        480       490      
pF1KE3 GAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGG-FTCLCMPGFKGVHCELEIN
       :   :    : . :      .   :  :   . :... :: :.:.:  :: :..:. .:.
CCDS99 G---CGSDAGPGMP------GTAASGVCGPHGRCVSQPGGNFSCICDSGFTGTYCHENID
     550          560             570       580       590       600

        500       510       520       530       540       550      
pF1KE3 ECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYEC
       .: ..:: :.: :.:.:. :.:.:: :. : .:. . .::   :: . ..: :  : . :
CCDS99 DCLGQPCRNGGTCIDEVDAFRCFCPSGWEGELCDTNPNDCLPDPCHSRGRCYDLVNDFYC
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