FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9396, 3969 aa 1>>>pF1KE9396 3969 - 3969 aa - 3969 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.7520+/-0.000487; mu= -7.7544+/- 0.031 mean_var=573.8586+/-120.712, 0's: 0 Z-trim(122.9): 206 B-trim: 614 in 1/59 Lambda= 0.053539 statistics sampled from 41581 (41798) to 41581 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.747), E-opt: 0.2 (0.49), width: 16 Scan time: 25.300 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005924 (OMIM: 159555,605130) histone-lysine N-m (3969) 26471 2062.2 0 NP_001184033 (OMIM: 159555,605130) histone-lysine (3972) 26455 2061.0 0 XP_011541133 (OMIM: 159555,605130) PREDICTED: hist (4002) 25529 1989.4 0 XP_011541131 (OMIM: 159555,605130) PREDICTED: hist (4005) 25504 1987.5 0 XP_011541132 (OMIM: 159555,605130) PREDICTED: hist (4004) 25485 1986.1 0 XP_006718902 (OMIM: 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AIGTNLRRFRAVFGESGGGGGSGELTTQIPCSWRTKGHIHDKKTEPFRLLAWSWCLNDEQ 130 140 150 160 170 180 >>XP_016883035 (OMIM: 606834) PREDICTED: histone-lysine (1703 aa) initn: 2963 init1: 1265 opt: 1674 Z-score: 714.9 bits: 146.5 E(85289): 4.4e-33 Smith-Waterman score: 3411; 32.4% identity (47.4% similar) in 2759 aa overlap (1224-3969:2-1703) 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE9 CQNLQWMPSKAYLQKQAKAVKKKEKKSKTSEKKDSKESSVVKNVV--DSSQKPTPSARED :. .: ..::... ::...: : XP_016 MERLAKKGRTIVKTLLPWDSDESPEASPGP- 10 20 30 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KE9 PAPKKSSSEPPPRKPVEEKSEEGNVSAPGPESKQATTPASRKSSKQ-VSQ-PALVIPPQP :.:..... ::. : :. :::: ... .:::... :.: :. : . XP_016 PGPRRGAGAGGPREEV--------VAHPGPEEQDSLL--QRKSARRCVKQRPSYDIFEDS 40 50 60 70 80 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KE9 PTTGPPRKEVPKTTPSEPKKKQPPPPESGPEQSKQKKVAPRPSIPVKQK---PKEKEKPP . : .:. :.... : :: :::. .: . .: . .: . :. : XP_016 DDSEPGGPPAPRRRT--PRENELPLPEP-EEQSRPRKPTLQPVLQLKARRRLDKDALAPG 90 100 110 120 130 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KE9 PVNKQENAGTLNILSTLSNGNSSKQKIPADGVHRIRVDFKEDCEAENVWEMGGLGILTSV : .... :: ..::: : :::::.::::::::. :::: ::::..:::: XP_016 P------------FASFPNGWTGKQKSP-DGVHRVRVDFKEDCDLENVWLMGGLSVLTSV 140 150 160 170 180 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KE9 PITPRVVCFLCASSGHVEFVYCQVCCEPFHKFCLEENERPLEDQLENWCCRRCKFCHVCG : : .::.::::.: :.:.:::::.::: ::::: :::: .. ..::::::::::::: XP_016 PGGPPMVCLLCASKGLHELVFCQVCCDPFHPFCLEEAERPLPQHHDTWCCRRCKFCHVCG 190 200 210 220 230 240 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KE9 RQHQATKQLLECNKCRNSYHPECLGPNYPTKPTKKKKVWICTKCVRCKSCGSTTPGKGWD :. ...:.::::..::..::: ::::.:::. :.:.. :::. ::::::::.: :::.:: XP_016 RKGRGSKHLLECERCRHAYHPACLGPSYPTRATRKRRHWICSACVRCKSCGAT-PGKNWD 250 260 270 280 290 300 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KE9 AQWSHDFSLCHDCAKLFAKGNFCPLCDKCYDDDDYESKMMQCGKCDRWVHSKCENLSDEM ..:: :.::: :..:. :::.::.: .::.:.:::::::::..::.:::.:::.:::: XP_016 VEWSGDYSLCPRCTQLYEKGNYCPICTRCYEDNDYESKMMQCAQCDHWVHAKCEGLSDED 310 320 330 340 350 360 1610 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KE9 YEILSNLPESVAYTCVNCTERHPAEWRLALEKELQISLKQVLTALLNSRTTSHLLRYRQA :::::.::.:: ::: :. .:: :: :: .:.::: .::.:.... :: : XP_016 YEILSGLPDSVLYTCGPCAGAAQPRWREALSGALQGGLRQVLQGLLSSKVVGPLLLCTQC 370 380 390 400 410 420 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KE9 AKPPDLNPETEESIPSRSSPEGPDPPVLTEVSKQDDQQPLDLEGVKRKMDQGNYTSVLEF ::: .:: : :..:......:.: :: : XP_016 ---------------------GPD-------GKQLHPGPCGLQAVSQRFEDGHYKSVHSF 430 440 450 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KE9 SDDIVKIIQAAINSDGGQPEIKKANSMVKSFFIRQMERVFPWFSVKKSRFWEPNKVSSNS .:.: :.. .:. :. ..:....:..... .: .: ::... ..:. . : XP_016 MEDMVGILMR--HSEEGETPDRRAGGQMKGLLLKLLESAFGWFDAHDPKYWRRSTRLPN- 460 470 480 490 500 510 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KE9 GMLPNAVLPPSLDHNYAQWQEREENSHTEQPPLMKKIIPAPKPKGPGEPDSPTPLHPPTP :.:::::::::::: ::::...: :..: .:: XP_016 GVLPNAVLPPSLDHVYAQWRQQE-------------------------PETPESGQPPGD 520 530 540 1850 1860 1870 1880 1890 1900 pF1KE9 PILSTDRSREDSPELNPPPGIEDNRQCALCLTYGDDSANDAGRLLYIGQNEWTHVNCALW : :. . .: .. .:: ::::::: ::: ....::::::::::::::::::.: XP_016 P--SAAFQGKDPAAFSH---LEDPRQCALCLKYGDADSKEAGRLLYIGQNEWTHVNCAIW 550 560 570 580 590 600 1910 1920 1930 1940 1950 1960 pF1KE9 SAEVFEDDDGSLKNVHMAVIRGKQLRCEFCQKPGATVGCCLTSCTSNYHFMCSRAKNCVF ::::::..:::::::: :: ::.:.:::.: ::::::::::.:: ::.::::.::. :.: XP_016 SAEVFEENDGSLKNVHAAVARGRQMRCELCLKPGATVGCCLSSCLSNFHFMCARASYCIF 610 620 630 640 650 660 1970 1980 1990 2000 2010 2020 pF1KE9 LDDKKVYCQRHRDLIKG-EVVPENGFEVFRRVFVDFEGISLRRKFLNGLEPENIHMMIGS :::::.::.: ::. : :.: .::.:.:::.::::::...::::.::::. :...::: XP_016 QDDKKVFCQKHTDLLDGKEIVNPDGFDVLRRVYVDFEGINFKRKFLTGLEPDAINVLIGS 670 680 690 700 710 720 2030 2040 2050 2060 2070 2080 pF1KE9 MTIDCLGILNDLSDCEDKLFPIGYQCSRVYWSTTDARKRCVYTCKIVECRP--PVVEPDI . :: :: :.:::::: .::::::::::.::::.:::.:: : :.:.: :: : :: XP_016 IRIDSLGTLSDLSDCEGRLFPIGYQCSRLYWSTVDARRRCWYRCRILEYRPWGPREEPAH 730 740 750 760 770 780 2090 2100 2110 2120 2130 2140 pF1KE9 NSTVEHDENRTIAHSPTSFTESSSKESQNTAEIISPPSPDRPPHSQTSGSCYYHVISKVP ..: ::.::.:::. .: ::. . :: . .. .: XP_016 LEAAE--ENQTIVHSPAPSSE--------------PPGGEDPPLDTDV------LVPGAP 790 800 810 820 2150 2160 2170 2180 2190 2200 pF1KE9 RIRTPSYSPTQR-SPGCRPLPSAGSPTPTTHEIVTVGDPLLSSGLRSIGSRRHSTSSLSP . .:: : .: :: :...: :. . :.: XP_016 E----RHSPIQNLDPPLRP-DSGSAPPPAPR-------------------------SFSG 830 840 850 2210 2220 2230 2240 2250 2260 pF1KE9 QRSKLRIMSPMRTGNTYSRNNVSSVSTTGTATDLESSAKVVDHVLGPLNSSTSLGQNTST : :. .:: :: ...:: .::: : : XP_016 ARIKVPNYSP-------SRRPLGGVS------------------FGPLPSPGS------- 860 870 2270 2280 2290 2300 2310 2320 pF1KE9 SSNLQRTVVTVGNKNSHLDGSSSSEMKQSSASDLVSKSSSLKGEKTKVLSSKSSEGSAHN :.: . . :::. 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XP_016 -TPTSGELAPPGPA------------------------PSPPPPEDLGPDFEDMEVVSGL 940 950 960 970 2630 2640 2650 2660 2670 2680 pF1KE9 ARSNMFFGLTPLYGVRSYGEEDIPFYSSSTGKKRGKRSAEGQVDGADDLSTSDEDDLYYY . ... :. . : :.. . :: . ... :...: : :.... :. : XP_016 SAADLDFAAS-LLGTEPFQEEIVA--AGAMGSSHG-----GPGDSSEEESSPTS---RYI 980 990 1000 1010 1020 2690 2700 2710 2720 2730 2740 pF1KE9 NFTRTVISSGGEERLASHNLFREEEQCDLPKISQLDGVDDGTESDTSVTATTRKSSQIPK .: ::.:. : :. . :.: :::::::::.:.. .. : :. XP_016 HFPVTVVSAPGLAPSATPGA---------PRIEQLDGVDDGTDSEA-------EAVQQPR 1030 1040 1050 1060 2750 2760 2770 2780 2790 2800 pF1KE9 RNGKENGTENLKIDRPEDAGEKEHVTKSSVGHKNEPKMDNCHSVSRVKTQGQDSLEAQLS .: : : . . ...: . .: XP_016 GQGTP----------PSGPGVVRAGVLGAAGDRARP------------------------ 1070 1080 1090 2810 2820 2830 2840 2850 2860 pF1KE9 SLESSRRVHTSTPSDKNLLDTYNTELLKSDSDNNNSDDCGNILPSDIMDFVLKNTPSMQA : : :::.:.:::::: XP_016 ------------PED---------------------------LPSEIVDFVLKN------ 1100 2870 2880 2890 2900 2910 2920 pF1KE9 LGESPESSSSELLNLGEGLGLDSNREKDMGLFEVFSQQLPTTEPVDSSVSSSISAEEQFE :: : : : . :: ..:: . :. .. 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XP_011 KMA---GEGEPVP--PPVKQPP---------LPPT---------ISPTAPTSWTLPPGPL 2020 2030 2040 2050 3160 3170 3180 3190 3200 3210 pF1KE9 KGLLPMSHHQHLHSFPAATQSSFPPNISNPPSGLLIGVQPPPDPQLLVSESSQRTDLSTT :.::. . :: :: ::: : :: ::. XP_011 LGVLPVVGVVR----PA------------PP--------PPPPPLTLV--------LSSG 2060 2070 3220 3230 3240 3250 3260 3270 pF1KE9 VATPSSGLKKRPISRLQTRKNKKLAPSSTPSNIAPSDVVSNMTLINFTPSQLPNHPSLLD :.: : . ..... . .. : : :: : . XP_011 PASP-------PRQAIRVKRVSTFSGRSPP---APP------------PYK--------- 2080 2090 2100 3280 3290 3300 3310 3320 3330 pF1KE9 LGSLNTSSHRTVPNIIKRSKSSIMYFEPAPLLPQSVGGTAATAAGTSTISQDTSHLTSGS :: : .. : : :.:: . 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