FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5816, 862 aa
1>>>pF1KE5816 862 - 862 aa - 862 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3946+/-0.000537; mu= 15.5162+/- 0.033
mean_var=95.2342+/-18.678, 0's: 0 Z-trim(108.0): 175 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.131425
statistics sampled from 15852 (16031) to 15852 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.533), E-opt: 0.2 (0.188), width: 16
Scan time: 11.180
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003296 (OMIM: 602345,616410) short transient re ( 848) 4510 866.7 0
NP_001124170 (OMIM: 602345,616410) short transient ( 921) 4510 866.7 0
XP_011530520 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 920) 4496 864.1 0
XP_016864067 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 936) 4138 796.2 0
XP_011530519 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 937) 4127 794.1 0
XP_016864068 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 893) 4125 793.7 0
XP_011541270 (OMIM: 603652,603965) PREDICTED: shor ( 876) 3901 751.3 4.5e-216
NP_004612 (OMIM: 603652,603965) short transient re ( 931) 3898 750.7 7.1e-216
XP_016873711 (OMIM: 603652,603965) PREDICTED: shor ( 845) 3796 731.4 4.3e-210
XP_016873710 (OMIM: 603652,603965) PREDICTED: shor ( 815) 1878 367.7 1.2e-100
NP_001129428 (OMIM: 603651) short transient recept ( 828) 784 160.3 3.5e-38
NP_001129429 (OMIM: 603651) short transient recept ( 836) 784 160.3 3.5e-38
NP_001129427 (OMIM: 603651) short transient recept ( 893) 784 160.3 3.7e-38
NP_057263 (OMIM: 603651) short transient receptor ( 977) 784 160.3 4e-38
NP_003297 (OMIM: 603651) short transient receptor ( 982) 784 160.3 4e-38
XP_005247796 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 661) 692 142.8 5.2e-33
XP_005247795 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 695) 692 142.8 5.4e-33
XP_016862611 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 709) 692 142.8 5.5e-33
XP_016862610 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 732) 692 142.8 5.6e-33
NP_003295 (OMIM: 602343) short transient receptor ( 759) 692 142.8 5.8e-33
NP_001238774 (OMIM: 602343) short transient recept ( 793) 692 142.8 6e-33
XP_016876213 (OMIM: 603651) PREDICTED: short trans ( 557) 523 110.7 2e-23
NP_001129430 (OMIM: 603651) short transient recept ( 804) 523 110.8 2.7e-23
XP_016876212 (OMIM: 603651) PREDICTED: short trans ( 562) 520 110.1 3e-23
XP_011533508 (OMIM: 603651) PREDICTED: short trans ( 562) 520 110.1 3e-23
XP_016885263 (OMIM: 300334) PREDICTED: short trans ( 973) 493 105.1 1.6e-21
NP_036603 (OMIM: 300334) short transient receptor ( 973) 493 105.1 1.6e-21
XP_011516557 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1184) 244 57.9 3.1e-07
XP_016869778 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1560) 244 58.0 4e-07
XP_011516554 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1694) 244 58.0 4.2e-07
XP_011516553 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1779) 244 58.0 4.4e-07
XP_011516551 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1944) 244 58.1 4.8e-07
XP_011516550 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1975) 244 58.1 4.8e-07
XP_011516548 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1981) 244 58.1 4.8e-07
XP_011516547 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1991) 244 58.1 4.8e-07
NP_001170781 (OMIM: 602014,607009) transient recep (2017) 244 58.1 4.9e-07
NP_001170782 (OMIM: 602014,607009) transient recep (2017) 244 58.1 4.9e-07
XP_011516546 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (2021) 244 58.1 4.9e-07
NP_060132 (OMIM: 602014,607009) transient receptor (2022) 244 58.1 4.9e-07
XP_016869777 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1852) 215 52.6 2.1e-05
XP_011516552 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1930) 215 52.6 2.1e-05
XP_016877844 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1826) 211 51.8 3.4e-05
XP_016877843 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1826) 211 51.8 3.4e-05
NP_001288141 (OMIM: 105500,605692) transient recep (1864) 211 51.8 3.5e-05
NP_060142 (OMIM: 105500,605692) transient receptor (1865) 211 51.8 3.5e-05
XP_016877842 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1873) 211 51.8 3.5e-05
XP_016877841 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1874) 211 51.8 3.5e-05
XP_005254543 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1885) 211 51.8 3.5e-05
XP_016877840 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1893) 211 51.8 3.6e-05
XP_016877839 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1894) 211 51.8 3.6e-05
>>NP_003296 (OMIM: 602345,616410) short transient recept (848 aa)
initn: 2788 init1: 2426 opt: 4510 Z-score: 4624.4 bits: 866.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4510; 81.0% identity (92.4% similar) in 841 aa overlap (12-849:8-844)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLRNSTFKNMQRRHTTLREKGRRQAIRDPAYMFNEKGTSLTPEEERFLDSAEYGNIPVVR
:: :..::::::::.: ::.:::..::::: :::::::.::::::::::
NP_003 MEGSPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLTAEEERFLDAAEYGNIPVVR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 KMLEESKTLNFNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARVGDALLLAISKGYVR
:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_003 KMLEESKTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARIGDALLLAISKGYVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 IVEAILNHPAFAQGQRLTLSPLEQELRDDDFYAYDEDGTRFSHDITPIILAAHCQEYEIV
:::::::::.:: ..:::::: ::::.::::::::::::::: ::::::::::::.::.:
NP_003 IVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HILLLKGARIERPHDYFCKCNECTEKQRKDSFSHSRSRMNAYKGLASAAYLSLSSEDPVL
:.::.:::::::::::::::..: ::::.:::::::::.:::::::: ::::::::::::
NP_003 HMLLMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE5 TALELSNELARLANIETEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDTEEVEAILNGDVNFQ--
::::::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::::.::::::::::..
NP_003 TALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 VWSDHHRPSLSRIKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTMWYENLSGLRQQSIAVKFLAVFGV
. .:. ::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::.:.::.: :.:. :
NP_003 LEVHRHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 SIGLPFLAIAYWIAPCSKLGRTLRSPFMKFVAHAVSFTIFLGLLVVNASDRFEGVKTLPN
..:::::::.:::::::.::. ::::::::::::.:: ::::::: ::::::::. ::::
NP_003 ALGLPFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFLGLLVFNASDRFEGITTLPN
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 ETFTDYPKQIFRVKTTQFSWTEMLIMKWVLGMIWSECKEIWEEGPREYVLHLWNLLDFGM
: :::::::::::::::.::::::: :::::.::::::.: ::::::.:.:::.:::::
NP_003 ITVTDYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELWLEGPREYILQLWNVLDFGM
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 LSIFVASFTARFMAFLKATEAQLYVDQHVQDDTLHNVSLPPEVAYFTYARDKWWPSDPQI
::::.:.:::::.:::.::.:: :::..::.. : .:.::::. ::::::::: ::::::
NP_003 LSIFIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLPPEIQYFTYARDKWLPSDPQI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 ISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMIGMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: :::::::
NP_003 ISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVLFIMVFFAFMIGMF
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 NLYSYYRGAKYNPAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVISVVLKYDHKFIENIGYVLYGVYNV
::::: ::: : :::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.:::
NP_003 ILYSYYLGAKVNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLKYDHKFIENIGYVLYGIYNV
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE5 TMVVVLLNMLIAMINNSYQEIEEDADVEWKFARAKLWLSYFDEGRTLPAPFNLVPSPKSF
:::::::::::::::.::::::.:.::::::::.::::::::.:.::: ::.::::::::
NP_003 TMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYFDDGKTLPPPFSLVPSPKSF
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE5 YYLIMRIKMCLIKLCKSKAKSCENDLEMGMLNSKFKKTRY-QAGMRNSENLTANNTLSKP
:.:::: ... : . . ..:.:::: ::: . . . :.. : :. . :. :..:
NP_003 VYFIMRI----VNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLFTQSNSRVFESHSFNSILNQP
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE5 TRYQKIMKRLIKRYVLKAQVDRENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEEKSQATGELADL
::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::: ::: :
NP_003 TRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEDKSQATEELAIL
780 790 800 810 820 830
840 850 860
pF1KE5 IQQLSEKFGKNLNKDHLRVNKGKDI
:..::::.. ..
NP_003 IHKLSEKLNPSMLRCE
840
>>NP_001124170 (OMIM: 602345,616410) short transient rec (921 aa)
initn: 2788 init1: 2426 opt: 4510 Z-score: 4623.9 bits: 866.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4510; 81.0% identity (92.4% similar) in 841 aa overlap (12-849:81-917)
10 20 30 40
pF1KE5 MLRNSTFKNMQRRHTTLREKGRRQAIRDPAYMFNEKGTSLT
:: :..::::::::.: ::.:::..:::::
NP_001 SAPSQREPHGYCPPPFSHGPDLSMEGSPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLT
60 70 80 90 100 110
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 PEEERFLDSAEYGNIPVVRKMLEESKTLNFNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKE
:::::::.:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESKTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKE
120 130 140 150 160 170
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 NLARVGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPAFAQGQRLTLSPLEQELRDDDFYAYDEDGTRF
::::.:::::::::::::::::::::::.:: ..:::::: ::::.::::::::::::::
NP_001 NLARIGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRF
180 190 200 210 220 230
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 SHDITPIILAAHCQEYEIVHILLLKGARIERPHDYFCKCNECTEKQRKDSFSHSRSRMNA
: ::::::::::::.::.::.::.:::::::::::::::..: ::::.:::::::::.::
NP_001 SPDITPIILAAHCQKYEVVHMLLMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINA
240 250 260 270 280 290
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 YKGLASAAYLSLSSEDPVLTALELSNELARLANIETEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLC
:::::: ::::::::::::::::::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::
NP_001 YKGLASPAYLSLSSEDPVLTALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLC
300 310 320 330 340 350
290 300 310 320 330
pF1KE5 RDTEEVEAILNGDVNFQ--VWSDHHRPSLSRIKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTMWYEN
::.::::::::::.. . .:. ::::.:::::::::::::::::::::::.::::
NP_001 RDSEEVEAILNGDLESAEPLEVHRHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYEN
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 LSGLRQQSIAVKFLAVFGVSIGLPFLAIAYWIAPCSKLGRTLRSPFMKFVAHAVSFTIFL
:::::.:.::.: :.:. :..:::::::.:::::::.::. ::::::::::::.:: :::
NP_001 LSGLREQTIAIKCLVVLVVALGLPFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFL
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 GLLVVNASDRFEGVKTLPNETFTDYPKQIFRVKTTQFSWTEMLIMKWVLGMIWSECKEIW
:::: ::::::::. :::: : :::::::::::::::.::::::: :::::.::::::.:
NP_001 GLLVFNASDRFEGITTLPNITVTDYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELW
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 EEGPREYVLHLWNLLDFGMLSIFVASFTARFMAFLKATEAQLYVDQHVQDDTLHNVSLPP
::::::.:.:::.:::::::::.:.:::::.:::.::.:: :::..::.. : .:.:::
NP_001 LEGPREYILQLWNVLDFGMLSIFIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLPP
540 550 560 570 580 590
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 EVAYFTYARDKWWPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDI
:. ::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EIQYFTYARDKWLPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDI
600 610 620 630 640 650
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 FKFMVIFIMVFVAFMIGMFNLYSYYRGAKYNPAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVISVVLK
:::::.::::: ::::::: ::::: ::: : :::::::::::::::::::::: :::::
NP_001 FKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYSYYLGAKVNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLK
660 670 680 690 700 710
640 650 660 670 680 690
pF1KE5 YDHKFIENIGYVLYGVYNVTMVVVLLNMLIAMINNSYQEIEEDADVEWKFARAKLWLSYF
:::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::.:.::::::::.:::::::
NP_001 YDHKFIENIGYVLYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYF
720 730 740 750 760 770
700 710 720 730 740 750
pF1KE5 DEGRTLPAPFNLVPSPKSFYYLIMRIKMCLIKLCKSKAKSCENDLEMGMLNSKFKKTRY-
:.:.::: ::.:::::::: :.:::: ... : . . ..:.:::: ::: . . .
NP_001 DDGKTLPPPFSLVPSPKSFVYFIMRI----VNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLFT
780 790 800 810 820
760 770 780 790 800 810
pF1KE5 QAGMRNSENLTANNTLSKPTRYQKIMKRLIKRYVLKAQVDRENDEVNEGELKEIKQDISS
:.. : :. . :. :..:::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
NP_001 QSNSRVFESHSFNSILNQPTRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQDISS
830 840 850 860 870 880
820 830 840 850 860
pF1KE5 LRYELLEEKSQATGELADLIQQLSEKFGKNLNKDHLRVNKGKDI
:::::::.::::: ::: ::..::::.. ..
NP_001 LRYELLEDKSQATEELAILIHKLSEKLNPSMLRCE
890 900 910 920
>>XP_011530520 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: short tr (920 aa)
initn: 2816 init1: 2426 opt: 4496 Z-score: 4609.5 bits: 864.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4496; 81.0% identity (92.3% similar) in 841 aa overlap (12-849:81-916)
10 20 30 40
pF1KE5 MLRNSTFKNMQRRHTTLREKGRRQAIRDPAYMFNEKGTSLT
:: :..::::::::.: ::.:::..:::::
XP_011 SAPSQREPHGYCPPPFSHGPDLSMEGSPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLT
60 70 80 90 100 110
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 PEEERFLDSAEYGNIPVVRKMLEESKTLNFNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKE
:::::::.:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESKTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKE
120 130 140 150 160 170
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 NLARVGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPAFAQGQRLTLSPLEQELRDDDFYAYDEDGTRF
::::.:::::::::::::::::::::::.:: ..:::::: ::::.::::::::::::::
XP_011 NLARIGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRF
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pF1KE5 SHDITPIILAAHCQEYEIVHILLLKGARIERPHDYFCKCNECTEKQRKDSFSHSRSRMNA
: ::::::::::::.::.::.::.:::::::::::::::..: ::::.:::::::::.::
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:::::: ::::::::::::::::::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::
XP_011 YKGLASPAYLSLSSEDPVLTALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLC
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::.::::::::::.. . .:. ::::.:::::::::::::::::::::::.::::
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:::::.:.::.: :.:. :..:::::::.:::::::.::. ::::::::::::.:: :::
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pF1KE5 GLLVVNASDRFEGVKTLPNETFTDYPKQIFRVKTTQFSWTEMLIMKWVLGMIWSECKEIW
:::: ::::::::. :::: : :::::::::::::::.::::::: :::::.::::::.:
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460 470 480 490 500 510
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::::::.:.:::.:::::::::.:.:::::.:::.::.:: :::..::.. : .:.:::
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520 530 540 550 560 570
pF1KE5 EVAYFTYARDKWWPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDI
:. ::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EIQYFTYARDKWLPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDI
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:::::.::::: ::::::: ::::: ::: : :::::::::::::::::::::: :::::
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:::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::.:.::::::::.:::::::
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:.:.::: ::.:::::::: :.:::: ... : . . ..:.:::: ::: . . .
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:.. : :. . :. :..::::: ::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
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::.::::::::::.. . .:. ::::.:::::::::::::::::::::::.::::
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pF1KE5 SHDITPIILAAHCQEYEIVHILLLKGARIERPHDYFCKCNECTEKQRKDSFSHSRSRMNA
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pF1KE5 MLRNSTFKNMQRRHTTLREKGRRQAIRDPAYMFNEKGTSLT
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XP_016 SPDITPIILAAHCQKYEVVHMLLMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINA
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pF1KE5 YKGLASAAYLSLSSEDPVLTALELSNELARLANIETEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLC
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XP_016 YKGLASPAYLSLSSEDPVLTALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLC
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pF1KE5 RDTEEVEAILNGDVNFQ--VWSDHHRPSLSRIKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTMWYEN
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XP_016 RDSEEVEAILNGDLESAEPLEVHRHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYEN
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pF1KE5 LSGLRQQSIAVKFLAVFGVSIGLPFLAIAYWIAPCSKLGRTLRSPFMKFVAHAVSFTIFL
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XP_016 LSGLREQTIAIKCLVVLVVALGLPFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFL
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pF1KE5 GLLVVNASDRFEGVKTLPNETFTDYPKQIFRVKTTQFSWTEMLIMKWVLGMIWSECKEIW
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640 650 660 670 680 690
pF1KE5 YDHKFIENIGYVLYGVYNVTMVVVLLNMLIAMINNSYQEIEEDADVEWKFARAKLWLSYF
:::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::.:.::::::::.:::::::
XP_016 YDHKFIENIGYVLYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYF
720 730 740 750 760 770
700 710 720 730 740 750
pF1KE5 DEGRTLPAPFNLVPSPKSFYYLIMRIKMCLIKLCKSKAKSCENDLEMGMLNSKFKKTRYQ
:.:.::: ::.:::::::: :.:::: ... : . . ..:.:::: ::: ..
XP_016 DDGKTLPPPFSLVPSPKSFVYFIMRI----VNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRQ----
780 790 800 810 820
760 770 780 790 800 810
pF1KE5 AGMRNSENLTANNTLSKPTRYQKIMKRLIKRYVLKAQVDRENDEVNEGELKEIKQDISSL
::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
XP_016 -----------------------IMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQDISSL
830 840 850
820 830 840 850 860
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: :.: . .::.:.::::::: : : :::::....:::. :::::::.::::::::::
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::::: ..:: :::::::::::::::.:::::.::::::::::.::::::::::::::::
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70 80 90 100 110 120
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::::::.:::::.:.::. :: ..::..::::::::::::::::.:::::::::::::::
XP_011 IVEAILSHPAFAEGKRLATSPSQSELQQDDFYAYDEDGTRFSHDVTPIILAAHCQEYEIV
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: :: ::::::::::::::::.:..::..:::::::::.:::::::: :::::::::::.
XP_011 HTLLRKGARIERPHDYFCKCNDCNQKQKHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVM
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:::::::::: ::::: ::::::.::::::::::::.:::::.::::::::::::.
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.:: ::.:::.::::::::::::::::::::::..:::::::::::..:::::.:..:.:
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::::::. ::.:::::.:. .:.:::::::::.::::::::::.::.:::::.: :::::
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:: ::.::.::. ::: ::::..::.::::.:::::: .::.::...:::.::::::.
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::.::: :::::: .:..:: .: . : .:.: .: :.. :: :: ::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMIGMFNL
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:::: ::: : ::::::::::::::.::::::: :::..:.:::::::::::::::::::
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pF1KE5 VVVLLNMLIAMINNSYQEIEEDADVEWKFARAKLWLSYFDEGRTLPAPFNLVPSPKSFYY
:.:::::::::::.:.::::.::::::::::::::.:::.::::::.::::::::::..:
XP_011 VIVLLNMLIAMINSSFQEIEDDADVEWKFARAKLWFSYFEEGRTLPVPFNLVPSPKSLFY
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pF1KE5 LIMRIKMCLIKLCKSKAKSCENDLEMGMLN--------------SKFKKTRYQAG-----
:....: . .: ... :. ..: ::. .: ::.. . :.:
XP_011 LLLKLKKWISELFQGHKKGFQEDAEMNKINEEKKLGILGSHEDLSKLSLDKKQVGHNKQP
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pF1KE5 -MRNSENLTANNTLSKPTRYQKIMKRLIKRYVLKAQVDRENDEVNEGELKEIKQDISSLR
.:.::.. :. . : .::::::::::::::.::.:.:.:::::::::::::::::::
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:.::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::.:.::. :: ..::..:::
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:::::::::::::.:::::::::::::::: :: ::::::::::::::::.:..::..::
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220 230 240 250 260 270
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:::::::.:::::::: :::::::::::.:::::::::: ::::: ::::::.:::::::
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:::::.:::::.::::::::::::. .:: ::.:::.::::::::::::::::::::
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::..:::::::::::..:::::.:..:.:::::::. ::.:::::.:. .:.::::::::
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:.::::::::::.::.:::::.: ::::: :: ::.::.::. ::: ::::..::.:::
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:.:::::: .::.::...:::.::::::.::.::: :::::: .:..:: .: .
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: .:.: .: :.. :: :: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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580 590 600 610 620 630
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::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: : ::::::::::::::.:::::
NP_004 LGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMIGMFNLYSYYIGAKQNEAFTTVEESFKTLFWAIFGLS
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640 650 660 670 680 690
pF1KE5 EVISVVLKYDHKFIENIGYVLYGVYNVTMVVVLLNMLIAMINNSYQEIEEDADVEWKFAR
:: :::..:.::::::::::::::::::::.:::::::::::.:.::::.::::::::::
NP_004 EVKSVVINYNHKFIENIGYVLYGVYNVTMVIVLLNMLIAMINSSFQEIEDDADVEWKFAR
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pF1KE5 AKLWLSYFDEGRTLPAPFNLVPSPKSFYYLIMRIKMCLIKLCKSKAKSCENDLEMGMLN-
::::.:::.::::::.::::::::::..::....: . .: ... :. ..: ::. .:
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760 770 780 790
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::.. . :.: .:.::.. :. . : .::::::::::::
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::.::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::: : .::.::..:.::.. . :.
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.
NP_004 EETNR
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:: ::::::::::::::::.:..::..:::::::::.:::::::: :::::::::::.:
XP_016 TLLRKGARIERPHDYFCKCNDCNQKQKHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVMT
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::::::::: ::::: ::::::.::::::::::::.:::::.::::::::::::. .
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:: ::.:::.::::::::::::::::::::::..:::::::::::..:::::.:..:.::
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pF1KE5 LPFLAIAYWIAPCSKLGRTLRSPFMKFVAHAVSFTIFLGLLVVNASDRFEGVKTLPNETF
:::::. ::.:::::.:. .:.:::::::::.::::::::::.::.:::::.: :::::
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pF1KE5 TDYPKQIFRVKTTQFSWTEMLIMKWVLGMIWSECKEIWEEGPREYVLHLWNLLDFGMLSI
:: ::.::.::. ::: ::::..::.::::.:::::: .::.::...:::.::::::.:
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:.::: :::::: .:..:: .: . : .:.: .: :.. :: :: :::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMIGMFNLY
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::: ::: : ::::::::::::::.::::::: :::..:.::::::::::::::::::::
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.:::::::::::.:.::::.::::::::::::::.:::.::::::.::::::::::..::
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....: . .: ... :. ..: ::. .: ::.. . :.:
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.:.::.. :. . : .::::::::::::::.::.:.:.::::::::::::::::::::
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XP_016 ELLEEKSQNTEDLAELIRELGEKLSMEPNQEETNR
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40 50 60 70 80 90
pF1KE5 MFNEKGTSLTPEEERFLDSAEYGNIPVVRKMLEESKTLNFNCVDYMGQNALQLAVGNEHL
::....:::. :::::::.::::::::::::::: ..:: :::::::::::::::.::::
XP_016 MFSDRSTSLSIEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEECHSLNVNCVDYMGQNALQLAVANEHL
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:.::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::.:.::. :: ..::..:::
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:::::::::::::.:::::::::::::::: :: ::::::::::::::::.:..::..::
XP_016 YAYDEDGTRFSHDVTPIILAAHCQEYEIVHTLLRKGARIERPHDYFCKCNDCNQKQKHDS
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220 230 240 250 260 270
pF1KE5 FSHSRSRMNAYKGLASAAYLSLSSEDPVLTALELSNELARLANIETEFKNDYRKLSMQCK
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.
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