FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9407, 333 aa
1>>>pF1KE9407 333 - 333 aa - 333 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2848+/-0.00107; mu= 16.0082+/- 0.064
mean_var=113.0658+/-32.169, 0's: 0 Z-trim(103.0): 246 B-trim: 426 in 1/48
Lambda= 0.120617
statistics sampled from 6907 (7211) to 6907 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 2.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX ( 333) 2280 408.4 4.2e-114
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CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 663 127.1 2.3e-29
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 634 122.0 7.1e-28
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 596 115.4 6.9e-26
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CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 526 103.3 3.5e-22
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CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 478 94.8 1.1e-19
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY ( 359) 467 92.9 4.1e-19
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 467 92.9 4.1e-19
CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3 ( 334) 459 91.5 1e-18
CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 ( 328) 455 90.8 1.6e-18
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CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 446 89.3 5.3e-18
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CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 443 88.8 7.8e-18
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 436 87.6 1.8e-17
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CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 419 84.6 1.3e-16
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CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 ( 387) 403 81.8 9.7e-16
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 400 81.3 1.4e-15
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CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 393 80.1 3.2e-15
CCDS3159.1 P2RY12 gene_id:64805|Hs108|chr3 ( 342) 392 79.9 3.4e-15
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 390 79.6 4.5e-15
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CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 390 79.6 4.9e-15
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 390 79.6 4.9e-15
CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 ( 358) 389 79.4 5e-15
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 390 79.7 5.1e-15
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 389 79.4 5.1e-15
>>CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX (333 aa)
initn: 2280 init1: 2280 opt: 2280 Z-score: 2162.1 bits: 408.4 E(32554): 4.2e-114
Smith-Waterman score: 2280; 100.0% identity (100.0% similar) in 333 aa overlap (1-333:1-333)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MPANYTCTRPDGDNTDFRYFIYAVTYTVILVPGLIGNILALWVFYGYMKETKRAVIFMIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MPANYTCTRPDGDNTDFRYFIYAVTYTVILVPGLIGNILALWVFYGYMKETKRAVIFMIN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LAIADLLQVLSLPLRIFYYLNHDWPFGPGLCMFCFYLKYVNMYASIYFLVCISVRRFWFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LAIADLLQVLSLPLRIFYYLNHDWPFGPGLCMFCFYLKYVNMYASIYFLVCISVRRFWFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 MYPFRFHDCKQKYDLYISIAGWLIICLACVLFPLLRTSDDTSGNRTKCFVDLPTRNVNLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MYPFRFHDCKQKYDLYISIAGWLIICLACVLFPLLRTSDDTSGNRTKCFVDLPTRNVNLA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 QSVVMMTIGELIGFVTPLLIVLYCTWKTVLSLQDKYPMAQDLGEKQKALKMILTCAGVFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QSVVMMTIGELIGFVTPLLIVLYCTWKTVLSLQDKYPMAQDLGEKQKALKMILTCAGVFL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 ICFAPYHFSFPLDFLVKSNEIKSCLARRVILIFHSVALCLASLNSCLDPVIYYFSTNEFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ICFAPYHFSFPLDFLVKSNEIKSCLARRVILIFHSVALCLASLNSCLDPVIYYFSTNEFR
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE9 RRLSRQDLHDSIQLHAKSFVSNHTASTMTPELC
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RRLSRQDLHDSIQLHAKSFVSNHTASTMTPELC
310 320 330
>>CCDS14442.1 P2RY10 gene_id:27334|Hs108|chrX (339 aa)
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Smith-Waterman score: 1068; 49.7% identity (79.1% similar) in 316 aa overlap (14-328:29-337)
10 20 30 40
pF1KE9 MPANYTCTRPDGDNTDFRYFIYAVTYTVILVPGLIGNILALWVFY
:. :.: .::.:: .:..:::..: ::::.
CCDS14 MANLDKYTETFKMGSNSTSTAEIYCNVTNVKFQYSLYATTYILIFIPGLLANSAALWVLC
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 GYMKETKRAVIFMINLAIADLLQVLSLPLRIFYYLNHDWPFGPGLCMFCFYLKYVNMYAS
.... ..:.::::::..::: .::::::::.::..: ::: .::..::::::.:::::
CCDS14 RFISKKNKAIIFMINLSVADLAHVLSLPLRIYYYISHHWPFQRALCLLCFYLKYLNMYAS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 IYFLVCISVRRFWFLMYPFRFHDCKQKYDLYISIAGWLIICLACVLFPLLRTSDDTSGNR
: ::.:::..: .::. ::: .: :..::. :: : :... ::. ::.:: : : ..:.
CCDS14 ICFLTCISLQRCFFLLKPFRARDWKRRYDVGISAAIWIVVGTACLPFPILR-STDLNNNK
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 TKCFVDLPTRNVNLAQSVVMMTIGELIGFVTPLLIVLYCTWKTVLSLQDKYPMA-QDLGE
. ::.:: ...: . : :.:..:: ::: :..:. .:::::..::. . ::: : ..:
CCDS14 S-CFADLGYKQMNAVALVGMITVAELAGFVIPVIIIAWCTWKTTISLR-QPPMAFQGISE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 KQKALKMILTCAGVFLICFAPYHFSFPLDFLVKSNEIKSCLARRVILIFHSVALCLASLN
.::::.:.. ::.::.:::.:::..: . .:: . :.:: . :. : :: ::::::
CCDS14 RQKALRMVFMCAAVFFICFTPYHINFIFYTMVKETIISSCPVVRIALYFHPFCLCLASLC
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE9 SCLDPVIYYFSTNEFRRRLSRQDLHDSIQLHAKSFVSNHTASTMTPELC
:::..::: ..::: .::: : : ... ..:....:.:
CCDS14 CLLDPILYYFMASEFRDQLSR---HGSSVTRSR-LMSKESGSSMIG
300 310 320 330
>>CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX (370 aa)
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Smith-Waterman score: 663; 34.2% identity (64.5% similar) in 330 aa overlap (3-332:27-346)
10 20 30
pF1KE9 MPANYTCTRPDGDNTDFRYFIYAVTYTVILVPGLIG
:: :: :. :.: . ...:.:... :::
CCDS14 MGDRRFIDFQFQDSNSSLRPRLGNATANNTCIVDDS----FKYNLNGAVYSVVFILGLIT
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 NILALWVFYGYMKETKRAVIFMINLAIADLLQVLSLPLRIFYYLNHDWPFGPGLCMFCFY
: ..:.:: :: ....::. :::..::: : .::..::: .:. :::: :: .
CCDS14 NSVSLFVFCFRMKMRSETAIFITNLAVSDLLFVCTLPFKIFYNFNRHWPFGDTLCKISGT
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100 110 120 130 140 150
pF1KE9 LKYVNMYASIYFLVCISVRRFWFLMYPFRFHDCKQKYDLYISIAGWLIICLACVLFPLLR
.:.:.:. ::.:::: :: ..:::: . . . . : :: :. :. . :
CCDS14 AFLTNIYGSMLFLTCISVDRFLAIVYPFRSRTIRTRRNSAIVCAGVWILVLSGGISASLF
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 TSDDTSGNRTKCFVDLPTRNVNLAQSVVMMTIGELIGFVTPLLIVLYCTWKTVLSLQDKY
.. .... : :: . : . : . . : :..::. ::.. . :. .. .:.
CCDS14 STTNVNNATTTCFEGFSKRVWKTYLSKITIFI-EVVGFIIPLILNVSCSSVVLRTLRKPA
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 PMAQDLGEKQKALKMILTCAGVFLICFAPYHFSFPLDFLVKSNEIKSCLARRVILIFHSV
..: .:.:.:::: . .::..::.::. . : ::.:. : .:. .: :.. .
CCDS14 TLSQIGTNKKKVLKMITVHMAVFVVCFVPYNSVLFLYALVRSQAITNCFLERFAKIMYPI
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280 290 300 310 320 330
pF1KE9 ALCLASLNSCLDPVIYYFSTNEFRRRLSRQDLHDSIQLHAKSFVSNHTASTMTPELC
.::::.:: :.:: ::::. . :.. ... . ... .:. ...: : : :
CCDS14 TLCLATLNCCFDPFIYYFTLESFQK-----SFYINAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAIQ
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CCDS14 EEVSDQTTNNGGELMLESTF
360 370
>>CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 (344 aa)
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Smith-Waterman score: 634; 31.0% identity (68.1% similar) in 329 aa overlap (14-332:12-337)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MPANYTCTRPDGDNTDFRYFIYAVTYTVILVPGLIGNILALWVFYGYMKETKRAVIFMIN
: .:.: .:. .....: :::.: .:...: .: .... .:::
CCDS94 MVSVNSSHCFYNDSFKYTLYGCMFSMVFVLGLISNCVAIYIFICVLKVRNETTTYMIN
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pF1KE9 LAIADLLQVLSLPLRIFYYLNHDWPFGPGLCMFCFYLKYVNMYASIYFLVCISVRRFWFL
::..::: :..::.::::. ...:::: :: . .: :.:::.:: ::.:::: :: .
CCDS94 LAMSDLLFVFTLPFRIFYFTTRNWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGSILFLTCISVDRFLAI
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pF1KE9 MYPFRFHDCKQKYDLYISIAG-WLIICLACVLFPLLRTSDDTSGNRTK-CFVDLPTRNVN
.:::. . . : . : .: :: . . . ..... . ..: .. :: ..: . .
CCDS94 VYPFKSKTLRTKRNAKIVCTGVWLTVIGGSAPAVFVQSTHSQGNNASEACFENFPEATWK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 LAQSVVMMTIGELIGFVTPLLIVLYCTWKTVLSLQDKYPMAQDLGEKQKALKMILTCAGV
: ... : :..:: ::.. . :. .. .: .... .: :.::::.. .
CCDS94 TYLSRIVIFI-EIVGFFIPLILNVTCSSMVLKTLTKPVTLSRSKINKTKVLKMIFVHLII
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 FLICFAPYHFSFPLDFLVKSNEIKSCLARRVILIFHSVALCLASLNSCLDPVIYYFSTNE
: .::.::.... : ::... . .: . .. .. ..::.: : :.::..:::...
CCDS94 FCFCFVPYNINLILYSLVRTQTFVNCSVVAAVRTMYPITLCIAVSNCCFDPIVYYFTSDT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE9 FRRRLS-------RQDLHDSIQLH-AKSFVSNHTASTMTPELC
.. .. :.:.. : ..: :..:.. :. .:. ..
CCDS94 IQNSIKMKNWSVRRSDFRFS-EVHGAENFIQ-HNLQTLKSKIFDNESAA
300 310 320 330 340
>>CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX (337 aa)
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Smith-Waterman score: 596; 33.4% identity (64.1% similar) in 320 aa overlap (16-331:20-329)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MPANYTCTRPDGDNTDFRYFIYAVTYTVILVPGLIGNILALWVFYGYMKETKRAVI
::: .:.. :..: : :..:: ..:.:. ... . .
CCDS14 MDETGNLTVSSATCHDTIDDFRNQVYSTLYSMISVVGFFGNGFVLYVLIKTYHKKSAFQV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 FMINLAIADLLQVLSLPLRIFYYLNHD-WPFGPGLCMFCFYLKYVNMYASIYFLVCISVR
.:::::.:::: : .::::. ::... : :: :: . : :::.: ::.:.. .:
CCDS14 YMINLAVADLLCVCTLPLRVVYYVHKGIWLFGDFLCRLSTYALYVNLYCSIFFMTAMSFF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 RFWFLMYPFR-FHDCKQKYDLYISIAGWLIICLACVLFPLLRTSDDTSGNRTKCFVDLPT
: ...: . .. :: .. .. :... :. : . . . : ..: :::: . :
CCDS14 RCIAIVFPVQNINLVTQKKARFVCVGIWIFVILTSSPFLMAKPQKDEKNN-TKCF-EPPQ
130 140 150 160 170
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pF1KE9 RNVNLAQSVVMMTIGELIGFVTPLLIVLYCTWKTVLSLQDKYPMAQDLGEKQKALKMILT
: . . .:. .. ..::. :..:.. : .:.: : : ..:. ..::. ::..
CCDS14 DNQTKNHVLVLHYVSLFVGFIIPFVIIIVCYTMIILTLLKK-SMKKNLSSHKKAIGMIMV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 CAGVFLICFAPYHFSFPLDFLVKSNEIKSCLARRVILIFHSVA--LCLASLNSCLDPVIY
...::. : :::.. . . :: : : . :. . .::. : ::. : :.::..:
CCDS14 VTAAFLVSFMPYHIQRTIHLHFLHNETKPCDS--VLRMQKSVVITLSLAASNCCFDPLLY
240 250 260 270 280 290
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pF1KE9 YFSTNEFRRRLSRQDLHDSIQLHAKSFVSNHTASTMTPELC
.:: ..::.::: :. : . ..: . :: ::
CCDS14 FFSGGNFRKRLSTFRKHS---LSSVTYVPRKKAS--LPEKGEEICKV
300 310 320 330
>>CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 (367 aa)
initn: 361 init1: 211 opt: 556 Z-score: 540.2 bits: 108.4 E(32554): 9e-24
Smith-Waterman score: 558; 31.8% identity (62.6% similar) in 321 aa overlap (12-329:52-362)
10 20 30 40
pF1KE9 MPANYTCTRPDGDNTDFRYFIYAVTYTVILVPGLIGNILAL
:..: .. ...: : . .. .:.:: :::
CCDS21 GSDSSQSMNGLEVAPPGLITNFSLATAEQCGQETPLENMLFASFYLLDFILALVGNTLAL
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90
pF1KE9 WVFYGYMKETKRAVIFMINLAIADLLQVLSLPLRIFYYL--NHDWPFGPGLCMFCFYLKY
:.: : : .:...::.::: :: :: :. :.. :: :::: : . .: :
CCDS21 WLFIRDHKSGTPANVFLMHLAVADLSCVLVLPTRLVYHFSGNH-WPFGEIACRLTGFLFY
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 VNMYASIYFLVCISVRRFWFLMYPFRFHDCKQKYDLYISIA-GWLIICLACVLFPLLRTS
.:::::::::.:::. :: ...: . . : . :: .: ..: . .: .. ::: .
CCDS21 LNMYASIYFLTCISADRFLAIVHPVK--SLKLRRPLYAHLACAFLWVVVAVAMAPLLVSP
150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 DDTSGNRTKCFVDLPTRNVNLAQSVVMMTIGELIGFVTPLLIVLYCTWKTVLSLQDKYPM
. .. :.: ..: :. ...: .... :. :.. .. : . ::.. .
CCDS21 QTVQTNHTVVCLQL-YREKASHHALVSLAVA----FTFPFITTVTCYLLIIRSLRQGLRV
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 AQDLGEKQKALKMILTCAGVFLICFAPYHFSFPLDFLVKSNEIKSCLARRVILIFHSVAL
. : : ::..:: ..::.::.::: . . : .. :: ..:.. . . ..
CCDS21 EKRL--KTKAVRMIAIVLAIFLVCFVPYHVNRSVYVLHYRSHGASCATQRILALANRITS
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280 290 300 310 320 330
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::.:::. :::..:.: ...::. : .. :: .. . :...
CCDS21 CLTSLNGALDPIMYFFVAEKFRHALCNLLCGKRLKGPPPSFEGKTNESSLSAKSEL
320 330 340 350 360
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50 60 70 80 90 100
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CCDS14 IFRLRPWDATATYMFHLALSDTLYVLSLPTLIYYYAAHNHWPFGTEICKFVRFLFYWNLY
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CCDS14 CSVLFLTCISVHRYLGICHPLRALRWGRPRLAGLLCLAVWLVVA-GCLVPNLFFVTTSNK
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:. . : .. . ..: :.: .: :..: : . : . : . .
CCDS14 GTTVLCHDTTRPEEFDHYVHFSSAVMGLLFG--VPCLVTLVCYGLMARRLYQPLPGSAQS
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230 240 250 260 270 280
pF1KE9 GEKQKALKMILTCAGVFLICFAPYHFSFPLDFLVKSNEIKSCLARRVILIFHSVALCLAS
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CCDS14 SSRLRSLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLARLLEA-DCRVLNIVNVVYKVTRPLAS
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CCDS14 ANSCLDPVLYLLTGDKYRRQL-RQLCGGGKPQPRTAASSLALVSLPEDSSCRWAATPQDS
300 310 320 330 340 350
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CCDS31 FLAGPGSSWGNSTVASTAAVSSSFKCALTKTGFQFYYLPAVYILVFIIGFLGNSVAIWMF
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50 60 70 80 90 100
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CCDS31 VFHMKPWSGISVYMFNLALADFLYVLTLPALIFYYFNKTDWIFGDAMCKLQRFIFHVNLY
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110 120 130 140 150 160
pF1KE9 ASIYFLVCISVRRFWFLMYPFR-FHDCKQKYDLYISIAGWLIICLACVLFPLLRTSDDTS
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CCDS31 GSILFLTCISAHRYSGVVYPLKSLGRLKKKNAICISVLVWLIVVVA--ISPILFYSG-TG
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170 180 190 200 210 220
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CCDS31 VRKNKTITCYDTTSDEYLRSYFIYSMCTTVAMFCVPLVLILGCYGLIVRALIYKDLDNSP
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230 240 250 260 270
pF1KE9 LGEKQKALKMILTCAGVFLICFAPYHFSFPLDFLVKSN--EIKSCLARRVILIFHSVALC
: ..:.. ... :: . . :.: ... .. . : . ..:.
CCDS31 L--RRKSIYLVIIVLTVFAVSYIPFHVMKTMNLRARLDFQTPAMCAFNDRVYATYQVTRG
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280 290 300 310 320 330
pF1KE9 LASLNSCLDPVIYYFSTNEFRRRLSRQDLHDSIQLHAKSFVSNHTASTMTPELC
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CCDS31 LASLNSCVDPILYFLAGDTFRRRLSRATRKASRRSEANLQSKSEDMTLNILPEFKQNGDT
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CCDS40 AVIYMANLALADLLSVIWFPLKIAYHIHGNNWIYGEALCNVLIGFFYGNMYCSILFMTCL
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pF1KE9 SVRRFWFLMYPFRFHDCKQKYDLYISIAGWLIICLACV-LFPLLRTSDDTSGNRTKCFVD
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CCDS40 SVQRYWVIVNPMGHSRKKANIAIGISLAIWLLILLVTIPLYVVKQTIFIPALNITTCHDV
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CCDS40 LPEQL--LVGDMFNYFLSLAIGVFLFPAFLTA-SAYVLMIRMLRSSAMDENSEKKRKRAI
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CCDS40 KLIVTVLAMYLICFTPSNLLLVVHYFLIKSQ------GQSHVYALYIVALCLSTLNSCID
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CCDS40 PFVYYFVSHDFRDHAKNALLCRSVRTVKQMQVSLTSKKHSRKSSSYSSSSTTVKTSY
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CCDS94 MDIQMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNR
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CCDS94 KKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYAGVN
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CCDS94 FMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILV-FAQTLPLLINPMSKQEAERI
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CCDS94 TC-MEYP--NFEETKSLPWILLGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLTEKS
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CCDS94 GVNKKALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAI-IQHMIKKLRFSNFLE-CSQRHSFQISLHFTV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]