Result of FASTA (ccds) for pF1KE3824
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3824, 2554 aa
  1>>>pF1KE3824 2554 - 2554 aa - 2554 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3096+/-0.00105; mu= 16.7442+/- 0.064
 mean_var=110.7565+/-22.489, 0's: 0 Z-trim(107.4): 79  B-trim: 344 in 1/50
 Lambda= 0.121868
 statistics sampled from 9471 (9551) to 9471 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.293), width:  16
 Scan time:  6.100

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS55403.1 USP9X gene_id:8239|Hs108|chrX          (2554) 17316 3056.7       0
CCDS43930.1 USP9X gene_id:8239|Hs108|chrX          (2570) 16777 2961.9       0
CCDS14781.1 USP9Y gene_id:8287|Hs108|chrY          (2555) 16001 2825.5       0
CCDS44154.2 USP24 gene_id:23358|Hs108|chr1         (2620) 1164 216.9 1.1e-54
CCDS42686.1 USP34 gene_id:9736|Hs108|chr2          (3546)  595 116.9 1.9e-24
CCDS44084.1 USP48 gene_id:84196|Hs108|chr1         ( 485)  342 72.1 8.1e-12
CCDS81277.1 USP48 gene_id:84196|Hs108|chr1         ( 983)  342 72.2 1.5e-11
CCDS30623.1 USP48 gene_id:84196|Hs108|chr1         (1035)  342 72.2 1.6e-11


>>CCDS55403.1 USP9X gene_id:8239|Hs108|chrX               (2554 aa)
 initn: 17316 init1: 17316 opt: 17316  Z-score: 16442.8  bits: 3056.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 17316; 100.0% identity (100.0% similar) in 2554 aa overlap (1-2554:1-2554)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MTATTRGSPVGGNDNQGQAPDGQSQPPLQQNQTSSPDSSNENSPATPPDEQGQGDAPPQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MTATTRGSPVGGNDNQGQAPDGQSQPPLQQNQTSSPDSSNENSPATPPDEQGQGDAPPQL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 EDEEPAFPHTDLAKLDDMINRPRWVVPVLPKGELEVLLEAAIDLSKKGLDVKSEACQRFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EDEEPAFPHTDLAKLDDMINRPRWVVPVLPKGELEVLLEAAIDLSKKGLDVKSEACQRFF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 RDGLTISFTKILTDEAVSGWKFEIHRCIINNTHRLVELCVAKLSQDWFPLLELLAMALNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RDGLTISFTKILTDEAVSGWKFEIHRCIINNTHRLVELCVAKLSQDWFPLLELLAMALNP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 HCKFHIYNGTRPCESVSSSVQLPEDELFARSPDPRSPKGWLVDLLNKFGTLNGFQILHDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HCKFHIYNGTRPCESVSSSVQLPEDELFARSPDPRSPKGWLVDLLNKFGTLNGFQILHDR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 FINGSALNVQIIAALIKPFGQCYEFLTLHTVKKYFLPIIEMVPQFLENLTDEELKKEAKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FINGSALNVQIIAALIKPFGQCYEFLTLHTVKKYFLPIIEMVPQFLENLTDEELKKEAKN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 EAKNDALSMIIKSLKNLASRVPGQEETVKNLEIFRLKMILRLLQISSFNGKMNALNEVNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EAKNDALSMIIKSLKNLASRVPGQEETVKNLEIFRLKMILRLLQISSFNGKMNALNEVNK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 VISSVSYYTHRHGNPEEEEWLTAERMAEWIQQNNILSIVLRDSLHQPQYVEKLEKILRFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VISSVSYYTHRHGNPEEEEWLTAERMAEWIQQNNILSIVLRDSLHQPQYVEKLEKILRFV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 IKEKALTLQDLDNIWAAQAGKHEAIVKNVHDLLAKLAWDFSPEQLDHLFDCFKASWTNAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IKEKALTLQDLDNIWAAQAGKHEAIVKNVHDLLAKLAWDFSPEQLDHLFDCFKASWTNAS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 KKQREKLLELIRRLAEDDKDGVMAHKVLNLLWNLAHSDDVPVDIMDLALSAHIKILDYSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KKQREKLLELIRRLAEDDKDGVMAHKVLNLLWNLAHSDDVPVDIMDLALSAHIKILDYSC
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 SQDRDTQKIQWIDRFIEELRTNDKWVIPALKQIREICSLFGEAPQNLSQTQRSPHVFYRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SQDRDTQKIQWIDRFIEELRTNDKWVIPALKQIREICSLFGEAPQNLSQTQRSPHVFYRH
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 DLINQLQHNHALVTLVAENLATYMESMRLYARDHEDYDPQTVRLGSRYSHVQEVQERLNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DLINQLQHNHALVTLVAENLATYMESMRLYARDHEDYDPQTVRLGSRYSHVQEVQERLNF
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 LRFLLKDGQLWLCAPQAKQIWKCLAENAVYLCDREACFKWYSKLMGDEPDLDPDINKDFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LRFLLKDGQLWLCAPQAKQIWKCLAENAVYLCDREACFKWYSKLMGDEPDLDPDINKDFF
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 ESNVLQLDPSLLTENGMKCFERFFKAVNCREGKLVAKRRAYMMDDLELIGLDYLWRVVIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ESNVLQLDPSLLTENGMKCFERFFKAVNCREGKLVAKRRAYMMDDLELIGLDYLWRVVIQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 SNDDIASRAIDLLKEIYTNLGPRLQVNQVVIHEDFIQSCFDRLKASYDTLCVLDGDKDSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SNDDIASRAIDLLKEIYTNLGPRLQVNQVVIHEDFIQSCFDRLKASYDTLCVLDGDKDSV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 NCARQEAVRMVRVLTVLREYINECDSDYHEERTILPMSRAFRGKHLSFVVRFPNQGRQVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NCARQEAVRMVRVLTVLREYINECDSDYHEERTILPMSRAFRGKHLSFVVRFPNQGRQVD
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 DLEVWSHTNDTIGSVRRCILNRIKANVAHTKIELFVGGELIDPADDRKLIGQLNLKDKSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DLEVWSHTNDTIGSVRRCILNRIKANVAHTKIELFVGGELIDPADDRKLIGQLNLKDKSL
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 ITAKLTQISSNMPSSPDSSSDSSTGSPGNHGNHYSDGPNPEVESCLPGVIMSLHPRYISF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ITAKLTQISSNMPSSPDSSSDSSTGSPGNHGNHYSDGPNPEVESCLPGVIMSLHPRYISF
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE3 LWQVADLGSSLNMPPLRDGARVLMKLMPPDSTTIEKLRAICLDHAKLGESSLSPSLDSLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LWQVADLGSSLNMPPLRDGARVLMKLMPPDSTTIEKLRAICLDHAKLGESSLSPSLDSLF
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE3 FGPSASQVLYLTEVVYALLMPAGAPLADDSSDFQFHFLKSGGLPLVLSMLTRNNFLPNAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FGPSASQVLYLTEVVYALLMPAGAPLADDSSDFQFHFLKSGGLPLVLSMLTRNNFLPNAD
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE3 METRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPGVEGVNPMTQINQVTHDQAVVLQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 METRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPGVEGVNPMTQINQVTHDQAVVLQS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE3 ALQSIPNPSSECMLRNVSVRLAQQISDEASRYMPDICVIRAIQKIIWASGCGSLQLVFSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ALQSIPNPSSECMLRNVSVRLAQQISDEASRYMPDICVIRAIQKIIWASGCGSLQLVFSP
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE3 NEEITKIYEKTNAGNEPDLEDEQVCCEALEVMTLCFALIPTALDALSKEKAWQTFIIDLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NEEITKIYEKTNAGNEPDLEDEQVCCEALEVMTLCFALIPTALDALSKEKAWQTFIIDLL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE3 LHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTVLGSTARERAKHSGDYFTLLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTVLGSTARERAKHSGDYFTLLR
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE3 HLLNYAYNSNINVPNAEVLLNNEIDWLKRIRDDVKRTGETGIEETILEGHLGVTKELLAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HLLNYAYNSNINVPNAEVLLNNEIDWLKRIRDDVKRTGETGIEETILEGHLGVTKELLAF
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE3 QTSEKKFHIGCEKGGANLIKELIDDFIFPASNVYLQYMRNGELPAEQAIPVCGSPPTINA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QTSEKKFHIGCEKGGANLIKELIDDFIFPASNVYLQYMRNGELPAEQAIPVCGSPPTINA
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE3 GFELLVALAVGCVRNLKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKGFVGLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GFELLVALAVGCVRNLKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKGFVGLK
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE3 NAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRDDVFGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRDDVFGY
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE3 PQQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWGEPVNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PQQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWGEPVNL
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KE3 REQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEESFTTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 REQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEESFTTL
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KE3 NVDIRNHQNLLDSLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAIQLKRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NVDIRNHQNLLDSLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAIQLKRF
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KE3 DYDWERECAIKFNDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLEGDNVNPESQLIQQSEQSESETAGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DYDWERECAIKFNDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLEGDNVNPESQLIQQSEQSESETAGS
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KE3 TKYRLVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEEMKNQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TKYRLVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEEMKNQC
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
pF1KE3 FGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELAITTRPHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELAITTRPHQ
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

             1990      2000      2010      2020      2030      2040
pF1KE3 IIMPSAIERSVRKQNVQFMHNRMQYSMEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLPEAEEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IIMPSAIERSVRKQNVQFMHNRMQYSMEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLPEAEEI
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

             2050      2060      2070      2080      2090      2100
pF1KE3 TMISIQLAARFLFTTGFHTKKVVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFNVSNRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TMISIQLAARFLFTTGFHTKKVVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFNVSNRF
             2050      2060      2070      2080      2090      2100

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pF1KE3 SEYLLECPSAEVRGAFAKLIVFIAHFSLQDGPCPSPFASPGPSSQAYDNLSLSDHLLRAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SEYLLECPSAEVRGAFAKLIVFIAHFSLQDGPCPSPFASPGPSSQAYDNLSLSDHLLRAV
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pF1KE3 LNLLRREVSEHGRHLQQYFNLFVMYANLGVAEKTQLLKLSVPATFMLVSLDEGPGPPIKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LNLLRREVSEHGRHLQQYFNLFVMYANLGVAEKTQLLKLSVPATFMLVSLDEGPGPPIKY
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pF1KE3 QYAELGKLYSVVSQLIRCCNVSSRMQSSINGNPPLPNPFGDPNLSQPIMPIQQNVADILF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QYAELGKLYSVVSQLIRCCNVSSRMQSSINGNPPLPNPFGDPNLSQPIMPIQQNVADILF
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pF1KE3 VRTSYVKKIIEDCSNSEETVKLLRFCCWENPQFSSTVLSELLWQVAYSYTYELRPYLDLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VRTSYVKKIIEDCSNSEETVKLLRFCCWENPQFSSTVLSELLWQVAYSYTYELRPYLDLL
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pF1KE3 LQILLIEDSWQTHRIHNALKGIPDDRDGLFDTIQRSKNHYQKRAYQCIKCMVALFSNCPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LQILLIEDSWQTHRIHNALKGIPDDRDGLFDTIQRSKNHYQKRAYQCIKCMVALFSNCPV
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pF1KE3 AYQILQGNGDLKRKWTWAVEWLGDELERRPYTGNPQYTYNNWSPPVQSNETSNGYFLERS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AYQILQGNGDLKRKWTWAVEWLGDELERRPYTGNPQYTYNNWSPPVQSNETSNGYFLERS
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pF1KE3 HSARMTLAKACELCPEEEPDDQDAPDEHESPPPEDAPLYPHSPGSQYQQNNHVHGQPYTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HSARMTLAKACELCPEEEPDDQDAPDEHESPPPEDAPLYPHSPGSQYQQNNHVHGQPYTG
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             2530      2540      2550    
pF1KE3 PAAHHMNNPQRTGQRAQENYEGSEEVSPPQTKDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PAAHHMNNPQRTGQRAQENYEGSEEVSPPQTKDQ
             2530      2540      2550    

>>CCDS43930.1 USP9X gene_id:8239|Hs108|chrX               (2570 aa)
 initn: 16746 init1: 16746 opt: 16777  Z-score: 15930.6  bits: 2961.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 17274; 99.4% identity (99.4% similar) in 2570 aa overlap (1-2554:1-2570)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MTATTRGSPVGGNDNQGQAPDGQSQPPLQQNQTSSPDSSNENSPATPPDEQGQGDAPPQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MTATTRGSPVGGNDNQGQAPDGQSQPPLQQNQTSSPDSSNENSPATPPDEQGQGDAPPQL
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pF1KE3 EDEEPAFPHTDLAKLDDMINRPRWVVPVLPKGELEVLLEAAIDLSKKGLDVKSEACQRFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EDEEPAFPHTDLAKLDDMINRPRWVVPVLPKGELEVLLEAAIDLSKKGLDVKSEACQRFF
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pF1KE3 RDGLTISFTKILTDEAVSGWKFEIHRCIINNTHRLVELCVAKLSQDWFPLLELLAMALNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RDGLTISFTKILTDEAVSGWKFEIHRCIINNTHRLVELCVAKLSQDWFPLLELLAMALNP
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pF1KE3 HCKFHIYNGTRPCESVSSSVQLPEDELFARSPDPRSPKGWLVDLLNKFGTLNGFQILHDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HCKFHIYNGTRPCESVSSSVQLPEDELFARSPDPRSPKGWLVDLLNKFGTLNGFQILHDR
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              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 FINGSALNVQIIAALIKPFGQCYEFLTLHTVKKYFLPIIEMVPQFLENLTDEELKKEAKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FINGSALNVQIIAALIKPFGQCYEFLTLHTVKKYFLPIIEMVPQFLENLTDEELKKEAKN
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pF1KE3 EAKNDALSMIIKSLKNLASRVPGQEETVKNLEIFRLKMILRLLQISSFNGKMNALNEVNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EAKNDALSMIIKSLKNLASRVPGQEETVKNLEIFRLKMILRLLQISSFNGKMNALNEVNK
              310       320       330       340       350       360

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pF1KE3 VISSVSYYTHRHGNPEEEEWLTAERMAEWIQQNNILSIVLRDSLHQPQYVEKLEKILRFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VISSVSYYTHRHGNPEEEEWLTAERMAEWIQQNNILSIVLRDSLHQPQYVEKLEKILRFV
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pF1KE3 IKEKALTLQDLDNIWAAQAGKHEAIVKNVHDLLAKLAWDFSPEQLDHLFDCFKASWTNAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IKEKALTLQDLDNIWAAQAGKHEAIVKNVHDLLAKLAWDFSPEQLDHLFDCFKASWTNAS
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pF1KE3 KKQREKLLELIRRLAEDDKDGVMAHKVLNLLWNLAHSDDVPVDIMDLALSAHIKILDYSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KKQREKLLELIRRLAEDDKDGVMAHKVLNLLWNLAHSDDVPVDIMDLALSAHIKILDYSC
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 SQDRDTQKIQWIDRFIEELRTNDKWVIPALKQIREICSLFGEAPQNLSQTQRSPHVFYRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SQDRDTQKIQWIDRFIEELRTNDKWVIPALKQIREICSLFGEAPQNLSQTQRSPHVFYRH
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pF1KE3 DLINQLQHNHALVTLVAENLATYMESMRLYARDHEDYDPQTVRLGSRYSHVQEVQERLNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DLINQLQHNHALVTLVAENLATYMESMRLYARDHEDYDPQTVRLGSRYSHVQEVQERLNF
              610       620       630       640       650       660

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pF1KE3 LRFLLKDGQLWLCAPQAKQIWKCLAENAVYLCDREACFKWYSKLMGDEPDLDPDINKDFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LRFLLKDGQLWLCAPQAKQIWKCLAENAVYLCDREACFKWYSKLMGDEPDLDPDINKDFF
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pF1KE3 ESNVLQLDPSLLTENGMKCFERFFKAVNCREGKLVAKRRAYMMDDLELIGLDYLWRVVIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ESNVLQLDPSLLTENGMKCFERFFKAVNCREGKLVAKRRAYMMDDLELIGLDYLWRVVIQ
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pF1KE3 SNDDIASRAIDLLKEIYTNLGPRLQVNQVVIHEDFIQSCFDRLKASYDTLCVLDGDKDSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SNDDIASRAIDLLKEIYTNLGPRLQVNQVVIHEDFIQSCFDRLKASYDTLCVLDGDKDSV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 NCARQEAVRMVRVLTVLREYINECDSDYHEERTILPMSRAFRGKHLSFVVRFPNQGRQVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NCARQEAVRMVRVLTVLREYINECDSDYHEERTILPMSRAFRGKHLSFVVRFPNQGRQVD
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 DLEVWSHTNDTIGSVRRCILNRIKANVAHTKIELFVGGELIDPADDRKLIGQLNLKDKSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DLEVWSHTNDTIGSVRRCILNRIKANVAHTKIELFVGGELIDPADDRKLIGQLNLKDKSL
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 ITAKLTQISSNMPSSPDSSSDSSTGSPGNHGNHYSDGPNPEVESCLPGVIMSLHPRYISF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ITAKLTQISSNMPSSPDSSSDSSTGSPGNHGNHYSDGPNPEVESCLPGVIMSLHPRYISF
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE3 LWQVADLGSSLNMPPLRDGARVLMKLMPPDSTTIEKLRAICLDHAKLGESSLSPSLDSLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LWQVADLGSSLNMPPLRDGARVLMKLMPPDSTTIEKLRAICLDHAKLGESSLSPSLDSLF
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE3 FGPSASQVLYLTEVVYALLMPAGAPLADDSSDFQFHFLKSGGLPLVLSMLTRNNFLPNAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FGPSASQVLYLTEVVYALLMPAGAPLADDSSDFQFHFLKSGGLPLVLSMLTRNNFLPNAD
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE3 METRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPGVEGVNPMTQINQVTHDQAVVLQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 METRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPGVEGVNPMTQINQVTHDQAVVLQS
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             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE3 ALQSIPNPSSECMLRNVSVRLAQQISDEASRYMPDICVIRAIQKIIWASGCGSLQLVFSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ALQSIPNPSSECMLRNVSVRLAQQISDEASRYMPDICVIRAIQKIIWASGCGSLQLVFSP
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pF1KE3 NEEITKIYEKTNAGNEPDLEDEQVCCEALEVMTLCFALIPTALDALSKEKAWQTFIIDLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NEEITKIYEKTNAGNEPDLEDEQVCCEALEVMTLCFALIPTALDALSKEKAWQTFIIDLL
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pF1KE3 LHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTVLGSTARERAKHSGDYFTLLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTVLGSTARERAKHSGDYFTLLR
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE3 HLLNYAYNSNINVPNAEVLLNNEIDWLKRIRDDVKRTGETGIEETILEGHLGVTKELLAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HLLNYAYNSNINVPNAEVLLNNEIDWLKRIRDDVKRTGETGIEETILEGHLGVTKELLAF
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE3 QTSEKKFHIGCEKGGANLIKELIDDFIFPASNVYLQYMRNGELPAEQAIPVCGSPPTINA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QTSEKKFHIGCEKGGANLIKELIDDFIFPASNVYLQYMRNGELPAEQAIPVCGSPPTINA
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE3 GFELLVALAVGCVRNLKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKGFVGLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GFELLVALAVGCVRNLKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKGFVGLK
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE3 NAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRDDVFGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRDDVFGY
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE3 PQQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWGEPVNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PQQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWGEPVNL
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KE3 REQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEESFTTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 REQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEESFTTL
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KE3 NVDIRNHQNLLDSLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAIQLKRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NVDIRNHQNLLDSLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAIQLKRF
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KE3 DYDWERECAIKFNDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLEGDNVNPESQLIQQSEQSESETAGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DYDWERECAIKFNDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLEGDNVNPESQLIQQSEQSESETAGS
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KE3 TKYRLVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEEMKNQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TKYRLVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEEMKNQC
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
pF1KE3 FGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELAITTRPHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELAITTRPHQ
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

             1990      2000      2010      2020      2030      2040
pF1KE3 IIMPSAIERSVRKQNVQFMHNRMQYSMEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLPEAEEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IIMPSAIERSVRKQNVQFMHNRMQYSMEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLPEAEEI
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

             2050      2060      2070      2080      2090      2100
pF1KE3 TMISIQLAARFLFTTGFHTKKVVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFNVSNRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TMISIQLAARFLFTTGFHTKKVVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFNVSNRF
             2050      2060      2070      2080      2090      2100

             2110      2120      2130      2140      2150      2160
pF1KE3 SEYLLECPSAEVRGAFAKLIVFIAHFSLQDGPCPSPFASPGPSSQAYDNLSLSDHLLRAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SEYLLECPSAEVRGAFAKLIVFIAHFSLQDGPCPSPFASPGPSSQAYDNLSLSDHLLRAV
             2110      2120      2130      2140      2150      2160

             2170      2180      2190      2200      2210      2220
pF1KE3 LNLLRREVSEHGRHLQQYFNLFVMYANLGVAEKTQLLKLSVPATFMLVSLDEGPGPPIKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LNLLRREVSEHGRHLQQYFNLFVMYANLGVAEKTQLLKLSVPATFMLVSLDEGPGPPIKY
             2170      2180      2190      2200      2210      2220

             2230      2240      2250      2260      2270      2280
pF1KE3 QYAELGKLYSVVSQLIRCCNVSSRMQSSINGNPPLPNPFGDPNLSQPIMPIQQNVADILF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QYAELGKLYSVVSQLIRCCNVSSRMQSSINGNPPLPNPFGDPNLSQPIMPIQQNVADILF
             2230      2240      2250      2260      2270      2280

             2290      2300      2310      2320      2330      2340
pF1KE3 VRTSYVKKIIEDCSNSEETVKLLRFCCWENPQFSSTVLSELLWQVAYSYTYELRPYLDLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VRTSYVKKIIEDCSNSEETVKLLRFCCWENPQFSSTVLSELLWQVAYSYTYELRPYLDLL
             2290      2300      2310      2320      2330      2340

             2350      2360      2370      2380      2390      2400
pF1KE3 LQILLIEDSWQTHRIHNALKGIPDDRDGLFDTIQRSKNHYQKRAYQCIKCMVALFSNCPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LQILLIEDSWQTHRIHNALKGIPDDRDGLFDTIQRSKNHYQKRAYQCIKCMVALFSNCPV
             2350      2360      2370      2380      2390      2400

             2410      2420      2430      2440      2450      2460
pF1KE3 AYQILQGNGDLKRKWTWAVEWLGDELERRPYTGNPQYTYNNWSPPVQSNETSNGYFLERS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AYQILQGNGDLKRKWTWAVEWLGDELERRPYTGNPQYTYNNWSPPVQSNETSNGYFLERS
             2410      2420      2430      2440      2450      2460

             2470                      2480      2490      2500    
pF1KE3 HSARMTLAKACELCPEE----------------EPDDQDAPDEHESPPPEDAPLYPHSPG
       :::::::::::::::::                :::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HSARMTLAKACELCPEEVKKATSVQQIEMEESKEPDDQDAPDEHESPPPEDAPLYPHSPG
             2470      2480      2490      2500      2510      2520

         2510      2520      2530      2540      2550    
pF1KE3 SQYQQNNHVHGQPYTGPAAHHMNNPQRTGQRAQENYEGSEEVSPPQTKDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SQYQQNNHVHGQPYTGPAAHHMNNPQRTGQRAQENYEGSEEVSPPQTKDQ
             2530      2540      2550      2560      2570

>>CCDS14781.1 USP9Y gene_id:8287|Hs108|chrY               (2555 aa)
 initn: 10829 init1: 10829 opt: 16001  Z-score: 15193.3  bits: 2825.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 16001; 91.6% identity (97.3% similar) in 2556 aa overlap (1-2554:1-2555)

               10        20        30        40         50         
pF1KE3 MTATTRGSPVGGNDNQGQAPDGQSQPPLQQNQTSSPDSSNENSPATPP-DEQGQGDAPPQ
       ::: :.::::::::.:::. :::::  .::::::::::::::: :::: .::::::::::
CCDS14 MTAITHGSPVGGNDSQGQVLDGQSQHLFQQNQTSSPDSSNENSVATPPPEEQGQGDAPPQ
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE3 LEDEEPAFPHTDLAKLDDMINRPRWVVPVLPKGELEVLLEAAIDLSKKGLDVKSEACQRF
        ::::::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS14 HEDEEPAFPHTELANLDDMINRPRWVVPVLPKGELEVLLEAAIDLSVKGLDVKSEACQRF
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE3 FRDGLTISFTKILTDEAVSGWKFEIHRCIINNTHRLVELCVAKLSQDWFPLLELLAMALN
       ::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FRDGLTISFTKILMDEAVSGWKFEIHRCIINNTHRLVELCVAKLSQDWFPLLELLAMALN
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE3 PHCKFHIYNGTRPCESVSSSVQLPEDELFARSPDPRSPKGWLVDLLNKFGTLNGFQILHD
       ::::::::::::::: .::..::::::::::: ::::::::::::.::::::::::::::
CCDS14 PHCKFHIYNGTRPCELISSNAQLPEDELFARSSDPRSPKGWLVDLINKFGTLNGFQILHD
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE3 RFINGSALNVQIIAALIKPFGQCYEFLTLHTVKKYFLPIIEMVPQFLENLTDEELKKEAK
       ::.::::::.:::::::::::::::::. ::.::::.:.::.::..::::::::::::::
CCDS14 RFFNGSALNIQIIAALIKPFGQCYEFLSQHTLKKYFIPVIEIVPHLLENLTDEELKKEAK
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE3 NEAKNDALSMIIKSLKNLASRVPGQEETVKNLEIFRLKMILRLLQISSFNGKMNALNEVN
       :::::::::::::::::::::. ::.::.:::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS14 NEAKNDALSMIIKSLKNLASRISGQDETIKNLEIFRLKMILRLLQISSFNGKMNALNEIN
              310       320       330       340       350       360

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE3 KVISSVSYYTHRHGNPEEEEWLTAERMAEWIQQNNILSIVLRDSLHQPQYVEKLEKILRF
       :::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS14 KVISSVSYYTHRHSNPEEEEWLTAERMAEWIQQNNILSIVLQDSLHQPQYVEKLEKILRF
              370       380       390       400       410       420

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE3 VIKEKALTLQDLDNIWAAQAGKHEAIVKNVHDLLAKLAWDFSPEQLDHLFDCFKASWTNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS14 VIKEKALTLQDLDNIWAAQAGKHEAIVKNVHDLLAKLAWDFSPGQLDHLFDCFKASWTNA
              430       440       450       460       470       480

     480       490       500       510       520       530         
pF1KE3 SKKQREKLLELIRRLAEDDKDGVMAHKVLNLLWNLAHSDDVPVDIMDLALSAHIKILDYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS14 SKKQREKLLELIRRLAEDDKDGVMAHKVLNLLWNLAQSDDVPVDIMDLALSAHIKILDYS
              490       500       510       520       530       540

     540       550       560       570       580       590         
pF1KE3 CSQDRDTQKIQWIDRFIEELRTNDKWVIPALKQIREICSLFGEAPQNLSQTQRSPHVFYR
       ::::::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::.:::
CCDS14 CSQDRDAQKIQWIDHFIEELRTNDKWVIPALKQIREICSLFGEASQNLSQTQRSPHIFYR
              550       560       570       580       590       600

     600       610       620       630       640       650         
pF1KE3 HDLINQLQHNHALVTLVAENLATYMESMRLYARDHEDYDPQTVRLGSRYSHVQEVQERLN
       ::::::::.::::::::::::::::.:.:::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HDLINQLQQNHALVTLVAENLATYMNSIRLYAGDHEDYDPQTVRLGSRYSHVQEVQERLN
              610       620       630       640       650       660

     660       670       680       690       700       710         
pF1KE3 FLRFLLKDGQLWLCAPQAKQIWKCLAENAVYLCDREACFKWYSKLMGDEPDLDPDINKDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FLRFLLKDGQLWLCAPQAKQIWKCLAENAVYLCDREACFKWYSKLMGDEPDLDPDINKDF
              670       680       690       700       710       720

     720       730       740       750       760       770         
pF1KE3 FESNVLQLDPSLLTENGMKCFERFFKAVNCREGKLVAKRRAYMMDDLELIGLDYLWRVVI
       :::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::.:::::::::::::::::::
CCDS14 FESNVLQLDPSLLTENGMKCFERFFKAVNCRERKLIAKRRSYMMDDLELIGLDYLWRVVI
              730       740       750       760       770       780

     780       790       800       810       820       830         
pF1KE3 QSNDDIASRAIDLLKEIYTNLGPRLQVNQVVIHEDFIQSCFDRLKASYDTLCVLDGDKDS
       ::.:.::.:::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::.::::.:
CCDS14 QSSDEIANRAIDLLKEIYTNLGPRLKANQVVIHEDFIQSCFDRLKASYDTLCVFDGDKNS
              790       800       810       820       830       840

     840       850       860       870       880       890         
pF1KE3 VNCARQEAVRMVRVLTVLREYINECDSDYHEERTILPMSRAFRGKHLSFVVRFPNQGRQV
       .:::::::.::::::::..:::::::::::.:: ::::::::::::::..::::::::::
CCDS14 INCARQEAIRMVRVLTVIKEYINECDSDYHKERMILPMSRAFRGKHLSLIVRFPNQGRQV
              850       860       870       880       890       900

     900       910       920       930       940       950         
pF1KE3 DDLEVWSHTNDTIGSVRRCILNRIKANVAHTKIELFVGGELIDPADDRKLIGQLNLKDKS
       :.:..:::::::::::::::.::::::::: ::::::::::::  :::::::::::::::
CCDS14 DELDIWSHTNDTIGSVRRCIVNRIKANVAHKKIELFVGGELIDSEDDRKLIGQLNLKDKS
              910       920       930       940       950       960

     960       970       980       990      1000      1010         
pF1KE3 LITAKLTQISSNMPSSPDSSSDSSTGSPGNHGNHYSDGPNPEVESCLPGVIMSLHPRYIS
       :::::::::. ::::::::::::::.::::: :::.:::: ::::::::::::.::::::
CCDS14 LITAKLTQINFNMPSSPDSSSDSSTASPGNHRNHYNDGPNLEVESCLPGVIMSVHPRYIS
              970       980       990      1000      1010      1020

    1020      1030      1040      1050      1060      1070         
pF1KE3 FLWQVADLGSSLNMPPLRDGARVLMKLMPPDSTTIEKLRAICLDHAKLGESSLSPSLDSL
       ::::::::::.:::::::::::::::::::: :..:::::.:::::::::..::: ::::
CCDS14 FLWQVADLGSNLNMPPLRDGARVLMKLMPPDRTAVEKLRAVCLDHAKLGEGKLSPPLDSL
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

    1080      1090      1100      1110      1120      1130         
pF1KE3 FFGPSASQVLYLTEVVYALLMPAGAPLADDSSDFQFHFLKSGGLPLVLSMLTRNNFLPNA
       ::::::::::::::::::::::::.::.: ::::: ::::::::::::::: :::::::.
CCDS14 FFGPSASQVLYLTEVVYALLMPAGVPLTDGSSDFQVHFLKSGGLPLVLSMLIRNNFLPNT
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

    1140      1150      1160      1170      1180      1190         
pF1KE3 DMETRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPGVEGVNPMTQINQVTHDQAVVLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.:..:.:::::::::::::::
CCDS14 DMETRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPVVDGTDPITQINQVTHDQAVVLQ
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

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pF1KE3 SALQSIPNPSSECMLRNVSVRLAQQISDEASRYMPDICVIRAIQKIIWASGCGSLQLVFS
       :::::::::::::.::: :. :::.::.::::::::::::::::::::::.::.: ::::
CCDS14 SALQSIPNPSSECVLRNESILLAQEISNEASRYMPDICVIRAIQKIIWASACGALGLVFS
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

    1260       1270      1280      1290      1300      1310        
pF1KE3 PNEEITKIYE-KTNAGNEPDLEDEQVCCEALEVMTLCFALIPTALDALSKEKAWQTFIID
       :::::::::.  ::..:. ..:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS14 PNEEITKIYQMTTNGSNKLEVEDEQVCCEALEVMTLCFALLPTALDALSKEKAWQTFIID
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

     1320      1330      1340      1350      1360      1370        
pF1KE3 LLLHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTVLGSTARERAKHSGDYFTL
       ::::: ::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::::::..:.:::::::
CCDS14 LLLHCPSKTVRQLAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTILGSTAREKGKYSGDYFTL
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

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pF1KE3 LRHLLNYAYNSNINVPNAEVLLNNEIDWLKRIRDDVKRTGETGIEETILEGHLGVTKELL
       ::::::::::.:::.::::::: .::::::::::.:: :::::.:: :::::::::::::
CCDS14 LRHLLNYAYNGNINIPNAEVLLVSEIDWLKRIRDNVKNTGETGVEEPILEGHLGVTKELL
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

     1440      1450      1460      1470      1480      1490        
pF1KE3 AFQTSEKKFHIGCEKGGANLIKELIDDFIFPASNVYLQYMRNGELPAEQAIPVCGSPPTI
       ::::::::.:.::::::::::::::::::::::.:::::.:.::::::::::::.:: ::
CCDS14 AFQTSEKKYHFGCEKGGANLIKELIDDFIFPASKVYLQYLRSGELPAEQAIPVCSSPVTI
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pF1KE3 NAGFELLVALAVGCVRNLKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKGFVG
       :::::::::::.::::::::::: ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NAGFELLVALAIGCVRNLKQIVDCLTEMYYMGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKGFVG
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

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pF1KE3 LKNAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRDDVF
       :::::::::::::::::::::::::.::::::::::. ::: ::::::.:::::::::::
CCDS14 LKNAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNSILAIEGTGSDLHDDMFGDEKQDSESNVDPRDDVF
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

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pF1KE3 GYPQQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWGEPV
       :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS14 GYPHQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASQLQYYVPRGFWKQFRLWGEPV
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pF1KE3 NLREQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEESFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NLREQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAILSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEESFT
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pF1KE3 TLNVDIRNHQNLLDSLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAIQLK
       :::::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::: :::::::
CCDS14 TLNVDIRNHQNLLDSLEQYIKGDLLEGANAYHCEKCDKKVDTVKRLLIKKLPRVLAIQLK
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pF1KE3 RFDYDWERECAIKFNDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLEGDNVNPESQLIQQSEQSESETA
       :::::::::::::::::::::::::: ::::::::.:: :::: :..::.:.:::..:::
CCDS14 RFDYDWERECAIKFNDYFEFPRELDMGPYTVAGVANLERDNVNSENELIEQKEQSDNETA
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

     1860      1870      1880      1890      1900      1910        
pF1KE3 GSTKYRLVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEEMKN
       :.::::::::::::::::::::::::::::: : . ..::::::::::::::::::::::
CCDS14 GGTKYRLVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGKDDQTDHWYKFDDGDVTECKMDDDEEMKN
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

     1920      1930      1940      1950      1960      1970        
pF1KE3 QCFGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELAITTRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: ::.:::.:::::::.:. ::
CCDS14 QCFGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYEQMDMIDEDDEMIRYISELTIA-RP
             1930      1940      1950      1960      1970          

     1980      1990      2000      2010      2020      2030        
pF1KE3 HQIIMPSAIERSVRKQNVQFMHNRMQYSMEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLPEAE
       :::::  :::::::::::.:::::.:::.:::::.::::::::::::: ::::.::::::
CCDS14 HQIIMSPAIERSVRKQNVKFMHNRLQYSLEYFQFVKKLLTCNGVYLNPAPGQDYLLPEAE
    1980      1990      2000      2010      2020      2030         

     2040      2050      2060      2070      2080      2090        
pF1KE3 EITMISIQLAARFLFTTGFHTKKVVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFNVSN
       :::::::::::::::::::::::.::: :::::::::.::::::::::::.:::::::::
CCDS14 EITMISIQLAARFLFTTGFHTKKIVRGPASDWYDALCVLLRHSKNVRFWFTHNVLFNVSN
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pF1KE3 RFSEYLLECPSAEVRGAFAKLIVFIAHFSLQDGPCPSPFASPGPSSQAYDNLSLSDHLLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::: :::::::::::
CCDS14 RFSEYLLECPSAEVRGAFAKLIVFIAHFSLQDGSCPSPFASPGPSSQACDNLSLSDHLLR
    2100      2110      2120      2130      2140      2150         

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pF1KE3 AVLNLLRREVSEHGRHLQQYFNLFVMYANLGVAEKTQLLKLSVPATFMLVSLDEGPGPPI
       :.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS14 ATLNLLRREVSEHGHHLQQYFNLFVMYANLGVAEKTQLLKLNVPATFMLVSLDEGPGPPI
    2160      2170      2180      2190      2200      2210         

     2220      2230      2240      2250      2260      2270        
pF1KE3 KYQYAELGKLYSVVSQLIRCCNVSSRMQSSINGNPPLPNPFGDPNLSQPIMPIQQNVADI
       ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::: ::::::::::::: ::
CCDS14 KYQYAELGKLYSVVSQLIRCCNVSSTMQSSINGNPPLPNPFGDLNLSQPIMPIQQNVLDI
    2220      2230      2240      2250      2260      2270         

     2280      2290      2300      2310      2320      2330        
pF1KE3 LFVRTSYVKKIIEDCSNSEETVKLLRFCCWENPQFSSTVLSELLWQVAYSYTYELRPYLD
       :::::::::::::::::::.:.:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LFVRTSYVKKIIEDCSNSEDTIKLLRFCSWENPQFSSTVLSELLWQVAYSYTYELRPYLD
    2280      2290      2300      2310      2320      2330         

     2340      2350      2360      2370      2380      2390        
pF1KE3 LLLQILLIEDSWQTHRIHNALKGIPDDRDGLFDTIQRSKNHYQKRAYQCIKCMVALFSNC
       ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS14 LLFQILLIEDSWQTHRIHNALKGIPDDRDGLFDTIQRSKNHYQKRAYQCIKCMVALFSSC
    2340      2350      2360      2370      2380      2390         

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pF1KE3 PVAYQILQGNGDLKRKWTWAVEWLGDELERRPYTGNPQYTYNNWSPPVQSNETSNGYFLE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::::
CCDS14 PVAYQILQGNGDLKRKWTWAVEWLGDELERRPYTGNPQYSYNNWSPPVQSNETANGYFLE
    2400      2410      2420      2430      2440      2450         

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pF1KE3 RSHSARMTLAKACELCPEEEPDDQDAPDEHESPPPEDAPLYPHSPGSQYQQNNHVHGQPY
       :::::::::::::::::::::::::::::::  : ::::::::::.::::::::::::::
CCDS14 RSHSARMTLAKACELCPEEEPDDQDAPDEHEPSPSEDAPLYPHSPASQYQQNNHVHGQPY
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pF1KE3 TGPAAHHMNNPQRTGQRAQENYEGSEEVSPPQTKDQ
       :::::::.::::.::::.::::::.:::: :: :::
CCDS14 TGPAAHHLNNPQKTGQRTQENYEGNEEVSSPQMKDQ
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>>CCDS44154.2 USP24 gene_id:23358|Hs108|chr1              (2620 aa)
 initn: 1697 init1: 755 opt: 1164  Z-score: 1095.0  bits: 216.9 E(32554): 1.1e-54
Smith-Waterman score: 3545; 30.5% identity (59.1% similar) in 2702 aa overlap (6-2495:71-2593)

                                        10        20         30    
pF1KE3                          MTATTRGSPVGGNDNQGQAPD-GQSQPPLQQNQTS
                                     ::.  ::.:. : .:. : :      .  .
CCDS44 LTNERPGLDYGGYEPMDSGGGPSPGPGGGPRGD--GGGDGGGGGPSRGGSTG--GGGGFD
               50        60        70          80        90        

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pF1KE3 SPDSSNENSPATPPDEQGQGDAPPQLEDEEPAFPHTDLAKLDDMINRPRWVVPVLPKGEL
        : . .:   :   ::.:. ..      :   :: :.: .:.. .   .: .:   .  :
CCDS44 PPPAYHEVVDAEKNDENGNCSG------EGIEFPTTNLYELESRVLTDHWSIPYKREESL
        100       110             120       130       140       150

          100       110       120       130       140       150    
pF1KE3 EVLLEAAIDLSKKGLDVKSEACQRFFRDGLTISFTKILTDEAVSGWKFEIHRCIINNTHR
          : :.  :.. ::. ..: :.::.   .  .: :.::. ::  :  :::. : :    
CCDS44 GKCLLASTYLARLGLSESDENCRRFMDRCMPEAFKKLLTSSAVHKWGTEIHEGIYNMLML
              160       170       180       190       200       210

          160         170       180       190       200       210  
pF1KE3 LVELCVAKLSQDWFP--LLELLAMALNPHCKFHIYNGTRPCESVSSSVQLPEDELFARSP
       :.:: . ...:: .:  :: .:.::.::  ..:. :  .  .   . : . : ..:: ::
CCDS44 LIELVAERIKQDPIPTGLLGVLTMAFNPDNEYHFKNRMKVSQRNWAEV-FGEGNMFAVSP
              220       230       240       250        260         

               220       230       240       250       260         
pF1KE3 DP---RSPKGWLVDLLNKFGTLNGFQILHDRFINGSALNVQIIAALIKPFGQCYEFLTLH
            . :.::.:::.:::: :.::  .. . ...  ...  ..:::.:.: : :.:.  
CCDS44 VSTFQKEPHGWVVDLVNKFGELGGFAAIQAK-LHSEDIELGAVSALIQPLGVCAEYLNSS
     270       280       290       300        310       320        

     270       280       290       300       310       320         
pF1KE3 TVKKYFLPIIEMVPQFLENLTDEELKKEAKNEAKNDALSMIIKSLKNLASRVPGQEETVK
       .:. .. :.:  . : .... ...::     . .  ..  .....: :  :   : . : 
CCDS44 VVQPMLDPVILTTIQDVRSVEEKDLK-----DKRLVSIPELLSAVKLLCMRF--QPDLVT
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pF1KE3 NLEIFRLKMILRLLQISSFNGKMNALNEVNKVISSVSYYTHRHGNPEEEEWLTAERMAEW
        .. .:: ..::.:.   :..:::.:.::.:.: . .       .   .. . ..:. .:
CCDS44 IVDDLRLDILLRMLKSPHFSAKMNSLKEVTKLIEDSTL------SKSVKNAIDTDRLLDW
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pF1KE3 IQQNNILSIVLRDSLHQPQYVEKLEKILRFVIKEKALTLQDLDNIWAAQAGKHEAIVKNV
       . .:..:::.:. .. : :: .... :.... ..  :.:..: .::  :.:.  ....:.
CCDS44 LVENSVLSIALEGNIDQAQYCDRIKGIIELLGSK--LSLDELTKIWKIQSGQSSTVIENI
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pF1KE3 HDLLAKLAWDFSPEQLDHLFDCFKASWTNASKKQREKLLELIRRLAEDDKDGVMAHKVLN
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CCDS44 HTIIAAAAVKFNSDQLNHLFVLIQKSWETESDRVRQKLLSLIGRIGREARFETTSGKVLD
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pF1KE3 LLWNLAHSDDVPVDIMDLALSAHIKILDYSCSQDRDTQKIQWIDRFIEELRT--------
       .::.:::   .: .... ::  :. ::. . .  ... : ..: . ::...         
CCDS44 VLWELAHLPTLPSSLIQQALEEHLTILSDAYAV-KEAIKRSYIIKCIEDIKRPGEWSGLE
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pF1KE3 -NDK--------------WVIPALKQIREICSLFGEAPQNLSQTQRSPHVFYRHDLINQL
        : :              ::.:::.:..::   :    :. .. ..:        .:..:
CCDS44 KNKKDGFKSSQLNNPQFVWVVPALRQLHEITRSF--IKQTYQKQDKS--------IIQDL
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pF1KE3 QHNHALVTLVAENLATYMESMRLYAR-DHEDYDPQTVRLGSRYSHVQEVQERLNFLRFLL
       ..:  .: ::. .:   .   :: :          .. . .::.. . .. .:.:: :.:
CCDS44 KKNFEIVKLVTGSL---IACHRLAAAVAGPGGLSGSTLVDGRYTYREYLEAHLKFLAFFL
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pF1KE3 KDGQLWLCAPQAKQIWKCLAENAVYLC--DREACFKWYSKLMGDEPDLDPDINKDFFESN
       ... :.:   .::.::.::. .   .:  ::: ::.:..:    . ::. :.....:. .
CCDS44 QEATLYLGWNRAKEIWECLVTGQ-DVCELDREMCFEWFTK---GQHDLESDVQQQLFKEK
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pF1KE3 VLQLDPSLLTENGMKCFERFFKAVNCREGKLVAKRRAYMMDDLELIGLDYLWRVVIQSND
       .:.:.   .: ::.. :. ::. ::  . .:  .    ... :::::.:..:.....: :
CCDS44 ILKLESYEITMNGFNLFKTFFENVNLCDHRLKRQGAQLYVEKLELIGMDFIWKIAMESPD
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pF1KE3 D-IASRAIDLLKEI-YTNLGPRLQVNQVVIHEDFIQSCFDRLKASYDTL-------CVLD
       . ::..::.:. .  : ::.:::. ..: .:. :: .:. ::.:. ..:        :  
CCDS44 EEIANEAIQLIINYSYINLNPRLKKDSVSLHKKFIADCYTRLEAASSALGGPTLTHAVTR
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pF1KE3 GDK-------DSVNCARQEAVRMVRVLTVLR------EYINECDSDYHEERTILPMSRAF
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CCDS44 ATKMLTATAMPTVATSVQSPYRSTKLVIIERLLLLAERYVITIEDFYSVPRTILPHGASF
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pF1KE3 RGKHLSFVVRFPNQGRQVDDLEVWSHTNDTIGSVRRCILNRIKANVAHTKIELFVGGELI
       .:. :.. : . .     : . : .:.:.::::::  : ... . : .  :..:..  :.
CCDS44 HGHLLTLNVTYESTK---DTFTVEAHSNETIGSVRWKIAKQLCSPVDN--IQIFTNDSLL
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pF1KE3 DPADDRKLIGQLNLKDKSLITAKLTQISSNMPSSPDSSSDSSTGSPGNHGNHYSDGPNPE
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CCDS44 TVNKDQKLLHQLGFSDEQILTVKTSGSGTPSGSSADSSTSSSSSSSGVFSSSYA----ME
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pF1KE3 VESCLPGVIMSLHPRYISFLWQVADLGSSLNMPPLRDGARVLMKLMPPDSTTIEKL----
        :. ::::.:.:    ...:.:.:.    :. : .   .: :. :.: : .  : :    
CCDS44 QEKSLPGVVMALVCNVFDMLYQLAN----LEEPRITLRVRKLLLLIPTDPAIQEALDQLD
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pF1KE3 ---RAICLDHAKLGESSLSPSL--------------DSLF--FGPSAS--QVLYLTEVVY
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CCDS44 SLGRKKTLLSESSSQSSKSPSLSSKQQHQPSASSILESLFRSFAPGMSTFRVLYNLEVLS
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pF1KE3 ALLMP-AGAPLADD-SSDFQFHFLKSGGLPLVLSMLTRNNFLPNADMETRRGAYLNALKI
       . ::: :   .: . ...:  .:::.::: ::.... :...  ..:.:::.:.:   :..
CCDS44 SKLMPTADDDMARSCAKSFCENFLKAGGLSLVVNVMQRDSIPSEVDYETRQGVYSICLQL
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pF1KE3 AKLLLTAIGYGHVRAVAEA-CQPGVEGVN--PMTQINQVTHDQAVVLQSALQS------I
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CCDS44 ARFLL--VGQTMPTLLDEDLTKDGIEALSSRPFRNVSRQTSRQMSLCGTPEKSSYRQLSV
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pF1KE3 PNPSSECMLRNV-SVRLAQQISDEASRYMPDI-CVIRAIQKIIWASGCGSLQLVFS--PN
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CCDS44 SDRSSIRVEEIIPAARVAIQ-TMEVSDFTSTVACFMR----LSWAAAAGRLDLVGSSQPI
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pF1KE3 EEITKIYEK------TNAGN--------EP--------------DLEDEQVCCEALEVMT
       .: ...         ...:.        ::              . .:  .  ::: ...
CCDS44 KESNSLCPAGIRNRLSSSGSNCSSGSEGEPVALHAGICVRQQSVSTKDSLIAGEALSLLV
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pF1KE3 LCFALIPTALDALSKEKAWQTFIIDLLLHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGH----RP
        :. :    : .. .      ::::.::   :  .:.:: .:.. .      .:    .:
CCDS44 TCLQLRSQQLASFYNLPCVADFIIDILLGSPSAEIRRVACDQLYTLSQTDTSAHPDVQKP
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pF1KE3 LLFFITLLFT----------VLGSTARERAKHSGDYFTLLRHLLNYAYNSNINV--PNAE
         :.. ...:          .. .. ..  ..  .:: :  .::.   .:...    .  
CCDS44 NQFLLGVILTAQLPLWSPTSIMRGVNQRLLSQCMEYFDLRCQLLDDLTTSEMEQLRISPA
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pF1KE3 VLLNNEIDWLKRIRDDVKRTGETGIEETIL-EGHLGVTKELLAFQTSEKKFHIGCEKGGA
       ..:..:: ::  .. .     ::.  ..::  ::: . : ::..  .::      :  :.
CCDS44 TMLEDEITWLDNFEPNRTAECETSEADNILLAGHLRLIKTLLSLCGAEK------EMLGS
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pF1KE3 NLIKELIDDFIFPASNVYLQYMRNGELPAEQAI-------PVCGSPPTINAGFELLVALA
       .::: :.:::.: :: . :    :.. :: .:        : :..  .  :..:.:: ::
CCDS44 SLIKPLLDDFLFRASRIIL----NSHSPAGSAAISQQDFHPKCSTANSRLAAYEVLVMLA
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pF1KE3 VGCVRNLKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKGFVGLKNAGATCYMN
        .   ::. :.  :  :..      :     :..:::::  :  .:::::.:.:::::::
CCDS44 DSSPSNLQIIIKELLSMHHQPDPALT----KEFDYLPPVDSRSSSGFVGLRNGGATCYMN
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pF1KE3 SVIQQLYMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRDDVFGYPQQFEDKPA
       .:.::::: :.. ...:.       ::::       ::     : :.::           
CCDS44 AVFQQLYMQPGLPESLLS-------VDDDT------DN-----PDDSVF-----------
            1710             1720                 1730             

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pF1KE3 LSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWGEPVNLREQHDALEF
                :..      : .::::  :.::::::..::: :..:.. . .:::.:: ::
CCDS44 ---------YQV------QSLFGHLMESKLQYYVPENFWKIFKMWNKELYVREQQDAYEF
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pF1KE3 FNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEESFTTLNVDIRNHQN
       :.::.:..:: :: .:.  ...... : ..:::::. :::::: ::.: .::. . . :.
CCDS44 FTSLIDQMDEYLKKMGRDQIFKNTFQGIYSDQKICKDCPHRYEREEAFMALNLGVTSCQS
      1780      1790      1800      1810      1820      1830       

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pF1KE3 LLDSLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAIQLKRFDYDWERECA
       :  ::.:.:.:..:::.:::.::::..:  ::::  ::.:: ::.:.: :: .:::   .
CCDS44 LEISLDQFVRGEVLEGSNAYYCEKCKEKRITVKRTCIKSLPSVLVIHLMRFGFDWESGRS
      1840      1850      1860      1870      1880      1890       

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pF1KE3 IKFNDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLEGDN-VNPESQLIQQSE--QSESETAGSTKYRLV
       ::... ..::  :.::::::.:.:. .... :. ... ..:.   . ....: . .:.::
CCDS44 IKYDEQIRFPWMLNMEPYTVSGMARQDSSSEVGENGRSVDQGGGGSPRKKVALTENYELV
      1900      1910      1920      1930      1940      1950       

       1870      1880       1890      1900      1910      1920     
pF1KE3 GVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNG-GDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEEMKNQCFGGEY
       ::.:::::: .:::::.: .: : : :   .::::.:  . :  ..: : .. .::::::
CCDS44 GVIVHSGQAHAGHYYSFIKDRRGCGKG---KWYKFNDTVIEEFDLND-ETLEYECFGGEY
      1960      1970      1980         1990      2000       2010   

        1930      1940      1950      1960      1970               
pF1KE3 MGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELAI-----------
         .:.:.     . ::  :.::::.:::.:..  ::.. ..   :....           
CCDS44 RPKVYDQTNPYTDVRR--RYWNAYMLFYQRVS--DQNSPVLPKKSRVSVVRQEAEDLSLS
          2020        2030      2040        2050      2060         

                    1980                             1990      2000
pF1KE3 -----------TTRPHQ-------II----------------MPSAIERSVRKQNVQFMH
                  . :::.       :.                ::. : . :: .:..::.
CCDS44 APSSPEISPQSSPRPHRPNNDRLSILTKLVKKGEKKGLFVEKMPARIYQMVRDENLKFMK
    2070      2080      2090      2100      2110      2120         

             2010      2020      2030      2040      2050      2060
pF1KE3 NRMQYSMEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLPEAEEITMISIQLAARFLFTTGFHTK
       ::  :: .::.:. .: . :.. :. :       :    .. .:.::: .::: : ..::
CCDS44 NRDVYSSDYFSFVLSLASLNATKLKHP-----YYPC---MAKVSLQLAIQFLFQTYLRTK
    2130      2140      2150           2160         2170      2180 

             2070      2080      2090      2100       2110         
pF1KE3 KVVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFNVSNRFSE-YLLECPSAEVRGAFAKL
       : .: .. .:  ..  :: .: ..  :...  . . . .. . .::::   ::: : : .
CCDS44 KKLRVDTEEWIATIEALLSKSFDACQWLVEYFISSEGRELIKIFLLECNVREVRVAVATI
            2190      2200      2210      2220      2230      2240 

    2120      2130      2140       2150      2160      2170        
pF1KE3 IVFIAHFSLQDGPCPSPFASPGPSSQAY-DNLSLSDHLLRAVLNLLRREVSEHGRHLQQY
       .    . .:.             :.  : :.:.   .::...: :: ..: :. ..  ::
CCDS44 L----EKTLD-------------SALFYQDKLKSLHQLLEVLLALLDKDVPENCKNCAQY
                             2250      2260      2270      2280    

     2180       2190      2200      2210         2220          2230
pF1KE3 FNLFVMYAN-LGVAEKTQLLKLSVPATFMLVSLDEGPG---PPIKY----QYAELGKLYS
       : ::  ...  :.     ::. :  :   ..:.  : .     :.     :  :.:.:..
CCDS44 FFLFNTFVQKQGIRAGDLLLRHS--ALRHMISFLLGASRQNNQIRRWSSAQAREFGNLHN
         2290      2300        2310      2320      2330      2340  

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pF1KE3 VVSQLIRCCNVSSRMQSSINGNPPLPNPFGDPNLSQPIMPIQQNVADILFVRTS--YVKK
       .:. :.   .:::  : ..  .     :  .   :.:..:....:  .::.  .  :. .
CCDS44 TVALLVLHSDVSS--QRNVAPGIFKQRPPISIAPSSPLLPLHEEVEALLFMSEGKPYLLE
           2350        2360      2370      2380      2390      2400

     2290          2300      2310      2320      2330      2340    
pF1KE3 II----EDCSNSEETVKLLRFCCWENPQFSSTVLSELLWQVAYSYTYELRPYLDLLLQIL
       ..    :  ..    .... .::. : .:: :.:  .  :.  .  .::.  ..:: .::
CCDS44 VMFALRELTGSLLALIEMVVYCCFCNEHFSFTMLHFIKNQLETAPPHELKNTFQLLHEIL
             2410      2420      2430      2440      2450      2460

         2350      2360      2370      2380      2390      2400    
pF1KE3 LIEDSWQTHRIHNALKGIPDDRDGLFDTIQRSKNHYQKRAYQCIKCMVALFSNCPVAYQI
       .:::  :..:.    : . . ..::.  ...:..  ..: :::.: .:.: ..::.: . 
CCDS44 VIEDPIQVERV----KFVFETENGLLALMHHSNHVDSSRCYQCVKFLVTLAQKCPAAKEY
             2470          2480      2490      2500      2510      

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pF1KE3 LQGNGDLKRKWTWAVEWLGDELERRPYTGNPQYTYNNWSPPVQ-SNETSNGYFLERSHSA
       .. :.   ..:.:::.::           . ... . :.:  . :::::.:  ..:. ::
CCDS44 FKENS---HHWSWAVQWL-----------QKKMSEHYWTPQSNVSNETSTGKTFQRTISA
       2520         2530                 2540      2550      2560  

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pF1KE3 RMTLAKACELCPEEEPDDQDAPDEHESPPPEDAPLYPHSPGSQYQQNNHVHGQPYTGPAA
       . ::: :  :  :.: . ..  .:  ::  :.                            
CCDS44 QDTLAYATALLNEKEQSGSSNGSES-SPANENGDRHLQQGSESPMMIGELRSDLDDVDP 
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pF1KE3 HHMNNPQRTGQRAQENYEGSEEVSPPQTKDQ

>>CCDS42686.1 USP34 gene_id:9736|Hs108|chr2               (3546 aa)
 initn: 829 init1: 230 opt: 595  Z-score: 552.3  bits: 116.9 E(32554): 1.9e-24
Smith-Waterman score: 1055; 22.6% identity (51.0% similar) in 1948 aa overlap (510-2344:862-2611)

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pF1KE3 SKKQREKLLELIRRLAEDDKDGVMAHKVLNLLWNLAHSDDVPVDIMDLALSAHIKILDYS
                                     :::......:. :.. .  ..   :.:   
CCDS42 SQGPVVHKHQFNSNAVTDINLDNVCKKGNTLLWDIVQDEDA-VNLSEGLINEAEKLLCSL
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pF1KE3 CSQDRDTQ-KIQWIDRFIEELRTNDKWVIPALKQIREICSLFGEAPQNLSQTQRSPHVFY
            : : ....:.  .:.: .: . ::    ..: . .:::   :  :.       . 
CCDS42 VCWFTDRQIRMRFIEGCLENLGNNRSVVI----SLRLLPKLFGTFQQFGSS-------YD
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pF1KE3 RHDLINQLQHNHALVTLVAENLATYMESMRLYARDHEDYDPQTVRLGSRYSHVQEVQERL
        : .    ...  .. :  .::. :....:   . :           . :::  ::: ::
CCDS42 THWITMWAEKELNMMKLFFDNLVYYIQTVREGRQKH-----------ALYSHSAEVQVRL
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pF1KE3 NFLRFLLKD----GQLWLCAPQAKQIWKCLAENAVYLCDREACFKWYSKLM--GDEPDLD
       .::  ...      .. :   :.  .:.::.:..   :  .: ..:. . .   :.  . 
CCDS42 QFLTCVFSTLGSPDHFRLSLEQVDILWHCLVEDS--ECYDDA-LHWFLNQVRSKDQHAMG
      990      1000      1010      1020         1030      1040     

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pF1KE3 PDINKDFFESNVLQLDPSLLTENGMKCFERFFKAVNCREGKLVAKRRAY-MMDDLELIGL
        .  : .:  .. :: :  .. .:.. :...     :  ..:...  ::   .. :: :.
CCDS42 METYKHLFLEKMPQLKPETISMTGLNLFQHL-----CNLARLATS--AYDGCSNSELCGM
        1050      1060      1070           1080        1090        

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pF1KE3 DYLWRVVIQSND-DIASRAIDLLKEIYTNLGPRLQVNQVVIHEDFIQSCFDRLKASYDTL
       : .: ....... :..  ::. ..  : :    :. .:     .::..:.. :  . ..:
CCDS42 DQFWGIALRAQSGDVSRAAIQYINSYYINGKTGLEKEQ-----EFISKCMESLMIASSSL
     1100      1110      1120      1130           1140      1150   

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pF1KE3 CVLDGDKDSVNCARQEAVRMVRV-LTVLREYINECDSDYHEERT-ILPMSRAFRGKHLSF
          . .. :   . .... :... : ..:. .     ... : : :    .:.  :. :.
CCDS42 ---EQESHSSLMVIERGLLMLKTHLEAFRRRFAYHLRQWQIEGTGISSHLKALSDKQ-SL
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      890       900        910       920       930       940       
pF1KE3 VVRFPNQGRQVDD-LEVWSHTNDTIGSVRRCILNRIKANVAHTKIELFVGGELIDPADDR
        .:   :   . : . .  . .: ....:        :.:.:   .:    : :.   . 
CCDS42 PLRVVCQPAGLPDKMTIEMYPSDQVADLR--------AEVTHWYENL--QKEQINQQAQL
    1210      1220      1230              1240        1250         

       950         960       970         980       990       1000  
pF1KE3 KLIGQLNLKDK--SLITAKLTQISSN--MPSSPDSSSDSSTGSPGNHGNHYSDG-PNPEV
       . .:: : : .  . . . . .:::.  . .. : ..    :    .    : : :  : 
CCDS42 QEFGQSNRKGEFPGGLMGPVRMISSGHELTTDYDEKALHELGFKDMQMVFVSLGAPRRER
    1260      1270      1280      1290      1300      1310         

                          1010      1020      1030         1040    
pF1KE3 E--------SCLPG-------VIMSLHPRYISFLWQVADLGSSLNMPPLR---DGARVL-
       .        ::::        ... :.  ... :... .. .:.. :  .   : .. : 
CCDS42 KGEGVQLPASCLPPPQKDNIPMLLLLQEPHLTTLFDLLEMLASFKPPSGKVAVDDSESLR
    1320      1330      1340      1350      1360      1370         

             1050       1060             1070        1080      1090
pF1KE3 ---MKLMPPD-STTIEKLRAI---C----LDHAKLGESSLSPSLD--SLFFGPSASQVLY
          ..:   . :  . .:  .   :    .   .... . . ...   :.   :: ..::
CCDS42 CEELHLHAENLSRRVWELLMLLPTCPNMLMAFQNISDEQSNDGFNWKELLKIKSAHKLLY
    1380      1390      1400      1410      1420      1430         

             1100                   1110               1120        
pF1KE3 LTEVVYALLMP--------AGA-----PLADDSSDFQFH---------FLKSGGLPLVLS
         :.. ::  :        .:.     : .::::. : .         :. .:::  .: 
CCDS42 ALEIIEALGKPNRRIRRESTGSYSDLYPDSDDSSEDQVENSKNSWSCKFVAAGGLQQLLE
    1440      1450      1460      1470      1480      1490         

     1130      1140      1150       1160                 1170      
pF1KE3 MLTRNNFLPNADMETRRGAYLNALK-IAKLLLT--------AIGYGHVRA---VAEACQ-
       ... . . :. ..:.     :. :  . ::.           ..:  : :   .::. . 
CCDS42 IFNSGILEPK-EQESWTVWQLDCLACLLKLICQFAVDPSDLDLAYHDVFAWSGIAESHRK
    1500       1510      1520      1530      1540      1550        

               1180       1190        1200      1210      1220     
pF1KE3 ---PG----VEGVNPM-TQINQVTHDQAVVLQ--SALQSIPNPSSECMLRNVSVRLAQQI
          ::    . : .    .: ..:.   :..:  : .: .   :      :.. :. .  
CCDS42 RTWPGKSRKAAGDHAKGLHIPRLTEVFLVLVQGTSLIQRLM--SVAYTYDNLAPRVLKAQ
     1560      1570      1580      1590        1600      1610      

        1230      1240      1250      1260      1270      1280     
pF1KE3 SDEASRYMPDICVIRAIQKIIWASGCGSLQLVFSPNEEITKIYEKTNAGNEPDLEDEQVC
       ::. ::.  ..        . ::  :. ..  .. ....    .: .    :.   ..  
CCDS42 SDHRSRH--EVSHYSMWLLVSWAHCCSLVKSSLADSDHLQDWLKKLTLLI-PETAVRHES
       1620        1630      1640      1650      1660       1670   

        1290      1300      1310      1320      1330      1340     
pF1KE3 CEALEVMTLCFALIPTALDALSKEKAWQTFIIDLLLHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCM
       : .:  ..:      ..::.   ..  ..:    ::   :  .. . . : .        
CCDS42 CSGLYKLSL------SGLDG--GDSINRSF----LLLAASTLLKFLPDAQAL--------
          1680              1690          1700      1710           

        1350      1360      1370      1380      1390      1400     
pF1KE3 GHRPLLFFITLLFTVLGSTARERAKHSGDYFTLLRHLLNYAYNSNINVPNAEVLLNNEID
         .:. .       .:    .:       :: :: .:..     ::.. .:      ..:
CCDS42 --KPIRIDDYEEEPILKPGCKE-------YFWLLCKLVD-----NIHIKDASQTTLLDLD
            1720      1730             1740           1750         

        1410      1420       1430       1440      1450      1460   
pF1KE3 WLKRIRDDVKRTGET-GIEETILEGHLGVTKEL-LAFQTSEKKFHIGCEKGGANLIKELI
        : :   :  :. :    ..  .:   :.:  : :: .. ..:  .   . : .......
CCDS42 ALARHLADCIRSREILDHQDGNVEDD-GLTGLLRLATSVVKHKPPFKFSREGQEFLRDIF
    1760      1770      1780       1790      1800      1810        

           1470      1480      1490      1500      1510      1520  
pF1KE3 DD-FIFPASNVYLQYMRNGELPAEQAIPVCGSPPTINAGFELLVALAVGCVRNLKQIVDS
       .  :..:.            :  .:  : : :  .  :...::: .. : :.: . : . 
CCDS42 NLLFLLPS------------LKDRQQ-PKCKSHSSRAAAYDLLVEMVKGSVENYRLIHNW
     1820                  1830       1840      1850      1860     

           1530      1540      1550      1560      1570      1580  
pF1KE3 LTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKGFVGLKNAGATCYMNSVIQQLYMIPSIR
       .  ...        .:  .:.: :    :    :::: : :::::. :.::::::::  :
CCDS42 VMAQHM------QSHAPYKWDYWPHEDVRAECRFVGLTNLGATCYLASTIQQLYMIPEAR
        1870            1880      1890      1900      1910         

           1590      1600      1610      1620      1630      1640  
pF1KE3 NGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRDDVFGYPQQFEDKPALSKTEDRKEYNIG
       ..... . .     .::.                               ::         
CCDS42 QAVFTAKYS-----EDMK------------------------------HKT---------
    1920           1930                                            

           1650      1660      1670      1680      1690      1700  
pF1KE3 VLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWGEPVNLREQHDALEFFNSLVDSLDEALK
       .: .:: .: .:  :. . : :: : : . .  .:.:  ::.:  :::..:. ...:   
CCDS42 TLLELQKMFTYLMESECKAYNPRPFCKTYTMDKQPLNTGEQKDMTEFFTDLITKIEEMSP
        1940      1950      1960      1970      1980      1990     

           1710      1720      1730      1740      1750      1760  
pF1KE3 ALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEESFTTLNVDIRNHQNLLDSLEQYVKGDL
        : .   .....:: .... .   : :  .  : : :.  .. . .:. .::.. .  : 
CCDS42 ELKN--TVKSLFGGVITNNVVSLDCEHVSQTAEEFYTVRCQVADMKNIYESLDEVTIKDT
          2000      2010      2020      2030      2040      2050   

           1770      1780      1790      1800      1810      1820  
pF1KE3 LEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAIQLKRFDYDWERECAIKFNDYFEFPREL
       ::: : : : .:.::: . ::  .:::: .:...  :. ..       : : .: :: .:
CCDS42 LEGDNMYTCSHCGKKVRAEKRACFKKLPRILSFNTMRYTFNMVTMMKEKVNTHFSFPLRL
          2060      2070      2080      2090      2100      2110   

           1830      1840        1850      1860      1870      1880
pF1KE3 DMEPYTVAGVAKLEGDNVNPES--QLIQQSEQSESETAGSTKYRLVGVLVHSGQASGGHY
       :: :::      : : .   :.  .. ..:..:::      .: :.:: ::.: :.::::
CCDS42 DMTPYTEDF---LMGKSERKEGFKEVSDHSKDSESY-----EYDLIGVTVHTGTADGGHY
          2120         2130      2140           2150      2160     

              1890      1900      1910      1920      1930         
pF1KE3 YSYIIQ-RNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEEMKNQCFGGEYMGEVFDHMM-KRMS
       ::.: .  :    . :.:: :.:..:   :  :. .. ..:::::.  ...: .  : :.
CCDS42 YSFIRDIVNPHAYKNNKWYLFNDAEV---KPFDSAQLASECFGGEMTTKTYDSVTDKFMD
        2170      2180      2190         2200      2210      2220  

     1940      1950      1960      1970      1980      1990        
pF1KE3 YRRQKRWWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELAITTRPHQIIMPSAIERSVRKQNVQF
       .  .:   .::.:::.::.  ...              : ... . : . . . ..:.::
CCDS42 FSFEKTH-SAYMLFYKRMEPEEENG-------------REYKFDVSSELLEWIWHDNMQF
            2230      2240                   2250      2260        

     2000      2010      2020      2030      2040      2050        
pF1KE3 MHNRMQYSMEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLPEAEEITMISIQLAARFLFTTGFH
       ....  .   :: :: .: .:        :.    ::. . ..... .:.. :.. : .:
CCDS42 LQDKNIFEHTYFGFMWQLCSCI-------PST---LPDPKAVSLMTAKLSTSFVLETFIH
     2270      2280      2290                2300      2310        

     2060      2070      2080      2090      2100      2110        
pF1KE3 TKKVVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFNVSNRFSEYLLECPSAEVRGAFAK
       .:.  . .  .: . :   . .:. .  ::  . . . .    . :..::.  ::  : .
CCDS42 SKE--KPTMLQWIELLTKQFNNSQAACEWFL-DRMADDDWWPMQILIKCPNQIVRQMFQR
     2320        2330      2340       2350      2360      2370     

     2120              2130      2140      2150      2160      2170
pF1KE3 LIVFI--------AHFSLQDGPCPSPFASPGPSSQAYDNLSLSDHLLRAVLNLLRREVSE
       : . .        ::. :: :   .   .   : .   . :   ...:..: .... :. 
CCDS42 LCIHVIQRLRPVHAHLYLQPG-MEDGSDDMDTSVEDIGGRSCVTRFVRTLLLIMEHGVKP
        2380      2390       2400      2410      2420      2430    

             2180      2190      2200      2210        2220        
pF1KE3 HGRHLQQYFNLFVMYANLGVAEKTQLLKLSVPATFMLVSLD-EGP-GPPIKYQYAELGKL
       :..:: .:: ..  .:..:  :.  ::.:.. .:..   .  .:: .: ..    : :. 
CCDS42 HSKHLTEYFAFLYEFAKMGEEESQFLLSLQAISTMVHFYMGTKGPENPQVEVLSEEEGEE
         2440      2450      2460      2470      2480      2490    

     2230      2240      2250      2260      2270       2280       
pF1KE3 YSVVSQLIRCCNVSSRMQSSINGNPPLPNPFGDPNLSQPIMPIQQ-NVADILFVRT-SYV
            ...   . . :  ....    :   . . . :.  . ..: ..: .   .   ..
CCDS42 EEEEEDILSLAEEKYR-PAALEKMIALVALLVEQSRSERHLTLSQTDMAALTGGKGFPFL
         2500      2510       2520      2530      2540      2550   

       2290      2300      2310      2320      2330      2340      
pF1KE3 KKIIEDCSNSEETVKLLRFCCWENPQFSSTVLSELLWQVAYSYTYELRPYLDLLLQILLI
        . :.:  : ..: .:.   :  : ...  ..: :. ..:        :.. :: ...  
CCDS42 FQHIRDGINIRQTCNLIFSLCRYNNRLAEHIVSMLFTSIAKLTPEAANPFFKLLTMLMEF
          2560      2570      2580      2590      2600      2610   

       2350      2360      2370      2380      2390      2400      
pF1KE3 EDSWQTHRIHNALKGIPDDRDGLFDTIQRSKNHYQKRAYQCIKCMVALFSNCPVAYQILQ
                                                                   
CCDS42 AGGPPGMPPFASYILQRIWEVIEYNPSQCLDWLAVQTPRNKLAHSWVLQNMENWVERFLL
          2620      2630      2640      2650      2660      2670   

>>CCDS44084.1 USP48 gene_id:84196|Hs108|chr1              (485 aa)
 initn: 366 init1: 225 opt: 342  Z-score: 325.7  bits: 72.1 E(32554): 8.1e-12
Smith-Waterman score: 452; 26.4% identity (52.4% similar) in 473 aa overlap (1546-2011:78-477)

        1520      1530      1540      1550      1560      1570     
pF1KE3 LKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKGFVGLKNAGATCYMNSVIQQL
                                     :    :  ..:::: : :::::.:. .:  
CCDS44 CKGNPNCLVGIGEHIWLGEIDENSFHNIDDPNCERRKKNSFVGLTNLGATCYVNTFLQVW
        50        60        70        80        90       100       

        1580      1590      1600      1610      1620      1630     
pF1KE3 YMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRDDVFGYPQQFEDKPALSKTED
       ..   .:...    .: ::    : ::  :. :.. .:.                     
CCDS44 FLNLELRQALYLCPSTCSDY---MLGDGIQE-EKDYEPQT--------------------
       110       120          130        140                       

        1640      1650      1660      1670      1680      1690     
pF1KE3 RKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWGEPVNLREQHDALEFFNSLVD
              . .::: .:. :  :  .:  : :: : . :     .  .:.:: :: . ...
CCDS44 -------ICEHLQYLFALLQNSNRRYIDPSGFVKALGL-----DTGQQQDAQEFSKLFMS
                  150       160       170            180       190 

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pF1KE3 SLDEALKALGHP---AMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEESFTTLNVDIRNHQNLLD
        :...:.   .:    .... . : .:   .:. : .. .   .:  :...:..:..: :
CCDS44 LLEDTLSKQKNPDVRNIVQQQFCGEYAYVTVCNQCGRESKLLSKFYELELNIQGHKQLTD
             200       210       220       230       240       250 

           1760      1770      1780      1790      1800      1810  
pF1KE3 SLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAIQLKRFDYDWERECAIKF
        . ...: . ::: : : ::.:..: ...... . .:: .: .:: :: .: .     :.
CCDS44 CISEFLKEEKLEGDNRYFCENCQSKQNATRKIRLLSLPCTLNLQLMRFVFDRQTGHKKKL
             260       270       280       290       300       310 

           1820      1830      1840      1850      1860      1870  
pF1KE3 NDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLEGDNVNPESQLIQQSEQSESETAGSTKYRLVGVLVHS
       : :. : . ::::::.                           . .::  :.: .::.: 
CCDS44 NTYIGFSEILDMEPYV--------------------------EHKGGSYVYELSAVLIHR
             320                                 330       340     

            1880      1890      1900      1910      1920      1930 
pF1KE3 G-QASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEEMKNQCFGGEYMGEVFD
       : .: .::: ...      : . ..::::.: :.   ::   :  : :    : ..:   
CCDS44 GVSAYSGHYIAHV-----KDPQSGEWYKFNDEDIE--KM---EGKKLQLGIEEDLAEPSK
         350            360       370            380       390     

            1940       1950      1960      1970       1980         
pF1KE3 HMMKRMSYRRQKR-WWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELA-ITTRPHQIIMPSAIER
        . .. .  .  .   :::.: : :..: .. .  ..  . :  .. : .. .    :: 
CCDS44 SQTRKPKCGKGTHCSRNAYMLVY-RLQTQEKPNTTVQVPAFLQELVDRDNSKFEEWCIEM
         400       410        420       430       440       450    

    1990       2000      2010      2020      2030      2040        
pF1KE3 S-VRKQNVQFMHNRMQYSMEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLPEAEEITMISIQLA
       . .:::.:.  . . .   : .:                                     
CCDS44 AEMRKQSVDKGKAKHEEVKELYQRLPAGAGL                             
          460       470       480                                  

>>CCDS81277.1 USP48 gene_id:84196|Hs108|chr1              (983 aa)
 initn: 366 init1: 225 opt: 342  Z-score: 320.8  bits: 72.2 E(32554): 1.5e-11
Smith-Waterman score: 452; 26.4% identity (52.4% similar) in 473 aa overlap (1546-2011:78-477)

        1520      1530      1540      1550      1560      1570     
pF1KE3 LKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKGFVGLKNAGATCYMNSVIQQL
                                     :    :  ..:::: : :::::.:. .:  
CCDS81 CKGNPNCLVGIGEHIWLGEIDENSFHNIDDPNCERRKKNSFVGLTNLGATCYVNTFLQVW
        50        60        70        80        90       100       

        1580      1590      1600      1610      1620      1630     
pF1KE3 YMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRDDVFGYPQQFEDKPALSKTED
       ..   .:...    .: ::    : ::  :. :.. .:.                     
CCDS81 FLNLELRQALYLCPSTCSDY---MLGDGIQE-EKDYEPQT--------------------
       110       120          130        140                       

        1640      1650      1660      1670      1680      1690     
pF1KE3 RKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWGEPVNLREQHDALEFFNSLVD
              . .::: .:. :  :  .:  : :: : . :     .  .:.:: :: . ...
CCDS81 -------ICEHLQYLFALLQNSNRRYIDPSGFVKALGL-----DTGQQQDAQEFSKLFMS
                  150       160       170            180       190 

        1700         1710      1720      1730      1740      1750  
pF1KE3 SLDEALKALGHP---AMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEESFTTLNVDIRNHQNLLD
        :...:.   .:    .... . : .:   .:. : .. .   .:  :...:..:..: :
CCDS81 LLEDTLSKQKNPDVRNIVQQQFCGEYAYVTVCNQCGRESKLLSKFYELELNIQGHKQLTD
             200       210       220       230       240       250 

           1760      1770      1780      1790      1800      1810  
pF1KE3 SLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAIQLKRFDYDWERECAIKF
        . ...: . ::: : : ::.:..: ...... . .:: .: .:: :: .: .     :.
CCDS81 CISEFLKEEKLEGDNRYFCENCQSKQNATRKIRLLSLPCTLNLQLMRFVFDRQTGHKKKL
             260       270       280       290       300       310 

           1820      1830      1840      1850      1860      1870  
pF1KE3 NDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLEGDNVNPESQLIQQSEQSESETAGSTKYRLVGVLVHS
       : :. : . ::::::.                           . .::  :.: .::.: 
CCDS81 NTYIGFSEILDMEPYV--------------------------EHKGGSYVYELSAVLIHR
             320                                 330       340     

            1880      1890      1900      1910      1920      1930 
pF1KE3 G-QASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEEMKNQCFGGEYMGEVFD
       : .: .::: ...      : . ..::::.: :.   ::   :  : :    : ..:   
CCDS81 GVSAYSGHYIAHV-----KDPQSGEWYKFNDEDIE--KM---EGKKLQLGIEEDLAEPSK
         350            360       370            380       390     

            1940       1950      1960      1970       1980         
pF1KE3 HMMKRMSYRRQKR-WWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELA-ITTRPHQIIMPSAIER
        . .. .  .  .   :::.: : :..: .. .  ..  . :  .. : .. .    :: 
CCDS81 SQTRKPKCGKGTHCSRNAYMLVY-RLQTQEKPNTTVQVPAFLQELVDRDNSKFEEWCIEM
         400       410        420       430       440       450    

    1990       2000      2010      2020      2030      2040        
pF1KE3 S-VRKQNVQFMHNRMQYSMEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLPEAEEITMISIQLA
       . .:::.:.  . . .   : .:                                     
CCDS81 AEMRKQSVDKGKAKHEEVKELYQRLPAGAEPYEFVSLEWLQKWLDESTPTKPIDNHACLC
          460       470       480       490       500       510    

>>CCDS30623.1 USP48 gene_id:84196|Hs108|chr1              (1035 aa)
 initn: 366 init1: 225 opt: 342  Z-score: 320.4  bits: 72.2 E(32554): 1.6e-11
Smith-Waterman score: 452; 26.4% identity (52.4% similar) in 473 aa overlap (1546-2011:78-477)

        1520      1530      1540      1550      1560      1570     
pF1KE3 LKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKGFVGLKNAGATCYMNSVIQQL
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pF1KE3 YMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRDDVFGYPQQFEDKPALSKTED
       ..   .:...    .: ::    : ::  :. :.. .:.                     
CCDS30 FLNLELRQALYLCPSTCSDY---MLGDGIQE-EKDYEPQT--------------------
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pF1KE3 RKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWGEPVNLREQHDALEFFNSLVD
              . .::: .:. :  :  .:  : :: : . :     .  .:.:: :: . ...
CCDS30 -------ICEHLQYLFALLQNSNRRYIDPSGFVKALGL-----DTGQQQDAQEFSKLFMS
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        :...:.   .:    .... . : .:   .:. : .. .   .:  :...:..:..: :
CCDS30 LLEDTLSKQKNPDVRNIVQQQFCGEYAYVTVCNQCGRESKLLSKFYELELNIQGHKQLTD
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pF1KE3 SLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAIQLKRFDYDWERECAIKF
        . ...: . ::: : : ::.:..: ...... . .:: .: .:: :: .: .     :.
CCDS30 CISEFLKEEKLEGDNRYFCENCQSKQNATRKIRLLSLPCTLNLQLMRFVFDRQTGHKKKL
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pF1KE3 NDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLEGDNVNPESQLIQQSEQSESETAGSTKYRLVGVLVHS
       : :. : . ::::::.                           . .::  :.: .::.: 
CCDS30 NTYIGFSEILDMEPYV--------------------------EHKGGSYVYELSAVLIHR
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pF1KE3 G-QASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEEMKNQCFGGEYMGEVFD
       : .: .::: ...      : . ..::::.: :.   ::   :  : :    : ..:   
CCDS30 GVSAYSGHYIAHV-----KDPQSGEWYKFNDEDIE--KM---EGKKLQLGIEEDLAEPSK
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pF1KE3 HMMKRMSYRRQKR-WWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELA-ITTRPHQIIMPSAIER
        . .. .  .  .   :::.: : :..: .. .  ..  . :  .. : .. .    :: 
CCDS30 SQTRKPKCGKGTHCSRNAYMLVY-RLQTQEKPNTTVQVPAFLQELVDRDNSKFEEWCIEM
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