Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3826
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3826, 2671 aa
1>>>pF1KE3826 2671 - 2671 aa - 2671 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8709+/-0.00131; mu= 23.2869+/- 0.079
mean_var=74.3032+/-13.994, 0's: 0 Z-trim(99.8): 46 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.148789
statistics sampled from 5937 (5953) to 5937 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.493), E-opt: 0.2 (0.178), width: 16
Scan time: 3.760
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS4783.1 ITPR3 gene_id:3710|Hs109|chr6 (2671) 17552 3778.8 0
CCDS41764.1 ITPR2 gene_id:3709|Hs109|chr12 (2701) 5318 1152.7 0
CCDS46740.2 ITPR1 gene_id:3708|Hs109|chr3 (2710) 5009 1086.4 0
CCDS54551.1 ITPR1 gene_id:3708|Hs109|chr3 (2743) 4447 965.7 0
CCDS54550.1 ITPR1 gene_id:3708|Hs109|chr3 (2695) 4231 919.4 0
CCDS42563.1 RYR1 gene_id:6261|Hs109|chr19 (5033) 458 109.6 4.6e-22
CCDS33011.1 RYR1 gene_id:6261|Hs109|chr19 (5038) 458 109.6 4.7e-22
CCDS55691.1 RYR2 gene_id:6262|Hs109|chr1 (4967) 455 108.9 7.2e-22
CCDS58351.1 RYR3 gene_id:6263|Hs109|chr15 (4865) 451 108.1 1.3e-21
CCDS45210.1 RYR3 gene_id:6263|Hs109|chr15 (4870) 451 108.1 1.3e-21
>>CCDS4783.1 ITPR3 gene_id:3710|Hs109|chr6 (2671 aa)
initn: 17552 init1: 17552 opt: 17552 Z-score: 20344.8 bits: 3778.8 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 17552; 100.0% identity (100.0% similar) in 2671 aa overlap (1-2671:1-2671)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSEMSSFLHIGDIVSLYAEGSVNGFISTLGLVDDRCVVEPAAGDLDNPPKKFRDCLFKVC
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CCDS47 MSEMSSFLHIGDIVSLYAEGSVNGFISTLGLVDDRCVVEPAAGDLDNPPKKFRDCLFKVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PMNRYSAQKQYWKAKQTKQDKEKIADVVLLQKLQHAAQMEQKQNDTENKKVHGDVVKYGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PMNRYSAQKQYWKAKQTKQDKEKIADVVLLQKLQHAAQMEQKQNDTENKKVHGDVVKYGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VIQLLHMKSNKYLTVNKRLPALLEKNAMRVTLDATGNEGSWLFIQPFWKLRSNGDNVVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VIQLLHMKSNKYLTVNKRLPALLEKNAMRVTLDATGNEGSWLFIQPFWKLRSNGDNVVVG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 DKVILNPVNAGQPLHASNYELSDNAGCKEVNSVNCNTSWKINLFMQFRDHLEEVLKGGDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DKVILNPVNAGQPLHASNYELSDNAGCKEVNSVNCNTSWKINLFMQFRDHLEEVLKGGDV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VRLFHAEQEKFLTCDEYKGKLQVFLRTTLRQSATSATSSNALWEVEVVHHDPCRGGAGHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VRLFHAEQEKFLTCDEYKGKLQVFLRTTLRQSATSATSSNALWEVEVVHHDPCRGGAGHW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 NGLYRFKHLATGNYLAAEENPSYKGDASDPKAAGMGAQGRTGRRNAGEKIKYCLVAVPHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NGLYRFKHLATGNYLAAEENPSYKGDASDPKAAGMGAQGRTGRRNAGEKIKYCLVAVPHG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 NDIASLFELDPTTLQKTDSFVPRNSYVRLRHLCTNTWIQSTNVPIDIEEERPIRLMLGTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NDIASLFELDPTTLQKTDSFVPRNSYVRLRHLCTNTWIQSTNVPIDIEEERPIRLMLGTC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 PTKEDKEAFAIVSVPVSEIRDLDFANDASSMLASAVEKLNEGFISQNDRRFVIQLLEDLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PTKEDKEAFAIVSVPVSEIRDLDFANDASSMLASAVEKLNEGFISQNDRRFVIQLLEDLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 FFVSDVPNNGQNVLDIMVTKPNRERQKLMREQNILKQVFGILKAPFREKGGEGPLVRLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FFVSDVPNNGQNVLDIMVTKPNRERQKLMREQNILKQVFGILKAPFREKGGEGPLVRLEE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 LSDQKNAPYQHMFRLCYRVLRHSQEDYRKNQEHIAKQFGMMQSQIGYDILAEDTITALLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSDQKNAPYQHMFRLCYRVLRHSQEDYRKNQEHIAKQFGMMQSQIGYDILAEDTITALLH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 NNRKLLEKHITKTEVETFVSLVRKNREPRFLDYLSDLCVSNHIAIPVTQELICKCVLDPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NNRKLLEKHITKTEVETFVSLVRKNREPRFLDYLSDLCVSNHIAIPVTQELICKCVLDPK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 NSDILIRTELRPVKEMAQSHEYLSIEYSEEEVWLTWTDKNNEHHEKSVRQLAQEARAGNA
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CCDS47 NSDILIRTELRPVKEMAQSHEYLSIEYSEEEVWLTWTDKNNEHHEKSVRQLAQEARAGNA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 HDENVLSYYRYQLKLFARMCLDRQYLAIDEISQQLGVDLIFLCMADEMLPFDLRASFCHL
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CCDS47 HDENVLSYYRYQLKLFARMCLDRQYLAIDEISQQLGVDLIFLCMADEMLPFDLRASFCHL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 MLHVHVDRDPQELVTPVKFARLWTEIPTAITIKDYDSNLNASRDDKKNKFANTMEFVEDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MLHVHVDRDPQELVTPVKFARLWTEIPTAITIKDYDSNLNASRDDKKNKFANTMEFVEDY
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 LNNVVSEAVPFANEEKNKLTFEVVSLAHNLIYFGFYSFSELLRLTRTLLGIIDCVQGPPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LNNVVSEAVPFANEEKNKLTFEVVSLAHNLIYFGFYSFSELLRLTRTLLGIIDCVQGPPA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 MLQAYEDPGGKNVRRSIQGVGHMMSTMVLSRKQSVFSAPSLSAGASAAEPLDRSKFEENE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MLQAYEDPGGKNVRRSIQGVGHMMSTMVLSRKQSVFSAPSLSAGASAAEPLDRSKFEENE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 DIVVMETKLKILEILQFILNVRLDYRISYLLSVFKKEFVEVFPMQDSGADGTAPAFDSTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DIVVMETKLKILEILQFILNVRLDYRISYLLSVFKKEFVEVFPMQDSGADGTAPAFDSTT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 ANMNLDRIGEQAEAMFGVGKTSSMLEVDDEGGRMFLRVLIHLTMHDYAPLVSGALQLLFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ANMNLDRIGEQAEAMFGVGKTSSMLEVDDEGGRMFLRVLIHLTMHDYAPLVSGALQLLFK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 HFSQRQEAMHTFKQVQLLISAQDVENYKVIKSELDRLRTMVEKSELWVDKKGSGKGEEVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HFSQRQEAMHTFKQVQLLISAQDVENYKVIKSELDRLRTMVEKSELWVDKKGSGKGEEVE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 AGAAKDKKERPTDEEGFLHPPGEKSSENYQIVKGILERLNKMCGVGEQMRKKQQRLLKNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AGAAKDKKERPTDEEGFLHPPGEKSSENYQIVKGILERLNKMCGVGEQMRKKQQRLLKNM
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 DAHKVMLDLLQIPYDKGDAKMMEILRYTHQFLQKFCAGNPGNQALLHKHLHLFLTPGLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DAHKVMLDLLQIPYDKGDAKMMEILRYTHQFLQKFCAGNPGNQALLHKHLHLFLTPGLLE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 AETMQHIFLNNYQLCSEISEPVLQHFVHLLATHGRHVQYLDFLHTVIKAEGKYVKKCQDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AETMQHIFLNNYQLCSEISEPVLQHFVHLLATHGRHVQYLDFLHTVIKAEGKYVKKCQDM
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 IMTELTNAGDDVVVFYNDKASLAHLLDMMKAARDGVEDHSPLMYHISLVDLLAACAEGKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IMTELTNAGDDVVVFYNDKASLAHLLDMMKAARDGVEDHSPLMYHISLVDLLAACAEGKN
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 VYTEIKCTSLLPLEDVVSVVTHEDCITEVKMAYVNFVNHCYVDTEVEMKEIYTSNHIWTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VYTEIKCTSLLPLEDVVSVVTHEDCITEVKMAYVNFVNHCYVDTEVEMKEIYTSNHIWTL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE3 FENFTLDMARVCSKREKRVADPTLEKYVLSVVLDTINAFFSSPFSENSTSLQTHQTIVVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FENFTLDMARVCSKREKRVADPTLEKYVLSVVLDTINAFFSSPFSENSTSLQTHQTIVVQ
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE3 LLQSTTRLLECPWLQQQHKGSVEACIRTLAMVAKGRAILLPMDLDAHISSMLSSGASCAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LLQSTTRLLECPWLQQQHKGSVEACIRTLAMVAKGRAILLPMDLDAHISSMLSSGASCAA
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE3 AAQRNASSYKATTRAFPRVTPTANQWDYKNIIEKLQDIITALEERLKPLVQAELSVLVDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AAQRNASSYKATTRAFPRVTPTANQWDYKNIIEKLQDIITALEERLKPLVQAELSVLVDV
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE3 LHWPELLFLEGSEAYQRCESGGFLSKLIQHTKDLMESEEKLCIKVLRTLQQMLLKKTKYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LHWPELLFLEGSEAYQRCESGGFLSKLIQHTKDLMESEEKLCIKVLRTLQQMLLKKTKYG
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE3 DRGNQLRKMLLQNYLQNRKSTSRGDLPDPIGTGLDPDWSAIAATQCRLDKEGATKLVCDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DRGNQLRKMLLQNYLQNRKSTSRGDLPDPIGTGLDPDWSAIAATQCRLDKEGATKLVCDL
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE3 ITSTKNEKIFQESIGLAIHLLDGGNTEIQKSFHNLMMSDKKSERFFKVLHDRMKRAQQET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ITSTKNEKIFQESIGLAIHLLDGGNTEIQKSFHNLMMSDKKSERFFKVLHDRMKRAQQET
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE3 KSTVAVNMNDLGSQPHEDREPVDPTTKGRVASFSIPGSSSRYSLGPSLRRGHEVSERVQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KSTVAVNMNDLGSQPHEDREPVDPTTKGRVASFSIPGSSSRYSLGPSLRRGHEVSERVQS
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE3 SEMGTSVLIMQPILRFLQLLCENHNRDLQNFLRCQNNKTNYNLVCETLQFLDIMCGSTTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SEMGTSVLIMQPILRFLQLLCENHNRDLQNFLRCQNNKTNYNLVCETLQFLDIMCGSTTG
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE3 GLGLLGLYINEDNVGLVIQTLETLTEYCQGPCHENQTCIVTHESNGIDIITALILNDISP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GLGLLGLYINEDNVGLVIQTLETLTEYCQGPCHENQTCIVTHESNGIDIITALILNDISP
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE3 LCKYRMDLVLQLKDNASKLLLALMESRHDSENAERILISLRPQELVDVIKKAYLQEEERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LCKYRMDLVLQLKDNASKLLLALMESRHDSENAERILISLRPQELVDVIKKAYLQEEERE
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KE3 NSEVSPREVGHNIYILALQLSRHNKQLQHLLKPVKRIQEEEAEGISSMLSLNNKQLSQML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NSEVSPREVGHNIYILALQLSRHNKQLQHLLKPVKRIQEEEAEGISSMLSLNNKQLSQML
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KE3 KSSAPAQEEEEDPLAYYENHTSQIEIVRQDRSMEQIVFPVPGICQFLTEETKHRLFTTTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KSSAPAQEEEEDPLAYYENHTSQIEIVRQDRSMEQIVFPVPGICQFLTEETKHRLFTTTE
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KE3 QDEQGSKVSDFFDQSSFLHNEMEWQRKLRSMPLIYWFSRRMTLWGSISFNLAVFINIIIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QDEQGSKVSDFFDQSSFLHNEMEWQRKLRSMPLIYWFSRRMTLWGSISFNLAVFINIIIA
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KE3 FFYPYMEGASTGVLDSPLISLLFWILICFSIAALFTKRYSIRPLIVALILRSIYYLGIGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FFYPYMEGASTGVLDSPLISLLFWILICFSIAALFTKRYSIRPLIVALILRSIYYLGIGP
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KE3 TLNILGALNLTNKIVFVVSFVGNRGTFIRGYKAMVMDMEFLYHVGYILTSVLGLFAHELF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TLNILGALNLTNKIVFVVSFVGNRGTFIRGYKAMVMDMEFLYHVGYILTSVLGLFAHELF
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KE3 YSILLFDLIYREETLFNVIKSVTRNGRSILLTALLALILVYLFSIVGFLFLKDDFILEVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YSILLFDLIYREETLFNVIKSVTRNGRSILLTALLALILVYLFSIVGFLFLKDDFILEVD
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KE3 RLPNNHSTASPLGMPHGAAAFVDTCSGDKMDCVSGLSVPEVLEEDRELDSTERACDTLLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RLPNNHSTASPLGMPHGAAAFVDTCSGDKMDCVSGLSVPEVLEEDRELDSTERACDTLLM
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KE3 CIVTVMNHGLRNGGGVGDILRKPSKDESLFPARVVYDLLFFFIVIIIVLNLIFGVIIDTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CIVTVMNHGLRNGGGVGDILRKPSKDESLFPARVVYDLLFFFIVIIIVLNLIFGVIIDTF
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2530 2540 2550 2560 2570 2580
pF1KE3 ADLRSEKQKKEEILKTTCFICGLERDKFDNKTVSFEEHIKLEHNMWNYLYFIVLVRVKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ADLRSEKQKKEEILKTTCFICGLERDKFDNKTVSFEEHIKLEHNMWNYLYFIVLVRVKNK
2530 2540 2550 2560 2570 2580
2590 2600 2610 2620 2630 2640
pF1KE3 TDYTGPESYVAQMIKNKNLDWFPRMRAMSLVSNEGEGEQNEIRILQDKLNSTMKLVSHLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TDYTGPESYVAQMIKNKNLDWFPRMRAMSLVSNEGEGEQNEIRILQDKLNSTMKLVSHLT
2590 2600 2610 2620 2630 2640
2650 2660 2670
pF1KE3 AQLNELKEQMTEQRKRRQRLGFVDVQNCISR
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AQLNELKEQMTEQRKRRQRLGFVDVQNCISR
2650 2660 2670
>>CCDS41764.1 ITPR2 gene_id:3709|Hs109|chr12 (2701 aa)
initn: 8299 init1: 1727 opt: 5318 Z-score: 6152.0 bits: 1152.7 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 11423; 65.0% identity (84.2% similar) in 2734 aa overlap (1-2663:1-2687)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MSE-MSSFLHIGDIVSLYAEGSVNGFISTLGLVDDRCVVEPAAGDLDNPPKKFRDCLFKV
:.: :::::.:::::::::::::::::::::::::::::.: :::: :::::::::::::
CCDS41 MTEKMSSFLYIGDIVSLYAEGSVNGFISTLGLVDDRCVVHPEAGDLANPPKKFRDCLFKV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 CPMNRYSAQKQYWKAKQTKQDKEKIADVVLLQKLQHAAQMEQKQNDTENKKVHGDVVKYG
:::::::::::::::::.:: .. ....::.::::::..:::::..::::. :..:::.
CCDS41 CPMNRYSAQKQYWKAKQAKQGNH--TEAALLKKLQHAAELEQKQNESENKKLLGEIVKYS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 SVIQLLHMKSNKYLTVNKRLPALLEKNAMRVTLDATGNEGSWLFIQPFWKLRSNGDNVVV
.::::::.:::::::::::::::::::::::.:::.::::::..:.:::::::.:::.::
CCDS41 NVIQLLHIKSNKYLTVNKRLPALLEKNAMRVSLDAAGNEGSWFYIHPFWKLRSEGDNIVV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GDKVILNPVNAGQPLHASNYELSDNAGCKEVNSVNCNTSWKINLFMQFRDHLEEVLKGGD
::::.: :::::::::::: :: :: ::::::.:::::::::.:::.. .. :.::::::
CCDS41 GDKVVLMPVNAGQPLHASNIELLDNPGCKEVNAVNCNTSWKITLFMKYSSYREDVLKGGD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 VVRLFHAEQEKFLTCDEYKGKLQVFLRTTLRQSATSATSSNALWEVEVVHHDPCRGGAGH
::::::::::::::::::. : ..::::::::::::::::.::::.:::::::::::::.
CCDS41 VVRLFHAEQEKFLTCDEYEKKQHIFLRTTLRQSATSATSSKALWEIEVVHHDPCRGGAGQ
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pF1KE3 WNGLYRFKHLATGNYLAAEENPSYKGDASDPKAAGMGAQGRTGR-RNAGEKIKYCLVAVP
::.:.:::::::::::::: ::.:. .. : . :. . . :.::::: : ::.::
CCDS41 WNSLFRFKHLATGNYLAAELNPDYRDAQNEGKNVRDGVPPTSKKKRQAGEKIMYTLVSVP
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pF1KE3 HGNDIASLFELDPTTLQKTDSFVPRNSYVRLRHLCTNTWIQSTNVPIDIEEERPIRLMLG
:::::::::::: ::::..: .:::::::::::::::::. ::..::: .::::. : .:
CCDS41 HGNDIASLFELDATTLQRADCLVPRNSYVRLRHLCTNTWVTSTSIPIDTDEERPVMLKIG
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CCDS41 TCQTKEDKEAFAIVSVPLSEVRDLDFANDANKVLATTVKKLENGTITQNERRFVTKLLED
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CCDS41 LIFFVADVPNNGQEVLDVVITKPNRERQKLMREQNILAQVFGILKAPFKEKAGEGSMLRL
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:.:.::. :::..:.:::::::::::.:::::::.:::.: .::::::::::::::::::
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CCDS41 LHNNRKLLEKHITAKEIETFVSLLRRNREPRFLDYLSDLCVSNTTAIPVTQELICKFMLS
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pF1KE3 PKNSDILIRTELRPVK-EMAQSHEYLSIEYSEEEVWLTWTDKNNEHHEKSVRQLAQEARA
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CCDS41 SGALQLLFKHFSQRAEVLQAFKQVQLLVSNQDVDNYKQIKADLDQLRLTVEKSELWVEK-
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CCDS41 -SSNYENGEIGESQVKGGEEPIEESNILSPVQDGTKKPQIDSNKSNNYRIVKEILIRLSK
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CCDS41 LCVQNKKCRNQHQRLLKNMGAHSVVLDLLQIPYEKNDEKMNEVMNLAHTFLQNFCRGNPQ
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CCDS41 NQVLLHKHLNLFLTPGLLEAETMRHIFMNNYHLCNEISERVVQHFVHCIETHGRHVEYLR
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CCDS41 FLQTIVKADGKYVKKCQDMVMTELINGGEDVLIFYNDRASFPILLHMMCSERDRGDESGP
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CCDS41 LAYHITLVELLAACTEGKNVYTEIKCNSLLPLDDIVRVVTHDDCIPEVKIAYVNFVNHCY
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CCDS41 NSPFSDNSTSLQTHQPVFIQLLQSAFRIYNCTWPNPAQKASVESCIRTLAEVAKNRGIAI
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...::....:..:::.:::::::. ::::: :::.: :: :.:.::::.::: :::.:
CCDS41 VASLEHQFSPMMQAEFSVLVDVLYSPELLFPEGSDARIRC--GAFMSKLINHTKKLMEKE
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CCDS41 EKLCIKILQTLREMLEKKDSFVEEGNTLRKILLNRYFKGDYSIGVNGHLSGAYSKTAQVG
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. : ::.. . .::::.:::::.:::: ::.: .:::.:: :::.. ..:
CCDS41 QTQYSFYQQLHEQKKSEKFFKVLYDRMKAAQKEIRSTVTVNTIDLGNKKRDDDNELMTSG
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CCDS41 GGLGLLGLYINEKNVALVNQNLESLTEYCQGPCHENQTCIATHESNGIDIIIALILNDIN
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..: .. :::..::::::::: ::.:::: ::..:::
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.: : .: .. : :: :::.::::::.::.:::::::::.::..::.:.:
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CCDS41 VFINLAVALFYPFGDDGDEGTL-SPLFSVLLWIAVAICTSMLFFFSKPVGIRPFLVSIML
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:::: .:.:::: .::: :: :::::.:::::::::: :::.:...:: :::::.:.:.
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::::: .::::: : ... .: . ......:. : .: . . .. .:. : :
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1120 1130 1140 1150 1160 1170
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CCDS54 QNQALLHKHINLFLNPGILEAVTMQHIFMNNFQLCSEINERVVQHFVHCIETHGRNVQYI
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KE3 DFLHTVIKAEGKYVKKCQDMIMTELTNAGDDVVVFYNDKASLAHLLDMMKAARDGVEDHS
::.:..:::::..::::::.:.::.:.:.::.:::::.::. :..::.. :: ....:
CCDS54 KFLQTIVKAEGKFIKKCQDMVMAELVNSGEDVLVFYNDRASFQTLIQMMRSERDRMDENS
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KE3 PLMYHISLVDLLAACAEGKNVYTEIKCTSLLPLEDVVSVVTHEDCITEVKMAYVNFVNHC
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CCDS54 PLMYHIHLVELLAVCTEGKNVYTEIKCNSLLPLDDIVRVVTHEDCIPEVKIAYINFLNHC
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1430 1440 1450 1460 1470
pF1KE3 YVDTEVEMKEIYTSNHIWTLFENFTLDMARVCSKR-EKRVADPTLEKYVLSVVLDTINAF
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CCDS54 YVDTEVEMKEIYTSNHMWKLFENFLVDICRACNNTSDRKHADSILEKYVTEIVMSIVTTF
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KE3 FSSPFSENSTSLQTHQTIVVQLLQSTTRLLECPWLQQQHKGSVEACIRTLAMVAKGRAIL
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CCDS54 FSSPFSDQSTTLQTRQPVFVQLLQGVFRVYHCNWLMPSQKASVESCIRVLSDVAKSRAIA
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KE3 LPMDLDAHISSMLSSGASCAAAAQRNASSYKATTR-AFPRVTPTANQWDYKNIIEKLQDI
.:.:::....... .. : .:..: ... ..: : : . : . ::.::::.::::
CCDS54 IPVDLDSQVNNLFLKSHS---IVQKTAMNWRLSARNAARRDSVLAASRDYRNIIERLQDI
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KE3 ITALEERLKPLVQAELSVLVDVLHWPELLFLEGSEAYQRCESGGFLSKLIQHTKDLME-S
..:::.::.::::::::::::::: ::::: :...: ..::::::. :::.:::.:.: .
CCDS54 VSALEDRLRPLVQAELSVLVDVLHRPELLFPENTDARRKCESGGFICKLIKHTKQLLEEN
1600 1610 1620 1630 1640 1650
1660 1670 1680 1690 1700
pF1KE3 EEKLCIKVLRTLQQMLLKKTKYGDRGNQLRKMLLQNYLQN------RKS-TSRGDLP---
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CCDS54 EEKLCIKVLQTLREMMTKDRGYGEKGEALRQVLVNRYYGNVRPSGRRESLTSFGNGPLSA
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1710 1720 1730 1740 1750
pF1KE3 ----DPIGTGLDPDWSAI-------AATQCRLDKEGATKLVCDLITSTKNEKIFQESIGL
: : : :.. : .::.::::::..:: ::: .......:.::: :
CCDS54 GGPGKPGGGGGGSGSSSMSRGEMSLAEVQCHLDKEGASNLVIDLIMNASSDRVFHESILL
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1760 1770 1780 1790 1800 1810
pF1KE3 AIHLLDGGNTEIQKSFHNLMMSDKKSERFFKVLHDRMKRAQQETKSTVAVNMNDLGSQPH
:: ::.:::: ::.:: . :::::.::::..:::: :::: :.::.:: .:::.. .
CCDS54 AIALLEGGNTTIQHSFFCRLTEDKKSEKFFKVFYDRMKVAQQEIKATVTVNTSDLGNKKK
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1820 1830 1840 1850
pF1KE3 ED---------REPVDPTTK--GRVASFSIPGSSSRYSLGPSLRR------GHEVSERVQ
.: .. .:::. .: . . .:.. . ..:: .. .: .:
CCDS54 DDEVDRDAPSRKKAKEPTTQITEEVRDQLLEASAATRKAFTTFRREADPDDHYQPGEGTQ
1840 1850 1860 1870 1880 1890
1860 1870 1880 1890 1900 1910
pF1KE3 SS--------EMGTSVLIMQPILRFLQLLCENHNRDLQNFLRCQNNKTNYNLVCETLQFL
.. ::.. . :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ATADKAKDDLEMSAVITIMQPILRFLQLLCENHNRDLQNFLRCQNNKTNYNLVCETLQFL
1900 1910 1920 1930 1940 1950
1920 1930 1940 1950 1960 1970
pF1KE3 DIMCGSTTGGLGLLGLYINEDNVGLVIQTLETLTEYCQGPCHENQTCIVTHESNGIDIIT
: .::::::::::::::::: ::.:. ::::.:::::::::::::.::.:::::::::::
CCDS54 DCICGSTTGGLGLLGLYINEKNVALINQTLESLTEYCQGPCHENQNCIATHESNGIDIIT
1960 1970 1980 1990 2000 2010
1980 1990 2000 2010 2020 2030
pF1KE3 ALILNDISPLCKYRMDLVLQLKDNASKLLLALMESRHDSENAERILISLRPQELVDVIKK
:::::::.:: : ::::::.::.::::::::.:::::::::::::: ..::.:::.::::
CCDS54 ALILNDINPLGKKRMDLVLELKNNASKLLLAIMESRHDSENAERILYNMRPKELVEVIKK
2020 2030 2040 2050 2060 2070
2040 2050 2060 2070 2080
pF1KE3 AYLQEE----ERENSE---VSPREVGHNIYILALQLSRHNKQLQHLLKPVKRIQEEEAEG
::.: : . ::.: .:::.::::::::: ::.::::.:: .::: ... .::
CCDS54 AYMQGEVEFEDGENGEDGAASPRNVGHNIYILAHQLARHNKELQSMLKPGGQVDGDEA--
2080 2090 2100 2110 2120 2130
2090 2100 2110 2120 2130 2140
pF1KE3 ISSMLSLNNKQLSQMLKSSAPAQEEEEDPLAYYENHTSQIEIVRQDRSMEQIVFPVPGIC
: .: .::.:::::: ::.:::::::::.::
CCDS54 -----------------------------LEFYAKHTAQIEIVRLDRTMEQIVFPVPSIC
2140 2150 2160
2150 2160 2170 2180 2190 2200
pF1KE3 QFLTEETKHRLFTTTEQDEQGSKVSDFFDQSSFLHNEMEWQRKLRSMPLIYWFSRRMTLW
.:::.:.: :.. :::.::::::..::: .: : :::.::.:::..:..:: .: :..:
CCDS54 EFLTKESKLRIYYTTERDEQGSKINDFFLRSEDLFNEMNWQKKLRAQPVLYWCARNMSFW
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2210 2220 2230 2240 2250 2260
pF1KE3 GSISFNLAVFINIIIAFFYPYMEGASTGVLDSPLISLLFW--ILICFSIAALFTKRYSIR
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CCDS54 SSISFNLAVLMNLLVAFFYPF-KGVRGGTLE-PHWSGLLWTAMLISLAIVIALPKPHGIR
2230 2240 2250 2260 2270
2270 2280 2290 2300 2310 2320
pF1KE3 PLIVALILRSIYYLGIGPTLNILGALNLTNKIVFVVSFVGNRGTFIRGYKAMVMDMEFLY
::.. ::: :. .:. ::: .:::.:. :::.:..::::: ::: :::.:::.:.::::
CCDS54 ALIASTILRLIFSVGLQPTLFLLGAFNVCNKIIFLMSFVGNCGTFTRGYRAMVLDVEFLY
2280 2290 2300 2310 2320 2330
2330 2340 2350 2360 2370 2380
pF1KE3 HVGYILTSVLGLFAHELFYSILLFDLIYREETLFNVIKSVTRNGRSILLTALLALILVYL
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CCDS54 HLLYLVICAMGLFVHEFFYSLLLFDLVYREETLLNVIKSVTRNGRSIILTAVLALILVYL
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2390 2400 2410 2420 2430
pF1KE3 FSIVGFLFLKDDFILEVDRLPNNHSTASPLGMPHGAAAFV--DTC---SGDKMDCVSGLS
:::::.::.:::::::::::::. :: : :. :. :.: ::. .: :
CCDS54 FSIVGYLFFKDDFILEVDRLPNE--TAVPETGESLASEFLFSDVCRVESGE--NCSSPAP
2400 2410 2420 2430 2440 2450
2440 2450 2460 2470 2480 2490
pF1KE3 VPEVLEEDRELDSTERACDTLLMCIVTVMNHGLRNGGGVGDILRKPSKDESLFPARVVYD
:.. .. .. :..:.:::::::::..::::.::::::.::::::.: :: :::.::
CCDS54 REELVPAEETEQDKEHTCETLLMCIVTVLSHGLRSGGGVGDVLRKPSKEEPLFAARVIYD
2460 2470 2480 2490 2500 2510
2500 2510 2520 2530 2540 2550
pF1KE3 LLFFFIVIIIVLNLIFGVIIDTFADLRSEKQKKEEILKTTCFICGLERDKFDNKTVSFEE
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS54 LLFFFMVIIIVLNLIFGVIIDTFADLRSEKQKKEEILKTTCFICGLERDKFDNKTVTFEE
2520 2530 2540 2550 2560 2570
2560 2570 2580 2590 2600 2610
pF1KE3 HIKLEHNMWNYLYFIVLVRVKNKTDYTGPESYVAQMIKNKNLDWFPRMRAMSLVSNEGEG
::: :::::.:: :::::.::..:.:::::::::.:::..:::::::::::::::...::
CCDS54 HIKEEHNMWHYLCFIVLVKVKDSTEYTGPESYVAEMIKERNLDWFPRMRAMSLVSSDSEG
2580 2590 2600 2610 2620 2630
2620 2630 2640 2650 2660 2670
pF1KE3 EQNEIRILQDKLNSTMKLVSHLTAQLNELKEQMTEQRKRRQRLGFVDVQNCISR
::::.: ::.::.::::::..:..::.:::.:::::::..::.:..
CCDS54 EQNELRNLQEKLESTMKLVTNLSGQLSELKDQMTEQRKQKQRIGLLGHPPHMNVNPQQPA
2640 2650 2660 2670 2680 2690
>>CCDS42563.1 RYR1 gene_id:6261|Hs109|chr19 (5033 aa)
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Smith-Waterman score: 523; 32.4% identity (61.1% similar) in 293 aa overlap (2311-2603:4776-5019)
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. .. : ::: :.. :.:: . ...:
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.. :.:. . .:: ....:::.::.....:. : ..:::...:.: :.. .
CCDS42 FAAHLLDIAMGVKTLRTILSSVTHNGKQLVMTVGLLAVVVYLYTVVAFNFFRKFY-----
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CCDS42 ----NKS------------------------------------EDE--DEPDMKCDDMMT
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: . : :.: :::.:: .. :. :: . :::.:. :::.::.:.: .: :.:::.:
CCDS42 CYLFHMYVGVRAGGGIGDEIEDPAGDEYEL-YRVVFDITFFFFVIVILLAIIQGLIIDAF
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pF1KE3 ADLRSEKQKKEEILKTTCFICGLERDKFDNKTVSFEEHIKLEHNMWNYLYFIVLVRVKNK
..::..... .: ..: :::::. : ::. .:: : :::. ::..:.. . :..
CCDS42 GELRDQQEQVKEDMETKCFICGIGSDYFDTTPHGFETHTLEEHNLANYMFFLMYLINKDE
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pF1KE3 TDYTGPESYVAQMIKNKNLDWFPRMRAMSLVSNEGEGEQNEIRILQDKLNSTMKLVSHLT
:..:: :::: .: ... :.::
CCDS42 TEHTGQESYVWKMYQERCWDFFPAGDCFRKQYEDQLS
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>>CCDS33011.1 RYR1 gene_id:6261|Hs109|chr19 (5038 aa)
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Smith-Waterman score: 523; 32.4% identity (61.1% similar) in 293 aa overlap (2311-2603:4781-5024)
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pF1KE3 TLNILGALNLTNKIVFVVSFVGNRGTFIRGYKAMVMDMEFLYHVGYILTSVLGLFAHELF
. .. : ::: :.. :.:: . ...:
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pF1KE3 YSILLFDLIYREETLFNVIKSVTRNGRSILLTALLALILVYLFSIVGFLFLKDDFILEVD
.. :.:. . .:: ....:::.::.....:. : ..:::...:.: :.. .
CCDS33 FAAHLLDIAMGVKTLRTILSSVTHNGKQLVMTVGLLAVVVYLYTVVAFNFFRKFY-----
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CCDS33 ----NKS------------------------------------EDE--DEPDMKCDDMMT
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pF1KE3 CIVTVMNHGLRNGGGVGDILRKPSKDESLFPARVVYDLLFFFIVIIIVLNLIFGVIIDTF
: . : :.: :::.:: .. :. :: . :::.:. :::.::.:.: .: :.:::.:
CCDS33 CYLFHMYVGVRAGGGIGDEIEDPAGDEYEL-YRVVFDITFFFFVIVILLAIIQGLIIDAF
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pF1KE3 ADLRSEKQKKEEILKTTCFICGLERDKFDNKTVSFEEHIKLEHNMWNYLYFIVLVRVKNK
..::..... .: ..: :::::. : ::. .:: : :::. ::..:.. . :..
CCDS33 GELRDQQEQVKEDMETKCFICGIGSDYFDTTPHGFETHTLEEHNLANYMFFLMYLINKDE
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pF1KE3 TDYTGPESYVAQMIKNKNLDWFPRMRAMSLVSNEGEGEQNEIRILQDKLNSTMKLVSHLT
:..:: :::: .: ... :.::
CCDS33 TEHTGQESYVWKMYQERCWDFFPAGDCFRKQYEDQLS
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>>CCDS55691.1 RYR2 gene_id:6262|Hs109|chr1 (4967 aa)
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: ::: . :. :::: . ...:.. :.
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:. . .:: ....:::.::....::. : ..:::...:.: :.. . :.
CCDS55 DIAMGFKTLRTILSSVTHNGKQLVLTVGLLAVVVYLYTVVAFNFFRKFY---------NK
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pF1KE3 STASPLGMPHGAAAFVDTCSGDKMDCVSGLSVPEVLEEDRELDSTERACDTLLMCIVTVM
: :: :. . :: .: : . :
CCDS55 S------------------------------------EDG--DTPDMKCDDMLTCYMFHM
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:.: :::.:: .. :. :: . :...:. :::.::.:.: .: :.:::.:..::..
CCDS55 YVGVRAGGGIGDEIEDPAGDEYEI-YRIIFDITFFFFVIVILLAIIQGLIIDAFGELRDQ
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pF1KE3 KQKKEEILKTTCFICGLERDKFDNKTVSFEEHIKLEHNMWNYLYFIVLVRVKNKTDYTGP
... .: ..: :::::. : ::. .:: : :::. :::.:.. . :..:..::
CCDS55 QEQVKEDMETKCFICGIGNDYFDTVPHGFETHTLQEHNLANYLFFLMYLINKDETEHTGQ
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pF1KE3 ESYVAQMIKNKNLDWFPRMRAMSLVSNEGEGEQNEIRILQDKLNSTMKLVSHLTAQLNEL
:::: .: ... ..::
CCDS55 ESYVWKMYQERCWEFFPAGDCFRKQYEDQLN
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>>CCDS58351.1 RYR3 gene_id:6263|Hs109|chr15 (4865 aa)
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2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KE3 ALNLTNKIVFVVSFVGNRGTFIRGYKAMVMDMEFLYHVGYILTSVLGLFAHELFYSILLF
: ::: . : :::: . ...:.. :.
CCDS58 ETKAEAASLVSWLSSIDMKYHIWKLGVVFTDNSFLYLAWYTTMSVLGHY-NNFFFAAHLL
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pF1KE3 DLIYREETLFNVIKSVTRNGRSILLTALLALILVYLFSIVGFLFLKDDFILEVDRLPNNH
:. . .:: ....:::.::....::. : ..:::...:.: :.. . :.
CCDS58 DIAMGFKTLRTILSSVTHNGKQLVLTVGLLAVVVYLYTVVAFNFFRKFY---------NK
4650 4660 4670 4680 4690
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pF1KE3 STASPLGMPHGAAAFVDTCSGDKMDCVSGLSVPEVLEEDRELDSTERACDTLLMCIVTVM
: :.: : : :: .. : . :
CCDS58 S-----------------------------------EDDDEPDMK---CDDMMTCYLFHM
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pF1KE3 NHGLRNGGGVGDILRKPSKDESLFPARVVYDLLFFFIVIIIVLNLIFGVIIDTFADLRSE
:.: :::.:: .. :. : . :.:.:. :::.::.:.: .: :.:::.:..::..
CCDS58 YVGVRAGGGIGDEIEDPAGDPYEM-YRIVFDITFFFFVIVILLAIIQGLIIDAFGELRDQ
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pF1KE3 KQKKEEILKTTCFICGLERDKFDNKTVSFEEHIKLEHNMWNYLYFIVLVRVKNKTDYTGP
... .: ..: :::::. : ::. .:: : :::. :::.:.. . :..:..::
CCDS58 QEQVREDMETKCFICGIGNDYFDTTPHGFETHTLQEHNLANYLFFLMYLINKDETEHTGQ
4780 4790 4800 4810 4820 4830
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pF1KE3 ESYVAQMIKNKNLDWFPRMRAMSLVSNEGEGEQNEIRILQDKLNSTMKLVSHLTAQLNEL
:::: .: ... :.::
CCDS58 ESYVWKMYQERCWDFFPAGDCFRKQYEDQLG
4840 4850 4860
>>CCDS45210.1 RYR3 gene_id:6263|Hs109|chr15 (4870 aa)
initn: 675 init1: 360 opt: 451 Z-score: 501.8 bits: 108.1 E(33420): 1.3e-21
Smith-Waterman score: 521; 33.8% identity (60.6% similar) in 287 aa overlap (2317-2603:4619-4856)
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KE3 ALNLTNKIVFVVSFVGNRGTFIRGYKAMVMDMEFLYHVGYILTSVLGLFAHELFYSILLF
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CCDS45 ETKAEAASLVSWLSSIDMKYHIWKLGVVFTDNSFLYLAWYTTMSVLGHY-NNFFFAAHLL
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