FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9442, 967 aa
1>>>pF1KE9442 967 - 967 aa - 967 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6375+/-0.000896; mu= 22.4453+/- 0.055
mean_var=139.6356+/-30.123, 0's: 0 Z-trim(111.2): 203 B-trim: 664 in 1/52
Lambda= 0.108537
statistics sampled from 12093 (12328) to 12093 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.706), E-opt: 0.2 (0.369), width: 16
Scan time: 2.380
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs109|chr1 ( 967) 6538 1036.3 0
CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs109|chr1 ( 915) 6010 953.6 0
CCDS30972.1 LGR6 gene_id:59352|Hs109|chr1 ( 828) 5041 801.8 0
CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs109|chr12 ( 907) 3297 528.7 2e-149
CCDS61195.1 LGR5 gene_id:8549|Hs109|chr12 ( 835) 2616 422.1 2.4e-117
CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs109|chr12 ( 883) 2381 385.3 2.9e-106
CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs109|chr11 ( 951) 1676 275.0 5.2e-73
CCDS86187.1 LGR4 gene_id:55366|Hs109|chr11 ( 927) 1499 247.2 1.1e-64
CCDS1844.2 FSHR gene_id:2492|Hs109|chr2 ( 669) 627 110.5 1.2e-23
CCDS1842.1 LHCGR gene_id:3973|Hs109|chr2 ( 699) 567 101.1 8.2e-21
CCDS1843.1 FSHR gene_id:2492|Hs109|chr2 ( 695) 550 98.5 5.2e-20
CCDS55602.1 PODN gene_id:127435|Hs109|chr1 ( 642) 519 93.6 1.4e-18
CCDS573.1 PODN gene_id:127435|Hs109|chr1 ( 661) 519 93.6 1.4e-18
CCDS45905.1 LINGO3 gene_id:645191|Hs109|chr19 ( 592) 472 86.2 2.2e-16
CCDS3307.1 GP5 gene_id:2814|Hs109|chr3 ( 560) 468 85.5 3.3e-16
CCDS9872.1 TSHR gene_id:7253|Hs109|chr14 ( 764) 466 85.4 5e-16
CCDS47272.1 LRRTM2 gene_id:26045|Hs109|chr5 ( 516) 441 81.2 5.9e-15
CCDS9039.1 DCN gene_id:1634|Hs109|chr12 ( 359) 434 79.9 1e-14
CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs109|chr3 ( 581) 434 80.2 1.4e-14
CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs109|chr3 ( 587) 434 80.2 1.4e-14
CCDS30855.1 LINGO4 gene_id:339398|Hs109|chr1 ( 593) 427 79.1 2.9e-14
CCDS44933.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs109|chr12 (1059) 414 77.4 1.7e-13
CCDS1966.1 LRRTM1 gene_id:347730|Hs109|chr2 ( 522) 410 76.4 1.7e-13
CCDS8960.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs109|chr12 (1119) 414 77.4 1.8e-13
CCDS42595.1 LRRC4B gene_id:94030|Hs109|chr19 ( 713) 401 75.1 5.5e-13
CCDS73766.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs109|chr15 ( 614) 399 74.7 6.3e-13
CCDS45313.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs109|chr15 ( 620) 399 74.8 6.3e-13
CCDS7270.1 LRRTM3 gene_id:347731|Hs109|chr10 ( 581) 392 73.6 1.3e-12
CCDS46715.1 CHADL gene_id:150356|Hs109|chr22 ( 762) 391 73.6 1.7e-12
CCDS13777.1 RTN4R gene_id:65078|Hs109|chr22 ( 473) 388 72.9 1.8e-12
CCDS47218.1 LRRC70 gene_id:100130733|Hs109|chr5 ( 622) 382 72.1 4e-12
CCDS5799.1 LRRC4 gene_id:64101|Hs109|chr7 ( 653) 380 71.8 5.1e-12
CCDS31464.1 LRRC4C gene_id:57689|Hs109|chr11 ( 640) 368 69.9 1.9e-11
CCDS12300.2 PODNL1 gene_id:79883|Hs109|chr19 ( 505) 366 69.5 2e-11
CCDS54226.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs109|chr19 ( 510) 366 69.5 2e-11
CCDS14721.1 BGN gene_id:633|Hs109|chrX ( 368) 362 68.7 2.5e-11
CCDS1448.1 LRRN2 gene_id:10446|Hs109|chr1 ( 713) 365 69.5 2.7e-11
CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs109|chr6 ( 524) 363 69.0 2.8e-11
CCDS6524.1 LINGO2 gene_id:158038|Hs109|chr9 ( 606) 354 67.7 8.2e-11
>>CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs109|chr1 (967 aa)
initn: 6538 init1: 6538 opt: 6538 Z-score: 5538.8 bits: 1036.3 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 6538; 99.9% identity (100.0% similar) in 967 aa overlap (1-967:1-967)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MPSPPGLRALWLCAALCASRRAGGAPQPGPGPTACPAPCHCQEDGIMLSADCSELGLSAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MPSPPGLRALWLCAALCASRRAGGAPQPGPGPTACPAPCHCQEDGIMLSADCSELGLSAV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 PGDLDPLTAYLDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKILM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PGDLDPLTAYLDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKILM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLVPERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLVPERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPVR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 ALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLVVLHLHNNRIQHLGTHSFEGLHNLETLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLVVLHLHNNRIQHLGTHSFEGLHNLETLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 FQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLELS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 HNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 LHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQCC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 PYGMCASFFKASGQWEAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEMEDSKPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PYGMCASFFKASGQWEAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEMEDSKPH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 PSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPAPLPPVKFV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS30 PSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPVPLPPVKFV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 VGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASVLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASVLLL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 TLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLCLPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLCLPY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 APPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAWLIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 APPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAWLIF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 ADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDDLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDDLRR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 LRPRAGDSGPLAYAAAGELEKSSCDSTQALVAFSDVDLILEASEAGRPPGLETYGFPSVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LRPRAGDSGPLAYAAAGELEKSSCDSTQALVAFSDVDLILEASEAGRPPGLETYGFPSVT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 LISCQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGGGLSGGGGFQPSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LISCQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGGGLSGGGGFQPSG
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 LAFASHV
:::::::
CCDS30 LAFASHV
>>CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs109|chr1 (915 aa)
initn: 6010 init1: 6010 opt: 6010 Z-score: 5092.3 bits: 953.6 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 6010; 99.9% identity (100.0% similar) in 896 aa overlap (72-967:20-915)
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 QEDGIMLSADCSELGLSAVPGDLDPLTAYLDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MGRPRLTLVCQVSIIISARDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNH
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 LSHIPGQAFSGLYSLKILMLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLVPERSFEGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LSHIPGQAFSGLYSLKILMLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLVPERSFEGL
50 60 70 80 90 100
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 SSLRHLWLDDNALTEIPVRALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLVVLHLHNNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SSLRHLWLDDNALTEIPVRALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLVVLHLHNNR
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 IQHLGTHSFEGLHNLETLDLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IQHLGTHSFEGLHNLETLDLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNP
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 LLQTIHFYDNPIQFVGRSAFQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLQTIHFYDNPIQFVGRSAFQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIR
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 LLPSGMCQQLPRLRVLELSHNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLPSGMCQQLPRLRVLELSHNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQ
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KE9 ALDLSWNAIRSIHPEAFSTLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ALDLSWNAIRSIHPEAFSTLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFS
350 360 370 380 390 400
470 480 490 500 510 520
pF1KE9 KDSFPKLRILEVPYAYQCCPYGMCASFFKASGQWEAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KDSFPKLRILEVPYAYQCCPYGMCASFFKASGQWEAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAEN
410 420 430 440 450 460
530 540 550 560 570 580
pF1KE9 HYDQDLDELQLEMEDSKPHPSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HYDQDLDELQLEMEDSKPHPSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGL
470 480 490 500 510 520
590 600 610 620 630 640
pF1KE9 VLLTVFAGGPAPLPPVKFVVGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYGARWETGLG
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VLLTVFAGGPVPLPPVKFVVGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYGARWETGLG
530 540 550 560 570 580
650 660 670 680 690 700
pF1KE9 CRATGFLAVLGSEASVLLLTLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CRATGFLAVLGSEASVLLLTLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAA
590 600 610 620 630 640
710 720 730 740 750 760
pF1KE9 ALPLASVGEYGASPLCLPYAPPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ALPLASVGEYGASPLCLPYAPPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRG
650 660 670 680 690 700
770 780 790 800 810 820
pF1KE9 DFEAVWDCAMVRHVAWLIFADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DFEAVWDCAMVRHVAWLIFADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPAC
710 720 730 740 750 760
830 840 850 860 870 880
pF1KE9 LNPLLYLLFNPHFRDDLRRLRPRAGDSGPLAYAAAGELEKSSCDSTQALVAFSDVDLILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LNPLLYLLFNPHFRDDLRRLRPRAGDSGPLAYAAAGELEKSSCDSTQALVAFSDVDLILE
770 780 790 800 810 820
890 900 910 920 930 940
pF1KE9 ASEAGRPPGLETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ASEAGRPPGLETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAE
830 840 850 860 870 880
950 960
pF1KE9 GSTPAGGGLSGGGGFQPSGLAFASHV
::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GSTPAGGGLSGGGGFQPSGLAFASHV
890 900 910
>>CCDS30972.1 LGR6 gene_id:59352|Hs109|chr1 (828 aa)
initn: 5041 init1: 5041 opt: 5041 Z-score: 4272.7 bits: 801.8 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 5187; 89.2% identity (89.3% similar) in 896 aa overlap (72-967:29-828)
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 QEDGIMLSADCSELGLSAVPGDLDPLTAYLDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MRLEGEGRSARAGQNLSRAGSARRGAPRDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNH
10 20 30 40 50
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 LSHIPGQAFSGLYSLKILMLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLVPERSFEGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LSHIPGQAFSGLYSLKILMLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSL------------------
60 70 80 90 100
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 SSLRHLWLDDNALTEIPVRALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLVVLHLHNNR
CCDS30 ------------------------------------------------------------
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 IQHLGTHSFEGLHNLETLDLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ------------------DLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNP
110 120 130 140
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 LLQTIHFYDNPIQFVGRSAFQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LLQTIHFYDNPIQFVGRSAFQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIR
150 160 170 180 190 200
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 LLPSGMCQQLPRLRVLELSHNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LLPSGMCQQLPRLRVLELSHNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQ
210 220 230 240 250 260
410 420 430 440 450 460
pF1KE9 ALDLSWNAIRSIHPEAFSTLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ALDLSWNAIRSIHPEAFSTLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFS
270 280 290 300 310 320
470 480 490 500 510 520
pF1KE9 KDSFPKLRILEVPYAYQCCPYGMCASFFKASGQWEAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KDSFPKLRILEVPYAYQCCPYGMCASFFKASGQWEAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAEN
330 340 350 360 370 380
530 540 550 560 570 580
pF1KE9 HYDQDLDELQLEMEDSKPHPSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HYDQDLDELQLEMEDSKPHPSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGL
390 400 410 420 430 440
590 600 610 620 630 640
pF1KE9 VLLTVFAGGPAPLPPVKFVVGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYGARWETGLG
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VLLTVFAGGPVPLPPVKFVVGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYGARWETGLG
450 460 470 480 490 500
650 660 670 680 690 700
pF1KE9 CRATGFLAVLGSEASVLLLTLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CRATGFLAVLGSEASVLLLTLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAA
510 520 530 540 550 560
710 720 730 740 750 760
pF1KE9 ALPLASVGEYGASPLCLPYAPPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ALPLASVGEYGASPLCLPYAPPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRG
570 580 590 600 610 620
770 780 790 800 810 820
pF1KE9 DFEAVWDCAMVRHVAWLIFADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DFEAVWDCAMVRHVAWLIFADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPAC
630 640 650 660 670 680
830 840 850 860 870 880
pF1KE9 LNPLLYLLFNPHFRDDLRRLRPRAGDSGPLAYAAAGELEKSSCDSTQALVAFSDVDLILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LNPLLYLLFNPHFRDDLRRLRPRAGDSGPLAYAAAGELEKSSCDSTQALVAFSDVDLILE
690 700 710 720 730 740
890 900 910 920 930 940
pF1KE9 ASEAGRPPGLETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ASEAGRPPGLETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAE
750 760 770 780 790 800
950 960
pF1KE9 GSTPAGGGLSGGGGFQPSGLAFASHV
::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GSTPAGGGLSGGGGFQPSGLAFASHV
810 820
>>CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs109|chr12 (907 aa)
initn: 2808 init1: 1977 opt: 3297 Z-score: 2796.4 bits: 528.7 E(33420): 2e-149
Smith-Waterman score: 3297; 55.9% identity (81.3% similar) in 894 aa overlap (23-904:22-906)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MPSPPGLRALWLCAALCASRRAGGAPQPGPGPTACPAPCHCQEDG-IMLSADCSELGLSA
:..:. : .::. :::. :: ..: .:::.::::
CCDS90 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VPGDLDPLTAYLDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKIL
.:..:. .:.::::::::...: :. . :::::::::.:: :..:: ::.::::::.:
CCDS90 LPSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 MLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLVPERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPV
::::::: .:.::: .: :::::::::: :: :: : :: :::::::::::::::::
CCDS90 MLQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 RALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLVVLHLHNNRIQHLGTHSFEGLHNLETL
.:. .: ::::::::::.: ::::::: ::.::::::::::::. :: . :.:::.::::
CCDS90 QAFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 DLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRS
:::::.:.:::.:::::. :.:::::.:::..::::::.::: : :::::::::::::::
CCDS90 DLNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 AFQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLEL
:::.::.:.::.:::: .: ::::: ::..:: :::: : : ::. .:.::: :.::.:
CCDS90 AFQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 SHNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFS
:.: .:.:::. ::::..: :.::.:.:: .:::.:: ::..:.:.:: : :::.:::
CCDS90 SYNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 TLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQC
:: ::.::::..: :...:..:: :: :::: :: ::.. .:...::.:...:.::::::
CCDS90 TLPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQC
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE9 CPYGMCASFFKASGQW-EAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEME-DS
: .:.: . .: :.:: .... .:: . :. :.. ::.. ..::... :..: :
CCDS90 CAFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLH--KKDAGMF--QAQD--ERDLEDFLLDFEEDL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE9 KPHPSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPAPLPPV
: ::::::.::::::::.:...: ::..::.:..:.. ::.:: ::: . : . :.
CCDS90 KALHSVQCSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRS-PLYISPI
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE9 KFVVGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASV
:...:.::..: :::.: ..::.:::.:::.:...:: ::.:.::.. :::....::.::
CCDS90 KLLIGVIAAVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSV
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE9 LLLTLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLC
.::::::.. . ::. . . ..:... .: : :: ::.:: . ..:::::::
CCDS90 FLLTLAALERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLC
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE9 LPYAPPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAW
:: : :.:...:. :::...::.:::... :: ::::.: .::.: .:::.::.:.:
CCDS90 LPL--PFGEPSTMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIAL
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE9 LIFADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDD
:.:.. .: ::::::::.:...: ..::..: .::::.:::::::::::.::::::..:
CCDS90 LLFTNCILNCPVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKED
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880
pF1KE9 LRRLRPRAG----DSGP-LAYAAAGELEKSSCDSTQALVAF--SDVDLILEASEAGRP--
: :: .. .. : : . ..::.:::::::::.: :.. : : . :
CCDS90 LVSLRKQTYVWTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAY
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
pF1KE9 PGLETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGG
: :. . ::... :
CCDS90 PVTESCHLSSVAFVPCL
900
>>CCDS61195.1 LGR5 gene_id:8549|Hs109|chr12 (835 aa)
initn: 2198 init1: 1367 opt: 2616 Z-score: 2220.5 bits: 422.1 E(33420): 2.4e-117
Smith-Waterman score: 2794; 49.6% identity (74.3% similar) in 894 aa overlap (23-904:22-834)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MPSPPGLRALWLCAALCASRRAGGAPQPGPGPTACPAPCHCQEDG-IMLSADCSELGLSA
:..:. : .::. :::. :: ..: .:::.::::
CCDS61 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VPGDLDPLTAYLDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKIL
.:..:. .:.::::::::...: :. . :::::::::.:: :..:: ::.::::::.:
CCDS61 LPSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 MLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLVPERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPV
:::::::
CCDS61 MLQNNQL-----------------------------------------------------
120
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 RALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLVVLHLHNNRIQHLGTHSFEGLHNLETL
:.: :.::: :: ::::::::. :: . :.:::.::::
CCDS61 -------------------RHVPTEALQNLRSLQSLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETL
130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 DLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRS
:::::.:.:::.:::::. :.:::::.:::..::::::.::: : :::::::::::::::
CCDS61 DLNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRS
170 180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 AFQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLEL
:::.::.:.::.:::: .: ::::: ::..:: :::: : : ::. .:.::: :.::.:
CCDS61 AFQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDL
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 SHNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFS
:.: .:.:::. ::::..: :.::.:.:: .:::.:: ::..:.:.:: : :::.:::
CCDS61 SYNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFS
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 TLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQC
:: ::.::::..: :...:..:: :: :::: :: ::.. .:...::.:...:.::::::
CCDS61 TLPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQC
350 360 370 380 390 400
480 490 500 510 520 530
pF1KE9 CPYGMCASFFKASGQW-EAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEME-DS
: .:.: . .: :.:: .... .:: . :. :.. ::.. ..::... :..: :
CCDS61 CAFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLH--KKDAGMF--QAQD--ERDLEDFLLDFEEDL
410 420 430 440 450 460
540 550 560 570 580 590
pF1KE9 KPHPSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPAPLPPV
: ::::::.::::::::.:...: ::..::.:..:.. ::.:: ::: . : . :.
CCDS61 KALHSVQCSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRS-PLYISPI
470 480 490 500 510 520
600 610 620 630 640 650
pF1KE9 KFVVGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASV
:...:.::..: :::.: ..::.:::.:::.:...:: ::.:.::.. :::....::.::
CCDS61 KLLIGVIAAVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSV
530 540 550 560 570 580
660 670 680 690 700 710
pF1KE9 LLLTLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLC
.::::::.. . ::. . . ..:... .: : :: ::.:: . ..:::::::
CCDS61 FLLTLAALERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLC
590 600 610 620 630 640
720 730 740 750 760 770
pF1KE9 LPYAPPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAW
:: : :.:...:. :::...::.:::... :: ::::.: .::.: .:::.::.:.:
CCDS61 LPL--PFGEPSTMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIAL
650 660 670 680 690
780 790 800 810 820 830
pF1KE9 LIFADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDD
:.:.. .: ::::::::.:...: ..::..: .::::.:::::::::::.::::::..:
CCDS61 LLFTNCILNCPVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKED
700 710 720 730 740 750
840 850 860 870 880
pF1KE9 LRRLRPRAG----DSGP-LAYAAAGELEKSSCDSTQALVAF--SDVDLILEASEAGRP--
: :: .. .. : : . ..::.:::::::::.: :.. : : . :
CCDS61 LVSLRKQTYVWTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAY
760 770 780 790 800 810
890 900 910 920 930 940
pF1KE9 PGLETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGG
: :. . ::... :
CCDS61 PVTESCHLSSVAFVPCL
820 830
>>CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs109|chr12 (883 aa)
initn: 2089 init1: 1054 opt: 2381 Z-score: 2021.4 bits: 385.3 E(33420): 2.9e-106
Smith-Waterman score: 3114; 53.9% identity (78.9% similar) in 894 aa overlap (23-904:22-882)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MPSPPGLRALWLCAALCASRRAGGAPQPGPGPTACPAPCHCQEDG-IMLSADCSELGLSA
:..:. : .::. :::. :: ..: .:::.::::
CCDS61 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VPGDLDPLTAYLDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKIL
.:..:. .:.::::::::...: :. . :::::::::.:: :..:: ::.::::::.:
CCDS61 LPSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 MLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLVPERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPV
::::::: .:.::: .: :::::::::: :: :: : :: :::::::::::::::::
CCDS61 MLQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 RALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLVVLHLHNNRIQHLGTHSFEGLHNLETL
.:. .: ::::::::::.: ::::::: ::.::::::::::::. :: . :.:::.::::
CCDS61 QAFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 DLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRS
:::::.:.:::.:::::. :.:: :::::::::::::
CCDS61 DLNYNNLDEFPTAIRTLSNLKEL------------------------HFYDNPIQFVGRS
240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 AFQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLEL
:::.::.:.::.:::: .: ::::: ::..:: :::: : : ::. .:.::: :.::.:
CCDS61 AFQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 SHNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFS
:.: .:.:::. ::::..: :.::.:.:: .:::.:: ::..:.:.:: : :::.:::
CCDS61 SYNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFS
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 TLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQC
:: ::.::::..: :...:..:: :: :::: :: ::.. .:...::.:...:.::::::
CCDS61 TLPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQC
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE9 CPYGMCASFFKASGQW-EAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEME-DS
: .:.: . .: :.:: .... .:: . :. :.. ::.. ..::... :..: :
CCDS61 CAFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLH--KKDAGMF--QAQD--ERDLEDFLLDFEEDL
460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KE9 KPHPSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPAPLPPV
: ::::::.::::::::.:...: ::..::.:..:.. ::.:: ::: . : . :.
CCDS61 KALHSVQCSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRS-PLYISPI
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KE9 KFVVGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASV
:...:.::..: :::.: ..::.:::.:::.:...:: ::.:.::.. :::....::.::
CCDS61 KLLIGVIAAVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSV
570 580 590 600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KE9 LLLTLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLC
.::::::.. . ::. . . ..:... .: : :: ::.:: . ..:::::::
CCDS61 FLLTLAALERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLC
630 640 650 660 670 680
720 730 740 750 760 770
pF1KE9 LPYAPPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAW
:: : :.:...:. :::...::.:::... :: ::::.: .::.: .:::.::.:.:
CCDS61 LPL--PFGEPSTMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIAL
690 700 710 720 730 740
780 790 800 810 820 830
pF1KE9 LIFADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDD
:.:.. .: ::::::::.:...: ..::..: .::::.:::::::::::.::::::..:
CCDS61 LLFTNCILNCPVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKED
750 760 770 780 790 800
840 850 860 870 880
pF1KE9 LRRLRPRAG----DSGP-LAYAAAGELEKSSCDSTQALVAF--SDVDLILEASEAGRP--
: :: .. .. : : . ..::.:::::::::.: :.. : : . :
CCDS61 LVSLRKQTYVWTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAY
810 820 830 840 850 860
890 900 910 920 930 940
pF1KE9 PGLETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGG
: :. . ::... :
CCDS61 PVTESCHLSSVAFVPCL
870 880
>>CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs109|chr11 (951 aa)
initn: 2229 init1: 1613 opt: 1676 Z-score: 1424.4 bits: 275.0 E(33420): 5.2e-73
Smith-Waterman score: 2648; 47.5% identity (72.3% similar) in 918 aa overlap (1-907:1-892)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MPSPPGLRALWLCAALCASRRAGGAPQPGPGPTACPAPCHCQEDGIMLSADCSELGLSAV
::.: :: :: . : :.: : .: : ::: :. : .::: ::.::
CCDS31 MPGPLGL----LC--FLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDR---RVDCSGKGLTAV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 PGDLDPLTAYLDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKILM
: :. .: ::.::::.:.: :... :::::.:.:: :: : .:.::: ::.:
CCDS31 PEGLSAFTQALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLVPERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPVR
:::::: .:.::. : .::::::::: :. ::: ::::: .:::::::::.:::.::.
CCDS31 LQNNQLKTVPSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 ALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLVVLHLHNNRIQHLGTHSFEGLHNLETLD
:.:::.:::.:::::.:: :::.:: ::.::::::::::.:. :. : :.:: ::::::
CCDS31 PLSNLPTLQALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLD
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRSA
::::.: ::: ::..: :.:::::.:.:..::. :: :::::.:::.::::..::: ::
CCDS31 LNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 FQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLELS
:. : ::.: . :: .:.::.: ::. :: :::: . : .:...::. ::.:.::
CCDS31 FHNLSDLHSLVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 HNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFST
.:.:..:::.. :. ::::.::.:.:..: ::. : ::. :::: : :. :: .::.:
CCDS31 YNNIRDLPSFNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFAT
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 LHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQCC
: ...::.. :.::..: ::.:: .::: ::. :..:.. .: .:: : ::::::::
CCDS31 LGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCC
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 PYGMCASFFKASGQWEAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEMEDSKPH
. : :. .. ..:: :.:. . : .. : :: :. . .
CCDS31 AFWGCDSY----ANLNTEDNSLQDHSVA---------QEKGTADAANVTSTLENEEHS-Q
480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 PSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPAPLPPVKFV
..:.:. : :::::::. :: :::.:: : :.... : ::.::.::. . :: :.
CCDS31 IIIHCTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTS-LPSSKLF
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 VGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASVLLL
.: :. .: . :: :.:. .::...:.:.:.: :::: ::...:::::..::....::
CCDS31 IGLISVSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLL
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 TLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLCLPY
::.:. :.:.. . ::: : . :...: . : .:. .:: :::.:::::::.
CCDS31 MLATVERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPF
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 APPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAWLIF
: :. .:::::.::..::. ::..: : ::::.: . :. . .:..:::::::
CCDS31 --PTGETPSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIF
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830
pF1KE9 ADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDDL--
.. ...:::::.::: .. . ..:: .::: :. .::::::::.::..:::.:..:
CCDS31 TNCIFFCPVAFFSFAPLITAISISPEIMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKL
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KE9 --RRLRPRAGDSGPLAYAAAGELEKS---SCDSTQALVAFSDVDLILEASEAGRPPG---
::. ..:. . . .: ::.. .: . : . : :. .: .
CCDS31 LKRRVTKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKH
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940
pF1KE9 -LETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGGG
..... :.... :::.:
CCDS31 LIKSHSCPALAVASCQRPEGYWSDCGTQSAHSDYADEEDSFVSDSSDQVQACGRACFYQS
880 890 900 910 920 930
>>CCDS86187.1 LGR4 gene_id:55366|Hs109|chr11 (927 aa)
initn: 2097 init1: 1481 opt: 1499 Z-score: 1274.7 bits: 247.2 E(33420): 1.1e-64
Smith-Waterman score: 2515; 46.2% identity (70.5% similar) in 918 aa overlap (1-907:1-868)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MPSPPGLRALWLCAALCASRRAGGAPQPGPGPTACPAPCHCQEDGIMLSADCSELGLSAV
::.: :: :: . : :.: : .: : ::: :. : .::: ::.::
CCDS86 MPGPLGL----LC--FLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDR---RVDCSGKGLTAV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 PGDLDPLTAYLDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKILM
: . :.: : . :.:.:: :: : .:.::: ::.:
CCDS86 P---EGLSA---------------------FTQALQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLT
60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLVPERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPVR
:::::: .:.::. : .::::::::: :. ::: ::::: .:::::::::.:::.::.
CCDS86 LQNNQLKTVPSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVH
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 ALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLVVLHLHNNRIQHLGTHSFEGLHNLETLD
:.:::.:::.:::::.:: :::.:: ::.::::::::::.:. :. : :.:: ::::::
CCDS86 PLSNLPTLQALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLD
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRSA
::::.: ::: ::..: :.:::::.:.:..::. :: :::::.:::.::::..::: ::
CCDS86 LNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSA
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 FQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLELS
:. : ::.: . :: .:.::.: ::. :: :::: . : .:...::. ::.:.::
CCDS86 FHNLSDLHSLVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLS
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 HNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFST
.:.:..:::.. :. ::::.::.:.:..: ::. : ::. :::: : :. :: .::.:
CCDS86 YNNIRDLPSFNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFAT
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 LHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQCC
: ...::.. :.::..: ::.:: .::: ::. :..:.. .: .:: : ::::::::
CCDS86 LGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCC
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 PYGMCASFFKASGQWEAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEMEDSKPH
. : :. .. ..:: :.:. . : .. : :: :. . .
CCDS86 AFWGCDSY----ANLNTEDNSLQDHSVA---------QEKGTADAANVTSTLENEEHS-Q
450 460 470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 PSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPAPLPPVKFV
..:.:. : :::::::. :: :::.:: : :.... : ::.::.::. . :: :.
CCDS86 IIIHCTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTS-LPSSKLF
500 510 520 530 540 550
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 VGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASVLLL
.: :. .: . :: :.:. .::...:.:.:.: :::: ::...:::::..::....::
CCDS86 IGLISVSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLL
560 570 580 590 600 610
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 TLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLCLPY
::.:. :.:.. . ::: : . :...: . : .:. .:: :::.:::::::.
CCDS86 MLATVERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPF
620 630 640 650 660 670
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 APPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAWLIF
: :. .:::::.::..::. ::..: : ::::.: . :. . .:..:::::::
CCDS86 --PTGETPSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIF
680 690 700 710 720 730
790 800 810 820 830
pF1KE9 ADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDDL--
.. ...:::::.::: .. . ..:: .::: :. .::::::::.::..:::.:..:
CCDS86 TNCIFFCPVAFFSFAPLITAISISPEIMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKL
740 750 760 770 780 790
840 850 860 870 880 890
pF1KE9 --RRLRPRAGDSGPLAYAAAGELEKS---SCDSTQALVAFSDVDLILEASEAGRPPG---
::. ..:. . . .: ::.. .: . : . : :. .: .
CCDS86 LKRRVTKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKH
800 810 820 830 840 850
900 910 920 930 940
pF1KE9 -LETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGGG
..... :.... :::.:
CCDS86 LIKSHSCPALAVASCQRPEGYWSDCGTQSAHSDYADEEDSFVSDSSDQVQACGRACFYQS
860 870 880 890 900 910
>>CCDS1844.2 FSHR gene_id:2492|Hs109|chr2 (669 aa)
initn: 604 init1: 187 opt: 627 Z-score: 538.3 bits: 110.5 E(33420): 1.2e-23
Smith-Waterman score: 636; 25.2% identity (57.9% similar) in 596 aa overlap (261-846:50-619)
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 EGLHNLETLDLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNPLLQTIHFYD
:: : .....: . :: : :. :.. .
CCDS18 HRICHCSNRVFLCQESKVTEIPSDLPRNAIELRFVLTKLRVIQKGAFSGFGDLEKIEISQ
20 30 40 50 60 70
300 310 320 330 340
pF1KE9 NPI-QFVGRSAFQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLPSGMCQ
: . . . ..:. ::::: . .. : .. . . : .. :
CCDS18 NDVLEVIEADVFSNLPKLHEIRIEKANNL---------------------LYINPEAF-Q
80 90 100 110
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 QLPRLRVLELSHNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNR--IWEIGADTFSQLSSLQALDLS-
.:: :. : .:.. :..::..:. ..:... : :. : :: .:. ..:. :.::
CCDS18 NLPNLQYLLISNTGIKHLPDVHKIHSLQKVLLWLNKNGIQEIHNCAFNG-TQLDELNLSD
120 130 140 150 160 170
410 420 430 440 450 460
pF1KE9 WNAIRSIHPEAFSTLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKDSFP
: .. . ..: . : ::.. ... .:: :: .: .:. ... :.. . ...
CCDS18 NNNLEELPNDVFHGASGPVILDISRTRIHSLPSYGLENLKKLRARSTYNLKKLPTLEKLV
180 190 200 210 220 230
470 480 490 500 510 520
pF1KE9 KLRILEVPYAYQCCPYGM---CASFFKASGQWEAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAENHY
: . : .:: .. : .. . ..: ... . ::.. :. :
CCDS18 ALMEASLTYPSHCCAFANWRRQISELHPICNKSILRQEVDYMTQARGQRSSLAEDNESSY
240 250 260 270 280 290
530 540 550 560 570 580
pF1KE9 DQDLDELQLEMEDSKPHP--SVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGL
.. .: :.. . . .: ::: : :.::: .. .:. .: : .:.. : .
CCDS18 SRGFDMTYTEFDYDLCNEVVDVTCSPKPDAFNPCEDIMGYNILRVLIWFISILAITGN-I
300 310 320 330 340 350
590 600 610 620 630 640
pF1KE9 VLLTVFAGGPAPLPPVKFVVGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYGARWETGLG
..:.... . : .:.. .: :. :: :.:::: : .:. .:. :.:: :
CCDS18 IVLVILTTSQYKLTVPRFLMCNLAFADLCIGIYLLLIASVDIHTKSQYHNYAIDWQTGAG
360 370 380 390 400 410
650 660 670 680 690 700
pF1KE9 CRATGFLAVLGSEASVLLLTLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAA
: :.::..:..:: :: :: ... ... . . .: . . .. .: ::
CCDS18 CDAAGFFTVFASELSVYTLTAITLERWHTITHAMQLDCKVQLRHAASVMVMGWIFAFAAA
420 430 440 450 460 470
710 720 730 740 750 760
pF1KE9 ALPLASVGEYGASPLCLPYAPPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRG
.:. ... : .:::. .: . ....:...: . :.:. : ::..: .
CCDS18 LFPIFGISSYMKVSICLPMDID--SPLSQLYVMSLLVLNVLAFVVICGCYIHIYLTVRNP
480 490 500 510 520 530
770 780 790 800 810 820
pF1KE9 DF-EAVWDCAMVRHVAWLIFADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPA
.. . : .....: :::.: : . :..:..... : . .: .: .:.. :. .
CCDS18 NIVSSSSDTRIAKRMAMLIFTDFLCMAPISFFAISASLKVPLITVSKAKILLVLFHPINS
540 550 560 570 580 590
830 840 850 860 870 880
pF1KE9 CLNPLLYLLFNPHFRDDLRRLRPRAGDSGPLAYAAAGELEKSSCDSTQALVAFSDVDLIL
: ::.:: .:. .:: :. : . :
CCDS18 CANPFLYAIFTKNFRRDFFILLSKCGCYEMQAQIYRTETSSTVHNTHPRNGHCSSAPRVT
600 610 620 630 640 650
>>CCDS1842.1 LHCGR gene_id:3973|Hs109|chr2 (699 aa)
initn: 359 init1: 188 opt: 567 Z-score: 487.4 bits: 101.1 E(33420): 8.2e-21
Smith-Waterman score: 567; 24.4% identity (58.3% similar) in 595 aa overlap (269-846:61-642)
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 LDLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMG-NPLLQTIHFYDNPIQFVG
.:.:: .:: : : ... . .. .
CCDS18 PEPCNCVPDGALRCPGPTAGLTRLSLAYLPVKVIPSQAFRGLNEVIKIEISQIDSLERIE
40 50 60 70 80 90
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 RSAFQYLPKLHTLSLNGAMDIQ--EFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLP--SGMCQQLPR
.::. : .: . .... ... : . . :. :.. .::: .: . . ..
CCDS18 ANAFDNLLNLSEILIQNTKNLRYIEPGAFINLPRLKYLSICNTGIRKFPDVTKVFSSESN
100 110 120 130 140 150
360 370 380 390 400
pF1KE9 LRVLELSHN-QIEELP-SLHRCQKLEEIGLQ--HNRIWEIGADTFSQLSSLQALDLSWNA
. .::. : .: .: . . .. : . :. : . :. . .:. ..: .:.:. :.
CCDS18 F-ILEICDNLHITTIPGNAFQGMNNESVTLKLYGNGFEEVQSHAFNG-TTLTSLELKENV
160 170 180 190 200
410 420 430 440 450 460
pF1KE9 -IRSIHPEAFSTLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKDSFPKL
....: :: . ::.....: .:: :: ....: .. .:.. :...: .:
CCDS18 HLEKMHNGAFRGATGPKTLDISSTKLQALPSYGLESIQRLIATSSYSLKKLPSRETFVNL
210 220 230 240 250 260
470 480 490 500 510 520
pF1KE9 RILEVPYAYQCCPYGMCASFFKASGQWEAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAENH--YDQD
. : .:: :. : . : .:. ::. . . :...:. :..
CCDS18 LEATLTYPSHCCA-------FRNLPTKEQNFSHSISENFSKQCESTV-RKVNNKTLYSSM
270 280 290 300 310 320
530 540 550 560 570 580
pF1KE9 LDELQLEMEDSKPH---PSV-QCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGLV
: : .: : . :.. .:.: : :.::: .. .:. .: : .:... : :
CCDS18 LAESELSGWDYEYGFCLPKTPRCAPEPDAFNPCEDIMGYDFLRVLIWLINILAIMGNMTV
330 340 350 360 370 380
590 600 610 620 630 640
pF1KE9 LLTVFAGGPAPLPPVKFVVGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYGARWETGLGC
:...... : .:.. .. :. :. :.::::. : ::. ... :.:: ::
CCDS18 LFVLLTSRYKLTVP-RFLMCNLSFADFCMGLYLLLIASVDSQTKGQYYNHAIDWQTGSGC
390 400 410 420 430
650 660 670 680 690 700
pF1KE9 RATGFLAVLGSEASVLLLTLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAAA
..::..:..:: :: ::. ... ... . .. : . .:: ...: :
CCDS18 STAGFFTVFASELSVYTLTVITLERWHTITYAIHLDQKLRLRHAILIMLGGWLFSSLIAM
440 450 460 470 480 490
710 720 730 740 750 760
pF1KE9 LPLASVGEYGASPLCLPYAPPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRGD
:::..:..: .:.:. . . ......: :... . :::.: . .
CCDS18 LPLVGVSNYMKVSICFPMDVETTLSQV--YILTILILNVVAFFIICACYIKIYFAVRNPE
500 510 520 530 540 550
770 780 790 800 810 820
pF1KE9 FEAV-WDCAMVRHVAWLIFADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPAC
. :. : .....: :::.: . :..:..... . . .: : .:.. :. .:
CCDS18 LMATNKDTKIAKKMAILIFTDFTCMAPISFFAISAAFKVPLITVTNSKVLLVLFYPINSC
560 570 580 590 600 610
830 840 850 860 870 880
pF1KE9 LNPLLYLLFNPHFRDDLRRLRPRAGDSGPLAYAAAGELEKSSCDSTQALVAFSDVDLILE
::.:: .:. :. :. : . :
CCDS18 ANPFLYAIFTKTFQRDFFLLLSKFGCCKRRAELYRRKDFSAYTSNCKNGFTGSNKPSQST
620 630 640 650 660 670
967 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Oct 24 21:36:44 2019 done: Thu Oct 24 21:36:45 2019
Total Scan time: 2.380 Total Display time: 0.210
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]