FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4277, 1280 aa
1>>>pF1KE4277 1280 - 1280 aa - 1280 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0324+/-0.00118; mu= 0.8523+/- 0.070
mean_var=248.4112+/-49.986, 0's: 0 Z-trim(108.8): 38 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.081375
statistics sampled from 10588 (10618) to 10588 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.318), width: 16
Scan time: 2.660
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS1321.2 RASAL2 gene_id:9462|Hs109|chr1 (1280) 8403 1001.1 0
CCDS1322.1 RASAL2 gene_id:9462|Hs109|chr1 (1139) 7341 876.4 0
CCDS6833.2 DAB2IP gene_id:153090|Hs109|chr9 (1132) 3357 408.7 4.6e-113
CCDS6832.1 DAB2IP gene_id:153090|Hs109|chr9 (1065) 3110 379.7 2.3e-104
CCDS34434.2 SYNGAP1 gene_id:8831|Hs109|chr6 (1343) 1705 214.8 1.3e-54
CCDS46006.1 RASAL3 gene_id:64926|Hs109|chr19 (1011) 1471 187.2 1.9e-46
CCDS47243.1 RASA1 gene_id:5921|Hs109|chr5 ( 870) 649 90.7 1.9e-17
CCDS34200.1 RASA1 gene_id:5921|Hs109|chr5 (1047) 649 90.7 2.2e-17
>>CCDS1321.2 RASAL2 gene_id:9462|Hs109|chr1 (1280 aa)
initn: 8403 init1: 8403 opt: 8403 Z-score: 5344.3 bits: 1001.1 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 8403; 100.0% identity (100.0% similar) in 1280 aa overlap (1-1280:1-1280)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MELSPSSGGAAEALSWPEMFPALESDSPLPPEDLDAVVPVSGAVAGGMLDRILLESVCQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MELSPSSGGAAEALSWPEMFPALESDSPLPPEDLDAVVPVSGAVAGGMLDRILLESVCQQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 QSWVRVYDVKGPPTHRLSCGQSPYTETTTWERKYCILTDSQLVLLNKEKEIPVEGGQEQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QSWVRVYDVKGPPTHRLSCGQSPYTETTTWERKYCILTDSQLVLLNKEKEIPVEGGQEQQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 TDSTKGRCLRRTVSVPSEGQFPEYPPEGATKLEVPAERSPRRRSISGTSTSEKPNSMDTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TDSTKGRCLRRTVSVPSEGQFPEYPPEGATKLEVPAERSPRRRSISGTSTSEKPNSMDTA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NTSPFKVPGFFSKRLKGSIKRTKSQSKLDRNTSFRLPSLRSTDDRSRGLPKLKESRSHES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NTSPFKVPGFFSKRLKGSIKRTKSQSKLDRNTSFRLPSLRSTDDRSRGLPKLKESRSHES
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LLSPCSTVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LLSPCSTVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMEN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LRRTVQPNKDNCRRAENVLRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LRRTVQPNKDNCRRAENVLRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 GEHFEFFSLPPLHSITVHIYKDVEKKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GEHFEFFSLPPLHSITVHIYKDVEKKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 TPNKGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TPNKGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 CALVHILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CALVHILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 ALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 FASWKQQCLNRGKQDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FASWKQQCLNRGKQDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 VIQNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VIQNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 LSVLHSLLWEVVSQLDKATVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNSSPNVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LSVLHSLLWEVVSQLDKATVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNSSPNVS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 GSLSSGLQKIFEDPTDSDLHKLKSPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSMTYSEKDERES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GSLSSGLQKIFEDPTDSDLHKLKSPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSMTYSEKDERES
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 SLPNGRSVSLMDLQDTHAAQVEHASVMLDVPIRLTGSQLSITQVASIKQLRETQSTPQSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SLPNGRSVSLMDLQDTHAAQVEHASVMLDVPIRLTGSQLSITQVASIKQLRETQSTPQSA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 PQVRRPLHPALNQPGGLQPLSFQNPVYHLNNPIPAMPKASIDSSLENLSTASSRSQSNSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PQVRRPLHPALNQPGGLQPLSFQNPVYHLNNPIPAMPKASIDSSLENLSTASSRSQSNSE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 DFKLSGPSNSSMEDFTKRSTQSEDFSRRHTVPDRHIPLALPRQNSTGQAQIRKVDQGGLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DFKLSGPSNSSMEDFTKRSTQSEDFSRRHTVPDRHIPLALPRQNSTGQAQIRKVDQGGLG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE4 ARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSVVSAALVAEPVQNGSRSRQQSSSSRESPVPKVRAIQRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSVVSAALVAEPVQNGSRSRQQSSSSRESPVPKVRAIQRQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE4 QTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLNNGQYEEDVEETEQNLDEAKHAEKYEQEITKLKER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLNNGQYEEDVEETEQNLDEAKHAEKYEQEITKLKER
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE4 LRVSSRRLEEYERRLLVQEQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRRQQEEKDSQMKSIISRLMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LRVSSRRLEEYERRLLVQEQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRRQQEEKDSQMKSIISRLMA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE4 VEEELKKDHAEMQAVIDAKQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMSALTQVKERYSMQVRNGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VEEELKKDHAEMQAVIDAKQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMSALTQVKERYSMQVRNGIS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280
pF1KE4 PTNPTKLSITENGEFKNSSC
::::::::::::::::::::
CCDS13 PTNPTKLSITENGEFKNSSC
1270 1280
>>CCDS1322.1 RASAL2 gene_id:9462|Hs109|chr1 (1139 aa)
initn: 3972 init1: 3916 opt: 7341 Z-score: 4671.3 bits: 876.4 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 7341; 99.4% identity (99.4% similar) in 1135 aa overlap (153-1280:5-1139)
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 STKGRCLRRTVSVPSEGQFPEYPPEGATKLEVPAERSPRRRSISGTSTSEKPNSMDTANT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MQTPEVPAERSPRRRSISGTSTSEKPNSMDTANT
10 20 30
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SPFKVPGFFSKRLKGSIKRTKSQSKLDRNTSFRLPSLRSTDDRSRGLPKLKESRSHESLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SPFKVPGFFSKRLKGSIKRTKSQSKLDRNTSFRLPSLRSTDDRSRGLPKLKESRSHESLL
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SPCSTVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMENLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SPCSTVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMENLR
100 110 120 130 140 150
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 RTVQPNKDNCRRAENVLRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFWGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RTVQPNKDNCRRAENVLRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFWGE
160 170 180 190 200 210
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 HFEFFSLPPLHSITVHIYKDVEKKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HFEFFSLPPLHSITVHIYKDVEKKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTP
220 230 240 250 260 270
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 NKGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELACA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NKGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELACA
280 290 300 310 320 330
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 LVHILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHDAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LVHILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHDAL
340 350 360 370 380 390
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 GEFIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GEFIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFA
400 410 420 430 440 450
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 SWKQQCLNRGKQDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAKVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SWKQQCLNRGKQDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAKVI
460 470 480 490 500 510
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 QNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRELS
520 530 540 550 560 570
730 740 750 760 770
pF1KE4 VLHSLLWEVVSQLDK-------ATVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNS
::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VLHSLLWEVVSQLDKGENSFLQATVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNS
580 590 600 610 620 630
780 790 800 810 820 830
pF1KE4 SPNVSGSLSSGLQKIFEDPTDSDLHKLKSPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSMTYSEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SPNVSGSLSSGLQKIFEDPTDSDLHKLKSPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSMTYSEK
640 650 660 670 680 690
840 850 860 870 880 890
pF1KE4 DERESSLPNGRSVSLMDLQDTHAAQVEHASVMLDVPIRLTGSQLSITQVASIKQLRETQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DERESSLPNGRSVSLMDLQDTHAAQVEHASVMLDVPIRLTGSQLSITQVASIKQLRETQS
700 710 720 730 740 750
900 910 920 930 940 950
pF1KE4 TPQSAPQVRRPLHPALNQPGGLQPLSFQNPVYHLNNPIPAMPKASIDSSLENLSTASSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TPQSAPQVRRPLHPALNQPGGLQPLSFQNPVYHLNNPIPAMPKASIDSSLENLSTASSRS
760 770 780 790 800 810
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE4 QSNSEDFKLSGPSNSSMEDFTKRSTQSEDFSRRHTVPDRHIPLALPRQNSTGQAQIRKVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QSNSEDFKLSGPSNSSMEDFTKRSTQSEDFSRRHTVPDRHIPLALPRQNSTGQAQIRKVD
820 830 840 850 860 870
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE4 QGGLGARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSVVSAALVAEPVQNGSRSRQQSSSSRESPVPKVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QGGLGARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSVVSAALVAEPVQNGSRSRQQSSSSRESPVPKVR
880 890 900 910 920 930
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE4 AIQRQQTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLNNGQYEEDVEETEQNLDEAKHAEKYEQEIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AIQRQQTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLNNGQYEEDVEETEQNLDEAKHAEKYEQEIT
940 950 960 970 980 990
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE4 KLKERLRVSSRRLEEYERRLLVQEQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRRQQEEKDSQMKSII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KLKERLRVSSRRLEEYERRLLVQEQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRRQQEEKDSQMKSII
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE4 SRLMAVEEELKKDHAEMQAVIDAKQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMSALTQVKERYSMQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SRLMAVEEELKKDHAEMQAVIDAKQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMSALTQVKERYSMQV
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1260 1270 1280
pF1KE4 RNGISPTNPTKLSITENGEFKNSSC
:::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RNGISPTNPTKLSITENGEFKNSSC
1120 1130
>>CCDS6833.2 DAB2IP gene_id:153090|Hs109|chr9 (1132 aa)
initn: 3707 init1: 2854 opt: 3357 Z-score: 2143.6 bits: 408.7 E(33420): 4.6e-113
Smith-Waterman score: 4028; 57.9% identity (79.3% similar) in 1141 aa overlap (153-1249:14-1129)
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 STKGRCLRRTVSVPSEGQFPEYPPEGATKLEVPAERSPRRRSISGTSTSEKPNSMDTANT
: : :: :::. : : ::: ::. . .
CCDS68 MEPDSLLDQDDSYESPQERPGSRRSLPG-SLSEKSPSMEPSAA
10 20 30 40
190 200 210 220 230
pF1KE4 SPFKVPGFFSKRLKGSIKRTKSQSKLDRNTSFR--LPSLRST------DDRSRGLPKLKE
.::.: ::.:.:::::::::::: ::::: ::: ::..::. ..::. .:.:::
CCDS68 TPFRVTGFLSRRLKGSIKRTKSQPKLDRNHSFRHILPGFRSAAAAAADNERSHLMPRLKE
50 60 70 80 90 100
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SRSHESLLSPCSTVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASER
:::::::::: :.:: :::. : : .::.::::::::.::::: :::::::: ::.::
CCDS68 SRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEEVVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAER
110 120 130 140 150 160
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 DKWMENLRRTVQPNKDNCRRAENVLRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTK
:::::::::.:.::::: ::.:..:.::.:::::: ::::.:::::::.:.::::.: :
CCDS68 DKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHILKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLK
170 180 190 200 210 220
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 ADNIFWGEHFEFFSLPPLHSITVHIYKDVEKKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKW
.::.:::::::: .::::...:::.:....:::::..:.:.:::..:.:::.::::::::
CCDS68 TDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKW
230 240 250 260 270 280
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 YPVSTPTPNKGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVR
::: ::.:. :: :: ::::.:.:::::::::.:::::: .:..: ::..:::..:..
CCDS68 YPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARYQTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAK
290 300 310 320 330 340
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 NKEELACALVHILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVG
.:::.: ::::::::::..:::::::.::::::::... :::::::.:::.:::::::::
CCDS68 TKEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVG
350 360 370 380 390 400
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 QQYLHDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFP
:.::.:::::::::::::::::::::::::...: .::.:::::::::::::::::::::
CCDS68 QKYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFP
410 420 430 440 450 460
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 RELKEVFASWKQQCLNRGKQDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRT
::::::::::.:.: .::. ::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.::
CCDS68 RELKEVFASWRQECSSRGRPDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTART
470 480 490 500 510 520
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 LTLIAKVIQNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGY
::::::: ::::::::::.:::::.:::.:::::: .:.:::::::::.:.::: ::.::
CCDS68 LTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGY
530 540 550 560 570 580
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pF1KE4 IDLGRELSVLHSLLWEVVSQLDKATVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHN
:::::::: :::::::.::::... :.:::::::.: :. .:. :: . :: ..
CCDS68 IDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIVSKLGPLPRILRDVHTALS--TPGSGQLPGTNDLA
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pF1KE4 SSPNV-SGSLSSGLQK-IFEDPTDS--DLHKLKSPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSM
:.:. :.:.:.:::: ..:. .. :. .: ::. .: : .: .. :: . ..:
CCDS68 STPGSGSSSISAGLQKMVIENDLSGLIDFTRLPSPTPENKDLFFVTRSSG-VQPSPARSS
650 660 670 680 690
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pF1KE4 TYSEKDERESSLPNG-RSVSLMDLQDTHAAQVEHAS-VMLDV-PIRLTGSQLSITQVASI
.::: .: . .. :: .:.:..::::... . : .: . :: : : .: . .:...
CCDS68 SYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDLQDARTLDGEAGSPAGPDVLP---TDGQAAAAQLVAG
700 710 720 730 740 750
890 900 910 920 930
pF1KE4 KQLRETQSTPQSAPQVRR----PLHPALNQ--PGG---LQPLSFQNPVYHLNNPIPAMPK
: : . . ::: : :. .. :: : :::::::::.. .: :.
CCDS68 WPARATPVNLAGLATVRRAGQTPTTPGTSEGAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPR
760 770 780 790 800 810
940 950 960 970 980 990
pF1KE4 ASIDSSLENLSTASSRSQSNSEDFKLS---GPSNSSMEDFTKRSTQSEDFSRRHTVPDRH
. ::. :. :. :: .::::.. . : ... :....: .: :. .. ..
CCDS68 GLGDSGSEGHSSLSS--HSNSEELAAAAKLGSFSTAAEELARR--PGELARRQMSLTEKG
820 830 840 850 860 870
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pF1KE4 IPLALPRQNSTGQAQIRKVDQGGL-------GARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSVVSAAL
..:::::.: :..:: . :...::.: . . .: ...::.
CCDS68 GQPTVPRQNSAGPQ--RRIDQPPPPPPPPPPAPRGRTPPNLLSTLQYPRPSSGTLASAS-
880 890 900 910 920
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pF1KE4 VAEPVQNGSRSRQQSSSSR-ESPVPKVRAIQRQQTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLN-
. : ..: :::::::. .:: : ::...: :::. .. .:::::.:.
CCDS68 -PDWVGPSTRLRQQSSSSKGDSPELKPRAVHKQGP----SPVSPNAL---DRTAAWLLTM
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pF1KE4 NGQYEEDV--------EETEQNLDEAKHAEKYEQEITKLKERLRVSSRRLEEYERRLLVQ
:.: :: .. .. :: ..::: ... :...::.:...::::: . :
CCDS68 NAQLLEDEGLGPDPPHRDRLRSKDELSQAEK---DLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFKCQ
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pF1KE4 EQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRRQQEEKDSQMKSIISRLMAVEEELKKDHAEMQAVIDA
:. :::.:::.::::..:::::::::.:: :::.::::::.::::::::::::::..:.
CCDS68 EETTQKLVLEYQARLEEGEERLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVEEELKKDHAEMQAAVDS
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pF1KE4 KQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMSALTQVKERYSMQVRNGISPTNPTKLSITENGEFKNS
::::::::::::.:::.::.::::::::.::
CCDS68 KQKIIDAQEKRIASLDAANARLMSALTQLKESMH
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1280
pF1KE4 SC
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CCDS68 MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEE
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pF1KE4 VSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMENLRRTVQPNKDNCRRAENV
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CCDS68 VVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHI
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pF1KE4 LRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFWGEHFEFFSLPPLHSITVH
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CCDS68 LKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVH
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CCDS68 LYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARY
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:::::::::.:::::: .:..: ::..:::..:...:::.: ::::::::::..:::::
CCDS68 QTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLT
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::.::::::::... :::::::.:::.::::::::::.::.:::::::::::::::::::
CCDS68 DLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEV
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::::::...: .::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:.: .::. ::::
CCDS68 DPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISE
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CCDS68 RLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYM
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CCDS68 SFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQS
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CCDS68 IVSKLGPLPRILRDVHTALS--TPGSGQLPGTNDLASTPGSGSSSISAGLQKMVIENDLS
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CCDS68 GLIDFTRLPSPTPENKDLFFVTRSSG-VQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDL
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::... . : .: . : .: . .:... : : . . ::: : :
CCDS68 QDARTLDGEAGSPA-GPDVLPTDGQAAAAQLVAGWPARATPVNLAGLATVRRAGQTPTTP
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CCDS68 GTSEGAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSS--HSNSEELAA
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. : ... :....: .: :. .. .. ..:::::.: :..::
CCDS68 AAKLGSFSTAAEELARRP--GELARRQMSLTEKGGQPTVPRQNSAGPQ--RRIDQPPPPP
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. :...::.: . . .: ...::. . : ..: :::::::. .:: :
CCDS68 PPPPPAPRGRTPPNLLSTLQYPRPSSGTLASAS--PDWVGPSTRLRQQSSSSKGDSPELK
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pF1KE4 VRAIQRQQTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLN-NGQYEEDV--------EETEQNLDEA
::...: :::. .. .:::::.:. :.: :: .. .. ::
CCDS68 PRAVHKQGP----SPVSPNAL---DRTAAWLLTMNAQLLEDEGLGPDPPHRDRLRSKDEL
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CCDS68 SQAEK---DLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEGEERLRRQQ
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pF1KE4 EEKDSQMKSIISRLMAVEEELKKDHAEMQAVIDAKQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMSAL
:.:: :::.::::::.::::::::::::::..:.::::::::::::.:::.::.::::::
CCDS68 EDKDIQMKGIISRLMSVEEELKKDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRIASLDAANARLMSAL
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CCDS68 TQLKERYSMQARNGISPTNPTKLQITENGEFRNSSNC
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CCDS34 MSRSRASIHRGSIPAMSYAPFRDVRGPSMHRTQYVHSPY-DRPGWN
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..::.. .::..:.... :. ......:.... :::::::: ::. :.: .
CCDS34 PRFCIISGNQLLMLDEDEIHPLLI-RDRRSESSRNKLLRRTVSVPVEGR-----PHG--E
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pF1KE4 LEVPAERSPRRRSISGTSTSEKPNSMDTANTSPFK-VPGFFSKRLKGSIKRTKSQSKLDR
: :: ::.:. : : ::. : ..::. ::.:.:::.:::::::: ::::
CCDS34 HEYHLGRS-RRKSVPGG----KQYSMEGAPAAPFRPSQGFLSRRLKSSIKRTKSQPKLDR
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..::: :: .::.: ::.: . ..:::.:::::::: :..: :.:. : .::.:::
CCDS34 TSSFRQILPRFRSADHDRARLMQSFKESHSHESLLSPSSAAEALELNLDEDSIIKPVHSS
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::::.:::::: ::.:::.: ::.:::::.:::.:.:.::::: ::..:::.::::::.
CCDS34 ILGQEFCFEVTTSSGTKCFACRSAAERDKWIENLQRAVKPNKDNSRRVDNVLKLWIIEAR
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pF1KE4 DLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKA---DNIFWGEHFEFFSLPPLHSITVHIYKDVE
.: :::.:.::::::: :.:::::: .. :..:::::::: .:: .... .:.:.: .
CCDS34 ELPPKKRYYCELCLDDMLYARTTSKPRSASGDTVFWGEHFEFNNLPAVRALRLHLYRDSD
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pF1KE4 KKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTPN--------------------K
::.:::: .:::::..:.:...::.:.:.::::. :: . :
CCDS34 KKRKKDKAGYVGLVTVPVATLAGRHFTEQWYPVTLPTGSGGSGGMGSGGGGGSGGGSGGK
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pF1KE4 GKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELACALV
:: : :..:.:.:.::..::::: ::::::.::..: :::.::::...:..:::.: :::
CCDS34 GKGGCPAVRLKARYQTMSILPMELYKEFAEYVTNHYRMLCAVLEPALNVKGKEEVASALV
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pF1KE4 HILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHDALGE
:::::::.:::::.:..:::::: :.. :::::::.:::.::::..:.::.::.::.::
CCDS34 HILQSTGKAKDFLSDMAMSEVDRFMEREHLIFRENTLATKAIEEYMRLIGQKYLKDAIGE
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::.:::::.::::::: ::..: : .::.::.::::::.::..::.::::::::::::::
CCDS34 FIRALYESEENCEVDPIKCTASSLAEHQANLRMCCELALCKVVNSHCVFPRELKEVFASW
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. .: .::..::..::::::::::::::::::::::.:::::::..::::::::::::::
CCDS34 RLRCAERGREDIADRLISASLFLRFLCPAIMSPSLFGLMQEYPDEQTSRTLTLIAKVIQN
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::::.:: .::....:::.::: :::.:..:: :::: ::..:. .:.::::::::::.:
CCDS34 LANFSKFTSKEDFLGFMNEFLELEWGSMQQFLYEISNLDTLTNSSSFEGYIDLGRELSTL
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CCDS34 HALLWEVLPQLSKEALLKLGPLPRLLNDISTALRNPN-IQRQPSRQSERPRPQPVVLRGP
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CCDS34 SAEMQGYMMRDLNSSIDLQSFMARGLNSSMDMARLPSPTKEKPPPPPPGGGKDLFYVSRP
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:: .. : .: : : ..:::..::: : ..... .:: . : :
CCDS34 PLARSSPAYCTSSSDITEPEQKMLSVNKSVSMLDLQGDGPGGRLNSSSVSNLAAVGDLLH
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.:: :.: . ... : .:.. .: . : :. :::::::.
CCDS34 SSQASLTAALGLRPAPAGRLSQGSGSSITAAGMRLSQMGVTTDGVPAQQLRIPLSFQNPL
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pF1KE4 YHLNNPIPAMPKA-------SIDSSLENL--------------STASSRSQSNSEDFKLS
.:. :. : . . :: .. . : .. :.:::.. .
CCDS34 FHMAADGPGPPGGHGGGGGHGPPSSHHHHHHHHHHRGGEPPGDTFAPFHGYSKSEDLSSG
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1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE4 L------GARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSV----VSAALVA--EPVQNGSRSRQQSSSS
:. . :: : .. : . : : . :. :. :: . .: :::: :
CCDS34 GSGGGSGGGGGGQPPPLQRGKSQQLTVSAAQKPRPSSGNLLQSPEPSYGPARPRQQSLS-
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pF1KE4 RESPV---------------PKVRAIQRQQTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLNNGQYE
.:. . :.. :..:: .. .: :: :::.::: : .
CCDS34 KEGSIGGSGGSGGGGGGGLKPSITK-QHSQTPSTLNP----TMPASERTVAWVSNMPHLS
1120 1130 1140 1150 1160
1120 1130 1140 1150
pF1KE4 EDVE------------ETEQNLDEAK--HAEKYEQEITKLKERLRVSSRRLEEYERRLLV
:.: : ...::.. ....::.:: .:::::..:.:.:::::::::
CCDS34 ADIESAHIEREEYKLKEYSKSMDESRLDRVKEYEEEIHSLKERLHMSNRKLEEYERRLLS
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pF1KE4 QEQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRRQQEEKDSQMKSIISRLMAVEEELKKDHAEMQAVID
::.: .:.:..:.::::.::.:::.:: :::::.::::.::: :::::..:: :
CCDS34 QEEQTSKILMQYQARLEQSEKRLRQQQAEKDSQIKSIIGRLMLVEEELRRDHPAMAEPLP
1230 1240 1250 1260 1270 1280
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pF1KE4 AKQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMSALTQVKERYSMQVRNGISPTNPTKLSITENGEFKN
CCDS34 EPKKRLLDAQERQLPPLGPTNPRVTLAPPWNGLAPPAPPPPPRLQITENGEFRNTADH
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130 140 150 160 170 180
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CCDS46 IPEAPTPNVPVWDIGGFTLLDGKLVLLGGEEEGPRRPRV-GSASSEGSIHVAMGNFRDPD
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pF1KE4 KVPGFFSKRLKGSIKRTKSQSKLDRNTSFRLPSLRSTDDRSRGLPKLKESRSHESLLSPC
..:: . : . . .. : : . :. : : :. :: :::
CCDS46 RMPGKTEPETAGPNQVHNVRGLLKRLKEKKKARLEPRD----GPPSALGSR--ESL----
190 200 210 220 230
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pF1KE4 STVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMENLRRTV
.:. :::: . : . ::: :.::. ::.::. .::.:::: ::.:::.:.:.:::
CCDS46 ATLSELDLGAERDVRIWPLHPSLLGEPHCFQVTWTGGSRCFSCRSAAERDRWIEDLRRQF
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QPNKDNCRRAENVLRLWIIEAKDL----APKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFWG
::..:: .: :. : .:. ::: : : :: :: .:.:::. .. ..::.
CCDS46 QPTQDNVEREETWLSVWVHEAKGLPRAAAGAPGVRAELWLDGALLARTAPRAGPGQLFWA
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:.:.: .::: . ..... . . . ..: .. : : ..: .:.:.:.
CCDS46 ERFHFEALPPARRLSLRL-RGLGPGSAVLGRVALALEELDAPRAPAAG---LERWFPLL-
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pF1KE4 PTPNKGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEEL
: .: ..: . : . . .:: :.:::.:::.: .:. ::..:::.. .. ::::
CCDS46 -----GAPAGAALRARIRARRLRVLPSERYKELAEFLTFHYARLCGALEPALPAQAKEEL
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: :.:..:..::::. ..::: .:. ::: ...:.:::::.:::.:.::.:::.:.::.
CCDS46 AAAMVRVLRATGRAQALVTDLGTAELARCGGREALLFRENTLATKAIDEYMKLVAQDYLQ
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CCDS46 ETLGQVVRRLCASTEDCEVDPSKCPASELPEHQARLRNSCEEVFETIIHSYDWFPAELGI
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::.::.. : .::.. .. ::. ::::::.:::::..::::.: ..: .:::::::
CCDS46 VFSSWREACKERGSEVLGPRLVCASLFLRLLCPAILAPSLFGLAPDHPAPGPARTLTLIA
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pF1KE4 KVIQNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGR
:::::::: : ::.:: ::.:::.:::.. .:. :: ... :. . :..: ::.
CCDS46 KVIQNLANRAPFGEKEAYMGFMNSFLEEHGPAMQCFLDQVAMVDVDAAPSGYQGSGDLAL
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pF1KE4 ELSVLHSLLWEVVSQLDKATVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNSSPNV
.:.:::. : . ..::..: : ::: .: : .. .:. .. .: .:
CCDS46 QLAVLHAQLCTIFAELDQTTRDTLEPLPTILRAIEEG--QPVLVSVPMRLPL---PPAQV
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pF1KE4 SGSLSSGLQKIFEDPTDSDLHK-LKSPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSMTYSEKDER
.:::.: . : : : : : : :: . : :... . . . . .:
CCDS46 HSSLSAGEKPGFLAPRDLPKHTPLISKSQ-SLRSVRRSESWARPRPDEERPLRRPRPVQR
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pF1KE4 ESSLPNGRSVSLMDLQDTHAAQVEHASVMLDVPIRLTGSQLSITQVASIKQ-LRETQSTP
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CCDS46 TQSVPVRRP----------ARRRQSAGPW---P-RPKGS-LSMGPAPRARPWTRDSASLP
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pF1KE4 QSAPQVRRPLHPALNQPGGL-QPLSFQNPVYHLNN---PIPAM-PKASIDSSL-ENLSTA
.. :.: : . ..:: : :. . :: .: . . :. . .. : : :.:::
CCDS46 RK-PSV--PWQRQMDQPQDRNQALGTHRPVNKLAELQCEVAALREEQKVLSRLVESLST-
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. :. ..... .: : ...:. .: . : .:. .:.. . ... : ...
CCDS46 QIRALTEQQE-QLRG----QLQDLDSRLRAGSSEFDSEHNLTSNEGHSLKNLEHRLNEME
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pF1KE4 STGQAQIRKVDQG-GLGARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSVVSAALVAEPVQNGSRSRQQS
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CCDS46 RT-QAQLRDAVQSLQLSPRTRGSWSQPQPLKAPCLNGDTT
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:: .:.:. .:.:.: .. :..: :: . : ..:: ..::..::: ..: .. . .
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CCDS47 HLLNILSELVE-KIFMASEILPPTLRYIYGCLQKSVQHKWPTNTTMRTRVVSGFVFLRLI
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pF1KE4 ADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNSSPNVSGSLSSGLQKIFEDPTDSDLHKLKSPSQDNT
: :. .::. ..:. :
CCDS47 ---KKLLAITELLQQKQNQYTKTNDVR
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>>CCDS34200.1 RASA1 gene_id:5921|Hs109|chr5 (1047 aa)
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Smith-Waterman score: 669; 27.9% identity (60.5% similar) in 534 aa overlap (260-774:526-1044)
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CCDS34 ILEGSDAQLIYFESEKRATKPKGLIDLSVCSVYVVHDSLFGRPNCFQIVVQHFSEEHYIF
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pF1KE4 -FSCNSASERDKWMENLR-----RTVQPNKDNCR-RAENVLRLWIIEAKDLAPKKKY---
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CCDS34 YFAGETPEQAEDWMKGLQAFCNLRKSSPGTSNKRLRQVSSLVLHIEEAHKL-PVKHFTNP
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CCDS34 YCNIYLNSVQVAKTHAR-EGQNPVWSEEFVFDDLPPDINRFEITL----SNKTKKSKDPD
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pF1KE4 VGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTPNKGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAE
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CCDS34 ILFMRCQLSRLQKGHATDEWFLLSSHIPLKGIEPG-SLRVRARYSMEKIMPEEEYSEFKE
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CCDS34 LILQKELHVVYALSHVCG-QDRTLLASILLRIFLHEKLESLLLCTLNDREISMEDEATTL
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CCDS34 HLLNILSELVE-KIFMASEILPPTLRYIYGCLQKSVQHKWPTNTTMRTRVVSGFVFLRLI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]