Result of FASTA (omim) for
pF1KE4235
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4235, 858 aa
1>>>pF1KE4235 858 - 858 aa - 858 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
65089639 residues in 91964 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5592+/-0.000356; mu= 9.9263+/- 0.022
mean_var=125.7197+/-25.085, 0's: 0 Z-trim(116.9): 257 B-trim: 344 in 1/55
Lambda= 0.114386
statistics sampled from 29235 (29523) to 29235 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.682), E-opt: 0.2 (0.321), width: 16
Scan time: 6.400
The best scores are: opt bits E(91964)
NP_004966 (OMIM: 600397,616056) potassium voltage- ( 858) 5673 948.1 0
XP_006723847 (OMIM: 600397,616056) potassium volta ( 858) 5673 948.1 0
XP_011527101 (OMIM: 600397,616056) potassium volta ( 858) 5673 948.1 0
NP_004761 (OMIM: 607738) potassium voltage-gated c ( 911) 3148 531.4 7.7e-150
XP_016869470 (OMIM: 607738) potassium voltage-gate ( 666) 1686 290.1 2.5e-77
XP_016869471 (OMIM: 607738) potassium voltage-gate ( 666) 1686 290.1 2.5e-77
NP_055194 (OMIM: 608164) potassium voltage-gated c ( 500) 1276 222.4 4.6e-57
NP_002227 (OMIM: 603787) potassium voltage-gated c ( 494) 1243 216.9 2e-55
NP_036415 (OMIM: 605696) potassium voltage-gated c ( 466) 1084 190.7 1.5e-47
XP_011524222 (OMIM: 605696) potassium voltage-gate ( 466) 1084 190.7 1.5e-47
XP_016881194 (OMIM: 605696) potassium voltage-gate ( 466) 1084 190.7 1.5e-47
XP_011524220 (OMIM: 605696) potassium voltage-gate ( 466) 1084 190.7 1.5e-47
XP_016881193 (OMIM: 605696) potassium voltage-gate ( 509) 1084 190.7 1.6e-47
NP_758847 (OMIM: 606767) potassium voltage-gated c ( 425) 1021 180.2 1.8e-44
XP_011542212 (OMIM: 300281) potassium voltage-gate ( 647) 933 165.8 6.2e-40
NP_004970 (OMIM: 300281) potassium voltage-gated c ( 647) 933 165.8 6.2e-40
NP_036413 (OMIM: 605410) potassium voltage-gated c ( 630) 918 163.3 3.4e-39
XP_024308146 (OMIM: 300281) potassium voltage-gate ( 675) 918 163.3 3.6e-39
XP_011531127 (OMIM: 603888) potassium voltage-gate ( 491) 896 159.7 3.4e-38
NP_002243 (OMIM: 603888) potassium voltage-gated c ( 491) 896 159.7 3.4e-38
NP_001269357 (OMIM: 603888) potassium voltage-gate ( 491) 896 159.7 3.4e-38
XP_016884997 (OMIM: 300281) potassium voltage-gate ( 558) 867 154.9 1e-36
XP_016884998 (OMIM: 300281) potassium voltage-gate ( 558) 867 154.9 1e-36
NP_065748 (OMIM: 602906) potassium voltage-gated c ( 477) 861 153.9 1.8e-36
XP_011539698 (OMIM: 176262,616366) potassium volta ( 499) 824 147.8 1.3e-34
XP_011539700 (OMIM: 176262,616366) potassium volta ( 499) 824 147.8 1.3e-34
XP_011539699 (OMIM: 176262,616366) potassium volta ( 499) 824 147.8 1.3e-34
XP_016856702 (OMIM: 176262,616366) potassium volta ( 499) 824 147.8 1.3e-34
XP_011539701 (OMIM: 176262,616366) potassium volta ( 499) 824 147.8 1.3e-34
NP_004965 (OMIM: 176262,616366) potassium voltage- ( 499) 824 147.8 1.3e-34
XP_011539702 (OMIM: 176262,616366) potassium volta ( 499) 824 147.8 1.3e-34
XP_011527104 (OMIM: 603788) potassium voltage-gate ( 513) 816 146.5 3.3e-34
XP_011527105 (OMIM: 603788) potassium voltage-gate ( 513) 816 146.5 3.3e-34
XP_011527103 (OMIM: 603788) potassium voltage-gate ( 513) 816 146.5 3.3e-34
XP_011527102 (OMIM: 603788) potassium voltage-gate ( 513) 816 146.5 3.3e-34
XP_006723848 (OMIM: 603788) potassium voltage-gate ( 513) 816 146.5 3.3e-34
XP_011527108 (OMIM: 603788) potassium voltage-gate ( 513) 816 146.5 3.3e-34
XP_011527107 (OMIM: 603788) potassium voltage-gate ( 513) 816 146.5 3.3e-34
NP_002228 (OMIM: 603788) potassium voltage-gated c ( 513) 816 146.5 3.3e-34
XP_011527106 (OMIM: 603788) potassium voltage-gate ( 513) 816 146.5 3.3e-34
NP_002223 (OMIM: 176263) potassium voltage-gated c ( 575) 782 140.9 1.8e-32
NP_114092 (OMIM: 176268) potassium voltage-gated c ( 456) 755 136.4 3.2e-31
NP_000208 (OMIM: 160120,176260) potassium voltage- ( 495) 755 136.4 3.4e-31
NP_005540 (OMIM: 602420) potassium voltage-gated c ( 511) 738 133.6 2.5e-30
NP_751948 (OMIM: 605411,607346,616399) potassium v ( 636) 727 131.8 1.1e-29
XP_006710693 (OMIM: 605411,607346,616399) potassiu ( 636) 727 131.8 1.1e-29
NP_758857 (OMIM: 607603) potassium voltage-gated c ( 519) 716 130.0 3.1e-29
NP_002224 (OMIM: 176266) potassium voltage-gated c ( 653) 716 130.0 3.8e-29
XP_006710692 (OMIM: 605411,607346,616399) potassiu ( 655) 715 129.8 4.3e-29
NP_004971 (OMIM: 605411,607346,616399) potassium v ( 655) 715 129.8 4.3e-29
>>NP_004966 (OMIM: 600397,616056) potassium voltage-gate (858 aa)
initn: 5673 init1: 5673 opt: 5673 Z-score: 5064.0 bits: 948.1 E(91964): 0
Smith-Waterman score: 5673; 100.0% identity (100.0% similar) in 858 aa overlap (1-858:1-858)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLWDLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLWDLLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 KPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVCIAWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVCIAWF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 TMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDDTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDDTK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 FKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDKVQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDKVQD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 NHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQHLNVQQLEDMYNKMAKTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQHLNVQQLEDMYNKMAKTQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 SQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTRTEGVIDMRSMSSIDSFISCATDFPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTRTEGVIDMRSMSSIDSFISCATDFPE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 ATRFSHSPLTSLPSKTGGSTAPEVGWRGALGASGGRFVEANPSPDASQHSSFFIESPKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ATRFSHSPLTSLPSKTGGSTAPEVGWRGALGASGGRFVEANPSPDASQHSSFFIESPKSS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 MKTNNPLKLRALKVNFMEGDPSPLLPVLGMYHDPLRNRGSAAAAVAGLECATLLDKAVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MKTNNPLKLRALKVNFMEGDPSPLLPVLGMYHDPLRNRGSAAAAVAGLECATLLDKAVLS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 PESSIYTTASAKTPPRSPEKHTAIAFNFEAGVHQYIDADTDDEGQLLYSVDSSPPKSLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PESSIYTTASAKTPPRSPEKHTAIAFNFEAGVHQYIDADTDDEGQLLYSVDSSPPKSLPG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 STSPKFSTGTRSEKNHFESSPLPTSPKFLRQNCIYSTEALTGKGPSGQEKCKLENHISPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 STSPKFSTGTRSEKNHFESSPLPTSPKFLRQNCIYSTEALTGKGPSGQEKCKLENHISPD
790 800 810 820 830 840
850
pF1KE4 VRVLPGGGAHGSTRDQSI
::::::::::::::::::
NP_004 VRVLPGGGAHGSTRDQSI
850
>>XP_006723847 (OMIM: 600397,616056) potassium voltage-g (858 aa)
initn: 5673 init1: 5673 opt: 5673 Z-score: 5064.0 bits: 948.1 E(91964): 0
Smith-Waterman score: 5673; 100.0% identity (100.0% similar) in 858 aa overlap (1-858:1-858)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLWDLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLWDLLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 KPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVCIAWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVCIAWF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 TMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDDTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 IMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDDTK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 FKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDKVQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDKVQD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 NHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQHLNVQQLEDMYNKMAKTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 NHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQHLNVQQLEDMYNKMAKTQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 SQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTRTEGVIDMRSMSSIDSFISCATDFPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTRTEGVIDMRSMSSIDSFISCATDFPE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 ATRFSHSPLTSLPSKTGGSTAPEVGWRGALGASGGRFVEANPSPDASQHSSFFIESPKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ATRFSHSPLTSLPSKTGGSTAPEVGWRGALGASGGRFVEANPSPDASQHSSFFIESPKSS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 MKTNNPLKLRALKVNFMEGDPSPLLPVLGMYHDPLRNRGSAAAAVAGLECATLLDKAVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MKTNNPLKLRALKVNFMEGDPSPLLPVLGMYHDPLRNRGSAAAAVAGLECATLLDKAVLS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 PESSIYTTASAKTPPRSPEKHTAIAFNFEAGVHQYIDADTDDEGQLLYSVDSSPPKSLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PESSIYTTASAKTPPRSPEKHTAIAFNFEAGVHQYIDADTDDEGQLLYSVDSSPPKSLPG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 STSPKFSTGTRSEKNHFESSPLPTSPKFLRQNCIYSTEALTGKGPSGQEKCKLENHISPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 STSPKFSTGTRSEKNHFESSPLPTSPKFLRQNCIYSTEALTGKGPSGQEKCKLENHISPD
790 800 810 820 830 840
850
pF1KE4 VRVLPGGGAHGSTRDQSI
::::::::::::::::::
XP_006 VRVLPGGGAHGSTRDQSI
850
>>XP_011527101 (OMIM: 600397,616056) potassium voltage-g (858 aa)
initn: 5673 init1: 5673 opt: 5673 Z-score: 5064.0 bits: 948.1 E(91964): 0
Smith-Waterman score: 5673; 100.0% identity (100.0% similar) in 858 aa overlap (1-858:1-858)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLWDLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLWDLLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 KPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVCIAWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVCIAWF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 TMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDDTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDDTK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 FKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDKVQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDKVQD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 NHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQHLNVQQLEDMYNKMAKTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQHLNVQQLEDMYNKMAKTQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 SQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTRTEGVIDMRSMSSIDSFISCATDFPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTRTEGVIDMRSMSSIDSFISCATDFPE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 ATRFSHSPLTSLPSKTGGSTAPEVGWRGALGASGGRFVEANPSPDASQHSSFFIESPKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ATRFSHSPLTSLPSKTGGSTAPEVGWRGALGASGGRFVEANPSPDASQHSSFFIESPKSS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 MKTNNPLKLRALKVNFMEGDPSPLLPVLGMYHDPLRNRGSAAAAVAGLECATLLDKAVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MKTNNPLKLRALKVNFMEGDPSPLLPVLGMYHDPLRNRGSAAAAVAGLECATLLDKAVLS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 PESSIYTTASAKTPPRSPEKHTAIAFNFEAGVHQYIDADTDDEGQLLYSVDSSPPKSLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PESSIYTTASAKTPPRSPEKHTAIAFNFEAGVHQYIDADTDDEGQLLYSVDSSPPKSLPG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 STSPKFSTGTRSEKNHFESSPLPTSPKFLRQNCIYSTEALTGKGPSGQEKCKLENHISPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 STSPKFSTGTRSEKNHFESSPLPTSPKFLRQNCIYSTEALTGKGPSGQEKCKLENHISPD
790 800 810 820 830 840
850
pF1KE4 VRVLPGGGAHGSTRDQSI
::::::::::::::::::
XP_011 VRVLPGGGAHGSTRDQSI
850
>>NP_004761 (OMIM: 607738) potassium voltage-gated chann (911 aa)
initn: 3453 init1: 3024 opt: 3148 Z-score: 2811.6 bits: 531.4 E(91964): 7.7e-150
Smith-Waterman score: 3417; 63.6% identity (77.4% similar) in 895 aa overlap (2-841:6-894)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTR
: :.... :::: ::::::..:.:::.:::::..::::: :::::::::::::::
NP_004 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 LGKLRDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFS
::::::::::.:::::::::.:..::::::::::::::::::::::.::::::::::::.
NP_004 LGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 QELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLW
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::: .::::::
NP_004 QELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDKRKKLW
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVC
:::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::: ::::: .:: :::::::::
NP_004 DLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLAHVEAVC
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 IAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVV
::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 QIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 DDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNF
: ::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNF
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 SEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKD
:::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:..:..::: ::. . ::
NP_004 SEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESANTKD
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520
pF1KE4 KVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEK-------ARSSSSPQHLNVQQL
...::::::..:::....::::::.::::.: : .: ::::::::..:.:
NP_004 SADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSAQKL
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 EDMYNKMAKTQ--SQPILNTKESAAQ-SKPKEELEMESIPSPVAPLPT-RTEGVIDMRSM
: .::...::: :.: . .:. . : .::.::: . : : . .:: ..::.:
NP_004 EMLYNEITKTQPHSHPNPDCQEKPERPSAYEEEIEMEEVVCPQEQLAVAQTEVIVDMKST
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630
pF1KE4 SSIDSFISCATDFPEATRFSHSPLTS------LPSKTGGSTA-------PEVGWRGALG-
:::::: :::::: :. : : .. .:. :. : . :
NP_004 SSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASHLQMKFPTDLPGTEEHQRARGPPFLTLSREKGP
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670
pF1KE4 -ASGGRF------VEANPSPDASQ---HSSF----FIESPKSSMKTNNPLKLRALKVNFM
: : . . .: . ..:: :: . .:::::.: .:::: :.:::::
NP_004 AARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHSPLQSDNATDSPKSSLKGSNPLKSRSLKVNFK
670 680 690 700 710 720
680 690 700 710 720 730
pF1KE4 EG-------DPSPLLPVLGMYHDPLRNRGSAAAAVAGLECATLLDKAVLSPESSIYTTAS
:. :: :. : . . ... : . :. .:. : : .
NP_004 ENRGSAPQTPPSTARPLPVTTADFSLTTPQHISTILLEETPSQGDRPLLGTEVSAPCQGP
730 740 750 760 770 780
740 750 760 770 780
pF1KE4 AK-TPPRSPEKHTAIAFNFEAGVHQ-YIDADTDDEGQLLYSVDSSPPK---SLPGSTSPK
.: :: :... : : . .. . . :: :. ..: . : : :. . :
NP_004 SKGLSPRFPKQKL---FPFSSRERRSFTEIDTGDDEDFLELPGAREEKQVDSSPNCFADK
790 800 810 820 830
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 FSTGTRSEKNHFESSPLPTSPKFLRQNC---IYSTEALTGKGPSGQEKCKLENHI-SPDV
: : .. :.: .::. .:: :: . . . : :.:: ::.:::. .:..
NP_004 PSDGRDPLRE--EGSVGSSSPQDTGHNCRQDIYHAVSEVKKD-SSQEGCKMENHLFAPEI
840 850 860 870 880 890
850
pF1KE4 RVLPGGGAHGSTRDQSI
NP_004 HSNPGDTGYCPTRETSM
900 910
>>XP_016869470 (OMIM: 607738) potassium voltage-gated ch (666 aa)
initn: 2012 init1: 1583 opt: 1686 Z-score: 1509.9 bits: 290.1 E(91964): 2.5e-77
Smith-Waterman score: 1955; 54.9% identity (70.9% similar) in 656 aa overlap (242-841:1-649)
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 PELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAIL
:::::::::::.::::::::::.:::::::
XP_016 MEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAIL
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 PYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNEL
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 GLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGK
:::::::::::::::::::::::::: ::: :::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGK
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 IVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
XP_016 IVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLK
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 DAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGS
::::::.:..:..::: ::. . ::...::::::..:::....::::::.::::.: :
XP_016 DAFARSMELIDVAVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEV
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560
pF1KE4 PEK-------ARSSSSPQHLNVQQLEDMYNKMAKTQ--SQPILNTKESAAQ-SKPKEELE
.: ::::::::..:.:: .::...::: :.: . .:. . : .::.:
XP_016 SQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSAQKLEMLYNEITKTQPHSHPNPDCQEKPERPSAYEEEIE
280 290 300 310 320 330
570 580 590 600 610
pF1KE4 MESIPSPVAPLPT-RTEGVIDMRSMSSIDSFISCATDFPEATRFSHSPLTS------LPS
:: . : : . .:: ..::.: :::::: :::::: :. : : .. .:.
XP_016 MEEVVCPQEQLAVAQTEVIVDMKSTSSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASHLQMKFPT
340 350 360 370 380 390
620 630 640 650
pF1KE4 KTGGSTAPEVGWRG----------ALGASGGRF------VEANPSPDASQ---HSSF---
:. . . :: . .: : . . .: . ..:: :: .
XP_016 DLPGTEEHQRA-RGPPFLTLSREKGPAARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHSPLQSD
400 410 420 430 440
660 670 680 690 700
pF1KE4 -FIESPKSSMKTNNPLKLRALKVNFMEG-------DPSPLLPVLGMYHDPLRNRGSAAAA
.:::::.: .:::: :.::::: :. :: :. : . . ..
XP_016 NATDSPKSSLKGSNPLKSRSLKVNFKENRGSAPQTPPSTARPLPVTTADFSLTTPQHIST
450 460 470 480 490 500
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 VAGLECATLLDKAVLSPESSIYTTASAK-TPPRSPEKHTAIAFNFEAGVHQ-YIDADTDD
. : . :. .:. : : . .: :: :... : : . .. . . :: :
XP_016 ILLEETPSQGDRPLLGTEVSAPCQGPSKGLSPRFPKQKL---FPFSSRERRSFTEIDTGD
510 520 530 540 550 560
770 780 790 800 810
pF1KE4 EGQLLYSVDSSPPK---SLPGSTSPKFSTGTRSEKNHFESSPLPTSPKFLRQNC---IYS
. ..: . : : :. . : : : .. :.: .::. .:: ::
XP_016 DEDFLELPGAREEKQVDSSPNCFADKPSDGRDPLRE--EGSVGSSSPQDTGHNCRQDIYH
570 580 590 600 610 620
820 830 840 850
pF1KE4 TEALTGKGPSGQEKCKLENHI-SPDVRVLPGGGAHGSTRDQSI
. . . : :.:: ::.:::. .:..
XP_016 AVSEV-KKDSSQEGCKMENHLFAPEIHSNPGDTGYCPTRETSM
630 640 650 660
>>XP_016869471 (OMIM: 607738) potassium voltage-gated ch (666 aa)
initn: 2012 init1: 1583 opt: 1686 Z-score: 1509.9 bits: 290.1 E(91964): 2.5e-77
Smith-Waterman score: 1955; 54.9% identity (70.9% similar) in 656 aa overlap (242-841:1-649)
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 PELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAIL
:::::::::::.::::::::::.:::::::
XP_016 MEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAIL
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 PYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNEL
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 GLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGK
:::::::::::::::::::::::::: ::: :::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGK
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 IVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
XP_016 IVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLK
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 DAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGS
::::::.:..:..::: ::. . ::...::::::..:::....::::::.::::.: :
XP_016 DAFARSMELIDVAVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEV
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560
pF1KE4 PEK-------ARSSSSPQHLNVQQLEDMYNKMAKTQ--SQPILNTKESAAQ-SKPKEELE
.: ::::::::..:.:: .::...::: :.: . .:. . : .::.:
XP_016 SQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSAQKLEMLYNEITKTQPHSHPNPDCQEKPERPSAYEEEIE
280 290 300 310 320 330
570 580 590 600 610
pF1KE4 MESIPSPVAPLPT-RTEGVIDMRSMSSIDSFISCATDFPEATRFSHSPLTS------LPS
:: . : : . .:: ..::.: :::::: :::::: :. : : .. .:.
XP_016 MEEVVCPQEQLAVAQTEVIVDMKSTSSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASHLQMKFPT
340 350 360 370 380 390
620 630 640 650
pF1KE4 KTGGSTAPEVGWRG----------ALGASGGRF------VEANPSPDASQ---HSSF---
:. . . :: . .: : . . .: . ..:: :: .
XP_016 DLPGTEEHQRA-RGPPFLTLSREKGPAARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHSPLQSD
400 410 420 430 440
660 670 680 690 700
pF1KE4 -FIESPKSSMKTNNPLKLRALKVNFMEG-------DPSPLLPVLGMYHDPLRNRGSAAAA
.:::::.: .:::: :.::::: :. :: :. : . . ..
XP_016 NATDSPKSSLKGSNPLKSRSLKVNFKENRGSAPQTPPSTARPLPVTTADFSLTTPQHIST
450 460 470 480 490 500
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 VAGLECATLLDKAVLSPESSIYTTASAK-TPPRSPEKHTAIAFNFEAGVHQ-YIDADTDD
. : . :. .:. : : . .: :: :... : : . .. . . :: :
XP_016 ILLEETPSQGDRPLLGTEVSAPCQGPSKGLSPRFPKQKL---FPFSSRERRSFTEIDTGD
510 520 530 540 550 560
770 780 790 800 810
pF1KE4 EGQLLYSVDSSPPK---SLPGSTSPKFSTGTRSEKNHFESSPLPTSPKFLRQNC---IYS
. ..: . : : :. . : : : .. :.: .::. .:: ::
XP_016 DEDFLELPGAREEKQVDSSPNCFADKPSDGRDPLRE--EGSVGSSSPQDTGHNCRQDIYH
570 580 590 600 610 620
820 830 840 850
pF1KE4 TEALTGKGPSGQEKCKLENHI-SPDVRVLPGGGAHGSTRDQSI
. . . : :.:: ::.:::. .:..
XP_016 AVSEV-KKDSSQEGCKMENHLFAPEIHSNPGDTGYCPTRETSM
630 640 650 660
>>NP_055194 (OMIM: 608164) potassium voltage-gated chann (500 aa)
initn: 1227 init1: 565 opt: 1276 Z-score: 1146.1 bits: 222.4 E(91964): 4.6e-57
Smith-Waterman score: 1276; 45.9% identity (72.9% similar) in 468 aa overlap (35-481:43-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCN
.:::: . ..:. .:.::::::
NP_055 LDSGSLTSLDSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110
pF1KE4 TH----------DSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALS
. : ::.::: . :::::::: :: .:..:::::::.::..::::
NP_055 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 FSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEEL--KREAETLR-EREGEE-FDNTCCAE
: ::..::::::. ..:::. :: ..:: ..: : :...: . ..:.:. :.. :
NP_055 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKE-LSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFSQGPCPT
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLA
:.:::..::::.::.::.:...:::.:.:.: : ..: . ::. :: ::
NP_055 VRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMS-AELSWLDL--------QLL
200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE4 HV-EAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTES---NKSV
.. : :::.::: :..:::: . .:.. : ::::::::.:.:. :.:: ....
NP_055 EILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL-LVESLSGSQTT
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 LQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFS
...:: :.::..:..: ::.:::.::::::.:::.:. . :.:.:::.:::..:: :::
NP_055 QELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFS
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 SLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIA
.. .:::.. :: : :.: ..:::: .::::::::: : : ::::. .: ..:.::.:
NP_055 TVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLA
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 LPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRN---GSIVSMNMKDAFARSIEMMDI
::: :: . :: : : .: :...::::.. .: : .:.:..:..:::: :..
NP_055 LPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSI--MEM
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470 480 490 500 510 520
pF1KE4 VVEKNGENMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQH
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NP_055 LRLKGRERASTRSSGGDDFWF
480 490 500
>>NP_002227 (OMIM: 603787) potassium voltage-gated chann (494 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRL--NVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLG
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pF1KE4 KLRDC--NTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFS
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NP_002 ELINCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFK
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NP_002 NEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREEL-EEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKCVW
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NP_002 PETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNF
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pF1KE4 SEFYKEQKRQEKAIKRR-EALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKK
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NP_002 VRYYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSSRLK
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>>NP_036415 (OMIM: 605696) potassium voltage-gated chann (466 aa)
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pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
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pF1KE4 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELD
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pF1KE4 YWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTC----CAEKRKKLW
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NP_036 YWGIDEARLERCCLRRLRRREEEAAEA--RAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRRRLR
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pF1KE4 DLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQ-STDNPQLAHVEAV
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NP_036 DVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVLETV
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pF1KE4 CIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFL--TESNKSVLQFQNVR
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NP_036 CVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAG
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pF1KE4 RVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAE
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NP_036 LVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAE
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pF1KE4 KDEDDTK-FKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPII
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NP_036 RELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSI
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pF1KE4 VNNFSEFYKEQK-RQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGEN
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NP_036 FHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALWVRA
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>>XP_011524222 (OMIM: 605696) potassium voltage-gated ch (466 aa)
initn: 926 init1: 392 opt: 1084 Z-score: 975.4 bits: 190.7 E(91964): 1.5e-47
Smith-Waterman score: 1084; 39.8% identity (73.4% similar) in 417 aa overlap (30-437:16-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
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XP_011 MEPWPCSPGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERL
10 20 30 40
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pF1KE4 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELD
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XP_011 RACRGHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDELA
50 60 70 80 90 100
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pF1KE4 YWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTC----CAEKRKKLW
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XP_011 YWGIDEARLERCCLRRLRRREEEAAEA--RAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRRRLR
110 120 130 140 150 160
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pF1KE4 DLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQ-STDNPQLAHVEAV
:....:.:..:.:..: .:. :.......: :.:.:.... .: :. : .: .:.:
XP_011 DVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVLETV
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 CIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFL--TESNKSVLQFQNVR
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XP_011 CVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAG
230 240 250 260 270 280
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pF1KE4 RVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAE
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XP_011 LVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAE
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pF1KE4 KDEDDTK-FKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPII
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XP_011 RELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]