FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4281, 1502 aa
1>>>pF1KE4281 1502 - 1502 aa - 1502 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1220+/-0.000457; mu= 10.8125+/- 0.029
mean_var=171.0552+/-34.856, 0's: 0 Z-trim(115.7): 382 B-trim: 297 in 1/55
Lambda= 0.098063
statistics sampled from 25907 (26294) to 25907 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.308), width: 16
Scan time: 16.050
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016876776 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase- (1502) 10038 1433.8 0
XP_005267692 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase- (1502) 10038 1433.8 0
XP_005267693 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase- (1502) 10038 1433.8 0
NP_001025226 (OMIM: 602680) rho GTPase-activating (1502) 10038 1433.8 0
NP_001164 (OMIM: 602680) rho GTPase-activating pro (1501) 10019 1431.1 0
XP_016876777 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase- (1501) 10019 1431.1 0
XP_011525175 (OMIM: 605277) PREDICTED: rho GTPase- (1415) 4021 582.6 7.8e-165
XP_016882203 (OMIM: 605277) PREDICTED: rho GTPase- (1499) 4021 582.6 8.2e-165
NP_004482 (OMIM: 605277) rho GTPase-activating pro (1499) 4021 582.6 8.2e-165
NP_001193531 (OMIM: 118423,604356) N-chimaerin iso ( 334) 444 76.1 5.4e-13
NP_001020372 (OMIM: 118423,604356) N-chimaerin iso ( 433) 444 76.2 6.6e-13
NP_001813 (OMIM: 118423,604356) N-chimaerin isofor ( 459) 444 76.2 6.9e-13
NP_001280010 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 261) 422 72.9 3.8e-12
NP_001280002 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 287) 422 72.9 4.1e-12
NP_001035025 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 332) 422 73.0 4.6e-12
NP_001280000 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 433) 422 73.0 5.7e-12
NP_001280001 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 453) 422 73.1 5.9e-12
NP_004058 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform 2 ( 468) 422 73.1 6.1e-12
NP_001279999 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 481) 422 73.1 6.2e-12
XP_011513409 (OMIM: 602857) PREDICTED: beta-chimae ( 494) 422 73.1 6.4e-12
XP_016867211 (OMIM: 602857) PREDICTED: beta-chimae ( 500) 422 73.1 6.4e-12
NP_001279998 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 543) 422 73.1 6.8e-12
XP_011513408 (OMIM: 602857) PREDICTED: beta-chimae ( 556) 422 73.1 7e-12
XP_011513407 (OMIM: 602857) PREDICTED: beta-chimae ( 569) 422 73.1 7.1e-12
XP_016867210 (OMIM: 602857) PREDICTED: beta-chimae ( 575) 422 73.1 7.2e-12
NP_954976 (OMIM: 610591) rho GTPase-activating pro ( 548) 414 72.0 1.5e-11
XP_011522776 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 581) 414 72.0 1.6e-11
XP_005257185 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 667) 414 72.0 1.8e-11
XP_016879801 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 689) 414 72.0 1.8e-11
XP_011522774 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 722) 414 72.1 1.9e-11
XP_011522773 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 865) 414 72.1 2.2e-11
XP_006721810 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 867) 414 72.1 2.2e-11
NP_001269219 (OMIM: 610591) rho GTPase-activating ( 889) 414 72.1 2.2e-11
XP_006721808 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 889) 414 72.1 2.2e-11
XP_011522771 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 900) 414 72.1 2.2e-11
XP_011522770 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 922) 414 72.1 2.3e-11
XP_016879800 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 922) 414 72.1 2.3e-11
XP_011509785 (OMIM: 610578) PREDICTED: rho GTPase- ( 397) 387 68.1 1.7e-10
XP_016859989 (OMIM: 610578) PREDICTED: rho GTPase- ( 432) 387 68.1 1.8e-10
NP_060930 (OMIM: 610578) rho GTPase-activating pro ( 475) 387 68.1 1.9e-10
XP_016859988 (OMIM: 610578) PREDICTED: rho GTPase- ( 475) 387 68.1 1.9e-10
XP_011509781 (OMIM: 610578) PREDICTED: rho GTPase- ( 475) 387 68.1 1.9e-10
NP_001280005 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 274) 382 67.2 2e-10
NP_001243776 (OMIM: 600365) active breakpoint clus ( 310) 365 64.9 1.2e-09
NP_001269078 (OMIM: 600365) active breakpoint clus ( 641) 365 65.1 2.1e-09
NP_001153218 (OMIM: 600365) active breakpoint clus ( 813) 365 65.2 2.5e-09
NP_001309769 (OMIM: 600365) active breakpoint clus ( 813) 365 65.2 2.5e-09
NP_001083 (OMIM: 600365) active breakpoint cluster ( 822) 365 65.2 2.5e-09
NP_068781 (OMIM: 600365) active breakpoint cluster ( 859) 365 65.2 2.6e-09
XP_011523378 (OMIM: 610590) PREDICTED: rho GTPase- (1159) 366 65.4 3e-09
>>XP_016876776 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase-acti (1502 aa)
initn: 10038 init1: 10038 opt: 10038 Z-score: 7680.5 bits: 1433.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10038; 100.0% identity (100.0% similar) in 1502 aa overlap (1-1502:1-1502)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE4 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE4 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE4 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE4 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE4 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE4 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE4 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE4 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE4 II
::
XP_016 II
>>XP_005267692 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase-acti (1502 aa)
initn: 10038 init1: 10038 opt: 10038 Z-score: 7680.5 bits: 1433.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10038; 100.0% identity (100.0% similar) in 1502 aa overlap (1-1502:1-1502)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
730 740 750 760 770 780
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pF1KE4 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE4 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KE4 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KE4 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE4 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE4 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE4 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KE4 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE4 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE4 II
::
XP_005 II
>>XP_005267693 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase-acti (1502 aa)
initn: 10038 init1: 10038 opt: 10038 Z-score: 7680.5 bits: 1433.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10038; 100.0% identity (100.0% similar) in 1502 aa overlap (1-1502:1-1502)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
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pF1KE4 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
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pF1KE4 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
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pF1KE4 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
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pF1KE4 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
550 560 570 580 590 600
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pF1KE4 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
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pF1KE4 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
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pF1KE4 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE4 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KE4 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KE4 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
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1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE4 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE4 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
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pF1KE4 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE4 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE4 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE4 II
::
XP_005 II
>>NP_001025226 (OMIM: 602680) rho GTPase-activating prot (1502 aa)
initn: 10038 init1: 10038 opt: 10038 Z-score: 7680.5 bits: 1433.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10038; 100.0% identity (100.0% similar) in 1502 aa overlap (1-1502:1-1502)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
310 320 330 340 350 360
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pF1KE4 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE4 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE4 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE4 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE4 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE4 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE4 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE4 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE4 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE4 II
::
NP_001 II
>>NP_001164 (OMIM: 602680) rho GTPase-activating protein (1501 aa)
initn: 8263 init1: 8263 opt: 10019 Z-score: 7666.0 bits: 1431.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10019; 99.9% identity (99.9% similar) in 1502 aa overlap (1-1502:1-1501)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
430 440 450 460 470 480
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pF1KE4 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE4 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE4 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE4 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE4 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_001 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKK-KKKTKNFNPPTRRNWESNYF
1210 1220 1230 1240 1250
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE4 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE4 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE4 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE4 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KE4 II
::
NP_001 II
1500
>>XP_016876777 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase-acti (1501 aa)
initn: 8263 init1: 8263 opt: 10019 Z-score: 7666.0 bits: 1431.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10019; 99.9% identity (99.9% similar) in 1502 aa overlap (1-1502:1-1501)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
310 320 330 340 350 360
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pF1KE4 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE4 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE4 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE4 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE4 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
XP_016 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKK-KKKTKNFNPPTRRNWESNYF
1210 1220 1230 1240 1250
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE4 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
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pF1KE4 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
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XP_016 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
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pF1KE4 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
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XP_016 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
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XP_016 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
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::
XP_016 II
1500
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..:.:::: :::::::::: : :.: :.:.:..: ... . . .. :::..::
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XP_016 SDFGGRVVNNDHFLYWGEVSRSLEDCVECKMHIVEQTEFIDDQTFQPHRSTALQPYIKRA
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pF1KE4 VNNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCF
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XP_016 VSNLYNQLAKTKKPIVVVLTKCDEGVERYIRDAHTFALSKKNLQVVETSARSNVNVDLAF
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pF1KE4 TALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLV-QTVRDYHATWKTVSNKLK
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XP_016 EKLRNERKRVEMRRAFKENLETSPFITPGKPWEEARSFIMNEDFYQWLEESVYMDIYGKH
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pF1KE4 QREIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDR
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XP_016 QKQIIDKAKEEFQELLLEYSELFYELELDAKPSKEKMGVIQDVLGEEQRFKALQKLQAER
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pF1KE4 ESLLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNL
..:.:::: :::::::::: : :.: :.:.:..: ... . . .. :::..::
XP_016 DALILKHIHFVYHPTKETCPSCPACVDAKIEHLISSRFIRPSDRNQKNSLSDPNIDRINL
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XP_016 VILGKDGLARELANEIRALCTNDDKYVIDGKMYELSLRPIEGNVRLPVNSFQTPTFQPHG
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pF1KE4 CFCVFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQR-DSISKNLPILRH
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XP_016 CLCLYNSKESLSYVVESIEKSR-ESTLGRRDNHLVHLPLTLILVNKRGDTSGETLHSLIQ
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XP_016 QGQQIASKLQCVFLD-PASAGIGYGRNINEKQISQVLKGLLDS-KRNLNLVSSTASIKDL
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pF1KE4 SEADLRIVMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITI
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XP_016 ADVDLRIVMCLMCGDPFSADDILFPVLQSQTCKSSHCGSNNSVLLELPIGLHKKRIELSV
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XP_016 LSYHSSFSIRKSRLVHGYIVFYSAKRKASLAMLRAFLCEVQDIIPIQLVALTDGAVDVLD
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pF1KE4 NEAIKELMTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDN
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XP_016 AAEACSTTEEVF-NSPRAGSPLCNSNLQDSEEDIE--PSYSLFREDTSLPSLSKDHSKLS
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XP_016 MELEGND-GLSFIMSNFESKLNNKVPPPVKPKPPV-HFEITKGD---LSYLDQGHRDGQR
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pF1KE4 KQTSRVPLAHPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDS-QNRI-KIRNSFVNNT
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XP_016 KSVSSSPWLPQDGFDPSD-YAEPMDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRN--INKA
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XP_016 QSNGSGNGSDSEMDTSSLERGRKVSIVSKPVLYRTRC--TRLGRFASYRTSFSVGSDDEL
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pF1KE4 GRHRGSEEDPLLSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNP
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XP_016 GPIRKKEED---QASQGYKG--DNAVIPYETDEDPRR-RNILRSLRRNTK-KPKPKPRPS
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pF1KE4 PTRRNWESNYFGMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQ
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XP_016 ITKATWESNYFGVPLTTVVTPEKPIPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQ
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pF1KE4 KQFDQDHNINLVSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHA
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XP_016 RQFDQDHNLDLAEKDFTVNTVAGAMKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHA
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pF1KE4 LKEIVKKFHPVNYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLS
:::..::: :..::.:::.:::.::...:.::::..::::::::::::::: . . :.
XP_016 LKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALT
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KE4 TTKIHQSVVETFIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVE-----PMV----PLQ
.:. .:...: ::::: ::::: :.: . . : :: .. : :.. : :
XP_016 ATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRPITEPPG-ARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQ
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1490 1500
pF1KE4 LPPPLQPQLIQPQLQTDPLGII
::: . .:: : .
XP_016 SPPPTPQSPMQPLLPSQLQAEHTL
1480 1490
>>NP_004482 (OMIM: 605277) rho GTPase-activating protein (1499 aa)
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10 20 30 40 50
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:::.... : :.:.::.::::::::.::.::.::::::::::: .:::.. .:::::::
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NP_004 VSNLYNQLAKTKKPIVVVLTKCDEGVERYIRDAHTFALSKKNLQVVETSARSNVNVDLAF
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..:::..::.:.: :::::..: : : : ..:: ::.: :: . :.... .: .:: :..
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:..:..::::::::.:.:.:::::.:.:.: ::..::. :. ::.:: :.:::::: .:
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..:.:::: :::::::::: : :.: :.:.:..: ... . . .. :::..::
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:.:..:: ::::.. : : : : :.. :.:.....::.::::.:.: :. ...: : .
NP_004 CLCLYNSKESLSYVVESIEKSR-ESTLGRRDNHLVHLPLTLILVNKRGDTSGETLHSLIQ
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pF1KE4 SEADLRIVMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITI
...::::::: :::::::.: :: : :.:..:.... :.:::..:. :: ...::....
NP_004 ADVDLRIVMCLMCGDPFSADDILFPVLQSQTCKSSHCGSNNSVLLELPIGLHKKRIELSV
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NP_004 KSVSSSPWLPQDGFDPSD-YAEPMDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRN--INKA
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NP_004 LKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALT
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::: . .:: : .
NP_004 SPPPTPQSPMQPLLPSQLQAEHTL
1480 1490
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. ...:
NP_001 NEDILF
330
1502 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 09:11:36 2016 done: Sun Nov 6 09:11:39 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]