Result of FASTA (omim) for
pF1KE5297
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5297, 1137 aa
1>>>pF1KE5297 1137 - 1137 aa - 1137 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9989+/-0.00042; mu= 24.6131+/- 0.026
mean_var=70.1607+/-14.114, 0's: 0 Z-trim(110.3): 61 B-trim: 906 in 1/53
Lambda= 0.153118
statistics sampled from 18589 (18650) to 18589 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16
Scan time: 13.610
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_758952 (OMIM: 608171,610478) voltage-dependent (1137) 7636 1696.9 0
NP_060868 (OMIM: 606399) voltage-dependent calcium (1091) 4540 1013.0 0
XP_011532249 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep (1012) 4171 931.5 0
XP_005265375 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep (1085) 4061 907.2 0
XP_016862340 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 914) 3946 881.7 0
XP_011532250 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 819) 3505 784.3 0
XP_011519343 (OMIM: 608171,610478) PREDICTED: volt (1133) 3262 730.7 1.2e-209
XP_011532251 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 653) 2928 656.7 1.3e-187
XP_011532248 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep (1043) 2853 640.3 1.8e-182
XP_016862341 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 654) 2839 637.1 1.1e-181
XP_011532254 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 617) 2635 592.0 3.7e-168
XP_011532253 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 619) 2635 592.0 3.7e-168
XP_011532252 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 623) 2635 592.0 3.7e-168
XP_011532255 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 617) 2634 591.8 4.3e-168
XP_016862339 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep (1061) 2063 465.8 6.1e-130
XP_016862342 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 631) 2010 453.9 1.4e-126
XP_016862343 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 628) 2006 453.1 2.5e-126
XP_011532256 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 616) 1998 451.3 8.5e-126
XP_011532257 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 603) 1657 375.9 4e-103
NP_001005505 (OMIM: 607082) voltage-dependent calc (1145) 1539 350.1 4.5e-95
XP_011532545 (OMIM: 607082) PREDICTED: voltage-dep (1151) 1533 348.8 1.1e-94
NP_001167522 (OMIM: 607082) voltage-dependent calc (1150) 1532 348.5 1.3e-94
NP_006021 (OMIM: 607082) voltage-dependent calcium (1143) 1529 347.9 2.1e-94
XP_005265638 (OMIM: 607082) PREDICTED: voltage-dep (1144) 1528 347.7 2.4e-94
NP_001278030 (OMIM: 607082) voltage-dependent calc (1076) 1512 344.1 2.7e-93
NP_000713 (OMIM: 114204) voltage-dependent calcium (1091) 1291 295.3 1.4e-78
XP_005250627 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1103) 1285 294.0 3.4e-78
XP_011514874 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1098) 1267 290.0 5.4e-77
XP_011514873 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1105) 1260 288.4 1.6e-76
XP_016868077 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1052) 1257 287.8 2.4e-76
XP_005250630 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1084) 1111 255.5 1.3e-66
XP_005250629 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1086) 1044 240.7 3.6e-62
XP_005250631 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1079) 1043 240.5 4.2e-62
XP_006716181 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1110) 995 229.9 6.6e-59
XP_011514872 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1110) 995 229.9 6.6e-59
XP_006716182 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1085) 985 227.7 3e-58
XP_006716183 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1071) 961 222.4 1.2e-56
NP_001289819 (OMIM: 114204) voltage-dependent calc ( 309) 500 120.1 2.1e-26
XP_006716184 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep ( 580) 378 93.4 4.3e-18
NP_002207 (OMIM: 146640) inter-alpha-trypsin inhib ( 946) 204 55.1 2.3e-06
NP_001159908 (OMIM: 147270) inter-alpha-trypsin in ( 623) 194 52.8 7.9e-06
NP_001159907 (OMIM: 147270) inter-alpha-trypsin in ( 623) 194 52.8 7.9e-06
NP_001159906 (OMIM: 147270) inter-alpha-trypsin in ( 769) 194 52.8 9.2e-06
NP_002206 (OMIM: 147270) inter-alpha-trypsin inhib ( 911) 194 52.9 1.1e-05
NP_002208 (OMIM: 146650) inter-alpha-trypsin inhib ( 890) 192 52.5 1.4e-05
XP_005265162 (OMIM: 146650) PREDICTED: inter-alpha ( 927) 192 52.5 1.4e-05
NP_001159921 (OMIM: 143890,600564) inter-alpha-try ( 900) 187 51.4 3e-05
NP_002209 (OMIM: 143890,600564) inter-alpha-trypsi ( 930) 187 51.4 3.1e-05
NP_001001851 (OMIM: 609783) inter-alpha-trypsin in ( 702) 152 43.5 0.0053
NP_116206 (OMIM: 609783) inter-alpha-trypsin inhib ( 728) 152 43.5 0.0055
>>NP_758952 (OMIM: 608171,610478) voltage-dependent calc (1137 aa)
initn: 7636 init1: 7636 opt: 7636 Z-score: 9106.8 bits: 1696.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7636; 100.0% identity (100.0% similar) in 1137 aa overlap (1-1137:1-1137)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVCGCSALLPLPNPRPTMPATPNFLANPSSSSRWIPLQPMPVAWAFVQKTSALLWLLLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 MVCGCSALLPLPNPRPTMPATPNFLANPSSSSRWIPLQPMPVAWAFVQKTSALLWLLLLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 TSLSPAWGQAKIPLETVKLWADTFGGDLYNTVTKYSGSLLLQKKYKDVESSLKIEEVDGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 TSLSPAWGQAKIPLETVKLWADTFGGDLYNTVTKYSGSLLLQKKYKDVESSLKIEEVDGL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ELVRKFSEDMENMLRRKVEAVQNLVEAAEEADLNHEFNESLVFDYYNSVLINERDEKGNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 ELVRKFSEDMENMLRRKVEAVQNLVEAAEEADLNHEFNESLVFDYYNSVLINERDEKGNF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VELGAEFLLESNAHFSNLPVNTSISSVQLPTNVYNKDPDILNGVYMSEALNAVFVENFQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 VELGAEFLLESNAHFSNLPVNTSISSVQLPTNVYNKDPDILNGVYMSEALNAVFVENFQR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 DPTLTWQYFGSATGFFRIYPGIKWTPDENGVITFDCRNRGWYIQAATSPKDIVILVDVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 DPTLTWQYFGSATGFFRIYPGIKWTPDENGVITFDCRNRGWYIQAATSPKDIVILVDVSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 SMKGLRMTIAKHTITTILDTLGENDFINIIAYNDYVHYIEPCFKGILVQADRDNREHFKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 SMKGLRMTIAKHTITTILDTLGENDFINIIAYNDYVHYIEPCFKGILVQADRDNREHFKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 LVEELMVKGVGVVDQALREAFQILKQFQEAKQGSLCNQAIMLISDGAVEDYEPVFEKYNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 LVEELMVKGVGVVDQALREAFQILKQFQEAKQGSLCNQAIMLISDGAVEDYEPVFEKYNW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 PDCKVRVFTYLIGREVSFADRMKWIACNNKGYYTQISTLADTQENVMEYLHVLSRPMVIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 PDCKVRVFTYLIGREVSFADRMKWIACNNKGYYTQISTLADTQENVMEYLHVLSRPMVIN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 HDHDIIWTEAYMDSKLLSSQAQSLTLLTTVAMPVFSKKNETRSHGILLGVVGSDVALREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 HDHDIIWTEAYMDSKLLSSQAQSLTLLTTVAMPVFSKKNETRSHGILLGVVGSDVALREL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 MKLAPRYKLGVHGYAFLNTNNGYILSHPDLRPLYREGKKLKPKPNYNSVDLSEVEWEDQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 MKLAPRYKLGVHGYAFLNTNNGYILSHPDLRPLYREGKKLKPKPNYNSVDLSEVEWEDQA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 ESLRTAMINRETGTLSMDVKVPMDKGKRVLFLTNDYFFTDISDTPFSLGVVLSRGHGEYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 ESLRTAMINRETGTLSMDVKVPMDKGKRVLFLTNDYFFTDISDTPFSLGVVLSRGHGEYI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 LLGNTSVEEGLHDLLHPDLALAGDWIYCITDIDPDHRKLSQLEAMIRFLTRKDPDLECDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 LLGNTSVEEGLHDLLHPDLALAGDWIYCITDIDPDHRKLSQLEAMIRFLTRKDPDLECDE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 ELVREVLFDAVVTAPMEAYWTALALNMSEESEHVVDMAFLGTRAGLLRSSLFVGSEKVSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 ELVREVLFDAVVTAPMEAYWTALALNMSEESEHVVDMAFLGTRAGLLRSSLFVGSEKVSD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE5 RKFLTPEDEASVFTLDRFPLWYRQASEHPAGSFVFNLRWAEGPESAGEPMVVTASTAVAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 RKFLTPEDEASVFTLDRFPLWYRQASEHPAGSFVFNLRWAEGPESAGEPMVVTASTAVAV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE5 TVDKRTAIAAAAGVQMKLEFLQRKFWAATRQCSTVDGPCTQSCEDSDLDCFVIDNNGFIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 TVDKRTAIAAAAGVQMKLEFLQRKFWAATRQCSTVDGPCTQSCEDSDLDCFVIDNNGFIL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE5 ISKRSRETGRFLGEVDGAVLTQLLSMGVFSQVTMYDYQAMCKPSSHHHSAAQPLVSPISA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 ISKRSRETGRFLGEVDGAVLTQLLSMGVFSQVTMYDYQAMCKPSSHHHSAAQPLVSPISA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE5 FLTATRWLLQELVLFLLEWSVWGSWYDRGAEAKSVFHHSHKHKKQDPLQPCDTEYPVFVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 FLTATRWLLQELVLFLLEWSVWGSWYDRGAEAKSVFHHSHKHKKQDPLQPCDTEYPVFVY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE5 QPAIREANGIVECGPCQKVFVVQQIPNSNLLLLVTDPTCDCSIFPPVLQEATEVKYNASV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 QPAIREANGIVECGPCQKVFVVQQIPNSNLLLLVTDPTCDCSIFPPVLQEATEVKYNASV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE5 KCDRMRSQKLRRRPDSCHAFHPEENAQDCGGASDTSASPPLLLLPVCAWGLLPQLLR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 KCDRMRSQKLRRRPDSCHAFHPEENAQDCGGASDTSASPPLLLLPVCAWGLLPQLLR
1090 1100 1110 1120 1130
>>NP_060868 (OMIM: 606399) voltage-dependent calcium cha (1091 aa)
initn: 4149 init1: 2061 opt: 4540 Z-score: 5410.8 bits: 1013.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4540; 59.8% identity (85.3% similar) in 1083 aa overlap (51-1126:15-1084)
30 40 50 60 70
pF1KE5 TPNFLANPSSSSRWIPLQPMPVAWAFVQKTSALLWLLLLGTSLSPAW-GQAKIPLETVKL
:::: :: ..:. . .. .::: .:::
NP_060 MAGPGSPRRASRGASALLAAALLYAALGDVVRSEQQIPLSVVKL
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KE5 WADTFGGDLYNTVTKYSGSLLLQKKYKDVESSLKIEEVDGLELVRKFSEDMENMLRRKVE
::..:::.. . ..::::: :::::::. :... :::.:::.::.:....::.:...: :
NP_060 WASAFGGEIKSIAAKYSGSQLLQKKYKEYEKDVAIEEIDGLQLVKKLAKNMEEMFHKKSE
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 AVQNLVEAAEEADLNHEFNESLVFDYYNSVLINERDEKGNFVELGAEFLLESNAHFSNLP
::. :::::::: :.:::. .: ..:.:.:::::::. :::.::: ::.: : ::.:::
NP_060 AVRRLVEAAEEAHLKHEFDADLQYEYFNAVLINERDKDGNFLELGKEFILAPNDHFNNLP
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 VNTSISSVQLPTNVYNKDPDILNGVYMSEALNAVFVENFQRDPTLTWQYFGSATGFFRIY
:: :.:.::.:::.::::: :.:::: ::.:: :::.::.:::.: ::::::: :::: :
NP_060 VNISLSDVQVPTNMYNKDPAIVNGVYWSESLNKVFVDNFDRDPSLIWQYFGSAKGFFRQY
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 PGIKWTPDENGVITFDCRNRGWYIQAATSPKDIVILVDVSGSMKGLRMTIAKHTITTILD
::::: :::::::.:::::: :::::::::::.::::::::::::::.::::.:...:::
NP_060 PGIKWEPDENGVIAFDCRNRKWYIQAATSPKDVVILVDVSGSMKGLRLTIAKQTVSSILD
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 TLGENDFINIIAYNDYVHYIEPCFKGILVQADRDNREHFKLLVEELMVKGVGVVDQALRE
:::..::.::::::. .::.:::..: :::::: :.:::. ...:..::.:..: :: :
NP_060 TLGDDDFFNIIAYNEELHYVEPCLNGTLVQADRTNKEHFREHLDKLFAKGIGMLDIALNE
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 AFQILKQFQEAKQGSLCNQAIMLISDGAVEDYEPVFEKYNWPDCKVRVFTYLIGREVSFA
::.::..:... :::.:.::::::.::::. :. .: :::::: :::.::::::::..::
NP_060 AFNILSDFNHTGQGSICSQAIMLITDGAVDTYDTIFAKYNWPDRKVRIFTYLIGREAAFA
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470 480 490
pF1KE5 DRMKWIACNNKGYYTQISTLADTQENVMEYLHVLSRPMVINHDHDIIWTEAYMDSKLLSS
: .::.:: :::..::::::::.:::::::::::::: ::...::..:::::.:: :
NP_060 DNLKWMACANKGFFTQISTLADVQENVMEYLHVLSRPKVIDQEHDVVWTEAYIDSTL--P
410 420 430 440 450 460
500 510 520 530 540 550
pF1KE5 QAQSLT------LLTTVAMPVFSKKNETRSHGILLGVVGSDVALRELMKLAPRYKLGVHG
:::.:: :.::::::::::.:::::.::::::::.:: ..::.: :.::::.::
NP_060 QAQKLTDDQGPVLMTTVAMPVFSKQNETRSKGILLGVVGTDVPVKELLKTIPKYKLGIHG
470 480 490 500 510 520
560 570 580 590 600 610
pF1KE5 YAFLNTNNGYILSHPDLRPLYREGKKLKPKPNYNSVDLSEVEWEDQAESLRTAMINRETG
::: :::::::.::.:: ::.:::: . ::::.:::::::::::. . ::.::.::.::
NP_060 YAFAITNNGYILTHPELRLLYEEGKKRR-KPNYSSVDLSEVEWEDRDDVLRNAMVNRKTG
530 540 550 560 570 580
620 630 640 650 660 670
pF1KE5 TLSMDVKVPMDKGKRVLFLTNDYFFTDISDTPFSLGVVLSRGHGEYILLGNTSVEEGLHD
.::.:: .::::::: .::::..:::. :::::::.::::::.:.. ::...::::::
NP_060 KFSMEVKKTVDKGKRVLVMTNDYYYTDIKGTPFSLGVALSRGHGKYFFRGNVTIEEGLHD
590 600 610 620 630 640
680 690 700 710 720 730
pF1KE5 LLHPDLALAGDWIYCITDIDPDHRKLSQLEAMIRFLTRKDPDLECDEELVREVLFDAVVT
: :::..:: .: :: ::. :.::.::::::. .: :.: :.::.::..::::::::.
NP_060 LEHPDVSLADEWSYCNTDLHPEHRHLSQLEAIKLYLKGKEPLLQCDKELIQEVLFDAVVS
650 660 670 680 690 700
740 750 760 770 780 790
pF1KE5 APMEAYWTALALNMSEESEHVVDMAFLGTRAGLLRSSLFVGSEKVSDRKFLTPEDEASVF
::.:::::.:::: ::.:.. :..::::::.:: : .::::.:..... :: :. ..:
NP_060 APIEAYWTSLALNKSENSDKGVEVAFLGTRTGLSRINLFVGAEQLTNQDFLKAGDKENIF
710 720 730 740 750 760
800 810 820 830 840 850
pF1KE5 TLDRFPLWYRQASEHPAGSFVFNLRWAEGPESAGEPMVVTASTAVAVTVDKRTAIAAAAG
. :.::::::.:.:. ::::... .. :: ... ::::::.. . .... ..::.:
NP_060 NADHFPLWYRRAAEQIPGSFVYSIPFSTGP--VNKSNVVTASTSIQLLDERKSPVVAAVG
770 780 790 800 810
860 870 880 890 900 910
pF1KE5 VQMKLEFLQRKFWAATRQCSTVDGPCTQSCEDSDLDCFVIDNNGFILISKRSRETGRFLG
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pF1KE5 KVSDRKFLTPEDEASVFTLDRFPLWYRQASEHPAGSFVFNLRWAEGPESAGEPMVVTAST
..... :: :. ..:. :.::::::.:.:. ::::... .. :: ... ::::::
XP_016 QLTNQDFLKAGDKENIFNADHFPLWYRRAAEQIPGSFVYSIPFSTGP--VNKSNVVTAST
570 580 590 600 610 620
840 850 860 870 880 890
pF1KE5 AVAVTVDKRTAIAAAAGVQMKLEFLQRKFWAATRQCSTVDGPCTQSCEDSDLDCFVIDNN
.. . .... ..::.:.::::::.:::::.:.:::...:: :. ::.: ..:..::::
XP_016 SIQLLDERKSPVVAAVGIQMKLEFFQRKFWTASRQCASLDGKCSISCDDETVNCYLIDNN
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pF1KE5 GFILISKRSRETGRFLGEVDGAVLTQLLSMGVFSQVTMYDYQAMCKPSSHHHSAAQPLVS
::::.:. .:: :.::..:::...::.:: :...:.:::::::. ... ..:. :..
XP_016 GFILVSEDYTQTGDFFGEIEGAVMNKLLTMGSFKRITLYDYQAMCRANKESSDGAHGLLD
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pF1KE5 PISAFLTATRWLLQELVLFLLEWSVWGSWYDRGAEAKSVFHHSHKHKKQDPLQPCDTEYP
: .:::.:..:.. ::::::.:... ::. ::. .: .. :.:::::::
XP_016 PYNAFLSAVKWIMTELVLFLVEFNL-CSWWHSDMTAKA-------QKLKQTLEPCDTEYP
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pF1KE5 VFVYQPAIREANGIVECGPCQKVFVVQQIPNSNLLLLVTDPTCDCSIFPPVLQEATEVKY
.:: . .:.:..: . : :.: ::.::::.:::...:.: .: : :. . :..:
XP_016 AFVSERTIKETTGNIACEDCSKSFVIQQIPSSNLFMVVVDSSCLCESVAPITMAPIEIRY
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pF1KE5 NASVKCDRMRSQKLRRRPDSCHAFHPEENAQDCGGASDTSASPPLLLLPVCAWGLLPQLL
: :.::.:...::.::::.:::.:::::::..:::: . .:. :::::.
XP_016 NESLKCERLKAQKIRRRPESCHGFHPEENARECGGAPSLQAQTVLLLLPLLLMLFSR
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pF1KE5 R
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pF1KE5 TPNFLANPSSSSRWIPLQPMPVAWAFVQKTSALLWLLLLGTSLSPAW-GQAKIPLETVKL
:::: :: ..:. . .. .::: .:::
XP_011 MAGPGSPRRASRGASALLAAALLYAALGDVVRSEQQIPLSVVKL
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pF1KE5 WADTFGGDLYNTVTKYSGSLLLQKKYKDVESSLKIEEVDGLELVRKFSEDMENMLRRKVE
::..:::.. . ..::::: :::::::. :... :::.:::.::.:....::.:...: :
XP_011 WASAFGGEIKSIAAKYSGSQLLQKKYKEYEKDVAIEEIDGLQLVKKLAKNMEEMFHKKSE
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pF1KE5 AVQNLVEAAEEADLNHEFNESLVFDYYNSVLINERDEKGNFVELGAEFLLESNAHFSNLP
::. :::::::: :.:::. .: ..:.:.:::::::. :::.::: ::.: : ::.:::
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:: :.:.::.:::.::::: :.:::: ::.:: :::.::.:::.: ::::::: :::: :
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::::: :::::::.:::::: :::::::::::.::::::::::::::.::::.:...:::
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:::..::.::::::. .::.:::..: :::::: :.:::. ...:..::.:..: :: :
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::.::..:... :::.:.::::::.::::. :. .: :::::: :::.::::::::..::
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: .::.:: :::..::::::::.:::::::::::::: ::...::..:::::.:: :
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:::.:: :.::::::::::.:::::.::::::::.:: ..::.: :.::::.::
XP_011 QAQKLTDDQGPVLMTTVAMPVFSKQNETRSKGILLGVVGTDVPVKELLKTIPKYKLGIHG
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::: :::::::.::.:: ::.:::: . ::::.:::::::::::. . ::.::.::.::
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pF1KE5 LLHPDLALAGDWIYCITDIDPDHRKLSQLEAMIRFLTRKDPDLECDEELVREVLFDAVVT
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XP_011 APIEAYWTSLALNKSENSDKGVEVAFLGTRTGLSRINLFVGAEQLTNQDFLKAGDKENIF
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. :.::::::.:.:. ::::... .. :: ... ::::::.. . .... ..::.
XP_011 NADHFPLWYRRAAEQIPGSFVYSIPFSTGP--VNKSNVVTASTSIQLLDERKSPVVAASH
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pF1KE5 VQMKLEFLQRKFWAATRQCSTVDGPCTQSCEDSDLDCFVIDNNGFILISKRSRETGRFLG
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XP_011 MVCGCSALLPLPNPRPTMPATPNFLANPSSSSRWIPLQPMPVAWAFVQKTSALLWLLLLG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TSLSPAWGQAKIPLETVKLWADTFGGDLYNTVTKYSGSLLLQKKYKDVESSLKIEEVDGL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VINHDHDIIWTEAYMDSKLLSSQAQSLTLLTTVAMPVFSKKNETRSHGILLGVVGSDVAL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CDEELVREVLFDAVVTAPMEAYWTALALNMSEESEHVVDMAFLGTRAGLLRSSLFVGSEK
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pF1KE5 VSDRKFLTPEDEASVFTLDRFPLWYRQASEHPAGSFVFNLRWAEGPESAGEPMVVTASTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSDRKFLTPEDEASVFTLDRFPLWYRQASEHPAGSFVFNLRWAEGPESAGEPMVVTASTA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VAVTVDKRTAIAAAAGVQMKLEFLQRKFWAATRQCSTVDGPCTQSCEDSDLDCFVIDNNG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FILISKRSRETGRFLGEVDGAVLTQLLSMGVFSQVTMYDYQAMCKPSSHHHSAAQPLVSP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISAFLTATRWLLQELVLFLLEWSVWGSWYDRGAEAKSVFHHSHKHKKQDPLQPCDTEYPV
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pF1KE5 FVYQPAIREANGIVECGPCQKVFVVQQIPNSNLLLLVTDPTCDCSIFPPVLQEATEVKYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FVYQPAIREANGIVECGPCQKVFVVQQIPNSNLLLLVTDPTCDCSIFPPVLQEATEVKYN
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:::::::::::::::::::::::::: .. : : :. .: .: : : .:
XP_011 ASVKCDRMRSQKLRRRPDSCHAFHPEVRVEADRGWAGFSSPNP--LCLGLCPCRQEHIGM
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pF1KE5 R
XP_011 PMNTPVPVLLGGNIRVYAL
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pF1KE5 TPNFLANPSSSSRWIPLQPMPVAWAFVQKTSALLWLLLLGTSLSPAW-GQAKIPLETVKL
:::: :: ..:. . .. .::: .:::
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pF1KE5 WADTFGGDLYNTVTKYSGSLLLQKKYKDVESSLKIEEVDGLELVRKFSEDMENMLRRKVE
::..:::.. . ..::::: :::::::. :... :::.:::.::.:....::.:...: :
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pF1KE5 AVQNLVEAAEEADLNHEFNESLVFDYYNSVLINERDEKGNFVELGAEFLLESNAHFSNLP
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XP_011 AVRRLVEAAEEAHLKHEFDADLQYEYFNAVLINERDKDGNFLELGKEFILAPNDHFNNLP
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XP_011 VNISLSDVQVPTNMYNKDPAIVNGVYWSESLNKVFVDNFDRDPSLIWQYFGSAKGFFRQY
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pF1KE5 PGIKWTPDENGVITFDCRNRGWYIQAATSPKDIVILVDVSGSMKGLRMTIAKHTITTILD
::::: :::::::.:::::: :::::::::::.::::::::::::::.::::.:...:::
XP_011 PGIKWEPDENGVIAFDCRNRKWYIQAATSPKDVVILVDVSGSMKGLRLTIAKQTVSSILD
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pF1KE5 TLGENDFINIIAYNDYVHYIEPCFKGILVQADRDNREHFKLLVEELMVKGVGVVDQALRE
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XP_011 AFNILSDFNHTGQGSICSQAIMLITDGAVDTYDTIFAKYNWPDRKVRIFTYLIGREAAFA
350 360 370 380 390 400
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pF1KE5 DRMKWIACNNKGYYTQISTLADTQENVMEYLHVLSRPMVINHDHDIIWTEAYMDSKLLSS
: .::.:: :::..::::::::.:::::::::::::: ::...::..:::::.:: :
XP_011 DNLKWMACANKGFFTQISTLADVQENVMEYLHVLSRPKVIDQEHDVVWTEAYIDSTL--P
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XP_011 YAFAITNNGYILTHPELRLLYEEGKK-RRKPNYSSVDLSEVEWEDRDDVLRNAMVNRKTG
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.::.:: .::::::: .::::..:::. :::::::.::::::.:.. ::...::::::
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: :::..:: .:
XP_011 LEHPDVSLADEW
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initn: 3891 init1: 2061 opt: 2853 Z-score: 3397.1 bits: 640.3 E(85289): 1.8e-182
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30 40 50 60 70
pF1KE5 TPNFLANPSSSSRWIPLQPMPVAWAFVQKTSALLWLLLLGTSLSPAW-GQAKIPLETVKL
:::: :: ..:. . .. .::: .:::
XP_011 MAGPGSPRRASRGASALLAAALLYAALGDVVRSEQQIPLSVVKL
10 20 30 40
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]