Result of FASTA (ccds) for
pF1KE4265
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4265, 1062 aa
1>>>pF1KE4265 1062 - 1062 aa - 1062 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1794+/-0.00119; mu= 0.2085+/- 0.072
mean_var=264.3390+/-55.952, 0's: 0 Z-trim(110.9): 117 B-trim: 348 in 2/50
Lambda= 0.078885
statistics sampled from 12004 (12121) to 12004 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.684), E-opt: 0.2 (0.363), width: 16
Scan time: 2.400
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS76262.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs109|chr1 (1070) 4813 562.1 2.4e-159
CCDS33689.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs109|chr3 (1075) 4812 561.9 2.6e-159
CCDS73017.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs109|chr1 (1071) 4238 496.6 1.2e-139
CCDS76261.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs109|chr1 ( 789) 4068 477.2 6.3e-134
CCDS8967.1 SRGAP1 gene_id:57522|Hs109|chr12 (1085) 3888 456.8 1.2e-127
CCDS2572.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs109|chr3 (1099) 2423 290.1 1.9e-77
CCDS14736.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs109|chrX ( 946) 1449 179.2 3.9e-44
CCDS81365.1 SRGAP2B gene_id:647135|Hs109|chr1 ( 305) 1346 167.1 5.3e-41
CCDS72854.2 SRGAP2B gene_id:647135|Hs109|chr1 ( 459) 1334 165.9 1.9e-40
CCDS81364.1 SRGAP2C gene_id:653464|Hs109|chr1 ( 459) 1308 162.9 1.5e-39
CCDS55540.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs109|chrX ( 986) 1114 141.1 1.2e-32
>>CCDS76262.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs109|chr1 (1070 aa)
initn: 4186 init1: 1639 opt: 4813 Z-score: 2974.4 bits: 562.1 E(33420): 2.4e-159
Smith-Waterman score: 4813; 68.2% identity (86.2% similar) in 1084 aa overlap (1-1062:1-1070)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
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CCDS76 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
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CCDS76 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
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CCDS76 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
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CCDS76 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEY
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CCDS76 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 NLETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQ
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CCDS76 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 PVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTE
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CCDS76 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 SVKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGE
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CCDS76 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 GHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVND
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CCDS76 SQRTD---CSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVND
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 IKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYER
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CCDS76 IKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQER
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 ALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQ
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CCDS76 ALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQ
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 VSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDA
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CCDS76 VSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQDV
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 GTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLV
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CCDS76 TAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLI
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KE4 PHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRH-PDGYLA---RQ
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CCDS76 PHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQ
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KE4 RKRGEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQ---NRGLNND
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CCDS76 RKRPESGS-IRKTFR-SDSH-------GLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPKE
840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KE4 SPERRRRPGHGSLTNISRHDSLK-KIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEE
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CCDS76 GPDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEA
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990 1000
pF1KE4 TMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQI
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CCDS76 TMNSALNELRELERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPAF
950 960 970 980 990 1000
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE4 RRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTN---PTIGPAPPPQGPTDK
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CCDS76 QRSASTAGDIACAFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQS-TDK
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1060
pF1KE4 SCTM
:::.
CCDS76 SCTV
1070
>>CCDS33689.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs109|chr3 (1075 aa)
initn: 3768 init1: 2247 opt: 4812 Z-score: 2973.8 bits: 561.9 E(33420): 2.6e-159
Smith-Waterman score: 4812; 68.9% identity (87.2% similar) in 1072 aa overlap (1-1058:1-1062)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
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CCDS33 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
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CCDS33 LEYSRSLEKLAERFSSKIRSSREHQ-FKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATLNDI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
..::::.:. ::::: :.:::::::..:.::.:.:: ::::::::::::::::::::::
CCDS33 FMNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESISAES
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHI-RLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKA
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CCDS33 KLKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKCTKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 RNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGL
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CCDS33 RNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEYNLETSRHEGL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 DIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRY
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CCDS33 DVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQPVQTELLMRY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 QQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETY
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CCDS33 HQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRSTESVKSAASETY
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 LSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTS
.:: .::::::::::::.::: :..::..:::::::::::::::..:::::.::: ::
CCDS33 MSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLGEGERAECGTT-
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 RGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGEN
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CCDS33 RGRRNARTRNQDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQQQGIFRVPGSQVEVNDIKNSFERGED
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 PLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLT
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CCDS33 PLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFQDLISTIKLENPAERVHQIQQILVT
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 LPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEI
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CCDS33 LPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMHIPDGQDPVSCQAHINEV
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 IKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAG-DDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSED
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CCDS33 IKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGGEEYCDSPHSEPGAIDEVDHDNGTEPHTSDE
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 ECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQD
: : :::::::::.::: ::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::
CCDS33 EVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGVDGLIPHQYIVVQD
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE4 MDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSK-DMNSPTDRHPD----GYLARQRKRGEPPP
:::.:::.:::::::::::::. .::.::: :..:::.. : : ..: : :..
CCDS33 MDDAFSDSLSQKADSEASSGPLLDDKASSKNDLQSPTEHISDYGFGGVMGRVRLRSDGAA
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KE4 -PVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLA--SHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRP
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CCDS33 IPRRRSG--GDTHSP---PRGLG-PSIDTPPRAAACPSSPHKIPLTRG-RIESPEKRRMA
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KE4 GHGSLTNISRHDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNEL
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CCDS33 TFGSAGSINYPDKKALSEGHSMRSTCGSTRHSSLGDHKSLEAEALAEDIEKTMSTALHEL
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE4 RELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSD
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CCDS33 RELERQNTVKQAPDVVLDTLEPLKNPPGPVSS-EPASPLHTIVIRDPDAAMRRSSSSSTE
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE4 TMSTFKPMVAPRM-GVQLKPPALRP-KPAVLPKTNPTI--GPAPPPQGPTDKSCTM
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CCDS33 MMTTFKPALSARLAGAQLRPPPMRPVRPVVQHRSSSSSSSGVGSPAVTPTEKMFPNSSAD
1020 1030 1040 1050 1060 1070
CCDS33 KSGTM
>>CCDS73017.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs109|chr1 (1071 aa)
initn: 3905 init1: 1639 opt: 4238 Z-score: 2620.7 bits: 496.6 E(33420): 1.2e-139
Smith-Waterman score: 4801; 68.1% identity (86.1% similar) in 1085 aa overlap (1-1062:1-1071)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
:..:..:::::::::::..:::::::::.::.:::.:: :.:::::::::::::::::::
CCDS73 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
.::::::::::::.:::::::: ::.:::::.::::::: ::::::.:::.::.:::::
CCDS73 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
CCDS73 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
:::::::::::::: :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
CCDS73 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLID-CCDLGYHASLNRALRTYLSAE
.:::::.:::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.::::
CCDS73 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 YNLETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQ
::: :.::::: :::::.::. :::::.:::: .:::::::::: :::: . :. ::
CCDS73 LNLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 QPVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRST
::::.::. : :::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.:::.:::.: :
CCDS73 QPVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSM
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 ESVKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLG
::::::::::..:::::::::::::::::::: :..::::: ::::::::::::::.:::
CCDS73 ESVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLG
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 EGHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVN
:..:.. : .::.: .:.:::.:.:::.::::::::. .::::.:::::::::::::
CCDS73 ESQRTD---CSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVN
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 DIKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYE
::::.:::::.::: ::..::..:.::::::::::::.:::::. :.::..:. .::: :
CCDS73 DIKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQE
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 RALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQD
:::::::.::.::...::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::.:: ::: .:
CCDS73 RALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHD
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 QVSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQD
::::::::::.::::::.::.:::. .::.:::: . . .::::::..: ..:. ::
CCDS73 QVSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQD
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 AGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGL
. .: :::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::::
CCDS73 VTAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGL
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KE4 VPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRH-PDGYLA---R
.::::::::: .: . : :.. :. : : : .. . :. : : ::: .
CCDS73 IPHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINK
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KE4 QRKRGEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQ---NRGLNN
:::: : .:. : ::.: .::.: .: .::.... : : ...: .
CCDS73 QRKRPESGS-IRKTFR-SDSH-------GLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPK
840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KE4 DSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLK-KIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIE
..:.. :::::..::::.::: ..::: ::.....:. .::.:.:.:::.::::::
CCDS73 EGPDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIE
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990 1000
pF1KE4 ETMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQ
:::.::::::::::::..::.::::::::: .:.::. : ..: ::::. :.. ::
CCDS73 ATMNSALNELRELERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPA
950 960 970 980 990 1000
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE4 IRRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTN---PTIGPAPPPQGPTD
..::.:...: .:.:. . .:.. .:::: ::::.:.:::: : .. . ::. ::
CCDS73 FQRSASTAGDIACAFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQS-TD
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1060
pF1KE4 KSCTM
::::.
CCDS73 KSCTV
1070
>>CCDS76261.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs109|chr1 (789 aa)
initn: 3678 init1: 1597 opt: 4068 Z-score: 2518.1 bits: 477.2 E(33420): 6.3e-134
Smith-Waterman score: 4068; 77.1% identity (91.9% similar) in 789 aa overlap (1-778:1-785)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
:..:..:::::::::::..:::::::::.::.:::.:: :.:::::::::::::::::::
CCDS76 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
.::::::::::::.:::::::: ::.:::::.::::::: ::::::.:::.::.:::::
CCDS76 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
CCDS76 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
:::::::::::::: :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
CCDS76 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEY
.:::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS76 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 NLETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQ
::: :.::::: :::::.::. :::::.:::: .:::::::::: :::: . :. :::
CCDS76 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 PVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTE
:::.::. : :::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.:::.:::.: : :
CCDS76 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 SVKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGE
:::::::::..:::::::::::::::::::: :..::::: ::::::::::::::.::::
CCDS76 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 GHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVND
..:.. : .::.: .:.:::.:.:::.::::::::. .::::.::::::::::::::
CCDS76 SQRTD---CSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVND
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 IKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYER
:::.:::::.::: ::..::..:.::::::::::::.:::::. :.::..:. .::: ::
CCDS76 IKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQER
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 ALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQ
::::::.::.::...::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::.:: ::: .::
CCDS76 ALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQ
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 VSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDA
:::::::::.::::::.::.:::. .::.:::: . . .::::::..: ..:. ::.
CCDS76 VSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQDV
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 GTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLV
.: :::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::::.
CCDS76 TAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLI
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KE4 PHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRG
:::::::::
CCDS76 PHQYIVVQDTLIS
780
>>CCDS8967.1 SRGAP1 gene_id:57522|Hs109|chr12 (1085 aa)
initn: 6949 init1: 3888 opt: 3888 Z-score: 2405.4 bits: 456.8 E(33420): 1.2e-127
Smith-Waterman score: 6917; 97.1% identity (97.5% similar) in 1085 aa overlap (1-1062:1-1085)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKAR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 NEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 NEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 IIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 QLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 QLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE4 SKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTS-
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTRP
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KE4 -------RGRRNSHTRHQ---------------DSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGI
. .:.:. : : :::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 PNVPPKPQKHRKSRPRSQYNTKLFNGDLETFVKDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGI
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 FRVSGSQVEVNDIKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 FRVSGSQVEVNDIKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDL
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 ISCIRIDNLYERALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 ISCIRIDNLYERALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFG
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 PTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 PTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYS
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KE4 EHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 EHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDW
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KE4 WEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 WEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRH
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KE4 PDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 PDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNR
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KE4 GLNNDSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GLNNDSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQ
910 920 930 940 950 960
940 950 960 970 980 990
pF1KE4 DIEETMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 DIEETMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSS
970 980 990 1000 1010 1020
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE4 EPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTNPTIGPAPPPQGPTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 EPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTNPTIGPAPPPQGPTD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1060
pF1KE4 KSCTM
:::::
CCDS89 KSCTM
>>CCDS2572.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs109|chr3 (1099 aa)
initn: 3552 init1: 1762 opt: 2423 Z-score: 1504.2 bits: 290.1 E(33420): 1.9e-77
Smith-Waterman score: 4715; 67.1% identity (84.8% similar) in 1095 aa overlap (1-1058:1-1086)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
::. ..::::::::::::.:.::::.::::: ::::::.: :.:::::::.:::.:::::
CCDS25 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
::::.:::::::: .: ::...:: .:::: ::::::::::.:.:.::::.:::::.::
CCDS25 LEYSRSLEKLAERFSSKIRSSREHQ-FKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATLNDI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
..::::.:. ::::: :.:::::::..:.::.:.:: ::::::::::::::::::::::
CCDS25 FMNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESISAES
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHI-RLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKA
::::::::::::...::: ... : :.: :::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS25 KLKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKCTKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 RNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGL
::.:::.: ::::.. ::::::.::::::::::.:::: :..::::::::::::::::::
CCDS25 RNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEYNLETSRHEGL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 DIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRY
:.::::::::. ::::. :.: .::::.::::: ::::::::::::::::.::..::
CCDS25 DVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQPVQTELLMRY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 QQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETY
.::::::::::::::::.:: .::.::.:::.:.::.:::. ::::::::::::..::::
CCDS25 HQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRSTESVKSAASETY
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 LSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTS
.:: .::::::::::::.::: :..::..:::::::::::::::..:::::.::: ::
CCDS25 MSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLGEGERAECGTTR
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KE4 ------------RGRRNSHTRHQ-----------DSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQG
: : : :. ::::.:::.::::::.:::::::.::
CCDS25 PPCLPPKPQKMRRPRPLSVYSHKLFNGSMEAFIKDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQQQG
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 IFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFND
:::: :::::::::::::::::.::.:::...::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS25 IFRVPGSQVEVNDIKNSFERGEDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFQD
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 LISCIRIDNLYERALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICF
::: :...: ::. .:...:.:::: :..::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LISTIKLENPAERVHQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICF
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 GPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAG-DDYCDSP
::::: .:. :: ::::::.::.:::::::::.:::. .::.:::::::::: ..:::::
CCDS25 GPTLMHIPDGQDPVSCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGGEEYCDSP
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KE4 YSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASE
.:: :...:::.: :::::::..: : :::::::::.::: :::::::::::::::::::
CCDS25 HSEPGAIDEVDHDNGTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGASLLLYHRASE
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KE4 DWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSK-DMNSPT
:::::::::.:::.::::::::::::.:::.:::::::::::::. .::.::: :..:::
CCDS25 DWWEGRHNGVDGLIPHQYIVVQDMDDAFSDSLSQKADSEASSGPLLDDKASSKNDLQSPT
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860
pF1KE4 DRHPD----GYLARQRKRGEPPP-PVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLA--
.. : : ..: : :.. : :: : .: : : :..:. :.: . :
CCDS25 EHISDYGFGGVMGRVRLRSDGAAIPRRRSG--GDTHSP---PRGLG-PSIDTPPRAAACP
840 850 860 870 880 890
870 880 890 900 910 920
pF1KE4 SHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDH
: :. . .:: .:::.:: :: .:. :. .. .: . .: ......::
CCDS25 SSPHKIPLTRG-RIESPEKRRMATFGSAGSINYPDKKALSEGHSMRSTCGSTRHSSLGDH
900 910 920 930 940 950
930 940 950 960 970 980
pF1KE4 KPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLS
: :. :..:.:::.::.:::.::::::::.:.:.:::::::::: .:: : :..: : :
CCDS25 KSLEAEALAEDIEKTMSTALHELRELERQNTVKQAPDVVLDTLEPLKNPPGPVSS-EPAS
960 970 980 990 1000 1010
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE4 PLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRM-GVQLKPPALRP-KPAVLPKTNPT
:::....:. . .:::.:::.. :.:::: .. :. :.::.:: .:: .:.: ... .
CCDS25 PLHTIVIRDPDAAMRRSSSSSTEMMTTFKPALSARLAGAQLRPPPMRPVRPVVQHRSSSS
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1050 1060
pF1KE4 I--GPAPPPQGPTDKSCTM
: . : ::.:
CCDS25 SSSGVGSPAVTPTEKMFPNSSADKSGTM
1080 1090
>>CCDS14736.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs109|chrX (946 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
:.. ....... . ::::.::::.: :: :: .::: : :.: .:::.: .:.:..::.:
CCDS14 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAK---TRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATL
::::.:::::::: .. :...::...:. .::::..:: .::...:..:.. :.:
CCDS14 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 SDIYLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESIS
:.. . . .:. .:.:: :. :::... ::...:..:..:: :. :::. :: ::..
CCDS14 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 AESKLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSI
::.::.:::.::::. ::: . : :.::.:: .. ::::::. :.:::
CCDS14 AEAKLREAERQEEKRAGRSVPTTTAGATEAGPLRKSSLKKGGRLVEKRQAKFMEHKLKCT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 KARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHE
::::::::.: ..::.: .::.::. ::.:::: :.: .:...::.: .:: ..:. .
CCDS14 KARNEYLLSLASVNAAVSNYYLHDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQVQ
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 GLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELML
:: .:.::. :.: .:: . .:.. ..::::..:... : :::: .. ... .. :..
CCDS14 GLGSLEEAVEALDPPGDKAKVLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEILP
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 RYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSE
: :..:::: ::.:::.:: .::::.. ..:. .: :: . :: : ::::.::: :.
CCDS14 RAQNIQSRLDRQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSSD
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 TYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMT
.. . ..::..::::: ::. ::.::: : ....::::::. ::..: .: . : .
CCDS14 P--GSRQAGRRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQEV
430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KE4 T-----------SRGRRNSHTRHQ------------DSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQH
. :: : : .: .::: .::.:::::::::: ::::
CCDS14 SWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQH
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 QGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERF
.:::::::.:..:..:...:::::.::.. . ::..:::::::::::.:: :::: . :
CCDS14 EGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLF
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 NDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAI
..:.. ... ::. :. .:: :: ::.:.::::.:::::.::::::::::::::.
CCDS14 GELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAV
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 CFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDY-C-
::::::.::: :: :. :..::....:.:.. . .:: : ::::::::: . :
CCDS14 CFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASCL
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KE4 -DSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDECEPI-EAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLY
:. :. .: . .: : ..::. : . ::.: : :.::.:.::::..: : :.
CCDS14 GDAQLESLGADNEPELEA--EMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLH
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800
pF1KE4 HRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGP----VTEDKSS
.::: :::.:.:::. ::.::.::.. . . .. .:..:.: ..:
CCDS14 ERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLLASELVHR
780 790 800 810 820 830
810 820 830 840 850 860
pF1KE4 SKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSL
. .:: :.:. :
CCDS14 PEPCTSPEAMGPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKTSVRQGLGPAS
840 850 860 870 880 890
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130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAESKLKE
::::::::.::::::::.:.::::.:::::
CCDS81 MKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSKLKE
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190 200 210 220 230
pF1KE4 AEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENK
:::::::::: :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::.:::
CCDS81 AEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYTENK
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 LKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLET
::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: :::
CCDS81 LKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTFLSAELNLEQ
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300 310 320 330 340 350
pF1KE4 SRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQA
:.::::: :::::.::. :::::.:::: .:::::::::: :::: . :. ::::::.
CCDS81 SKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQPVQS
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 ELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKS
::. : :::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.:::.:::.: : :::::
CCDS81 ELLQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSMESVKS
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 TVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRA
:::::..:::::::::::::::::::: .::
CCDS81 TVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFT-VRECYGF
280 290 300
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pF1KE4 EYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNS
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10 20 30 40 50 60
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CCDS72 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
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pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
.::::::::::::.::: :::: ::.:::::.::::::: ::::::.:::.::.:::::
CCDS72 MDYSRNLEKLAERFLAKTCSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDI
70 80 90 100 110
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pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
CCDS72 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
:::::::::::::: :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
CCDS72 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLID-CCDLGYHASLNRALRTYLSAE
.:::::.:::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.::::
CCDS72 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 YNLETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQ
::: :.::::: :::::.::. :::::.:::: .:::::::::: :::: . :. ::
CCDS72 LNLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQ
300 310 320 330 340 350
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pF1KE4 QPVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRST
::::.::. : :::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.:::.:::.: :
CCDS72 QPVQSELLQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSM
360 370 380 390 400 410
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pF1KE4 ESVKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLG
::::::::::..:::::::::::::::::::: .::
CCDS72 ESVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFT-VRECYGF
420 430 440 450
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pF1KE4 EGHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVN
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10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
:..:..:::::::::::..:::::::::.::.:::.:: :.:::::::::::::::::::
CCDS81 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
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pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
.::::::::::.:.:::::::: ::.:::::.::::::: ::::::. ::.::.:::::
CCDS81 MDYSRNLEKLAEHFLAKTRSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKWESRDHTTLSDI
70 80 90 100 110
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pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
CCDS81 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
120 130 140 150 160 170
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pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIGRS-----------GDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
::::::::::::::.: : . ..:.::.: ::::::::::::::.::::
CCDS81 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPCSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKHQAKY
180 190 200 210 220 230
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pF1KE4 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLID-CCDLGYHASLNRALRTYLSAE
.:::::.:::.:::::.::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.::::
CCDS81 TENKLKAIKAQNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAE
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pF1KE4 YNLETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQ
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CCDS81 LNLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQ
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pF1KE4 QPVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRST
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CCDS81 QPVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSM
360 370 380 390 400 410
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pF1KE4 ESVKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLG
::::::::::..:::::::::::::::::::: .::
CCDS81 ESVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFT-VRECYGF
420 430 440 450
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pF1KE4 EGHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVN
1062 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Oct 24 21:29:32 2019 done: Thu Oct 24 21:29:32 2019
Total Scan time: 2.400 Total Display time: 0.250
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]