Result of FASTA (ccds) for
pF1KE4105
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4105, 475 aa
1>>>pF1KE4105 475 - 475 aa - 475 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2111+/-0.00102; mu= 13.3769+/- 0.062
mean_var=80.5198+/-16.429, 0's: 0 Z-trim(105.1): 141 B-trim: 5 in 1/49
Lambda= 0.142930
statistics sampled from 8208 (8352) to 8208 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16
Scan time: 1.410
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS2184.1 ARHGAP15 gene_id:55843|Hs109|chr2 ( 475) 3099 649.0 3.2e-186
CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs109|chr17 ( 548) 1218 261.1 2.1e-69
CCDS74082.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs109|chr17 ( 889) 1218 261.2 3.3e-69
CCDS59214.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10 ( 794) 1023 221.0 3.8e-57
CCDS73082.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10 ( 799) 1023 221.0 3.8e-57
CCDS59215.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10 ( 816) 1023 221.0 3.8e-57
CCDS59216.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10 ( 841) 1023 221.0 3.9e-57
CCDS7170.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10 ( 846) 1023 221.0 4e-57
CCDS44929.1 ARHGAP9 gene_id:64333|Hs109|chr12 ( 640) 735 161.6 2.3e-39
CCDS56027.1 ARHGAP23 gene_id:57636|Hs109|chr17 (1491) 539 121.3 7.3e-27
CCDS7144.2 ARHGAP21 gene_id:57584|Hs109|chr10 (1958) 488 110.8 1.4e-23
CCDS47566.1 CHN2 gene_id:1124|Hs109|chr7 ( 332) 442 101.0 2e-21
CCDS56147.1 CHN1 gene_id:1123|Hs109|chr2 ( 334) 442 101.1 2e-21
CCDS44928.1 ARHGAP9 gene_id:64333|Hs109|chr12 ( 547) 445 101.7 2e-21
CCDS58497.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17 ( 310) 440 100.6 2.5e-21
CCDS46454.1 CHN1 gene_id:1123|Hs109|chr2 ( 433) 442 101.1 2.5e-21
CCDS8941.2 ARHGAP9 gene_id:64333|Hs109|chr12 ( 731) 445 101.8 2.6e-21
CCDS46455.1 CHN1 gene_id:1123|Hs109|chr2 ( 459) 442 101.1 2.7e-21
CCDS5420.1 CHN2 gene_id:1124|Hs109|chr7 ( 468) 442 101.1 2.7e-21
CCDS81705.1 ARHGAP9 gene_id:64333|Hs109|chr12 ( 821) 445 101.8 2.9e-21
CCDS87488.1 CHN2 gene_id:1124|Hs109|chr7 ( 543) 442 101.1 3.1e-21
CCDS73936.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17 ( 641) 440 100.7 4.8e-21
CCDS54060.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17 ( 813) 440 100.8 5.9e-21
CCDS11000.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17 ( 822) 440 100.8 6e-21
CCDS10999.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17 ( 859) 440 100.8 6.2e-21
CCDS87332.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs109|chr5 ( 686) 436 99.9 9e-21
CCDS47297.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs109|chr5 ( 759) 436 99.9 9.9e-21
CCDS4277.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs109|chr5 ( 814) 436 100.0 1.1e-20
CCDS54254.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs109|chr19 (1123) 437 100.2 1.2e-20
CCDS12477.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs109|chr19 (1126) 437 100.2 1.2e-20
CCDS14388.1 OPHN1 gene_id:4983|Hs109|chrX ( 802) 433 99.3 1.6e-20
CCDS34075.1 ARHGAP10 gene_id:79658|Hs109|chr4 ( 786) 431 98.9 2.1e-20
CCDS44769.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs109|chr11 (2087) 433 99.5 3.7e-20
CCDS13807.1 BCR gene_id:613|Hs109|chr22 (1227) 429 98.6 4.1e-20
CCDS13806.1 BCR gene_id:613|Hs109|chr22 (1271) 429 98.6 4.2e-20
CCDS1215.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs109|chr1 ( 890) 418 96.3 1.5e-19
CCDS30918.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs109|chr1 (1101) 418 96.3 1.8e-19
CCDS31718.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs109|chr11 (1738) 417 96.2 3.1e-19
CCDS46127.1 ARHGAP35 gene_id:2909|Hs109|chr19 (1499) 415 95.7 3.6e-19
CCDS78219.1 CHN2 gene_id:1124|Hs109|chr7 ( 274) 391 90.5 2.5e-18
CCDS43135.1 ARHGAP31 gene_id:57514|Hs109|chr3 (1444) 396 91.8 5.3e-18
CCDS45095.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs109|chr14 (1501) 387 90.0 2e-17
CCDS32062.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs109|chr14 (1502) 387 90.0 2e-17
CCDS43246.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs109|chr4 ( 653) 348 81.8 2.5e-15
CCDS3611.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs109|chr4 ( 655) 348 81.8 2.5e-15
CCDS58080.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs109|chr10 ( 714) 348 81.8 2.7e-15
CCDS34025.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs109|chr4 ( 748) 348 81.8 2.8e-15
CCDS14736.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs109|chrX ( 946) 340 80.2 1.1e-14
CCDS55540.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs109|chrX ( 986) 340 80.2 1.1e-14
CCDS11845.1 RALBP1 gene_id:10928|Hs109|chr18 ( 655) 332 78.5 2.5e-14
>>CCDS2184.1 ARHGAP15 gene_id:55843|Hs109|chr2 (475 aa)
initn: 3099 init1: 3099 opt: 3099 Z-score: 3456.8 bits: 649.0 E(33420): 3.2e-186
Smith-Waterman score: 3099; 100.0% identity (100.0% similar) in 475 aa overlap (1-475:1-475)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MQKSTNSDTSVETLNSTRQGTGAVQMRIKNANSHHDRLSQSKSMILTDVGKVTEPISRHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 MQKSTNSDTSVETLNSTRQGTGAVQMRIKNANSHHDRLSQSKSMILTDVGKVTEPISRHR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWSTSWIVLSSRRIEFYKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 RNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWSTSWIVLSSRRIEFYKES
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KQQALSNMKTGHKPESVDLCGAHIEWAKEKSSRKNVFQITTVSGNEFLLQSDIDFIILDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 KQQALSNMKTGHKPESVDLCGAHIEWAKEKSSRKNVFQITTVSGNEFLLQSDIDFIILDW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 FHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDIKEQKPEHRKSLMFRLHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 FHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDIKEQKPEHRKSLMFRLHH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHKVCERENSTVPWFVKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 SASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHKVCERENSTVPWFVKQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 CIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 CIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 ELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNRDTMKVLFGHLTKIVAKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 ELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNRDTMKVLFGHLTKIVAKA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE4 SKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELMLSEYSKIFGSEED
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 SKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELMLSEYSKIFGSEED
430 440 450 460 470
>>CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs109|chr17 (548 aa)
initn: 1204 init1: 944 opt: 1218 Z-score: 1359.6 bits: 261.1 E(33420): 2.1e-69
Smith-Waterman score: 1218; 48.1% identity (75.6% similar) in 397 aa overlap (80-470:156-545)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 GKVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRK-NWSTSWIV
..: : :...: :: ::.::: .::.:: :
CCDS11 PPEEKVPAELDEVGSWEEVSPATAAVRTKTLDKAGVLHRTKTADKGKRLRKKHWSASWTV
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 LSSRRIEFYKESKQQALSNMKTGHK---PE-SVDLCGAHIEWA-KEKSSRKNVFQITTVS
: . . :.:.:: .: .... : :: .:.: :: . :: :.:::::::... . .
CCDS11 LEGGVLTFFKDSKTSAAGGLRQPSKFSTPEYTVELRGATLSWAPKDKSSRKNVLELRSRD
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 GNEFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDI
:.:.:.: : . :: : .:: ..:..: . : .. : ... .:: .: :
CCDS11 GSEYLIQHDSEAIISTWHKAIAQGIQELSAE--LPPEESESSRVDFGSSERLGSW-----
250 260 270 280 290
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 KEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHL
.:.. . : . .. :: ..:. .:.::. :::.:..:.::: ::::.:: :
CCDS11 QEKEEDARPNAAAPALGPVGLESDLSKVRHKLRKFLQRRPTLQSLREKGYIKDQVFGCAL
300 310 320 330 340 350
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 HKVCERENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDS
.:::: : :: ::.:::.::: ::::.::.::.:::::::::::. :...:.:.:::.
CCDS11 AALCERERSRVPRFVQQCIRAVEARGLDIDGLYRISGNLATIQKLRYKVDHDERLDLDDG
360 370 380 390 400 410
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 QWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNR
.:::.::.:::::.:::::::::::.: :.::. ::: ::. : . :..::..:: ::.
CCDS11 RWEDVHVITGALKLFFRELPEPLFPFSHFRQFIAAIKLQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNH
420 430 440 450 460 470
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 DTMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELML
::...:: :: ... .. .: ::.::..::::::::: : : .: . ::.:::..::.:
CCDS11 DTLRMLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLRPEVEETSMPMTMVFQNQVVELIL
480 490 500 510 520 530
470
pF1KE4 SEYSKIFGSEED
.. . ::
CCDS11 QQCADIFPPH
540
>>CCDS74082.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs109|chr17 (889 aa)
initn: 1180 init1: 944 opt: 1218 Z-score: 1356.3 bits: 261.2 E(33420): 3.3e-69
Smith-Waterman score: 1218; 48.1% identity (75.6% similar) in 397 aa overlap (80-470:497-886)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 GKVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRK-NWSTSWIV
..: : :...: :: ::.::: .::.:: :
CCDS74 PPEEKVPAELDEVGSWEEVSPATAAVRTKTLDKAGVLHRTKTADKGKRLRKKHWSASWTV
470 480 490 500 510 520
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 LSSRRIEFYKESKQQALSNMKTGHK---PE-SVDLCGAHIEWA-KEKSSRKNVFQITTVS
: . . :.:.:: .: .... : :: .:.: :: . :: :.:::::::... . .
CCDS74 LEGGVLTFFKDSKTSAAGGLRQPSKFSTPEYTVELRGATLSWAPKDKSSRKNVLELRSRD
530 540 550 560 570 580
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 GNEFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDI
:.:.:.: : . :: : .:: ..:..: . : .. : ... .:: .: :
CCDS74 GSEYLIQHDSEAIISTWHKAIAQGIQELSAE--LPPEESESSRVDFGSSERLGSW-----
590 600 610 620 630
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 KEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHL
.:.. . : . .. :: ..:. .:.::. :::.:..:.::: ::::.:: :
CCDS74 QEKEEDARPNAAAPALGPVGLESDLSKVRHKLRKFLQRRPTLQSLREKGYIKDQVFGCAL
640 650 660 670 680 690
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 HKVCERENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDS
.:::: : :: ::.:::.::: ::::.::.::.:::::::::::. :...:.:.:::.
CCDS74 AALCERERSRVPRFVQQCIRAVEARGLDIDGLYRISGNLATIQKLRYKVDHDERLDLDDG
700 710 720 730 740 750
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 QWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNR
.:::.::.:::::.:::::::::::.: :.::. ::: ::. : . :..::..:: ::.
CCDS74 RWEDVHVITGALKLFFRELPEPLFPFSHFRQFIAAIKLQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNH
760 770 780 790 800 810
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 DTMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELML
::...:: :: ... .. .: ::.::..::::::::: : : .: . ::.:::..::.:
CCDS74 DTLRMLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLRPEVEETSMPMTMVFQNQVVELIL
820 830 840 850 860 870
470
pF1KE4 SEYSKIFGSEED
.. . ::
CCDS74 QQCADIFPPH
880
>>CCDS59214.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10 (794 aa)
initn: 924 init1: 640 opt: 1023 Z-score: 1139.7 bits: 221.0 E(33420): 3.8e-57
Smith-Waterman score: 1292; 53.7% identity (80.1% similar) in 397 aa overlap (81-471:413-793)
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 KVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWSTSWIVLS
:: : :. .:::..:::.:::: .:: ::.
CCDS59 NDKESPTASKPCFPENESSPSSPKHQDTDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQ
390 400 410 420 430 440
120 130 140 150 160
pF1KE4 SRRIEFYKESKQQALSNMKTGH---KPE-SVDLCGAHIEWA-KEKSSRKNVFQITTVSGN
. . : .: :. :. : ::: .::: :: :: : :.:::.::::.. : .:.
CCDS59 GSSLLF---TKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGT
450 460 470 480 490
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 EFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDIKE
:.:.::: : .: :::......:. .. ....: .: : . : ..:.. ::
CCDS59 ELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVET---DEGIEE-EIPDSPGIE---KHDKE-KE
500 510 520 530 540 550
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 QK-PEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLH
:: :.. .: :.. :. :.:.....:. ::::.::::.:....::: ::::.:::.:
CCDS59 QKDPKKLRS--FKV--SSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLA
560 570 580 590 600
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 KVCERENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQ
..:.:::.::: ::: ::: ::..:::.:::::::::::.:::::: ::..:::.:.::.
CCDS59 NLCQRENGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSK
610 620 630 640 650 660
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 WEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNRD
::::::.:::::::::::::::: .. :..::.::: :. :. :::.:...:: ::.:
CCDS59 WEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIK-QEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQD
670 680 690 700 710 720
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 TMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELMLS
::..:: :: ... .. :: :. ::..::::::::. :.::::.:.: ::::::.::.:
CCDS59 TMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILL
730 740 750 760 770 780
470
pF1KE4 EYSKIFGSEED
: :.:::
CCDS59 ELSSIFGR
790
>>CCDS73082.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10 (799 aa)
initn: 924 init1: 640 opt: 1023 Z-score: 1139.7 bits: 221.0 E(33420): 3.8e-57
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60 70 80 90 100 110
pF1KE4 KVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWSTSWIVLS
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CCDS73 PTASKPCFPENESSPSSPKHQDTASSPKDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQ
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120 130 140 150 160
pF1KE4 SRRIEFYKESKQQALSNMKTGH---KPE-SVDLCGAHIEWA-KEKSSRKNVFQITTVSGN
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CCDS73 GSSLLF---TKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGT
450 460 470 480 490 500
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pF1KE4 EFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDIKE
:.:.::: : .: :::......:. .. ....: .: : . : ..:.. ::
CCDS73 ELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVET---DEGIEE-EIPDSPGIE---KHDKE-KE
510 520 530 540 550
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pF1KE4 QK-PEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLH
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CCDS73 QKDPKKLRS--FKV--SSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLA
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pF1KE4 KVCERENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQ
..:.:::.::: ::: ::: ::..:::.:::::::::::.:::::: ::..:::.:.::.
CCDS73 NLCQRENGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSK
620 630 640 650 660 670
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pF1KE4 WEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNRD
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CCDS73 WEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIK-QEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQD
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pF1KE4 TMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELMLS
::..:: :: ... .. :: :. ::..::::::::. :.::::.:.: ::::::.::.:
CCDS73 TMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILL
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470
pF1KE4 EYSKIFGSEED
: :.:::
CCDS73 ELSSIFGR
>>CCDS59215.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10 (816 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE4 MQKSTNSDTSVETLNSTRQGTGAVQMRIKNANSHHDR-LSQSKSMILTDVGKVTEPISR
::.:...: . .:.:. : .. :::
CCDS59 EKWLKHVDDQGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSL---DR-RLQEPIVL
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pF1KE4 HRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWSTSWIVLSSRRIEFYK
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CCDS59 TKWRHSTIVL-DTNDK-DQ---EKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLF--
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pF1KE4 ESKQQALSNMKTGH---KPE-SVDLCGAHIEWA-KEKSSRKNVFQITTVSGNEFLLQSDI
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CCDS59 -TKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDN
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pF1KE4 DFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDIKEQK-PEHRK
: .: :::......:. ... ...: .: : . : ..:.. :::: :.. .
CCDS59 DTVINDWFKVLSSTINNQAVETD---EGIEE-EIPDSPGIE---KHDKE-KEQKDPKKLR
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pF1KE4 SLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHKVCERENS
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CCDS59 S--FKV--SSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQRENG
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pF1KE4 TVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVT
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CCDS59 TVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVIT
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360 370 380 390 400 410
pF1KE4 GALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNRDTMKVLFGH
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CCDS59 GALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIK-QEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRH
700 710 720 730 740 750
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 LTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELMLSEYSKIFGS
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CCDS59 LRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR
760 770 780 790 800 810
pF1KE4 EED
>>CCDS59216.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10 (841 aa)
initn: 924 init1: 640 opt: 1023 Z-score: 1139.3 bits: 221.0 E(33420): 3.9e-57
Smith-Waterman score: 1292; 53.7% identity (80.1% similar) in 397 aa overlap (81-471:460-840)
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 KVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWSTSWIVLS
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CCDS59 NDKESPTASKPCFPENESSPSSPKHQDTDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQ
430 440 450 460 470 480
120 130 140 150 160
pF1KE4 SRRIEFYKESKQQALSNMKTGH---KPE-SVDLCGAHIEWA-KEKSSRKNVFQITTVSGN
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CCDS59 GSSLLF---TKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGT
490 500 510 520 530 540
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 EFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDIKE
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CCDS59 ELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVET---DEGIEE-EIPDSPGIE---KHDKE-KE
550 560 570 580 590
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 QK-PEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLH
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CCDS59 QKDPKKLRS--FKV--SSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLA
600 610 620 630 640 650
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 KVCERENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQ
..:.:::.::: ::: ::: ::..:::.:::::::::::.:::::: ::..:::.:.::.
CCDS59 NLCQRENGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSK
660 670 680 690 700 710
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 WEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNRD
::::::.:::::::::::::::: .. :..::.::: :. :. :::.:...:: ::.:
CCDS59 WEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIK-QEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQD
720 730 740 750 760 770
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 TMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELMLS
::..:: :: ... .. :: :. ::..::::::::. :.::::.:.: ::::::.::.:
CCDS59 TMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILL
780 790 800 810 820 830
470
pF1KE4 EYSKIFGSEED
: :.:::
CCDS59 ELSSIFGR
840
>>CCDS7170.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10 (846 aa)
initn: 924 init1: 640 opt: 1023 Z-score: 1139.3 bits: 221.0 E(33420): 4e-57
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60 70 80 90 100 110
pF1KE4 KVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWSTSWIVLS
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CCDS71 PTASKPCFPENESSPSSPKHQDTASSPKDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQ
440 450 460 470 480 490
120 130 140 150 160
pF1KE4 SRRIEFYKESKQQALSNMKTGH---KPE-SVDLCGAHIEWA-KEKSSRKNVFQITTVSGN
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CCDS71 GSSLLF---TKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGT
500 510 520 530 540 550
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pF1KE4 EFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDIKE
:.:.::: : .: :::......:. .. ....: .: : . : ..:.. ::
CCDS71 ELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVET---DEGIEE-EIPDSPGIE---KHDKE-KE
560 570 580 590 600
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 QK-PEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLH
:: :.. .: :.. :. :.:.....:. ::::.::::.:....::: ::::.:::.:
CCDS71 QKDPKKLRS--FKV--SSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLA
610 620 630 640 650
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 KVCERENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQ
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CCDS71 NLCQRENGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSK
660 670 680 690 700 710
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pF1KE4 WEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNRD
::::::.:::::::::::::::: .. :..::.::: :. :. :::.:...:: ::.:
CCDS71 WEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIK-QEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQD
720 730 740 750 760 770
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pF1KE4 TMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELMLS
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CCDS71 TMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILL
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470
pF1KE4 EYSKIFGSEED
: :.:::
CCDS71 ELSSIFGR
840
>>CCDS44929.1 ARHGAP9 gene_id:64333|Hs109|chr12 (640 aa)
initn: 876 init1: 405 opt: 735 Z-score: 820.3 bits: 161.6 E(33420): 2.3e-39
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CCDS44 GTPEPLDPQGSLSLSQRTSQLDPPALQAPRPLPQLLDDPHEVEKSGLLNMTKIAQGGRKL
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::::. ::.::.. . ::.: : :. .: .::: ::: :: . ... :::.:
CCDS44 RKNWGPSWVVLTGNSLVFYREPPPTAPSSGWGPAGSRPESSVDLRGAALAHGRHLSSRRN
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CCDS44 VLHIRTIPGHEFLLQSDHETELRAWHRALRTVIERLDREN--P---LEL-RLSGSGPAEL
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pF1KE4 KGLIKDQIFGSHLHKVCERENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRF
.::..::.:: .:...:.::..::: :.. :: ::.:::::::::::::::::..:::::
CCDS44 RGLLRDQVFGCQLESLCQREGDTVPSFLRLCIAAVDKRGLDVDGIYRVSGNLAVVQKLRF
520 530 540 550 560 570
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pF1KE4 IVN------------------QEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFF
.:. :: .:.::...:.::::::::::.:.::::.:: : ..
CCDS44 LVDRERAVTSDGRYVFPEQPGQEGRLDLDSTEWDDIHVVTGALKLFLRELPQPLVPPLLL
580 590 600 610 620 630
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pF1KE4 EQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNRDTMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGI
.: :.
CCDS44 PHFRAALG
640
>>CCDS56027.1 ARHGAP23 gene_id:57636|Hs109|chr17 (1491 aa)
initn: 452 init1: 304 opt: 539 Z-score: 596.0 bits: 121.3 E(33420): 7.3e-27
Smith-Waterman score: 573; 29.5% identity (63.3% similar) in 420 aa overlap (80-475:689-1102)
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pF1KE4 GKVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKI-ADGGKK----LRKNWST
...::.: .: . ::: ::. :.
CCDS56 SLDSWGTSEDADAPSKRHSTSDLSDATFSDIRREGWLYYKQILTKKGKKAGSGLRQ-WKR
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pF1KE4 SWIVLSSRRIEFYKESKQQ---ALSNMKTGH-KPESVDLC-GAH-IEWAKEKSSRKNVFQ
. .: .: . . :: .. : . .: . :.. .: :. .. . ...:..::.
CCDS56 VYAALRARSLSLSKERREPGPAAAGAAAAGAGEDEAAPVCIGSCLVDISYSETKRRHVFR
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pF1KE4 ITTVSGNEFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSH
.::.. :.:.:.. .: :..::.. .: .: .. : :. .. . .::
CCDS56 LTTADFCEYLFQAEDRDDMLGWIRAIRENSRAEGEDPGCANQALISKKL---NDYRKVSH
780 790 800 810 820 830
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pF1KE4 YDSDIKEQKPEHRKSL-----MFRLHHSASD---TSDKNRVKSRLKKFITRRP-SLKTLQ
.. ...:. ..: : :..::. :.: .. . . : ... ..
CCDS56 SSGPKADSSPKGSRGLGGLKSEF-LKQSAARGLRTQDLPAGSKDDSAAAPKTPWGINIIK
840 850 860 870 880 890
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pF1KE4 EKGLIKDQIFGSHLHKVCE--RENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQK
.. . :: .:.. :. ::. :: .: : . :: :::. ::::: :: :....
CCDS56 KNKKAAPRAFGVRLEE-CQPATENQRVPLIVAACCRIVEARGLESTGIYRVPGNNAVVSS
900 910 920 930 940 950
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 LRFIVNQEE-KLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNT
:. .:. .::.: .:.:..:... :: :::.:::::: . ...:.:: . .:
CCDS56 LQEQLNRGPGDINLQDERWQDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTDDKYNDFIEANRIEDARE
960 970 980 990 1000 1010
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pF1KE4 RIEAVKSLVQKLPPPNRDTMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLR-AENET
:......:.. :: .:.: : ::: :. .. :: : ..:..::::::.: .:..
CCDS56 RMRTLRKLIRDLPGHYYETLKFLVGHLKTIADHSEKNKMEPRNLALVFGPTLVRTSEDNM
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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pF1KE4 GNMAIHMVYQNQIAELMLSEYSKIFGSEED
.:. :: . .:.: .... . .:..:::
CCDS56 TDMVTHMPDRYKIVETLIQHSDWFFSDEEDKGERTPVGDKEPQAVPNIEYLLPNIGRTVP
1080 1090 1100 1110 1120 1130
475 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Oct 24 21:37:42 2019 done: Thu Oct 24 21:37:42 2019
Total Scan time: 1.410 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]