FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4483, 500 aa
1>>>pF1KE4483 500 - 500 aa - 500 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2834+/-0.000893; mu= 17.9234+/- 0.054
mean_var=63.1633+/-12.513, 0's: 0 Z-trim(105.5): 25 B-trim: 29 in 1/50
Lambda= 0.161377
statistics sampled from 8423 (8440) to 8423 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.635), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 2.800
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11938.1 LIPG gene_id:9388|Hs108|chr18 ( 500) 3444 810.7 0
CCDS77187.1 LIPG gene_id:9388|Hs108|chr18 ( 426) 1603 382.1 6.7e-106
CCDS6012.1 LPL gene_id:4023|Hs108|chr8 ( 475) 1501 358.3 1e-98
CCDS10166.1 LIPC gene_id:3990|Hs108|chr15 ( 499) 1389 332.3 7.7e-91
CCDS7594.1 PNLIP gene_id:5406|Hs108|chr10 ( 465) 702 172.3 1e-42
CCDS7595.1 PNLIPRP1 gene_id:5407|Hs108|chr10 ( 467) 668 164.4 2.5e-40
CCDS31292.1 PNLIPRP3 gene_id:119548|Hs108|chr10 ( 467) 644 158.8 1.2e-38
CCDS13564.1 LIPI gene_id:149998|Hs108|chr21 ( 481) 512 128.1 2.2e-29
CCDS3272.1 LIPH gene_id:200879|Hs108|chr3 ( 451) 506 126.7 5.4e-29
CCDS2991.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 ( 456) 506 126.7 5.4e-29
CCDS77795.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 ( 440) 487 122.2 1.1e-27
CCDS56268.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 ( 440) 351 90.6 3.9e-18
CCDS56269.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 ( 283) 274 72.6 6.6e-13
>>CCDS11938.1 LIPG gene_id:9388|Hs108|chr18 (500 aa)
initn: 3444 init1: 3444 opt: 3444 Z-score: 4330.1 bits: 810.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3444; 99.6% identity (99.8% similar) in 500 aa overlap (1-500:1-500)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSNSVPLLCFWSLCYCFAAGSPVPFGPEGRLEDKLHKPKATQTEVKPSVRFNLRTSKDPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSNSVPLLCFWSLCYCFAAGSPVPFGPEGRLEDKLHKPKATQTEVKPSVRFNLRTSKDPE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 HEGCYLSVGHSQPLEDCSFNMTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHTREKDANVVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HEGCYLSVGHSQPLEDCSFNMTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHTREKDANVVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VDWLPLAHQLYTDAVNNTRVVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAHVAGYAGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VDWLPLAHQLYTDAVNNTRVVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAHVAGYAGN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 FVKGTVGRITGLDPAGPMFEGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTRSFGLSIGIQMPVGHID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FVKGTVGRITGLDPAGPMFEGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTRSFGLSIGIQMPVGHID
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 IYPNGGDFQPGCGLNDVLGSIAYGTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVNQDKPSFAFQCTDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IYPNGGDFQPGCGLNDVLGSIAYGTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVNQDKPSFAFQCTDS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 NRFKKGICLSCRKNRCNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVYHYQMKIHVFSYKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NRFKKGICLSCRKNRCNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVYHYQMKIHVFSYKN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 MGEIEPTFYVTLYGTNADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLGDLLKIQLTWEGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MGEIEPTFYVTLYGTNADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLGDLLKIQLTWEGAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 QSWYNLWKEFRSYLSQPRNPGREPNIRRIRVKSGETQRKLTFCTEDPENTSISPGQELWF
::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS11 QSWYNLWKEFRSYLSQPRNPGRELNIRRIRVKSGETQRKLTFCTEDPENTSISPGRELWF
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE4 RKCRDGWRMKNETSPTVELP
::::::::::::::::::::
CCDS11 RKCRDGWRMKNETSPTVELP
490 500
>>CCDS77187.1 LIPG gene_id:9388|Hs108|chr18 (426 aa)
initn: 1595 init1: 1595 opt: 1603 Z-score: 2014.7 bits: 382.1 E(32554): 6.7e-106
Smith-Waterman score: 2756; 84.6% identity (85.0% similar) in 500 aa overlap (1-500:1-426)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSNSVPLLCFWSLCYCFAAGSPVPFGPEGRLEDKLHKPKATQTEVKPSVRFNLRTSKDPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MSNSVPLLCFWSLCYCFAAGSPVPFGPEGRLEDKLHKPKATQTEVKPSVRFNLRTSKDPE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 HEGCYLSVGHSQPLEDCSFNMTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHTREKDANVVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HEGCYLSVGHSQPLEDCSFNMTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHTREKDANVVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VDWLPLAHQLYTDAVNNTRVVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAHVAGYAGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VDWLPLAHQLYTDAVNNTRVVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAHVAGYAGN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 FVKGTVGRITGLDPAGPMFEGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTRSFGLSIGIQMPVGHID
::::::::::.
CCDS77 FVKGTVGRITA-------------------------------------------------
190
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 IYPNGGDFQPGCGLNDVLGSIAYGTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVNQDKPSFAFQCTDS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 -------------------------ITEVVKCEHERAVHLFVDSLVNQDKPSFAFQCTDS
200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 NRFKKGICLSCRKNRCNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVYHYQMKIHVFSYKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 NRFKKGICLSCRKNRCNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVYHYQMKIHVFSYKN
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 MGEIEPTFYVTLYGTNADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLGDLLKIQLTWEGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MGEIEPTFYVTLYGTNADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLGDLLKIQLTWEGAS
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 QSWYNLWKEFRSYLSQPRNPGREPNIRRIRVKSGETQRKLTFCTEDPENTSISPGQELWF
::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS77 QSWYNLWKEFRSYLSQPRNPGRELNIRRIRVKSGETQRKLTFCTEDPENTSISPGRELWF
350 360 370 380 390 400
490 500
pF1KE4 RKCRDGWRMKNETSPTVELP
::::::::::::::::::::
CCDS77 RKCRDGWRMKNETSPTVELP
410 420
>>CCDS6012.1 LPL gene_id:4023|Hs108|chr8 (475 aa)
initn: 1482 init1: 674 opt: 1501 Z-score: 1885.6 bits: 358.3 E(32554): 1e-98
Smith-Waterman score: 1503; 49.1% identity (77.6% similar) in 442 aa overlap (50-485:40-467)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 GSPVPFGPEGRLEDKLHKPKATQTEVKPSVRFNLRTSKDPEHEGCYLSVGHSQPLEDCSF
.: ::: .: .. :.: : .. . : :
CCDS60 TLAVWLQSLTASRGGVAAADQRRDFIDIESKFALRTPEDTAEDTCHLIPGVAESVATCHF
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 NMTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHTREKDANVVVVDWLPLAHQLYTDAVNNTR
: ..:::..:::::..:..:.:. :::.::. :: :.::.::::: :.. : ... :.
CCDS60 NHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYKREPDSNVIVVDWLSRAQEHYPVSAGYTK
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 VVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAHVAGYAGNFVKGTVGRITGLDPAGPMF
.::...::...:..:. .. : ::::.:::::::.:: ::.... :.:::::::::: :
CCDS60 LVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLGAHAAGIAGSLTNKKVNRITGLDPAGPNF
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 EGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTR-SFGLSIGIQMPVGHIDIYPNGGDFQPGCGLNDVL
: :. .:::::::::::::::.:: : : ::::: ::::.::::::: :::::......
CCDS60 EYAEAPSRLSPDDADFVDVLHTFTRGSPGRSIGIQKPVGHVDIYPNGGTFQPGCNIGEAI
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 GSIA---YGTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVNQDKPSFAFQCTDSNRFKKGICLSCRKNR
:: : . ..::: :::..:::.:::.:...:: :..:.... :.::.::::::::
CCDS60 RVIAERGLGDVDQLVKCSHERSIHLFIDSLLNEENPSKAYRCSSKEAFEKGLCLSCRKNR
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 CNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVYHYQMKIHVFSYKNMGEIEPTFYVTLYGT
::..::. .:.: ::.::::::::. ::..:.:::.::: . .. . . .: ..::::
CCDS60 CNNLGYEINKVRAKRSSKMYLKTRSQMPYKVFHYQVKIHFSGTESETHTNQAFEISLYGT
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 NADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLGDLLKIQLTWEGASQ-SWYNLWKEFRSYL
:.:...:. . : . : : .::.::: :.:.:: ..: :.. : :: . :.
CCDS60 VAESENIPFTLPE-VSTNKTYSFLIYTEVDIGELLMLKLKWKSDSYFSWSDWWS------
370 380 390 400 410 420
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 SQPRNPGREPNIRRIRVKSGETQRKLTFCTEDPENTSISPGQE-LWFRKCRDGWRMKNET
.:: :..::::.::::.:. ::... . . .. :. : ::.:
CCDS60 ----SPGF--AIQKIRVKAGETQKKVIFCSRE-KVSHLQKGKAPAVFVKCHDKSLNKKSG
430 440 450 460 470
500
pF1KE4 SPTVELP
>>CCDS10166.1 LIPC gene_id:3990|Hs108|chr15 (499 aa)
initn: 1295 init1: 358 opt: 1389 Z-score: 1744.4 bits: 332.3 E(32554): 7.7e-91
Smith-Waterman score: 1389; 42.9% identity (71.2% similar) in 503 aa overlap (8-494:6-494)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSNSVPLLCF---WSLCYCF---AAGSPVPFGPEGRLEDKLHKPKATQTEVKPSVRFNLR
::: :: . : :. . : :: . .. : : :.: .:: :
CCDS10 MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNK-TLHEMK--TRFLLF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 TSKDPEHEGCYLSVGHSQPLEDCSFNMTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHTRE-
..:: . ..: . :..:.:: . .:::::...:..:::. ..:.::...
CCDS10 ---GETNQGCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 KDANVVVVDWLPLAHQLYTDAVNNTRVVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAH
. .:: .:::. :::. :: :: :::.::. .: .: ::.:. ..: ..:::::::::::
CCDS10 QPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 VAGYAGNFVKGT--VGRITGLDPAGPMFEGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTRS-FGLSI
:.:.::. . :: .::::::: :::.:::. .:::::::.:::..::.:: .:::.
CCDS10 VSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDANFVDAIHTFTREHMGLSV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE4 GIQMPVGHIDIYPNGGDFQPGCGLNDVLGSIA---YGTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVN
::..:.:: :.:::::.::::: . .. :: ...::...:: :::.::::.:::..
CCDS10 GIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 QDKPSFAFQCTDSNRFKKGICLSCRKNRCNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVY
:.:. : : : :..:.::::.:.:::..::.... .......: ::: ::.::
CCDS10 AGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVY
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 HYQMKIHVFSYKNMGEIEPTFYVTLYGTNADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLG
:::.::. : .. :. :: ..: ::. : .:. . . : .: : .::. . :.:
CCDS10 HYQFKIQ-FINQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIG
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 DLLKIQLTWEGASQSWYNLWKEFRSYL---SQPRNPGREPNIRRIRVKSGETQRKLTFCT
.:. :.. ::. : : :.: .. . . ::. : .. ::::.::::...:::.
CCDS10 ELIMIKFKWEN-SAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGL--VLKTIRVKAGETQQRMTFCS
420 430 440 450 460
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pF1KE4 EDPENTSISPGQELWFRKCRDGWRMKNETSPTVELP
:. .. . : :: : ::. .:..::
CCDS10 ENTDDLLLRPTQEKIFVKCE----IKSKTSKRKIR
470 480 490
>>CCDS7594.1 PNLIP gene_id:5406|Hs108|chr10 (465 aa)
initn: 441 init1: 347 opt: 702 Z-score: 880.4 bits: 172.3 E(32554): 1e-42
Smith-Waterman score: 718; 35.1% identity (62.1% similar) in 422 aa overlap (13-416:19-419)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSNSVPLLCFWSLCY----CFAAGSPVPFGPEGRLEDKLHKPKATQTEVKPSVR
.:: ::. :: : : :: . .: ..:
CCDS75 MLPLWTLSLLLGAVAGKEVCYERLGCFSDDSPWS----GITERPLHILPWSPKDV--NTR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE4 FNLRTSKDPEHEGCYLSVG-HSQPLEDCSFNMTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSAL
: : :...:.. . :. :. . .:. . :: :::::. .: :::: .. . :
CCDS75 FLLYTNENPNN---FQEVAADSSSISGSNFKTNRKTRFIIHGFIDKG-EENWLANVCKNL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 HTREKDANVVVVDWLPLAHQLYTDAVNNTRVVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYS
:. .: . ::: .. ::.: .: :.:: .: ....:: .: .:::.::.:
CCDS75 FKVES-VNCICVDWKGGSRTGYTQASQNIRIVGAEVAYFVEFLQSAFGYSPSNVHVIGHS
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 LGAHVAGYAGNFVKGTVGRITGLDPAGPMFEGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTRSF--G
::::.:: :: ..::.::::::::: : :.:. ::.:.:: ::::.:: . .
CCDS75 LGAHAAGEAGRRTNGTIGRITGLDPAEPCFQGTPELVRLDPSDAKFVDVIHTDGAPIVPN
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 LSIGIQMPVGHIDIYPNGGDFQPGCGLN------DVLGSIAYGTITEVVKCEHERAVHLF
:..:... :::.:..:::: .::: : :. : : :: . . :.: :. . .
CCDS75 LGFGMSQVVGHLDFFPNGGVEMPGCKKNILSQIVDIDG-IWEGT-RDFAACNHLRSYKYY
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE4 VDSLVNQDKPSFA-FQCTDSNRFKKGICLSCRKNRCNSIGYNAKKMRNKRNS---KMYLK
.::.:: : .:: : :.. : : . :. : .. : ..:. : .. .: :. :.::
CCDS75 TDSIVNPD--GFAGFPCASYNVFTANKCFPCPSGGCPQMGHYADRYPGKTNDVGQKFYLD
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 TRAGMPFRVYHYQMKIHVFSYKNMGEIEPTFYVTLYGTNADSQTLPLEIVE-RIEQNATN
: . : ..:.... . . : :.: :.:.:....:. :: . .. ..:.
CCDS75 TGDASNFARWRYKVSVTLSGKKVTGHI----LVSLFGNKGNSKQY--EIFKGTLKPDSTH
350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 TFLVYTEEDLGDLLKIQLTWEGASQSWYNLWKEFRSYLSQPRNPGREPNIRRIRVKSGET
. .. :.::: ... :
CCDS75 SNEFDSDVDVGDLQMVKFIWYNNVINPTLPRVGASKIIVETNVGKQFNFCSPETVREEVL
400 410 420 430 440 450
>>CCDS7595.1 PNLIPRP1 gene_id:5407|Hs108|chr10 (467 aa)
initn: 475 init1: 214 opt: 668 Z-score: 837.6 bits: 164.4 E(32554): 2.5e-40
Smith-Waterman score: 685; 31.8% identity (62.9% similar) in 431 aa overlap (46-466:51-454)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 CFAAGSPVPFGPEGRLEDKLHKPKATQTEVKPSVRFNLRTSKDPEHEGCYLSVGHSQPLE
: ..:: : :...:.. : .. . .:
CCDS75 CYEDLGCFSDTEPWGGTAIRPLKILPWSPEKIGTRFLLYTNENPNNFQILL-LSDPSTIE
30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 DCSFNMTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHTREKDANVVVVDWLPLAHQLYTDAV
.:.: :: :::::. .: :.:. . . : : ..: . ::: .. ::.:.
CCDS75 ASNFQMDRKTRFIIHGFIDKGD-ESWVTDMCKKLFEVE-EVNCICVDWKKGSQATYTQAA
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 NNTRVVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAHVAGYAGNFVKGTVGRITGLDPA
::.:::: ..:.::: : . .. ..:::::.:::::::: ::. . : ..:::::::.
CCDS75 NNVRVVGAQVAQMLDILLTEYSYPPSKVHLIGHSLGAHVAGEAGSKTPG-LSRITGLDPV
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 GPMFEGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTRSFG--LSIGIQMPVGHIDIYPNGGDFQPGCG
::.. . ::.:.:::::::.:: . . :..: .. .::.:..::::. .:::
CCDS75 EASFESTPEEVRLDPSDADFVDVIHTDAAPLIPFLGFGTNQQMGHLDFFPNGGESMPGCK
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300
pF1KE4 LNDV-----LGSIAYGTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVNQDKPSFAFQCTDSNRFKKGIC
: . : .: :: . : :.: :. . ...:..: : . :. ::. . :.. :
CCDS75 KNALSQIVDLDGIWAGT-RDFVACNHLRSYKYYLESILNPDGFA-AYPCTSYKSFESDKC
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LSCRKNRCNSIGYNAKKMRNKRN---SKMYLKTRAGMPFRVYHYQMKIHVFSYKNMGEIE
. : . : ..:. : :. .. . .:..:.: . : ..: ..: . . :.:.
CCDS75 FPCPDQGCPQMGHYADKFAGRTSEEQQKFFLNTGEASNFARWRYGVSITLSGRTATGQIK
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 PTFYVTLYGTNADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLGDLLKIQLTWEGASQSWYN
:.:.:...... . . .. ..:... .. :.: . :... :..
CCDS75 ----VALFGNKGNTHQYSI-FRGILKPGSTHSYEFDAKLDVGTIEKVKFLWNNN------
380 390 400 410 420
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. .: : . . .: :..:: . .::.::
CCDS75 --------VINPTLP--KVGATKITVQKGEEKTVYNFCSEDTVREDTLLTLTPC
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490 500
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:: : : ..:. .:. .:. .. :. : . : :: .: .: . . ..:
CCDS31 RFLLYTIHNPNAYQ-EISAVNSSTIQASYFGTDKITRINIAGWKTDG---KWQRDMCNVL
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110 120 130 140 150 160
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: : : . .::. ... : :::: :::: .: ..: :..: ..: ..:::::.:
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::::.:: ::. . : .:::::::::::.:... . ::.:.::.::::.:: . :
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:..: ::.:.::::: .::: .:.. . :: .. :.: :. ..
CCDS31 LGVGTIDACGHLDFYPNGGKHMPGC--EDLITPLLKFNFNAYKKEMASFFDCNHARSYQF
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...:..: : .:. : . . :: : :. : :. : ..:. : .. .: : : :...:
CCDS31 YAESILNPDA-FIAYPCRSYTSFKAGNCFFCSKEGCPTMGHFADRFHFKNMKTNGSHYFL
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.: . :: ......... . .:. . : .. . : : .: . :: ..: .
CCDS31 NTGSLSPFARWRHKLSVKL----SGSEVTQGTVFLRVGG--AVRKTGEFAIVSGKLEPGM
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: : :. .. ..:.. ..:. :. .:... .. : : : : ::
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. : :::..:
CCDS31 KYGYKSTFCSQDIMGPNILQNLKPC
450 460
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CCDS13 VRIL-LNEEDMNVIVVDWSRGATTFIYNRAVKNTRKVAVSLSVHIKNLL-KHGASLDNFH
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.:: :::::..:..:.. .: .::::::::::: : ..::. :: ::::.: .
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CCDS13 SNGL--GIQEPLGHIDFYPNGGNKQPGCP-KSIFSGIQF------IKCNHQRAVHLFMAS
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CCDS13 L-ETNCNFISFPCRSYKDYKTSLCVDCDCFKEKSCPRLGYQAKLFKGVLKERMEGRPLRT
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CCDS13 TVFLDTSGTYPFCTYYFVLSIIVPDKTMMDGSFSFKLLNQLGMIEEPRLYEKNKPFYKLQ
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CCDS13 EVKILAQFYNDFVNISSIGLTYFQSSNLQCSTCTYKIQSLMLKSLTYPERPPLCRYNIVL
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CCDS32 NLNVTKKTTFIVHGFRPTGSPPVWMDDLVKGLLSVE-DMNVVVVDWNRGATTLIYTHASS
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.:: :. . ...: . . :: ....:: :::::..:..:.. : .::::::::::
CCDS32 KTRKVAMVLKEFIDQMLAEGA-SLDDIYMIGVSLGAHISGFVGEMYDGWLGRITGLDPAG
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CCDS32 PLFNGKPHQDRLDPSDAQFVDVIHSDTDA----LGYKEPLGNIDFYPNGGLDQPGCP-KT
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.::.. : ::.:.:.:.:...:: .. :. : . . ...: :.:: .:
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CCDS32 ESCPLLGYYADNWKDHLRGKDPPMTKAFFDTAEESPFCMYHYFVDIITWN-KNVRRGDIT
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. . . :. . . : . ... ..:. ..:: . :.: . .: :.
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: . .: : . .: : :.. : . ... :: . .: :
CCDS32 L-RILRMKLRSLAHPER-PQLCRYDLVLMENVETVFQPILCPELQL
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500 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 00:51:43 2016 done: Sun Nov 6 00:51:43 2016
Total Scan time: 2.800 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]