FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9532, 370 aa
1>>>pF1KE9532 370 - 370 aa - 370 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7068+/-0.00105; mu= 13.8380+/- 0.062
mean_var=139.1738+/-43.766, 0's: 0 Z-trim(105.5): 351 B-trim: 1047 in 2/46
Lambda= 0.108717
statistics sampled from 7814 (8456) to 7814 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.617), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16
Scan time: 2.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 2450 396.6 1.8e-110
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CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 1288 214.4 1.3e-55
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 1288 214.4 1.3e-55
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 1288 214.4 1.4e-55
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 1288 214.4 1.4e-55
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 1288 214.4 1.4e-55
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CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 1288 214.5 1.4e-55
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CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 1288 214.5 1.5e-55
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CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 1250 208.4 8.1e-54
CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 291) 1157 193.7 1.7e-49
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 1152 193.0 3.1e-49
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 1132 189.8 2.6e-48
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 841 144.3 1.7e-34
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 825 141.8 9.6e-34
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 795 137.1 2.4e-32
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 789 136.1 4.6e-32
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 787 135.9 6.3e-32
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 761 131.7 9.1e-31
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 734 127.4 1.7e-29
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 578 103.1 4.4e-22
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 554 99.2 5.6e-21
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 550 98.7 9.8e-21
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 512 92.7 5.5e-19
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 512 92.7 5.8e-19
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 512 92.7 5.8e-19
CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 507 91.9 9.7e-19
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 503 91.2 1.5e-18
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 503 91.3 1.5e-18
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 502 91.1 1.6e-18
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 498 90.5 2.5e-18
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 498 90.5 2.5e-18
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 492 89.5 4.8e-18
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 486 88.6 9.4e-18
CCDS5044.1 MCHR2 gene_id:84539|Hs108|chr6 ( 340) 475 86.8 3e-17
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 471 86.2 4.7e-17
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 469 85.9 5.9e-17
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 463 85.0 1.2e-16
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 462 84.8 1.3e-16
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 462 84.8 1.3e-16
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 458 84.2 1.9e-16
CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 ( 423) 459 84.4 1.9e-16
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 456 83.9 2.4e-16
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 455 83.7 2.7e-16
CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1 ( 374) 455 83.7 2.8e-16
CCDS12049.1 KISS1R gene_id:84634|Hs108|chr19 ( 398) 455 83.8 2.9e-16
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 453 83.4 3.4e-16
>>CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 (370 aa)
initn: 2450 init1: 2450 opt: 2450 Z-score: 2096.9 bits: 396.6 E(32554): 1.8e-110
Smith-Waterman score: 2450; 100.0% identity (100.0% similar) in 370 aa overlap (1-370:1-370)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MEPLFPAPFWEVIYGSHLQGNLSLLSPNHSLLPPHLLLNASHGAFLPLGLKVTIVGLYLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MEPLFPAPFWEVIYGSHLQGNLSLLSPNHSLLPPHLLLNASHGAFLPLGLKVTIVGLYLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VCVGGLLGNCLVMYVILRHTKMKTATNIYIFNLALADTLVLLTLPFQGTDILLGFWPFGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VCVGGLLGNCLVMYVILRHTKMKTATNIYIFNLALADTLVLLTLPFQGTDILLGFWPFGN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 ALCKTVIAIDYYNMFTSTFTLTAMSVDRYVAICHPIRALDVRTSSKAQAVNVAIWALASV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ALCKTVIAIDYYNMFTSTFTLTAMSVDRYVAICHPIRALDVRTSSKAQAVNVAIWALASV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VGVPVAIMGSAQVEDEEIECLVEIPTPQDYWGPVFAICIFLFSFIVPVLVISVCYSLMIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VGVPVAIMGSAQVEDEEIECLVEIPTPQDYWGPVFAICIFLFSFIVPVLVISVCYSLMIR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 RLRGVRLLSGSREKDRNLRRITRLVLVVVAVFVGCWTPVQVFVLAQGLGVQPSSETAVAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RLRGVRLLSGSREKDRNLRRITRLVLVVVAVFVGCWTPVQVFVLAQGLGVQPSSETAVAI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 LRFCTALGYVNSCLNPILYAFLDENFKACFRKFCCASALRRDVQVSDRVRSIAKDVALAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LRFCTALGYVNSCLNPILYAFLDENFKACFRKFCCASALRRDVQVSDRVRSIAKDVALAC
310 320 330 340 350 360
370
pF1KE9 KTSETVPRPA
::::::::::
CCDS13 KTSETVPRPA
370
>>CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 (389 aa)
initn: 1232 init1: 1232 opt: 1288 Z-score: 1111.7 bits: 214.4 E(32554): 1.3e-55
Smith-Waterman score: 1288; 53.8% identity (77.0% similar) in 366 aa overlap (6-368:26-384)
10 20 30
pF1KE9 MEPLFPAP-FWEVIYGSHLQGNLSL-LSPNHSLLPPHLLL
:.: : . :::.:::: .::.. : . :
CCDS55 MDSSAAPTNASNCTDALAYSSCSPAPSPGSW--VNLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDSL
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 NASHGAFLP-LGLKVTIVGLYLAVCVGGLLGNCLVMYVILRHTKMKTATNIYIFNLALAD
:. : . .::..:: ::: ::.:: ::::::.:.::::::::::::::::::
CCDS55 CPPTGS--PSMITAITIMALYSIVCVVGLFGNFLVMYVIVRYTKMKTATNIYIFNLALAD
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 TLVLLTLPFQGTDILLGFWPFGNALCKTVIAIDYYNMFTSTFTLTAMSVDRYVAICHPIR
.:. :::::... :.: ::::. ::: ::.::::::::: ::: .::::::.:.:::..
CCDS55 ALATSTLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVK
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 ALDVRTSSKAQAVNVAIWALASVVGVPVAIMGSAQVEDEEIECLVEIPTPQDYWGPVFAI
::: :: .:. .:: : :.:..:.:: .:.... .. :.: . . : :: .. :
CCDS55 ALDFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSIDCTLTFSHPTWYWENLLKI
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 CIFLFSFIVPVLVISVCYSLMIRRLRGVRLLSGSREKDRNLRRITRLVLVVVAVFVGCWT
:.:.:.::.:::.:.:::.::: ::..::.::::.:::::::::::.::::::::. :::
CCDS55 CVFIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 PVQVFVLAQGLGVQPSSETAVAILRFCTALGYVNSCLNPILYAFLDENFKACFRKFCCAS
:....:. ..: . : . .. .:: ::::.::::::.:::::::::: :::.:: .
CCDS55 PIHIYVIIKALVTIPETTFQTVSWHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPT
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KE9 ALRRDVQVSDRVRSIAKDVALACKTSETVPRPA
. . : : :.:. ..: .:..:: :
CCDS55 SSNIEQQNSTRIRQNTRDHP---STANTVDRTNHQS
360 370 380
>>CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 (392 aa)
initn: 1232 init1: 1232 opt: 1288 Z-score: 1111.7 bits: 214.4 E(32554): 1.3e-55
Smith-Waterman score: 1288; 53.8% identity (77.0% similar) in 366 aa overlap (6-368:26-384)
10 20 30
pF1KE9 MEPLFPAP-FWEVIYGSHLQGNLSL-LSPNHSLLPPHLLL
:.: : . :::.:::: .::.. : . :
CCDS47 MDSSAAPTNASNCTDALAYSSCSPAPSPGSW--VNLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDSL
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 NASHGAFLP-LGLKVTIVGLYLAVCVGGLLGNCLVMYVILRHTKMKTATNIYIFNLALAD
:. : . .::..:: ::: ::.:: ::::::.:.::::::::::::::::::
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100 110 120 130 140 150
pF1KE9 TLVLLTLPFQGTDILLGFWPFGNALCKTVIAIDYYNMFTSTFTLTAMSVDRYVAICHPIR
.:. :::::... :.: ::::. ::: ::.::::::::: ::: .::::::.:.:::..
CCDS47 ALATSTLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVK
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 ALDVRTSSKAQAVNVAIWALASVVGVPVAIMGSAQVEDEEIECLVEIPTPQDYWGPVFAI
::: :: .:. .:: : :.:..:.:: .:.... .. :.: . . : :: .. :
CCDS47 ALDFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSIDCTLTFSHPTWYWENLLKI
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 CIFLFSFIVPVLVISVCYSLMIRRLRGVRLLSGSREKDRNLRRITRLVLVVVAVFVGCWT
:.:.:.::.:::.:.:::.::: ::..::.::::.:::::::::::.::::::::. :::
CCDS47 CVFIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 PVQVFVLAQGLGVQPSSETAVAILRFCTALGYVNSCLNPILYAFLDENFKACFRKFCCAS
:....:. ..: . : . .. .:: ::::.::::::.:::::::::: :::.:: .
CCDS47 PIHIYVIIKALVTIPETTFQTVSWHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPT
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KE9 ALRRDVQVSDRVRSIAKDVALACKTSETVPRPA
. . : : :.:. ..: .:..:: :
CCDS47 SSNIEQQNSTRIRQNTRDHP---STANTVDRTNHQVRSL
360 370 380 390
>>CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 (397 aa)
initn: 1232 init1: 1232 opt: 1288 Z-score: 1111.6 bits: 214.4 E(32554): 1.3e-55
Smith-Waterman score: 1288; 53.8% identity (77.0% similar) in 366 aa overlap (6-368:26-384)
10 20 30
pF1KE9 MEPLFPAP-FWEVIYGSHLQGNLSL-LSPNHSLLPPHLLL
:.: : . :::.:::: .::.. : . :
CCDS47 MDSSAAPTNASNCTDALAYSSCSPAPSPGSW--VNLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDSL
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 NASHGAFLP-LGLKVTIVGLYLAVCVGGLLGNCLVMYVILRHTKMKTATNIYIFNLALAD
:. : . .::..:: ::: ::.:: ::::::.:.::::::::::::::::::
CCDS47 CPPTGS--PSMITAITIMALYSIVCVVGLFGNFLVMYVIVRYTKMKTATNIYIFNLALAD
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 TLVLLTLPFQGTDILLGFWPFGNALCKTVIAIDYYNMFTSTFTLTAMSVDRYVAICHPIR
.:. :::::... :.: ::::. ::: ::.::::::::: ::: .::::::.:.:::..
CCDS47 ALATSTLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVK
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 ALDVRTSSKAQAVNVAIWALASVVGVPVAIMGSAQVEDEEIECLVEIPTPQDYWGPVFAI
::: :: .:. .:: : :.:..:.:: .:.... .. :.: . . : :: .. :
CCDS47 ALDFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSIDCTLTFSHPTWYWENLLKI
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 CIFLFSFIVPVLVISVCYSLMIRRLRGVRLLSGSREKDRNLRRITRLVLVVVAVFVGCWT
:.:.:.::.:::.:.:::.::: ::..::.::::.:::::::::::.::::::::. :::
CCDS47 CVFIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 PVQVFVLAQGLGVQPSSETAVAILRFCTALGYVNSCLNPILYAFLDENFKACFRKFCCAS
:....:. ..: . : . .. .:: ::::.::::::.:::::::::: :::.:: .
CCDS47 PIHIYVIIKALVTIPETTFQTVSWHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPT
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KE9 ALRRDVQVSDRVRSIAKDVALACKTSETVPRPA
. . : : :.:. ..: .:..:: :
CCDS47 SSNIEQQNSTRIRQNTRDHP---STANTVDRTNHQRERRQKSDW
360 370 380 390
>>CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 (400 aa)
initn: 1232 init1: 1232 opt: 1288 Z-score: 1111.6 bits: 214.4 E(32554): 1.4e-55
Smith-Waterman score: 1288; 53.8% identity (77.0% similar) in 366 aa overlap (6-368:26-384)
10 20 30
pF1KE9 MEPLFPAP-FWEVIYGSHLQGNLSL-LSPNHSLLPPHLLL
:.: : . :::.:::: .::.. : . :
CCDS55 MDSSAAPTNASNCTDALAYSSCSPAPSPGSW--VNLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDSL
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 NASHGAFLP-LGLKVTIVGLYLAVCVGGLLGNCLVMYVILRHTKMKTATNIYIFNLALAD
:. : . .::..:: ::: ::.:: ::::::.:.::::::::::::::::::
CCDS55 CPPTGS--PSMITAITIMALYSIVCVVGLFGNFLVMYVIVRYTKMKTATNIYIFNLALAD
60 70 80 90 100 110
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pF1KE9 TLVLLTLPFQGTDILLGFWPFGNALCKTVIAIDYYNMFTSTFTLTAMSVDRYVAICHPIR
.:. :::::... :.: ::::. ::: ::.::::::::: ::: .::::::.:.:::..
CCDS55 ALATSTLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVK
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 ALDVRTSSKAQAVNVAIWALASVVGVPVAIMGSAQVEDEEIECLVEIPTPQDYWGPVFAI
::: :: .:. .:: : :.:..:.:: .:.... .. :.: . . : :: .. :
CCDS55 ALDFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSIDCTLTFSHPTWYWENLLKI
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 CIFLFSFIVPVLVISVCYSLMIRRLRGVRLLSGSREKDRNLRRITRLVLVVVAVFVGCWT
:.:.:.::.:::.:.:::.::: ::..::.::::.:::::::::::.::::::::. :::
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CCDS47 CVFIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWT
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CCDS47 PIHIYVIIKALVTIPETTFQTVSWHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPT
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CCDS43 DYMKR
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CCDS47 SSNIEQQNSTRIRQNTRDHP---STANTVDRTNHQVELNLDCHCENAKPWPLSYNAGQSP
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CCDS47 FPFPGRV
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CCDS43 CPPTGS--PSMITAITIMALYSIVCVVGLFGNFLVMYVIVRYTKMKTATNIYIFNLALAD
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CCDS43 ALDFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSIDCTLTFSHPTWYWENLLKI
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pF1KE9 CIFLFSFIVPVLVISVCYSLMIRRLRGVRLLSGSREKDRNLRRITRLVLVVVAVFVGCWT
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CCDS43 PIHIYVIIKALVTIPETTFQTVSWHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPT
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360 370 380 390 400 410
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]