Result of FASTA (ccds) for
pF1KE6355
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6355, 349 aa
1>>>pF1KE6355 349 - 349 aa - 349 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9765+/-0.000968; mu= 18.0790+/- 0.058
mean_var=70.6883+/-14.866, 0's: 0 Z-trim(105.3): 25 B-trim: 536 in 1/49
Lambda= 0.152546
statistics sampled from 8431 (8450) to 8431 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16
Scan time: 1.190
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS9797.1 SLC10A1 gene_id:6554|Hs109|chr14 ( 349) 2311 517.9 5e-147
CCDS3482.1 SLC10A4 gene_id:201780|Hs109|chr4 ( 437) 766 178.0 1.4e-44
CCDS3614.1 SLC10A6 gene_id:345274|Hs109|chr4 ( 377) 722 168.2 9.9e-42
CCDS9506.1 SLC10A2 gene_id:6555|Hs109|chr13 ( 348) 708 165.1 7.9e-41
CCDS48195.1 SLC10A3 gene_id:8273|Hs109|chrX ( 448) 438 105.8 7.4e-23
CCDS14755.1 SLC10A3 gene_id:8273|Hs109|chrX ( 477) 438 105.8 7.8e-23
CCDS34915.1 SLC10A5 gene_id:347051|Hs109|chr8 ( 438) 410 99.6 5.2e-21
>>CCDS9797.1 SLC10A1 gene_id:6554|Hs109|chr14 (349 aa)
initn: 2311 init1: 2311 opt: 2311 Z-score: 2753.3 bits: 517.9 E(33420): 5e-147
Smith-Waterman score: 2311; 100.0% identity (100.0% similar) in 349 aa overlap (1-349:1-349)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPKG
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CCDS97 MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPKG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLSI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 VMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSKR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PQYMRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLLGYVL
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CCDS97 PQYMRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLLGYVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGEGLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGEGLLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE6 IAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
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CCDS97 IAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
310 320 330 340
>>CCDS3482.1 SLC10A4 gene_id:201780|Hs109|chr4 (437 aa)
initn: 786 init1: 734 opt: 766 Z-score: 914.3 bits: 178.0 E(33420): 1.4e-44
Smith-Waterman score: 766; 36.2% identity (65.5% similar) in 351 aa overlap (3-343:78-426)
10 20
pF1KE6 MEAHNASAPFNFTLPPN---FGKRPTDLALSV
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CCDS34 LSLGPGPSFGFSPGPTPTPEPTTSGLAGGAASHGPSPFPRPWAPHALPFWDTPLNHGLNV
50 60 70 80 90 100
30 40 50 60 70 80
pF1KE6 ILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPKGLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIE
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CCDS34 FVGAALCITMLGLGCTVDVNHFGAHVRRPVGALLAALCQFGLLPLLAFLLALAFKLDEVA
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 ALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLSIVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGD
:.:.:.::: :::::::..:: . :::::::.:: ::. :: .::: :.::: . .
CCDS34 AVAVLLCGCCPGGNLSNLMSLLVDGDMNLSIIMTISSTLLALVLMPLCLWIYSWAWINTP
170 180 190 200 210 220
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 LKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSKRPQYMRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAIN
. . .: ....: .::: .:. .. : . :..: .. .:. :.. ....
CCDS34 IVQLLPLGTVTLTLCSTLIPIGLGVFIRYKYSRVADYIVKVSLWSLLVTLVVLFIMTGTM
230 240 250 260 270 280
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 VGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLLGYVLSALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTI
.: .. .. . . . .::. :. :: :..:: : :.::: .::: ::::::..:
CCDS34 LGPELLASIPAAVYVIAIFMPLAGYASGYGLATLFHLPPNCKRTVCLETGSQNVQLCTAI
290 300 310 320 330 340
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 LNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGEGLLLIAIFWCY--EKF--KTPKDK---TKMIYT
:..::::. :: ...::::: .:: .:. ... :. : : . . : :. : . :
CCDS34 LKLAFPPQFIGSMYMFPLLYALFQSAEAGIFVLIYKMYGSEMLHKRDPLDEDEDTDISYK
350 360 370 380 390 400
330 340
pF1KE6 AATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
:: . : : :.:.
CCDS34 KLKEEEMADTSYG--TVKAENIIMMETAQTSL
410 420 430
>>CCDS3614.1 SLC10A6 gene_id:345274|Hs109|chr4 (377 aa)
initn: 695 init1: 402 opt: 722 Z-score: 862.8 bits: 168.2 E(33420): 9.9e-42
Smith-Waterman score: 722; 38.7% identity (73.6% similar) in 292 aa overlap (24-309:31-313)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKA
.:...:. . :. ..:.::::..:. :. .
CCDS36 MRANCSSSSACPANSSEEELPVGLEVHGNLELVFTVVSTVMMGLLMFSLGCSVEIRKLWS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 HLWKPKGLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMK
:. .: :.:..:. :.:.::.::..:. : :: ..:.:.:. :: :::..::.:.. .
CCDS36 HIRRPWGIAVGLLCQFGLMPFTAYLLAISFSLKPVQAIAVLIMGCCPGGTISNIFTFWVD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 GDMNLSIVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDK--VPYKGIVISLVLVLIPCT
:::.::: :::::: ::::::: .:.:. .. .:... .::..: :.:: . :: .
CCDS36 GDMDLSISMTTCSTVAALGMMPLCIYLYT---WSWSLQQNLTIPYQNIGITLVCLTIPVA
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE6 IGIVLKSKRPQYMRYVIKGGMII--ILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLM
.:. .. . :. . ..: : .. .:: ::: ... ..:. . :.. : ..
CCDS36 FGVYVNYRWPKQSKIILKIGAVVGGVLLLVVAV---AGVVLAKG-SWNSDITLLTISFIF
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 PFIGFLLGYVLSALFCLNG--RCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPL
:.:: . :..: ::: .. ::: :.:.::: ::.:.: :.:...: : . .. :::
CCDS36 PLIGHVTGFLL-ALFTHQSWQRCR-TISLETGAQNIQMCITMLQLSFTAEHLVQMLSFPL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 LYMIFQLGEGLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPC
: .::: .:.:..: . :..
CCDS36 AYGLFQLIDGFLIVAAYQTYKRRLKNKHGKKNSGCTEVCHTRKSTSSRETNAFLEVNEEG
300 310 320 330 340 350
>>CCDS9506.1 SLC10A2 gene_id:6555|Hs109|chr13 (348 aa)
initn: 690 init1: 401 opt: 708 Z-score: 846.7 bits: 165.1 E(33420): 7.9e-41
Smith-Waterman score: 708; 38.4% identity (73.4% similar) in 297 aa overlap (25-319:32-322)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAH
..::..:...: ..:.:.::..:..:. .:
CCDS95 NDPNSCVDNATVCSGASCVVPESNFNNILSVVLSTVLTILLALVMFSMGCNVEIKKFLGH
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LWKPKGLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKG
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CCDS95 IKRPWGICVGFLCQFGIMPLTGFILSVAFDILPLQAVVVLIIGCCPGGTASNILAYWVDG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DMNLSIVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYD-GDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIG
::.::. ::::::. ::::::: : ::.. : :.. .:: .: ::: ...: .::
CCDS95 DMDLSVSMTTCSTLLALGMMPLCLLIYTKMWVDSGSI--VIPYDNIGTSLVSLVVPVSIG
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 IVLKSKRPQYMRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIG
. .. : :: . ..: : : . : ..:...: .. ..: : : ....: :
CCDS95 MFVNHKWPQKAKIILKIGSIAGAILIVLIAVVGGILYQSAWIIA--PKLWIIGTIFPVAG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FLLGYVLSALFCLNG-RCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIF
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CCDS95 YSLGFLLARIAGLPWYRCR-TVAFETGMQNTQLCSTIVQLSFTPEELNVVFTFPLIYSIF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE6 QLGEGLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
::. . ...... :.: . :.:...
CCDS95 QLAFAAIFLGFYVAYKKCHG-KNKAEIPESKENGTEPESSFYKANGGFQPDEK
300 310 320 330 340
>>CCDS48195.1 SLC10A3 gene_id:8273|Hs109|chrX (448 aa)
initn: 409 init1: 271 opt: 438 Z-score: 524.0 bits: 105.8 E(33420): 7.4e-23
Smith-Waterman score: 438; 32.7% identity (66.1% similar) in 248 aa overlap (30-274:166-408)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPK
.:. ..: :.:: .:. .:. . .:.
CCDS48 DFCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQSPQ
140 150 160 170 180 190
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 GLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLS
. ..:..:. .::: ::...::: : . ::.... ::::. : .::: . ::..:.
CCDS48 PMLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLA
200 210 220 230 240 250
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 IVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSK
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CCDS48 ISMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETL-HVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLIKSK
260 270 280 290 300 310
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RPQY---MRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLL
:.. . :.: ...:: .. . : .: :. .. .. .. .:..:.:.
CCDS48 LPKFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGL----FLAYRMGVFILAGIRLPIVLVGITVPLVGLLV
320 330 340 350 360 370
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 GYVLSALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGE
:: :.. . : :::::.:.: :: : ..:....
CCDS48 GYCLATCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTSE
380 390 400 410 420 430
300 310 320 330 340
pF1KE6 GLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
CCDS48 MLALVIGHFIYSSLFPVP
440
>>CCDS14755.1 SLC10A3 gene_id:8273|Hs109|chrX (477 aa)
initn: 409 init1: 271 opt: 438 Z-score: 523.7 bits: 105.8 E(33420): 7.8e-23
Smith-Waterman score: 438; 32.7% identity (66.1% similar) in 248 aa overlap (30-274:195-437)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPK
.:. ..: :.:: .:. .:. . .:.
CCDS14 DFCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQSPQ
170 180 190 200 210 220
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 GLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLS
. ..:..:. .::: ::...::: : . ::.... ::::. : .::: . ::..:.
CCDS14 PMLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLA
230 240 250 260 270 280
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 IVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSK
: :: :: : :..:: :::: . . .:: . :. .:... :: ..:...:::
CCDS14 ISMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETL-HVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLIKSK
290 300 310 320 330 340
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RPQY---MRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLL
:.. . :.: ...:: .. . : .: :. .. .. .. .:..:.:.
CCDS14 LPKFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGL----FLAYRMGVFILAGIRLPIVLVGITVPLVGLLV
350 360 370 380 390
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 GYVLSALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGE
:: :.. . : :::::.:.: :: : ..:....
CCDS14 GYCLATCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTSE
400 410 420 430 440 450
300 310 320 330 340
pF1KE6 GLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
CCDS14 MLALVIGHFIYSSLFPVP
460 470
>>CCDS34915.1 SLC10A5 gene_id:347051|Hs109|chr8 (438 aa)
initn: 382 init1: 227 opt: 410 Z-score: 490.9 bits: 99.6 E(33420): 5.2e-21
Smith-Waterman score: 410; 30.1% identity (65.0% similar) in 286 aa overlap (30-304:143-418)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLS---LGCTMEFSKIKAHLW
::...: .:.:. .:: .:.. ... .:
CCDS34 RLIEEIKNVKVKVLKQKDSLLQAPMHIDRNILMLILPLILLNKCAFGCKIELQLFQT-VW
120 130 140 150 160 170
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 K-PKGLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAI-LVCGCSPGGNLSNVFSLAMKG
: : . .. :.:. .::. .:.:... : . .:... ..: : :::. . .:.: . :
CCDS34 KRPLPVILGAVTQFFLMPFCGFLLSQIVALPEAQAFGVVMTCTC-PGGGGGYLFALLLDG
180 190 200 210 220 230
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DMNLSIVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGI-YDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIG
:..:.:.:: ::. :: :::. ::::: . .: . ..: . :: .:...:.: .::
CCDS34 DFTLAILMTCTSTLLALIMMPVNSYIYSRILGLSGTF--HIPVSKIVSTLLFILVPVSIG
240 250 260 270 280
180 190 200 210 220
pF1KE6 IVLKSKRPQ---YMRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLL--IATSSL
::.: . :. ... .:. .:... .. .: ..:: ..: : : : . :
CCDS34 IVIKHRIPEKASFLERIIRPLSFILMFVGIYLT----FTVG--LVFLKTDNLEVILLGLL
290 300 310 320 330 340
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 MPFIGFLLGYVLSALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLL
.: .:.:.:: .. . : .::..:.: : : ......:: . :.
CCDS34 VPALGLLFGYSFAKVCTLPLPVCKTVAIESGMLNSFLALAVIQLSFPQSKANLASVAPFT
350 360 370 380 390 400
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 YMIFQLGEGLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCT
. . : ::.: ..
CCDS34 VAMCSGCEMLLIILVYKAKKRCIFFLQDKRKRNFLI
410 420 430
349 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Jul 14 21:19:40 2018 done: Sat Jul 14 21:19:41 2018
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]