FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5816, 862 aa 1>>>pF1KE5816 862 - 862 aa - 862 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3946+/-0.000537; mu= 15.5162+/- 0.033 mean_var=95.2342+/-18.678, 0's: 0 Z-trim(108.0): 175 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.131425 statistics sampled from 15852 (16031) to 15852 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.533), E-opt: 0.2 (0.188), width: 16 Scan time: 11.180 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003296 (OMIM: 602345,616410) short transient re ( 848) 4510 866.7 0 NP_001124170 (OMIM: 602345,616410) short transient ( 921) 4510 866.7 0 XP_011530520 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 920) 4496 864.1 0 XP_016864067 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 936) 4138 796.2 0 XP_011530519 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 937) 4127 794.1 0 XP_016864068 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 893) 4125 793.7 0 XP_011541270 (OMIM: 603652,603965) PREDICTED: shor ( 876) 3901 751.3 4.5e-216 NP_004612 (OMIM: 603652,603965) short transient re ( 931) 3898 750.7 7.1e-216 XP_016873711 (OMIM: 603652,603965) PREDICTED: shor ( 845) 3796 731.4 4.3e-210 XP_016873710 (OMIM: 603652,603965) PREDICTED: shor ( 815) 1878 367.7 1.2e-100 NP_001129428 (OMIM: 603651) short transient recept ( 828) 784 160.3 3.5e-38 NP_001129429 (OMIM: 603651) short transient recept ( 836) 784 160.3 3.5e-38 NP_001129427 (OMIM: 603651) short transient recept ( 893) 784 160.3 3.7e-38 NP_057263 (OMIM: 603651) short transient receptor ( 977) 784 160.3 4e-38 NP_003297 (OMIM: 603651) short transient receptor ( 982) 784 160.3 4e-38 XP_005247796 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 661) 692 142.8 5.2e-33 XP_005247795 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 695) 692 142.8 5.4e-33 XP_016862611 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 709) 692 142.8 5.5e-33 XP_016862610 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 732) 692 142.8 5.6e-33 NP_003295 (OMIM: 602343) short transient receptor ( 759) 692 142.8 5.8e-33 NP_001238774 (OMIM: 602343) short transient recept ( 793) 692 142.8 6e-33 XP_016876213 (OMIM: 603651) PREDICTED: short trans ( 557) 523 110.7 2e-23 NP_001129430 (OMIM: 603651) short transient recept ( 804) 523 110.8 2.7e-23 XP_016876212 (OMIM: 603651) PREDICTED: short trans ( 562) 520 110.1 3e-23 XP_011533508 (OMIM: 603651) PREDICTED: short trans ( 562) 520 110.1 3e-23 XP_016885263 (OMIM: 300334) PREDICTED: short trans ( 973) 493 105.1 1.6e-21 NP_036603 (OMIM: 300334) short transient receptor ( 973) 493 105.1 1.6e-21 XP_011516557 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1184) 244 57.9 3.1e-07 XP_016869778 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1560) 244 58.0 4e-07 XP_011516554 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1694) 244 58.0 4.2e-07 XP_011516553 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1779) 244 58.0 4.4e-07 XP_011516551 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1944) 244 58.1 4.8e-07 XP_011516550 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1975) 244 58.1 4.8e-07 XP_011516548 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1981) 244 58.1 4.8e-07 XP_011516547 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1991) 244 58.1 4.8e-07 NP_001170781 (OMIM: 602014,607009) transient recep (2017) 244 58.1 4.9e-07 NP_001170782 (OMIM: 602014,607009) transient recep (2017) 244 58.1 4.9e-07 XP_011516546 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (2021) 244 58.1 4.9e-07 NP_060132 (OMIM: 602014,607009) transient receptor (2022) 244 58.1 4.9e-07 XP_016869777 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1852) 215 52.6 2.1e-05 XP_011516552 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1930) 215 52.6 2.1e-05 XP_016877844 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1826) 211 51.8 3.4e-05 XP_016877843 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1826) 211 51.8 3.4e-05 NP_001288141 (OMIM: 105500,605692) transient recep (1864) 211 51.8 3.5e-05 NP_060142 (OMIM: 105500,605692) transient receptor (1865) 211 51.8 3.5e-05 XP_016877842 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1873) 211 51.8 3.5e-05 XP_016877841 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1874) 211 51.8 3.5e-05 XP_005254543 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1885) 211 51.8 3.5e-05 XP_016877840 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1893) 211 51.8 3.6e-05 XP_016877839 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1894) 211 51.8 3.6e-05 >>NP_003296 (OMIM: 602345,616410) short transient recept (848 aa) initn: 2788 init1: 2426 opt: 4510 Z-score: 4624.4 bits: 866.7 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4510; 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