Result of FASTA (ccds) for pF1KE4105
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4105, 475 aa
  1>>>pF1KE4105     475 - 475 aa - 475 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2111+/-0.00102; mu= 13.3769+/- 0.062
 mean_var=80.5198+/-16.429, 0's: 0 Z-trim(105.1): 141  B-trim: 5 in 1/49
 Lambda= 0.142930
 statistics sampled from 8208 (8352) to 8208 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.25), width:  16
 Scan time:  1.410

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS2184.1 ARHGAP15 gene_id:55843|Hs109|chr2       ( 475) 3099 649.0 3.2e-186
CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs109|chr17    ( 548) 1218 261.1 2.1e-69
CCDS74082.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs109|chr17    ( 889) 1218 261.2 3.3e-69
CCDS59214.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10     ( 794) 1023 221.0 3.8e-57
CCDS73082.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10     ( 799) 1023 221.0 3.8e-57
CCDS59215.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10     ( 816) 1023 221.0 3.8e-57
CCDS59216.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10     ( 841) 1023 221.0 3.9e-57
CCDS7170.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10      ( 846) 1023 221.0   4e-57
CCDS44929.1 ARHGAP9 gene_id:64333|Hs109|chr12      ( 640)  735 161.6 2.3e-39
CCDS56027.1 ARHGAP23 gene_id:57636|Hs109|chr17     (1491)  539 121.3 7.3e-27
CCDS7144.2 ARHGAP21 gene_id:57584|Hs109|chr10      (1958)  488 110.8 1.4e-23
CCDS47566.1 CHN2 gene_id:1124|Hs109|chr7           ( 332)  442 101.0   2e-21
CCDS56147.1 CHN1 gene_id:1123|Hs109|chr2           ( 334)  442 101.1   2e-21
CCDS44928.1 ARHGAP9 gene_id:64333|Hs109|chr12      ( 547)  445 101.7   2e-21
CCDS58497.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17             ( 310)  440 100.6 2.5e-21
CCDS46454.1 CHN1 gene_id:1123|Hs109|chr2           ( 433)  442 101.1 2.5e-21
CCDS8941.2 ARHGAP9 gene_id:64333|Hs109|chr12       ( 731)  445 101.8 2.6e-21
CCDS46455.1 CHN1 gene_id:1123|Hs109|chr2           ( 459)  442 101.1 2.7e-21
CCDS5420.1 CHN2 gene_id:1124|Hs109|chr7            ( 468)  442 101.1 2.7e-21
CCDS81705.1 ARHGAP9 gene_id:64333|Hs109|chr12      ( 821)  445 101.8 2.9e-21
CCDS87488.1 CHN2 gene_id:1124|Hs109|chr7           ( 543)  442 101.1 3.1e-21
CCDS73936.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17             ( 641)  440 100.7 4.8e-21
CCDS54060.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17             ( 813)  440 100.8 5.9e-21
CCDS11000.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17             ( 822)  440 100.8   6e-21
CCDS10999.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17             ( 859)  440 100.8 6.2e-21
CCDS87332.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs109|chr5      ( 686)  436 99.9   9e-21
CCDS47297.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs109|chr5      ( 759)  436 99.9 9.9e-21
CCDS4277.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs109|chr5       ( 814)  436 100.0 1.1e-20
CCDS54254.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs109|chr19    (1123)  437 100.2 1.2e-20
CCDS12477.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs109|chr19    (1126)  437 100.2 1.2e-20
CCDS14388.1 OPHN1 gene_id:4983|Hs109|chrX          ( 802)  433 99.3 1.6e-20
CCDS34075.1 ARHGAP10 gene_id:79658|Hs109|chr4      ( 786)  431 98.9 2.1e-20
CCDS44769.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs109|chr11      (2087)  433 99.5 3.7e-20
CCDS13807.1 BCR gene_id:613|Hs109|chr22            (1227)  429 98.6 4.1e-20
CCDS13806.1 BCR gene_id:613|Hs109|chr22            (1271)  429 98.6 4.2e-20
CCDS1215.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs109|chr1      ( 890)  418 96.3 1.5e-19
CCDS30918.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs109|chr1     (1101)  418 96.3 1.8e-19
CCDS31718.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs109|chr11      (1738)  417 96.2 3.1e-19
CCDS46127.1 ARHGAP35 gene_id:2909|Hs109|chr19      (1499)  415 95.7 3.6e-19
CCDS78219.1 CHN2 gene_id:1124|Hs109|chr7           ( 274)  391 90.5 2.5e-18
CCDS43135.1 ARHGAP31 gene_id:57514|Hs109|chr3      (1444)  396 91.8 5.3e-18
CCDS45095.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs109|chr14        (1501)  387 90.0   2e-17
CCDS32062.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs109|chr14        (1502)  387 90.0   2e-17
CCDS43246.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs109|chr4      ( 653)  348 81.8 2.5e-15
CCDS3611.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs109|chr4       ( 655)  348 81.8 2.5e-15
CCDS58080.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs109|chr10     ( 714)  348 81.8 2.7e-15
CCDS34025.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs109|chr4      ( 748)  348 81.8 2.8e-15
CCDS14736.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs109|chrX         ( 946)  340 80.2 1.1e-14
CCDS55540.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs109|chrX         ( 986)  340 80.2 1.1e-14
CCDS11845.1 RALBP1 gene_id:10928|Hs109|chr18       ( 655)  332 78.5 2.5e-14


>>CCDS2184.1 ARHGAP15 gene_id:55843|Hs109|chr2            (475 aa)
 initn: 3099 init1: 3099 opt: 3099  Z-score: 3456.8  bits: 649.0 E(33420): 3.2e-186
Smith-Waterman score: 3099; 100.0% identity (100.0% similar) in 475 aa overlap (1-475:1-475)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MQKSTNSDTSVETLNSTRQGTGAVQMRIKNANSHHDRLSQSKSMILTDVGKVTEPISRHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 MQKSTNSDTSVETLNSTRQGTGAVQMRIKNANSHHDRLSQSKSMILTDVGKVTEPISRHR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 RNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWSTSWIVLSSRRIEFYKES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 RNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWSTSWIVLSSRRIEFYKES
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 KQQALSNMKTGHKPESVDLCGAHIEWAKEKSSRKNVFQITTVSGNEFLLQSDIDFIILDW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 KQQALSNMKTGHKPESVDLCGAHIEWAKEKSSRKNVFQITTVSGNEFLLQSDIDFIILDW
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 FHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDIKEQKPEHRKSLMFRLHH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 FHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDIKEQKPEHRKSLMFRLHH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 SASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHKVCERENSTVPWFVKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 SASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHKVCERENSTVPWFVKQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 CIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 CIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 ELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNRDTMKVLFGHLTKIVAKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 ELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNRDTMKVLFGHLTKIVAKA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470     
pF1KE4 SKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELMLSEYSKIFGSEED
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 SKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELMLSEYSKIFGSEED
              430       440       450       460       470     

>>CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs109|chr17         (548 aa)
 initn: 1204 init1: 944 opt: 1218  Z-score: 1359.6  bits: 261.1 E(33420): 2.1e-69
Smith-Waterman score: 1218; 48.1% identity (75.6% similar) in 397 aa overlap (80-470:156-545)

      50        60        70        80        90       100         
pF1KE4 GKVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRK-NWSTSWIV
                                     ..: : :...: :: ::.::: .::.:: :
CCDS11 PPEEKVPAELDEVGSWEEVSPATAAVRTKTLDKAGVLHRTKTADKGKRLRKKHWSASWTV
         130       140       150       160       170       180     

      110       120       130           140        150       160   
pF1KE4 LSSRRIEFYKESKQQALSNMKTGHK---PE-SVDLCGAHIEWA-KEKSSRKNVFQITTVS
       : .  . :.:.:: .: ....   :   :: .:.: :: . :: :.:::::::... . .
CCDS11 LEGGVLTFFKDSKTSAAGGLRQPSKFSTPEYTVELRGATLSWAPKDKSSRKNVLELRSRD
         190       200       210       220       230       240     

           170       180       190       200       210       220   
pF1KE4 GNEFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDI
       :.:.:.: : . ::  : .:: ..:..:  .   : .. :  ... .:: .: :      
CCDS11 GSEYLIQHDSEAIISTWHKAIAQGIQELSAE--LPPEESESSRVDFGSSERLGSW-----
         250       260       270         280       290             

           230       240       250       260       270       280   
pF1KE4 KEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHL
       .:.. . : .        ..  :: ..:. .:.::. :::.:..:.::: ::::.::  :
CCDS11 QEKEEDARPNAAAPALGPVGLESDLSKVRHKLRKFLQRRPTLQSLREKGYIKDQVFGCAL
      300       310       320       330       340       350        

           290       300       310       320       330       340   
pF1KE4 HKVCERENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDS
         .:::: : :: ::.:::.::: ::::.::.::.:::::::::::. :...:.:.:::.
CCDS11 AALCERERSRVPRFVQQCIRAVEARGLDIDGLYRISGNLATIQKLRYKVDHDERLDLDDG
      360       370       380       390       400       410        

           350       360       370       380       390       400   
pF1KE4 QWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNR
       .:::.::.:::::.:::::::::::.: :.::. ::: ::.  : . :..::..:: ::.
CCDS11 RWEDVHVITGALKLFFRELPEPLFPFSHFRQFIAAIKLQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNH
      420       430       440       450       460       470        

           410       420       430       440       450       460   
pF1KE4 DTMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELML
       ::...:: :: ... .. .: ::.::..::::::::: : :  .: . ::.:::..::.:
CCDS11 DTLRMLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLRPEVEETSMPMTMVFQNQVVELIL
      480       490       500       510       520       530        

           470     
pF1KE4 SEYSKIFGSEED
       .. . ::     
CCDS11 QQCADIFPPH  
      540          

>>CCDS74082.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs109|chr17         (889 aa)
 initn: 1180 init1: 944 opt: 1218  Z-score: 1356.3  bits: 261.2 E(33420): 3.3e-69
Smith-Waterman score: 1218; 48.1% identity (75.6% similar) in 397 aa overlap (80-470:497-886)

      50        60        70        80        90       100         
pF1KE4 GKVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRK-NWSTSWIV
                                     ..: : :...: :: ::.::: .::.:: :
CCDS74 PPEEKVPAELDEVGSWEEVSPATAAVRTKTLDKAGVLHRTKTADKGKRLRKKHWSASWTV
        470       480       490       500       510       520      

      110       120       130           140        150       160   
pF1KE4 LSSRRIEFYKESKQQALSNMKTGHK---PE-SVDLCGAHIEWA-KEKSSRKNVFQITTVS
       : .  . :.:.:: .: ....   :   :: .:.: :: . :: :.:::::::... . .
CCDS74 LEGGVLTFFKDSKTSAAGGLRQPSKFSTPEYTVELRGATLSWAPKDKSSRKNVLELRSRD
        530       540       550       560       570       580      

           170       180       190       200       210       220   
pF1KE4 GNEFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDI
       :.:.:.: : . ::  : .:: ..:..:  .   : .. :  ... .:: .: :      
CCDS74 GSEYLIQHDSEAIISTWHKAIAQGIQELSAE--LPPEESESSRVDFGSSERLGSW-----
        590       600       610         620       630              

           230       240       250       260       270       280   
pF1KE4 KEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHL
       .:.. . : .        ..  :: ..:. .:.::. :::.:..:.::: ::::.::  :
CCDS74 QEKEEDARPNAAAPALGPVGLESDLSKVRHKLRKFLQRRPTLQSLREKGYIKDQVFGCAL
     640       650       660       670       680       690         

           290       300       310       320       330       340   
pF1KE4 HKVCERENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDS
         .:::: : :: ::.:::.::: ::::.::.::.:::::::::::. :...:.:.:::.
CCDS74 AALCERERSRVPRFVQQCIRAVEARGLDIDGLYRISGNLATIQKLRYKVDHDERLDLDDG
     700       710       720       730       740       750         

           350       360       370       380       390       400   
pF1KE4 QWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNR
       .:::.::.:::::.:::::::::::.: :.::. ::: ::.  : . :..::..:: ::.
CCDS74 RWEDVHVITGALKLFFRELPEPLFPFSHFRQFIAAIKLQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNH
     760       770       780       790       800       810         

           410       420       430       440       450       460   
pF1KE4 DTMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELML
       ::...:: :: ... .. .: ::.::..::::::::: : :  .: . ::.:::..::.:
CCDS74 DTLRMLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLRPEVEETSMPMTMVFQNQVVELIL
     820       830       840       850       860       870         

           470     
pF1KE4 SEYSKIFGSEED
       .. . ::     
CCDS74 QQCADIFPPH  
     880           

>>CCDS59214.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10          (794 aa)
 initn: 924 init1: 640 opt: 1023  Z-score: 1139.7  bits: 221.0 E(33420): 3.8e-57
Smith-Waterman score: 1292; 53.7% identity (80.1% similar) in 397 aa overlap (81-471:413-793)

               60        70        80        90       100       110
pF1KE4 KVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWSTSWIVLS
                                     :: : :. .:::..:::.:::: .:: ::.
CCDS59 NDKESPTASKPCFPENESSPSSPKHQDTDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQ
            390       400       410       420       430       440  

              120       130           140        150       160     
pF1KE4 SRRIEFYKESKQQALSNMKTGH---KPE-SVDLCGAHIEWA-KEKSSRKNVFQITTVSGN
       .  . :   .: :. :.   :    ::: .::: :: :: : :.:::.::::.. : .:.
CCDS59 GSSLLF---TKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGT
               450       460       470       480       490         

         170       180       190       200       210       220     
pF1KE4 EFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDIKE
       :.:.::: : .: :::......:.    ..   ....:  .:  : . :   ..:.. ::
CCDS59 ELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVET---DEGIEE-EIPDSPGIE---KHDKE-KE
     500       510       520          530        540           550 

          230       240       250       260       270       280    
pF1KE4 QK-PEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLH
       :: :.. .:  :..  :. :.:.....:. ::::.::::.:....::: ::::.:::.: 
CCDS59 QKDPKKLRS--FKV--SSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLA
             560           570       580       590       600       

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE4 KVCERENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQ
       ..:.:::.::: ::: ::: ::..:::.:::::::::::.:::::: ::..:::.:.::.
CCDS59 NLCQRENGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSK
       610       620       630       640       650       660       

          350       360       370       380       390       400    
pF1KE4 WEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNRD
       ::::::.:::::::::::::::: .. :..::.::: :.   :. :::.:...:: ::.:
CCDS59 WEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIK-QEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQD
       670       680       690       700        710       720      

          410       420       430       440       450       460    
pF1KE4 TMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELMLS
       ::..:: :: ... .. :: :. ::..::::::::. :.::::.:.: ::::::.::.: 
CCDS59 TMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILL
        730       740       750       760       770       780      

          470     
pF1KE4 EYSKIFGSEED
       : :.:::    
CCDS59 ELSSIFGR   
        790       

>>CCDS73082.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10          (799 aa)
 initn: 924 init1: 640 opt: 1023  Z-score: 1139.7  bits: 221.0 E(33420): 3.8e-57
Smith-Waterman score: 1292; 53.7% identity (80.1% similar) in 397 aa overlap (81-471:418-798)

               60        70        80        90       100       110
pF1KE4 KVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWSTSWIVLS
                                     :: : :. .:::..:::.:::: .:: ::.
CCDS73 PTASKPCFPENESSPSSPKHQDTASSPKDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQ
       390       400       410       420       430       440       

              120       130           140        150       160     
pF1KE4 SRRIEFYKESKQQALSNMKTGH---KPE-SVDLCGAHIEWA-KEKSSRKNVFQITTVSGN
       .  . :   .: :. :.   :    ::: .::: :: :: : :.:::.::::.. : .:.
CCDS73 GSSLLF---TKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGT
       450          460       470       480       490       500    

         170       180       190       200       210       220     
pF1KE4 EFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDIKE
       :.:.::: : .: :::......:.    ..   ....:  .:  : . :   ..:.. ::
CCDS73 ELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVET---DEGIEE-EIPDSPGIE---KHDKE-KE
          510       520       530          540           550       

          230       240       250       260       270       280    
pF1KE4 QK-PEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLH
       :: :.. .:  :..  :. :.:.....:. ::::.::::.:....::: ::::.:::.: 
CCDS73 QKDPKKLRS--FKV--SSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLA
        560           570       580       590       600       610  

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE4 KVCERENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQ
       ..:.:::.::: ::: ::: ::..:::.:::::::::::.:::::: ::..:::.:.::.
CCDS73 NLCQRENGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSK
            620       630       640       650       660       670  

          350       360       370       380       390       400    
pF1KE4 WEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNRD
       ::::::.:::::::::::::::: .. :..::.::: :.   :. :::.:...:: ::.:
CCDS73 WEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIK-QEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQD
            680       690       700        710       720       730 

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pF1KE4 TMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELMLS
       ::..:: :: ... .. :: :. ::..::::::::. :.::::.:.: ::::::.::.: 
CCDS73 TMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILL
             740       750       760       770       780       790 

          470     
pF1KE4 EYSKIFGSEED
       : :.:::    
CCDS73 ELSSIFGR   
                  

>>CCDS59215.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10          (816 aa)
 initn: 924 init1: 640 opt: 1023  Z-score: 1139.5  bits: 221.0 E(33420): 3.8e-57
Smith-Waterman score: 1308; 50.8% identity (77.3% similar) in 449 aa overlap (30-471:392-815)

                10        20        30         40        50        
pF1KE4  MQKSTNSDTSVETLNSTRQGTGAVQMRIKNANSHHDR-LSQSKSMILTDVGKVTEPISR
                                     ::.:...: . .:.:.   :  .. :::  
CCDS59 EKWLKHVDDQGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSL---DR-RLQEPIVL
             370       380       390       400           410       

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE4 HRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWSTSWIVLSSRRIEFYK
        .  ::  .: :.    .:   :: : :. .:::..:::.:::: .:: ::..  . :  
CCDS59 TKWRHSTIVL-DTNDK-DQ---EKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLF--
       420        430           440       450       460       470  

      120       130           140        150       160       170   
pF1KE4 ESKQQALSNMKTGH---KPE-SVDLCGAHIEWA-KEKSSRKNVFQITTVSGNEFLLQSDI
        .: :. :.   :    ::: .::: :: :: : :.:::.::::.. : .:.:.:.::: 
CCDS59 -TKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDN
               480       490       500       510       520         

           180       190       200       210       220        230  
pF1KE4 DFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDIKEQK-PEHRK
       : .: :::......:.    ...   ...:  .:  : . :   ..:.. :::: :.. .
CCDS59 DTVINDWFKVLSSTINNQAVETD---EGIEE-EIPDSPGIE---KHDKE-KEQKDPKKLR
     530       540       550           560          570        580 

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE4 SLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHKVCERENS
       :  :..  :. :.:.....:. ::::.::::.:....::: ::::.:::.: ..:.:::.
CCDS59 S--FKV--SSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQRENG
                 590       600       610       620       630       

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE4 TVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVT
       ::: ::: ::: ::..:::.:::::::::::.:::::: ::..:::.:.::.::::::.:
CCDS59 TVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVIT
       640       650       660       670       680       690       

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE4 GALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNRDTMKVLFGH
       ::::::::::::::: .. :..::.::: :.   :. :::.:...:: ::.:::..:: :
CCDS59 GALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIK-QEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRH
       700       710       720        730       740       750      

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE4 LTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELMLSEYSKIFGS
       : ... .. :: :. ::..::::::::. :.::::.:.: ::::::.::.: : :.::: 
CCDS59 LRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR
        760       770       780       790       800       810      

          
pF1KE4 EED

>>CCDS59216.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10          (841 aa)
 initn: 924 init1: 640 opt: 1023  Z-score: 1139.3  bits: 221.0 E(33420): 3.9e-57
Smith-Waterman score: 1292; 53.7% identity (80.1% similar) in 397 aa overlap (81-471:460-840)

               60        70        80        90       100       110
pF1KE4 KVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWSTSWIVLS
                                     :: : :. .:::..:::.:::: .:: ::.
CCDS59 NDKESPTASKPCFPENESSPSSPKHQDTDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQ
     430       440       450       460       470       480         

              120       130           140        150       160     
pF1KE4 SRRIEFYKESKQQALSNMKTGH---KPE-SVDLCGAHIEWA-KEKSSRKNVFQITTVSGN
       .  . :   .: :. :.   :    ::: .::: :: :: : :.:::.::::.. : .:.
CCDS59 GSSLLF---TKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGT
     490          500       510       520       530       540      

         170       180       190       200       210       220     
pF1KE4 EFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDIKE
       :.:.::: : .: :::......:.    ..   ....:  .:  : . :   ..:.. ::
CCDS59 ELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVET---DEGIEE-EIPDSPGIE---KHDKE-KE
        550       560       570          580        590            

          230       240       250       260       270       280    
pF1KE4 QK-PEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLH
       :: :.. .:  :..  :. :.:.....:. ::::.::::.:....::: ::::.:::.: 
CCDS59 QKDPKKLRS--FKV--SSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLA
      600         610         620       630       640       650    

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE4 KVCERENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQ
       ..:.:::.::: ::: ::: ::..:::.:::::::::::.:::::: ::..:::.:.::.
CCDS59 NLCQRENGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSK
          660       670       680       690       700       710    

          350       360       370       380       390       400    
pF1KE4 WEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNRD
       ::::::.:::::::::::::::: .. :..::.::: :.   :. :::.:...:: ::.:
CCDS59 WEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIK-QEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQD
          720       730       740       750        760       770   

          410       420       430       440       450       460    
pF1KE4 TMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELMLS
       ::..:: :: ... .. :: :. ::..::::::::. :.::::.:.: ::::::.::.: 
CCDS59 TMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILL
           780       790       800       810       820       830   

          470     
pF1KE4 EYSKIFGSEED
       : :.:::    
CCDS59 ELSSIFGR   
           840    

>>CCDS7170.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10           (846 aa)
 initn: 924 init1: 640 opt: 1023  Z-score: 1139.3  bits: 221.0 E(33420): 4e-57
Smith-Waterman score: 1292; 53.7% identity (80.1% similar) in 397 aa overlap (81-471:465-845)

               60        70        80        90       100       110
pF1KE4 KVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWSTSWIVLS
                                     :: : :. .:::..:::.:::: .:: ::.
CCDS71 PTASKPCFPENESSPSSPKHQDTASSPKDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQ
          440       450       460       470       480       490    

              120       130           140        150       160     
pF1KE4 SRRIEFYKESKQQALSNMKTGH---KPE-SVDLCGAHIEWA-KEKSSRKNVFQITTVSGN
       .  . :   .: :. :.   :    ::: .::: :: :: : :.:::.::::.. : .:.
CCDS71 GSSLLF---TKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGT
          500          510       520       530       540       550 

         170       180       190       200       210       220     
pF1KE4 EFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDIKE
       :.:.::: : .: :::......:.    ..   ....:  .:  : . :   ..:.. ::
CCDS71 ELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVET---DEGIEE-EIPDSPGIE---KHDKE-KE
             560       570       580           590          600    

          230       240       250       260       270       280    
pF1KE4 QK-PEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLH
       :: :.. .:  :..  :. :.:.....:. ::::.::::.:....::: ::::.:::.: 
CCDS71 QKDPKKLRS--FKV--SSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLA
           610           620       630       640       650         

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE4 KVCERENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQ
       ..:.:::.::: ::: ::: ::..:::.:::::::::::.:::::: ::..:::.:.::.
CCDS71 NLCQRENGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSK
     660       670       680       690       700       710         

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pF1KE4 WEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNRD
       ::::::.:::::::::::::::: .. :..::.::: :.   :. :::.:...:: ::.:
CCDS71 WEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIK-QEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQD
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pF1KE4 TMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELMLS
       ::..:: :: ... .. :: :. ::..::::::::. :.::::.:.: ::::::.::.: 
CCDS71 TMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILL
      780       790       800       810       820       830        

          470     
pF1KE4 EYSKIFGSEED
       : :.:::    
CCDS71 ELSSIFGR   
      840         

>>CCDS44929.1 ARHGAP9 gene_id:64333|Hs109|chr12           (640 aa)
 initn: 876 init1: 405 opt: 735  Z-score: 820.3  bits: 161.6 E(33420): 2.3e-39
Smith-Waterman score: 866; 44.5% identity (71.5% similar) in 337 aa overlap (74-379:312-639)

            50        60        70             80        90        
pF1KE4 MILTDVGKVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLM-----VEKEGYLQKAKIADGGKKL
                                     :: ::.     ::: : :. .:::.::.::
CCDS44 GTPEPLDPQGSLSLSQRTSQLDPPALQAPRPLPQLLDDPHEVEKSGLLNMTKIAQGGRKL
             290       300       310       320       330       340 

      100       110       120         130        140       150     
pF1KE4 RKNWSTSWIVLSSRRIEFYKESKQQALSNM--KTGHKPES-VDLCGAHIEWAKEKSSRKN
       ::::. ::.::..  . ::.:    : :.    .: .::: ::: :: .  ... :::.:
CCDS44 RKNWGPSWVVLTGNSLVFYREPPPTAPSSGWGPAGSRPESSVDLRGAALAHGRHLSSRRN
             350       360       370       380       390       400 

         160       170       180       190       200       210     
pF1KE4 VFQITTVSGNEFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTEL
       :..: :. :.::::::: .  .  : .:....:.:: ...  :   ::: ... :. .::
CCDS44 VLHIRTIPGHEFLLQSDHETELRAWHRALRTVIERLDREN--P---LEL-RLSGSGPAEL
             410       420       430       440             450     

         220       230       240            250       260       270
pF1KE4 LSHYDSDIKEQKPEHRKSLMFRLHHSAS-----DTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQE
        .  :   .:.. :  .. ..::    :     . ...:::...::..:..:: :..:::
CCDS44 SAGED---EEEESELVSKPLLRLSSRRSSIRGPEGTEQNRVRNKLKRLIAKRPPLQSLQE
         460          470       480       490       500       510  

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pF1KE4 KGLIKDQIFGSHLHKVCERENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRF
       .::..::.:: .:...:.::..::: :.. :: ::.:::::::::::::::::..:::::
CCDS44 RGLLRDQVFGCQLESLCQREGDTVPSFLRLCIAAVDKRGLDVDGIYRVSGNLAVVQKLRF
            520       530       540       550       560       570  

                                340       350       360       370  
pF1KE4 IVN------------------QEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFF
       .:.                  :: .:.::...:.::::::::::.:.::::.:: :  ..
CCDS44 LVDRERAVTSDGRYVFPEQPGQEGRLDLDSTEWDDIHVVTGALKLFLRELPQPLVPPLLL
            580       590       600       610       620       630  

            380       390       400       410       420       430  
pF1KE4 EQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNRDTMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGI
        .:  :.                                                     
CCDS44 PHFRAALG                                                    
            640                                                    

>>CCDS56027.1 ARHGAP23 gene_id:57636|Hs109|chr17          (1491 aa)
 initn: 452 init1: 304 opt: 539  Z-score: 596.0  bits: 121.3 E(33420): 7.3e-27
Smith-Waterman score: 573; 29.5% identity (63.3% similar) in 420 aa overlap (80-475:689-1102)

      50        60        70        80        90            100    
pF1KE4 GKVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKI-ADGGKK----LRKNWST
                                     ...::.:   .: .  :::    ::. :. 
CCDS56 SLDSWGTSEDADAPSKRHSTSDLSDATFSDIRREGWLYYKQILTKKGKKAGSGLRQ-WKR
      660       670       680       690       700       710        

          110       120          130        140         150        
pF1KE4 SWIVLSSRRIEFYKESKQQ---ALSNMKTGH-KPESVDLC-GAH-IEWAKEKSSRKNVFQ
        . .: .: . . :: ..    : .   .:  . :.. .: :.  .. .  ...:..::.
CCDS56 VYAALRARSLSLSKERREPGPAAAGAAAAGAGEDEAAPVCIGSCLVDISYSETKRRHVFR
       720       730       740       750       760       770       

      160       170       180       190       200       210        
pF1KE4 ITTVSGNEFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSH
       .::..  :.:.:..    .: :..::..      .: .: .. :   :.   .. . .::
CCDS56 LTTADFCEYLFQAEDRDDMLGWIRAIRENSRAEGEDPGCANQALISKKL---NDYRKVSH
       780       790       800       810       820          830    

      220       230            240          250       260          
pF1KE4 YDSDIKEQKPEHRKSL-----MFRLHHSASD---TSDKNRVKSRLKKFITRRP-SLKTLQ
        ..   ...:.  ..:      : :..::.    :.:    ..  .    . : ... ..
CCDS56 SSGPKADSSPKGSRGLGGLKSEF-LKQSAARGLRTQDLPAGSKDDSAAAPKTPWGINIIK
          840       850        860       870       880       890   

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pF1KE4 EKGLIKDQIFGSHLHKVCE--RENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQK
       ..     . :: .:.. :.   ::. :: .:  : . :: :::.  ::::: :: :....
CCDS56 KNKKAAPRAFGVRLEE-CQPATENQRVPLIVAACCRIVEARGLESTGIYRVPGNNAVVSS
           900        910       920       930       940       950  

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pF1KE4 LRFIVNQEE-KLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNT
       :.  .:.    .::.: .:.:..:... :: :::.::::::  . ...:.:: . .:   
CCDS56 LQEQLNRGPGDINLQDERWQDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTDDKYNDFIEANRIEDARE
            960       970       980       990      1000      1010  

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pF1KE4 RIEAVKSLVQKLPPPNRDTMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLR-AENET
       :......:.. ::    .:.: : :::  :. .. :: :  ..:..::::::.: .:.. 
CCDS56 RMRTLRKLIRDLPGHYYETLKFLVGHLKTIADHSEKNKMEPRNLALVFGPTLVRTSEDNM
           1020      1030      1040      1050      1060      1070  

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pF1KE4 GNMAIHMVYQNQIAELMLSEYSKIFGSEED                              
        .:. ::  . .:.: .... . .:..:::                              
CCDS56 TDMVTHMPDRYKIVETLIQHSDWFFSDEEDKGERTPVGDKEPQAVPNIEYLLPNIGRTVP
           1080      1090      1100      1110      1120      1130  




475 residues in 1 query   sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Oct 24 21:37:42 2019 done: Thu Oct 24 21:37:42 2019
 Total Scan time:  1.410 Total Display time:  0.080

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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