FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4265, 1062 aa
1>>>pF1KE4265 1062 - 1062 aa - 1062 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
64369986 residues in 92320 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.8775+/-0.00045; mu= -3.5040+/- 0.028
mean_var=333.1147+/-70.449, 0's: 0 Z-trim(119.2): 380 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.070271
statistics sampled from 33986 (34393) to 33986 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16
Scan time: 7.650
The best scores are: opt bits E(92320)
NP_001333130 (OMIM: 188470,606523) SLIT-ROBO Rho G (1062) 7046 729.4 2.9e-209
NP_001164108 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1070) 4813 503.0 4.1e-141
XP_005277568 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1070) 4813 503.0 4.1e-141
NP_001028289 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1075) 4812 502.9 4.4e-141
XP_016863064 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1093) 4703 491.8 9.4e-138
XP_005277567 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1071) 4238 444.7 1.4e-123
NP_056141 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-acti (1071) 4238 444.7 1.4e-123
XP_011507657 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1083) 4171 437.9 1.6e-121
XP_016856330 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 840) 4119 432.5 5.1e-120
NP_001287881 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 789) 4068 427.3 1.8e-118
XP_005277572 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 789) 4068 427.3 1.8e-118
XP_011536883 (OMIM: 188470,606523) SLIT-ROBO Rho G (1045) 3888 409.2 6.8e-113
XP_011536882 (OMIM: 188470,606523) SLIT-ROBO Rho G (1045) 3888 409.2 6.8e-113
NP_065813 (OMIM: 188470,606523) SLIT-ROBO Rho GTPa (1085) 3888 409.2 7e-113
XP_024301784 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 973) 3786 398.8 8.3e-110
XP_016863069 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 709) 3661 386.0 4.3e-106
XP_011507656 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1084) 3596 379.6 5.7e-104
XP_011507658 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 986) 3566 376.5 4.4e-103
XP_011507661 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 841) 3544 374.2 1.8e-102
XP_005277571 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 790) 3493 369.1 6.2e-101
XP_024301782 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1053) 3432 363.0 5.6e-99
XP_024301783 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1053) 3432 363.0 5.6e-99
XP_016856327 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 931) 3180 337.4 2.5e-91
XP_016856329 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 931) 3180 337.4 2.5e-91
XP_024304865 (OMIM: 188470,606523) SLIT-ROBO Rho G ( 491) 3160 335.1 6.3e-91
XP_024304864 (OMIM: 188470,606523) SLIT-ROBO Rho G ( 545) 3076 326.7 2.5e-88
XP_011532597 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1104) 2433 261.7 1.8e-68
NP_055665 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-acti (1099) 2423 260.7 3.6e-68
XP_011532605 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 591) 2364 254.5 1.4e-66
XP_011532598 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1085) 2328 251.1 2.8e-65
XP_016863068 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 876) 2314 249.6 6.4e-65
XP_016863063 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1117) 2314 249.6 7.7e-65
XP_024309611 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 984) 1818 199.3 9.6e-50
XP_024309612 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 984) 1818 199.3 9.6e-50
XP_016863065 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 979) 1808 198.3 1.9e-49
XP_024309610 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1083) 1651 182.4 1.3e-44
XP_011532603 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 941) 1621 179.3 9.6e-44
NP_001657 (OMIM: 300023) rho GTPase-activating pro ( 946) 1449 161.9 1.7e-38
NP_001317613 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 305) 1346 151.1 1e-35
XP_024304895 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 305) 1346 151.1 1e-35
XP_016857580 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 305) 1346 151.1 1e-35
XP_016857581 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 305) 1346 151.1 1e-35
XP_024304892 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 458) 1346 151.2 1.4e-35
NP_001353209 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 458) 1346 151.2 1.4e-35
NP_001355253 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 306) 1334 149.9 2.3e-35
XP_005277479 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 306) 1334 149.9 2.3e-35
XP_016857578 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 306) 1334 149.9 2.3e-35
XP_005277478 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 306) 1334 149.9 2.3e-35
NP_001258799 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 459) 1334 150.0 3.2e-35
NP_001258801 (OMIM: 614704) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 458) 1320 148.6 8.5e-35
>>NP_001333130 (OMIM: 188470,606523) SLIT-ROBO Rho GTPas (1062 aa)
initn: 7046 init1: 7046 opt: 7046 Z-score: 3878.6 bits: 729.4 E(92320): 2.9e-209
Smith-Waterman score: 7046; 100.0% identity (100.0% similar) in 1062 aa overlap (1-1062:1-1062)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKAR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 NEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 QLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 SKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 GRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 LADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 PRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEII
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 KTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDEC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 EPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 DTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 TSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 HDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 HAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060
pF1KE4 PRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTNPTIGPAPPPQGPTDKSCTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTNPTIGPAPPPQGPTDKSCTM
1030 1040 1050 1060
>>NP_001164108 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-activ (1070 aa)
initn: 4186 init1: 1639 opt: 4813 Z-score: 2655.1 bits: 503.0 E(92320): 4.1e-141
Smith-Waterman score: 4813; 68.2% identity (86.2% similar) in 1084 aa overlap (1-1062:1-1070)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
:..:..:::::::::::..:::::::::.::.:::.:: :.:::::::::::::::::::
NP_001 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
.::::::::::::.:::::::: ::.:::::.::::::: ::::::.:::.::.:::::
NP_001 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
NP_001 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
:::::::::::::: :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
NP_001 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEY
.:::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
NP_001 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 NLETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQ
::: :.::::: :::::.::. :::::.:::: .:::::::::: :::: . :. :::
NP_001 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 PVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTE
:::.::. : :::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.:::.:::.: : :
NP_001 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 SVKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGE
:::::::::..:::::::::::::::::::: :..::::: ::::::::::::::.::::
NP_001 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 GHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVND
..:.. : .::.: .:.:::.:.:::.::::::::. .::::.::::::::::::::
NP_001 SQRTD---CSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVND
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 IKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYER
:::.:::::.::: ::..::..:.::::::::::::.:::::. :.::..:. .::: ::
NP_001 IKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQER
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 ALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQ
::::::.::.::...::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::.:: ::: .::
NP_001 ALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQ
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 VSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDA
:::::::::.::::::.::.:::. .::.:::: . . .::::::..: ..:. ::.
NP_001 VSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQDV
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 GTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLV
.: :::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::::.
NP_001 TAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLI
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KE4 PHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRH-PDGYLA---RQ
::::::::: .: . : :.. :. : : : .. . :. : : ::: .:
NP_001 PHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQ
780 790 800 810 820 830
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::: : .:. : ::.: .::.: .: .::.... : : ...: ..
NP_001 RKRPESGS-IRKTFR-SDSH-------GLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPKE
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pF1KE4 SPERRRRPGHGSLTNISRHDSLK-KIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEE
.:.. :::::..::::.::: ..::: ::.....:. .::.:.:.:::.::::::
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pF1KE4 TMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQI
:::.::::::::::::..::.::::::::: .:.::. : ..: ::::. :.. :: .
NP_001 TMNSALNELRELERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPAF
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.::.:...: .:.:. . .:.. .:::: ::::.:.:::: : .. . ::. :::
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1060
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NP_001 SCTV
1070
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::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
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:::::::::::::: :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
XP_005 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
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.:::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
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::: :.::::: :::::.::. :::::.:::: .:::::::::: :::: . :. :::
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..:.. : .::.: .:.:::.:.:::.::::::::. .::::.::::::::::::::
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XP_005 VSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQDV
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pF1KE4 GTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLV
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XP_005 PHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQ
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XP_005 GPDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEA
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pF1KE4 TMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQI
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XP_005 TMNSALNELRELERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPAF
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pF1KE4 RRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTN---PTIGPAPPPQGPTDK
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XP_005 QRSASTAGDIACAFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQS-TDK
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1060
pF1KE4 SCTM
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XP_005 SCTV
1070
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pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
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NP_001 FMNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESISAES
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::::::::::::...::: ... : :.: :::::::::::::::::::::::::: ::
NP_001 KLKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKCTKA
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pF1KE4 RNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGL
::.:::.: ::::.. ::::::.::::::::::.:::: :..::::::::::::::::::
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:.::::::::. ::::. :.: .::::.::::: ::::::::::::::::.::..::
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.::::::::::::::::.:: .::.::.:::.:.::.:::. ::::::::::::..::::
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pF1KE4 LSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTS
.:: .::::::::::::.::: :..::..:::::::::::::::..:::::.::: ::
NP_001 MSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLGEGERAECGTT-
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pF1KE4 RGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGEN
:::::..::.:::::.:::.::::::.:::::::.:::::: :::::::::::::::::.
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::.:::...::::::::::::::::::::::::::.:::: :...: ::. .:...:.:
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::: :..::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:. :: ::::::.::.
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:::::::::.:::. .::.:::::::::: ..:::::.:: :...:::.: :::::::..
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pF1KE4 ECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQD
: : :::::::::.::: ::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::
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pF1KE4 MDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSK-DMNSPTDRHPD----GYLARQRKRGEPPP
:::.:::.:::::::::::::. .::.::: :..:::.. : : ..: : :..
NP_001 MDDAFSDSLSQKADSEASSGPLLDDKASSKNDLQSPTEHISDYGFGGVMGRVRLRSDGAA
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pF1KE4 -PVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLA--SHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRP
: :: : .: : : :..:. :.: . : : :. . .:: .:::.::
NP_001 IPRRRSG--GDTHSP---PRGLG-PSIDTPPRAAACPSSPHKIPLTRG-RIESPEKRRMA
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pF1KE4 GHGSLTNISRHDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNEL
:: .:. :. .. .: . .: ......::: :. :..:.:::.::.:::.::
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::::::.:.:.:::::::::: .:: : :..: : ::::....:. . .:::.:::..
NP_001 RELERQNTVKQAPDVVLDTLEPLKNPPGPVSS-EPASPLHTIVIRDPDAAMRRSSSSSTE
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:.:::: .. :. :.::.:: .:: .:.: ... . : . : ::.:
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NP_001 KSGTM
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pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQD
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:::.::::: ::::.:::::::: .: ::...:: .:::: ::::::::::.:.:.::::
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.:::::.::..::::.:. ::::: :.:::::::..:.::.:.:: :::::::::::::
XP_016 RDHATLNDIFMNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMY
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pF1KE4 HAESISAESKLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHI-RLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYS
:::::::::::::::::::::...::: ... : :.: :::::::::::::::::::::
XP_016 HAESISAESKLKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYN
::::: ::::.:::.: ::::.. ::::::.::::::::::.:::: :..:::::::::
XP_016 ENKLKCTKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEYN
250 260 270 280 290 300
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pF1KE4 LETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQP
::::::::::.::::::::. ::::. :.: .::::.::::: ::::::::::::::
XP_016 LETSRHEGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQP
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360 370 380 390 400 410
pF1KE4 VQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTES
::.::..::.::::::::::::::::.:: .::.::.:::.:.::.:::. :::::::::
XP_016 VQTELLMRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRSTES
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pF1KE4 VKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEG
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pF1KE4 HRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDI
.::: :: :::::..::.:::::.:::.::::::.:::::::.:::::: :::::::::
XP_016 ERAECGTT-RGRRNARTRNQDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQQQGIFRVPGSQVEVNDI
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pF1KE4 KNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERA
::::::::.::.:::...::::::::::::::::::::::::::.:::: :...: ::.
XP_016 KNSFERGEDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFQDLISTIKLENPAERV
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 LHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQV
.:...:.:::: :..::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:. :: :
XP_016 HQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMHIPDGQDPV
610 620 630 640 650 660
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pF1KE4 SCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAG-DDYCDSPYSEHGTLEEVDQDA
:::::.::.:::::::::.:::. .::.:::::::::: ..:::::.:: :...:::.:
XP_016 SCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGGEEYCDSPHSEPGAIDEVDHDN
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 GTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLV
:::::::..: : :::::::::.::: ::::::::::::::::::::::::::::.:::.
XP_016 GTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGVDGLI
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KE4 PHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSK-DMNSPTDRHPD----GYLAR
::::::::::::.:::.:::::::::::::. .::.::: :..:::.. : : ..:
XP_016 PHQYIVVQDMDDAFSDSLSQKADSEASSGPLLDDKASSKNDLQSPTEHISDYGFGGVMGR
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pF1KE4 QRKRGEPPP-PVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLA--SHPRGLLQNRGLNN
: :.. : :: : .: : : :..:. :.: . : : :. . .::
XP_016 VRLRSDGAAIPRRRSG--GDTHSP---PRGLG-PSIDTPPRAAACPSSPHKIPLTRG-RI
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890 900 910 920 930 940
pF1KE4 DSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEE
.:::.:: :: .:. :. .. .: . .: ......::: :. :..:.:::.
XP_016 ESPEKRRMATFGSAGSINYPDKKALSEGHSMRSTCGSTRHSSLGDHKSLEAEALAEDIEK
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950 960 970 980 990 1000
pF1KE4 TMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQI
::.:::.::::::::.:.:.:::::::::: .:: : :..: : ::::....:. . .
XP_016 TMSTALHELRELERQNTVKQAPDVVLDTLEPLKNPPGPVSS-EPASPLHTIVIRDPDAAM
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1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE4 RRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRM-GVQLKPPALRP-KPAVLPKTNPTI--GPAPPPQGPTD
:::.:::.. :.:::: .. :. :.::.:: .:: .:.: ... . : . : ::.
XP_016 RRSSSSSTEMMTTFKPALSARLAGAQLRPPPMRPVRPVVQHRSSSSSSSGVGSPAVTPTE
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1060
pF1KE4 KSCTM
:
XP_016 KMFPNSSADKSGTM
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:..:..:::::::::::..:::::::::.::.:::.:: :.:::::::::::::::::::
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.::::::::::::.:::::::: ::.:::::.::::::: ::::::.:::.::.:::::
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:::::::::::::: :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
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.:::::.:::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.::::
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::::::::::..:::::::::::::::::::: :..::::: ::::::::::::::.:::
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:..:.. : .::.: .:.:::.:.:::.::::::::. .::::.:::::::::::::
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pF1KE4 DIKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYE
::::.:::::.::: ::..::..:.::::::::::::.:::::. :.::..:. .::: :
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:::::::.::.::...::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::.:: ::: .:
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::::::::::.::::::.::.:::. .::.:::: . . .::::::..: ..:. ::
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pF1KE4 AGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGL
. .: :::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::::
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..:.. :::::..::::.::: ..::: ::.....:. .::.:.:.:::.::::::
XP_005 EGPDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIE
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pF1KE4 ETMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQ
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pF1KE4 IRRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTN---PTIGPAPPPQGPTD
..::.:...: .:.:. . .:.. .:::: ::::.:.:::: : .. . ::. ::
XP_005 FQRSASTAGDIACAFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQS-TD
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1060
pF1KE4 KSCTM
::::.
XP_005 KSCTV
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10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
:..:..:::::::::::..:::::::::.::.:::.:: :.:::::::::::::::::::
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.::::::::::::.:::::::: ::.:::::.::::::: ::::::.:::.::.:::::
NP_056 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDI
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pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
NP_056 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
:::::::::::::: :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
NP_056 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
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pF1KE4 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLID-CCDLGYHASLNRALRTYLSAE
.:::::.:::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.::::
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pF1KE4 EGHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVN
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NP_056 ESQRTD---CSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVN
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pF1KE4 DIKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYE
::::.:::::.::: ::..::..:.::::::::::::.:::::. :.::..:. .::: :
NP_056 DIKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQE
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 RALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQD
:::::::.::.::...::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::.:: ::: .:
NP_056 RALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHD
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 QVSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQD
::::::::::.::::::.::.:::. .::.:::: . . .::::::..: ..:. ::
NP_056 QVSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQD
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pF1KE4 AGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGL
. .: :::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::::
NP_056 VTAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGL
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770 780 790 800 810 820
pF1KE4 VPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRH-PDGYLA---R
.::::::::: .: . : :.. :. : : : .. . :. : : ::: .
NP_056 IPHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINK
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pF1KE4 DSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLK-KIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIE
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NP_056 EGPDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIE
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pF1KE4 ETMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQ
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NP_056 ATMNSALNELRELERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPA
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pF1KE4 IRRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTN---PTIGPAPPPQGPTD
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NP_056 FQRSASTAGDIACAFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQS-TD
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1060
pF1KE4 KSCTM
::::.
NP_056 KSCTV
1070
>>XP_011507657 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-activ (1083 aa)
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pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
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XP_011 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
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pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
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XP_011 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDI
70 80 90 100 110
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pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
XP_011 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
:::::::::::::: :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
XP_011 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
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pF1KE4 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEY
.:::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
XP_011 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
240 250 260 270 280 290
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pF1KE4 PVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTE
:::.::. : :::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.:::.:::.: : :
XP_011 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
360 370 380 390 400 410
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pF1KE4 SVKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGE
:::::::::..:::::::::::::::::::: :..::::: ::::::::::::::.::::
XP_011 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
420 430 440 450 460 470
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pF1KE4 GHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVND
..:.. : .::.: .:.:::.:.:::.::::::::. .::::.::::::::::::::
XP_011 SQRTD---CSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVND
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 IKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYER
:::.:::::.::: ::..::..:.::::::::::::.:::::. :.::..:. .::: ::
XP_011 IKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQER
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 ALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQ
::::::.::.::...::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::.:: ::: .::
XP_011 ALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQ
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 VSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDA
:::::::::.::::::.::.:::. .::.:::: . . .::::::..: ..:. ::.
XP_011 VSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQDV
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 GTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLV
.: :::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::::.
XP_011 TAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLI
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KE4 PHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRH-PDGYLARQRK-
::::::::: .: . : :.. :. : : : .. . :. : : ::: .
XP_011 PHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINNN
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870
pF1KE4 -RGEPPPPV-----RRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQ---NRG
. . :: .:: : . :.::.: .: .::.... : : ...
XP_011 LHLDNTKPVTTKQRKRPESGSIRKTFRSDSHGLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQS
840 850 860 870 880 890
880 890 900 910 920 930
pF1KE4 LNNDSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLK-KIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQ
: ...:.. :::::..::::.::: ..::: ::.....:. .::.:.:.:::.:::
XP_011 LPKEGPDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQ
900 910 920 930 940 950
940 950 960 970 980 990
pF1KE4 DIEETMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSS
::: :::.::::::::::::..::.::::::::: .:.::. : ..: ::::. :..
XP_011 DIEATMNSALNELRELERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDP
960 970 980 990 1000 1010
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE4 EPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTN---PTIGPAPPPQG
:: ..::.:...: .:.:. . .:.. .:::: ::::.:.:::: : .. . ::.
XP_011 EPAFQRSASTAGDIACAFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQS
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1060
pF1KE4 PTDKSCTM
::::::.
XP_011 -TDKSCTV
1080
>>XP_016856330 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-activ (840 aa)
initn: 3685 init1: 1604 opt: 4119 Z-score: 2276.3 bits: 432.5 E(92320): 5.1e-120
Smith-Waterman score: 4119; 74.4% identity (89.5% similar) in 835 aa overlap (1-823:1-831)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
:..:..:::::::::::..:::::::::.::.:::.:: :.:::::::::::::::::::
XP_016 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
.::::::::::::.:::::::: ::.:::::.::::::: ::::::.:::.::.:::::
XP_016 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
XP_016 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
:::::::::::::: :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
XP_016 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEY
.:::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
XP_016 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 NLETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQ
::: :.::::: :::::.::. :::::.:::: .:::::::::: :::: . :. :::
XP_016 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
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350 360 370 380 390 400
pF1KE4 PVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTE
:::.::. : :::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.:::.:::.: : :
XP_016 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 SVKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGE
:::::::::..:::::::::::::::::::: :..::::: ::::::::::::::.::::
XP_016 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 GHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVND
..:.. : .::.: .:.:::.:.:::.::::::::. .::::.::::::::::::::
XP_016 SQRTD---CSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVND
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 IKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYER
:::.:::::.::: ::..::..:.::::::::::::.:::::. :.::..:. .::: ::
XP_016 IKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQER
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 ALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQ
::::::.::.::...::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::.:: ::: .::
XP_016 ALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQ
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 VSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDA
:::::::::.::::::.::.:::. .::.:::: . . .::::::..: ..:. ::.
XP_016 VSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQDV
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 GTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLV
.: :::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::::.
XP_016 TAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLI
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KE4 PHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRH-PDGYLARQRKR
::::::::: .: . : :.. :. : : : .. . :. : : :::
XP_016 PHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINNF
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KE4 GEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRR
XP_016 HCGC
840
>>NP_001287881 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-activ (789 aa)
initn: 3678 init1: 1597 opt: 4068 Z-score: 2248.7 bits: 427.3 E(92320): 1.8e-118
Smith-Waterman score: 4068; 77.1% identity (91.9% similar) in 789 aa overlap (1-778:1-785)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
:..:..:::::::::::..:::::::::.::.:::.:: :.:::::::::::::::::::
NP_001 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
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pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
.::::::::::::.:::::::: ::.:::::.::::::: ::::::.:::.::.:::::
NP_001 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
NP_001 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
:::::::::::::: :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
NP_001 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEY
.:::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
NP_001 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 NLETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQ
::: :.::::: :::::.::. :::::.:::: .:::::::::: :::: . :. :::
NP_001 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
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pF1KE4 PVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTE
:::.::. : :::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.:::.:::.: : :
NP_001 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 SVKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGE
:::::::::..:::::::::::::::::::: :..::::: ::::::::::::::.::::
NP_001 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 GHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVND
..:.. : .::.: .:.:::.:.:::.::::::::. .::::.::::::::::::::
NP_001 SQRTD---CSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVND
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 IKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYER
:::.:::::.::: ::..::..:.::::::::::::.:::::. :.::..:. .::: ::
NP_001 IKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQER
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 ALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQ
::::::.::.::...::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::.:: ::: .::
NP_001 ALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQ
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 VSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDA
:::::::::.::::::.::.:::. .::.:::: . . .::::::..: ..:. ::.
NP_001 VSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQDV
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 GTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLV
.: :::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::::.
NP_001 TAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLI
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KE4 PHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRG
:::::::::
NP_001 PHQYIVVQDTLIS
780
1062 residues in 1 query sequences
64369986 residues in 92320 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Oct 24 21:29:33 2019 done: Thu Oct 24 21:29:34 2019
Total Scan time: 7.650 Total Display time: 0.290
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]