FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5408, 336 aa 1>>>pF1KE5408 336 - 336 aa - 336 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6610+/-0.000921; mu= 14.1459+/- 0.055 mean_var=73.1372+/-15.294, 0's: 0 Z-trim(105.7): 42 B-trim: 88 in 1/48 Lambda= 0.149970 statistics sampled from 8635 (8675) to 8635 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16 Scan time: 1.230 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS1599.1 KCNK1 gene_id:3775|Hs109|chr1 ( 336) 2238 493.6 9.8e-140 CCDS12513.1 KCNK6 gene_id:9424|Hs109|chr19 ( 313) 807 184.0 1.5e-46 CCDS31608.1 KCNK7 gene_id:10089|Hs109|chr11 ( 307) 696 159.9 2.4e-39 CCDS8106.1 KCNK7 gene_id:10089|Hs109|chr11 ( 252) 583 135.5 4.7e-32 CCDS41673.1 KCNK7 gene_id:10089|Hs109|chr11 ( 257) 583 135.5 4.8e-32 CCDS9880.1 KCNK10 gene_id:54207|Hs109|chr14 ( 538) 523 122.6 7.3e-28 CCDS9882.1 KCNK10 gene_id:54207|Hs109|chr14 ( 543) 523 122.6 7.4e-28 CCDS9881.1 KCNK10 gene_id:54207|Hs109|chr14 ( 543) 523 122.6 7.4e-28 CCDS47422.1 KCNK16 gene_id:83795|Hs109|chr6 ( 294) 517 121.2 1.1e-27 CCDS4843.1 KCNK16 gene_id:83795|Hs109|chr6 ( 309) 517 121.2 1.1e-27 CCDS8067.1 KCNK4 gene_id:50801|Hs109|chr11 ( 393) 504 118.5 9.7e-27 CCDS31024.1 KCNK2 gene_id:3776|Hs109|chr1 ( 411) 504 118.5 1e-26 CCDS41466.1 KCNK2 gene_id:3776|Hs109|chr1 ( 422) 504 118.5 1e-26 CCDS41467.1 KCNK2 gene_id:3776|Hs109|chr1 ( 426) 504 118.5 1e-26 CCDS47421.1 KCNK16 gene_id:83795|Hs109|chr6 ( 322) 488 115.0 9e-26 CCDS47420.1 KCNK16 gene_id:83795|Hs109|chr6 ( 262) 484 114.0 1.4e-25 CCDS4841.1 KCNK5 gene_id:8645|Hs109|chr6 ( 499) 468 110.7 2.6e-24 CCDS4842.1 KCNK17 gene_id:89822|Hs109|chr6 ( 332) 417 99.6 3.9e-21 CCDS87391.1 KCNK16 gene_id:83795|Hs109|chr6 ( 197) 376 90.6 1.2e-18 CCDS1727.1 KCNK3 gene_id:3777|Hs109|chr2 ( 394) 379 91.4 1.3e-18 CCDS47419.1 KCNK17 gene_id:89822|Hs109|chr6 ( 271) 372 89.8 2.8e-18 CCDS6377.1 KCNK9 gene_id:51305|Hs109|chr8 ( 374) 366 88.6 9e-18 CCDS13337.1 KCNK15 gene_id:60598|Hs109|chr20 ( 330) 342 83.4 3e-16 CCDS9889.1 KCNK13 gene_id:56659|Hs109|chr14 ( 408) 273 68.5 1.1e-11 >>CCDS1599.1 KCNK1 gene_id:3775|Hs109|chr1 (336 aa) initn: 2238 init1: 2238 opt: 2238 Z-score: 2622.4 bits: 493.6 E(33420): 9.8e-140 Smith-Waterman score: 2238; 100.0% identity (100.0% similar) in 336 aa overlap (1-336:1-336) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLQSLAGSSCVRLVERHRSAWCFGFLVLGYLLYLVFGAVVFSSVELPYEDLLRQELRKLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS15 MLQSLAGSSCVRLVERHRSAWCFGFLVLGYLLYLVFGAVVFSSVELPYEDLLRQELRKLK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 RRFLEEHECLSEQQLEQFLGRVLEASNYGVSVLSNASGNWNWDFTSALFFASTVLSTTGY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS15 RRFLEEHECLSEQQLEQFLGRVLEASNYGVSVLSNASGNWNWDFTSALFFASTVLSTTGY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 GHTVPLSDGGKAFCIIYSVIGIPFTLLFLTAVVQRITVHVTRRPVLYFHIRWGFSKQVVA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS15 GHTVPLSDGGKAFCIIYSVIGIPFTLLFLTAVVQRITVHVTRRPVLYFHIRWGFSKQVVA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 IVHAVLLGFVTVSCFFFIPAAVFSVLEDDWNFLESFYFCFISLSTIGLGDYVPGEGYNQK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS15 IVHAVLLGFVTVSCFFFIPAAVFSVLEDDWNFLESFYFCFISLSTIGLGDYVPGEGYNQK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FRELYKIGITCYLLLGLIAMLVVLETFCELHELKKFRKMFYVKKDKDEDQVHIIEHDQLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS15 FRELYKIGITCYLLLGLIAMLVVLETFCELHELKKFRKMFYVKKDKDEDQVHIIEHDQLS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 FSSITDQAAGMKEDQKQNEPFVATQSSACVDGPANH :::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS15 FSSITDQAAGMKEDQKQNEPFVATQSSACVDGPANH 310 320 330 >>CCDS12513.1 KCNK6 gene_id:9424|Hs109|chr19 (313 aa) initn: 874 init1: 645 opt: 807 Z-score: 949.6 bits: 184.0 E(33420): 1.5e-46 Smith-Waterman score: 833; 45.5% identity (73.5% similar) in 310 aa overlap (18-309:3-310) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLQSLAGSSCVRLVERHRSAWCFGFLVLGYLLYLVFGAVVFSSVELPYEDLLRQELRKLK :.: : :. .: :::.::.. . .: :.: :: ::. :. 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CCDS12 TTVGYGYTTPLTDAGKAFSIAFALLGVPTTMLLLTASAQRLSLLLTHVPLSWLSMRWGWD 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 KQVVAIVHAV-LLGFVTVSCFFFIPAAVFSVLEDDWNFLESFYFCFISLSTIGLGDYVPG . .: : : ::: :.. ::. .::..:. ::. :.::..::::::::::::::::::: CCDS12 PRRAACWHLVALLGVVVTVCFL-VPAVIFAHLEEAWSFLDAFYFCFISLSTIGLGDYVPG 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 pF1KE5 EGYNQKFRELYKIGITCYLLLGLIAMLVVLETFCELHELKKFRKMFYVKK------DKDE :. .: .: :::. .: ::.:::.::..::.:: .. .:. . ... . . :: CCDS12 EAPGQPYRALYKVLVTVYLFLGLVAMVLVLQTFRHVSDLHGLTELILLPPPCPASFNADE 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 D-QVHII-----EHDQLSFSSITDQAAGMKEDQKQNEPFVATQSSACVDGPANH : .: :. :.::: :: :: :. 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CCDS31 AALLQAVALGLLVASSFVLLPALVLWGLQGDCSLLGAVYFCFSSLSTIGLEDLLPGRGRS 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 QK--FRELYKIGITCYLLLGLIAMLVVLETFCELHELKKFRKMFYVKKD-KDEDQVHIIE . . .: .... ::::::.:::...::: :: ... . :.: . ::: :. 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CCDS98 SSRATVVARMEGTSQGGLQTVMKWKTVVAIFVVV--VVYLVTGGLVFRALEQPFESSQKN 50 60 70 80 90 100 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 ELRKLKRRFLEEHECLSEQQLEQFLGRVLEASNYGVSVLSNASGNWN-WDFTSALFFAST . : .::..: :.: :.:: .. ..:.:.: ::: ..:.:.: . ::. ::.:::.: CCDS98 TIALEKAEFLRDHVCVSPQELETLIQHALDADNAGVSPIGNSSNNSSHWDLGSAFFFAGT 110 120 130 140 150 160 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 VLSTTGYGHTVPLSDGGKAFCIIYSVIGIPFTLLFLTAVVQRITVHVTRRPVLYFHI--R :..: :::. .: ..::: :::.:...:::. ..:... ... . . . .. . CCDS98 VITTIGYGNIAPSTEGGKIFCILYAIFGIPLFGFLLAGIGDQLGTIFGKSIARVEKVFRK 170 180 190 200 210 220 180 190 200 210 220 pF1KE5 WGFSKQVVAIVHAVLLGFVTVSCFFF--IPAAVFSVLEDDWNFLESFYFCFISLSTIGLG :. . .. ..: :. ..:. : :::..:. .: :. :::.:: ..:.:.:.: CCDS98 KQVSQTKIRVISTIL--FILAGCIVFVTIPAVIFKYIEG-WTALESIYFVVVTLTTVGFG 230 240 250 260 270 280 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 DYVPGEGYNQKFRELYKIGITCYLLLGLIAMLVVLETFCELHELKKFRKMFYVKKDKDED :.: : . . ..:: :: . ..:.:: . .:: CCDS98 DFVAGGNAGINYREWYKPLVWFWILVGLAYFAAVLSMIGDWLRVLSKKTKEEVGEIKAHA 290 300 310 320 330 340 290 300 310 320 330 pF1KE5 QVHIIEHDQLSFSSITDQAAGMKEDQKQNEPFVATQSSACVDGPANH CCDS98 AEWKANVTAEFRETRRRLSVEIHDKLQRAATIRSMERRRLGLDQRAHSLDMLSPEKRSVF 350 360 370 380 390 400 >>CCDS9882.1 KCNK10 gene_id:54207|Hs109|chr14 (543 aa) initn: 488 init1: 193 opt: 523 Z-score: 613.8 bits: 122.6 E(33420): 7.4e-28 Smith-Waterman score: 523; 35.1% identity (71.4% similar) in 245 aa overlap (25-264:81-320) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MLQSLAGSSCVRLVERHRSAWCFGFLVLGYLLYLVFGAVVFSSVELPYEDLLRQ :.:. ..::: :..:: ..: :.:. .. CCDS98 SSRATVVARMEGTSQGGLQTVMKWKTVVAIFVVV--VVYLVTGGLVFRALEQPFESSQKN 60 70 80 90 100 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 ELRKLKRRFLEEHECLSEQQLEQFLGRVLEASNYGVSVLSNASGNWN-WDFTSALFFAST . : .::..: :.: :.:: .. ..:.:.: ::: ..:.:.: . ::. ::.:::.: CCDS98 TIALEKAEFLRDHVCVSPQELETLIQHALDADNAGVSPIGNSSNNSSHWDLGSAFFFAGT 110 120 130 140 150 160 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 VLSTTGYGHTVPLSDGGKAFCIIYSVIGIPFTLLFLTAVVQRITVHVTRRPVLYFHI--R :..: :::. .: ..::: :::.:...:::. ..:... ... . . . .. . 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