Result of FASTA (ccds) for pF1KE9636
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE9636, 1559 aa
  1>>>pF1KE9636 1559 - 1559 aa - 1559 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1024+/-0.000917; mu= 11.6478+/- 0.055
 mean_var=157.8978+/-31.472, 0's: 0 Z-trim(111.8): 78  B-trim: 24 in 1/52
 Lambda= 0.102067
 statistics sampled from 12616 (12694) to 12616 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.718), E-opt: 0.2 (0.39), width:  16
 Scan time:  6.510

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS65269.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX          (1559) 10626 1577.6       0
CCDS14351.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX          (1560) 10614 1575.8       0
CCDS55417.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX          (1379) 8800 1308.7       0
CCDS55554.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY          (1482) 7291 1086.5       0
CCDS14794.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY          (1539) 7291 1086.5       0
CCDS55555.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY          (1570) 6152 918.8       0
CCDS81417.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1         (1580) 4344 652.6 2.9e-186
CCDS41736.1 KDM5A gene_id:5927|Hs108|chr12         (1690) 4033 606.8 1.8e-172
CCDS30974.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1         (1544) 3359 507.5 1.3e-142
CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11       ( 506)  491 84.9 6.9e-16
CCDS8302.1 KDM4D gene_id:55693|Hs108|chr11         ( 523)  466 81.3 9.1e-15
CCDS491.1 KDM4A gene_id:9682|Hs108|chr1            (1064)  452 79.4 6.9e-14
CCDS55286.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9         ( 813)  444 78.1 1.2e-13
CCDS55285.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9         ( 835)  444 78.1 1.3e-13
CCDS6471.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9          (1056)  444 78.2 1.5e-13
CCDS12138.1 KDM4B gene_id:23030|Hs108|chr19        (1096)  436 77.0 3.6e-13
CCDS58996.1 JARID2 gene_id:3720|Hs108|chr6         (1074)  417 74.2 2.5e-12
CCDS4533.1 JARID2 gene_id:3720|Hs108|chr6          (1246)  417 74.3 2.8e-12


>>CCDS65269.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX               (1559 aa)
 initn: 10626 init1: 10626 opt: 10626  Z-score: 8457.0  bits: 1577.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10626; 100.0% identity (100.0% similar) in 1559 aa overlap (1-1559:1-1559)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE9 MEPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 MEPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 DNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERRILDLYSLSKIVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 DNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERRILDLYSLSKIVV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE9 EEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLVCNTRPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLVCNTRPF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE9 DNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPELKKLQIYGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 DNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPELKKLQIYGA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE9 GPKMMGLGLMAKDKTLRKKDKEGPECPPTVVVKEELGGDVKVESTSPKTFLESKEELSHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 GPKMMGLGLMAKDKTLRKKDKEGPECPPTVVVKEELGGDVKVESTSPKTFLESKEELSHS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE9 PEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYHIFCLLPPLPEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYHIFCLLPPLPEI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE9 PKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTELV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTELV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE9 EKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRHLTPEEEEYATSGWNLNVMPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRHLTPEEEEYATSGWNLNVMPV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE9 LEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE9 AEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 AEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAY
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE9 HSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLDLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 HSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLDLN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE9 LAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALAC
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE9 YDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVRVAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 YDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVRVAL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE9 EVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEAGPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEAGPH
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE9 RVAGLQMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVLEQVEAYQAEAREALASLPSSPGLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 RVAGLQMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVLEQVEAYQAEAREALASLPSSPGLL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE9 QSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVMRGLLVAGASVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 QSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVMRGLLVAGASVA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE9 PSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE9 LKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSW
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE9 REKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQDLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 REKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQDLR
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE9 DPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGALQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 DPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGALQ
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE9 CDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNPTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 CDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNPTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILAL
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE9 LVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASEDVTALLGRLAELRQRLQAEPRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASEDVTALLGRLAELRQRLQAEPRP
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE9 EEPPNYPAAPASDPLREGSGKDMPKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSGKRDLELLSSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EEPPNYPAAPASDPLREGSGKDMPKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSGKRDLELLSSLL
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE9 PQLTGPVLELPEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLELE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PQLTGPVLELPEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLELE
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE9 KAERHGSRARGRALERRRRRKVDRGGEGDDPAREELEPKRVRSSGPEAEEVQEEEELEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 KAERHGSRARGRALERRRRRKVDRGGEGDDPAREELEPKRVRSSGPEAEEVQEEEELEEE
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550         
pF1KE9 TGGEGPPAPIPTTGSPSTQENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQQL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 TGGEGPPAPIPTTGSPSTQENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQQL
             1510      1520      1530      1540      1550         

>>CCDS14351.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX               (1560 aa)
 initn: 10612 init1: 9417 opt: 10614  Z-score: 8447.4  bits: 1575.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10614; 99.9% identity (99.9% similar) in 1560 aa overlap (1-1559:1-1560)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE9 MEPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MEPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 DNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERRILDLYSLSKIVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERRILDLYSLSKIVV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170          
pF1KE9 EEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLV-CNTRP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS14 EEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLVQCNTRP
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE9 FDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPELKKLQIYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPELKKLQIYG
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE9 AGPKMMGLGLMAKDKTLRKKDKEGPECPPTVVVKEELGGDVKVESTSPKTFLESKEELSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AGPKMMGLGLMAKDKTLRKKDKEGPECPPTVVVKEELGGDVKVESTSPKTFLESKEELSH
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE9 SPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYHIFCLLPPLPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYHIFCLLPPLPE
              310       320       330       340       350       360

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE9 IPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTEL
              370       380       390       400       410       420

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE9 VEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRHLTPEEEEYATSGWNLNVMP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRHLTPEEEEYATSGWNLNVMP
              430       440       450       460       470       480

     480       490       500       510       520       530         
pF1KE9 VLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSL
              490       500       510       520       530       540

     540       550       560       570       580       590         
pF1KE9 AAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRA
              550       560       570       580       590       600

     600       610       620       630       640       650         
pF1KE9 YHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLDL
              610       620       630       640       650       660

     660       670       680       690       700       710         
pF1KE9 NLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALA
              670       680       690       700       710       720

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pF1KE9 CYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVRVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVRVA
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pF1KE9 LEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEAGP
              790       800       810       820       830       840

     840       850       860       870       880       890         
pF1KE9 HRVAGLQMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVLEQVEAYQAEAREALASLPSSPGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HRVAGLQMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVLEQVEAYQAEAREALASLPSSPGL
              850       860       870       880       890       900

     900       910       920       930       940       950         
pF1KE9 LQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVMRGLLVAGASV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVMRGLLVAGASV
              910       920       930       940       950       960

     960       970       980       990      1000      1010         
pF1KE9 APSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 APSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQ
              970       980       990      1000      1010      1020

    1020      1030      1040      1050      1060      1070         
pF1KE9 ALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

    1080      1090      1100      1110      1120      1130         
pF1KE9 WREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 WREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQDL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

    1140      1150      1160      1170      1180      1190         
pF1KE9 RDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGAL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

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pF1KE9 QCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNPTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNPTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILA
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

    1260      1270      1280      1290      1300      1310         
pF1KE9 LLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASEDVTALLGRLAELRQRLQAEPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASEDVTALLGRLAELRQRLQAEPR
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

    1320      1330      1340      1350      1360      1370         
pF1KE9 PEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDMPKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSGKRDLELLSSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDMPKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSGKRDLELLSSL
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

    1380      1390      1400      1410      1420      1430         
pF1KE9 LPQLTGPVLELPEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LPQLTGPVLELPEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLEL
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

    1440      1450      1460      1470      1480      1490         
pF1KE9 EKAERHGSRARGRALERRRRRKVDRGGEGDDPAREELEPKRVRSSGPEAEEVQEEEELEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EKAERHGSRARGRALERRRRRKVDRGGEGDDPAREELEPKRVRSSGPEAEEVQEEEELEE
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pF1KE9 ETGGEGPPAPIPTTGSPSTQENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ETGGEGPPAPIPTTGSPSTQENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQQL
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

>>CCDS55417.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX               (1379 aa)
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pF1KE9 MEPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::          
CCDS55 MEPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPA----------
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pF1KE9 DNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERRILDLYSLSKIVV
                                                                :::
CCDS55 ---------------------------------------------------------IVV
                                                                   

              130       140       150       160       170          
pF1KE9 EEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLV-CNTRP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS55 EEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLVQCNTRP
            60        70        80        90       100       110   

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pF1KE9 FDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPELKKLQIYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPELKKLQIYG
           120       130       140       150       160       170   

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE9 AGPKMMGLGLMAKDKTLRKKDKEGPECPPTVVVKEELGGDVKVESTSPKTFLESKEELSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AGPKMMGLGLMAKDKTLRKKDKEGPECPPTVVVKEELGGDVKVESTSPKTFLESKEELSH
           180       190       200       210       220       230   

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pF1KE9 SPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYHIFCLLPPLPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYHIFCLLPPLPE
           240       250       260       270       280       290   

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pF1KE9 IPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTEL
           300       310       320       330       340       350   

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pF1KE9 VEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRHLTPEEEEYATSGWNLNVMP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRHLTPEEEEYATSGWNLNVMP
           360       370       380       390       400       410   

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pF1KE9 VLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSL
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pF1KE9 AAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRA
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pF1KE9 YHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLDL
           540       550       560       570       580       590   

     660       670       680       690       700       710         
pF1KE9 NLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALA
           600       610       620       630       640       650   

     720       730       740       750       760       770         
pF1KE9 CYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVRVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVRVA
           660       670       680       690       700       710   

     780       790       800       810       820       830         
pF1KE9 LEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEAGP
           720       730       740       750       760       770   

     840       850       860       870       880       890         
pF1KE9 HRVAGLQMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVLEQVEAYQAEAREALASLPSSPGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HRVAGLQMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVLEQVEAYQAEAREALASLPSSPGL
           780       790       800       810       820       830   

     900       910       920       930       940       950         
pF1KE9 LQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVMRGLLVAGASV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVMRGLLVAGASV
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     960       970       980       990      1000      1010         
pF1KE9 APSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 APSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQ
           900       910       920       930       940       950   

    1020      1030      1040      1050      1060      1070         
pF1KE9 ALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHS
           960       970       980       990      1000      1010   

    1080      1090      1100      1110      1120      1130         
pF1KE9 WREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 WREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQDL
          1020      1030      1040      1050      1060      1070   

    1140      1150      1160      1170      1180      1190         
pF1KE9 RDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGAL
          1080      1090      1100      1110      1120      1130   

    1200      1210      1220      1230      1240      1250         
pF1KE9 QCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNPTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNPTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILA
          1140      1150      1160      1170      1180      1190   

    1260      1270      1280      1290      1300      1310         
pF1KE9 LLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASEDVTALLGRLAELRQRLQAEPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASEDVTALLGRLAELRQRLQAEPR
          1200      1210      1220      1230      1240      1250   

    1320      1330      1340      1350      1360      1370         
pF1KE9 PEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDMPKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSGKRDLELLSSL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   ::::::::
CCDS55 PEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDMPKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGS---DLELLSSL
          1260      1270      1280      1290      1300         1310

    1380      1390      1400      1410      1420      1430         
pF1KE9 LPQLTGPVLELPEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLEL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                     
CCDS55 LPQLTGPVLELPEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIPESLDFCILTPRYCSDLSSWG
             1320      1330      1340      1350      1360      1370

    1440      1450      1460      1470      1480      1490         
pF1KE9 EKAERHGSRARGRALERRRRRKVDRGGEGDDPAREELEPKRVRSSGPEAEEVQEEEELEE
                                                                   
CCDS55 PAPGVFPPW                                                   
                                                                   

>>CCDS55554.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY               (1482 aa)
 initn: 5498 init1: 3556 opt: 7291  Z-score: 5803.3  bits: 1086.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8443; 81.5% identity (89.6% similar) in 1562 aa overlap (1-1559:1-1482)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE9 MEPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEV
       :::: :.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MEPGCDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 DNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERRILDLYSLSKIVV
       ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::   
CCDS55 DNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSLSKQ--
               70        80        90       100       110          

              130       140       150       160       170       180
pF1KE9 EEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLVCNTRPF
                                                             :::.::
CCDS55 ------------------------------------------------------CNTHPF
                                                            120    

              190       200       210       220       230       240
pF1KE9 DNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPELKKLQIYGA
       ::: :::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::.:::::::::: 
CCDS55 DNEVKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSSYSRRAKRLQPDPEPTEEDIEKHPELKKLQIYGP
          130       140       150       160       170       180    

              250         260       270       280       290        
pF1KE9 GPKMMGLGLMAKDK--TLRKKDKEGPECPPTVVVKEELGGDVKVESTSPKTFLESKEELS
       ::::::::::::::  :..::      :::::.::.: .:  .: ::  :  :       
CCDS55 GPKMMGLGLMAKDKDKTVHKK----VTCPPTVTVKDEQSGGGNVSSTLLKQHL-------
          190       200           210       220       230          

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE9 HSPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYHIFCLLPPLP
        : ::::: ::.::.:::.::::.::.:..:::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS55 -SLEPCTKTTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHIFCLLPPLP
            240       250       260       270       280       290  

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE9 EIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTE
       :::.:.::::::..::::.:::::::::::.::.::::::::::::.:::::::::::::
CCDS55 EIPRGIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNMPVHMVPTE
            300       310       320       330       340       350  

      420       430       440       450       460       470        
pF1KE9 LVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRHLTPEEEEYATSGWNLNVM
       ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::..:.:::.::::::::::::
CCDS55 LVEKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKEYATSGWNLNVM
            360       370       380       390       400       410  

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pF1KE9 PVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPS
       :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PVLDQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPS
            420       430       440       450       460       470  

      540       550       560       570       580       590        
pF1KE9 LAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPR
       ::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LAAEHLEEVMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPR
            480       490       500       510       520       530  

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pF1KE9 AYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :: ::
CCDS55 AYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPETLD
            540       550       560       570       580       590  

      660       670       680       690       700       710        
pF1KE9 LNLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSAL
       ::::.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LNLAVAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSAL
            600       610       620       630       640       650  

      720       730       740       750       760       770        
pF1KE9 ACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.::::::::::::::
CCDS55 ACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFDTWANKVRV
            660       670       680       690       700       710  

      780       790       800       810       820       830        
pF1KE9 ALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEAG
       :::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::.:::....::::::: : 
CCDS55 ALEVEDGRKRSFEELRALESEARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLGLVSGQVA-
            720       730       740       750       760       770  

      840       850       860       870       880       890        
pF1KE9 PHRVAGLQMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVLEQVEAYQAEAREALASLPSSPG
         :.   :.::::::..:.::..:::::::::::: :::::::::::::::::.::::::
CCDS55 --RMDTPQLTLTELRVLLEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEAREALATLPSSPG
               780       790       800       810       820         

      900       910       920       930       940       950        
pF1KE9 LLQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVMRGLLVAGAS
       ::.::::::.:::::::::.:::.:::::.::::::..:::::.::.:..:.:::: ::.
CCDS55 LLRSLLERGQQLGVEVPEAHQLQQQVEQAQWLDEVKQALAPSAHRGSLVIMQGLLVMGAK
     830       840       850       860       870       880         

      960       970       980       990      1000      1010        
pF1KE9 VAPSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPNI
       .: ::.::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS55 IASSPSVDKARAELQELLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAIIRETENIPVHLPNI
     890       900       910       920       930       940         

     1020      1030      1040      1050      1060      1070        
pF1KE9 QALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAH
       :::::::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QALKEALTKAQAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAH
     950       960       970       980       990      1000         

     1080      1090      1100      1110      1120      1130        
pF1KE9 SWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::. :::::::::::
CCDS55 SWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKALGLYQCDTELLGLSAQD
    1010      1020      1030      1040      1050      1060         

     1140      1150      1160      1170      1180      1190        
pF1KE9 LRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :  ::: ::::::::: ::.:.
CCDS55 LRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSLMASSPTSICVCGQVPAGVGV
    1070      1080      1090      1100      1110      1120         

     1200      1210      1220      1230      1240      1250        
pF1KE9 LQCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNPTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETIL
       ::::::::::::.:::::.::.::.:. ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LQCDLCQDWFHGQCVSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETIL
    1130      1140      1150      1160      1170      1180         

     1260      1270      1280      1290      1300      1310        
pF1KE9 ALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASEDVTALLGRLAELRQRLQAEP
       :::::::::::::::::::::::::::.:: :::.::::::::::: .::::::.:::.:
CCDS55 ALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAIGWQDRARKALASEDVTALLRQLAELRQQLQAKP
    1190      1200      1210      1220      1230      1240         

     1320      1330      1340      1350      1360      1370        
pF1KE9 RPEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDMPKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSGKRDLELLSS
       ::::   : .: : ::.:::::... ::::::::::::::::..:: .::   :::::::
CCDS55 RPEEASVYTSATACDPIREGSGNNISKVQGLLENGDSVTSPENMAPGKGS---DLELLSS
    1250      1260      1270      1280      1290         1300      

     1380      1390      1400      1410      1420      1430        
pF1KE9 LLPQLTGPVLELPEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLE
       ::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS55 LLPQLTGPVLELPEAIRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLDRIRTLLE
       1310      1320      1330      1340      1350      1360      

     1440      1450      1460       1470      1480      1490       
pF1KE9 LEKAERHGSRARGRALERRRRR-KVDRGGEGDDPAREELEPKRVRSSGPEAEEVQEEEEL
       ::: :..:::.:.::::::::: :::.: . .. ...::. ::.::::  ..  .:::. 
CCDS55 LEKFEHQGSRTRSRALERRRRRQKVDQGRNVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREEEHY
       1370      1380      1390      1400      1410      1420      

      1500      1510      1520      1530      1540      1550       
pF1KE9 EEETGGEGPPAPIPTTGSPSTQENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQ
       .:..  :.      :  ::  . :::.:.  .   :: ::   .: : :.:   .   .:
CCDS55 QEKADRENMFLTPSTDHSPFLKGNQNSLQHKD---SGSSAACPSLMPLLQL---SYSDEQ
       1430      1440      1450         1460      1470         1480

         
pF1KE9 QL
       ::
CCDS55 QL
         

>>CCDS14794.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY               (1539 aa)
 initn: 5868 init1: 3556 opt: 7291  Z-score: 5803.0  bits: 1086.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8926; 84.8% identity (93.2% similar) in 1563 aa overlap (1-1559:1-1539)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE9 MEPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEV
       :::: :.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MEPGCDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 DNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERRILDLYSLSKIVV
       ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.
CCDS14 DNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSLSKIVI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170          
pF1KE9 EEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLV-CNTRP
       :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::.::::: : :::.:
CCDS14 EEGGYEAICKDRRWARVAQRLHYPPGKNIGSLLRSHYERIIYPYEMFQSGANHVQCNTHP
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE9 FDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPELKKLQIYG
       :::: :::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS14 FDNEVKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSSYSRRAKRLQPDPEPTEEDIEKHPELKKLQIYG
              190       200       210       220       230       240

     240       250         260       270       280       290       
pF1KE9 AGPKMMGLGLMAKDK--TLRKKDKEGPECPPTVVVKEELGGDVKVESTSPKTFLESKEEL
        ::::::::::::::  :..::      :::::.::.: .:  .: ::  :  :      
CCDS14 PGPKMMGLGLMAKDKDKTVHKK----VTCPPTVTVKDEQSGGGNVSSTLLKQHL------
              250       260           270       280       290      

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE9 SHSPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYHIFCLLPPL
         : ::::: ::.::.:::.::::.::.:..:::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS14 --SLEPCTKTTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHIFCLLPPL
                300       310       320       330       340        

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE9 PEIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPT
       ::::.:.::::::..::::.:::::::::::.::.::::::::::::.::::::::::::
CCDS14 PEIPRGIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNMPVHMVPT
      350       360       370       380       390       400        

       420       430       440       450       460       470       
pF1KE9 ELVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRHLTPEEEEYATSGWNLNV
       :::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::..:.:::.:::::::::::
CCDS14 ELVEKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKEYATSGWNLNV
      410       420       430       440       450       460        

       480       490       500       510       520       530       
pF1KE9 MPVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVP
       ::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MPVLDQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVP
      470       480       490       500       510       520        

       540       550       560       570       580       590       
pF1KE9 SLAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFP
       :::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SLAAEHLEEVMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFP
      530       540       550       560       570       580        

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pF1KE9 RAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :: :
CCDS14 RAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPETL
      590       600       610       620       630       640        

       660       670       680       690       700       710       
pF1KE9 DLNLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSA
       :::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DLNLAVAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSA
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       720       730       740       750       760       770       
pF1KE9 LACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::
CCDS14 LACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFDTWANKVR
      710       720       730       740       750       760        

       780       790       800       810       820       830       
pF1KE9 VALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEA
       ::::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::.:::....::::::: :
CCDS14 VALEVEDGRKRSFEELRALESEARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLGLVSGQVA
      770       780       790       800       810       820        

       840       850       860       870       880       890       
pF1KE9 GPHRVAGLQMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVLEQVEAYQAEAREALASLPSSP
          :.   :.::::::..:.::..:::::::::::: :::::::::::::::::.:::::
CCDS14 ---RMDTPQLTLTELRVLLEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEAREALATLPSSP
         830       840       850       860       870       880     

       900       910       920       930       940       950       
pF1KE9 GLLQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVMRGLLVAGA
       :::.::::::.:::::::::.:::.:::::.::::::..:::::.::.:..:.:::: ::
CCDS14 GLLRSLLERGQQLGVEVPEAHQLQQQVEQAQWLDEVKQALAPSAHRGSLVIMQGLLVMGA
         890       900       910       920       930       940     

       960       970       980       990      1000      1010       
pF1KE9 SVAPSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPN
       ..: ::.::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS14 KIASSPSVDKARAELQELLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAIIRETENIPVHLPN
         950       960       970       980       990      1000     

      1020      1030      1040      1050      1060      1070       
pF1KE9 IQALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTA
       ::::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IQALKEALTKAQAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTA
        1010      1020      1030      1040      1050      1060     

      1080      1090      1100      1110      1120      1130       
pF1KE9 HSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::. ::::::::::
CCDS14 HSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKALGLYQCDTELLGLSAQ
        1070      1080      1090      1100      1110      1120     

      1140      1150      1160      1170      1180      1190       
pF1KE9 DLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :  ::: ::::::::: ::.:
CCDS14 DLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSLMASSPTSICVCGQVPAGVG
        1130      1140      1150      1160      1170      1180     

      1200      1210      1220      1230      1240      1250       
pF1KE9 ALQCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNPTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETI
       .::::::::::::.:::::.::.::.:. :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VLQCDLCQDWFHGQCVSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETI
        1190      1200      1210      1220      1230      1240     

      1260      1270      1280      1290      1300      1310       
pF1KE9 LALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASEDVTALLGRLAELRQRLQAE
       ::::::::::::::::::::::::::::.:: :::.::::::::::: .::::::.:::.
CCDS14 LALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAIGWQDRARKALASEDVTALLRQLAELRQQLQAK
        1250      1260      1270      1280      1290      1300     

      1320      1330      1340      1350      1360      1370       
pF1KE9 PRPEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDMPKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSGKRDLELLS
       :::::   : .: : ::.:::::... ::::::::::::::::..:: .::   ::::::
CCDS14 PRPEEASVYTSATACDPIREGSGNNISKVQGLLENGDSVTSPENMAPGKGS---DLELLS
        1310      1320      1330      1340      1350         1360  

      1380      1390      1400      1410      1420      1430       
pF1KE9 SLLPQLTGPVLELPEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLL
       :::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS14 SLLPQLTGPVLELPEAIRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLDRIRTLL
           1370      1380      1390      1400      1410      1420  

      1440      1450      1460       1470      1480      1490      
pF1KE9 ELEKAERHGSRARGRALERRRRR-KVDRGGEGDDPAREELEPKRVRSSGPEAEEVQEEEE
       :::: :..:::.:.::::::::: :::.: . .. ...::. ::.::::  ..  .:::.
CCDS14 ELEKFEHQGSRTRSRALERRRRRQKVDQGRNVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREEEH
           1430      1440      1450      1460      1470      1480  

       1500      1510      1520      1530      1540      1550      
pF1KE9 LEEETGGEGPPAPIPTTGSPSTQENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQ
        .:..  :.      :  ::  . :::.:.  .   :: ::   .: : :.:   .   .
CCDS14 YQEKADRENMFLTPSTDHSPFLKGNQNSLQHKD---SGSSAACPSLMPLLQL---SYSDE
           1490      1500      1510         1520      1530         

          
pF1KE9 QQL
       :::
CCDS14 QQL
          

>>CCDS55555.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY               (1570 aa)
 initn: 6421 init1: 3044 opt: 6152  Z-score: 4896.5  bits: 918.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8855; 83.1% identity (91.3% similar) in 1594 aa overlap (1-1559:1-1570)

               10        20        30        40        50        60
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       :::: :.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MEPGCDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 DNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERRILDLYSLSKIVV
       ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.
CCDS55 DNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSLSKIVI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170          
pF1KE9 EEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLV-CNTRP
       :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::.::::: : :::.:
CCDS55 EEGGYEAICKDRRWARVAQRLHYPPGKNIGSLLRSHYERIIYPYEMFQSGANHVQCNTHP
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE9 FDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPELKKLQIYG
       :::: :::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS55 FDNEVKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSSYSRRAKRLQPDPEPTEEDIEKHPELKKLQIYG
              190       200       210       220       230       240

     240       250         260       270       280       290       
pF1KE9 AGPKMMGLGLMAKDK--TLRKKDKEGPECPPTVVVKEELGGDVKVESTSPKTFLESKEEL
        ::::::::::::::  :..::      :::::.::.: .:  .: ::  :  :      
CCDS55 PGPKMMGLGLMAKDKDKTVHKK----VTCPPTVTVKDEQSGGGNVSSTLLKQHL------
              250       260           270       280       290      

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE9 SHSPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYHIFCLLPPL
         : ::::: ::.::.:::.::::.::.:..:::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS55 --SLEPCTKTTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHIFCLLPPL
                300       310       320       330       340        

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE9 PEIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPT
       ::::.:.::::::..::::.:::::::::::.::.::::::::::::.::::::::::::
CCDS55 PEIPRGIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNMPVHMVPT
      350       360       370       380       390       400        

       420       430       440       450       460                 
pF1KE9 ELVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRHLTPEE------------
       :::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::..:.:::            
CCDS55 ELVEKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKRQSLTVLTRLI
      410       420       430       440       450       460        

                            470       480       490       500      
pF1KE9 -------------------EEYATSGWNLNVMPVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMV
                          .:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SSFWAQAVLPPWPPKVLGLQEYATSGWNLNVMPVLDQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMV
      470       480       490       500       510       520        

        510       520       530       540       550       560      
pF1KE9 FSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS55 FSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMKMLTPELFDSQPDLLHQL
      530       540       550       560       570       580        

        570       580       590       600       610       620      
pF1KE9 VTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGR
      590       600       610       620       630       640        

        630       640       650       660       670       680      
pF1KE9 QCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLDLNLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEK
       :::::::::::::::::::::::::: :: ::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS55 QCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPETLDLNLAVAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEK
      650       660       670       680       690       700        

        690       700       710       720       730       740      
pF1KE9 GITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYL
       :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GVTEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYL
      710       720       730       740       750       760        

        750       760       770       780       790       800      
pF1KE9 RYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFP
       ::::::::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS55 RYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSFEELRALESEARERRFP
      770       780       790       800       810       820        

        810       820       830       840       850       860      
pF1KE9 NSELLQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEAGPHRVAGLQMTLTELRAFLDQMNNLPCAM
       ::::::.:::::::.:::....::::::: :   :.   :.::::::..:.::..:::::
CCDS55 NSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLGLVSGQVA---RMDTPQLTLTELRVLLEQMGSLPCAM
      830       840       850          860       870       880     

        870       880       890       900       910       920      
pF1KE9 HQIGDVKGVLEQVEAYQAEAREALASLPSSPGLLQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQ
       ::::::: :::::::::::::::::.::::::::.::::::.:::::::::.:::.::::
CCDS55 HQIGDVKDVLEQVEAYQAEAREALATLPSSPGLLRSLLERGQQLGVEVPEAHQLQQQVEQ
         890       900       910       920       930       940     

        930       940       950       960       970       980      
pF1KE9 ARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVMRGLLVAGASVAPSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKA
       :.::::::..:::::.::.:..:.:::: ::..: ::.::::.:::::::::::::::::
CCDS55 AQWLDEVKQALAPSAHRGSLVIMQGLLVMGAKIASSPSVDKARAELQELLTIAERWEEKA
         950       960       970       980       990      1000     

        990      1000      1010      1020      1030      1040      
pF1KE9 HLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPC
       :.:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::
CCDS55 HFCLEARQKHPPATLEAIIRETENIPVHLPNIQALKEALTKAQAWIADVDEIQNGDHYPC
        1010      1020      1030      1040      1050      1060     

       1050      1060      1070      1080      1090      1100      
pF1KE9 LDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCAD
        1070      1080      1090      1100      1110      1120     

       1110      1120      1130      1140      1150      1160      
pF1KE9 AGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRT
       :::::::::::::: ::::. :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AGSDSTKRSRWMEKALGLYQCDTELLGLSAQDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRT
        1130      1140      1150      1160      1170      1180     

       1170      1180      1190      1200      1210      1220      
pF1KE9 NSAKPSPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGALQCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNP
       ::::::::: :  ::: ::::::::: ::.:.::::::::::::.:::::.::.::.:. 
CCDS55 NSAKPSPLAPSLMASSPTSICVCGQVPAGVGVLQCDLCQDWFHGQCVSVPHLLTSPKPSL
        1190      1200      1210      1220      1230      1240     

       1230      1240      1250      1260      1270      1280      
pF1KE9 TSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAIS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS55 TSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAIG
        1250      1260      1270      1280      1290      1300     

       1290      1300      1310      1320      1330      1340      
pF1KE9 WQGRARQALASEDVTALLGRLAELRQRLQAEPRPEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDMPKV
       :: :::.::::::::::: .::::::.:::.:::::   : .: : ::.:::::... ::
CCDS55 WQDRARKALASEDVTALLRQLAELRQQLQAKPRPEEASVYTSATACDPIREGSGNNISKV
        1310      1320      1330      1340      1350      1360     

       1350      1360      1370      1380      1390      1400      
pF1KE9 QGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSGKRDLELLSSLLPQLTGPVLELPEATRAPLEELMMEGD
       ::::::::::::::..:: .::   :::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS55 QGLLENGDSVTSPENMAPGKGS---DLELLSSLLPQLTGPVLELPEAIRAPLEELMMEGD
        1370      1380         1390      1400      1410      1420  

       1410      1420      1430      1440      1450      1460      
pF1KE9 LLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLELEKAERHGSRARGRALERRRRR-KVDRG
       ::::::::::::::::::::::::.:::::::::: :..:::.:.::::::::: :::.:
CCDS55 LLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLDRIRTLLELEKFEHQGSRTRSRALERRRRRQKVDQG
           1430      1440      1450      1460      1470      1480  

        1470      1480      1490      1500      1510      1520     
pF1KE9 GEGDDPAREELEPKRVRSSGPEAEEVQEEEELEEETGGEGPPAPIPTTGSPSTQENQNGL
        . .. ...::. ::.::::  ..  .:::. .:..  :.      :  ::  . :::.:
CCDS55 RNVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREEEHYQEKADRENMFLTPSTDHSPFLKGNQNSL
           1490      1500      1510      1520      1530      1540  

        1530      1540      1550         
pF1KE9 EPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQQL
       .  .   :: ::   .: : :.:   .   .:::
CCDS55 QHKD---SGSSAACPSLMPLLQL---SYSDEQQL
              1550      1560         1570

>>CCDS81417.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1              (1580 aa)
 initn: 4571 init1: 2583 opt: 4344  Z-score: 3457.6  bits: 652.6 E(32554): 2.9e-186
Smith-Waterman score: 4668; 47.8% identity (71.9% similar) in 1572 aa overlap (3-1528:20-1525)

                                 10        20        30        40  
pF1KE9                  MEPGS-DDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSG
                          ::   .:::::::::::::: :: ::...: :::::::..:
CCDS81 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
               10        20        30        40        50        60

             50        60        70        80        90       100  
pF1KE9 ICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKI
       :::.::: ::::::: .::...::::::::::::::::::::.::::::.::.:::.:::
CCDS81 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
               70        80        90       100       110       120

            110       120       130       140       150       160  
pF1KE9 PNVERRILDLYSLSKIVVEEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVY
       :.:::.::::..:.:.:.::::. ..::::.:...: .... ::: .:: .:.:::::. 
CCDS81 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
              130       140       150       160       170       180

            170        180       190       200       210       220 
pF1KE9 PYEMYQSGANLVCNTRP-FDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPE-
       ::... :: .: :  .: . .. ::::::::.:: :::::::.    .:::::.. . . 
CCDS81 PYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAERQS
              190       200       210       220       230       240

                     230       240          250           260      
pF1KE9 ----PTEE---DIEKNPELKKLQIYGAGP---KMMGLGLMAKDKTLRK----KDKEGPEC
           :  :    :  . .:. :.  ...    . :.. .  .. :  .    . . :  :
CCDS81 LAVLPRLECSGAILAHCNLRLLDSSNSSASASQAMNIKIEPEETTEARTHNLRRRMG--C
              250       260       270       280       290          

         270       280       290       300       310       320     
pF1KE9 P-PTVVVKEELGGDVKVESTSPKTFLESKEELSHSPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYV
       : :    ..:. ...: :    : ..  .:.     .: ..      .. .::  .. ::
CCDS81 PTPKCENEKEMKSSIKQEPIERKDYIVENEK----EKPKSR-----SKKATNA--VDLYV
      300       310       320           330            340         

         330       340       350       360       370       380     
pF1KE9 CRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFE
       : .:. :...:.:::::::::.:: :::.::: ..::: ::::::.  ::..: ::::::
CCDS81 CLLCGSGNDEDRLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFE
       350       360       370       380       390       400       

         390       400       410       420       430       440     
pF1KE9 QATREYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHS
       ::.:.:::..::::::.::.:::::::::::::::::::::::..::::::::::::: :
CCDS81 QAARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIAS
       410       420       430       440       450       460       

         450       460       470       480       490       500     
pF1KE9 KEFGSGFPVSDSKRHLTPEEEEYATSGWNLNVMPVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGM
       ::::::::: :.: .:.::::::  :::::: :::.::::: ::.::: :::.:::::::
CCDS81 KEFGSGFPVRDGKIKLSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGM
       470       480       490       500       510       520       

         510       520       530       540       550       560     
pF1KE9 VFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQ
        ::.::::::::::::::::::::::::::::. :::.::.:::::.:::: ::::::::
CCDS81 CFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQ
       530       540       550       560       570       580       

         570       580       590       600       610       620     
pF1KE9 LVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAG
       :::.:::::::.: ::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::: :
CCDS81 LVTIMNPNTLMTHEVPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLG
       590       600       610       620       630       640       

         630       640       650       660       670       680     
pF1KE9 RQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLDLNLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLE
       :::.:::: :.:::::::.:.:::::.  . ::. .:..:.:.: ::...:. ::... .
CCDS81 RQCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRK
       650       660       670       680       690       700       

         690       700       710       720       730       740     
pF1KE9 KGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQY
        :. ..::  :::::::::::.:::::::.::..:   :  :::: :...::.:   .  
CCDS81 LGVIDSERMDFELLPDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYK
       710       720       730       740       750       760       

         750       760       770       780       790       800     
pF1KE9 LRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRF
       ::::::::.:  :.. ::.::::.. :: .:  :::.. ..:.::  ..::  :.. ..:
CCDS81 LRYRYTLDDLYPMMNALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEESEMKKF
       770       780       790       800       810       820       

         810       820       830       840           850       860 
pF1KE9 PNSELLQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEAGPHRVAGL----QMTLTELRAFLDQMNN
       :...::..:.   ..:: :.: :  :..:..   .: .:     :.:..::: :. :.  
CCDS81 PDNDLLRHLRLVTQDAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYA
       830       840       850       860       870       880       

             870       880       890       900       910       920 
pF1KE9 LPCAMHQIGDVKGVLEQVEAYQAEAREALASLPSSPGLLQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQ
       :::.. :   .: .:..:: .: .... :.    : . ::.::. . .. ::.:.  ...
CCDS81 LPCVLSQTPLLKDLLNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMR
       890       900       910       920       930       940       

             930        940       950       960       970       980
pF1KE9 RQVEQARWLDEVKRT-LAPSARRGTLAVMRGLLVAGASVAPSPAVDKAQAELQELLTIAE
        ..::::::.::... : ::.   ::  :: :.  :...::  ::.::.:.::::::..:
CCDS81 IRLEQARWLEEVQQACLDPSSL--TLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQELLTVSE
       950       960         970       980       990      1000     

              990      1000      1010      1020      1030      1040
pF1KE9 RWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQALKEALAKARAWIADVDEIQN
       .:..::.  :.:: .:   .: . ..: :.::..:::  :::... .:: :. ::. .: 
CCDS81 HWDDKAKSLLKARPRHSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQDVEGLQA
        1010      1020      1030      1040      1050      1060     

             1050      1060      1070      1080      1090      1100
pF1KE9 GDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEV
       : . : :: :  ::. ::..:: :. : .::  :  ...:.: : .::: .:: :.::::
CCDS81 GGRVPVLDTLIELVTRGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSPYSLLEV
        1070      1080      1090      1100      1110      1120     

             1110       1120       1130           1140      1150   
pF1KE9 LCPCADAGSDSTKRS-RWMEKEL-GLYKSDTELLGLSA-----QDLRDPGSVIVAFKEGE
       :::  : :  . ::. : ... : .  :..:.: .::       . .. .:..... :..
CCDS81 LCPRCDIGLLGLKRKQRKLKEPLPNGKKKSTKLESLSDLERALTESKETASAMATLGEAR
        1130      1140      1150      1160      1170      1180     

          1160      1170       1180      1190      1200      1210  
pF1KE9 QKEKEGILQLRRTNSAKP-SPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGALQCDLCQDWFHGRC
        .: :.. .:: .: .:  ::: . .      .::.: :   .:  .::.::.: ::  :
CCDS81 LREMEALQSLRLANEGKLLSPLQDVDI-----KICLC-QKAPAAPMIQCELCRDAFHTSC
        1190      1200      1210            1220      1230         

           1220      1230      1240      1250      1260      1270  
pF1KE9 VSVPRLLSSPRPNPTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLP
       :.:: .         :. :  :       ::: : ::..: :: :: ::..:::. ::::
CCDS81 VAVPSI---------SQGLRIW-------LCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLP
    1240               1250             1260      1270      1280   

           1280      1290      1300        1310      1320      1330
pF1KE9 EGEALQCLTERAISWQGRARQALASEDVTALLGRLAE--LRQRLQAEPRPEEPPNYPAAP
       ::.::. . ::...:: ::.: :.: ..  .  :..   : .: ::        :  . :
CCDS81 EGDALRYMIERTVNWQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQP
          1290      1300      1310      1320      1330      1340   

             1340      1350      1360      1370      1380      1390
pF1KE9 ASDPLREGSGKDMPKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSGKRDLELLSSLLPQLTGPVLEL
        .      .. ..:      .. :. ::  . .:  ..:.       : .: : :     
CCDS81 PGT-----TSFSLP------DDWDNRTSYLH-SPF-STGR-------SCIP-LHGVS---
               1350            1360        1370                    

             1400      1410      1420      1430      1440          
pF1KE9 PEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLELEKAERH----G
       ::     ..::.::..::.:.: : . ..: : :   :  .  :.     ..:..    :
CCDS81 PE-----VNELLMEAQLLQVSLPEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCCRG
    1380           1390      1400      1410      1420      1430    

       1450      1460         1470      1480         1490      1500
pF1KE9 SRARGRALERRRRRKVDRGG---EGDDPAREELEPKR--VRSSGP-EAEEVQEEEELEEE
       .:    .:::. .:...: :   :  . ...   ::.  .. : : . .. . :.:   :
CCDS81 KRDGINSLERKLKRRLEREGLSSERWERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYE
         1440      1450      1460      1470      1480      1490    

             1510      1520         1530      1540      1550       
pF1KE9 TGGEGPPAPIPTTGSPSTQEN---QNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQ
           .    .:.  : : ::.   .... ::                             
CCDS81 LVRSAETHSLPSDTSYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCV
         1500      1510      1520      1530      1540      1550    

                                 
pF1KE9 QL                        
                                 
CCDS81 GVSPEMAEKEDYICVRCTVKDAPSRK
         1560      1570      1580

>>CCDS41736.1 KDM5A gene_id:5927|Hs108|chr12              (1690 aa)
 initn: 5294 init1: 2699 opt: 4033  Z-score: 3209.7  bits: 606.8 E(32554): 1.8e-172
Smith-Waterman score: 5209; 51.7% identity (74.1% similar) in 1605 aa overlap (3-1504:6-1558)

                    10        20        30        40        50     
pF1KE9    MEPG--SDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPP
            ::  . .:.:::::::::::: :: :::..:..:::.:::.:::::::: :::::
CCDS41 MAGVGPGGYAAEFVPPPECPVFEPSWEEFTDPLSFIGRIRPLAEKTGICKIRPPKDWQPP
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE9 FAVEVDNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERRILDLYSL
       :: :: .::::::.::::::::.:::.:..:::.:::::.:::.:::: :::.:::::.:
CCDS41 FACEVKSFRFTPRVQRLNELEAMTRVRLDFLDQLAKFWELQGSTLKIPVVERKILDLYAL
               70        80        90       100       110       120

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE9 SKIVVEEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLVC
       ::::. .::.: . :...:..:..::.: :::. ::::.::::::.::::..:::..:. 
CCDS41 SKIVASKGGFEMVTKEKKWSKVGSRLGYLPGKGTGSLLKSHYERILYPYELFQSGVSLMG
              130       140       150       160       170       180

          180       190       200        210       220       230   
pF1KE9 NTRP-FDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQP-SKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPELK
          : .: .::  : .  :   . : .: ...:   .:..:.. . :    :. .: :::
CCDS41 VQMPNLDLKEK-VEPEVLSTDTQTSPEPGTRMNILPKRTRRVKTQSESG--DVSRNTELK
              190        200       210       220         230       

           240       250       260       270       280       290   
pF1KE9 KLQIYGAGPKMMGLGLMAKDKTLRKKDKEGPECPPTVVVKEELGGDVKVESTSPKTFLES
       ::::.:::::..::.. .:::                  ..:.    :: . :  .:   
CCDS41 KLQIFGAGPKVVGLAMGTKDK------------------EDEVTRRRKVTNRSD-AF---
       240       250                         260       270         

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE9 KEELSHSPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYHIFCL
                   .: :: :..  ...:.. ::: .:.::...:::::::::::.:: :::
CCDS41 ------------NMQMRQRKGTLSVNFVDLYVCMFCGRGNNEDKLLLCDGCDDSYHTFCL
                     280       290       300       310       320   

           360       370       380       390       400       410   
pF1KE9 LPPLPEIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVH
       .::::..::: :::::::  ::..: ::::::::.:::::::::::::.::.::::::::
CCDS41 IPPLPDVPKGDWRCPKCVAEECSKPREAFGFEQAVREYTLQSFGEMADNFKSDYFNMPVH
           330       340       350       360       370       380   

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pF1KE9 MVPTELVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRHLTPEEEEYATSGW
       :::::::::::::::.:::::: ::::::: ::.:::::::.:..:.. ::::::: :::
CCDS41 MVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVIVEYGADISSKDFGSGFPVKDGRRKILPEEEEYALSGW
           390       400       410       420       430       440   

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pF1KE9 NLNVMPVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTW
       ::: ::::::::: :::.:::::::::::::: ::.::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NLNNMPVLEQSVLAHINVDISGMKVPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTW
           450       460       470       480       490       500   

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pF1KE9 YGVPSLAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFV
       ::::: :::.:::::..:.::::.:::::::::::.::::.:: ::::: ::::::::::
CCDS41 YGVPSHAAEQLEEVMRELAPELFESQPDLLHQLVTIMNPNVLMEHGVPVYRTNQCAGEFV
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pF1KE9 ITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAC
       .::::::::::::::::::::::::::::: ::::..:::::::.::::::::: :::: 
CCDS41 VTFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPIGRQCVNHYRRLRRHCVFSHEELIFKMAAD
           570       580       590       600       610       620   

           660       670       680       690       700       710   
pF1KE9 PEKLDLNLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTC
       :: ::..::: : ::. .:..:: :::..... :.  .:.:.:::.:::::::  :.:::
CCDS41 PECLDVGLAAMVCKELTLMTEEETRLRESVVQMGVLMSEEEVFELVPDDERQCSACRTTC
           630       640       650       660       670       680   

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pF1KE9 FLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWA
       :::::.:   :. :::: : .::: :  ... ::::: :..::..:. .::::.:.:::.
CCDS41 FLSALTCSCNPERLVCLYHPTDLCPCPMQKKCLRYRYPLEDLPSLLYGVKVRAQSYDTWV
           690       700       710       720       730       740   

           780       790       800       810       820       830   
pF1KE9 NKVRVALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSEAEACVSRALGLVS
       ..:  :: .. ..:..: :::..  .:..:..:...:...:.. ..:::.:.: :  :.:
CCDS41 SRVTEALSANFNHKKDLIELRVMLEDAEDRKYPENDLFRKLRDAVKEAETCASVAQLLLS
           750       760       770       780       790       800   

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pF1KE9 GQEAGPHRVAG------LQMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVLEQVEAYQAEAR
        ..   :: .        ..:. ::.::..:. .:::.. :  .::..:..:: .. .:.
CCDS41 KKQK--HRQSPDSGRTRTKLTVEELKAFVQQLFSLPCVISQARQVKNLLDDVEEFHERAQ
             810       820       830       840       850       860 

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pF1KE9 EALASLPSSPGLLQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLA
       ::. .   . . :: :.. : .: ::.::  .:.....::::::::. ::. . .. :: 
CCDS41 EAMMDETPDSSKLQMLIDMGSSLYVELPELPRLKQELQQARWLDEVRLTLS-DPQQVTLD
             870       880       890       900       910        920

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pF1KE9 VMRGLLVAGASVAPSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIRE
       ::. :. .:...::  ::.::.::::::::..:::::::..::.:: .:  :.::.:. :
CCDS41 VMKKLIDSGVGLAPHHAVEKAMAELQELLTVSERWEEKAKVCLQARPRHSVASLESIVNE
              930       940       950       960       970       980

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pF1KE9 AENIPVHLPNIQALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEEL
       :.:::. :::. .::::: ::: : : :. ::.:..:  :..::.: : :: .:: :: :
CCDS41 AKNIPAFLPNVLSLKEALQKAREWTAKVEAIQSGSNYAYLEQLESLSAKGRPIPVRLEAL
              990      1000      1010      1020      1030      1040

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pF1KE9 RQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGS-DSTKRSRWMEKEL--GL
        :.: :: .:..:::....::::::: .:::.:: : .: :   : :  :   :::    
CCDS41 PQVESQVAAARAWRERTGRTFLKKNSSHTLLQVLSPRTDIGVYGSGKNRRKKVKELIEKE
             1050      1060      1070      1080      1090      1100

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pF1KE9 YKSDTELLGLSA-----QDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLASSST
        ..: .:  ::      .. :: . :...::: :::: :.. .:: .: ::     .   
CCDS41 KEKDLDLEPLSDLEEGLEETRDTAMVVAVFKEREQKEIEAMHSLRAANLAK----MTMVD
             1110      1120      1130      1140      1150          

    1180      1190      1200      1210      1220      1230         
pF1KE9 ASSTTSICVCGQVLAGAGALQCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNPTSSPLLAWWEWDT
           ...:.: .. .:   :::.::.::::. :: .:.  :: . . .:     :   ..
CCDS41 RIEEVKFCICRKTASGF-MLQCELCKDWFHNSCVPLPK--SSSQKKGSS-----WQAKEV
       1160      1170       1180      1190        1200             

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pF1KE9 KFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASED
       :::::::::::::::::::.:::.::.::::::::::::::::::.::: :::::::...
CCDS41 KFLCPLCMRSRRPRLETILSLLVSLQKLPVRLPEGEALQCLTERAMSWQDRARQALATDE
     1210      1220      1230      1240      1250      1260        

    1300      1310                        1320                 1330
pF1KE9 VTALLGRLAELRQRL------------------QAEPRPEEPPNYPA-----------AP
       ... :..:. : ::.                  .:   :.   . :.           . 
CCDS41 LSSALAKLSVLSQRMVEQAAREKTEKIISAELQKAAANPDLQGHLPSFQQSAFNRVVSSV
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pF1KE9 ASDP----------------LREGSGKDMP-----KVQGLLE-----------NGDSVTS
       .:.:                .::  : ::      : .. ::           ... :..
CCDS41 SSSPRQTMDYDDEETDSDEDIRETYGYDMKDTASVKSSSSLEPNLFCDEEIPIKSEEVVT
     1330      1340      1350      1360      1370      1380        

     1360                     1370       1380       1390      1400 
pF1KE9 PEKVAPE---------------EGSGK-RDLELLSSLLPQ-LTGPVLELPEATRAPLEEL
          .::                .::.  :     : :.:. :  :::::  ...: ::::
CCDS41 HMWTAPSFCAEHAYSSASKSCSQGSSTPRKQPRKSPLVPRSLEPPVLELSPGAKAQLEEL
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            1410      1420      1430      1440      1450       1460
pF1KE9 MMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLELEKAERHGSRARGR-ALERRRRR
       :: ::::::.:::.. ::..::: .::. .:.  ..: .. :..  ...:. . :..:.:
CCDS41 MMVGDLLEVSLDETQHIWRILQATHPPSEDRFLHIMEDDSMEEKPLKVKGKDSSEKKRKR
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pF1KE9 KVDRG----GEGDDPARE--ELEPKRVRSSGPEAEEVQEEEELEEETGGEGPPAPIPTTG
       :...     ::: . ..:  ...  : ..    :.. .: ..: .. . :          
CCDS41 KLEKVEQLFGEGKQKSKELKKMDKPRKKKLKLGADKSKELNKLAKKLAKEEERKKKKEKA
     1510      1520      1530      1540      1550      1560        

         1520      1530      1540      1550                        
pF1KE9 SPSTQENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQQL               
                                                                   
CCDS41 AAAKVELVKESTEKKREKKVLDIPSKYDWSGAEESDDENAVCAAQNCQRPCKDKVDWVQC
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>>CCDS30974.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1              (1544 aa)
 initn: 4574 init1: 2583 opt: 3359  Z-score: 2673.9  bits: 507.5 E(32554): 1.3e-142
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                                 10        20        30        40  
pF1KE9                  MEPGS-DDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSG
                          ::   .:::::::::::::: :: ::...: :::::::..:
CCDS30 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
               10        20        30        40        50        60

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pF1KE9 ICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKI
       :::.::: ::::::: .::...::::::::::::::::::::.::::::.::.:::.:::
CCDS30 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
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pF1KE9 PNVERRILDLYSLSKIVVEEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVY
       :.:::.::::..:.:.:.::::. ..::::.:...: .... ::: .:: .:.:::::. 
CCDS30 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
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pF1KE9 PYEMYQSGANLVCNTRP-FDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEP
       ::... :: .: :  .: . .. ::::::::.:: :::::::.    .:::::.. .   
CCDS30 PYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAEAMN
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             230       240       250       260        270       280
pF1KE9 TEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKMMGLGLMAKDKTLRKKDKEGPECP-PTVVVKEELGGDV
        . . :.. :                   :. ..::.  . :  :: :    ..:. ...
CCDS30 IKIEPEETTE-------------------ARTHNLRR--RMG--CPTPKCENEKEMKSSI
              250                            260         270       

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pF1KE9 KVESTSPKTFLESKEELSHSPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLL
       : :    : ..  .:.     .: ..      .. .::  .. ::: .:. :...:.:::
CCDS30 KQEPIERKDYIVENEK----EKPKSR-----SKKATNA--VDLYVCLLCGSGNDEDRLLL
       280       290                300         310       320      

              350       360       370       380       390       400
pF1KE9 CDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMA
       ::::::.:: :::.::: ..::: ::::::.  ::..: ::::::::.:.:::..:::::
CCDS30 CDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMA
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              410       420       430       440       450       460
pF1KE9 DSFKADYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRH
       :.::.:::::::::::::::::::::::..::::::::::::: :::::::::: :.: .
CCDS30 DAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIK
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pF1KE9 LTPEEEEYATSGWNLNVMPVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSY
       :.::::::  :::::: :::.::::: ::.::: :::.::::::: ::.:::::::::::
CCDS30 LSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSY
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pF1KE9 SINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGV
       :::::::::::::::::. :::.::.:::::.:::: :::::::::::.:::::::.: :
CCDS30 SINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHEV
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pF1KE9 PVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCV
       :: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::: ::::.:::: :.::::
CCDS30 PVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYCV
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       :::.:.:::::.  . ::. .:..:.:.: ::...:. ::... . :. ..::  :::::
CCDS30 FSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFELLP
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pF1KE9 DDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLH
       ::::::.:::::::.::..:   :  :::: :...::.:   .  ::::::::.:  :..
CCDS30 DDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMN
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pF1KE9 KLKVRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSE
        ::.::::.. :: .:  :::.. ..:.::  ..::  :.. ..::...::..:.   ..
CCDS30 ALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQD
        750       760       770       780       790       800      

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pF1KE9 AEACVSRALGLVSGQEAGPHRVAGL----QMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVL
       :: :.: :  :..:..   .: .:     :.:..::: :. :.  :::.. :   .: .:
CCDS30 AEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDLL
        810       820       830       840       850       860      

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pF1KE9 EQVEAYQAEAREALASLPSSPGLLQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRT
       ..:: .: .... :.    : . ::.::. . .. ::.:.  ... ..::::::.::...
CCDS30 NRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQA
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pF1KE9 -LAPSARRGTLAVMRGLLVAGASVAPSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQK
        : ::.   ::  :: :.  :...::  ::.::.:.::::::..:.:..::.  :.:: .
CCDS30 CLDPSSL--TLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPR
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pF1KE9 HPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVA
       :   .: . ..: :.::..:::  :::... .:: :. ::. .: : . : :: :  ::.
CCDS30 HSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVT
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pF1KE9 VGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRS
        ::..:: :. : .::  :  ...:.: : .::: .:: :.:::::::  : :  . ::.
CCDS30 RGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKRK
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pF1KE9 -RWMEKEL-GLYKSDTELLGLSA-----QDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNS
        : ... : .  :..:.: .::       . .. .:..... :.. .: :.. .:: .: 
CCDS30 QRKLKEPLPNGKKKSTKLESLSDLERALTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLANE
         1110      1120      1130      1140      1150      1160    

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pF1KE9 AKP-SPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGALQCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNPT
       .:  ::: . .      .::.: :   .:  .::.::.: ::  ::.:: .         
CCDS30 GKLLSPLQDVDI-----KICLC-QKAPAAPMIQCELCRDAFHTSCVAVPSI---------
         1170           1180       1190      1200                  

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pF1KE9 SSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISW
       :. :  :       ::: : ::..: :: :: ::..:::. ::::::.::. . ::...:
CCDS30 SQGLRIW-------LCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTVNW
    1210             1220      1230      1240      1250      1260  

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pF1KE9 QGRARQALASEDVTALLGRLAE--LRQRLQAEPRPEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDMPK
       : ::.: :.: ..  .  :..   : .: ::        :  . : .      .. ..: 
CCDS30 QHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQPPGT-----TSFSLP-
           1270      1280      1290      1300      1310            

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pF1KE9 VQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSGKRDLELLSSLLPQLTGPVLELPEATRAPLEELMMEG
            .. :. ::  . .:  ..:.       : .: : :     ::     ..::.::.
CCDS30 -----DDWDNRTSYLH-SPF-STGR-------SCIP-LHGVS---PE-----VNELLMEA
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pF1KE9 DLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLELEKAERH----GSRARGRALERRRRRK
       .::.:.: : . ..: : :   :  .  :.     ..:..    :.:    .:::. .:.
CCDS30 QLLQVSLPEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCCRGKRDGINSLERKLKRR
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pF1KE9 VDRGG---EGDDPAREELEPKR--VRSSGP-EAEEVQEEEELEEETGGEGPPAPIPTTGS
       ..: :   :  . ...   ::.  .. : : . .. . :.:   :    .    .:.  :
CCDS30 LEREGLSSERWERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELVRSAETHSLPSDTS
          1420      1430      1440      1450      1460      1470   

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pF1KE9 PSTQEN---QNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQQL             
        : ::.   .... ::                                            
CCDS30 YSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYICV
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>>CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11            (506 aa)
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CCDS44 ARQMYDDIEDILIATPLQQVTSGQGGVFTQYHKKKKAMRVGQYRRLANSKK---YQTPPH
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       .  ..: :...:.   :   .  . :::::     :: :              : .:. :
CCDS44 QNFADL-EQRYWK---SHPGNPPI-YGADIS----GSLF--------------EESTKQW
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pF1KE9 NLN----VMPVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGE
       ::.    .. .:::   : .   : :...:.:: ::  ..: :: ::   :::::::.::
CCDS44 NLGHLGTILDLLEQE--CGVV--IEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGE
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       ::::: ::   ..:::.. ..: :..  .   .:.. :.:..:..:  .:.:    .: :
CCDS44 PKTWYVVPPEHGQHLERLARELFPDISRGCEAFLRHKVALISPTVLKENGIPFNCMTQEA
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       :::..::: .::.:::.:.: :::.:: :  :.  :.   ::      .    .:: . .
CCDS44 GEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRWIDYGKMASQCSCGESTV----TFSMDPF
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       .    . ::. .:     .:: . : :  .   ::    :  .. .  . . :    :::
CCDS44 V--RIVQPESYELWKHRQDLAIVEHTEPRVAESQELSNWRDDIVLRRAALGLR----LLP
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       .   ::     :  .:.  ::. : :                                  
CCDS44 NLTAQC----PTQPVSSGHCYN-PKGCGTDAVPGSAFQSSAYHTQTQSLTLGMSARVLLP
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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