Result of FASTA (ccds) for
pF1KE5297
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5297, 1137 aa
1>>>pF1KE5297 1137 - 1137 aa - 1137 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4926+/-0.00108; mu= 21.5403+/- 0.065
mean_var=73.0662+/-14.210, 0's: 0 Z-trim(103.7): 22 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.150043
statistics sampled from 7531 (7553) to 7531 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16
Scan time: 4.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44785.1 CACNA2D4 gene_id:93589|Hs108|chr12 (1137) 7636 1663.2 0
CCDS54598.1 CACNA2D3 gene_id:55799|Hs108|chr3 (1091) 4540 993.0 0
CCDS63647.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1145) 1539 343.4 1.8e-93
CCDS54588.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1150) 1532 341.8 5.3e-93
CCDS33763.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1143) 1529 341.2 8.3e-93
CCDS77748.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1076) 1512 337.5 1e-91
CCDS5598.1 CACNA2D1 gene_id:781|Hs108|chr7 (1091) 1291 289.7 2.6e-77
CCDS78253.1 CACNA2D1 gene_id:781|Hs108|chr7 ( 309) 500 118.1 3.2e-26
>>CCDS44785.1 CACNA2D4 gene_id:93589|Hs108|chr12 (1137 aa)
initn: 7636 init1: 7636 opt: 7636 Z-score: 8924.2 bits: 1663.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7636; 100.0% identity (100.0% similar) in 1137 aa overlap (1-1137:1-1137)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVCGCSALLPLPNPRPTMPATPNFLANPSSSSRWIPLQPMPVAWAFVQKTSALLWLLLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MVCGCSALLPLPNPRPTMPATPNFLANPSSSSRWIPLQPMPVAWAFVQKTSALLWLLLLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 TSLSPAWGQAKIPLETVKLWADTFGGDLYNTVTKYSGSLLLQKKYKDVESSLKIEEVDGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TSLSPAWGQAKIPLETVKLWADTFGGDLYNTVTKYSGSLLLQKKYKDVESSLKIEEVDGL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ELVRKFSEDMENMLRRKVEAVQNLVEAAEEADLNHEFNESLVFDYYNSVLINERDEKGNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ELVRKFSEDMENMLRRKVEAVQNLVEAAEEADLNHEFNESLVFDYYNSVLINERDEKGNF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VELGAEFLLESNAHFSNLPVNTSISSVQLPTNVYNKDPDILNGVYMSEALNAVFVENFQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VELGAEFLLESNAHFSNLPVNTSISSVQLPTNVYNKDPDILNGVYMSEALNAVFVENFQR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 DPTLTWQYFGSATGFFRIYPGIKWTPDENGVITFDCRNRGWYIQAATSPKDIVILVDVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DPTLTWQYFGSATGFFRIYPGIKWTPDENGVITFDCRNRGWYIQAATSPKDIVILVDVSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 SMKGLRMTIAKHTITTILDTLGENDFINIIAYNDYVHYIEPCFKGILVQADRDNREHFKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SMKGLRMTIAKHTITTILDTLGENDFINIIAYNDYVHYIEPCFKGILVQADRDNREHFKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 LVEELMVKGVGVVDQALREAFQILKQFQEAKQGSLCNQAIMLISDGAVEDYEPVFEKYNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LVEELMVKGVGVVDQALREAFQILKQFQEAKQGSLCNQAIMLISDGAVEDYEPVFEKYNW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 PDCKVRVFTYLIGREVSFADRMKWIACNNKGYYTQISTLADTQENVMEYLHVLSRPMVIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PDCKVRVFTYLIGREVSFADRMKWIACNNKGYYTQISTLADTQENVMEYLHVLSRPMVIN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 HDHDIIWTEAYMDSKLLSSQAQSLTLLTTVAMPVFSKKNETRSHGILLGVVGSDVALREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HDHDIIWTEAYMDSKLLSSQAQSLTLLTTVAMPVFSKKNETRSHGILLGVVGSDVALREL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 MKLAPRYKLGVHGYAFLNTNNGYILSHPDLRPLYREGKKLKPKPNYNSVDLSEVEWEDQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MKLAPRYKLGVHGYAFLNTNNGYILSHPDLRPLYREGKKLKPKPNYNSVDLSEVEWEDQA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 ESLRTAMINRETGTLSMDVKVPMDKGKRVLFLTNDYFFTDISDTPFSLGVVLSRGHGEYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ESLRTAMINRETGTLSMDVKVPMDKGKRVLFLTNDYFFTDISDTPFSLGVVLSRGHGEYI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 LLGNTSVEEGLHDLLHPDLALAGDWIYCITDIDPDHRKLSQLEAMIRFLTRKDPDLECDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LLGNTSVEEGLHDLLHPDLALAGDWIYCITDIDPDHRKLSQLEAMIRFLTRKDPDLECDE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 ELVREVLFDAVVTAPMEAYWTALALNMSEESEHVVDMAFLGTRAGLLRSSLFVGSEKVSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ELVREVLFDAVVTAPMEAYWTALALNMSEESEHVVDMAFLGTRAGLLRSSLFVGSEKVSD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE5 RKFLTPEDEASVFTLDRFPLWYRQASEHPAGSFVFNLRWAEGPESAGEPMVVTASTAVAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RKFLTPEDEASVFTLDRFPLWYRQASEHPAGSFVFNLRWAEGPESAGEPMVVTASTAVAV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE5 TVDKRTAIAAAAGVQMKLEFLQRKFWAATRQCSTVDGPCTQSCEDSDLDCFVIDNNGFIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TVDKRTAIAAAAGVQMKLEFLQRKFWAATRQCSTVDGPCTQSCEDSDLDCFVIDNNGFIL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE5 ISKRSRETGRFLGEVDGAVLTQLLSMGVFSQVTMYDYQAMCKPSSHHHSAAQPLVSPISA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ISKRSRETGRFLGEVDGAVLTQLLSMGVFSQVTMYDYQAMCKPSSHHHSAAQPLVSPISA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE5 FLTATRWLLQELVLFLLEWSVWGSWYDRGAEAKSVFHHSHKHKKQDPLQPCDTEYPVFVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FLTATRWLLQELVLFLLEWSVWGSWYDRGAEAKSVFHHSHKHKKQDPLQPCDTEYPVFVY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE5 QPAIREANGIVECGPCQKVFVVQQIPNSNLLLLVTDPTCDCSIFPPVLQEATEVKYNASV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QPAIREANGIVECGPCQKVFVVQQIPNSNLLLLVTDPTCDCSIFPPVLQEATEVKYNASV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE5 KCDRMRSQKLRRRPDSCHAFHPEENAQDCGGASDTSASPPLLLLPVCAWGLLPQLLR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KCDRMRSQKLRRRPDSCHAFHPEENAQDCGGASDTSASPPLLLLPVCAWGLLPQLLR
1090 1100 1110 1120 1130
>>CCDS54598.1 CACNA2D3 gene_id:55799|Hs108|chr3 (1091 aa)
initn: 4149 init1: 2061 opt: 4540 Z-score: 5302.5 bits: 993.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4540; 59.8% identity (85.3% similar) in 1083 aa overlap (51-1126:15-1084)
30 40 50 60 70
pF1KE5 TPNFLANPSSSSRWIPLQPMPVAWAFVQKTSALLWLLLLGTSLSPAW-GQAKIPLETVKL
:::: :: ..:. . .. .::: .:::
CCDS54 MAGPGSPRRASRGASALLAAALLYAALGDVVRSEQQIPLSVVKL
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KE5 WADTFGGDLYNTVTKYSGSLLLQKKYKDVESSLKIEEVDGLELVRKFSEDMENMLRRKVE
::..:::.. . ..::::: :::::::. :... :::.:::.::.:....::.:...: :
CCDS54 WASAFGGEIKSIAAKYSGSQLLQKKYKEYEKDVAIEEIDGLQLVKKLAKNMEEMFHKKSE
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 AVQNLVEAAEEADLNHEFNESLVFDYYNSVLINERDEKGNFVELGAEFLLESNAHFSNLP
::. :::::::: :.:::. .: ..:.:.:::::::. :::.::: ::.: : ::.:::
CCDS54 AVRRLVEAAEEAHLKHEFDADLQYEYFNAVLINERDKDGNFLELGKEFILAPNDHFNNLP
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 VNTSISSVQLPTNVYNKDPDILNGVYMSEALNAVFVENFQRDPTLTWQYFGSATGFFRIY
:: :.:.::.:::.::::: :.:::: ::.:: :::.::.:::.: ::::::: :::: :
CCDS54 VNISLSDVQVPTNMYNKDPAIVNGVYWSESLNKVFVDNFDRDPSLIWQYFGSAKGFFRQY
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 PGIKWTPDENGVITFDCRNRGWYIQAATSPKDIVILVDVSGSMKGLRMTIAKHTITTILD
::::: :::::::.:::::: :::::::::::.::::::::::::::.::::.:...:::
CCDS54 PGIKWEPDENGVIAFDCRNRKWYIQAATSPKDVVILVDVSGSMKGLRLTIAKQTVSSILD
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 TLGENDFINIIAYNDYVHYIEPCFKGILVQADRDNREHFKLLVEELMVKGVGVVDQALRE
:::..::.::::::. .::.:::..: :::::: :.:::. ...:..::.:..: :: :
CCDS54 TLGDDDFFNIIAYNEELHYVEPCLNGTLVQADRTNKEHFREHLDKLFAKGIGMLDIALNE
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 AFQILKQFQEAKQGSLCNQAIMLISDGAVEDYEPVFEKYNWPDCKVRVFTYLIGREVSFA
::.::..:... :::.:.::::::.::::. :. .: :::::: :::.::::::::..::
CCDS54 AFNILSDFNHTGQGSICSQAIMLITDGAVDTYDTIFAKYNWPDRKVRIFTYLIGREAAFA
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470 480 490
pF1KE5 DRMKWIACNNKGYYTQISTLADTQENVMEYLHVLSRPMVINHDHDIIWTEAYMDSKLLSS
: .::.:: :::..::::::::.:::::::::::::: ::...::..:::::.:: :
CCDS54 DNLKWMACANKGFFTQISTLADVQENVMEYLHVLSRPKVIDQEHDVVWTEAYIDSTL--P
410 420 430 440 450 460
500 510 520 530 540 550
pF1KE5 QAQSLT------LLTTVAMPVFSKKNETRSHGILLGVVGSDVALRELMKLAPRYKLGVHG
:::.:: :.::::::::::.:::::.::::::::.:: ..::.: :.::::.::
CCDS54 QAQKLTDDQGPVLMTTVAMPVFSKQNETRSKGILLGVVGTDVPVKELLKTIPKYKLGIHG
470 480 490 500 510 520
560 570 580 590 600 610
pF1KE5 YAFLNTNNGYILSHPDLRPLYREGKKLKPKPNYNSVDLSEVEWEDQAESLRTAMINRETG
::: :::::::.::.:: ::.:::: . ::::.:::::::::::. . ::.::.::.::
CCDS54 YAFAITNNGYILTHPELRLLYEEGKKRR-KPNYSSVDLSEVEWEDRDDVLRNAMVNRKTG
530 540 550 560 570 580
620 630 640 650 660 670
pF1KE5 TLSMDVKVPMDKGKRVLFLTNDYFFTDISDTPFSLGVVLSRGHGEYILLGNTSVEEGLHD
.::.:: .::::::: .::::..:::. :::::::.::::::.:.. ::...::::::
CCDS54 KFSMEVKKTVDKGKRVLVMTNDYYYTDIKGTPFSLGVALSRGHGKYFFRGNVTIEEGLHD
590 600 610 620 630 640
680 690 700 710 720 730
pF1KE5 LLHPDLALAGDWIYCITDIDPDHRKLSQLEAMIRFLTRKDPDLECDEELVREVLFDAVVT
: :::..:: .: :: ::. :.::.::::::. .: :.: :.::.::..::::::::.
CCDS54 LEHPDVSLADEWSYCNTDLHPEHRHLSQLEAIKLYLKGKEPLLQCDKELIQEVLFDAVVS
650 660 670 680 690 700
740 750 760 770 780 790
pF1KE5 APMEAYWTALALNMSEESEHVVDMAFLGTRAGLLRSSLFVGSEKVSDRKFLTPEDEASVF
::.:::::.:::: ::.:.. :..::::::.:: : .::::.:..... :: :. ..:
CCDS54 APIEAYWTSLALNKSENSDKGVEVAFLGTRTGLSRINLFVGAEQLTNQDFLKAGDKENIF
710 720 730 740 750 760
800 810 820 830 840 850
pF1KE5 TLDRFPLWYRQASEHPAGSFVFNLRWAEGPESAGEPMVVTASTAVAVTVDKRTAIAAAAG
. :.::::::.:.:. ::::... .. :: ... ::::::.. . .... ..::.:
CCDS54 NADHFPLWYRRAAEQIPGSFVYSIPFSTGP--VNKSNVVTASTSIQLLDERKSPVVAAVG
770 780 790 800 810
860 870 880 890 900 910
pF1KE5 VQMKLEFLQRKFWAATRQCSTVDGPCTQSCEDSDLDCFVIDNNGFILISKRSRETGRFLG
.::::::.:::::.:.:::...:: :. ::.: ..:..::::::::.:. .:: :.:
CCDS54 IQMKLEFFQRKFWTASRQCASLDGKCSISCDDETVNCYLIDNNGFILVSEDYTQTGDFFG
820 830 840 850 860 870
920 930 940 950 960 970
pF1KE5 EVDGAVLTQLLSMGVFSQVTMYDYQAMCKPSSHHHSAAQPLVSPISAFLTATRWLLQELV
:..:::...::.:: :...:.:::::::. ... ..:. :..: .:::.:..:.. :::
CCDS54 EIEGAVMNKLLTMGSFKRITLYDYQAMCRANKESSDGAHGLLDPYNAFLSAVKWIMTELV
880 890 900 910 920 930
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KE5 LFLLEWSVWGSWYDRGAEAKSVFHHSHKHKKQDPLQPCDTEYPVFVYQPAIREANGIVEC
:::.:... ::. ::. .: .. :.:::::::.:: . .:.:..: . :
CCDS54 LFLVEFNL-CSWWHSDMTAKA-------QKLKQTLEPCDTEYPAFVSERTIKETTGNIAC
940 950 960 970 980 990
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE5 GPCQKVFVVQQIPNSNLLLLVTDPTCDCSIFPPVLQEATEVKYNASVKCDRMRSQKLRRR
:.: ::.::::.:::...:.: .: : :. . :..:: :.::.:...::.:::
CCDS54 EDCSKSFVIQQIPSSNLFMVVVDSSCLCESVAPITMAPIEIRYNESLKCERLKAQKIRRR
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1100 1110 1120 1130
pF1KE5 PDSCHAFHPEENAQDCGGASDTSASPPLLLLPVCAWGLLPQLLR
:.:::.:::::::..:::: . .:. :::::.
CCDS54 PESCHGFHPEENARECGGAPSLQAQTVLLLLPLLLMLFSR
1060 1070 1080 1090
>>CCDS63647.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1145 aa)
initn: 1171 init1: 287 opt: 1539 Z-score: 1791.4 bits: 343.4 E(32554): 1.8e-93
Smith-Waterman score: 1609; 29.8% identity (60.0% similar) in 1180 aa overlap (3-1122:8-1115)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVCGCSALLPLPNPRPTMPATPNFLANPSSSSRWIPLQPMPVAWAFVQKTSALLW
:: : :.: : :. .:. ..: : . : ::
CCDS63 MAVPARTCGASR----PGPARTARPWPGCGPHPGPGTRR-PTSGPPRP----------LW
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LLL--LGTSLSPAWGQAKIPLE-TVKLWADTFGGDLYNTVTKYSGSLLLQKKYKDVESSL
::: : .:. . ..: . :.. :: . .. ... ..: :.. ::: .. .
CCDS63 LLLPLLPLLAAPGASAYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLF
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KE5 KIEEVDGLELVRKFSEDMENMLRRKVEAVQNLVEAAEEADLNHEFNESLVFD---YYNSV
...: . .::.: . :.:..: :::.:.. :..:::. . :...... . ::..
CCDS63 EVQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAK
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 LINERDE-KGNFVELGA-------EFLLESNAHFSNLPVNTSISSVQLPTNVYNKDPDIL
: :. ... :: :. .:. . : :.: :: : ..::.::..:. . ::
CCDS63 ADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFIEDPN--FKN-KVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVIL
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 NGVYMSEALNAVFVENFQRDPTLTWQYFGSATGFFRIYPGIKWTPDENGVITFDCRNRGW
: . .:::. ::.:: ..:::: :: :::::: : ::. : .. . .: : : :
CCDS63 NELNWTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKK-IDLYDVRRRPW
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 YIQAATSPKDIVILVDVSGSMKGLRMTIAKHTITTILDTLGENDFINIIAYNDYVHYIEP
:::.:.::::.::.::::::..:: . . : .. .::::...:..:. ..:. .. .
CCDS63 YIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVS-
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 CFKGILVQADRDNREHFKLLVEELMVKGVGVVDQALREAFQILKQFQEAKQGSLCNQAIM
:: ::::. :.. :: :. ...::. ... ::. :.. . .. . ::. ::
CCDS63 CFTH-LVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRAN--CNKMIM
350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 LISDGAVEDYEPVFEKYNWPDCKVRVFTYLIGREVSFADRMKWIACNNKGYYTQISTLAD
...::. . . ::::::::. :::::. .:.. . ..:.:: ::::: .: ...
CCDS63 MFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGA
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510
pF1KE5 TQENVMEYLHVLSRPMVI--NHDHDIIWTEAYMDSKLLSSQAQSLTLLTTVAMPVFSKKN
. :..::: ::.::::. .. ... ::..: : : .: :..: ..:::. .
CCDS63 IRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNVYED-------ALGLGLVVTGTLPVFNLTQ
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 E---TRSHGILLGVVGSDVALRELMKLAPRYKLGVHGYAFLNTNNGYILSHPDLRPLYRE
. ... ..:::.: :::: .. .:.: : ::..::.: :::.: ::.:.: .
CCDS63 DGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTN
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 GKKLKPKPNYNSVDLSEVEWEDQA-ESLRTAMINRETGTLSMDVKVPMDKGKRVLFLTND
.. : ..:. ..: ::. : .: .::. . : .. . : . . .: .
CCDS63 FRE--PV----TLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRN
580 590 600 610 620
640 650 660 670 680
pF1KE5 YFFTDISDTPFSLGVVLSRGHGEYILLGNTS---VEEGLHDLLHPD-LALAGDWI-----
: .. : .: .:::.:: .. . : .: : .. ..: :. . : .
CCDS63 YTWVPIRSTNYSLGLVLP-PYSTFYLQANLSDQILQVKYFEFLLPSSFESEGHVFIAPRE
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730 740
pF1KE5 YCITDIDPDHRKLSQLEAMIRFLTRKDPDL-ECDEELVREVLFDAVVTAPM-EAYWTALA
:: :.. . . :. .:... . :: .:.. :......:. .: . : :
CCDS63 YC-KDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWRDQD
690 700 710 720 730 740
750 760 770 780 790 800
pF1KE5 LNMSEESEHVVDMAFLGTRAGLLRSSLFVGSEKVSDRKFLTPEDEASVFTLDRFPLWYRQ
:: . . .: .: .:. : : .:... .:: . : . :.
CCDS63 LNT-----YSLLAVFAATDGGITR----VFPNKAAEDWTENPEPFNASF-------YRRS
750 760 770 780
810 820 830 840 850 860
pF1KE5 ASEHPAGSFVFNLRWAEG---P-ESAGEPMVVTASTAVAVTVDKRTAIAAAAGVQMKLEF
..: ..::. .. : : .. . . .:::: ... .:: :..::.. ::
CCDS63 LDNH---GYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLDLEA
790 800 810 820 830 840
870 880 890 900
pF1KE5 LQRKFWAATRQCSTVDGP--------CTQSCE--DSDLDCFVIDNNGFILISKRSRE---
.:: . . . . : : : ..:: . :: : .::..::...:.....
CCDS63 WAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQWDQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE5 TGRFLGEVDGAVLTQLLSMGVFSQVTMYDYQAMCKPSSHHHSAAQP---LVSPISAFL--
.:::..:::. .. : . . ... ::::: : :. . .: : .: .. ::
CCDS63 VGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVADFLNL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KE5 ----TATRWLLQELVLFLLEWSVWGSWYDRG-AEAKSVFHHSHKHKKQDPLQPCDTEYPV
.:. : : . .:. : .. ::.. :::.. : . .... : .
CCDS63 AWWTSAAAWSLFQQLLYGL---IYHSWFQADPAEAEG----SPETRESS----CVMKQTQ
970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE5 FVYQPAIREANGIVECGPCQKVFVVQQIPNSNLLLLVTD-PTCDCSIFPPVLQEATEVKY
. . . :.:..:: :...: .:.. :.:::..:.. : :. .::. :.
CCDS63 YYFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPA
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE5 NASVKCDRMRSQKLRRRPDSCHAFHPEENAQDCG-GASDTSASPPLLLLPVCAWGLLPQL
.. .:. .. . :: : : .. :...::: ::: :: :
CCDS63 DGPEQCELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGAS----FPPSLGVLVSLQLLLLLG
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE5 LR
CCDS63 LPPRPQPQVLVHASRRL
1130 1140
>>CCDS54588.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1150 aa)
initn: 1280 init1: 287 opt: 1532 Z-score: 1783.2 bits: 341.8 E(32554): 5.3e-93
Smith-Waterman score: 1589; 29.8% identity (59.7% similar) in 1187 aa overlap (3-1122:8-1120)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVCGCSALLPLPNPRPTMPATPNFLANPSSSSRWIPLQPMPVAWAFVQKTSALLW
:: : :.: : :. .:. ..: : . : ::
CCDS54 MAVPARTCGASR----PGPARTARPWPGCGPHPGPGTRR-PTSGPPRP----------LW
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LLL--LGTSLSPAWGQAKIPLE-TVKLWADTFGGDLYNTVTKYSGSLLLQKKYKDVESSL
::: : .:. . ..: . :.. :: . .. ... ..: :.. ::: .. .
CCDS54 LLLPLLPLLAAPGASAYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLF
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KE5 KIEEVDGLELVRKFSEDMENMLRRKVEAVQNLVEAAEEADLNHEFNESLVFD---YYNSV
...: . .::.: . :.:..: :::.:.. :..:::. . :...... . ::..
CCDS54 EVQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAK
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 LINERDE-KGNFVELGA-------EFLLESNAHFSNLPVNTSISSVQLPTNVYNKDPDIL
: :. ... :: :. .:. . : :.: :: : ..::.::..:. . ::
CCDS54 ADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFIEDPN--FKN-KVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVIL
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 NGVYMSEALNAVFVENFQRDPTLTWQYFGSATGFFRIYPGIKWTPDENGVITFDCRNRGW
: . .:::. ::.:: ..:::: :: :::::: : ::. : .. . .: : : :
CCDS54 NELNWTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKK-IDLYDVRRRPW
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 YIQAATSPKDIVILVDVSGSMKGLRMTIAKHTITTILDTLGENDFINIIAYNDYVHYIEP
:::.:.::::.::.::::::..:: . . : .. .::::...:..:. ..:. .. .
CCDS54 YIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVS-
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 CFKGILVQADRDNREHFKLLVEELMVKGVGVVDQALREAFQILKQFQEAKQGSLCNQAIM
:: ::::. :.. :: :. ...::. ... ::. :.. . .. . ::. ::
CCDS54 CFTH-LVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRAN--CNKMIM
350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 LISDGAVEDYEPVFEKYNWPDCKVRVFTYLIGREVSFADRMKWIACNNKGYYTQISTLAD
...::. . . ::::::::. :::::. .:.. . ..:.:: ::::: .: ...
CCDS54 MFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGA
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510
pF1KE5 TQENVMEYLHVLSRPMVI--NHDHDIIWTEAYMDSKLLSSQAQSLTLLTTVAMPVFSKKN
. :..::: ::.::::. .. ... ::..: : : .: :..: ..:::. .
CCDS54 IRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNVYED-------ALGLGLVVTGTLPVFNLTQ
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 E---TRSHGILLGVVGSDVALRELMKLAPRYKLGVHGYAFLNTNNGYILSHPDLRPLYRE
. ... ..:::.: :::: .. .:.: : ::..::.: :::.: ::.:.: .
CCDS54 DGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTN
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 GKKLKPKPNYNSVDLSEVEWEDQA-ESLRTAMINRETGTLSMDVKVPMDKGKRVLFLTND
.. : ..:. ..: ::. : .: .::. . : .. . : . . .: .
CCDS54 FRE--PV----TLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRN
580 590 600 610 620
640 650 660 670 680
pF1KE5 YFFTDISDTPFSLGVVLSRGHGEYILLGNTSVE--------EGLHD---LLHPDLALAGD
: .. : .: .:::.:: .. . : .: : . :.: :: .. :
CCDS54 YTWVPIRSTNYSLGLVLP-PYSTFYLQANLSDQILQVKLPISKLKDFEFLLPSSFESEGH
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730
pF1KE5 WI-----YCITDIDPDHRKLSQLEAMIRFLTRKDPDL-ECDEELVREVLFDAVVTAPM-E
. :: :.. . . :. .:... . :: .:.. :......:. .: . :
CCDS54 VFIAPREYC-KDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLLHNLILDTGITQQLVE
690 700 710 720 730 740
740 750 760 770 780 790
pF1KE5 AYWTALALNMSEESEHVVDMAFLGTRAGLLRSSLFVGSEKVSDRKFLTPEDEASVFTLDR
: :: . . .: .: .:. : : .:... .:: . :
CCDS54 RVWRDQDLNT-----YSLLAVFAATDGGITR----VFPNKAAEDWTENPEPFNASF----
750 760 770 780
800 810 820 830 840 850
pF1KE5 FPLWYRQASEHPAGSFVFNLRWAEG---P-ESAGEPMVVTASTAVAVTVDKRTAIAAAAG
. :. ..: ..::. .. : : .. . . .:::: ... .:: :..:
CCDS54 ---YRRSLDNH---GYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVG
790 800 810 820 830 840
860 870 880 890 900
pF1KE5 VQMKLEFLQRKFWAATRQCSTVDGP--------CTQSCE--DSDLDCFVIDNNGFILISK
:.. :: .:: . . . . : : : ..:: . :: : .::..::...:.
CCDS54 VKLDLEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950
pF1KE5 RSRE---TGRFLGEVDGAVLTQLLSMGVFSQVTMYDYQAMCKPSSHHHSAAQP---LVSP
.... .:::..:::. .. : . . ... ::::: : :. . .: : .:
CCDS54 QNHQWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPT
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE5 ISAFL------TATRWLLQELVLFLLEWSVWGSWYDRG-AEAKSVFHHSHKHKKQDPLQP
.. :: .:. : : . .:. : .. ::.. :::.. : . ....
CCDS54 VADFLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGL---IYHSWFQADPAEAEG----SPETRESS----
970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE5 CDTEYPVFVYQPAIREANGIVECGPCQKVFVVQQIPNSNLLLLVTD-PTCDCSIFPPVLQ
: . . . . :.:..:: :...: .:.. :.:::..:.. : :. .::
CCDS54 CVMKQTQYYFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQ
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE5 EATEVKYNASVKCDRMRSQKLRRRPDSCHAFHPEENAQDCG-GASDTSASPPLLLLPVCA
. :.. .. .:. .. . :: : : .. :...::: ::: :: :
CCDS54 K--ETHSDGPEQCELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGAS----FPPSLGVLVSL
1080 1090 1100 1110 1120
1130
pF1KE5 WGLLPQLLR
CCDS54 QLLLLLGLPPRPQPQVLVHASRRL
1130 1140 1150
>>CCDS33763.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1143 aa)
initn: 1243 init1: 287 opt: 1529 Z-score: 1779.7 bits: 341.2 E(32554): 8.3e-93
Smith-Waterman score: 1599; 29.8% identity (60.1% similar) in 1180 aa overlap (3-1122:8-1113)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVCGCSALLPLPNPRPTMPATPNFLANPSSSSRWIPLQPMPVAWAFVQKTSALLW
:: : :.: : :. .:. ..: : . : ::
CCDS33 MAVPARTCGASR----PGPARTARPWPGCGPHPGPGTRR-PTSGPPRP----------LW
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LLL--LGTSLSPAWGQAKIPLE-TVKLWADTFGGDLYNTVTKYSGSLLLQKKYKDVESSL
::: : .:. . ..: . :.. :: . .. ... ..: :.. ::: .. .
CCDS33 LLLPLLPLLAAPGASAYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLF
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KE5 KIEEVDGLELVRKFSEDMENMLRRKVEAVQNLVEAAEEADLNHEFNESLVFD---YYNSV
...: . .::.: . :.:..: :::.:.. :..:::. . :...... . ::..
CCDS33 EVQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAK
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 LINERDE-KGNFVELGA-------EFLLESNAHFSNLPVNTSISSVQLPTNVYNKDPDIL
: :. ... :: :. .:. . : :.: :: : ..::.::..:. . ::
CCDS33 ADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFIEDPN--FKN-KVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVIL
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 NGVYMSEALNAVFVENFQRDPTLTWQYFGSATGFFRIYPGIKWTPDENGVITFDCRNRGW
: . .:::. ::.:: ..:::: :: :::::: : ::. : .. . .: : : :
CCDS33 NELNWTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKK-IDLYDVRRRPW
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 YIQAATSPKDIVILVDVSGSMKGLRMTIAKHTITTILDTLGENDFINIIAYNDYVHYIEP
:::.:.::::.::.::::::..:: . . : .. .::::...:..:. ..:. .. .
CCDS33 YIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVS-
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 CFKGILVQADRDNREHFKLLVEELMVKGVGVVDQALREAFQILKQFQEAKQGSLCNQAIM
:: ::::. :.. :: :. ...::. ... ::. :.. . .. . ::. ::
CCDS33 CFTH-LVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRAN--CNKMIM
350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 LISDGAVEDYEPVFEKYNWPDCKVRVFTYLIGREVSFADRMKWIACNNKGYYTQISTLAD
...::. . . ::::::::. :::::. .:.. . ..:.:: ::::: .: ...
CCDS33 MFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGA
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510
pF1KE5 TQENVMEYLHVLSRPMVI--NHDHDIIWTEAYMDSKLLSSQAQSLTLLTTVAMPVFSKKN
. :..::: ::.::::. .. ... ::..: : : .: :..: ..:::. .
CCDS33 IRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNVYED-------ALGLGLVVTGTLPVFNLTQ
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 E---TRSHGILLGVVGSDVALRELMKLAPRYKLGVHGYAFLNTNNGYILSHPDLRPLYRE
. ... ..:::.: :::: .. .:.: : ::..::.: :::.: ::.:.: .
CCDS33 DGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTN
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 GKKLKPKPNYNSVDLSEVEWEDQA-ESLRTAMINRETGTLSMDVKVPMDKGKRVLFLTND
.. : ..:. ..: ::. : .: .::. . : .. . : . . .: .
CCDS33 FRE--PV----TLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRN
580 590 600 610 620
640 650 660 670 680
pF1KE5 YFFTDISDTPFSLGVVLSRGHGEYILLGNTS---VEEGLHDLLHPD-LALAGDWI-----
: .. : .: .:::.:: .. . : .: : .. ..: :. . : .
CCDS33 YTWVPIRSTNYSLGLVLP-PYSTFYLQANLSDQILQVKYFEFLLPSSFESEGHVFIAPRE
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730 740
pF1KE5 YCITDIDPDHRKLSQLEAMIRFLTRKDPDL-ECDEELVREVLFDAVVTAPM-EAYWTALA
:: :.. . . :. .:... . :: .:.. :......:. .: . : :
CCDS33 YC-KDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWRDQD
690 700 710 720 730 740
750 760 770 780 790 800
pF1KE5 LNMSEESEHVVDMAFLGTRAGLLRSSLFVGSEKVSDRKFLTPEDEASVFTLDRFPLWYRQ
:: . . .: .: .:. : : .:... .:: . : . :.
CCDS33 LNT-----YSLLAVFAATDGGITR----VFPNKAAEDWTENPEPFNASF-------YRRS
750 760 770 780
810 820 830 840 850 860
pF1KE5 ASEHPAGSFVFNLRWAEG---P-ESAGEPMVVTASTAVAVTVDKRTAIAAAAGVQMKLEF
..: ..::. .. : : .. . . .:::: ... .:: :..::.. ::
CCDS33 LDNH---GYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLDLEA
790 800 810 820 830 840
870 880 890 900
pF1KE5 LQRKFWAATRQCSTVDGP--------CTQSCE--DSDLDCFVIDNNGFILISKRSRE---
.:: . . . . : : : ..:: . :: : .::..::...:.....
CCDS33 WAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQWDQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE5 TGRFLGEVDGAVLTQLLSMGVFSQVTMYDYQAMCKPSSHHHSAAQP---LVSPISAFL--
.:::..:::. .. : . . ... ::::: : :. . .: : .: .. ::
CCDS33 VGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVADFLNL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KE5 ----TATRWLLQELVLFLLEWSVWGSWYDRG-AEAKSVFHHSHKHKKQDPLQPCDTEYPV
.:. : : . .:. : .. ::.. :::.. : . .... : .
CCDS33 AWWTSAAAWSLFQQLLYGL---IYHSWFQADPAEAEG----SPETRESS----CVMKQTQ
970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE5 FVYQPAIREANGIVECGPCQKVFVVQQIPNSNLLLLVTD-PTCDCSIFPPVLQEATEVKY
. . . :.:..:: :...: .:.. :.:::..:.. : :. .::. :..
CCDS33 YYFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQK--ETHS
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE5 NASVKCDRMRSQKLRRRPDSCHAFHPEENAQDCG-GASDTSASPPLLLLPVCAWGLLPQL
.. .:. .. . :: : : .. :...::: ::: :: :
CCDS33 DGPEQCELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGAS----FPPSLGVLVSLQLLLLLG
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE5 LR
CCDS33 LPPRPQPQVLVHASRRL
1130 1140
>>CCDS77748.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1076 aa)
initn: 1166 init1: 287 opt: 1512 Z-score: 1760.2 bits: 337.5 E(32554): 1e-91
Smith-Waterman score: 1579; 30.2% identity (61.2% similar) in 1100 aa overlap (80-1122:4-1046)
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 TSALLWLLLLGTSLSPAWGQAKIPLETVKLWADTFGGDLYNTVTKYSGSLLLQKKYKDVE
:: . .. ... ..: :.. ::: .
CCDS77 MQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNR
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 SSLKIEEVDGLELVRKFSEDMENMLRRKVEAVQNLVEAAEEADLNHEFNESLVFD---YY
. ....: . .::.: . :.:..: :::.:.. :..:::. . :...... . ::
CCDS77 NLFEVQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYY
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210
pF1KE5 NSVLINERDE-KGNFVELGA-------EFLLESNAHFSNLPVNTSISSVQLPTNVYNKDP
.. : :. ... :: :. .:. . : :.: :: : ..::.::..:. .
CCDS77 DAKADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFIEDPN--FKN-KVNYSYAAVQIPTDIYKGST
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 DILNGVYMSEALNAVFVENFQRDPTLTWQYFGSATGFFRIYPGIKWTPDENGVITFDCRN
::: . .:::. ::.:: ..:::: :: :::::: : ::. : .. . .: :
CCDS77 VILNELNWTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKK-IDLYDVRR
160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 RGWYIQAATSPKDIVILVDVSGSMKGLRMTIAKHTITTILDTLGENDFINIIAYNDYVHY
: ::::.:.::::.::.::::::..:: . . : .. .::::...:..:. ..:. ..
CCDS77 RPWYIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQP
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 IEPCFKGILVQADRDNREHFKLLVEELMVKGVGVVDQALREAFQILKQFQEAKQGSLCNQ
. :: ::::. :.. :: :. ...::. ... ::. :.. . .. . ::.
CCDS77 VS-CFTH-LVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRAN--CNK
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 AIMLISDGAVEDYEPVFEKYNWPDCKVRVFTYLIGREVSFADRMKWIACNNKGYYTQIST
::...::. . . ::::::::. :::::. .:.. . ..:.:: ::::: .: .
CCDS77 MIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPS
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 LADTQENVMEYLHVLSRPMVI--NHDHDIIWTEAYMDSKLLSSQAQSLTLLTTVAMPVFS
.. . :..::: ::.::::. .. ... ::..: : : .: :..: ..:::.
CCDS77 IGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNVYED-------ALGLGLVVTGTLPVFN
390 400 410 420 430
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 KKNE---TRSHGILLGVVGSDVALRELMKLAPRYKLGVHGYAFLNTNNGYILSHPDLRPL
.. ... ..:::.: :::: .. .:.: : ::..::.: :::.: ::.:.:
CCDS77 LTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQ
440 450 460 470 480 490
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 YREGKKLKPKPNYNSVDLSEVEWEDQA-ESLRTAMINRETGTLSMDVKVPMDKGKRVLFL
. .. : ..:. ..: ::. : .: .::. . : .. . : . . .
CCDS77 TTNFRE--PV----TLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQIRTLVKSLDERYIDEV
500 510 520 530 540 550
640 650 660 670 680
pF1KE5 TNDYFFTDISDTPFSLGVVLSRGHGEYILLGNTS---VEEGLHDLLHPD-LALAGDWI--
: .: .. : .: .:::.:: .. . : .: : .. ..: :. . : .
CCDS77 TRNYTWVPIRSTNYSLGLVLP-PYSTFYLQANLSDQILQVKYFEFLLPSSFESEGHVFIA
560 570 580 590 600 610
690 700 710 720 730 740
pF1KE5 ---YCITDIDPDHRKLSQLEAMIRFLTRKDPDL-ECDEELVREVLFDAVVTAPM-EAYWT
:: :.. . . :. .:... . :: .:.. :......:. .: . : :
CCDS77 PREYC-KDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWR
620 630 640 650 660 670
750 760 770 780 790 800
pF1KE5 ALALNMSEESEHVVDMAFLGTRAGLLRSSLFVGSEKVSDRKFLTPEDEASVFTLDRFPLW
:: . . .: .: .:. : : .:... .:: . : .
CCDS77 DQDLNT-----YSLLAVFAATDGGITR----VFPNKAAEDWTENPEPFNASF-------Y
680 690 700 710
810 820 830 840 850
pF1KE5 YRQASEHPAGSFVFNLRWAEG---P-ESAGEPMVVTASTAVAVTVDKRTAIAAAAGVQMK
:. ..: ..::. .. : : .. . . .:::: ... .:: :..::..
CCDS77 RRSLDNH---GYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLD
720 730 740 750 760 770
860 870 880 890 900
pF1KE5 LEFLQRKFWAATRQCSTVDGP--------CTQSCE--DSDLDCFVIDNNGFILISKRSRE
:: .:: . . . . : : : ..:: . :: : .::..::...:.....
CCDS77 LEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQ
780 790 800 810 820 830
910 920 930 940 950 960
pF1KE5 ---TGRFLGEVDGAVLTQLLSMGVFSQVTMYDYQAMCKPSSHHHSAAQP---LVSPISAF
.:::..:::. .. : . . ... ::::: : :. . .: : .: .. :
CCDS77 WDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVADF
840 850 860 870 880 890
970 980 990 1000 1010
pF1KE5 L------TATRWLLQELVLFLLEWSVWGSWYDRG-AEAKSVFHHSHKHKKQDPLQPCDTE
: .:. : : . .:. : .. ::.. :::.. : . .... : .
CCDS77 LNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGL---IYHSWFQADPAEAEG----SPETRESS----CVMK
900 910 920 930 940
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE5 YPVFVYQPAIREANGIVECGPCQKVFVVQQIPNSNLLLLVTD-PTCDCSIFPPVLQEATE
. . . :.:..:: :...: .:.. :.:::..:.. : :. .::. :.
CCDS77 QTQYYFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETH
950 960 970 980 990 1000
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE5 VKYNASVKCDRMRSQKLRRRPDSCHAFHPEENAQDCG-GASDTSASPPLLLLPVCAWGLL
.. .:. .. . :: : : .. :...::: ::: :: :
CCDS77 CPADGPEQCELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGAS----FPPSLGVLVSLQLLL
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE5 PQLLR
CCDS77 LLGLPPRPQPQVLVHASRRL
1060 1070
>>CCDS5598.1 CACNA2D1 gene_id:781|Hs108|chr7 (1091 aa)
initn: 1031 init1: 297 opt: 1291 Z-score: 1501.6 bits: 289.7 E(32554): 2.6e-77
Smith-Waterman score: 1452; 29.0% identity (59.0% similar) in 1129 aa overlap (50-1118:10-1068)
20 30 40 50 60 70
pF1KE5 ATPNFLANPSSSSRWIPLQPMPVAWAFVQKTSALLWLLLLGTSLSPAWGQAKIPLETVKL
: .:. ::.: : . .: :.:
CCDS55 MAAGCLLALTLTLFQSLLIGPSSEEPFPSAV----TIKS
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE5 WADTFGGDLYNTVTKYSGSLLLQKKYKDVESSLKIEEVDGLELVRKFSEDMENMLRRKVE
:.: . :: . . :: : :. .. .: .. .::. ..:.:..: . .
CCDS55 WVDKMQEDLVTLAKTASGVNQLVDIYEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSK
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 AVQNLVEAAEEADLNHEFNESLVFD---YYNSVLINERDEKGNFVELGAEFL---LESNA
:. :. ::... :.. :... . :::. .. : . : : :.. . . .:
CCDS55 ALVRLALEAEKVQAAHQWREDFASNEVVYYNAK--DDLDPEKNDSEPGSQRIKPVFIEDA
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 HFSNLPVNTSISSVQLPTNVYNKDPDILNGVYMSEALNAVFVENFQRDPTLTWQYFGSAT
.:. .. . ..:..::..:. . .:: . . ::. :: .: ..::.: :: :::::
CCDS55 NFGR-QISYQHAAVHIPTDIYEGSTIVLNELNWTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGSAT
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 GFFRIYPGIKWTPDE---NGVITFDCRNRGWYIQAATSPKDIVILVDVSGSMKGLRMTIA
:. : ::. :. . : . .: : : ::::.:.::::..::::::::..:: . .
CCDS55 GLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRRRPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLKLI
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 KHTITTILDTLGENDFINIIAYNDYVHYIEPCFKGILVQADRDNREHFKLLVEELMVKGV
. ... .:.::...::.:. ..:. .. . ::. ::::. :.. .: :... .::.
CCDS55 RTSVSEMLETLSDDDFVNVASFNSNAQDVS-CFQH-LVQANVRNKKVLKDAVNNITAKGI
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 GVVDQALREAFQILKQFQEAKQGSLCNQAIMLISDGAVEDYEPVFEKYNWPDCKVRVFTY
... ::. : ... .. . ::. :::..::. : . .:.::: : ::::::.
CCDS55 TDYKKGFSFAFEQLLNYNVSRAN--CNKIIMLFTDGGEERAQEIFNKYN-KDKKVRVFTF
340 350 360 370 380
440 450 460 470 480
pF1KE5 LIGREVSFADRMKWIACNNKGYYTQISTLADTQENVMEYLHVLSRPMVINHDH--DIIWT
.:.. ..:.::.::::: .: ... . :..::: ::.::::. :. .. ::
CCDS55 SVGQHNYDRGPIQWMACENKGYYYEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGDKAKQVQWT
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 EAYMDSKLLSSQAQSLTLLTTVAMPVFSK----KNETR-SHGILLGVVGSDVALRELMKL
..:.: : : :. : ..:::. .:.: .. ..:::.: ::.:... .:
CCDS55 NVYLD-------ALELGLVITGTLPVFNITGQFENKTNLKNQLILGVMGVDVSLEDIKRL
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 APRYKLGVHGYAFLNTNNGYILSHPDLRPLYREGKKLKPKPNYNSVDLSEVEWEDQAE-S
.::. : .:: : :::.: ::.:.: .. :. .: ..:. ..: :.. .
CCDS55 TPRFTLCPNGYYFAIDPNGYVLLHPNLQP--KNPKSQEPV----TLDFLDAELENDIKVE
510 520 530 540 550
610 620 630 640 650
pF1KE5 LRTAMINRETG--TLSMDVKVP----MDKGKRVLFLTNDYFFTDISDTPFSLGVVLSRGH
.:. ::. :.: :. :: .:::.:. : .: .. : .::..::
CCDS55 IRNKMIDGESGEKTFRTLVKSQDERYIDKGNRT------YTWTPVNGTDYSLALVLPTYS
560 570 580 590 600
660 670 680 690 700
pF1KE5 GEYI------LLGNTSVEEG-LHD--LLHPD-LALAG-DWI----YCITDIDPDHRKLSQ
:: . .. ..: ..: :.:: . .: .: :: .:. . .
CCDS55 FYYIKAKLEETITQARSKKGKMKDSETLKPDNFEESGYTFIAPRDYC-NDLKISDNNTEF
610 620 630 640 650 660
710 720 730 740 750
pF1KE5 LEAMIRFLTRKDPDLE-CDEELVREVLFDAVVTAPM-EAYWTALALNMSEESEHVVDMAF
: . .:. :: :. :. .:. .::.:: : . . ::. .... . : :
CCDS55 LLNFNEFIDRKTPNNPSCNADLINRVLLDAGFTNELVQNYWS------KQKNIKGVKARF
670 680 690 700 710 720
760 770 780 790 800 810
pF1KE5 LGTRAGLLRSSLFVGSEKVSDRKFLTPEDEASVFTLDRFPLWYRQASEHPAGSFVFNLRW
. : .:. : : ..... .:: . : :... .. :.
CCDS55 VVTDGGITR----VYPKEAGENWQENPETYEDSF--------YKRSLDNDNYVFTAPYFN
730 740 750 760
820 830 840 850 860 870
pF1KE5 AEGPESAGEPMVVTASTAVAVTVDKRTAIAAAAGVQMKLEFLQRKFWAATRQCSTVDGPC
:: .: : ... : :: . .. . :..:... .. : . ... ::
CCDS55 KSGP-GAYESGIMV-SKAVEIYIQGKLLKPAVVGIKIDVNS-----WIENFTKTSIRDPC
770 780 790 800 810 820
880 890 900 910 920 930
pF1KE5 TQS-CE---DSD-LDCFVIDNNGFILISKR---SRETGRFLGEVDGAVLTQLLSMGVFSQ
. :. .:: .:: ..:..::.:.... . . :::.::.: ... .:....:..
CCDS55 AGPVCDCKRNSDVMDCVILDDGGFLLMANHDDYTNQIGRFFGEIDPSLMRHLVNISVYAF
830 840 850 860 870 880
940 950 960 970 980
pF1KE5 VTMYDYQAMCKPSSH------HHSAAQPLVSPI---SAFLTATRW-LLQELVLFLLEWSV
::::..:.:.. :.:: : :. : . . ::. : .::...: :
CCDS55 NKSYDYQSVCEPGAAPKQGAGHRSAYVPSVADILQIGWWATAAAWSILQQFLLSLT----
890 900 910 920 930
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE5 WGSWYDRGAEAKSVFHHSHKHKKQDPLQPCDTEYPVFVYQPAIREANGIVECGPCQKVFV
. : :: : .. . : : :: . .. . .:...:: :...:
CCDS55 ----FPRLLEA--VEMEDDDFTASLSKQSCITEQTQYFFDNDSKSFSGVLDCGNCSRIFH
940 950 960 970 980 990
1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE5 VQQIPNSNLLLLVTDP--TCDCSIFPPVLQEATEVKYNASVKCDRMRSQKLRRRPDSCHA
... :.::...... :: :. . : : : :: ... . :. :: :
CCDS55 GEKLMNTNLIFIMVESKGTCPCDTRLLIQAEQTSDGPNP---CDMVKQPRYRKGPDVCFD
1000 1010 1020 1030 1040
1100 1110 1120 1130
pF1KE5 FHPEENAQDCGGASDTSASPPLLLLPVCAWGLLPQLLR
. :. ::::.: . :
CCDS55 NNVLEDYTDCGGVSGLNPSLWYIIGIQFLLLWLVSGSTHRLL
1050 1060 1070 1080 1090
>>CCDS78253.1 CACNA2D1 gene_id:781|Hs108|chr7 (309 aa)
initn: 372 init1: 196 opt: 500 Z-score: 584.3 bits: 118.1 E(32554): 3.2e-26
Smith-Waterman score: 500; 32.2% identity (63.7% similar) in 289 aa overlap (50-329:10-291)
20 30 40 50 60 70
pF1KE5 ATPNFLANPSSSSRWIPLQPMPVAWAFVQKTSALLWLLLLGTSLSPAWGQAKIPLETVKL
: .:. ::.: : . .: :.:
CCDS78 MAAGCLLALTLTLFQSLLIGPSSEEPFPSAV----TIKS
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE5 WADTFGGDLYNTVTKYSGSLLLQKKYKDVESSLKIEEVDGLELVRKFSEDMENMLRRKVE
:.: . :: . . :: : :. .. .: .. .::. ..:.:..: . .
CCDS78 WVDKMQEDLVTLAKTASGVNQLVDIYEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSK
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 AVQNLVEAAEEADLNHEFNESLVFD---YYNSVLINERDEKGNFVELGAEFL---LESNA
:. :. ::... :.. :... . :::. .. : . : : :.. . . .:
CCDS78 ALVRLALEAEKVQAAHQWREDFASNEVVYYNAK--DDLDPEKNDSEPGSQRIKPVFIEDA
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 HFSNLPVNTSISSVQLPTNVYNKDPDILNGVYMSEALNAVFVENFQRDPTLTWQYFGSAT
.:. .. . ..:..::..:. . .:: . . ::. :: .: ..::.: :: :::::
CCDS78 NFGR-QISYQHAAVHIPTDIYEGSTIVLNELNWTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGSAT
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 GFFRIYPGIKWTPDE---NGVITFDCRNRGWYIQAATSPKDIVILVDVSGSMKGLRMTIA
:. : ::. :. . : . .: : : ::::.:.::::..::::::::..:: . .
CCDS78 GLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRRRPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLKLI
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 KHTITTILDTLGENDFINIIAYNDYVHYIEPCFKGILVQADRDNREHFKLLVEELMVKGV
. ... .:.::...::.:.
CCDS78 RTSVSEMLETLSDDDFVNVASDSKEISPSPEEIFNAE
280 290 300
1137 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 03:59:03 2016 done: Tue Nov 8 03:59:04 2016
Total Scan time: 4.110 Total Display time: 0.400
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]