Result of FASTA (ccds) for
pF1KE5778
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5778, 625 aa
1>>>pF1KE5778 625 - 625 aa - 625 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5570+/-0.0011; mu= 17.8472+/- 0.066
mean_var=74.9246+/-14.989, 0's: 0 Z-trim(103.8): 182 B-trim: 37 in 2/48
Lambda= 0.148171
statistics sampled from 7486 (7672) to 7486 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 1.510
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS3847.1 F11 gene_id:2160|Hs109|chr4 ( 625) 4347 939.3 0
CCDS34120.1 KLKB1 gene_id:3818|Hs109|chr4 ( 638) 2687 584.5 1.5e-166
CCDS82982.1 KLKB1 gene_id:3818|Hs109|chr4 ( 514) 2011 439.9 4.1e-123
CCDS87285.1 F11 gene_id:2160|Hs109|chr4 ( 162) 1124 250.0 1.9e-66
CCDS33564.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs109|chr21 ( 492) 712 162.2 1.5e-39
CCDS54486.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs109|chr21 ( 529) 712 162.2 1.6e-39
CCDS55788.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs109|chr11 ( 532) 709 161.6 2.5e-39
CCDS58185.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs109|chr11 ( 563) 709 161.6 2.7e-39
CCDS41721.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs109|chr11 ( 567) 709 161.6 2.7e-39
CCDS73391.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs109|chr11 ( 413) 699 159.4 9e-39
CCDS73392.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs109|chr11 ( 448) 699 159.4 9.7e-39
CCDS44735.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs109|chr11 ( 457) 699 159.4 9.8e-39
CCDS58790.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs109|chr21 ( 453) 684 156.2 9e-38
CCDS13571.1 TMPRSS15 gene_id:5651|Hs109|chr21 (1019) 681 155.8 2.7e-37
CCDS74856.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs109|chr22 ( 802) 677 154.9 4.1e-37
CCDS13941.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs109|chr22 ( 811) 677 154.9 4.1e-37
CCDS13686.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs109|chr21 ( 454) 673 153.9 4.6e-37
CCDS32993.1 HPN gene_id:3249|Hs109|chr19 ( 417) 671 153.4 5.8e-37
CCDS10481.1 PRSS22 gene_id:64063|Hs109|chr16 ( 317) 647 148.2 1.6e-35
CCDS10431.1 TPSAB1 gene_id:7177|Hs109|chr16 ( 275) 643 147.3 2.6e-35
CCDS5976.1 PRSS55 gene_id:203074|Hs109|chr8 ( 352) 642 147.2 3.7e-35
CCDS1563.1 PRSS38 gene_id:339501|Hs109|chr1 ( 326) 638 146.3 6.3e-35
CCDS43129.2 TMPRSS7 gene_id:344805|Hs109|chr3 ( 717) 640 146.9 8.9e-35
CCDS75122.1 CORIN gene_id:10699|Hs109|chr4 ( 938) 635 145.9 2.3e-34
CCDS3477.1 CORIN gene_id:10699|Hs109|chr4 (1042) 635 145.9 2.5e-34
CCDS3709.1 PRSS12 gene_id:8492|Hs109|chr4 ( 875) 633 145.5 3e-34
CCDS3518.1 TMPRSS11D gene_id:9407|Hs109|chr4 ( 418) 626 143.8 4.6e-34
CCDS3520.1 TMPRSS11F gene_id:389208|Hs109|chr4 ( 438) 624 143.4 6.4e-34
CCDS8487.1 ST14 gene_id:6768|Hs109|chr11 ( 855) 625 143.8 9.5e-34
CCDS47065.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs109|chr4 ( 418) 614 141.2 2.7e-33
CCDS3519.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs109|chr4 ( 421) 614 141.2 2.7e-33
CCDS32490.1 CTRB1 gene_id:1504|Hs109|chr16 ( 263) 609 140.0 3.9e-33
CCDS10430.1 TPSG1 gene_id:25823|Hs109|chr16 ( 321) 609 140.1 4.5e-33
CCDS53717.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs109|chr11 ( 397) 608 139.9 6.3e-33
CCDS76482.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs109|chr11 ( 290) 606 139.4 6.5e-33
CCDS53716.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs109|chr11 ( 435) 608 139.9 6.8e-33
CCDS31684.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs109|chr11 ( 437) 608 139.9 6.8e-33
CCDS44743.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs109|chr11 ( 432) 606 139.5 9.1e-33
CCDS12088.1 TMPRSS9 gene_id:360200|Hs109|chr19 (1059) 609 140.4 1.2e-32
CCDS32489.1 CTRB2 gene_id:440387|Hs109|chr16 ( 263) 599 137.9 1.7e-32
CCDS33993.1 TMPRSS11E gene_id:28983|Hs109|chr4 ( 423) 594 136.9 5.3e-32
CCDS73602.1 F7 gene_id:2155|Hs109|chr13 ( 382) 590 136.1 8.8e-32
CCDS9529.1 F7 gene_id:2155|Hs109|chr13 ( 444) 590 136.1 9.9e-32
CCDS9528.1 F7 gene_id:2155|Hs109|chr13 ( 466) 590 136.1 1e-31
CCDS3521.1 TMPRSS11B gene_id:132724|Hs109|chr4 ( 416) 588 135.7 1.3e-31
CCDS156.1 CTRC gene_id:11330|Hs109|chr1 ( 268) 574 132.6 7e-31
CCDS74669.1 PRSS56 gene_id:646960|Hs109|chr2 ( 603) 577 133.4 8.8e-31
CCDS3369.1 HGFAC gene_id:3083|Hs109|chr4 ( 655) 572 132.4 2e-30
CCDS75098.1 HGFAC gene_id:3083|Hs109|chr4 ( 662) 572 132.4 2e-30
CCDS5279.1 PLG gene_id:5340|Hs109|chr6 ( 810) 569 131.8 3.7e-30
>>CCDS3847.1 F11 gene_id:2160|Hs109|chr4 (625 aa)
initn: 4347 init1: 4347 opt: 4347 Z-score: 5021.5 bits: 939.3 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 4347; 100.0% identity (100.0% similar) in 625 aa overlap (1-625:1-625)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MIFLYQVVHFILFTSVSGECVTQLLKDTCFEGGDITTVFTPSAKYCQVVCTYHPRCLLFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 MIFLYQVVHFILFTSVSGECVTQLLKDTCFEGGDITTVFTPSAKYCQVVCTYHPRCLLFT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FTAESPSEDPTRWFTCVLKDSVTETLPRVNRTAAISGYSFKQCSHQISACNKDIYVDLDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 FTAESPSEDPTRWFTCVLKDSVTETLPRVNRTAAISGYSFKQCSHQISACNKDIYVDLDM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 KGINYNSSVAKSAQECQERCTDDVHCHFFTYATRQFPSLEHRNICLLKHTQTGTPTRITK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 KGINYNSSVAKSAQECQERCTDDVHCHFFTYATRQFPSLEHRNICLLKHTQTGTPTRITK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LDKVVSGFSLKSCALSNLACIRDIFPNTVFADSNIDSVMAPDAFVCGRICTHHPGCLFFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 LDKVVSGFSLKSCALSNLACIRDIFPNTVFADSNIDSVMAPDAFVCGRICTHHPGCLFFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FFSQEWPKESQRNLCLLKTSESGLPSTRIKKSKALSGFSLQSCRHSIPVFCHSSFYHDTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 FFSQEWPKESQRNLCLLKTSESGLPSTRIKKSKALSGFSLQSCRHSIPVFCHSSFYHDTD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 FLGEELDIVAAKSHEACQKLCTNAVRCQFFTYTPAQASCNEGKGKCYLKLSSNGSPTKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 FLGEELDIVAAKSHEACQKLCTNAVRCQFFTYTPAQASCNEGKGKCYLKLSSNGSPTKIL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 HGRGGISGYTLRLCKMDNECTTKIKPRIVGGTASVRGEWPWQVTLHTTSPTQRHLCGGSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 HGRGGISGYTLRLCKMDNECTTKIKPRIVGGTASVRGEWPWQVTLHTTSPTQRHLCGGSI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 IGNQWILTAAHCFYGVESPKILRVYSGILNQSEIKEDTSFFGVQEIIIHDQYKMAESGYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 IGNQWILTAAHCFYGVESPKILRVYSGILNQSEIKEDTSFFGVQEIIIHDQYKMAESGYD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 IALLKLETTVNYTDSQRPICLPSKGDRNVIYTDCWVTGWGYRKLRDKIQNTLQKAKIPLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 IALLKLETTVNYTDSQRPICLPSKGDRNVIYTDCWVTGWGYRKLRDKIQNTLQKAKIPLV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 TNEECQKRYRGHKITHKMICAGYREGGKDACKGDSGGPLSCKHNEVWHLVGITSWGEGCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 TNEECQKRYRGHKITHKMICAGYREGGKDACKGDSGGPLSCKHNEVWHLVGITSWGEGCA
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KE5 QRERPGVYTNVVEYVDWILEKTQAV
:::::::::::::::::::::::::
CCDS38 QRERPGVYTNVVEYVDWILEKTQAV
610 620
>>CCDS34120.1 KLKB1 gene_id:3818|Hs109|chr4 (638 aa)
initn: 3042 init1: 1445 opt: 2687 Z-score: 3103.6 bits: 584.5 E(33420): 1.5e-166
Smith-Waterman score: 2687; 58.5% identity (83.4% similar) in 627 aa overlap (1-624:1-627)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MIFLYQVVHFI-LFTSVSGECVTQLLKDTCFEGGDITTVFTPSAKYCQVVCTYHPRCLLF
::.. :...:: ::..:: :.::: ... :.:::.....::.:.:::. ::.:::::::
CCDS34 MILFKQATYFISLFATVSCGCLTQLYENAFFRGGDVASMYTPNAQYCQMRCTFHPRCLLF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 TFTAESPSEDPTRWFTCVLKDSVTETLPRVNRTAAISGYSFKQCSHQISACNKDIYVDLD
.: : .: . : : :::::: :::.:.::.:.::.:.:::.::::::..::: .:
CCDS34 SFLPASSINDMEKRFGCFLKDSVTGTLPKVHRTGAVSGHSLKQCGHQISACHRDIYKGVD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MKGINYNSSVAKSAQECQERCTDDVHCHFFTYATRQFPSLEHRNICLLKHTQTGTPTRIT
:.:.:.: : ..:..:::.:::....:.::.:::. : . :.:: ::::.. :::: :
CCDS34 MRGVNFNVSKVSSVEECQKRCTSNIRCQFFSYATQTFHKAEYRNNCLLKYSPGGTPTAIK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 KLDKVVSGFSLKSCALSNLACIRDIFPNTVFADSNIDSVMAPDAFVCGRICTHHPGCLFF
:..: :::::: ::::...: .:: . .:.: .. :..:::::: :::.::.::::
CCDS34 VLSNVESGFSLKPCALSEIGCHMNIFQHLAFSDVDVARVLTPDAFVCRTICTYHPNCLFF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TFFSQEWPKESQRNLCLLKTSESGLPSTRIKKSKALSGFSLQSCRHSIPVFCHSSFYHDT
::... : :::::.::::::::: ::. . ...::.:: .:....: :::..: .
CCDS34 TFYTNVWKIESQRNVCLLKTSESGTPSSSTPQENTISGYSLLTCKRTLPEPCHSKIYPGV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 DFLGEELDIVAAKSHEACQKLCTNAVRCQFFTYTPAQASCNEGKGKCYLKLSSNGSPTKI
:: ::::... .:. ..::. ::. .:::::::. .:.: : ::.:.:: .::::.:
CCDS34 DFGGEELNVTFVKGVNVCQETCTKMIRCQFFTYSLLPEDCKEEKCKCFLRLSMDGSPTRI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 LHGRGGISGYTLRLCKM-DNE-CTTKIKPRIVGGTASVRGEWPWQVTLHTTSPTQRHLCG
.: : :::.::::. :: :::: . :::::: : :::::::.:.. .::::::
CCDS34 AYGTQGSSGYSLRLCNTGDNSVCTTKTSTRIVGGTNSSWGEWPWQVSLQVKLTAQRHLCG
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 GSIIGNQWILTAAHCFYGVESPKILRVYSGILNQSEIKEDTSFFGVQEIIIHDQYKMAES
::.::.::.::::::: :. . :.:::::: :.: .:: : ..:::::..::..:.
CCDS34 GSLIGHQWVLTAAHCFDGLPLQDVWRIYSGILNLSDITKDTPFSQIKEIIIHQNYKVSEG
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 GYDIALLKLETTVNYTDSQRPICLPSKGDRNVIYTDCWVTGWGYRKLRDKIQNTLQKAKI
..::::.::.. .:::. :.::::::::: ..:::.:::::::. : . .::: :::..:
CCDS34 NHDIALIKLQAPLNYTEFQKPICLPSKGDTSTIYTNCWVTGWGFSKEKGEIQNILQKVNI
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 PLVTNEECQKRYRGHKITHKMICAGYREGGKDACKGDSGGPLSCKHNEVWHLVGITSWGE
::::::::::::. .:::..:.::::.::::::::::::::: :::: .:.:::::::::
CCDS34 PLVTNEECQKRYQDYKITQRMVCAGYKEGGKDACKGDSGGPLVCKHNGMWRLVGITSWGE
550 560 570 580 590 600
600 610 620
pF1KE5 GCAQRERPGVYTNVVEYVDWILEKTQAV
:::.::.:::::.:.::.::::::::.
CCDS34 GCARREQPGVYTKVAEYMDWILEKTQSSDGKAQMQSPA
610 620 630
>>CCDS82982.1 KLKB1 gene_id:3818|Hs109|chr4 (514 aa)
initn: 2375 init1: 1352 opt: 2011 Z-score: 2324.1 bits: 439.9 E(33420): 4.1e-123
Smith-Waterman score: 2011; 55.1% identity (80.9% similar) in 497 aa overlap (38-532:1-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 VHFILFTSVSGECVTQLLKDTCFEGGDITTVFTPSAKYCQVVCTYHPRCLLFTFTAESPS
..::.:.:::. ::.:::::::.: :
CCDS82 MYTPNAQYCQMRCTFHPRCLLFSFLPASSI
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 EDPTRWFTCVLKDSVTETLPRVNRTAAISGYSFKQCSHQISACNKDIYVDLDMKGINYNS
.: . : : :::::: :::.:.::.:.::.:.:::.::::::..::: .::.:.:.:
CCDS82 NDMEKRFGCFLKDSVTGTLPKVHRTGAVSGHSLKQCGHQISACHRDIYKGVDMRGVNFNV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SVAKSAQECQERCTDDVHCHFFTYATRQFPSLEHRNICLLKHTQTGTPTRITKLDKVVSG
: ..:..:::.:::....:.::.:::. : . :.:: ::::.. :::: : :..: ::
CCDS82 SKVSSVEECQKRCTSNIRCQFFSYATQTFHKAEYRNNCLLKYSPGGTPTAIKVLSNVESG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FSLKSCALSNLACIRDIFPNTVFADSNIDSVMAPDAFVCGRICTHHPGCLFFTFFSQEWP
:::: ::::...: .:: . .:.: .. :..:::::: :::.::.::::::... :
CCDS82 FSLKPCALSEIGCHMNIFQHLAFSDVDVARVLTPDAFVCRTICTYHPNCLFFTFYTNVWK
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KESQRNLCLLKTSESGLPSTRIKKSKALSGFSLQSCRHSIPVFCHSSFYHDTDFLGEELD
:::::.::::::::: ::. . ...::.:: .:....: :::..: .:: ::::.
CCDS82 IESQRNVCLLKTSESGTPSSSTPQENTISGYSLLTCKRTLPEPCHSKIYPGVDFGGEELN
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 IVAAKSHEACQKLCTNAVRCQFFTYTPAQASCNEGKGKCYLKLSSNGSPTKILHGRGGIS
.. .:. ..::. ::. .:::::::. .:.: : ::.:.:: .::::.: .: : :
CCDS82 VTFVKGVNVCQETCTKMIRCQFFTYSLLPEDCKEEKCKCFLRLSMDGSPTRIAYGTQGSS
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 GYTLRLCKM-DNE-CTTKIKPRIVGGTASVRGEWPWQVTLHTTSPTQRHLCGGSIIGNQW
::.::::. :: :::: . :::::: : :::::::.:.. .::::::::.::.::
CCDS82 GYSLRLCNTGDNSVCTTKTSTRIVGGTNSSWGEWPWQVSLQVKLTAQRHLCGGSLIGHQW
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 ILTAAHCFYGVESPKILRVYSGILNQSEIKEDTSFFGVQEIIIHDQYKMAESGYDIALLK
.::::::: :. . :.:::::: :.: .:: : ..:::::..::..:...::::.:
CCDS82 VLTAAHCFDGLPLQDVWRIYSGILNLSDITKDTPFSQIKEIIIHQNYKVSEGNHDIALIK
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 LETTVNYTDSQRPICLPSKGDRNVIYTDCWVTGWGYRKLRDKIQNTLQKAKIPLVTNEEC
:.. .:::. :.::::::::: ..:::.:::::::. : . ... .:
CCDS82 LQAPLNYTEFQKPICLPSKGDTSTIYTNCWVTGWGFSKEKGRFRWSLSLQTQWNVAFGGH
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 QKRYRGHKITHKMICAGYREGGKDACKGDSGGPLSCKHNEVWHLVGITSWGEGCAQRERP
CCDS82 HQLG
>>CCDS87285.1 F11 gene_id:2160|Hs109|chr4 (162 aa)
initn: 1124 init1: 1124 opt: 1124 Z-score: 1306.7 bits: 250.0 E(33420): 1.9e-66
Smith-Waterman score: 1124; 100.0% identity (100.0% similar) in 162 aa overlap (1-162:1-162)
10 20 30 40 50 60
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CCDS87 MIFLYQVVHFILFTSVSGECVTQLLKDTCFEGGDITTVFTPSAKYCQVVCTYHPRCLLFT
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CCDS87 FTAESPSEDPTRWFTCVLKDSVTETLPRVNRTAAISGYSFKQCSHQISACNKDIYVDLDM
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