Result of FASTA (ccds) for pF1KE4235
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4235, 858 aa
  1>>>pF1KE4235     858 - 858 aa - 858 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4077+/-0.000869; mu= 10.7542+/- 0.052
 mean_var=119.9647+/-23.744, 0's: 0 Z-trim(109.1): 89  B-trim: 77 in 1/52
 Lambda= 0.117097
 statistics sampled from 10716 (10806) to 10716 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.323), width:  16
 Scan time:  2.020

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs109|chr20         ( 858) 5673 970.1       0
CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs109|chr8           ( 911) 3148 543.5 6.4e-154
CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs109|chr8          ( 500) 1276 227.1   6e-59
CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs109|chr2           ( 494) 1243 221.6 2.8e-57
CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs109|chr18        ( 466) 1084 194.7 3.3e-49
CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs109|chr2        ( 425) 1021 184.0 4.9e-46
CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs109|chrX          ( 647)  933 169.2 2.1e-41
CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs109|chr7           ( 630)  918 166.7 1.2e-40
CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs109|chr2           ( 491)  896 162.9 1.3e-39
CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs109|chr8           ( 477)  861 157.0 7.4e-38
CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs109|chr1            ( 499)  824 150.8 5.8e-36
CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs109|chr20         ( 513)  816 149.4 1.5e-35
CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs109|chr1            ( 575)  782 143.7   9e-34
CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs109|chr19         ( 456)  755 139.1 1.7e-32
CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs109|chr12          ( 495)  755 139.1 1.9e-32
CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs109|chr1           ( 511)  738 136.3 1.4e-31
CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs109|chr1            ( 636)  727 134.4 6.2e-31
CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs109|chr16        ( 519)  716 132.5 1.9e-30
CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs109|chr11         ( 653)  716 132.6 2.3e-30
CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs109|chr1            ( 655)  715 132.4 2.6e-30
CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs109|chr12          ( 613)  682 126.8 1.2e-28
CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs109|chr9         ( 545)  676 125.8 2.1e-28
CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs109|chr2         ( 436)  646 120.7 5.9e-27
CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs109|chr12          ( 529)  576 108.9 2.5e-23
CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs109|chr12         ( 583)  559 106.0   2e-22
CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs109|chr12          ( 558)  557 105.7 2.4e-22
CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs109|chr12          ( 613)  551 104.7 5.3e-22
CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs109|chr12         ( 618)  551 104.7 5.4e-22
CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs109|chr12         ( 629)  551 104.7 5.5e-22
CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs109|chr12          ( 638)  551 104.7 5.5e-22
CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs109|chr19         ( 757)  550 104.6 7.2e-22
CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs109|chr11          ( 511)  542 103.1 1.3e-21
CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs109|chr11         ( 585)  542 103.2 1.5e-21
CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs109|chr1          ( 626)  537 102.3 2.8e-21
CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs109|chr1            ( 635)  537 102.3 2.8e-21
CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs109|chr20         ( 526)  419 82.4 2.4e-15
CCDS456.1 KCNQ4 gene_id:9132|Hs109|chr1            ( 695)  355 71.6 5.5e-12
CCDS13521.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs109|chr20         ( 393)  342 69.3 1.5e-11
CCDS46629.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs109|chr20         ( 841)  342 69.5   3e-11
CCDS13518.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs109|chr20         ( 844)  342 69.5   3e-11
CCDS13519.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs109|chr20         ( 854)  342 69.5   3e-11
CCDS13520.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs109|chr20         ( 872)  342 69.5 3.1e-11
CCDS55037.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs109|chr6         ( 923)  339 69.0 4.6e-11


>>CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs109|chr20              (858 aa)
 initn: 5673 init1: 5673 opt: 5673  Z-score: 5182.8  bits: 970.1 E(33420):    0
Smith-Waterman score: 5673; 100.0% identity (100.0% similar) in 858 aa overlap (1-858:1-858)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 YWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLWDLLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLWDLLE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 KPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVCIAWF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVCIAWF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 TMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 IMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDDTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDDTK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 FKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 KEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDKVQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDKVQD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 NHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQHLNVQQLEDMYNKMAKTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQHLNVQQLEDMYNKMAKTQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 SQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTRTEGVIDMRSMSSIDSFISCATDFPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTRTEGVIDMRSMSSIDSFISCATDFPE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE4 ATRFSHSPLTSLPSKTGGSTAPEVGWRGALGASGGRFVEANPSPDASQHSSFFIESPKSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ATRFSHSPLTSLPSKTGGSTAPEVGWRGALGASGGRFVEANPSPDASQHSSFFIESPKSS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE4 MKTNNPLKLRALKVNFMEGDPSPLLPVLGMYHDPLRNRGSAAAAVAGLECATLLDKAVLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MKTNNPLKLRALKVNFMEGDPSPLLPVLGMYHDPLRNRGSAAAAVAGLECATLLDKAVLS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE4 PESSIYTTASAKTPPRSPEKHTAIAFNFEAGVHQYIDADTDDEGQLLYSVDSSPPKSLPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PESSIYTTASAKTPPRSPEKHTAIAFNFEAGVHQYIDADTDDEGQLLYSVDSSPPKSLPG
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE4 STSPKFSTGTRSEKNHFESSPLPTSPKFLRQNCIYSTEALTGKGPSGQEKCKLENHISPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 STSPKFSTGTRSEKNHFESSPLPTSPKFLRQNCIYSTEALTGKGPSGQEKCKLENHISPD
              790       800       810       820       830       840

              850        
pF1KE4 VRVLPGGGAHGSTRDQSI
       ::::::::::::::::::
CCDS13 VRVLPGGGAHGSTRDQSI
              850        

>>CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs109|chr8                (911 aa)
 initn: 3453 init1: 3024 opt: 3148  Z-score: 2877.0  bits: 543.5 E(33420): 6.4e-154
Smith-Waterman score: 3417; 63.6% identity (77.4% similar) in 895 aa overlap (2-841:6-894)

                   10        20        30        40        50      
pF1KE4     MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTR
            : :.... :::: ::::::..:.:::.:::::..::::: :::::::::::::::
CCDS62 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTR
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KE4 LGKLRDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFS
       ::::::::::.:::::::::.:..::::::::::::::::::::::.::::::::::::.
CCDS62 LGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFG
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE4 QELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::: .::::::
CCDS62 QELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDKRKKLW
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE4 DLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVC
       :::::::::::::::::.::.::::::::::::::::::  ::::: .:: :::::::::
CCDS62 DLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLAHVEAVC
              190       200       210       220       230       240

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE4 IAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVV
       ::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 IAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVV
              250       260       270       280       290       300

        300       310       320       330       340       350      
pF1KE4 QIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 QIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE
              310       320       330       340       350       360

        360       370       380       390       400       410      
pF1KE4 DDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNF
       : ::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 DATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNF
              370       380       390       400       410       420

        420       430       440       450       460       470      
pF1KE4 SEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:..:..::: ::. . ::
CCDS62 SEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESANTKD
              430       440       450       460       470       480

        480       490       500       510              520         
pF1KE4 KVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEK-------ARSSSSPQHLNVQQL
       ...::::::..:::....::::::.::::.: :   .:         ::::::::..:.:
CCDS62 SADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSAQKL
              490       500       510       520       530       540

     530       540         550        560       570        580     
pF1KE4 EDMYNKMAKTQ--SQPILNTKESAAQ-SKPKEELEMESIPSPVAPLPT-RTEGVIDMRSM
       : .::...:::  :.:  . .:.  . :  .::.::: .  :   : . .:: ..::.: 
CCDS62 EMLYNEITKTQPHSHPNPDCQEKPERPSAYEEEIEMEEVVCPQEQLAVAQTEVIVDMKST
              550       560       570       580       590       600

         590       600       610             620              630  
pF1KE4 SSIDSFISCATDFPEATRFSHSPLTS------LPSKTGGSTA-------PEVGWRGALG-
       :::::: :::::: :. :    : ..      .:.   :.         : .      : 
CCDS62 SSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASHLQMKFPTDLPGTEEHQRARGPPFLTLSREKGP
              610       620       630       640       650       660

                    640          650           660       670       
pF1KE4 -ASGGRF------VEANPSPDASQ---HSSF----FIESPKSSMKTNNPLKLRALKVNFM
        :  : .      . .: . ..::   :: .      .:::::.: .:::: :.::::: 
CCDS62 AARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHSPLQSDNATDSPKSSLKGSNPLKSRSLKVNFK
              670       680       690       700       710       720

              680       690       700       710       720       730
pF1KE4 EG-------DPSPLLPVLGMYHDPLRNRGSAAAAVAGLECATLLDKAVLSPESSIYTTAS
       :.        ::   :.     :   .  .  ...   :  .  :. .:. : :    . 
CCDS62 ENRGSAPQTPPSTARPLPVTTADFSLTTPQHISTILLEETPSQGDRPLLGTEVSAPCQGP
              730       740       750       760       770       780

               740       750        760       770          780     
pF1KE4 AK-TPPRSPEKHTAIAFNFEAGVHQ-YIDADTDDEGQLLYSVDSSPPK---SLPGSTSPK
       .:   :: :...    : : .  .. . . :: :. ..:    .   :   : :.  . :
CCDS62 SKGLSPRFPKQKL---FPFSSRERRSFTEIDTGDDEDFLELPGAREEKQVDSSPNCFADK
              790          800       810       820       830       

         790       800       810          820       830        840 
pF1KE4 FSTGTRSEKNHFESSPLPTSPKFLRQNC---IYSTEALTGKGPSGQEKCKLENHI-SPDV
        : :    ..  :.:   .::.   .::   :: . . . :  :.:: ::.:::. .:..
CCDS62 PSDGRDPLRE--EGSVGSSSPQDTGHNCRQDIYHAVSEVKKD-SSQEGCKMENHLFAPEI
       840         850       860       870        880       890    

             850        
pF1KE4 RVLPGGGAHGSTRDQSI
                        
CCDS62 HSNPGDTGYCPTRETSM
          900       910 

>>CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs109|chr8               (500 aa)
 initn: 1227 init1: 565 opt: 1276  Z-score: 1171.9  bits: 227.1 E(33420): 6e-59
Smith-Waterman score: 1276; 45.9% identity (72.9% similar) in 468 aa overlap (35-481:43-497)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KE4 MTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCN
                                     .::::    .  ..:. .:.::::::    
CCDS63 LDSGSLTSLDSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV
             20        30        40        50        60        70  

                     70        80        90       100       110    
pF1KE4 TH----------DSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALS
       .            : ::.::: .  ::::::::   ::  .:..:::::::.::..::::
CCDS63 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS
             80        90       100       110       120       130  

          120       130       140         150        160        170
pF1KE4 FSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEEL--KREAETLR-EREGEE-FDNTCCAE
       : ::..::::::. ..:::. :: ..:: ..: :  :...:  . ..:.:. :..  :  
CCDS63 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKE-LSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFSQGPCPT
            140       150       160        170       180       190 

              180       190       200       210       220       230
pF1KE4 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLA
        :.:::..::::.::.::.:...:::.:.:.: : ..: .  ::. ::         :: 
CCDS63 VRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMS-AELSWLDL--------QLL
             200       210       220       230                240  

               240       250       260       270       280         
pF1KE4 HV-EAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTES---NKSV
       .. : :::.::: :..::::    . .:..   : ::::::::.:.:. :.::   ....
CCDS63 EILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL-LVESLSGSQTT
            250       260       270       280       290        300 

        290       300       310       320       330       340      
pF1KE4 LQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFS
        ...:: :.::..:..: ::.:::.::::::.:::.:. . :.:.:::.:::..:: :::
CCDS63 QELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFS
             310       320       330       340       350       360 

        350       360       370       380       390       400      
pF1KE4 SLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIA
       .. .:::..  :: : :.: ..:::: .::::::::: : :  ::::. .: ..:.::.:
CCDS63 TVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLA
             370       380       390       400       410       420 

        410       420       430       440          450       460   
pF1KE4 LPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRN---GSIVSMNMKDAFARSIEMMDI
       ::: :: . ::  :   : .: :...::::..  .:    : .:.:..:..::::  :..
CCDS63 LPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSI--MEM
             430       440       450       460       470           

           470       480       490       500       510       520   
pF1KE4 VVEKNGENMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQH
       .  :. :  . ...  :.                                          
CCDS63 LRLKGRERASTRSSGGDDFWF                                       
     480       490       500                                       

>>CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs109|chr2                (494 aa)
 initn: 1193 init1: 895 opt: 1243  Z-score: 1141.9  bits: 221.6 E(33420): 2.8e-57
Smith-Waterman score: 1243; 42.3% identity (74.8% similar) in 444 aa overlap (5-443:1-437)

               10        20        30          40        50        
pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRL--NVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLG
           :   : ::     :::    .:.: :  ...  ::::. . .    :.. :.:::.
CCDS16     MDGSGERSL----PEPGS--QSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLA
                       10          20        30        40        50

       60          70        80        90       100       110      
pF1KE4 KLRDC--NTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFS
       .: .:  . .:... .::::.    :..::: : ::  ... :  :..:: . .: . :.
CCDS16 ELINCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFK
               60        70        80        90       100       110

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE4 QELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLW
       .:.:.: .:  .:..::...  .:.:.. ::. :... . .  : .  .    . .: .:
CCDS16 NEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREEL-EEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKCVW
              120       130        140       150       160         

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE4 DLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVC
        .::::.::  :...:..:...:..:.... ..:.:::: ::  :. ...: : .::..:
CCDS16 KFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLENVETAC
     170       180       190       200       210       220         

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE4 IAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVV
       :.:::.:::::..:::.: .:  . .: .:.:::::.::.. ::. .  .... ::...:
CCDS16 IGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTNVQQAV
     230       240       250       260       270       280         

        300       310       320       330       340       350      
pF1KE4 QIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE
       : .::::: ::.::::::.:::.: ..:.::..:::::...::.::..::.: .  :...
CCDS16 QALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQSH
     290       300       310       320       330       340         

        360       370       380       390       400       410      
pF1KE4 DDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNF
        .: ::::: ::::: ::::::::::::::: :::. ...  . ::..:::::  :.:::
CCDS16 PETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNF
     350       360       370       380       390       400         

        420       430        440       450       460       470     
pF1KE4 SEFYKEQKRQEKAIKRR-EALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKK
        ..:..:.  : : :.. : .:  . .:                                
CCDS16 VRYYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSSRLK
     410       420       430       440       450       460         

>>CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs109|chr18             (466 aa)
 initn: 926 init1: 392 opt: 1084  Z-score: 997.1  bits: 194.7 E(33420): 3.3e-49
Smith-Waterman score: 1084; 39.8% identity (73.4% similar) in 417 aa overlap (30-437:16-430)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
                                    .:.: .::::   .. : .: : : .:: .:
CCDS12               MEPWPCSPGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERL
                             10        20        30        40      

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELD
       : :  ::.::.:::::... .:.:::: : :: .:. . :.:.:....  :::.: .:: 
CCDS12 RACRGHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDELA
         50        60        70        80        90       100      

              130       140       150       160           170      
pF1KE4 YWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTC----CAEKRKKLW
       ::::::  :: ::  : ....:.  :   : . : :  .:             . :..: 
CCDS12 YWGIDEARLERCCLRRLRRREEEAAEA--RAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRRRLR
        110       120       130         140       150       160    

        180       190       200       210       220        230     
pF1KE4 DLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQ-STDNPQLAHVEAV
       :....:.:..:.:..: .:. :.......: :.:.:.... .: :. :    .:  .:.:
CCDS12 DVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVLETV
          170       180       190       200       210       220    

         240       250       260       270         280       290   
pF1KE4 CIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFL--TESNKSVLQFQNVR
       :.:::..:.::: :.. .:  :...::: ::.::.::.::...:  . .  ..  .. . 
CCDS12 CVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAG
          230       240       250       260       270       280    

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE4 RVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAE
        :....: .:.: ...::::: ::.:::.:.::   :.:::.::: ... .:. :: .::
CCDS12 LVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAE
          290       300       310       320       330       340    

           360        370       380       390       400       410  
pF1KE4 KDEDDTK-FKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPII
       ..    . :.:.:::.:::.:.::::::::. :..: :..:.    ..:.:..:.:.  :
CCDS12 RELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSI
          350       360       370       380       390       400    

            420        430       440       450       460       470 
pF1KE4 VNNFSEFYKEQK-RQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGEN
        ..::. :.: : .:..: . . ::.                                  
CCDS12 FHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALWVRA
          410       420       430       440       450       460    

>>CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs109|chr2             (425 aa)
 initn: 982 init1: 369 opt: 1021  Z-score: 940.2  bits: 184.0 E(33420): 4.9e-46
Smith-Waterman score: 1021; 39.3% identity (67.8% similar) in 425 aa overlap (21-437:1-422)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
                           : . :: : :  : :::::  . .  . :  .:  :...:
CCDS42                     MTFGRSGAAS--VVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRL
                                   10          20        30        

               70        80        90       100        110         
pF1KE4 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRT-GRLHMMEEMCALSFSQEL
       . : .. ..:::::::. . ::::::::  ::  :: . :  :.:..  .:: ::: .:.
CCDS42 HGCRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEM
       40        50        60        70        80        90        

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE4 DYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLWDL-
        :::..  .:: ::: :  ..  .     . .   .  :.  .  ..  : .:. :  . 
CCDS42 IYWGLEGAHLEYCCQRRLDDRMSDTYTFYSADEPGVLGRDEARPGGAEAAPSRRWLERMR
      100       110       120       130       140       150        

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE4 --LEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVC
         .:.:.::.::.::: .:..:...: ..:  .:::. ..    ..: :. .   .::.:
CCDS42 RTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRI-IEAIC
      160       170       180       190       200       210        

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE4 IAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVV
       :.::: : ..::. : .: .: : ::: :::::: :::.....:  .    :.: .  ..
CCDS42 IGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGENSQLQRAGVTL
       220       230       240       250       260       270       

        300       310       320       330       340       350      
pF1KE4 QIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE
       ...:.:::. ..:::::  :::.::.::.: : :. .:..:. ... :::.:  . :.  
CCDS42 RVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGL
       280       290       300       310       320       330       

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE4 D----DTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPII
       :    .  : ::::. ::. :.::::::::.:: :. :.:.::.: ..:....:::: .:
CCDS42 DLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFI
       340       350       360       370       380       390       

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE4 VNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENM
        ..: . :.: : .    .:  . :                                   
CCDS42 YHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN                                
       400       410       420                                     

>>CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs109|chrX               (647 aa)
 initn: 828 init1: 497 opt: 933  Z-score: 857.0  bits: 169.2 E(33420): 2.1e-41
Smith-Waterman score: 974; 31.3% identity (63.7% similar) in 623 aa overlap (16-618:27-619)

                          10        20        30        40         
pF1KE4            MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWR-T
                                 ::: :   :...  .. . .::.:   :. :. :
CCDS14 MAAGLATWLPFARAAAVGWLPLAQQPLPPAPG--VKASRGDEVLVVNVSGRRFET-WKNT
               10        20        30          40        50        

       50        60        70        80        90       100        
pF1KE4 LDRLPRTRLGKLRDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMME
       ::: : : ::     ...  ..     :. :..:::::: :  :  .::::::::::  .
CCDS14 LDRYPDTLLG-----SSEKEFF-----YDADSGEYFFDRDPDMFRHVLNFYRTGRLHCPR
        60             70             80        90       100       

      110       120       130       140       150       160        
pF1KE4 EMCALSFSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCC
       . :  .:..:: ..:.    . .::  .:...:..  :.: .. :. .  .:  .     
CCDS14 QECIQAFDEELAFYGLVPELVGDCCLEEYRDRKKENAERLAEDEEAEQAGDGPALPAG--
       110       120       130       140       150       160       

      170       180       190       200       210           220    
pF1KE4 AEKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLP----ELQSLDEFGQST
       .  :..::  .:.:..:.:: ..  .. .::..:.::  ..:.:      .:  :   . 
CCDS14 SSLRQRLWRAFENPHTSTAALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETIPCRGSARRSSREQPCGE
         170       180       190       200       210       220     

           230       240       250       260       270       280   
pF1KE4 DNPQ-LAHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESN
         :: .  ....:.  :: :::::....:.. .:... .. ::..::::::. ... ...
CCDS14 RFPQAFFCMDTACVLIFTGEYLLRLFAAPSRCRFLRSVMSLIDVVAILPYYIGLLVPKND
         230       240       250       260       270       280     

           290       300       310       320       330       340   
pF1KE4 KSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIM
              .:  .   .:..:..::.:..::: ::. ::.::.   .:::.:.. :.:.:.
CCDS14 -------DVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAII
                290       300       310       320       330        

           350       360       370       380       390       400   
pF1KE4 IFSSLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVL
       ::....:.:::  . :.: ::::.::.. .::::.::::. :.:. ::: :..: ..:::
CCDS14 IFATVMFYAEKGTNKTNFTSIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPSTIAGKIFGSICSLSGVL
      340       350       360       370       380       390        

           410       420       430       440       450       460   
pF1KE4 VIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDI
       :::::.:.::.:::..:....: .:  .: .   :  :   ... .  .:: .  .   .
CCDS14 VIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADK--RRAQQKVRLARI-RLAKSGTTNAFLQYKQNGGL
      400       410       420         430        440       450     

           470             480       490        500       510      
pF1KE4 VVEKNGENMGK--KDKV----QDNHLSPNKWKWTKRTLS-ETSSSKSFETKEQGSPEKAR
           .::...   ...     : .::     : : . .. : . :... .   :.  .  
CCDS14 EDSGSGEEQALCVRNRSAFEQQHHHLLHCLEKTTCHEFTDELTFSEALGAVSPGGRTSRS
         460       470       480       490       500       510     

        520        530       540       550       560       570     
pF1KE4 SSSSPQHLNVQQL-EDMYNKMAKTQSQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTR
       .: : : ..  .:  .   . :: ..  . :.  :..... .:   . ..    ::   .
CCDS14 TSVSSQPVGPGSLLSSCCPRRAKRRAIRLANSTASVSRGSMQELDMLAGLRRSHAP---Q
         520       530       540       550       560       570     

         580       590        600            610       620         
pF1KE4 TEGVIDMRSMSSIDSFISCAT-DFPEA-----TRFSHSPLTSLPSKTGGSTAPEVGWRGA
       ... .. .  .:.:  ..: . ::  :     :  ...:  : ::. ::           
CCDS14 SRSSLNAKPHDSLD--LNCDSRDFVAAIISIPTPPANTPDESQPSSPGGGGRAGSTLRNS
            580         590       600       610       620       630

     630       640       650       660       670       680         
pF1KE4 LGASGGRFVEANPSPDASQHSSFFIESPKSSMKTNNPLKLRALKVNFMEGDPSPLLPVLG
                                                                   
CCDS14 SLGTPCLFPETVKISSL                                           
              640                                                  

>>CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs109|chr7                (630 aa)
 initn: 763 init1: 479 opt: 918  Z-score: 843.5  bits: 166.7 E(33420): 1.2e-40
Smith-Waterman score: 957; 34.3% identity (64.4% similar) in 531 aa overlap (9-528:18-523)

                        10         20        30        40        50
pF1KE4          MPAGMTKHGSRSTSSLP-PEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLD
                        :   ..: : : : .  :... .  . :::.:   ..   ::.
CCDS57 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVASGPMPAPPRQERKRTQDALIVLNVSGTRFQTWQDTLE
               10        20        30        40        50        60

               60         70        80        90       100         
pF1KE4 RLPRTRLGKL-RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEE
       : : : ::.  ::   :            . ..::::: :  :  ::::::::.::. ..
CCDS57 RYPDTLLGSSERDFFYHP-----------ETQQYFFDRDPDIFRHILNFYRTGKLHYPRH
               70                   80        90       100         

     110       120       130       140       150       160         
pF1KE4 MCALSFSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCA
        :  ....:: ..:.    . .::  .:......  :.:. .:.:  .  ::    :  :
CCDS57 ECISAYDEELAFFGLIPEIIGDCCYEEYKDRRRENAERLQDDADT--DTAGESALPTMTA
     110       120       130       140       150         160       

     170       180       190       200       210       220         
pF1KE4 EKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQL
         :...:  .:.:..:. : ..  .. .::..:.::  ..:.:  .:  .. .   . . 
CCDS57 --RQRVWRAFENPHTSTMALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETVPCGSSPGHIKELPCGERY
         170       180       190       200       210       220     

     230           240       250       260       270       280     
pF1KE4 A----HVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKS
       :     ....:.  ::.:::::. ..:....: .. .. ::..::::::. . .:..   
CCDS57 AVAFFCLDTACVMIFTVEYLLRLAAAPSRYRFVRSVMSIIDVVAILPYYIGLVMTDN---
         230       240       250       260       270       280     

         290       300       310       320       330       340     
pF1KE4 VLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIF
           ..:  .   .:..:..::.:..::: ::. ::.::.   .:::.:.. :.:.:.::
CCDS57 ----EDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIF
                290       300       310       320       330        

         350       360       370       380       390       400     
pF1KE4 SSLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVI
       ....:.:::  . .:: ::::.::.. .::::.::::. :::. ::: :..: ..:::::
CCDS57 ATVMFYAEKGSSASKFTSIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVI
      340       350       360       370       380       390        

         410       420         430        440        450       460 
pF1KE4 ALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEK--AIKR-REALERAKRNGSIVS-MNMKDAFARSIEMM
       :::.:.::.:::..:....: .:  : :. : :  :: ..::  . :. :     : ...
CCDS57 ALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQKKARLARIRAAKSGSANAYMQSKRNGLLSNQLQ
      400       410       420       430       440       450        

              470       480       490       500       510       520
pF1KE4 DIVVEKNG-ENMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSS
       .   :.    . :.. ..: .::        : :  :  . . :: . .      : :: 
CCDS57 SSEDEQAFVSKSGSSFETQHHHLLHC---LEKTTNHEFVDEQVFEESCMEVATVNRPSSH
      460       470       480          490       500       510     

              530       540       550       560       570       580
pF1KE4 PQHLNVQQLEDMYNKMAKTQSQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTRTEGVI
          :. ::                                                    
CCDS57 SPSLSSQQGVTSTCCSRRHKKTFRIPNANVSGSHQGSIQELSTIQIRCVERTPLSNSRSS
         520       530       540       550       560       570     

>>CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs109|chr2                (491 aa)
 initn: 1209 init1: 741 opt: 896  Z-score: 825.1  bits: 162.9 E(33420): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 1328; 43.3% identity (74.3% similar) in 467 aa overlap (33-487:17-477)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KE4 AGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRD
                                     : :::::. . :   :: :.:.::::::  
CCDS16               MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHTRLGKLLT
                             10        20        30        40      

             70        80        90       100       110       120  
pF1KE4 CNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELDYW
       :......::.:::::. :.::.:::.:. :  .:::: ::.::.:::.:..:: ::..::
CCDS16 CHSEEAILELCDDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSFCQEIEYW
         50        60        70        80        90       100      

            130       140                   150       160       170
pF1KE4 GIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNE------------ELKREAETLREREGEEFDNTCCAE
       ::.:....:::. ::...::. .:            . . :  .: :.: :.::.   ..
CCDS16 GINELFIDSCCSNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKFDTLRFGQ
        110       120       130       140       150       160      

              180       190       200       210       220       230
pF1KE4 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLA
        :::.:  .:.:   ..::..:: :.  .. : .:. .... :.:. :  :. .:.: : 
CCDS16 LRKKIWIRMENPAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNED--GE-VDDPVLE
        170       180       190       200       210          220   

              240       250       260       270       280       290
pF1KE4 HVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQ
        :: .:::::: :  .:. ..: . ::.:.::: ::...:.:.:.:. .  ...   ...
CCDS16 GVEIACIAWFTGELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTKEEESEDIE
           230       240       250       260       270       280   

              300       310       320       330       340       350
pF1KE4 NVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVF
       :. .::::.:.:::.:::::::::.::.::: :::.::.:.:::.:::..:: ::: :..
CCDS16 NMGKVVQILRLMRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLLLLFLSVGISIFSVLIY
           290       300       310       320       330       340   

              360       370       380       390       400       410
pF1KE4 FAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIP
        .:::.  ... :::  .:::::.:::::::: .: :: ::.... : : :.::.:::: 
CCDS16 SVEKDDHTSSLTSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIICGILVVALPIT
           350       360       370       380       390       400   

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pF1KE4 IIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGE
       :: :.::..:..::  .     ..: :. ..   .  .:..: .:. .. .   . . : 
CCDS16 IIFNKFSKYYQKQKDIDVDQCSEDAPEKCHE---LPYFNIRDIYAQRMHTFITSLSSVGI
           410       420       430          440       450       460

              480       490       500       510       520       530
pF1KE4 NMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQHLNVQQLE
        ..  :... . .  :.                                           
CCDS16 VVSDPDSTDASSIEDNEDICNTTSLENCTAK                             
              470       480       490                              

>>CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs109|chr8                (477 aa)
 initn: 1290 init1: 567 opt: 861  Z-score: 793.4  bits: 157.0 E(33420): 7.4e-38
Smith-Waterman score: 1256; 42.6% identity (75.3% similar) in 441 aa overlap (33-461:19-455)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KE4 AGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRD
                                     .:.::::. ...  .:: :.:.::::.:  
CCDS62             MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL
                           10        20        30        40        

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pF1KE4 CNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELDYW
       :......::.::::.  . :..:::.:  :  .:.::.::.::.: :.:..:::::..::
CCDS62 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW
       50        60        70        80        90       100        

            130       140            150              160       170
pF1KE4 GIDEIYLESCCQARYHQKK-----EQMNEELKREAETLRERE-------GEEFDNTCCAE
       ::.:....:::.  :: .:     :. .:.  .:. :    :       . .::.   ..
CCDS62 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGN
      110       120       130       140       150       160        

              180       190       200       210       220       230
pF1KE4 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLA
        :..::  :..:. :: .....:.::. .. : :.. ::.::..:  :  :.  ..:.. 
CCDS62 FRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFE
      170       180       190       200       210       220        

              240       250       260       270       280       290
pF1KE4 HVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQ
        ::   :::::.: . ::  .:   ::::. :: :::..:.:.:.:. ..   .:.  . 
CCDS62 IVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLA
      230       240       250       260       270       280        

              300       310       320       330       340       350
pF1KE4 NVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVF
       :. ::.:..:.:::.::::::::::::.::: ::. ::.:.:::.:.:..:: ::: ...
CCDS62 NLGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAY
      290       300       310       320       330       340        

              360       370       380       390       400       410
pF1KE4 FAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIP
         ::.:..  . .::: .::::..::::::::. : :  ::.... : .::.::..::: 
CCDS62 TIEKEENEG-LATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPIT
      350        360       370       380       390       400       

              420       430       440       450       460       470
pF1KE4 IIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGE
       .: :.::.::..::. :.:..  .  .  :.   . :.:..: .:.... .         
CCDS62 LIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKE---VPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSR
       410       420       430          440       450       460    

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pF1KE4 NMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQHLNVQQLE
                                                                   
CCDS62 SSPSELSLNDSLR                                               
          470                                                      




858 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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