FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3827, 2817 aa 1>>>pF1KE3827 2817 - 2817 aa - 2817 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 64092750 residues in 91774 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.3395+/-0.000524; mu= -6.5534+/- 0.032 mean_var=452.0277+/-93.783, 0's: 0 Z-trim(118.4): 150 B-trim: 805 in 1/58 Lambda= 0.060324 statistics sampled from 32327 (32484) to 32327 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.354), width: 16 Scan time: 15.820 The best scores are: opt bits E(91774) NP_006729 (OMIM: 604686) A-kinase anchor protein 1 (2817) 18469 1624.6 0 NP_009131 (OMIM: 604686) A-kinase anchor protein 1 (2813) 18290 1609.1 0 NP_001257475 (OMIM: 604686) A-kinase anchor protei (1434) 7846 699.9 7.7e-200 XP_016865192 (OMIM: 612790) rho guanine nucleotide (1286) 1932 185.1 6.1e-45 NP_001231293 (OMIM: 612790) rho guanine nucleotide (1392) 1932 185.2 6.5e-45 XP_005248625 (OMIM: 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NP_001 DSVL---ADTLSSHDVPGSPTASLVTGGREGRGCSDVDPGIQGVVTDLAVSDAGEKVECR 1310 1320 1330 1340 1350 1360 2520 2530 2540 2550 2560 2570 pF1KE3 MLKRNSE-QVVQSVVHLYELLSALQGVVLQQDSYIEDQKLVLSER---ALTRSLSRPSSL . .:. ...:.. .: .:: .::... :::.:: ..:::... .: .:. : . : NP_001 NFPGSSQSEIIQAIQNLTRLLYSLQAALTIQDSHIEIHRLVLQQQEGLSLGHSILRGGPL 1370 1380 1390 1400 1410 1420 2580 2590 2600 2610 2620 2630 pF1KE3 IEQEKQRSLEKQRQDLANLQKQQAQYLEEKRRREREWEARERELREREALLAQREEEVQQ .: :.:. ..:...:::... : : .:.:: :. : ..: ::. : .::.: :. NP_001 QDQ-KSRDADRQHEELANVHQLQHQLQQEQRRWLRRCEQQQRAQATRESWLQERERECQS 1430 1440 1450 1460 1470 1480 2640 2650 2660 2670 2680 2690 pF1KE3 GQQDLEKEREELQQKKGTYQYDLERLRAAQKQLEREQEQLRREAERLSQRQ--TERDLCQ .. : . : ::. . ::..::::: .:. .:::: ..: . :.. . .:.: NP_001 QEELLLRSRGELDLQLQEYQHSLERLREGQRLVEREQARMRAQQSLLGHWKHGRQRSLPA 1490 1500 1510 1520 1530 1540 2700 2710 2720 2730 2740 2750 pF1KE3 VSHPHTKLMRIPSFFPSPEEPPSPSAPSIAKSGSLDSELSVSPKRNSISRTHKDKGPFHI : : NP_001 VLLPGGPEVMELNRSESLCHENSFFINEALVQMSFNTFNKLNPSVIHQDATYPTTQSHSD 1550 1560 1570 1580 1590 1600 >-- initn: 533 init1: 286 opt: 469 Z-score: 238.6 bits: 57.9 E(91774): 1.6e-06 Smith-Waterman score: 469; 33.0% identity (65.9% similar) in 264 aa overlap (1-263:1-259) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MKLNPQQAPLYGDCVVTVLLAEEDKAEDDVVFYLVFLGSTLRHCTSTRKVSSDTLETIAP :.:. ..:::::. .. . . .. .:. ::... :: :: .... ...:.. .: NP_001 MELSCSEAPLYGQMMIYAKFDKNVYLPEDAEFYFTYDGSHQRHVMIAERIEDNVLQSSVP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 GHDCCETVKVQLCASKEGLPVFVVAEEDFHFVQDEAYDAAQFLATSAGNQQALNFTRFLD :: ::: :..: .:: ... . .:.. : :..:.:.:. : . .: NP_001 GHGLQETVTVSVCLCSEGYSPVTMGSGSVTYVDNMACRLARLLVTQANRLTACSHQTLLT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 QSGPPSGDVNSLDKKLVLAFRHLKLPTEWNVLGTDQSLHDAGPRETLMHFAVRLGLLRLT . .: . .::..::::. ::.:: ::.:::.. ::. .. ::.:.:.:.: :: .:. NP_001 PFALTAGALPALDEELVLALTHLELPLEWTVLGSS-SLEVSSHRESLLHLAMRWGLAKLS 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 WFLLQKPGGRGALSIHNQEGATPVSLALERGYHKLHQLLTEENAGEPDSWSSLSYEIPYG :.: ::: ::.. :.:::::..:::..:. :: .:. .. :: .. . NP_001 QFFLCLPGGVQALALPNEEGATPLDLALREGHSKL----VEDVTNFQGRWSPSFSRVQLS 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KE3 DCSVRHH-RELDIYTLTSESDSHHEHPFPGDGCTGPIFKLMNIQQQLMKTNLKQMDSLMP . . :. . . ::: . ..: NP_001 EEASLHYIHSSETLTLTLNHTAEHLLEADIKLFRKYFWDRAFLVKAFEPEARPEERTAMP 240 250 260 270 280 290 >>XP_011541849 (OMIM: 612790) rho guanine nucleotide exc (1729 aa) initn: 1362 init1: 642 opt: 1932 Z-score: 926.6 bits: 185.3 E(91774): 7.7e-45 Smith-Waterman score: 2040; 35.3% identity (66.0% similar) in 1174 aa overlap (1557-2694:423-1543) 1530 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KE3 PADPGDVEEEEMDSITEVPANCSVLRSSMRSLSPFRRHSWGPGKNAASDAEMNHRSMSWC :. :. .. : ... :... :. : : XP_011 GITATTSPESRGCTLWPQSSKHTLPTETSPSVYPLSENVEGTAHTEAQQSFMSPSSS--C 400 410 420 430 440 450 1590 1600 1610 1620 1630 pF1KE3 PSGVQYSAGL------SADFNYRSFSLEGLTGGA-GVGNKPSSSLEVSSANAEELRHPFS :... : : .. .. :: ::..: . . : :.. : . . .. : . 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XP_011 GKESLQCSNCNANVHKGCKDAAPACTK--------KFQEKYNKNKPQTILGN--SSFRDI 680 690 700 710 720 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KE3 PRSAVLLVDETATTPIF--ANRRSQ--QSVSLSKSV------SIQNITGVGNDENMSNTW :. .. : ....:. ..:: : ::.:: :.. . ..:. :. XP_011 PQPGLSL-HPSSSVPVGLPTGRRETVGQVHPLSRSVPGTTLESFRRSATSLESESDHNSC 730 740 750 760 770 780 1930 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KE3 KFLSHSTDSLNKISKVNESTESLTDEGVGTDMNEGQLLGDFEIESKQLEAESWSRIIDSK . ::: . :..... . ::::. : :. ...: .:. .....:::::: ..: . XP_011 RSRSHSDELLQSMGS-SPSTESFIME----DVVDSSLWSDLSSDAQEFEAESWSLVVDPS 790 800 810 820 830 1990 2000 2010 2020 2030 2040 pF1KE3 FLKQQKKDVVKRQEVIYELMQTEFHHVRTLKIMSGVYSQGMMADLLFEQQMVEKLFPCLD : ..:.:::.:::.::.::::::.::..:: ::: .. .:: .: .... :.:.::::: XP_011 FCNRQEKDVIKRQDVIFELMQTEMHHIQTLFIMSEIFRKGMKEELQLDHSTVDKIFPCLD 840 850 860 870 880 890 2050 2060 2070 2080 2090 2100 pF1KE3 ELISIHSQFFQRILERKKESLVDKSEKNFLIKRIGDVLVNQFSGENAERLKKTYGKFCGQ ::. :: .:: . ::..:: . :..::.: ::::.::.::: ::: ..:: ::.:: . XP_011 ELLEIHRHFFYSMKERRQESCAG-SDRNFVIDRIGDILVQQFSEENASKMKKIYGEFCCH 900 910 920 930 940 950 2110 2120 2130 2140 2150 2160 pF1KE3 HNQSVNYFKDLYAKDKRFQAFVKKKMSSSVVRRLGIPECILLVTQRITKYPVLFQRILQC :...:: ::.: ..:.:: :.: . :. ..:: ::::::::::::::::::: .:::: XP_011 HKEAVNLFKELQ-QNKKFQNFIKLRNSNLLARRRGIPECILLVTQRITKYPVLVERILQY 960 970 980 990 1000 1010 2170 2180 2190 2200 2210 2220 pF1KE3 TKDNEVEQEDLAQSLSLVKDVIGAVDSKVASYEKKVRLNEIYTKTDSKSIMRMKSGQMFA ::. :..:: ..: :.::.:..:: :: :::. . :: .: ..:. ..:.:..: XP_011 TKERTEEHKDLRKALCLIKDMIATVDLKVNEYEKNQKWLEILNKIENKTYTKLKNGHVFR 1020 1030 1040 1050 1060 1070 2230 2240 2250 2260 2270 2280 pF1KE3 KEDL--KRKKLVRDGSVFLKNAAGRLKEVQAVLLTDILVFLQEKDQKYIFASLDQKSTVI :. : ... :. :: :. :.:.::.:.. :.::::.:.::::::::::::..::: .:: XP_011 KQALMSEERTLLYDGLVYWKTATGRFKDILALLLTDVLLFLQEKDQKYIFAAVDQKPSVI 1080 1090 1100 1110 1120 1130 2290 2300 2310 2320 2330 2340 pF1KE3 SLKKLIVREVAHEEKGLFLISMGMTDPEMVEVHASSKEERNSWIQIIQDTINTLNRDEDE ::.:::.::::.::.:.:::: . . ::: :.:..::::::.:.. ::..... .: XP_011 SLQKLIAREVANEERGMFLISASSAGPEMYEIHTNSKEERNNWMRRIQQAVESCP-EEKG 1140 1150 1160 1170 1180 1190 2350 2360 2370 2380 2390 2400 pF1KE3 GIPSENEEEKKMLDTRARELK---EQLHQKDQKILLLLEEKEMIFRDMAECSTPLPEDCS : ::..:.:. ..:. ... : : ..::.: :::: :. ...: : :: XP_011 GRTSESDEDKRKAEARVAKIQQCQEILTNQDQQICAYLEEKLHIYAELGELSG--FED-- 1200 1210 1220 1230 1240 2410 2420 2430 2440 2450 2460 pF1KE3 PTH-SPRVLFRSNTEEALKGGPLMKSAINEVEILQGLVSGNLGGTLGPTVSSPIEQDVVG .: :..:.. . : ... :. .:..:.: :: :... :. ::. : : : XP_011 -VHLEPHLLIKPDPGEPPQAASLLAAALKEAESLQVAVKASQMGA----VSQSCE-DSCG 1250 1260 1270 1280 1290 1300 2470 2480 2490 2500 2510 pF1KE3 PVSLPRRAETFGGFD---SHQMNASKGGEKEEG--DDGQDLRRTESDSGLKKGGNANLVF : :.:... : : . ::.. .: : .. . .: ... .:. XP_011 DSVL---ADTLSSHDVPGSPTASLVTGGREGRGCSDVDPGIQGVVTDLAVSDAGEKVECR 1310 1320 1330 1340 1350 1360 2520 2530 2540 2550 2560 2570 pF1KE3 MLKRNSE-QVVQSVVHLYELLSALQGVVLQQDSYIEDQKLVLSER---ALTRSLSRPSSL . .:. ...:.. .: .:: .::... :::.:: ..:::... .: .:. : . : XP_011 NFPGSSQSEIIQAIQNLTRLLYSLQAALTIQDSHIEIHRLVLQQQEGLSLGHSILRGGPL 1370 1380 1390 1400 1410 1420 2580 2590 2600 2610 2620 2630 pF1KE3 IEQEKQRSLEKQRQDLANLQKQQAQYLEEKRRREREWEARERELREREALLAQREEEVQQ .: :.:. ..:...:::... : : .:.:: :. : ..: ::. : .::.: :. XP_011 QDQ-KSRDADRQHEELANVHQLQHQLQQEQRRWLRRCEQQQRAQATRESWLQERERECQS 1430 1440 1450 1460 1470 2640 2650 2660 2670 2680 2690 pF1KE3 GQQDLEKEREELQQKKGTYQYDLERLRAAQKQLEREQEQLRREAERLSQRQ--TERDLCQ .. : . : ::. . ::..::::: .:. .:::: ..: . :.. . .:.: XP_011 QEELLLRSRGELDLQLQEYQHSLERLREGQRLVEREQARMRAQQSLLGHWKHGRQRSLPA 1480 1490 1500 1510 1520 1530 2700 2710 2720 2730 2740 2750 pF1KE3 VSHPHTKLMRIPSFFPSPEEPPSPSAPSIAKSGSLDSELSVSPKRNSISRTHKDKGPFHI : : XP_011 VLLPGGPEVMELNRSESLCHENSFFINEALVQMSFNTFNKLNPSVIHQDATYPTTQSHSD 1540 1550 1560 1570 1580 1590 >-- initn: 496 init1: 249 opt: 433 Z-score: 221.6 bits: 54.8 E(91774): 1.4e-05 Smith-Waterman score: 433; 33.2% identity (64.8% similar) in 250 aa overlap (18-263:13-257) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MKLNPQQAPLYGDCVVTVLLAEEDKA---EDDVVFYLVFLGSTLRHCTSTRKVSSDTLET .. :. :: .:. ::... :: :: .... ...:.. 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XP_011 KLSQFFLCLPGGVQALALPNEEGATPLDLALREG----HSKLVEDVTNFQGRWSPSFSRV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 PYGDCSVRHH-RELDIYTLTSESDSHHEHPFPGDGCTGPIFKLMNIQQQLMKTNLKQMDS .. . :. . . ::: . ..: XP_011 QLSEEASLHYIHSSETLTLTLNHTAEHLLEADIKLFRKYFWDRAFLVKAFEPEARPEERT 240 250 260 270 280 290 >>NP_001073948 (OMIM: 612790) rho guanine nucleotide exc (1731 aa) initn: 1399 init1: 642 opt: 1932 Z-score: 926.6 bits: 185.3 E(91774): 7.7e-45 Smith-Waterman score: 2040; 35.3% identity (66.0% similar) in 1174 aa overlap (1557-2694:425-1545) 1530 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KE3 PADPGDVEEEEMDSITEVPANCSVLRSSMRSLSPFRRHSWGPGKNAASDAEMNHRSMSWC :. :. .. : ... :... :. : : NP_001 GITATTSPESRGCTLWPQSSKHTLPTETSPSVYPLSENVEGTAHTEAQQSFMSPSSS--C 400 410 420 430 440 450 1590 1600 1610 1620 1630 pF1KE3 PSGVQYSAGL------SADFNYRSFSLEGLTGGA-GVGNKPSSSLEVSSANAEELRHPFS :... : : .. .. :: ::..: . . : :.. : . . .. : . 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