FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4235, 858 aa
1>>>pF1KE4235 858 - 858 aa - 858 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4077+/-0.000869; mu= 10.7542+/- 0.052
mean_var=119.9647+/-23.744, 0's: 0 Z-trim(109.1): 89 B-trim: 77 in 1/52
Lambda= 0.117097
statistics sampled from 10716 (10806) to 10716 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.323), width: 16
Scan time: 2.020
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs109|chr20 ( 858) 5673 970.1 0
CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs109|chr8 ( 911) 3148 543.5 6.4e-154
CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs109|chr8 ( 500) 1276 227.1 6e-59
CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs109|chr2 ( 494) 1243 221.6 2.8e-57
CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs109|chr18 ( 466) 1084 194.7 3.3e-49
CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs109|chr2 ( 425) 1021 184.0 4.9e-46
CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs109|chrX ( 647) 933 169.2 2.1e-41
CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs109|chr7 ( 630) 918 166.7 1.2e-40
CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs109|chr2 ( 491) 896 162.9 1.3e-39
CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs109|chr8 ( 477) 861 157.0 7.4e-38
CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs109|chr1 ( 499) 824 150.8 5.8e-36
CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs109|chr20 ( 513) 816 149.4 1.5e-35
CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs109|chr1 ( 575) 782 143.7 9e-34
CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs109|chr19 ( 456) 755 139.1 1.7e-32
CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs109|chr12 ( 495) 755 139.1 1.9e-32
CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs109|chr1 ( 511) 738 136.3 1.4e-31
CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs109|chr1 ( 636) 727 134.4 6.2e-31
CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs109|chr16 ( 519) 716 132.5 1.9e-30
CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs109|chr11 ( 653) 716 132.6 2.3e-30
CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs109|chr1 ( 655) 715 132.4 2.6e-30
CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs109|chr12 ( 613) 682 126.8 1.2e-28
CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs109|chr9 ( 545) 676 125.8 2.1e-28
CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs109|chr2 ( 436) 646 120.7 5.9e-27
CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs109|chr12 ( 529) 576 108.9 2.5e-23
CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs109|chr12 ( 583) 559 106.0 2e-22
CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs109|chr12 ( 558) 557 105.7 2.4e-22
CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs109|chr12 ( 613) 551 104.7 5.3e-22
CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs109|chr12 ( 618) 551 104.7 5.4e-22
CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs109|chr12 ( 629) 551 104.7 5.5e-22
CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs109|chr12 ( 638) 551 104.7 5.5e-22
CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs109|chr19 ( 757) 550 104.6 7.2e-22
CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs109|chr11 ( 511) 542 103.1 1.3e-21
CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs109|chr11 ( 585) 542 103.2 1.5e-21
CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs109|chr1 ( 626) 537 102.3 2.8e-21
CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs109|chr1 ( 635) 537 102.3 2.8e-21
CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs109|chr20 ( 526) 419 82.4 2.4e-15
CCDS456.1 KCNQ4 gene_id:9132|Hs109|chr1 ( 695) 355 71.6 5.5e-12
CCDS13521.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs109|chr20 ( 393) 342 69.3 1.5e-11
CCDS46629.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs109|chr20 ( 841) 342 69.5 3e-11
CCDS13518.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs109|chr20 ( 844) 342 69.5 3e-11
CCDS13519.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs109|chr20 ( 854) 342 69.5 3e-11
CCDS13520.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs109|chr20 ( 872) 342 69.5 3.1e-11
CCDS55037.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs109|chr6 ( 923) 339 69.0 4.6e-11
>>CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs109|chr20 (858 aa)
initn: 5673 init1: 5673 opt: 5673 Z-score: 5182.8 bits: 970.1 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 5673; 100.0% identity (100.0% similar) in 858 aa overlap (1-858:1-858)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLWDLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLWDLLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 KPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVCIAWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVCIAWF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 TMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDDTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDDTK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 FKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDKVQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDKVQD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 NHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQHLNVQQLEDMYNKMAKTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQHLNVQQLEDMYNKMAKTQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 SQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTRTEGVIDMRSMSSIDSFISCATDFPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTRTEGVIDMRSMSSIDSFISCATDFPE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 ATRFSHSPLTSLPSKTGGSTAPEVGWRGALGASGGRFVEANPSPDASQHSSFFIESPKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ATRFSHSPLTSLPSKTGGSTAPEVGWRGALGASGGRFVEANPSPDASQHSSFFIESPKSS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 MKTNNPLKLRALKVNFMEGDPSPLLPVLGMYHDPLRNRGSAAAAVAGLECATLLDKAVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MKTNNPLKLRALKVNFMEGDPSPLLPVLGMYHDPLRNRGSAAAAVAGLECATLLDKAVLS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 PESSIYTTASAKTPPRSPEKHTAIAFNFEAGVHQYIDADTDDEGQLLYSVDSSPPKSLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PESSIYTTASAKTPPRSPEKHTAIAFNFEAGVHQYIDADTDDEGQLLYSVDSSPPKSLPG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 STSPKFSTGTRSEKNHFESSPLPTSPKFLRQNCIYSTEALTGKGPSGQEKCKLENHISPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 STSPKFSTGTRSEKNHFESSPLPTSPKFLRQNCIYSTEALTGKGPSGQEKCKLENHISPD
790 800 810 820 830 840
850
pF1KE4 VRVLPGGGAHGSTRDQSI
::::::::::::::::::
CCDS13 VRVLPGGGAHGSTRDQSI
850
>>CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs109|chr8 (911 aa)
initn: 3453 init1: 3024 opt: 3148 Z-score: 2877.0 bits: 543.5 E(33420): 6.4e-154
Smith-Waterman score: 3417; 63.6% identity (77.4% similar) in 895 aa overlap (2-841:6-894)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTR
: :.... :::: ::::::..:.:::.:::::..::::: :::::::::::::::
CCDS62 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 LGKLRDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFS
::::::::::.:::::::::.:..::::::::::::::::::::::.::::::::::::.
CCDS62 LGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 QELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLW
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::: .::::::
CCDS62 QELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDKRKKLW
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVC
:::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::: ::::: .:: :::::::::
CCDS62 DLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLAHVEAVC
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 IAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVV
::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 IAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 QIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 QIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 DDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNF
: ::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 DATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNF
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 SEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKD
:::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:..:..::: ::. . ::
CCDS62 SEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESANTKD
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520
pF1KE4 KVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEK-------ARSSSSPQHLNVQQL
...::::::..:::....::::::.::::.: : .: ::::::::..:.:
CCDS62 SADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSAQKL
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 EDMYNKMAKTQ--SQPILNTKESAAQ-SKPKEELEMESIPSPVAPLPT-RTEGVIDMRSM
: .::...::: :.: . .:. . : .::.::: . : : . .:: ..::.:
CCDS62 EMLYNEITKTQPHSHPNPDCQEKPERPSAYEEEIEMEEVVCPQEQLAVAQTEVIVDMKST
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630
pF1KE4 SSIDSFISCATDFPEATRFSHSPLTS------LPSKTGGSTA-------PEVGWRGALG-
:::::: :::::: :. : : .. .:. :. : . :
CCDS62 SSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASHLQMKFPTDLPGTEEHQRARGPPFLTLSREKGP
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670
pF1KE4 -ASGGRF------VEANPSPDASQ---HSSF----FIESPKSSMKTNNPLKLRALKVNFM
: : . . .: . ..:: :: . .:::::.: .:::: :.:::::
CCDS62 AARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHSPLQSDNATDSPKSSLKGSNPLKSRSLKVNFK
670 680 690 700 710 720
680 690 700 710 720 730
pF1KE4 EG-------DPSPLLPVLGMYHDPLRNRGSAAAAVAGLECATLLDKAVLSPESSIYTTAS
:. :: :. : . . ... : . :. .:. : : .
CCDS62 ENRGSAPQTPPSTARPLPVTTADFSLTTPQHISTILLEETPSQGDRPLLGTEVSAPCQGP
730 740 750 760 770 780
740 750 760 770 780
pF1KE4 AK-TPPRSPEKHTAIAFNFEAGVHQ-YIDADTDDEGQLLYSVDSSPPK---SLPGSTSPK
.: :: :... : : . .. . . :: :. ..: . : : :. . :
CCDS62 SKGLSPRFPKQKL---FPFSSRERRSFTEIDTGDDEDFLELPGAREEKQVDSSPNCFADK
790 800 810 820 830
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 FSTGTRSEKNHFESSPLPTSPKFLRQNC---IYSTEALTGKGPSGQEKCKLENHI-SPDV
: : .. :.: .::. .:: :: . . . : :.:: ::.:::. .:..
CCDS62 PSDGRDPLRE--EGSVGSSSPQDTGHNCRQDIYHAVSEVKKD-SSQEGCKMENHLFAPEI
840 850 860 870 880 890
850
pF1KE4 RVLPGGGAHGSTRDQSI
CCDS62 HSNPGDTGYCPTRETSM
900 910
>>CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs109|chr8 (500 aa)
initn: 1227 init1: 565 opt: 1276 Z-score: 1171.9 bits: 227.1 E(33420): 6e-59
Smith-Waterman score: 1276; 45.9% identity (72.9% similar) in 468 aa overlap (35-481:43-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCN
.:::: . ..:. .:.::::::
CCDS63 LDSGSLTSLDSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110
pF1KE4 TH----------DSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALS
. : ::.::: . :::::::: :: .:..:::::::.::..::::
CCDS63 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 FSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEEL--KREAETLR-EREGEE-FDNTCCAE
: ::..::::::. ..:::. :: ..:: ..: : :...: . ..:.:. :.. :
CCDS63 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKE-LSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFSQGPCPT
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLA
:.:::..::::.::.::.:...:::.:.:.: : ..: . ::. :: ::
CCDS63 VRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMS-AELSWLDL--------QLL
200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE4 HV-EAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTES---NKSV
.. : :::.::: :..:::: . .:.. : ::::::::.:.:. :.:: ....
CCDS63 EILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL-LVESLSGSQTT
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 LQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFS
...:: :.::..:..: ::.:::.::::::.:::.:. . :.:.:::.:::..:: :::
CCDS63 QELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFS
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 SLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIA
.. .:::.. :: : :.: ..:::: .::::::::: : : ::::. .: ..:.::.:
CCDS63 TVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLA
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 LPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRN---GSIVSMNMKDAFARSIEMMDI
::: :: . :: : : .: :...::::.. .: : .:.:..:..:::: :..
CCDS63 LPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSI--MEM
430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 VVEKNGENMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQH
. :. : . ... :.
CCDS63 LRLKGRERASTRSSGGDDFWF
480 490 500
>>CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs109|chr2 (494 aa)
initn: 1193 init1: 895 opt: 1243 Z-score: 1141.9 bits: 221.6 E(33420): 2.8e-57
Smith-Waterman score: 1243; 42.3% identity (74.8% similar) in 444 aa overlap (5-443:1-437)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRL--NVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLG
: : :: ::: .:.: : ... ::::. . . :.. :.:::.
CCDS16 MDGSGERSL----PEPGS--QSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 KLRDC--NTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFS
.: .: . .:... .::::. :..::: : :: ... : :..:: . .: . :.
CCDS16 ELINCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 QELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLW
.:.:.: .: .:..::... .:.:.. ::. :... . . : . . . .: .:
CCDS16 NEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREEL-EEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKCVW
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVC
.::::.:: :...:..:...:..:.... ..:.:::: :: :. ...: : .::..:
CCDS16 KFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLENVETAC
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 IAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVV
:.:::.:::::..:::.: .: . .: .:.:::::.::.. ::. . .... ::...:
CCDS16 IGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTNVQQAV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 QIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE
: .::::: ::.::::::.:::.: ..:.::..:::::...::.::..::.: . :...
CCDS16 QALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQSH
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 DDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNF
.: ::::: ::::: ::::::::::::::: :::. ... . ::..::::: :.:::
CCDS16 PETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNF
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 SEFYKEQKRQEKAIKRR-EALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKK
..:..:. : : :.. : .: . .:
CCDS16 VRYYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSSRLK
410 420 430 440 450 460
>>CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs109|chr18 (466 aa)
initn: 926 init1: 392 opt: 1084 Z-score: 997.1 bits: 194.7 E(33420): 3.3e-49
Smith-Waterman score: 1084; 39.8% identity (73.4% similar) in 417 aa overlap (30-437:16-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
.:.: .:::: .. : .: : : .:: .:
CCDS12 MEPWPCSPGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELD
: : ::.::.:::::... .:.:::: : :: .:. . :.:.:.... :::.: .::
CCDS12 RACRGHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDELA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE4 YWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTC----CAEKRKKLW
:::::: :: :: : ....:. : : . : : .: . :..:
CCDS12 YWGIDEARLERCCLRRLRRREEEAAEA--RAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRRRLR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQ-STDNPQLAHVEAV
:....:.:..:.:..: .:. :.......: :.:.:.... .: :. : .: .:.:
CCDS12 DVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVLETV
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 CIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFL--TESNKSVLQFQNVR
:.:::..:.::: :.. .: :...::: ::.::.::.::...: . . .. .. .
CCDS12 CVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 RVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAE
:....: .:.: ...::::: ::.:::.:.:: :.:::.::: ... .:. :: .::
CCDS12 LVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAE
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 KDEDDTK-FKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPII
.. . :.:.:::.:::.:.::::::::. :..: :..:. ..:.:..:.:. :
CCDS12 RELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSI
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 VNNFSEFYKEQK-RQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGEN
..::. :.: : .:..: . . ::.
CCDS12 FHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALWVRA
410 420 430 440 450 460
>>CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs109|chr2 (425 aa)
initn: 982 init1: 369 opt: 1021 Z-score: 940.2 bits: 184.0 E(33420): 4.9e-46
Smith-Waterman score: 1021; 39.3% identity (67.8% similar) in 425 aa overlap (21-437:1-422)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
: . :: : : : ::::: . . . : .: :...:
CCDS42 MTFGRSGAAS--VVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRL
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE4 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRT-GRLHMMEEMCALSFSQEL
. : .. ..:::::::. . :::::::: :: :: . : :.:.. .:: ::: .:.
CCDS42 HGCRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEM
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 DYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLWDL-
:::.. .:: ::: : .. . . . . :. . .. : .:. : .
CCDS42 IYWGLEGAHLEYCCQRRLDDRMSDTYTFYSADEPGVLGRDEARPGGAEAAPSRRWLERMR
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 --LEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVC
.:.:.::.::.::: .:..:...: ..: .:::. .. ..: :. . .::.:
CCDS42 RTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRI-IEAIC
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 IAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVV
:.::: : ..::. : .: .: : ::: :::::: :::.....: . :.: . ..
CCDS42 IGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGENSQLQRAGVTL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 QIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE
...:.:::. ..::::: :::.::.::.: : :. .:..:. ... :::.: . :.
CCDS42 RVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 D----DTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPII
: . : ::::. ::. :.::::::::.:: :. :.:.::.: ..:....:::: .:
CCDS42 DLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFI
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 VNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENM
..: . :.: : . .: . :
CCDS42 YHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN
400 410 420
>>CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs109|chrX (647 aa)
initn: 828 init1: 497 opt: 933 Z-score: 857.0 bits: 169.2 E(33420): 2.1e-41
Smith-Waterman score: 974; 31.3% identity (63.7% similar) in 623 aa overlap (16-618:27-619)
10 20 30 40
pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWR-T
::: : :... .. . .::.: :. :. :
CCDS14 MAAGLATWLPFARAAAVGWLPLAQQPLPPAPG--VKASRGDEVLVVNVSGRRFET-WKNT
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 LDRLPRTRLGKLRDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMME
::: : : :: ... .. :. :..:::::: : : .:::::::::: .
CCDS14 LDRYPDTLLG-----SSEKEFF-----YDADSGEYFFDRDPDMFRHVLNFYRTGRLHCPR
60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 EMCALSFSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCC
. : .:..:: ..:. . .:: .:...:.. :.: .. :. . .: .
CCDS14 QECIQAFDEELAFYGLVPELVGDCCLEEYRDRKKENAERLAEDEEAEQAGDGPALPAG--
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 AEKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLP----ELQSLDEFGQST
. :..:: .:.:..:.:: .. .. .::..:.:: ..:.: .: : .
CCDS14 SSLRQRLWRAFENPHTSTAALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETIPCRGSARRSSREQPCGE
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 DNPQ-LAHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESN
:: . ....:. :: :::::....:.. .:... .. ::..::::::. ... ...
CCDS14 RFPQAFFCMDTACVLIFTGEYLLRLFAAPSRCRFLRSVMSLIDVVAILPYYIGLLVPKND
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 KSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIM
.: . .:..:..::.:..::: ::. ::.::. .:::.:.. :.:.:.
CCDS14 -------DVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAII
290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 IFSSLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVL
::....:.::: . :.: ::::.::.. .::::.::::. :.:. ::: :..: ..:::
CCDS14 IFATVMFYAEKGTNKTNFTSIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPSTIAGKIFGSICSLSGVL
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 VIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDI
:::::.:.::.:::..:....: .: .: . : : ... . .:: . . .
CCDS14 VIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADK--RRAQQKVRLARI-RLAKSGTTNAFLQYKQNGGL
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510
pF1KE4 VVEKNGENMGK--KDKV----QDNHLSPNKWKWTKRTLS-ETSSSKSFETKEQGSPEKAR
.::... ... : .:: : : . .. : . :... . :. .
CCDS14 EDSGSGEEQALCVRNRSAFEQQHHHLLHCLEKTTCHEFTDELTFSEALGAVSPGGRTSRS
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 SSSSPQHLNVQQL-EDMYNKMAKTQSQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTR
.: : : .. .: . . :: .. . :. :..... .: . .. :: .
CCDS14 TSVSSQPVGPGSLLSSCCPRRAKRRAIRLANSTASVSRGSMQELDMLAGLRRSHAP---Q
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620
pF1KE4 TEGVIDMRSMSSIDSFISCAT-DFPEA-----TRFSHSPLTSLPSKTGGSTAPEVGWRGA
... .. . .:.: ..: . :: : : ...: : ::. ::
CCDS14 SRSSLNAKPHDSLD--LNCDSRDFVAAIISIPTPPANTPDESQPSSPGGGGRAGSTLRNS
580 590 600 610 620 630
630 640 650 660 670 680
pF1KE4 LGASGGRFVEANPSPDASQHSSFFIESPKSSMKTNNPLKLRALKVNFMEGDPSPLLPVLG
CCDS14 SLGTPCLFPETVKISSL
640
>>CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs109|chr7 (630 aa)
initn: 763 init1: 479 opt: 918 Z-score: 843.5 bits: 166.7 E(33420): 1.2e-40
Smith-Waterman score: 957; 34.3% identity (64.4% similar) in 531 aa overlap (9-528:18-523)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLP-PEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLD
: ..: : : : . :... . . :::.: .. ::.
CCDS57 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVASGPMPAPPRQERKRTQDALIVLNVSGTRFQTWQDTLE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE4 RLPRTRLGKL-RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEE
: : : ::. :: : . ..::::: : : ::::::::.::. ..
CCDS57 RYPDTLLGSSERDFFYHP-----------ETQQYFFDRDPDIFRHILNFYRTGKLHYPRH
70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 MCALSFSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCA
: ....:: ..:. . .:: .:...... :.:. .:.: . :: : :
CCDS57 ECISAYDEELAFFGLIPEIIGDCCYEEYKDRRRENAERLQDDADT--DTAGESALPTMTA
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 EKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQL
:...: .:.:..:. : .. .. .::..:.:: ..:.: .: .. . . .
CCDS57 --RQRVWRAFENPHTSTMALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETVPCGSSPGHIKELPCGERY
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 A----HVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKS
: ....:. ::.:::::. ..:....: .. .. ::..::::::. . .:..
CCDS57 AVAFFCLDTACVMIFTVEYLLRLAAAPSRYRFVRSVMSIIDVVAILPYYIGLVMTDN---
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 VLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIF
..: . .:..:..::.:..::: ::. ::.::. .:::.:.. :.:.:.::
CCDS57 ----EDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIF
290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 SSLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVI
....:.::: . .:: ::::.::.. .::::.::::. :::. ::: :..: ..:::::
CCDS57 ATVMFYAEKGSSASKFTSIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVI
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 ALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEK--AIKR-REALERAKRNGSIVS-MNMKDAFARSIEMM
:::.:.::.:::..:....: .: : :. : : :: ..:: . :. : : ...
CCDS57 ALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQKKARLARIRAAKSGSANAYMQSKRNGLLSNQLQ
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 DIVVEKNG-ENMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSS
. :. . :.. ..: .:: : : : . . :: . . : ::
CCDS57 SSEDEQAFVSKSGSSFETQHHHLLHC---LEKTTNHEFVDEQVFEESCMEVATVNRPSSH
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 PQHLNVQQLEDMYNKMAKTQSQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTRTEGVI
:. ::
CCDS57 SPSLSSQQGVTSTCCSRRHKKTFRIPNANVSGSHQGSIQELSTIQIRCVERTPLSNSRSS
520 530 540 550 560 570
>>CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs109|chr2 (491 aa)
initn: 1209 init1: 741 opt: 896 Z-score: 825.1 bits: 162.9 E(33420): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 1328; 43.3% identity (74.3% similar) in 467 aa overlap (33-487:17-477)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 AGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRD
: :::::. . : :: :.:.::::::
CCDS16 MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHTRLGKLLT
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 CNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELDYW
:......::.:::::. :.::.:::.:. : .:::: ::.::.:::.:..:: ::..::
CCDS16 CHSEEAILELCDDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSFCQEIEYW
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE4 GIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNE------------ELKREAETLREREGEEFDNTCCAE
::.:....:::. ::...::. .: . . : .: :.: :.::. ..
CCDS16 GINELFIDSCCSNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKFDTLRFGQ
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLA
:::.: .:.: ..::..:: :. .. : .:. .... :.:. : :. .:.: :
CCDS16 LRKKIWIRMENPAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNED--GE-VDDPVLE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 HVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQ
:: .:::::: : .:. ..: . ::.:.::: ::...:.:.:.:. . ... ...
CCDS16 GVEIACIAWFTGELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTKEEESEDIE
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 NVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVF
:. .::::.:.:::.:::::::::.::.::: :::.::.:.:::.:::..:: ::: :..
CCDS16 NMGKVVQILRLMRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLLLLFLSVGISIFSVLIY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 FAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIP
.:::. ... ::: .:::::.:::::::: .: :: ::.... : : :.::.::::
CCDS16 SVEKDDHTSSLTSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIICGILVVALPIT
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 IIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGE
:: :.::..:..:: . ..: :. .. . .:..: .:. .. . . . :
CCDS16 IIFNKFSKYYQKQKDIDVDQCSEDAPEKCHE---LPYFNIRDIYAQRMHTFITSLSSVGI
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 NMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQHLNVQQLE
.. :... . . :.
CCDS16 VVSDPDSTDASSIEDNEDICNTTSLENCTAK
470 480 490
>>CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs109|chr8 (477 aa)
initn: 1290 init1: 567 opt: 861 Z-score: 793.4 bits: 157.0 E(33420): 7.4e-38
Smith-Waterman score: 1256; 42.6% identity (75.3% similar) in 441 aa overlap (33-461:19-455)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 AGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRD
.:.::::. ... .:: :.:.::::.:
CCDS62 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 CNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELDYW
:......::.::::. . :..:::.: : .:.::.::.::.: :.:..:::::..::
CCDS62 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE4 GIDEIYLESCCQARYHQKK-----EQMNEELKREAETLRERE-------GEEFDNTCCAE
::.:....:::. :: .: :. .:. .:. : : . .::. ..
CCDS62 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGN
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLA
:..:: :..:. :: .....:.::. .. : :.. ::.::..: : :. ..:..
CCDS62 FRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 HVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQ
:: :::::.: . :: .: ::::. :: :::..:.:.:.:. .. .:. .
CCDS62 IVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLA
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 NVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVF
:. ::.:..:.:::.::::::::::::.::: ::. ::.:.:::.:.:..:: ::: ...
CCDS62 NLGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 FAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIP
::.:.. . .::: .::::..::::::::. : : ::.... : .::.::..:::
CCDS62 TIEKEENEG-LATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPIT
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 IIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGE
.: :.::.::..::. :.:.. . . :. . :.:..: .:.... .
CCDS62 LIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKE---VPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSR
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 NMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQHLNVQQLE
CCDS62 SSPSELSLNDSLR
470
858 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Oct 29 21:03:27 2018 done: Mon Oct 29 21:03:28 2018
Total Scan time: 2.020 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]