FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4235, 858 aa 1>>>pF1KE4235 858 - 858 aa - 858 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4077+/-0.000869; mu= 10.7542+/- 0.052 mean_var=119.9647+/-23.744, 0's: 0 Z-trim(109.1): 89 B-trim: 77 in 1/52 Lambda= 0.117097 statistics sampled from 10716 (10806) to 10716 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.323), width: 16 Scan time: 2.020 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs109|chr20 ( 858) 5673 970.1 0 CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs109|chr8 ( 911) 3148 543.5 6.4e-154 CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs109|chr8 ( 500) 1276 227.1 6e-59 CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs109|chr2 ( 494) 1243 221.6 2.8e-57 CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs109|chr18 ( 466) 1084 194.7 3.3e-49 CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs109|chr2 ( 425) 1021 184.0 4.9e-46 CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs109|chrX ( 647) 933 169.2 2.1e-41 CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs109|chr7 ( 630) 918 166.7 1.2e-40 CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs109|chr2 ( 491) 896 162.9 1.3e-39 CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs109|chr8 ( 477) 861 157.0 7.4e-38 CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs109|chr1 ( 499) 824 150.8 5.8e-36 CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs109|chr20 ( 513) 816 149.4 1.5e-35 CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs109|chr1 ( 575) 782 143.7 9e-34 CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs109|chr19 ( 456) 755 139.1 1.7e-32 CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs109|chr12 ( 495) 755 139.1 1.9e-32 CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs109|chr1 ( 511) 738 136.3 1.4e-31 CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs109|chr1 ( 636) 727 134.4 6.2e-31 CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs109|chr16 ( 519) 716 132.5 1.9e-30 CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs109|chr11 ( 653) 716 132.6 2.3e-30 CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs109|chr1 ( 655) 715 132.4 2.6e-30 CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs109|chr12 ( 613) 682 126.8 1.2e-28 CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs109|chr9 ( 545) 676 125.8 2.1e-28 CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs109|chr2 ( 436) 646 120.7 5.9e-27 CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs109|chr12 ( 529) 576 108.9 2.5e-23 CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs109|chr12 ( 583) 559 106.0 2e-22 CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs109|chr12 ( 558) 557 105.7 2.4e-22 CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs109|chr12 ( 613) 551 104.7 5.3e-22 CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs109|chr12 ( 618) 551 104.7 5.4e-22 CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs109|chr12 ( 629) 551 104.7 5.5e-22 CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs109|chr12 ( 638) 551 104.7 5.5e-22 CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs109|chr19 ( 757) 550 104.6 7.2e-22 CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs109|chr11 ( 511) 542 103.1 1.3e-21 CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs109|chr11 ( 585) 542 103.2 1.5e-21 CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs109|chr1 ( 626) 537 102.3 2.8e-21 CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs109|chr1 ( 635) 537 102.3 2.8e-21 CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs109|chr20 ( 526) 419 82.4 2.4e-15 CCDS456.1 KCNQ4 gene_id:9132|Hs109|chr1 ( 695) 355 71.6 5.5e-12 CCDS13521.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs109|chr20 ( 393) 342 69.3 1.5e-11 CCDS46629.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs109|chr20 ( 841) 342 69.5 3e-11 CCDS13518.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs109|chr20 ( 844) 342 69.5 3e-11 CCDS13519.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs109|chr20 ( 854) 342 69.5 3e-11 CCDS13520.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs109|chr20 ( 872) 342 69.5 3.1e-11 CCDS55037.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs109|chr6 ( 923) 339 69.0 4.6e-11 >>CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs109|chr20 (858 aa) initn: 5673 init1: 5673 opt: 5673 Z-score: 5182.8 bits: 970.1 E(33420): 0 Smith-Waterman score: 5673; 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CCDS62 PSDGRDPLRE--EGSVGSSSPQDTGHNCRQDIYHAVSEVKKD-SSQEGCKMENHLFAPEI 840 850 860 870 880 890 850 pF1KE4 RVLPGGGAHGSTRDQSI CCDS62 HSNPGDTGYCPTRETSM 900 910 >>CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs109|chr8 (500 aa) initn: 1227 init1: 565 opt: 1276 Z-score: 1171.9 bits: 227.1 E(33420): 6e-59 Smith-Waterman score: 1276; 45.9% identity (72.9% similar) in 468 aa overlap (35-481:43-497) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCN .:::: . ..:. .:.:::::: CCDS63 LDSGSLTSLDSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 pF1KE4 TH----------DSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALS . : ::.::: . :::::::: :: .:..:::::::.::..:::: CCDS63 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 FSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEEL--KREAETLR-EREGEE-FDNTCCAE : ::..::::::. ..:::. :: ..:: ..: : :...: . ..:.:. :.. : CCDS63 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKE-LSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFSQGPCPT 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLA :.:::..::::.::.::.:...:::.:.:.: : ..: . ::. :: :: CCDS63 VRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMS-AELSWLDL--------QLL 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 pF1KE4 HV-EAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTES---NKSV .. : :::.::: :..:::: . .:.. : ::::::::.:.:. :.:: .... CCDS63 EILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL-LVESLSGSQTT 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 LQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFS ...:: :.::..:..: ::.:::.::::::.:::.:. . :.:.:::.:::..:: ::: CCDS63 QELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFS 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 SLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIA .. .:::.. :: : :.: ..:::: .::::::::: : : ::::. .: ..:.::.: CCDS63 TVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLA 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 LPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRN---GSIVSMNMKDAFARSIEMMDI ::: :: . :: : : .: :...::::.. .: : .:.:..:..:::: :.. CCDS63 LPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSI--MEM 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE4 VVEKNGENMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQH . :. : . ... :. CCDS63 LRLKGRERASTRSSGGDDFWF 480 490 500 >>CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs109|chr2 (494 aa) initn: 1193 init1: 895 opt: 1243 Z-score: 1141.9 bits: 221.6 E(33420): 2.8e-57 Smith-Waterman score: 1243; 42.3% identity (74.8% similar) in 444 aa overlap (5-443:1-437) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRL--NVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLG : : :: ::: .:.: : ... ::::. . . :.. :.:::. CCDS16 MDGSGERSL----PEPGS--QSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 KLRDC--NTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFS .: .: . .:... .::::. :..::: : :: ... : :..:: . .: . :. CCDS16 ELINCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 QELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLW .:.:.: .: .:..::... .:.:.. ::. :... . . : . . . .: .: CCDS16 NEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREEL-EEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKCVW 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 DLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVC .::::.:: :...:..:...:..:.... ..:.:::: :: :. ...: : .::..: CCDS16 KFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLENVETAC 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 IAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVV :.:::.:::::..:::.: .: . .: .:.:::::.::.. ::. . .... ::...: CCDS16 IGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTNVQQAV 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 QIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE : .::::: ::.::::::.:::.: ..:.::..:::::...::.::..::.: . :... CCDS16 QALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQSH 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 DDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNF .: ::::: ::::: ::::::::::::::: :::. ... . ::..::::: :.::: CCDS16 PETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNF 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 SEFYKEQKRQEKAIKRR-EALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKK ..:..:. : : :.. : .: . .: CCDS16 VRYYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSSRLK 410 420 430 440 450 460 >>CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs109|chr18 (466 aa) initn: 926 init1: 392 opt: 1084 Z-score: 997.1 bits: 194.7 E(33420): 3.3e-49 Smith-Waterman score: 1084; 39.8% identity (73.4% similar) in 417 aa overlap (30-437:16-430) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL .:.: .:::: .. : .: : : .:: .: CCDS12 MEPWPCSPGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERL 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELD : : ::.::.:::::... .:.:::: : :: .:. . :.:.:.... :::.: .:: CCDS12 RACRGHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDELA 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KE4 YWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTC----CAEKRKKLW :::::: :: :: : ....:. : : . : : .: . :..: CCDS12 YWGIDEARLERCCLRRLRRREEEAAEA--RAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRRRLR 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 DLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQ-STDNPQLAHVEAV :....:.:..:.:..: .:. :.......: :.:.:.... .: :. : .: .:.: CCDS12 DVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVLETV 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 CIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFL--TESNKSVLQFQNVR :.:::..:.::: :.. .: :...::: ::.::.::.::...: . . .. .. . CCDS12 CVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAG 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 RVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAE :....: .:.: ...::::: ::.:::.:.:: :.:::.::: ... .:. :: .:: CCDS12 LVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAE 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 KDEDDTK-FKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPII .. . :.:.:::.:::.:.::::::::. :..: :..:. ..:.:..:.:. : CCDS12 RELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSI 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 VNNFSEFYKEQK-RQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGEN ..::. :.: : .:..: . . ::. CCDS12 FHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALWVRA 410 420 430 440 450 460 >>CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs109|chr2 (425 aa) initn: 982 init1: 369 opt: 1021 Z-score: 940.2 bits: 184.0 E(33420): 4.9e-46 Smith-Waterman score: 1021; 39.3% identity (67.8% similar) in 425 aa overlap (21-437:1-422) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL : . :: : : : ::::: . . . : .: :...: CCDS42 MTFGRSGAAS--VVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRL 10 20 30 70 80 90 100 110 pF1KE4 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRT-GRLHMMEEMCALSFSQEL . : .. ..:::::::. . :::::::: :: :: . : :.:.. .:: ::: .:. CCDS42 HGCRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEM 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 DYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLWDL- :::.. .:: ::: : .. . . . . :. . .. : .:. : . CCDS42 IYWGLEGAHLEYCCQRRLDDRMSDTYTFYSADEPGVLGRDEARPGGAEAAPSRRWLERMR 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 --LEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVC .:.:.::.::.::: .:..:...: ..: .:::. .. ..: :. . .::.: CCDS42 RTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRI-IEAIC 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 IAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVV :.::: : ..::. : .: .: : ::: :::::: :::.....: . :.: . .. CCDS42 IGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGENSQLQRAGVTL 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 QIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE ...:.:::. ..::::: :::.::.::.: : :. .:..:. ... :::.: . :. CCDS42 RVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGL 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 D----DTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPII : . : ::::. ::. :.::::::::.:: :. :.:.::.: ..:....:::: .: CCDS42 DLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFI 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 VNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENM ..: . :.: : . .: . : CCDS42 YHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN 400 410 420 >>CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs109|chrX (647 aa) initn: 828 init1: 497 opt: 933 Z-score: 857.0 bits: 169.2 E(33420): 2.1e-41 Smith-Waterman score: 974; 31.3% identity (63.7% similar) in 623 aa overlap (16-618:27-619) 10 20 30 40 pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWR-T ::: : :... .. . .::.: :. :. : CCDS14 MAAGLATWLPFARAAAVGWLPLAQQPLPPAPG--VKASRGDEVLVVNVSGRRFET-WKNT 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 LDRLPRTRLGKLRDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMME ::: : : :: ... .. :. :..:::::: : : .:::::::::: . CCDS14 LDRYPDTLLG-----SSEKEFF-----YDADSGEYFFDRDPDMFRHVLNFYRTGRLHCPR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 EMCALSFSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCC . : .:..:: ..:. . .:: .:...:.. :.: .. :. . .: . CCDS14 QECIQAFDEELAFYGLVPELVGDCCLEEYRDRKKENAERLAEDEEAEQAGDGPALPAG-- 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 AEKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLP----ELQSLDEFGQST . :..:: .:.:..:.:: .. .. .::..:.:: ..:.: .: : . CCDS14 SSLRQRLWRAFENPHTSTAALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETIPCRGSARRSSREQPCGE 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 DNPQ-LAHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESN :: . ....:. :: :::::....:.. .:... .. ::..::::::. ... ... CCDS14 RFPQAFFCMDTACVLIFTGEYLLRLFAAPSRCRFLRSVMSLIDVVAILPYYIGLLVPKND 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 KSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIM .: . .:..:..::.:..::: ::. ::.::. .:::.:.. :.:.:. CCDS14 -------DVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAII 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 IFSSLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVL ::....:.::: . :.: ::::.::.. .::::.::::. :.:. ::: :..: ..::: CCDS14 IFATVMFYAEKGTNKTNFTSIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPSTIAGKIFGSICSLSGVL 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 VIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDI :::::.:.::.:::..:....: .: .: . : : ... . .:: . . . CCDS14 VIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADK--RRAQQKVRLARI-RLAKSGTTNAFLQYKQNGGL 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 pF1KE4 VVEKNGENMGK--KDKV----QDNHLSPNKWKWTKRTLS-ETSSSKSFETKEQGSPEKAR .::... ... : .:: : : . .. : . :... . :. . CCDS14 EDSGSGEEQALCVRNRSAFEQQHHHLLHCLEKTTCHEFTDELTFSEALGAVSPGGRTSRS 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE4 SSSSPQHLNVQQL-EDMYNKMAKTQSQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTR .: : : .. .: . . :: .. . :. :..... .: . .. :: . CCDS14 TSVSSQPVGPGSLLSSCCPRRAKRRAIRLANSTASVSRGSMQELDMLAGLRRSHAP---Q 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KE4 TEGVIDMRSMSSIDSFISCAT-DFPEA-----TRFSHSPLTSLPSKTGGSTAPEVGWRGA ... .. . .:.: ..: . :: : : ...: : ::. :: CCDS14 SRSSLNAKPHDSLD--LNCDSRDFVAAIISIPTPPANTPDESQPSSPGGGGRAGSTLRNS 580 590 600 610 620 630 630 640 650 660 670 680 pF1KE4 LGASGGRFVEANPSPDASQHSSFFIESPKSSMKTNNPLKLRALKVNFMEGDPSPLLPVLG CCDS14 SLGTPCLFPETVKISSL 640 >>CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs109|chr7 (630 aa) initn: 763 init1: 479 opt: 918 Z-score: 843.5 bits: 166.7 E(33420): 1.2e-40 Smith-Waterman score: 957; 34.3% identity (64.4% similar) in 531 aa overlap (9-528:18-523) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLP-PEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLD : ..: : : : . :... . . :::.: .. ::. CCDS57 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVASGPMPAPPRQERKRTQDALIVLNVSGTRFQTWQDTLE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE4 RLPRTRLGKL-RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEE : : : ::. :: : . ..::::: : : ::::::::.::. .. CCDS57 RYPDTLLGSSERDFFYHP-----------ETQQYFFDRDPDIFRHILNFYRTGKLHYPRH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 MCALSFSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCA : ....:: ..:. . .:: .:...... :.:. .:.: . :: : : CCDS57 ECISAYDEELAFFGLIPEIIGDCCYEEYKDRRRENAERLQDDADT--DTAGESALPTMTA 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 EKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQL :...: .:.:..:. : .. .. .::..:.:: ..:.: .: .. . . . CCDS57 --RQRVWRAFENPHTSTMALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETVPCGSSPGHIKELPCGERY 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 A----HVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKS : ....:. ::.:::::. ..:....: .. .. ::..::::::. . .:.. CCDS57 AVAFFCLDTACVMIFTVEYLLRLAAAPSRYRFVRSVMSIIDVVAILPYYIGLVMTDN--- 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 VLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIF ..: . .:..:..::.:..::: ::. ::.::. .:::.:.. :.:.:.:: CCDS57 ----EDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIF 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 SSLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVI ....:.::: . .:: ::::.::.. .::::.::::. :::. ::: :..: ..::::: CCDS57 ATVMFYAEKGSSASKFTSIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVI 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 ALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEK--AIKR-REALERAKRNGSIVS-MNMKDAFARSIEMM :::.:.::.:::..:....: .: : :. : : :: ..:: . :. : : ... 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CCDS16 VVSDPDSTDASSIEDNEDICNTTSLENCTAK 470 480 490 >>CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs109|chr8 (477 aa) initn: 1290 init1: 567 opt: 861 Z-score: 793.4 bits: 157.0 E(33420): 7.4e-38 Smith-Waterman score: 1256; 42.6% identity (75.3% similar) in 441 aa overlap (33-461:19-455) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 AGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRD .:.::::. ... .:: :.:.::::.: CCDS62 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 CNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELDYW :......::.::::. . :..:::.: : .:.::.::.::.: :.:..:::::..:: CCDS62 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KE4 GIDEIYLESCCQARYHQKK-----EQMNEELKREAETLRERE-------GEEFDNTCCAE ::.:....:::. :: .: :. .:. .:. : : . .::. .. 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