Result of FASTA (omim) for pF1KE6728
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6728, 975 aa
  1>>>pF1KE6728     975 - 975 aa - 975 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  63334102 residues in 89105 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6892+/-0.000455; mu= 18.8182+/- 0.028
 mean_var=68.7618+/-13.842, 0's: 0 Z-trim(107.5): 54  B-trim: 19 in 1/56
 Lambda= 0.154668
 statistics sampled from 15892 (15913) to 15892 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.511), E-opt: 0.2 (0.179), width:  16
 Scan time: 14.230

The best scores are:                                      opt bits E(89105)
NP_057422 (OMIM: 610889) importin-11 isoform 2 [Ho ( 975) 6418 1442.3       0
NP_001128251 (OMIM: 610889) importin-11 isoform 1  (1015) 6418 1442.4       0
XP_011526901 (OMIM: 601342) PREDICTED: exportin-2  ( 945)  231 61.8 2.1e-08
NP_001307 (OMIM: 601342) exportin-2 isoform 1 [Hom ( 971)  231 61.8 2.1e-08
NP_001243064 (OMIM: 601342) exportin-2 isoform 2 [ ( 915)  221 59.5 9.5e-08
NP_006382 (OMIM: 605586) importin-7 [Homo sapiens] (1038)  201 55.1 2.3e-06
XP_016874182 (OMIM: 605600) PREDICTED: importin-8  ( 532)  170 48.1 0.00016
NP_006381 (OMIM: 605600) importin-8 isoform 1 [Hom (1037)  170 48.2 0.00028
NP_038461 (OMIM: 603002) transportin-2 isoform 2 [ ( 887)  152 44.1   0.004
NP_001129667 (OMIM: 603002) transportin-2 isoform  ( 887)  152 44.1   0.004
NP_001129668 (OMIM: 603002) transportin-2 isoform  ( 897)  152 44.1   0.004
XP_016874180 (OMIM: 605600) PREDICTED: importin-8  (1020)  150 43.7  0.0061


>>NP_057422 (OMIM: 610889) importin-11 isoform 2 [Homo s  (975 aa)
 initn: 6418 init1: 6418 opt: 6418  Z-score: 7733.3  bits: 1442.3 E(89105):    0
Smith-Waterman score: 6418; 100.0% identity (100.0% similar) in 975 aa overlap (1-975:1-975)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MDLNSASTVVLQVLTQATSQDTAVLKPAEEQLKQWETQPGFYSVLLNIFTNHTLDINVRW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MDLNSASTVVLQVLTQATSQDTAVLKPAEEQLKQWETQPGFYSVLLNIFTNHTLDINVRW
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 LAVLYFKHGIDRYWRRVAPHALSEEEKTTLRAGLITNFNEPINQIATQIAVLIAKVARLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LAVLYFKHGIDRYWRRVAPHALSEEEKTTLRAGLITNFNEPINQIATQIAVLIAKVARLD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 CPRQWPELIPTLIESVKVQDDLRQHRALLTFYHVTKTLASKRLAADRKLFYDLASGIYNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 CPRQWPELIPTLIESVKVQDDLRQHRALLTFYHVTKTLASKRLAADRKLFYDLASGIYNF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 ACSLWNHHTDTFLQEVSSGNEAAILSSLERTLLSLKVLRKLTVNGFVEPHKNMEVMGFLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 ACSLWNHHTDTFLQEVSSGNEAAILSSLERTLLSLKVLRKLTVNGFVEPHKNMEVMGFLH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 GIFERLKQFLECSRSIGTDNVCRDRLEKTIILFTKVLLDFLDQHPFSFTPLIQRSLEFSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 GIFERLKQFLECSRSIGTDNVCRDRLEKTIILFTKVLLDFLDQHPFSFTPLIQRSLEFSV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 SYVFTEVGEGVTFERFIVQCMNLIKMIVKNYAYKPSKNFEDSSPETLEAHKIKMAFFTYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SYVFTEVGEGVTFERFIVQCMNLIKMIVKNYAYKPSKNFEDSSPETLEAHKIKMAFFTYP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE6 TLTEICRRLVSHYFLLTEEELTMWEEDPEGFTVEETGGDSWKYSLRPCTEVLFIDIFHEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 TLTEICRRLVSHYFLLTEEELTMWEEDPEGFTVEETGGDSWKYSLRPCTEVLFIDIFHEY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE6 NQTLTPVLLEMMQTLQGPTNVEDMNALLIKDAVYNAVGLAAYELFDSVDFDQWFKNQLLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 NQTLTPVLLEMMQTLQGPTNVEDMNALLIKDAVYNAVGLAAYELFDSVDFDQWFKNQLLP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE6 ELQVIHNRYKPLRRRVIWLIGQWISVKFKSDLRPMLYEAICNLLQDQDLVVRIETATTLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 ELQVIHNRYKPLRRRVIWLIGQWISVKFKSDLRPMLYEAICNLLQDQDLVVRIETATTLK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE6 LTVDDFEFRTDQFLPYLETMFTLLFQLLQQVTECDTKMHVLHVLSCVIERVNMQIRPYVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LTVDDFEFRTDQFLPYLETMFTLLFQLLQQVTECDTKMHVLHVLSCVIERVNMQIRPYVG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE6 CLVQYLPLLWKQSEEHNMLRCAILTTLIHLVQGLGADSKNLYPFLLPVIQLSTDVSQPPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 CLVQYLPLLWKQSEEHNMLRCAILTTLIHLVQGLGADSKNLYPFLLPVIQLSTDVSQPPH
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE6 VYLLEDGLELWLVTLENSPCITPELLRIFQNMSPLLELSSENLRTCFKIINGYIFLSSTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 VYLLEDGLELWLVTLENSPCITPELLRIFQNMSPLLELSSENLRTCFKIINGYIFLSSTE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE6 FLQTYAVGLCQSFCELLKEITTEGQVQVLKVVENALKVNPILGPQMFQPILPYVFKGIIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 FLQTYAVGLCQSFCELLKEITTEGQVQVLKVVENALKVNPILGPQMFQPILPYVFKGIIE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE6 GERYPVVMSTYLGVMGRVLLQNTSFFSSLLNEMAHKFNQEMDQLLGNMIEMWVDRMDNIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 GERYPVVMSTYLGVMGRVLLQNTSFFSSLLNEMAHKFNQEMDQLLGNMIEMWVDRMDNIT
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE6 QPERRKLSALALLSLLPSDNSVIQDKFCGIINISVEGLHDVMTEDPETGTYKDCMLMSHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 QPERRKLSALALLSLLPSDNSVIQDKFCGIINISVEGLHDVMTEDPETGTYKDCMLMSHL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE6 EEPKVTEDEEPPTEQDKRKKMLALKDPVHTVSLQQFIYEKLKAQQEMLGEQGFQSLMETV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 EEPKVTEDEEPPTEQDKRKKMLALKDPVHTVSLQQFIYEKLKAQQEMLGEQGFQSLMETV
              910       920       930       940       950       960

              970     
pF1KE6 DTEIVTQLQEFLQGF
       :::::::::::::::
NP_057 DTEIVTQLQEFLQGF
              970     

>>NP_001128251 (OMIM: 610889) importin-11 isoform 1 [Hom  (1015 aa)
 initn: 6418 init1: 6418 opt: 6418  Z-score: 7733.0  bits: 1442.4 E(89105):    0
Smith-Waterman score: 6418; 100.0% identity (100.0% similar) in 975 aa overlap (1-975:41-1015)

                                             10        20        30
pF1KE6                               MDLNSASTVVLQVLTQATSQDTAVLKPAEE
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVYSLLYLGYKPVQHVTALNTVSSCHKMVSMDLNSASTVVLQVLTQATSQDTAVLKPAEE
               20        30        40        50        60        70

               40        50        60        70        80        90
pF1KE6 QLKQWETQPGFYSVLLNIFTNHTLDINVRWLAVLYFKHGIDRYWRRVAPHALSEEEKTTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLKQWETQPGFYSVLLNIFTNHTLDINVRWLAVLYFKHGIDRYWRRVAPHALSEEEKTTL
               80        90       100       110       120       130

              100       110       120       130       140       150
pF1KE6 RAGLITNFNEPINQIATQIAVLIAKVARLDCPRQWPELIPTLIESVKVQDDLRQHRALLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RAGLITNFNEPINQIATQIAVLIAKVARLDCPRQWPELIPTLIESVKVQDDLRQHRALLT
              140       150       160       170       180       190

              160       170       180       190       200       210
pF1KE6 FYHVTKTLASKRLAADRKLFYDLASGIYNFACSLWNHHTDTFLQEVSSGNEAAILSSLER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FYHVTKTLASKRLAADRKLFYDLASGIYNFACSLWNHHTDTFLQEVSSGNEAAILSSLER
              200       210       220       230       240       250

              220       230       240       250       260       270
pF1KE6 TLLSLKVLRKLTVNGFVEPHKNMEVMGFLHGIFERLKQFLECSRSIGTDNVCRDRLEKTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLLSLKVLRKLTVNGFVEPHKNMEVMGFLHGIFERLKQFLECSRSIGTDNVCRDRLEKTI
              260       270       280       290       300       310

              280       290       300       310       320       330
pF1KE6 ILFTKVLLDFLDQHPFSFTPLIQRSLEFSVSYVFTEVGEGVTFERFIVQCMNLIKMIVKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILFTKVLLDFLDQHPFSFTPLIQRSLEFSVSYVFTEVGEGVTFERFIVQCMNLIKMIVKN
              320       330       340       350       360       370

              340       350       360       370       380       390
pF1KE6 YAYKPSKNFEDSSPETLEAHKIKMAFFTYPTLTEICRRLVSHYFLLTEEELTMWEEDPEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YAYKPSKNFEDSSPETLEAHKIKMAFFTYPTLTEICRRLVSHYFLLTEEELTMWEEDPEG
              380       390       400       410       420       430

              400       410       420       430       440       450
pF1KE6 FTVEETGGDSWKYSLRPCTEVLFIDIFHEYNQTLTPVLLEMMQTLQGPTNVEDMNALLIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FTVEETGGDSWKYSLRPCTEVLFIDIFHEYNQTLTPVLLEMMQTLQGPTNVEDMNALLIK
              440       450       460       470       480       490

              460       470       480       490       500       510
pF1KE6 DAVYNAVGLAAYELFDSVDFDQWFKNQLLPELQVIHNRYKPLRRRVIWLIGQWISVKFKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DAVYNAVGLAAYELFDSVDFDQWFKNQLLPELQVIHNRYKPLRRRVIWLIGQWISVKFKS
              500       510       520       530       540       550

              520       530       540       550       560       570
pF1KE6 DLRPMLYEAICNLLQDQDLVVRIETATTLKLTVDDFEFRTDQFLPYLETMFTLLFQLLQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLRPMLYEAICNLLQDQDLVVRIETATTLKLTVDDFEFRTDQFLPYLETMFTLLFQLLQQ
              560       570       580       590       600       610

              580       590       600       610       620       630
pF1KE6 VTECDTKMHVLHVLSCVIERVNMQIRPYVGCLVQYLPLLWKQSEEHNMLRCAILTTLIHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTECDTKMHVLHVLSCVIERVNMQIRPYVGCLVQYLPLLWKQSEEHNMLRCAILTTLIHL
              620       630       640       650       660       670

              640       650       660       670       680       690
pF1KE6 VQGLGADSKNLYPFLLPVIQLSTDVSQPPHVYLLEDGLELWLVTLENSPCITPELLRIFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQGLGADSKNLYPFLLPVIQLSTDVSQPPHVYLLEDGLELWLVTLENSPCITPELLRIFQ
              680       690       700       710       720       730

              700       710       720       730       740       750
pF1KE6 NMSPLLELSSENLRTCFKIINGYIFLSSTEFLQTYAVGLCQSFCELLKEITTEGQVQVLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NMSPLLELSSENLRTCFKIINGYIFLSSTEFLQTYAVGLCQSFCELLKEITTEGQVQVLK
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pF1KE6 VVENALKVNPILGPQMFQPILPYVFKGIIEGERYPVVMSTYLGVMGRVLLQNTSFFSSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVENALKVNPILGPQMFQPILPYVFKGIIEGERYPVVMSTYLGVMGRVLLQNTSFFSSLL
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pF1KE6 NEMAHKFNQEMDQLLGNMIEMWVDRMDNITQPERRKLSALALLSLLPSDNSVIQDKFCGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NEMAHKFNQEMDQLLGNMIEMWVDRMDNITQPERRKLSALALLSLLPSDNSVIQDKFCGI
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pF1KE6 INISVEGLHDVMTEDPETGTYKDCMLMSHLEEPKVTEDEEPPTEQDKRKKMLALKDPVHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 INISVEGLHDVMTEDPETGTYKDCMLMSHLEEPKVTEDEEPPTEQDKRKKMLALKDPVHT
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pF1KE6 VSLQQFIYEKLKAQQEMLGEQGFQSLMETVDTEIVTQLQEFLQGF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSLQQFIYEKLKAQQEMLGEQGFQSLMETVDTEIVTQLQEFLQGF
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       : : :..::.:.  ...  .  :       ::  ..:.  :.  . . :..: .. ::  
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       :. .. .  . :::.: :     ::.  :     .   :.. .:. . .    ...    
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        .::... .:      :  .    .   .:. :. .   . :.:  :  :.:.      .
XP_011 SANVNEFPVLKADGIKYIMIFRNQVPKEHLLVSIPL---LINHLQAESIVVHTYAAHALE
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       :.. . :   .. : . .. :..   . ::..   :    :.   .:  . .: .  . .
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pF1KE6 LPYLETMFTLLFQLLQQVTECDTKMHVLHVLS---CVIERVNMQIRPYV------GCLVQ
       .::. :..: : : :  :..  .: :  : .    :.  :.. .  : .      . .. 
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pF1KE6 YLPLLWKQSEEHNMLRCAILTTLIHLVQG-LGADSKNLYPFLL-PVIQLSTDVSQPPHVY
       .  .: .. .:       ... :..  .. . ..   :.: :: ::.   :  . :  : 
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pF1KE6 LLEDGLELWLVTLENSPC-ITPELLRIFQNMSPLLELSSENLRTCFKIINGYIFLSSTEF
       ::.  ::    :. ..     : :: .::.    :  :. : .  : ..:. :     : 
XP_011 LLQAFLERGSNTIASAAADKIPGLLGVFQK----LIASKANDHQGFYLLNSIIEHMPPES
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pF1KE6 LQTYAVGLCQSFCELLKEITTEGQVQVLKVVEN--ALKVNPILGPQMFQPILPYVFKGII
       .. :   .   . . :..  :   .. . :  :   .: . .   ..:. : : .:  ..
XP_011 VDQYRKQIFILLFQRLQNSKTTKFIKSFLVFINLYCIKYGALALQEIFDGIQPKMFGMVL
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pF1KE6 EGERYPVVMSTYLGVMGRVL-LQNTSFFSSLLNEMAHKFNQEMDQLLGNMIEMW-VDRMD
       :    : ....  .:  ..  .  :....     :  ....    :: ..: .. . . :
XP_011 EKIIIPEIQKVSGNVEKKICAVGITKLLTECPPMMDTEYTKLWTPLLQSLIGLFELPEDD
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pF1KE6 NITQPERRKLSALALLSLLPSDNSVIQDKFCGIINISVEGLHDVMTEDPETGTYKDCMLM
       .: . :                                                      
XP_011 TIPDEEHFIDIEDTPGYQTAFSQLAFAGKKEHDPVGQMVNNPKIHLAQSLHKLSTACPGR
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pF1KE6 MDLNSASTVVL-QVLTQATSQDTAVLKPAEEQLKQWETQPGFYSVLLNIFTNHTLDINVR
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NP_001 MELSDANLQTLTEYLKKTLDPDPAIRRPAEKFLESVEGNQN-YPLLLLTLLEKSQDNVIK
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pF1KE6 WLAVLYFKHGIDRYWRRVA--PHALSEEEKTTLRAGLITNFNEPINQIATQIAVLIAKVA
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pF1KE6 TMWEEDPEGFTVEETGGDSWKY---SLRPCTEVLFIDIFHEYNQT-LTPVLLEMMQTLQG
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        .::... .:      :  .    .   .:. :. .   . :.:  :  :.:.      .
NP_001 SANVNEFPVLKADGIKYIMIFRNQVPKEHLLVSIPL---LINHLQAESIVVHTYAAHALE
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pF1KE6 LPYLETMFTLLFQLLQQVTECDTKMHVLHVLS---CVIERVNMQIRPYV------GCLVQ
       .::. :..: : : :  :..  .: :  : .    :.  :.. .  : .      . .. 
NP_001 IPYIPTLITQLTQKLLAVSKNPSKPHFNHYMFEAICLSIRITCKANPAAVVNFEEALFLV
       590       600       610       620       630       640       

          610       620       630        640        650       660  
pF1KE6 YLPLLWKQSEEHNMLRCAILTTLIHLVQG-LGADSKNLYPFLL-PVIQLSTDVSQPPHVY
       .  .: .. .:       ... :..  .. . ..   :.: :: ::.   :  . :  : 
NP_001 FTEILQNDVQEFIPYVFQVMSLLLETHKNDIPSSYMALFPHLLQPVLWERTG-NIPALVR
       650       660       670       680       690        700      

            670       680        690       700       710       720 
pF1KE6 LLEDGLELWLVTLENSPC-ITPELLRIFQNMSPLLELSSENLRTCFKIINGYIFLSSTEF
       ::.  ::    :. ..     : :: .::.    :  :. : .  : ..:. :     : 
NP_001 LLQAFLERGSNTIASAAADKIPGLLGVFQK----LIASKANDHQGFYLLNSIIEHMPPES
        710       720       730           740       750       760  

             730       740       750         760       770         
pF1KE6 LQTYAVGLCQSFCELLKEITTEGQVQVLKVVEN--ALKVNPILGPQMFQPILPYVFKGII
       .. :   .   . . :..  :   .. . :  :   .: . .   ..:. : : .:  ..
NP_001 VDQYRKQIFILLFQRLQNSKTTKFIKSFLVFINLYCIKYGALALQEIFDGIQPKMFGMVL
            770       780       790       800       810       820  

     780       790        800       810       820       830        
pF1KE6 EGERYPVVMSTYLGVMGRVL-LQNTSFFSSLLNEMAHKFNQEMDQLLGNMIEMW-VDRMD
       :    : ....  .:  ..  .  :....     :  ....    :: ..: .. . . :
NP_001 EKIIIPEIQKVSGNVEKKICAVGITKLLTECPPMMDTEYTKLWTPLLQSLIGLFELPEDD
            830       840       850       860       870       880  

       840       850       860       870       880       890       
pF1KE6 NITQPERRKLSALALLSLLPSDNSVIQDKFCGIINISVEGLHDVMTEDPETGTYKDCMLM
       .: . :                                                      
NP_001 TIPDEEHFIDIEDTPGYQTAFSQLAFAGKKEHDPVGQMVNNPKIHLAQSLHKLSTACPGR
            890       900       910       920       930       940  

>>NP_001243064 (OMIM: 601342) exportin-2 isoform 2 [Homo  (915 aa)
 initn:  89 init1:  55 opt: 221  Z-score: 260.5  bits: 59.5 E(89105): 9.5e-08
Smith-Waterman score: 301; 21.2% identity (49.1% similar) in 884 aa overlap (1-843:1-832)

               10         20        30        40        50         
pF1KE6 MDLNSASTVVL-QVLTQATSQDTAVLKPAEEQLKQWETQPGFYSVLLNIFTNHTLDINVR
       :.:..:.  .: . : .. . : :. .:::. :.. : . . : .::  . ... :  ..
NP_001 MELSDANLQTLTEYLKKTLDPDPAIRRPAEKFLESVEGNQN-YPLLLLTLLEKSQDNVIK
               10        20        30        40         50         

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pF1KE6 WLAVLYFKHGIDRYWRRVA--PHALSEEEKTTLRAGLITNFNEPINQIATQIAVLIAKVA
         : . ::. : : :: :   :. . : ......:...  .    .::  :..  :. ..
NP_001 VCASVTFKNYIKRNWRIVEDEPNKICEADRVAIKANIVHLMLSSPEQIQKQLSDAISIIG
      60        70        80        90       100       110         

       120       130       140             150       160       170 
pF1KE6 RLDCPRQWPELIPTLIESVKVQD------DLRQHRALLTFYHVTKTLASKRLAADRKLFY
       : : :..::.:.  ...  .  :       ::  ..:.  :.  . . :..: .. ::  
NP_001 REDFPQKWPDLLTEMVNRFQSGDFHVINGVLRTAHSLFKRYR--HEFKSNELWTEIKLVL
     120       130       140       150       160         170       

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE6 DLASGIYNFACSLWNHHTDTFLQEVSSGNEAAILSSLERTLLSLKVLRKLTVNGFVEPHK
       :       ::  : :    :.    . .:.:   :.:.  . :: .. ::          
NP_001 D------AFALPLTNLFKATIELCSTHANDA---SALRILFSSLILISKL----------
             180       190       200          210                  

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE6 NMEVMGFLHGIFERLKQFLECSRSIGTDNVCRDRLEKTIILFTKVLLDFLDQHPFSFTPL
             :    :. : .:.:            : .:  .  :  .:   ::.. .. : :
NP_001 ------FYSLNFQDLPEFFE------------DNMETWMNNFHTLLT--LDNKLLQ-TDL
            220       230                   240         250        

             300       310       320       330         340         
pF1KE6 IQRSLEFSVSYVFTEVGEGVTFERFIVQCMNLIKMIVKNYAYKPS--KNFEDSSPE----
       .. ...: .: :  .      ::   .      :.:: :. .. .  . :::.: :    
NP_001 VSNAIQFLAS-VCERPHYKNLFEDQNTLTSICEKVIVPNMEFRAADEEAFEDNSEEYIRR
       260        270       280       290       300       310      

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pF1KE6 TLEAHKIKMAFFTYPTLTE-ICRRLVSHYF-LLTEEELTMWEEDPEGFTVEETGGDSWKY
        ::.  :     .   :.. .:. . .    ...    .: .:  .. .:.    :.  :
NP_001 DLEGSDIDTRRRAACDLVRGLCKFFEGPVTGIFSGYVNSMLQEYAKNPSVNWKHKDAAIY
        320       330       340       350       360       370      

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pF1KE6 ---SLRPCTEVLFIDIFHEYNQT-LTPVLLEMMQTLQGPTNVEDMNALLIKDAVYNAV--
          ::   ...    : .  . . ::  ... .      .::... .:      :  .  
NP_001 LVTSLASKAQTQKHGITQANELVNLTEFFVNHILPDLKSANVNEFPVLKADGIKYIMIFR
        380       390       400       410       420       430      

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pF1KE6 -GLAAYELFDSVDFDQWFKNQLLPELQVIHNRYKPLRRRVIWLIGQWISVKFKS-DLRPM
         .   .:. :. .   . :.:  :  :.:.      .:.. . :   .. : . .. :.
NP_001 NQVPKEHLLVSIPL---LINHLQAESIVVHTYAAHALERLFTMRGPNNATLFTAAEIAPF
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         520       530       540       550       560       570     
pF1KE6 LYEAICNLLQDQDLVVRIETATTLKLTVDDFEFRTDQFLPYLETMFTLLFQLLQQVTECD
       .   . ::..   :    :.   .:  . .: .  . ..::. :..: : : :  :..  
NP_001 VEILLTNLFKALTLPGSSENEYIMKAIMRSFSLLQEAIIPYIPTLITQLTQKLLAVSKNP
           500       510       520       530       540       550   

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pF1KE6 TKMHVLHVLS---CVIERVNMQIRPYV------GCLVQYLPLLWKQSEEHNMLRCAILTT
       .: :  : .    :.  :.. .  : .      . .. .  .: .. .:       ... 
NP_001 SKPHFNHYMFEAICLSIRITCKANPAAVVNFEEALFLVFTEILQNDVQEFIPYVFQVMSL
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pF1KE6 LIHLVQG-LGADSKNLYPFLL-PVIQLSTDVSQPPHVYLLEDGLELWLVTLENSPC-ITP
       :..  .. . ..   :.: :: ::.   :  . :  : ::.  ::    :. ..     :
NP_001 LLETHKNDIPSSYMALFPHLLQPVLWERTG-NIPALVRLLQAFLERGSNTIASAAADKIP
           620       630       640        650       660       670  

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pF1KE6 ELLRIFQNMSPLLELSSENLRTCFKIINGYIFLSSTEFLQTYAVGLCQSFCELLKEITTE
        :: .::.    :  :. : .  : ..:. :     : .. :   .   . . :..  : 
NP_001 GLLGVFQK----LIASKANDHQGFYLLNSIIEHMPPESVDQYRKQIFILLFQRLQNSKTT
            680           690       700       710       720        

           750         760       770       780       790        800
pF1KE6 GQVQVLKVVEN--ALKVNPILGPQMFQPILPYVFKGIIEGERYPVVMSTYLGVMGRVL-L
         .. . :  :   .: . .   ..:. : : .:  ..:    : ....  .:  ..  .
NP_001 KFIKSFLVFINLYCIKYGALALQEIFDGIQPKMFGMVLEKIIIPEIQKVSGNVEKKICAV
      730       740       750       760       770       780        

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pF1KE6 QNTSFFSSLLNEMAHKFNQEMDQLLGNMIEMW-VDRMDNITQPERRKLSALALLSLLPSD
         :....     :  ....    :: ..: .. . . :.: . :                
NP_001 GITKLLTECPPMMDTEYTKLWTPLLQSLIGLFELPEDDTIPDEEHFIDIEDTPGYQTAFS
      790       800       810       820       830       840        

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pF1KE6 NSVIQDKFCGIINISVEGLHDVMTEDPETGTYKDCMLMSHLEEPKVTEDEEPPTEQDKRK
                                                                   
NP_001 QLAFAGKKEHDPVGQMVNNPKIHLAQSLHKLSTACPGRVPSMVSTSLNAEALQYLQGYLQ
      850       860       870       880       890       900        

>>NP_006382 (OMIM: 605586) importin-7 [Homo sapiens]      (1038 aa)
 initn: 173 init1: 123 opt: 201  Z-score: 235.5  bits: 55.1 E(89105): 2.3e-06
Smith-Waterman score: 375; 19.7% identity (53.7% similar) in 992 aa overlap (19-963:13-938)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MDLNSASTVVLQVLTQATSQDTAVLKPAEEQLKQWETQPGFYSVLLNIFTNHTLDINVRW
                         ..: :. . ::.::.. . . .: :.::.:  .. ::. :: 
NP_006       MDPNTIIEALRGTMDPALREAAERQLNEAHKSLNFVSTLLQITMSEQLDLPVRQ
                     10        20        30        40        50    

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pF1KE6 LAVLYFKHGIDRYW--RRVAPHALS-----EEEKTTLRAGLITNFNEPINQIATQIAVLI
        .:.:.:. : .::  :..::  .:     ::..  .: ...  . .  . : .:... :
NP_006 AGVIYLKNMITQYWPDRETAPGDISPYTIPEEDRHCIRENIVEAIIHSPELIRVQLTTCI
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pF1KE6 AKVARLDCPRQWPELIPTLIESVKVQDDLRQHRALLTFYHVTKTLASKRLAADRKLFYDL
        .. . : : .:  ..  .   .. ...      :: .:...:.   :.   .:.    :
NP_006 HHIIKHDYPSRWTAIVDKIGFYLQSDNSACWLGILLCLYQLVKNYEYKK-PEERS---PL
          120       130       140       150       160           170

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE6 ASGIYNFACSLWNHHTDTFLQEVSSGNEAAILSSLERTLLSLKVLRKLTVNGFVEPHKNM
       .... .:   :     : :.: .:. .. ..:  ... .  .:..  :.   .. : . .
NP_006 VAAMQHFLPVL----KDRFIQLLSDQSDQSVL--IQKQI--FKIFYALV--QYTLPLELI
              180           190         200         210         220

           240       250       260          270       280       290
pF1KE6 EVMGFLHGIFERLKQFLECSRSIGTDNVC---RDRLEKTIILFTKVLLDFLDQHPFSFTP
       . ... . : : ::  .  .:.. ....     :: :       :  : .: .       
NP_006 NQQNLTEWI-EILKTVV--NRDVPNETLQVEEDDRPELPWWKCKKWALHILAR-------
               230         240       250       260       270       

               300       310       320       330       340         
pF1KE6 LIQR-SLEFSVSYVFTEVGEGVTFERFIVQCMNLIKMIVKNYAYKPSKNFEDSSPETLEA
       :..: .   .::  ..: .: : .. : :  ....  ..  : :: .. .   .:..:. 
NP_006 LFERYGSPGNVSKEYNEFAE-VFLKAFAVGVQQVLLKVL--YQYKEKQYM---APRVLQQ
              280       290        300         310          320    

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pF1KE6 ------HKIKMAFF---TYPTLTEICRRLVSHYFLLTEEELTMWEEDPEGFTVEETGGDS
             . .. :.      : .  : . ..   .  :. .  .:.:::  .   .   : 
NP_006 TLNYINQGVSHALTWKNLKPHIQGIIQDVIFPLMCYTDADEELWQEDPYEYIRMKF--DV
          330       340       350       360       370       380    

                410       420       430       440       450        
pF1KE6 WKYSLRPCT--EVLFIDIFHEYNQTLTPVLLEMMQTLQGPTNVEDMNALLIKDAVYNAVG
       ..  . : :  ..:..    . ...:  ..   .: :  : :..  .    ::.. . .:
NP_006 FEDFISPTTAAQTLLFTACSKRKEVLQKTMGFCYQILTEP-NADPRK----KDGALHMIG
            390       400       410       420            430       

       460       470          480       490       500       510    
pF1KE6 -LAAYELFDSVDFDQW---FKNQLLPELQVIHNRYKPLRRRVIWLIGQWISVKFKSD--L
        ::   :  ..  ::    ..:...:   .. ..   .: :. :..  .  ::::::  :
NP_006 SLAEILLKKKIYKDQMEYMLQNHVFP---LFSSELGYMRARACWVLHYFCEVKFKSDQNL
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pF1KE6 RPMLYEAICNLLQDQDLVVRIETATTLKLTVDDFEFRTDQFLPYLETMFTLLFQLLQQVT
       .  :  .   :..:... :..:.: .:.. ... :   . . :... ..  :...... :
NP_006 QTALELTRRCLIDDREMPVKVEAAIALQVLISNQEKAKEYITPFIRPVMQALLHIIRE-T
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pF1KE6 ECDTKMHVLHVLSCVIERVNMQIRPYVGCLVQYLPLLWKQ----------SEEHNMLRCA
       : :   .:.. . :   . . .. : .  ..:.: . ..:          :... .   .
NP_006 ENDDLTNVIQKMIC---EYSEEVTPIAVEMTQHLAMTFNQVIQTGPDEEGSDDKAVTAMG
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pF1KE6 ILTTLIHLVQGLGADSKNLYPFLLPV-IQLSTDVSQPPHVYLLEDGLELW--LVTLENSP
       ::.: :  . ..  : :..   :  . .:.   : :   . . :. . :   :.  . ::
NP_006 ILNT-IDTLLSVVEDHKEITQQLEGICLQVIGTVLQQHVLEFYEEIFSLAHSLTCQQVSP
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pF1KE6 CI---TPELLRIFQNMSPLLELSSENLRTCFKIINGYIFLSSTEFLQTYAVGLCQSFCEL
        .    : ....::. .     .   :   .  ..   .::.:..:. .  ..:.   ..
NP_006 QMWQLLPLVFEVFQQDGFDYFTDMMPLLHNYVTVDTDTLLSDTKYLE-MIYSMCK---KV
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pF1KE6 LKEITTE-GQVQVLKVVENALKVNPILGPQMFQPIL-PYVFKGIIEGERYPVVMSTYLGV
       :  .. : .. .. :..:  .      : ..  :..   ... . .  .   . .  : :
NP_006 LTGVAGEDAECHAAKLLEVIILQCKGRGIDQCIPLFVEAALERLTREVKTSELRTMCLQV
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pF1KE6 MGRVLLQNTSFFSSLLNEMAHKFNQEMDQLLGNMIEMWVDRMDNITQPERRKLSALALLS
          .:  :  .. . :...  .: .... . ...: .:.. .: .   . ::. .:.: .
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pF1KE6 LLPSDN-SVIQDKFCGIINISVEGLHDVMTEDPETGTYKDCMLMSHLEEPKVTEDEEPPT
       :.  ..   . ..  : :  .      ..  .    .:  :    : :. . ..:..   
NP_006 LIDMEQIPQVLNQVSGQILPAF-----ILLFNGLKRAYA-C----HAEHENDSDDDDEAE
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pF1KE6 EQDKRKKMLALKDPVHTVSLQQFIYEKLKAQQEMLGEQGFQSLMETVDTEIVTQLQEFLQ
       ..:. ... . .: .   . :...  .. :.:   ::.: .   :  :.:          
NP_006 DDDETEELGSDEDDIDE-DGQEYL--EILAKQA--GEDGDDEDWEEDDAEETALEGYSTI
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        . .. .:::  .. : .   : ... ... ..    :  :   . . . :. ...    
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        .:.:    .  : . .: . ..   .   .:.  .:.:::  .   .   : ..    :
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NP_006 MDLNR----IIQALK--GTIDPKLRIAAENELNQSYKIINFAPSLLRIIVSDHVEFPVRQ
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NP_006 AAAIYLKNMVTQYWPDREPPPGEAIFPFNIHENDRQQIRDNIVEGIIRSPDLVRVQLTMC
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pF1KE6 IAKVARLDCPRQWPELIPTLIESVKVQDDLRQHRALLTFYHVTKTLASKRLAADRKLFYD
       .  . . : : .:: ..  .   .. :..     .:: .:...::   :. : .:.    
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NP_006 NQTMTTWMEIFRTIIDRTVPPETLHIDE--DDRPELVWWKCKKWALHIVARLFERYGSPG
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pF1KE6 CT--EVLFIDIFHEYNQTLTPVLLEMMQTLQGPTNVEDMNALLIKDAVYNAVG-LAAYEL
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NP_006 TTAAQTLLYTAAKKRKEVLPKMMAFCYQILTDP-NFDPRK----KDGALHVIGSLAEILL
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pF1KE6 FDSVDFDQ---WFKNQLLPELQVIHNRYKPLRRRVIWLIGQWISVKFKSDL--RPMLYEA
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NP_006 KKSLFKDQMELFLQNHVFPLLL---SNLGYLRARSCWVLHAFSSLKFHNELNLRNAVELA
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pF1KE6 ICNLLQDQDLVVRIETATTLKLTVDDFEFRTDQFL-PYLETMFTLLFQLLQQVTECDTKM
         .:..:... :..:.: .:.  ... .... ... :... ..  :...... :: :   
NP_006 KKSLIEDKEMPVKVEAALALQSLISN-QIQAKEYMKPHVRPIMQELLHIVRE-TENDDVT
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pF1KE6 HVLHVLSCVIERVNMQIRPYVGCLVQYLPLLWK---QSEEHNML--RCAILTTLIHLVQG
       .:.. . :   . ....   .  ..:.:  ..    ::.:.. .  . ..   ..: .. 
NP_006 NVIQKMIC---EYSQEVASIAVDMTQHLAEIFGKVLQSDEYEEVEDKTVMAMGILHTIDT
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pF1KE6 LGA---DSKNLYPFLLPVIQLSTDVSQPPHVY-LLEDGLELWLVTLENSPCITPELLRIF
       . .   : :..   :  .     :.    ::  . :. : :      .:  :.:.. ...
NP_006 ILTVVEDHKEITQQLENICLRIIDLVLQKHVIEFYEEILSLAYSLTCHS--ISPQMWQLL
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pF1KE6 QNMSPLLELSS-ENLRTCFKIINGYIFLSSTEFLQTYA-VGLCQSFCE--LLKEITTEGQ
         .  ... .  : .   . ....:. ...  .:..   . .  ..:.  :  .   ...
NP_006 GILYEVFQQDCFEYFTDMMPLLHNYVTIDTDTLLSNAKHLEILFTMCRKVLCGDAGEDAE
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pF1KE6 VQVLKVVENALKVNPILGPQMFQPIL-PYVFKGIIEGERYPVVMSTYLGVMGRVLLQNTS
        .. :..:  .      : ..  :..   :.. . .: .   . .  : :   .:  : .
NP_006 CHAAKLLEVIILQCKGRGIDQCIPLFVQLVLERLTRGVKTSELRTMCLQVAIAALYYNPD
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pF1KE6 FFSSLLNEMAHKFNQEMDQLLGNMIEMWVDRMDNITQPERRKLSALALLSLLPSDNSVIQ
       ..   :...    :     .  ..:..:..  : .   . ::.  ..:  ::  .:    
NP_006 LLLHTLERIQLPHNP--GPITVQFINQWMNDTDCFLGHHDRKMCIIGLSILLELQNRPPA
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pF1KE6 -DKFCGIINISVEGLHDVMTEDPETGTYKDCMLMSHLEEPKVTEDEEPPTEQDKRKKMLA
        :   : :  :.  :   . .   :    .    :. :.  . :.::  .....      
NP_006 VDAVVGQIVPSILFLFLGLKQVCATRQLVNREDRSKAEKADMEENEEISSDEEETNVTAQ
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pF1KE6 LKDPVHTVSLQQFIYEKLKAQQEMLGEQGFQSLMETVDTEIVTQLQEFLQGF        
                                                                   
NP_006 AMQSNNGRGEDEEEEDDDWDEEVLEETALEGFSTPLDLDNSVDEYQFFTQALITVQSRDA
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NP_038 MDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRIVQDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDE
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pF1KE6 NVRWLAVLYFKHGIDRYWRRVAPHALSEEEKTTLRAGLITNFNEPINQIATQIAVLIAKV
        .: :. : .:...  ...   : . .      ..   ..:...  . : . :..::. .
NP_038 PTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVAD-----FIKQECLNNIGDASSLIRATIGILITTI
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NP_038 ALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIAC---------------VNQFI--------M
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          ..... .  :.:   . ..  :   :  . ...... .: .: :  :  :.   ..:
NP_038 DRAQALMDNIDTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQ
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       :. .        .  . .: . . .  : .  . ..:: ..:... :        : . .
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pF1KE6 FEDSSPETLEAHKIKMAFFTYPTLTEICRRLVSHYFLLTEEELTMWEEDPEGFTVEETGG
        ... :..   . ::  :    :.:      . :     : :     :: :    ... .
NP_038 EDEAVPDS--EQDIKPRFHKSRTVT------LPH-----EAERPDGSEDAEDDDDDDALS
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pF1KE6 DSWKYSLRPCTEVLFIDIFHEYNQTLTPVLLEMMQTLQ-GPTNVEDMNALLIKDAVYNAV
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pF1KE6 --GLAAYELFDSVDFDQWFKNQLLPEL-QVIHNRYKPLRRRVIWLIGQ---WISVKFKSD
         :.. :              .:.:.: : . ..   .:  . : ...   :. :.   :
NP_038 MQGMVPYL------------PELIPHLIQCLSDKKALVRSIACWTLSRYAHWV-VSQPPD
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pF1KE6 --LRPMLYEAICNLLQDQDLVVRIETATTLKLTVDDFEFRTDQFLPYLETMF-TLLFQLL
         :.:.. : .  .:. .    :.. :.   ... . :  :. ..:::  .. ::.: . 
NP_038 MHLKPLMTELLKRILDGNK---RVQEAACSAFATLEEEACTE-LVPYLSYILDTLVFAFG
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       .   .  . . .  ... . . :. .. .: :.  :.  :   :.. ....     .:.:
NP_038 KY--QHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLIQKWNELKDEDKDLFPLLEC
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pF1KE6 AILTTLIHLVQ-GLGADSKNLYPFLLPVIQLSTD----VSQPPHVYLLEDGLELWLVTLE
         :...   .: :.    . .:   . ..: .       .: :. :   :  .. .:.:.
NP_038 --LSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHPEQYEAPDK-DFMIVALD
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pF1KE6 NSPCITPELLRIFQNM---SPLLELSSENLRTCFKIINGYIFLSSTEFLQTYAVGLCQSF
           ..  :    ...   : .. :  . ..  .  .    :    .. ..  . .   .
NP_038 LLSGLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEVRQSSFALLGDLTKACFIHVKPCI
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pF1KE6 CELLKEITTEGQVQVLKVVENAL-KVNPI---LGPQMFQPILPYVFKGIIEGERYPVVMS
        :..  . :. . . ..: .::   .. :   .: .: :: . .:.....:    : . .
NP_038 AEFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEM-QPYVQMVLNNLVEIINRPNTPK
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pF1KE6 TYLGVMGRVLLQNTSFFSSLLNEMAHKFNQEMDQLLGNMIEMWVDRMDNITQPERRKLSA
       :        ::.::..    ......   ::.  .: ..:. :   . :: . :. : ::
NP_038 T--------LLENTAI---TIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEE-KDSA
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       .  . .. . :  .:.::   ::  .                                  
NP_038 FRGICMMIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQVGEDNWQQFS
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pF1KE6    MDLNSASTVVLQVLTQATSQDTAVLKPAEEQLKQWETQPGFYSVLLNIFTN-HTLDI
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NP_001 MDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRIVQDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDE
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NP_001 ASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFG---------ALQKICEDSSELLD--SD
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NP_001 ALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIAC---------------VNQFI--------M
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pF1KE6 GFLHGIFERLKQFLE--CSRSIGTDNVCRDRLEKTIILFTKVLLDFLDQHPFSFTP-LIQ
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NP_001 DRAQALMDNIDTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQ
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pF1KE6 RSLEF-------SVSYVFTEVGEGVTFERFIVQCMNLIKMIVKNYAY--------KPSKN
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NP_001 RTQDHDENVALEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVE
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pF1KE6 FEDSSPETLEAHKIKMAFFTYPTLTEICRRLVSHYFLLTEEELTMWEEDPEGFTVEETGG
        ... :..   . ::  :    :.:      . :     : :     :: :    ... .
NP_001 EDEAVPDS--EQDIKPRFHKSRTVT------LPH-----EAERPDGSEDAEDDDDDDALS
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pF1KE6 DSWKYSLRPCTEVLFIDIFHEYNQTLTPVLLEMMQTLQ-GPTNVEDMNALLIKDAVYNAV
       : :  .:: :. . .  . . . . : : :: ... :   :  :   ...:.  :. .. 
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       .   .  . . .  ... . . :. .. .: :.  :.  :   :.. ....     .:.:
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