Result of FASTA (ccds) for pF1KE9669
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE9669, 2997 aa
  1>>>pF1KE9669 2997 - 2997 aa - 2997 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.3525+/-0.00141; mu= -14.2892+/- 0.085
 mean_var=517.4663+/-105.387, 0's: 0 Z-trim(113.1): 107  B-trim: 394 in 1/52
 Lambda= 0.056381
 statistics sampled from 13680 (13771) to 13680 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.713), E-opt: 0.2 (0.423), width:  16
 Scan time:  9.040

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8          (2997) 20314 1669.3       0
CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16         (2881) 6607 554.4 3.6e-156
CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14         (2581) 6154 517.5 4.1e-145
CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14         (2302) 6109 513.8 4.7e-144
CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20         (2715) 5891 496.1 1.2e-138
CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16         (2897) 5851 492.9 1.2e-137
CCDS83299.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8          ( 948) 4183 356.9 3.3e-97
CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12          (1905) 1655 151.5 4.7e-35
CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12           (1912) 1655 151.5 4.7e-35
CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (1966) 1633 149.7 1.7e-34
CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (2000) 1633 149.7 1.7e-34
CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (2059) 1633 149.7 1.7e-34
CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1             (1954) 1582 145.6 2.9e-33
CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1054) 1146 109.9 8.4e-23
CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1070) 1146 109.9 8.5e-23
CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1572) 1144 109.9 1.3e-22
CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1590) 1144 109.9 1.3e-22
CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1613) 1127 108.5 3.5e-22
CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1614) 1127 108.5 3.5e-22
CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1616) 1127 108.5 3.5e-22
CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1617) 1127 108.5 3.5e-22
CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1647) 1124 108.3 4.2e-22
CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1514)  831 84.4 5.8e-15
CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5           (1710)  795 81.5 4.9e-14
CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15          (1828)  776 80.0 1.5e-13
CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10          (1493)  722 75.5 2.7e-12
CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4         (1052)  669 71.1   4e-11


>>CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8               (2997 aa)
 initn: 20314 init1: 20314 opt: 20314  Z-score: 8942.5  bits: 1669.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 20314; 100.0% identity (100.0% similar) in 2997 aa overlap (1-2997:1-2997)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE9 MADPGMMSLFGEDGNIFSEGLEGLGECGYPENPVNPMGQQMPIDQGFASLQPSLHHPSTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MADPGMMSLFGEDGNIFSEGLEGLGECGYPENPVNPMGQQMPIDQGFASLQPSLHHPSTN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 QNQTKLTHFDHYNQYEQQKMHLMDQPNRMMSNTPGNGLASPHSQYHTPPVPQVPHGGSGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QNQTKLTHFDHYNQYEQQKMHLMDQPNRMMSNTPGNGLASPHSQYHTPPVPQVPHGGSGG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE9 GQMGVYPGMQNERHGQSFVDSSSMWGPRAVQVPDQIRAPYQQQQPQPQPPQPAPSGPPAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GQMGVYPGMQNERHGQSFVDSSSMWGPRAVQVPDQIRAPYQQQQPQPQPPQPAPSGPPAQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE9 GHPQHMQQMGSYMARGDFSMQQHGQPQQRMSQFSQGQEGLNQGNPFIATSGPGHLSHVPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GHPQHMQQMGSYMARGDFSMQQHGQPQQRMSQFSQGQEGLNQGNPFIATSGPGHLSHVPQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE9 QSPSMAPSLRHSVQQFHHHPSTALHGESVAHSPRFSPNPPQQGAVRPQTLNFSSRSQTVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QSPSMAPSLRHSVQQFHHHPSTALHGESVAHSPRFSPNPPQQGAVRPQTLNFSSRSQTVP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE9 SPTINNSGQYSRYPYSNLNQGLVNNTGMNQNLGLTNNTPMNQSVPRYPNAVGFPSNSGQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SPTINNSGQYSRYPYSNLNQGLVNNTGMNQNLGLTNNTPMNQSVPRYPNAVGFPSNSGQG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE9 LMHQQPIHPSGSLNQMNTQTMHPSQPQGTYASPPPMSPMKAMSNPAGTPPPQVRPGSAGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LMHQQPIHPSGSLNQMNTQTMHPSQPQGTYASPPPMSPMKAMSNPAGTPPPQVRPGSAGI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE9 PMEVGSYPNMPHPQPSHQPPGAMGIGQRNMGPRNMQQSRPFIGMSSAPRELTGHMRPNGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PMEVGSYPNMPHPQPSHQPPGAMGIGQRNMGPRNMQQSRPFIGMSSAPRELTGHMRPNGC
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE9 PGVGLGDPQAIQERLIPGQQHPGQQPSFQQLPTCPPLQPHPGLHHQSSPPHPHHQPWAQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PGVGLGDPQAIQERLIPGQQHPGQQPSFQQLPTCPPLQPHPGLHHQSSPPHPHHQPWAQL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE9 HPSPQNTPQKVPVHQHSPSEPFLEKPVPDMTQVSGPNAQLVKSDDYLPSIEQQPQQKKKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HPSPQNTPQKVPVHQHSPSEPFLEKPVPDMTQVSGPNAQLVKSDDYLPSIEQQPQQKKKK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE9 KKNNHIVAEDPSKGFGKDDFPGGVDNQELNRNSLDGSQEEKKKKKRSKAKKDPKEPKEPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KKNNHIVAEDPSKGFGKDDFPGGVDNQELNRNSLDGSQEEKKKKKRSKAKKDPKEPKEPK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE9 EKKEPKEPKTPKAPKIPKEPKEKKAKTATPKPKSSKKSSNKKPDSEASALKKKVNKGKTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EKKEPKEPKTPKAPKIPKEPKEKKAKTATPKPKSSKKSSNKKPDSEASALKKKVNKGKTE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE9 GSENSDLDKTPPPSPPPEEDEDPGVQKRRSSRQVKRKRYTEDLEFKISDEEADDADAAGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GSENSDLDKTPPPSPPPEEDEDPGVQKRRSSRQVKRKRYTEDLEFKISDEEADDADAAGR
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE9 DSPSNTSQSEQQESVDAEGPVVEKIMSSRSVKKQKESGEEVEIEEFYVKYKNFSYLHCQW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DSPSNTSQSEQQESVDAEGPVVEKIMSSRSVKKQKESGEEVEIEEFYVKYKNFSYLHCQW
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE9 ASIEDLEKDKRIQQKIKRFKAKQGQNKFLSEIEDELFNPDYVEVDRIMDFARSTDDRGEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ASIEDLEKDKRIQQKIKRFKAKQGQNKFLSEIEDELFNPDYVEVDRIMDFARSTDDRGEP
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE9 VTHYLVKWCSLPYEDSTWERRQDIDQAKIEEFEKLMSREPETERVERPPADDWKKSESSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VTHYLVKWCSLPYEDSTWERRQDIDQAKIEEFEKLMSREPETERVERPPADDWKKSESSR
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE9 EYKNNNKLREYQLEGVNWLLFNWYNMRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEIYLKGIHGPFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EYKNNNKLREYQLEGVNWLLFNWYNMRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEIYLKGIHGPFL
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE9 VIAPLSTIPNWEREFRTWTELNVVVYHGSQASRRTIQLYEMYFKDPQGRVIKGSYKFHAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VIAPLSTIPNWEREFRTWTELNVVVYHGSQASRRTIQLYEMYFKDPQGRVIKGSYKFHAI
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE9 ITTFEMILTDCPELRNIPWRCVVIDEAHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ITTFEMILTDCPELRNIPWRCVVIDEAHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNT
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE9 VEELFSLLHFLEPSRFPSETTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VEELFSLLHFLEPSRFPSETTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAP
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE9 KEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFTFLSKGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLING
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFTFLSKGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLING
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE9 AEEKILEEFKETHNAESPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AEEKILEEFKETHNAESPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLD
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE9 ILEDYLIQRRYPYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ILEDYLIQRRYPYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADT
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE9 CIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQ
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE9 SMSGRENATNGVQQLSKKEIEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTHTITI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SMSGRENATNGVQQLSKKEIEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTHTITI
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE9 ESEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNNLVIDTPRVRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ESEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNNLVIDTPRVRK
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pF1KE9 QTRLYSAVKEDELMEFSDLESDSEEKPCAKPRRPQDKSQGYARSECFRVEKNLLVYGWGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QTRLYSAVKEDELMEFSDLESDSEEKPCAKPRRPQDKSQGYARSECFRVEKNLLVYGWGR
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pF1KE9 WTDILSHGRYKRQLTEQDVETICRTILVYCLNHYKGDENIKSFIWDLITPTADGQTRALV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 WTDILSHGRYKRQLTEQDVETICRTILVYCLNHYKGDENIKSFIWDLITPTADGQTRALV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NHSGLSAPVPRGRKGKKVKAQSTQPVVQDADWLASCNPDALFQEDSYKKHLKHHCNKVLL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RVRMLYYLRQEVIGDQADKILEGADSSEADVWIPEPFHAEVPADWWDKEADKSLLIGVFK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HGYEKYNSMRADPALCFLERVGMPDAKAIAAEQRGTDMLADGGDGGEFDREDEDPEYKPT
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pF1KE9 RTPFKDEIDEFANSPSEDKEESMEIHATGKHSESNAELGQLYWPNTSTLTTRLRRLITAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RTPFKDEIDEFANSPSEDKEESMEIHATGKHSESNAELGQLYWPNTSTLTTRLRRLITAY
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pF1KE9 QRSYKRQQMRQEALMKTDRRRRRPREEVRALEAEREAIISEKRQKWTRREEADFYRVVST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QRSYKRQQMRQEALMKTDRRRRRPREEVRALEAEREAIISEKRQKWTRREEADFYRVVST
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pF1KE9 FGVIFDPVKQQFDWNQFRAFARLDKKSDESLEKYFSCFVAMCRRVCRMPVKPDDEPPDLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FGVIFDPVKQQFDWNQFRAFARLDKKSDESLEKYFSCFVAMCRRVCRMPVKPDDEPPDLS
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pF1KE9 SIIEPITEERASRTLYRIELLRKIREQVLHHPQLGERLKLCQPSLDLPEWWECGRHDRDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SIIEPITEERASRTLYRIELLRKIREQVLHHPQLGERLKLCQPSLDLPEWWECGRHDRDL
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pF1KE9 LVGAAKHGVSRTDYHILNDPELSFLDAHKNFAQNRGAGNTSSLNPLAVGFVQTPPVISSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LVGAAKHGVSRTDYHILNDPELSFLDAHKNFAQNRGAGNTSSLNPLAVGFVQTPPVISSA
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pF1KE9 HIQDERVLEQAEGKVEEPENPAAKEKCEGKEEEEETDGSGKESKQECEAEASSVKNELKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HIQDERVLEQAEGKVEEPENPAAKEKCEGKEEEEETDGSGKESKQECEAEASSVKNELKG
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pF1KE9 VEVGADTGSKSISEKGSEEDEEEKLEDDDKSEESSQPEAGAVSRGKNFDEESNASMSTAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VEVGADTGSKSISEKGSEEDEEEKLEDDDKSEESSQPEAGAVSRGKNFDEESNASMSTAR
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pF1KE9 DETRDGFYMEDGDPSVAQLLHERTFAFSFWPKDRVMINRLDNICEAVLKGKWPVNRRQMF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DETRDGFYMEDGDPSVAQLLHERTFAFSFWPKDRVMINRLDNICEAVLKGKWPVNRRQMF
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pF1KE9 DFQGLIPGYTPTTVDSPLQKRSFAELSMVGQASISGSEDITTSPQLSKEDALNLSVPRQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DFQGLIPGYTPTTVDSPLQKRSFAELSMVGQASISGSEDITTSPQLSKEDALNLSVPRQR
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pF1KE9 RRRRRKIEIEAERAAKRRNLMEMVAQLRESQVVSENGQEKVVDLSKASREATSSTSNFSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RRRRRKIEIEAERAAKRRNLMEMVAQLRESQVVSENGQEKVVDLSKASREATSSTSNFSS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSSKFILPNVSTPVSDAFKTQMELLQAGLSRTPTRHLLNGSLVDGEPPMKRRRGRRKNVE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GLDLLFMSHKRTSLSAEDAEVTKAFEEDIETPPTRNIPSPGQLDPDTRIPVINLEDGTRL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VGEDAPKNKDLVEWLKLHPTYTVDMPSYVPKNADVLFSSFQKPKQKRHRCRNPNKLDINT
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LTGEERVPVVNKRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEENPEFAVAPDWTDIVKQSGFVPESMF
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pF1KE9 DRLLTGPVVRGEGASRRGRRPKSEIARAAAAAAAVASTSGINPLLVNSLFAGMDLTSLQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DRLLTGPVVRGEGASRRGRRPKSEIARAAAAAAAVASTSGINPLLVNSLFAGMDLTSLQN
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pF1KE9 LQNLQSLQLAGLMGFPPGLATAATAGGDAKNPAAVLPLMLPGMAGLPNVFGLGGLLNNPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LQNLQSLQLAGLMGFPPGLATAATAGGDAKNPAAVLPLMLPGMAGLPNVFGLGGLLNNPL
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pF1KE9 SAATGNTTTASSQGEPEDSTSKGEEKGNENEDENKDSEKSTDAVSAADSANGSVGAATAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SAATGNTTTASSQGEPEDSTSKGEEKGNENEDENKDSEKSTDAVSAADSANGSVGAATAP
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pF1KE9 AGLPSNPLAFNPFLLSTMAPGLFYPSMFLPPGLGGLTLPGFPALAGLQNAVGSSEEKAAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AGLPSNPLAFNPFLLSTMAPGLFYPSMFLPPGLGGLTLPGFPALAGLQNAVGSSEEKAAD
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pF1KE9 KAEGGPFKDGETLEGSDAEESLDKTAESSLLEDEIAQGEELDSLDGGDEIENNENDE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KAEGGPFKDGETLEGSDAEESLDKTAESSLLEDEIAQGEELDSLDGGDEIENNENDE
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       :.:: ::..: .:.:.:.: ::::.. .. . .::. . ... .   :  :.  ::.: .
CCDS45 MTDP-MMDFF-DDANLFGETLEGLSDDAFVQPGPVS-LVDELNLGAEFEPLHIDSLNHVQ
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        . .. :.: :.. ::... :.: ..:      ..:.. . :::::..  :. ::     
CCDS45 GTPTHQKMTDFEQLNQFDSIKFHHVNQS----FGSPAEHVLSPHSQFNCSPIHPQ-----
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         .   :..: ..         :.: ::: . :. . .:  .:..::             
CCDS45 --NQPNGLFPDVS---------DGSPMWGHQTATTISNQNGSPFHQQ-------------
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           :: . :.:  :..:. ::..    .:. :      ::  .... ::..:.:.. :.
CCDS45 ----GHSHSMHQNKSFVAHHDFALFQANEQQTQCTSLRSQQNRNNLNPGQNSLSQSKNFM
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pF1KE9 ATSGPG--HLSHVPQQSPSMAPSLRHSVQQFHH--HPSTALHGESVAHSPRFSPNPPQQG
        .:::   ...: ::.. .   .   :.::: .  .::. .:  : .:         :.:
CCDS45 NVSGPHRVNVNHPPQMTNASNSQQSISMQQFSQTSNPSAHFHKCS-SH---------QEG
              210       220       230       240                 250

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pF1KE9 AVRPQTLNFSSRSQTVPSPTINNSGQYSRYPYSNLNQGLVNNTGMNQNLGLTNNTPMNQS
              ::.. : .. : ...:: :.: . :: .... .. ... :. ..  ..  ::.
CCDS45 -------NFNGPSPNMTSCSVSNSQQFSSH-YS-FSSNHISPNSLLQSSAVLASNHTNQT
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pF1KE9 VPRYPNAVGFPSNSG-QGLMHQQPIHPSGSLNQMNTQTMHPSQPQGTYASPPPMSPMKAM
       .  . .. .:  . : .    :. ..:. :::. : : .: :.:::.: :   .::.. :
CCDS45 LSDFTGSNSFSPHRGIKQESTQHILNPNTSLNSNNFQILHSSHPQGNY-SNSKLSPVH-M
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pF1KE9 SNPAGTPPPQVRPGSAGIPMEVGSYPNMPHPQPSHQPPGAMGIGQRNMGPRNMQQSRPFI
       . :               :.. :.  .: : . .:   ....  ..:.  .  .:..:: 
CCDS45 NFPD--------------PVDSGT--QMGHFN-DHVETNGFSSLEENLLHQVESQTEPFT
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pF1KE9 GMSSAPRELTGHMRPNGCPGVGLGDPQAIQERLIP--GQQHPGQQPSFQQLPTCPPLQPH
       :..  :..:                   .:: :.:   ..  ::. : . :      :  
CCDS45 GLD--PEDL-------------------LQEGLLPHFDESTFGQDNSSHILDHDLDRQF-
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           :  . :    :   : .    ..  .   : :. ..  :..  :.  . .: ..  
CCDS45 --TSHLVTRPSDMAQTQLQSQARSWHSSFSNHQHLHDRNHLCLQRQPPSSKKSDGSGTYT
                450       460       470       480       490        

              590            600       610         620       630   
pF1KE9 VKSDDYLPSIEQQPQQKK-----KKKKNNHIVAEDPSKG--FGKDDFPGGVDNQELNRNS
         ..  .  . .. :.::     :..: :.:..:  .:.   :. ..:  .. ...   :
CCDS45 KLQNTQVRVMSEKKQRKKVESESKQEKANRIISEAIAKAKERGERNIPRVMSPENFPTAS
      500       510       520       530       540       550        

           640       650       660       670       680       690   
pF1KE9 LDGSQEEKKKKKRSKAKKDPKEPKEPKEKKEPKEPKTPKAPKIPKEPKEKKAKTATPKPK
       ..:..:.: .. .::                            ::.   ::.::      
CCDS45 VEGKEEKKGRRMKSK----------------------------PKDKDSKKTKTC-----
      560       570                                   580          

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pF1KE9 SSKKSSNKKPDSEASALKKKVNKGKTEGS-ENSDLDKTPPPSPPPEEDEDPGVQKRRSSR
        :: . . :  .   .: :: .: :.:.: : :: .. :  .    .:.:   :::::.:
CCDS45 -SKLKEKTKIGKLIITLGKK-QKRKNESSDEISDAEQMPQHT---LKDQDS--QKRRSNR
          590       600        610       620          630          

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pF1KE9 QVKRKRYTEDLEFKISDEEADDADAAGRDS-PSNTSQSEQ---QESVDAEGPVVEKIMSS
       :.:::.:.::.: : :.::.  .    ..: :    :  :   ..  . .. .:.::.::
CCDS45 QIKRKKYAEDIEGKQSEEEVKGSMKIKKNSAPLPGEQPLQLFVENPSEEDAAIVDKILSS
      640       650       660       670       680       690        

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pF1KE9 RSVKKQKESGEEVEIEEFYVKYKNFSYLHCQWASIEDLEKDKRIQQKIKRFKAKQGQN-K
       :.:::.   :  .. :::.:::::.:::::.::. :.: ::::::::::::: .:.:  .
CCDS45 RTVKKEISPGVMIDTEEFFVKYKNYSYLHCEWATEEQLLKDKRIQQKIKRFKLRQAQRAH
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pF1KE9 FLSEIEDELFNPDYVEVDRIMDFARSTD-DRGEPVTHYLVKWCSLPYEDSTWERRQDIDQ
       :....:.: ::::::::::... .   : : :::: .:::::::::::::::: ..:.: 
CCDS45 FFADMEEEPFNPDYVEVDRVLEVSFCEDKDTGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDL
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pF1KE9 AKIEEFEKLMSREPETERVERPPADDWKKSESSREYKNNNKLREYQLEGVNWLLFNWYNM
       :::::::.:.. .:.:.:..:::.. ::: ..::.:::.:.::::::::.::::::::: 
CCDS45 AKIEEFEQLQASRPDTRRLDRPPSNIWKKIDQSRDYKNGNQLREYQLEGLNWLLFNWYNR
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pF1KE9 RNCILADEMGLGKTIQSITFLYEIYLKGIHGPFLVIAPLSTIPNWEREFRTWTELNVVVY
       :::::::::::::::::::::::: : ::.::::.::::::: ::::::::::..:::::
CCDS45 RNCILADEMGLGKTIQSITFLYEILLTGIRGPFLIIAPLSTIANWEREFRTWTDINVVVY
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pF1KE9 HGSQASRRTIQLYEMYFKDPQGRVIKGSYKFHAIITTFEMILTDCPELRNIPWRCVVIDE
       :::  ::. :: :::::.: :::.:.:.:.:.::::::::::  : ::  : ::::.:::
CCDS45 HGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYRFQAIITTFEMILGGCGELNAIEWRCVIIDE
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pF1KE9 AHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSRFPSETTFMQEF
       ::::::.:::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::: :::::.::::::
CCDS45 AHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPLRFPSESTFMQEF
     1000      1010      1020      1030      1040      1050        

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pF1KE9 GDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNF
     1060      1070      1080      1090      1100      1110        

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pF1KE9 TFLSKGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEEFKETHNAESPDFQLQAMI
       .:::::.::.:::::.::::::::::::::::.::::::: ::..:.:  . ::.:::::
CCDS45 SFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKGAEEKILGEFRDTYNPAASDFHLQAMI
     1120      1130      1140      1150      1160      1170        

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pF1KE9 QAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYPYERIDGRVRGNLRQ
       :.:::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::..:: ::::::::::::::
CCDS45 QSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIHKRYLYERIDGRVRGNLRQ
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pF1KE9 AAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS45 AAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQN
     1240      1250      1260      1270      1280      1290        

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pF1KE9 KSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRENATNGVQQLSKKEIEDLLRK
       :.::.:::.:::::::::::.:::::::::::::::::::. ..:.:::::::::::::.
CCDS45 KAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSGRESNVGGIQQLSKKEIEDLLRR
     1300      1310      1320      1330      1340      1350        

       1470      1480      1490      1500      1510      1520      
pF1KE9 GAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTHTITIESEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLD
       :::::.:.:::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS45 GAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITIESEGRGSTFAKASFVASGNRTDISLD
     1360      1370      1380      1390      1400      1410        

       1530      1540      1550      1560      1570      1580      
pF1KE9 DPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNNLVIDTPRVRKQTRLYSAVKEDELMEFSDLESDSEEK
       :::::::::::::.::.:..:::.:::::::.::::: .::.: ::: :.:. ::...::
CCDS45 DPNFWQKWAKKAEIDIEAISGRNSLVIDTPRIRKQTRPFSATK-DELAELSEAESEGDEK
     1420      1430      1440      1450      1460       1470       

       1590      1600      1610      1620      1630      1640      
pF1KE9 PCAKPRRPQDKSQGYARSECFRVEKNLLVYGWGRWTDILSHGRYKRQLTEQDVETICRTI
       :  : ::: :.:.::.:.::::::::::::::::: .::::::.::::.:.::: :::..
CCDS45 P--KLRRPCDRSNGYGRTECFRVEKNLLVYGWGRWREILSHGRFKRQLNEHDVEIICRAL
        1480      1490      1500      1510      1520      1530     

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pF1KE9 LVYCLNHYKGDENIKSFIWDLITPTADGQTRALVNHSGLSAPVPRGRKGKKVKAQSTQPV
       :.::: ::.:::.::.::::::::: ::::: : :: ::::::::::::::::.:...  
CCDS45 LAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTRELQNHLGLSAPVPRGRKGKKVKTQTSSFD
        1540      1550      1560      1570      1580      1590     

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pF1KE9 VQDADWLASCNPDALFQEDSYKKHLKHHCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQADKILEGADS
       .: :.:: . ::. :.:...::::.:::::::::::::::::.:::::.. .:...:.:.
CCDS45 IQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHIKHHCNKVLLRVRMLYYLKQEVIGNECQKVFDGVDA
        1600      1610      1620      1630      1640      1650     

       1770      1780      1790      1800      1810      1820      
pF1KE9 SEADVWIPEPFHAEVPADWWDKEADKSLLIGVFKHGYEKYNSMRADPALCFLERVGMPDA
       :. :::.::: :.::::.::: .::::::::::::::::::..::::::::::::: :: 
CCDS45 SDIDVWVPEPDHSEVPAEWWDFDADKSLLIGVFKHGYEKYNTIRADPALCFLERVGKPDE
        1660      1670      1680      1690      1700      1710     

       1830      1840      1850      1860      1870      1880      
pF1KE9 KAIAAEQRGTDMLADGGDGGEFDREDEDPEYKPTRTPFKDEIDEFANSPSEDKEESMEIH
       ::.:::::..:.. ::        . :::::::. . :::.:.. ..::..     .   
CCDS45 KAVAAEQRANDYM-DG--------DVEDPEYKPAPAIFKDDIEDDVSSPGD----LVIAD
        1720       1730              1740      1750          1760  

       1890      1900      1910      1920      1930       1940     
pF1KE9 ATGKHSESNAELGQLYWPNTSTLTTRLRRLITAYQRSYKRQQMRQ-EALMKTDRRRRRPR
       . :.  :..    ..:::. :.::::::::::::::. : .:..: .  ...     .: 
CCDS45 GDGQLMEGD----KVYWPTQSALTTRLRRLITAYQRTNKNRQIQQIQPTFSVPTSVMQPI
           1770          1780      1790      1800      1810        

        1950      1960      1970      1980      1990      2000     
pF1KE9 EEVRALEAEREAIISEKRQKWTRREEADFYRVVSTFGVIFDPVKQQFDWNQFRAFARLDK
        :  .:. .  : : :..:.::::::::::::::::::.::: . ::::..:::.::: :
CCDS45 YEEATLNPKMAAKI-ERQQRWTRREEADFYRVVSTFGVVFDPDRGQFDWTKFRAMARLHK
     1820      1830       1840      1850      1860      1870       

        2010      2020      2030      2040      2050      2060     
pF1KE9 KSDESLEKYFSCFVAMCRRVCRMPVKPDDEPPDLSSIIEPITEERASRTLYRIELLRKIR
       :.:.:::::.  :..:::::::.: : .   :..  .:.:::::::::::::::::::.:
CCDS45 KTDDSLEKYLYAFMSMCRRVCRLPSKEELVDPNI--FIQPITEERASRTLYRIELLRKVR
      1880      1890      1900      1910        1920      1930     

        2070      2080      2090      2100      2110      2120     
pF1KE9 EQVLHHPQLGERLKLCQPSLDLPEWWECGRHDRDLLVGAAKHGVSRTDYHILNDPELSFL
       ::.:.:::: ::::::.:. ::: ::::: ::::::.::::::::::::::: ::::::.
CCDS45 EQALRHPQLFERLKLCHPNPDLPVWWECGPHDRDLLIGAAKHGVSRTDYHILRDPELSFM
        1940      1950      1960      1970      1980      1990     

        2130      2140                          2150      2160     
pF1KE9 DAHKNFAQNRGAGNTSSL------------NPL--------AVGFVQTPPVISSAHIQDE
        :..:..:.. : . .:             .::        : :..     ..: ....:
CCDS45 AAQRNYSQSKMAHSRTSTPLLQQYQVALSASPLTSLPRLLDAKGIILEEMKVKSENLKEE
        2000      2010      2020      2030      2040      2050     

                      2170                                     2180
pF1KE9 --------------RVLEQAE-------------------GKVE----------EP--EN
                     :.: ..:                   :: :          ::   :
CCDS45 PQSSEEESMSSVETRTLIKSEPVSPKNGVLPQATGDQKSGGKCETDRRMVAARTEPLTPN
        2060      2070      2080      2090      2100      2110     

                2190      2200      2210      2220      2230       
pF1KE9 PAAKE---KCEGKEEEEETDGSGKESKQECEAEASSVKNELKGVEVGADTGSKS----IS
       ::.:.   . .:.:   ..:.....:.   .. .:: ..  .  . :....:.:     :
CCDS45 PASKKPRVHKRGSESSSDSDSDSERSSCSSRSSSSSSSSSCSHSRSGSSSSSSSSCSSAS
        2120      2130      2140      2150      2160      2170     

          2240      2250      2260           2270      2280        
pF1KE9 EKGSEEDEEEKLEDDDKSEESSQPEAGAVSRG-----KNFDEESNASMSTARDETRDGFY
        ..:      .  ....::::.. :  : .:      : .:::: ::.::..:::.:.: 
CCDS45 SSSSSSTSSSSSSSSSSSEESDSDEEEAQKRESTTHMKAYDEESVASLSTTQDETQDSFQ
        2180      2190      2200      2210      2220      2230     

     2290      2300       2310      2320      2330      2340       
pF1KE9 MEDGDPSVAQLLHE-RTFAFSFWPKDRVMINRLDNICEAVLKGKWPVNRRQMFDFQGLIP
       :..: :  : .:.    .: :.::::::::::::.::..:::::::  ::. .: . .  
CCDS45 MNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMINRLDSICQTVLKGKWPSARRS-YDANTVAS
        2240      2250      2260      2270      2280       2290    

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pF1KE9 GYTPTTVDSPLQKRSFAELSMVGQASISGSEDITTSPQLSKEDALNLSVPRQRRRRRRKI
        ::   .:::     ... :.    . . .:.   : :.::: .:.:.  .:   ..: .
CCDS45 FYTTKLLDSPGAATEYSDPSVPTPPGAGVKEEHDQSTQMSKEGGLKLTFQKQGLAQKRPF
         2300      2310      2320      2330      2340      2350    

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pF1KE9 EIEAERAAKRRNLMEMVAQLRESQVVSENGQEKVVDLSKASREATSSTSNFSSLSSKFIL
       . :    .... :    ..::: : .::                 .:  ::         
CCDS45 DGEDGALGQQQYL----TRLRELQSASE-----------------TSLVNF---------
         2360          2370                       2380             

      2470      2480      2490      2500      2510      2520       
pF1KE9 PNVSTPVSDAFKTQMELLQAGLSRTPTRHLLNGSLVDGEPPMKRRRGRRKNVEGLDLLFM
       :. : :::            : :  ::    :: ..:..: .:.::::::::::.:..:.
CCDS45 PK-SIPVS------------GTSIQPTLGA-NGVILDNQPIVKKRRGRRKNVEGVDIFFF
          2390                  2400       2410      2420      2430

      2530          2540      2550      2560      2570      2580   
pF1KE9 SHKR----TSLSAEDAEVTKAFEEDIETPPTRNIPSPGQLDPDTRIPVINLEDGTRLVGE
       ....    .::.  ..... ...  .     ..::     : .. .:::::.:::::.:.
CCDS45 NRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYTQPQGIP-----DTESPVPVINLKDGTRLAGD
             2440      2450      2460           2470      2480     

          2590      2600      2610      2620      2630      2640   
pF1KE9 DAPKNKDLVEWLKLHPTYTVDMPSYVPKNADVLFSSFQKPKQKRHRCRNPNKLDINTLTG
       :::: ::: .::: :: :. :. ...:.    .     .:::::::::::::::.:.:::
CCDS45 DAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPR----MQLHEGRPKQKRHRCRNPNKLDVNSLTG
        2490      2500      2510          2520      2530      2540 

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pF1KE9 EERVPVVNKRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEENPEFAVAPDWTDIVKQSGFVPESMFDRL
       :::: ..:.::..:.:::.:::.::: :.:.:: :..:::.: :.::::::.::::..:.
CCDS45 EERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGVAPEWGDVVKQSGFLPESMYERI
            2550      2560      2570      2580      2590      2600 

          2710      2720      2730       2740      2750            
pF1KE9 LTGPVVRGEGASRRGRRPKSEIARAAAAAAAVASTS-GINPLLVNSLFAGMDLTSLQ---
       ::::::: : .::::::::: ::.:.:::::...:: . ::::.:.:. :.:::.::   
CCDS45 LTGPVVR-EEVSRRGRRPKSGIAKATAAAAAASATSVSGNPLLANGLLPGVDLTTLQALQ
             2610      2620      2630      2640      2650      2660

     2760       2770      2780      2790      2800      2810       
pF1KE9 -NLQNLQSLQL-AGLMGFPPGLATAATAGGDAKNPAAVLPLMLPGMAGLPNVFGLGGLLN
        :::::::::. :::::.: :: .    ::.::: ::..:..: :::::::..:.::::.
CCDS45 QNLQNLQSLQVTAGLMGMPTGLPS----GGEAKNMAAMFPMLLSGMAGLPNLLGMGGLLT
             2670      2680          2690      2700      2710      

      2820      2830      2840      2850      2860      2870       
pF1KE9 NPLSAATGNTTTASSQGEPEDSTSKGEEKGNENEDENKDSEKSTDAVSAADSANGSVGAA
       .:  ..: .   ..:. : : .: . : ...::  ::        .::.. :......  
CCDS45 KPTESGTEDKKGSDSK-ESEGKTERTESQSSENGGEN--------SVSSSPSTSSTAALN
       2720      2730       2740      2750              2760       

      2880      2890      2900      2910      2920      2930       
pF1KE9 TAPAGLPSNPLAFNPFLLSTMAPGLFYPSMFLPPGLGGLTLPGFPALAGLQNAVGSSEEK
       :: :   .::::.::.:::..    .::.:.: :::. : .: .      :. . . ..:
CCDS45 TAAA---ANPLALNPLLLSNI----LYPGMLLTPGLN-LHIPTLS-----QSNTFDVQNK
      2770         2780          2790       2800           2810    

      2940      2950      2960        2970       2980      2990    
pF1KE9 AADKAEGGPFKDGETLEGSDAEESLDK--TAESSLLEDEIAQG-EELDSLDGGDEIENNE
        .: . .   .  :  : :  ... ::  :  : : :.   .: :. :. .:.:   .. 
CCDS45 NSDLGSSKSVEVKE--EDSRIKDQEDKGGTEPSPLNENSTDEGSEKADASSGSDSTSSSS
         2820        2830      2840      2850      2860      2870  

                
pF1KE9 NDE      
       .:       
CCDS45 EDSDSSNED
           2880 

>>CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14              (2581 aa)
 initn: 6942 init1: 3921 opt: 6154  Z-score: 2718.7  bits: 517.5 E(32554): 4.1e-145
Smith-Waterman score: 7462; 47.3% identity (67.7% similar) in 2847 aa overlap (80-2868:6-2565)

      50        60        70        80        90       100         
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                                     : :.:.:: .  ..  .   .  .:    :
CCDS53                          MADPIMDLFDDPNLFGLDSLTD---DSFNQVTQDP
                                        10        20           30  

     110          120       130       140       150       160      
pF1KE9 VPQ---VPHGGSGGGQMGVYPGMQNERHGQSFVDSSSMWGPRAVQVPDQIRAPYQQQQPQ
       . .   .: . ..  ::       :.  : . : .::  . . :  :..  :: . .. .
CCDS53 IEEALGLPSSLDSLDQM-------NQDGGGGDVGNSS--ASELVPPPEET-APTELSKES
             40               50        60          70         80  

        170       180       190       200       210       220      
pF1KE9 PQPPQPAPSGPPAQGHPQHMQQMGSYMARGDFSMQQHGQPQQRMSQFSQGQEGLNQGNPF
         :   . .      .:  ..: ..        . : . : . . : :..:: :.:::::
CCDS53 TAPAPESITLHDYTTQPASQEQPAQ-------PVLQTSTPTSGLLQVSKSQEILSQGNPF
             90       100              110       120       130     

        230        240       250       260       270       280     
pF1KE9 IATSGPG-HLSHVPQQSPSMAPSLRHSVQQFHHHPSTALHGESVAHSPRFSPNPPQQGAV
       ...:. .   : .  : :. ::.    .  ..  ::... :  ::.              
CCDS53 MGVSATAVSSSSAGGQPPQSAPK----IVILKAPPSSSVTGAHVAQI-------------
         140       150           160       170                     

         290       300       310       320       330       340     
pF1KE9 RPQTLNFSSRSQTVPSPTINNSGQYSRYPYSNLNQGLVNNTGMNQNLGLTNNTPMNQSVP
         :. ...: .:    : . .... ..  ....  :     :..    ...:: .  .::
CCDS53 --QAQGITSTAQ----PLVAGTANGGKVTFTKVLTGTPLRPGVSI---VSGNTVLAAKVP
        180           190       200       210          220         

         350       360       370       380       390        400    
pF1KE9 RYPNAVGFPSNSGQGLMHQQPIHPSGSLNQMNTQTMHPSQPQGTY-ASPPPMSPMKAMSN
           ::            :. ..::  ..:.  : .. : : :.  :. ::..:  ... 
CCDS53 GNQAAV------------QRIVQPSRPVKQLVLQPVKGSAPAGNPGATGPPLKPAVTLT-
     230                   240       250       260       270       

          410       420       430       440       450       460    
pF1KE9 PAGTPPPQVRPGSAGIPMEVGSYPNMPHPQPSHQPPGAMGIGQRNMGPRNMQQSRPFIGM
          . : : .     . ..        .:: :  : :   .   ..  . . :.  . ..
CCDS53 ---STPTQGESKRITLVLQ--------QPQ-SGGPQGHRHVVLGSLPGKIVLQGNQLAAL
           280       290                300       310       320    

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       ..: ..  :.  :     . :   :  :. ...:  : :..::. :: :.  :.      
CCDS53 TQA-KNAQGQ--PAKVVTIQLQVQQPQQKIQIVP--QPPSSQPQPQQPPSTQPVTLSSV-
           330         340       350         360       370         

           530       540        550       560         570       580
pF1KE9 HHQSSPPHPHHQPWAQLH-PSPQNTPQKVPVHQHSPSEPFLEK--PVPDMTQVSGPNAQL
        .:..   : ..:  .:  :       ..   : . :   . :   . ... .:.: .. 
CCDS53 -QQAQIMGPGQSPGQRLSVPVKVVLQPQAGSSQGASSGLSVVKVLSASEVAALSSPASSA
       380       390       400       410       420       430       

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pF1KE9 VKSDDYLPSIEQQP-QQKKKKKKNNHIVAEDPSKGF--GKDDFPGGVDNQELNRNSLDGS
        .:       :..  ...::..: :.::::  ...   :....:  ....::   :.   
CCDS53 PHSGGKTGMEENRRLEHQKKQEKANRIVAEAIARARARGEQNIPRVLNEDEL--PSVRPE
       440       450       460       470       480         490     

       640       650       660       670       680       690       
pF1KE9 QEEKKKKKRSKAKKDPKEPKEPKEKKEPKEPKTPKAPKIPKEPKEKKAKTATPKPKSSKK
       .: .::.....: .  :: :       ::. ::  : :      . :.:  :  :  .::
CCDS53 EEGEKKRRKKSAGERLKEEK-------PKKSKTSGASKT-----KGKSKLNTITPVVGKK
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       700       710       720       730       740       750       
pF1KE9 SSNKKPDSEASALKKKVNKGKTEGSENSDLDKTPPPSPPPEEDEDPGVQKRRSSRQVKRK
                         . .. .:.:::..  :  ::  .:::. ..:::::.::::::
CCDS53 ------------------RKRNTSSDNSDVEVMPAQSP--REDEESSIQKRRSNRQVKRK
                             550       560         570       580   

       760        770       780           790            800       
pF1KE9 RYTEDLEFKISD-EEADDADAAGRDSPS----NTSQSEQQESVDA-----EGP------V
       .:::::..::.: :: ...:..:  .:     .  :  . :.. .     :.:      .
CCDS53 KYTEDLDIKITDDEEEEEVDVTGPIKPEPILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAI
           590       600       610       620       630       640   

             810       820       830       840       850       860 
pF1KE9 VEKIMSSRSVKKQKESGEEVEIEEFYVKYKNFSYLHCQWASIEDLEKDKRIQQKIKRFKA
       :.:..: : :::.  ::. .: :::.:::::.:::::.::.: .:::::::.::.::::.
CCDS53 VDKVLSMRIVKKELPSGQYTEAEEFFVKYKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKT
           650       660       670       680       690       700   

             870       880       890        900       910       920
pF1KE9 KQGQNKFLSEIEDELFNPDYVEVDRIMDFARSTD-DRGEPVTHYLVKWCSLPYEDSTWER
       :..: . . . ..: :::::::::::.: ..: : : :::: .:::::::::::::::: 
CCDS53 KMAQMRHFFHEDEEPFNPDYVEVDRILDESHSIDKDNGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWEL
           710       720       730       740       750       760   

              930       940       950       960       970       980
pF1KE9 RQDIDQAKIEEFEKLMSREPETERVERPPADDWKKSESSREYKNNNKLREYQLEGVNWLL
       ..:.:..::.::....::.:: .::.:: :. ::: : :.:::: :.:::::::::::::
CCDS53 KEDVDEGKIREFKRIQSRHPELKRVNRPQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEGVNWLL
           770       780       790       800       810       820   

              990      1000      1010      1020      1030      1040
pF1KE9 FNWYNMRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEIYLKGIHGPFLVIAPLSTIPNWEREFRTWTE
       ::::: .:::::::::::::::::.:: :.:  ::::::::::::::: :::::: ::::
CCDS53 FNWYNRQNCILADEMGLGKTIQSIAFLQEVYNVGIHGPFLVIAPLSTITNWEREFNTWTE
           830       840       850       860       870       880   

             1050      1060      1070      1080      1090      1100
pF1KE9 LNVVVYHGSQASRRTIQLYEMYFKDPQGRVIKGSYKFHAIITTFEMILTDCPELRNIPWR
       .:..::::: :::. :: :::: :: .::.: :.::: :.::::::::.::::::.: ::
CCDS53 MNTIVYHGSLASRQMIQQYEMYCKDSRGRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELREIEWR
           890       900       910       920       930       940   

             1110      1120      1130      1140      1150      1160
pF1KE9 CVVIDEAHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSRFPSET
       ::.:::::::::::::::..:: :::::::::::::::::::::::::::::::.::::.
CCDS53 CVIIDEAHRLKNRNCKLLDSLKHMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSQFPSES
           950       960       970       980       990      1000   

             1170      1180      1190      1200      1210      1220
pF1KE9 TFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRA
        :...::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS53 EFLKDFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRA
          1010      1020      1030      1040      1050      1060   

             1230      1240      1250      1260      1270      1280
pF1KE9 ILEKNFTFLSKGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEEFKETHNAESPDF
       ::::::.:::::.:..:.:::::::::::::::::::::::::::: ::.:. .    ::
CCDS53 ILEKNFSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDF
          1070      1080      1090      1100      1110      1120   

             1290      1300      1310      1320      1330      1340
pF1KE9 QLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYPYERIDGRV
       .::::...:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS53 HLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRV
          1130      1140      1150      1160      1170      1180   

             1350      1360      1370      1380      1390      1400
pF1KE9 RGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARC
          1190      1200      1210      1220      1230      1240   

             1410      1420      1430      1440      1450      1460
pF1KE9 HRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRENATNGVQQLSKKEI
       :::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::..  .:.::.:::::
CCDS53 HRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEI
          1250      1260      1270      1280      1290      1300   

             1470      1480      1490      1500      1510      1520
pF1KE9 EDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTHTITIESEGKGSTFAKASFVASGNR
       :::::::::.:.:.:.::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::: ::
CCDS53 EDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENR
          1310      1320      1330      1340      1350      1360   

             1530      1540      1550      1560      1570      1580
pF1KE9 TDISLDDPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNNLVIDTPRVRKQTRLYSAVKEDELMEFSDLE
       ::::::::::::::::::.::.: ::..::::::::::::::: .:..:.:.:.::::::
CCDS53 TDISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLE
          1370      1380      1390      1400      1410      1420   

             1590      1600      1610      1620      1630      1640
pF1KE9 SDSEEKPCAKPRRPQDKSQGYARSECFRVEKNLLVYGWGRWTDILSHGRYKRQLTEQDVE
       :...:.:  . :: .:. ..:.:..::::::.::::::::: :::::::.::..::.:::
CCDS53 SEDDERP--RSRR-HDRHHAYGRTDCFRVEKHLLVYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVE
          1430         1440      1450      1460      1470      1480

             1650      1660      1670      1680      1690      1700
pF1KE9 TICRTILVYCLNHYKGDENIKSFIWDLITPTADGQTRALVNHSGLSAPVPRGRKGKKVKA
       ::::.:::::: ::.::::::.::::::.:. .:.:. : :::::: ::::::::::::.
CCDS53 TICRAILVYCLLHYRGDENIKGFIWDLISPAENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKS
             1490      1500      1510      1520      1530      1540

             1710      1720      1730      1740      1750      1760
pF1KE9 QSTQPVVQDADWLASCNPDALFQEDSYKKHLKHHCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQADKI
       :::  . . :::. . :::.:::..::::::::.:::::::::::::::::::::::.:.
CCDS53 QSTFDI-HKADWIRKYNPDTLFQDESYKKHLKHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKV
              1550      1560      1570      1580      1590         

             1770      1780      1790      1800      1810      1820
pF1KE9 LEGADSSEADVWIPEPFHAEVPADWWDKEADKSLLIGVFKHGYEKYNSMRADPALCFLER
       : :: .:: :.:.:   . :::. :::.:::::::::::::::::::.:::::::::::.
CCDS53 LGGAIASEIDIWFPVVDQLEVPTTWWDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEK
    1600      1610      1620      1630      1640      1650         

             1830      1840      1850      1860      1870      1880
pF1KE9 VGMPDAKAIAAEQRGTDMLADGGDGGEFDREDEDPEYKPTRTPFKDEIDEFANSPSEDKE
       .: :: ::::::.:  : ..:  .: .::.. ::::::: . : ::. ::  ..:    .
CCDS53 AGRPDDKAIAAEHRVLDNFSDIVEGVDFDKDCEDPEYKPLQGPPKDQDDE--GDPLMMMD
    1660      1670      1680      1690      1700        1710       

             1890      1900      1910      1920      1930      1940
pF1KE9 ESMEIHATGKHSESNAELGQLYWPNTSTLTTRLRRLITAYQRSYKRQQMRQEALMKTDRR
       : . .   : ... . . :.:.::  :.::.:::::.:::::::::.::. ::  . :::
CCDS53 EEISV-IDGDEAQVTQQPGHLFWPPGSALTARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRR
      1720       1730      1740      1750      1760      1770      

             1950      1960      1970      1980      1990      2000
pF1KE9 RRRPREEVRALEAEREAIISEKRQKWTRREEADFYRVVSTFGVIFDPVKQQFDWNQFRAF
       ::: .   .  :  :.    ::.:.:::::..::::::::::: .::  .:: :..::.:
CCDS53 RRRCEAAFKLKEIARR----EKQQRWTRREQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTF
       1780      1790          1800      1810      1820      1830  

             2010      2020      2030      2040      2050      2060
pF1KE9 ARLDKKSDESLEKYFSCFVAMCRRVCRMPVKPDDEPPDLSSIIEPITEERASRTLYRIEL
       ::::::.:::: :::  ::::::.:::.:    ::::: . .::::::::::::::::::
CCDS53 ARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRLPPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIEL
           1840      1850      1860      1870      1880      1890  

             2070      2080       2090      2100      2110         
pF1KE9 LRKIREQVLHHPQLGERLKLCQP-SLDLPEWWECGRHDRDLLVGAAKHGVSRTDYHILND
       ::..::::: :: : .:: :::: . .::.:::  ::: .:: :::.::::.:: .:..:
CCDS53 LRRLREQVLCHPLLEDRLALCQPPGPELPKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQD
           1900      1910      1920      1930      1940      1950  

    2120      2130      2140       2150      2160      2170        
pF1KE9 PELSFLDAHKNFAQNRGAGNTS-SLNPLAVGFVQTPPVISSAHIQDERVLEQAEGKVEEP
       :..::: :. :. ::. ::  . ::.  .. ...   .  .:     :    .: . :: 
CCDS53 PDFSFLAARMNYMQNHQAGAPAPSLSRCSTPLLHQQYTSRTASPLPLRPDAPVEKSPEET
           1960      1970      1980      1990      2000      2010  

     2180      2190      2200      2210            2220      2230  
pF1KE9 ENPAAKEKCEGKEEEEETDGSGKESKQECEAEASS------VKNELKGVEVGADTGSKS-
        . . . .    . :.:. . .. . :. : ..:       :.  .  :..  .  : : 
CCDS53 ATQVPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQDYEMRVSPSDTTPLVSRSVPPVKLEDEDDSDSE
           2020      2030      2040      2050      2060      2070  

                  2240      2250      2260      2270      2280     
pF1KE9 --ISE----KGSEEDEEEKLEDDDKSEESSQPEAGAVSRGKNFDEESNASMSTARDETRD
         .:.    ..:  .   .  . :.::. .. .    ::.: .::::  :..     ..:
CCDS53 LDLSKLSPSSSSSSSSSSSSSSTDESEDEKEEKLTDQSRSKLYDEESLLSLTM----SQD
           2080      2090      2100      2110      2120            

        2290      2300        2310      2320      2330      2340   
pF1KE9 GFYMEDGDPSVAQLL--HERTFAFSFWPKDRVMINRLDNICEAVLKGKWPVNRRQMFDFQ
       ::  :::.  . .::  .::  : : ::::::.:::.: .:.:::.:::: .::..    
CCDS53 GFPNEDGEQMTPELLLLQERQRA-SEWPKDRVLINRIDLVCQAVLSGKWPSSRRSQEMVT
     2130      2140      2150       2160      2170      2180       

          2350      2360      2370      2380      2390      2400   
pF1KE9 GLIPGYTPTTVDSPLQKRSFAELSMVGQASISGSEDITTSPQLSKEDALNLSVPRQRRRR
       : : :     .:::               :.. .:    ::           ::  :   
CCDS53 GGILGPGNHLLDSP---------------SLTPGE-YGDSP-----------VPTPR---
      2190      2200                      2210                     

          2410      2420      2430      2440      2450      2460   
pF1KE9 RRKIEIEAERAAKRRNLMEMVAQLRESQVVSENGQEKVVDLSKASREATSSTSNFSSLSS
              .  ::   .. :     .:...::                  .....:..:  
CCDS53 -------SSSAA---SMAE-----EEASAVS------------------TAAAQFTKLRR
             2220              2230                        2240    

          2470      2480      2490        2500      2510      2520 
pF1KE9 KFILPNVSTPVSDAFKTQMELLQAGLSRTPTRHLL--NGSLVDGEPPMKRRRGRRKNVEG
        .   . .. ..:         . ::. :  .: :  :: . ::.: .....: ::..  
CCDS53 GMDEKEFTVQIKD---------EEGLKLTFQKHKLMANGVMGDGHPLFHKKKGNRKKLVE
         2250               2260      2270      2280      2290     

            2530      2540      2550      2560      2570      2580 
pF1KE9 LDLLFMSHKRTSLSAEDAEVTKAFEEDIETPPTRNIPSPGQLDPDTRIPVINLEDGTRLV
       :..  :                  ::          :.  ..: .:::::::  ::: ::
CCDS53 LEVECM------------------EE----------PNHLDVDLETRIPVINKVDGTLLV
        2300                                  2310      2320       

            2590      2600      2610      2620      2630      2640 
pF1KE9 GEDAPKNKDLVEWLKLHPTYTVDMPSYVPKNADVLFSSFQKPKQKRHRCRNPNKLDINTL
       :::::.  .:  ::. :: ..:: : ..    :       . ::: .::.. :: ..: :
CCDS53 GEDAPRRAELEMWLQGHPEFAVD-PRFLAYMED-------RRKQKWQRCKKNNKAELNCL
      2330      2340      2350              2360      2370         

            2650      2660      2670      2680      2690      2700 
pF1KE9 TGEERVPVVNKRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEENPEFAVAPDWTDIVKQSGFVPESMFD
        : : : ..:.:::::                                   :   :..:.
CCDS53 -GMEPVQTANSRNGKK-----------------------------------GHHTETVFN
     2380      2390                                         2400   

            2710      2720      2730      2740      2750      2760 
pF1KE9 RLLTGPVVRGEGASRRGRRPKSEIARAAAAAAAVASTSGINPLLVNSLFAGMDLTSLQNL
       :.: ::..  :....:.:: . ....  :   . .. :    : ... :   . ..::..
CCDS53 RVLPGPIA-PESSKKRARRMRPDLSKMMALMQGGSTGS----LSLHNTFQ-HSSSGLQSV
          2410       2420      2430      2440           2450       

             2770      2780      2790      2800      2810          
pF1KE9 QNL-QSLQLAGLMGFPPGLATAATAGGDAKNPAAVLPLMLPGMAGLPNVF-------GL-
       ..: .:   .. . : : .      ::  ..: .    ::      :.         :: 
CCDS53 SSLGHSSATSASLPFMPFVM-----GGAPSSPHVDSSTMLHHHHHHPHPHHHHHHHPGLR
      2460      2470           2480      2490      2500      2510  

            2820      2830      2840      2850      2860      2870 
pF1KE9 -GGLLNNPLSAATGNTTTASSQGEPEDSTSKGEEKGNENEDENKDSEKSTDAVSAADSAN
         :  ..:...:.: ::      .::.. .. ::   ...: ..  ..:    :  :   
CCDS53 APGYPSSPVTTASG-TTLRLPPLQPEEDDDEDEE---DDDDLSQGYDSSERDFSLIDDPM
           2520       2530      2540         2550      2560        

            2880      2890      2900      2910      2920      2930 
pF1KE9 GSVGAATAPAGLPSNPLAFNPFLLSTMAPGLFYPSMFLPPGLGGLTLPGFPALAGLQNAV
                                                                   
CCDS53 MPANSDSSEDADD                                               
     2570      2580                                                

>>CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14              (2302 aa)
 initn: 6942 init1: 3921 opt: 6109  Z-score: 2699.7  bits: 513.8 E(32554): 4.7e-144
Smith-Waterman score: 7350; 51.1% identity (70.6% similar) in 2492 aa overlap (430-2868:12-2286)

     400       410       420       430       440       450         
pF1KE9 KAMSNPAGTPPPQVRPGSAGIPMEVGSYPNMPHPQPSHQPPGAMGIGQRNMGPRNMQQSR
                                     . .:: :  : :   .   ..  . . :. 
CCDS45                    MKGESKRITLVLQQPQ-SGGPQGHRHVVLGSLPGKIVLQGN
                                  10         20        30        40

     460       470       480       490        500       510        
pF1KE9 PFIGMSSAPRELTGHMRPNGCPGVGLGDPQAIQE-RLIPGQQHPGQQPSFQQLPTCPPLQ
        . ....: ..  :.  :     . :   :  :. ...:  : :..::. :: :.  :. 
CCDS45 QLAALTQA-KNAQGQ--PAKVVTIQLQVQQPQQKIQIVP--QPPSSQPQPQQPPSTQPVT
                50          60        70          80        90     

      520       530       540        550       560         570     
pF1KE9 PHPGLHHQSSPPHPHHQPWAQLH-PSPQNTPQKVPVHQHSPSEPFLEK--PVPDMTQVSG
             .:..   : ..:  .:  :       ..   : . :   . :   . ... .:.
CCDS45 LSSV--QQAQIMGPGQSPGQRLSVPVKVVLQPQAGSSQGASSGLSVVKVLSASEVAALSS
           100       110       120       130       140       150   

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pF1KE9 PNAQLVKSDDYLPSIEQQP-QQKKKKKKNNHIVAEDPSKGF--GKDDFPGGVDNQELNRN
       : ..  .:       :..  ...::..: :.::::  ...   :....:  ....::   
CCDS45 PASSAPHSGGKTGMEENRRLEHQKKQEKANRIVAEAIARARARGEQNIPRVLNEDELP--
           160       170       180       190       200       210   

            640       650       660       670       680       690  
pF1KE9 SLDGSQEEKKKKKRSKAKKDPKEPKEPKEKKEPKEPKTPKAPKIPKEPKEKKAKTATPKP
       :.   .: .::.....: .  :: :       ::. ::  : :      . :.:  :  :
CCDS45 SVRPEEEGEKKRRKKSAGERLKEEK-------PKKSKTSGASKT-----KGKSKLNTITP
             220       230              240            250         

            700       710       720       730       740       750  
pF1KE9 KSSKKSSNKKPDSEASALKKKVNKGKTEGSENSDLDKTPPPSPPPEEDEDPGVQKRRSSR
         .::                  . .. .:.:::..  :  ::  .:::. ..:::::.:
CCDS45 VVGKK------------------RKRNTSSDNSDVEVMPAQSP--REDEESSIQKRRSNR
     260                         270       280         290         

            760        770       780           790            800  
pF1KE9 QVKRKRYTEDLEFKISD-EEADDADAAGRDSPS----NTSQSEQQESVDA-----EGP--
       :::::.:::::..::.: :: ...:..:  .:     .  :  . :.. .     :.:  
CCDS45 QVKRKKYTEDLDIKITDDEEEEEVDVTGPIKPEPILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSE
     300       310       320       330       340       350         

                  810       820       830       840       850      
pF1KE9 ----VVEKIMSSRSVKKQKESGEEVEIEEFYVKYKNFSYLHCQWASIEDLEKDKRIQQKI
           .:.:..: : :::.  ::. .: :::.:::::.:::::.::.: .:::::::.::.
CCDS45 EDAAIVDKVLSMRIVKKELPSGQYTEAEEFFVKYKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKL
     360       370       380       390       400       410         

        860       870       880       890        900       910     
pF1KE9 KRFKAKQGQNKFLSEIEDELFNPDYVEVDRIMDFARSTD-DRGEPVTHYLVKWCSLPYED
       ::::.:..: . . . ..: :::::::::::.: ..: : : :::: .::::::::::::
CCDS45 KRFKTKMAQMRHFFHEDEEPFNPDYVEVDRILDESHSIDKDNGEPVIYYLVKWCSLPYED
     420       430       440       450       460       470         

         920       930       940       950       960       970     
pF1KE9 STWERRQDIDQAKIEEFEKLMSREPETERVERPPADDWKKSESSREYKNNNKLREYQLEG
       :::: ..:.:..::.::....::.:: .::.:: :. ::: : :.:::: :.::::::::
CCDS45 STWELKEDVDEGKIREFKRIQSRHPELKRVNRPQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEG
     480       490       500       510       520       530         

         980       990      1000      1010      1020      1030     
pF1KE9 VNWLLFNWYNMRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEIYLKGIHGPFLVIAPLSTIPNWEREF
       :::::::::: .:::::::::::::::::.:: :.:  ::::::::::::::: ::::::
CCDS45 VNWLLFNWYNRQNCILADEMGLGKTIQSIAFLQEVYNVGIHGPFLVIAPLSTITNWEREF
     540       550       560       570       580       590         

        1040      1050      1060      1070      1080      1090     
pF1KE9 RTWTELNVVVYHGSQASRRTIQLYEMYFKDPQGRVIKGSYKFHAIITTFEMILTDCPELR
        ::::.:..::::: :::. :: :::: :: .::.: :.::: :.::::::::.::::::
CCDS45 NTWTEMNTIVYHGSLASRQMIQQYEMYCKDSRGRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELR
     600       610       620       630       640       650         

        1100      1110      1120      1130      1140      1150     
pF1KE9 NIPWRCVVIDEAHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSR
       .: ::::.:::::::::::::::..:: :::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS45 EIEWRCVIIDEAHRLKNRNCKLLDSLKHMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSQ
     660       670       680       690       700       710         

        1160      1170      1180      1190      1200      1210     
pF1KE9 FPSETTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETIIEVELTNIQK
       ::::. :...::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS45 FPSESEFLKDFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQK
     720       730       740       750       760       770         

        1220      1230      1240      1250      1260      1270     
pF1KE9 KYYRAILEKNFTFLSKGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEEFKETHNA
       :::::::::::.:::::.:..:.:::::::::::::::::::::::::::: ::.:. . 
CCDS45 KYYRAILEKNFSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHI
     780       790       800       810       820       830         

        1280      1290      1300      1310      1320      1330     
pF1KE9 ESPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYPYER
          ::.::::...:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: :::
CCDS45 IPHDFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYER
     840       850       860       870       880       890         

        1340      1350      1360      1370      1380      1390     
pF1KE9 IDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQ
     900       910       920       930       940       950         

        1400      1410      1420      1430      1440      1450     
pF1KE9 AQARCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRENATNGVQQL
       ::::::::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::..  .:.::.
CCDS45 AQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQF
     960       970       980       990      1000      1010         

        1460      1470      1480      1490      1500      1510     
pF1KE9 SKKEIEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTHTITIESEGKGSTFAKASFV
       ::::::::::::::.:.:.:.::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS45 SKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFV
    1020      1030      1040      1050      1060      1070         

        1520      1530      1540      1550      1560      1570     
pF1KE9 ASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNNLVIDTPRVRKQTRLYSAVKEDELME
       :: ::::::::::::::::::::.::.: ::..::::::::::::::: .:..:.:.:.:
CCDS45 ASENRTDISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVE
    1080      1090      1100      1110      1120      1130         

        1580      1590      1600      1610      1620      1630     
pF1KE9 FSDLESDSEEKPCAKPRRPQDKSQGYARSECFRVEKNLLVYGWGRWTDILSHGRYKRQLT
       ::::::...:.:  . :: .:. ..:.:..::::::.::::::::: :::::::.::..:
CCDS45 FSDLESEDDERP--RSRR-HDRHHAYGRTDCFRVEKHLLVYGWGRWRDILSHGRFKRRMT
    1140      1150         1160      1170      1180      1190      

        1640      1650      1660      1670      1680      1690     
pF1KE9 EQDVETICRTILVYCLNHYKGDENIKSFIWDLITPTADGQTRALVNHSGLSAPVPRGRKG
       :.:::::::.:::::: ::.::::::.::::::.:. .:.:. : :::::: ::::::::
CCDS45 ERDVETICRAILVYCLLHYRGDENIKGFIWDLISPAENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKG
       1200      1210      1220      1230      1240      1250      

        1700      1710      1720      1730      1740      1750     
pF1KE9 KKVKAQSTQPVVQDADWLASCNPDALFQEDSYKKHLKHHCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGD
       ::::.:::  . . :::. . :::.:::..::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS45 KKVKSQSTFDI-HKADWIRKYNPDTLFQDESYKKHLKHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGD
       1260       1270      1280      1290      1300      1310     

        1760      1770      1780      1790      1800      1810     
pF1KE9 QADKILEGADSSEADVWIPEPFHAEVPADWWDKEADKSLLIGVFKHGYEKYNSMRADPAL
       ::.:.: :: .:: :.:.:   . :::. :::.:::::::::::::::::::.:::::::
CCDS45 QAEKVLGGAIASEIDIWFPVVDQLEVPTTWWDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPAL
        1320      1330      1340      1350      1360      1370     

        1820      1830      1840      1850      1860      1870     
pF1KE9 CFLERVGMPDAKAIAAEQRGTDMLADGGDGGEFDREDEDPEYKPTRTPFKDEIDEFANSP
       ::::..: :: ::::::.:  : ..:  .: .::.. ::::::: . : ::. ::  ..:
CCDS45 CFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFSDIVEGVDFDKDCEDPEYKPLQGPPKDQDDE--GDP
        1380      1390      1400      1410      1420      1430     

        1880      1890      1900      1910      1920      1930     
pF1KE9 SEDKEESMEIHATGKHSESNAELGQLYWPNTSTLTTRLRRLITAYQRSYKRQQMRQEALM
           .: . .   : ... . . :.:.::  :.::.:::::.:::::::::.::. ::  
CCDS45 LMMMDEEISV-IDGDEAQVTQQPGHLFWPPGSALTARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAE
          1440       1450      1460      1470      1480      1490  

        1940      1950      1960      1970      1980      1990     
pF1KE9 KTDRRRRRPREEVRALEAEREAIISEKRQKWTRREEADFYRVVSTFGVIFDPVKQQFDWN
       . :::::: .   .  :  :.    ::.:.:::::..::::::::::: .::  .:: :.
CCDS45 RGDRRRRRCEAAFKLKEIARR----EKQQRWTRREQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWD
           1500      1510          1520      1530      1540        

        2000      2010      2020      2030      2040      2050     
pF1KE9 QFRAFARLDKKSDESLEKYFSCFVAMCRRVCRMPVKPDDEPPDLSSIIEPITEERASRTL
       .::.:::::::.:::: :::  ::::::.:::.:    ::::: . .:::::::::::::
CCDS45 RFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRLPPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTL
     1550      1560      1570      1580      1590      1600        

        2060      2070      2080       2090      2100      2110    
pF1KE9 YRIELLRKIREQVLHHPQLGERLKLCQP-SLDLPEWWECGRHDRDLLVGAAKHGVSRTDY
       :::::::..::::: :: : .:: :::: . .::.:::  ::: .:: :::.::::.:: 
CCDS45 YRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLALCQPPGPELPKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDC
     1610      1620      1630      1640      1650      1660        

         2120      2130      2140       2150      2160      2170   
pF1KE9 HILNDPELSFLDAHKNFAQNRGAGNTS-SLNPLAVGFVQTPPVISSAHIQDERVLEQAEG
       .:..::..::: :. :. ::. ::  . ::.  .. ...   .  .:     :    .: 
CCDS45 NIMQDPDFSFLAARMNYMQNHQAGAPAPSLSRCSTPLLHQQYTSRTASPLPLRPDAPVEK
     1670      1680      1690      1700      1710      1720        

          2180      2190      2200      2210            2220       
pF1KE9 KVEEPENPAAKEKCEGKEEEEETDGSGKESKQECEAEASS------VKNELKGVEVGADT
       . ::  . . . .    . :.:. . .. . :. : ..:       :.  .  :..  . 
CCDS45 SPEETATQVPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQDYEMRVSPSDTTPLVSRSVPPVKLEDED
     1730      1740      1750      1760      1770      1780        

      2230             2240      2250      2260      2270      2280
pF1KE9 GSKS---ISE----KGSEEDEEEKLEDDDKSEESSQPEAGAVSRGKNFDEESNASMSTAR
        : :   .:.    ..:  .   .  . :.::. .. .    ::.: .::::  :..   
CCDS45 DSDSELDLSKLSPSSSSSSSSSSSSSSTDESEDEKEEKLTDQSRSKLYDEESLLSLTM--
     1790      1800      1810      1820      1830      1840        

             2290      2300        2310      2320      2330        
pF1KE9 DETRDGFYMEDGDPSVAQLL--HERTFAFSFWPKDRVMINRLDNICEAVLKGKWPVNRRQ
         ..:::  :::.  . .::  .::  : : ::::::.:::.: .:.:::.:::: .::.
CCDS45 --SQDGFPNEDGEQMTPELLLLQERQRA-SEWPKDRVLINRIDLVCQAVLSGKWPSSRRS
         1850      1860      1870       1880      1890      1900   

     2340      2350      2360      2370      2380      2390        
pF1KE9 MFDFQGLIPGYTPTTVDSPLQKRSFAELSMVGQASISGSEDITTSPQLSKEDALNLSVPR
       .    : : :     .:::               :.. .:    ::           :: 
CCDS45 QEMVTGGILGPGNHLLDSP---------------SLTPGE-YGDSP-----------VP-
          1910      1920                      1930                 

     2400      2410      2420      2430      2440      2450        
pF1KE9 QRRRRRRKIEIEAERAAKRRNLMEMVAQLRESQVVSENGQEKVVDLSKASREATSSTSNF
                   . :...  .. :     .:...::                  .....:
CCDS45 ------------TPRSSSAASMAE-----EEASAVS------------------TAAAQF
                    1940           1950                        1960

     2460      2470      2480      2490        2500      2510      
pF1KE9 SSLSSKFILPNVSTPVSDAFKTQMELLQAGLSRTPTRHLL--NGSLVDGEPPMKRRRGRR
       ..:   .   . .. ..:         . ::. :  .: :  :: . ::.: .....: :
CCDS45 TKLRRGMDEKEFTVQIKD---------EEGLKLTFQKHKLMANGVMGDGHPLFHKKKGNR
             1970               1980      1990      2000      2010 

       2520      2530      2540      2550      2560      2570      
pF1KE9 KNVEGLDLLFMSHKRTSLSAEDAEVTKAFEEDIETPPTRNIPSPGQLDPDTRIPVINLED
       :..  :..  :                  ::          :.  ..: .:::::::  :
CCDS45 KKLVELEVECM------------------EE----------PNHLDVDLETRIPVINKVD
            2020                                  2030      2040   

       2580      2590      2600      2610      2620      2630      
pF1KE9 GTRLVGEDAPKNKDLVEWLKLHPTYTVDMPSYVPKNADVLFSSFQKPKQKRHRCRNPNKL
       :: :::::::.  .:  ::. :: ..:: : ..    :       . ::: .::.. :: 
CCDS45 GTLLVGEDAPRRAELEMWLQGHPEFAVD-PRFLAYMED-------RRKQKWQRCKKNNKA
          2050      2060      2070       2080             2090     

       2640      2650      2660      2670      2680      2690      
pF1KE9 DINTLTGEERVPVVNKRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEENPEFAVAPDWTDIVKQSGFVP
       ..: : : : : ..:.:::::                                   :   
CCDS45 ELNCL-GMEPVQTANSRNGKK-----------------------------------GHHT
        2100       2110                                            

       2700      2710      2720      2730      2740      2750      
pF1KE9 ESMFDRLLTGPVVRGEGASRRGRRPKSEIARAAAAAAAVASTSGINPLLVNSLFAGMDLT
       :..:.:.: ::..  :....:.:: . ....  :   . .. :    : ... :   . .
CCDS45 ETVFNRVLPGPIA-PESSKKRARRMRPDLSKMMALMQGGSTGS----LSLHNTFQ-HSSS
    2120      2130       2140      2150      2160           2170   

       2760       2770      2780      2790      2800      2810     
pF1KE9 SLQNLQNL-QSLQLAGLMGFPPGLATAATAGGDAKNPAAVLPLMLPGMAGLPNVF-----
       .::....: .:   .. . : : .      ::  ..: .    ::      :.       
CCDS45 GLQSVSSLGHSSATSASLPFMPFVM-----GGAPSSPHVDSSTMLHHHHHHPHPHHHHHH
          2180      2190           2200      2210      2220        

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pF1KE9 --GL--GGLLNNPLSAATGNTTTASSQGEPEDSTSKGEEKGNENEDENKDSEKSTDAVSA
         ::   :  ..:...:.: ::      .::.. .. ::   ...: ..  ..:    : 
CCDS45 HPGLRAPGYPSSPVTTASG-TTLRLPPLQPEEDDDEDEE---DDDDLSQGYDSSERDFSL
     2230      2240       2250      2260         2270      2280    

       2870      2880      2890      2900      2910      2920      
pF1KE9 ADSANGSVGAATAPAGLPSNPLAFNPFLLSTMAPGLFYPSMFLPPGLGGLTLPGFPALAG
        :                                                          
CCDS45 IDDPMMPANSDSSEDADD                                          
         2290      2300                                            

>>CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20              (2715 aa)
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                                     :. ::. .  .:    .::: :: .  . .
CCDS13              MKMKIQKKEKQLSNLKVLNHSPM-SDASVNFDYKSPS-PF-DCSTDQ
                            10        20         30          40    

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pF1KE9 MTQVSGPNAQLVKSDDYLPSIEQQPQQKKKKKKNNHIVAEDPSKGFG-------KDDFPG
         ..    .. . . : : . :..      .: ..:   :: : : :       :   ::
CCDS13 EEKIEDVASHCLPQKD-LYTAEEEAATLFPRKMTSHNGMED-SGGGGTGVKKKRKKKEPG
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pF1KE9 GVDNQELNRNSLDGSQEEKKKKKRSKAKKDPKEP---KEPKEKKEPKEPKTPKAPKIPKE
          .::   ..  ::.... : ::..  :.::::   ::::. :: ::::   . :  ..
CCDS13 ---DQE---GAAKGSKDREPKPKRKREPKEPKEPRKAKEPKKAKEHKEPKQKDGAKKARK
                  110       120       130       140       150      

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pF1KE9 PKE----KKAKTATPKPKSSKKSSNKKPDSEASAL---KKKVNKGKTEGS-ENSDLDK--
       :.:    :.::       :. .....: ..: .     ::: .: :.: . :. .::.  
CCDS13 PREASGTKEAKEKRSCTDSAARTKSRKASKEQGPTPVEKKKKGKRKSETTVESLELDQGL
        160       170       180       190       200       210      

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pF1KE9 TPPPSPPPEED-EDPGVQKRRSSRQVKRKRYTEDLEFKISDEEADDADA--AGRDSPSNT
       : :    :::. :.   :::::.:::::..:.:::.::. :....   .  ::: :  ..
CCDS13 TNPSLRSPEESTESTDSQKRRSGRQVKRRKYNEDLDFKVVDDDGETIAVLGAGRTSALSA
        220       230       240       250       260       270      

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pF1KE9 S----QSEQQESVDAEGPVVEKIMSSRSVKKQKESGEEVEIEEFYVKYKNFSYLHCQWAS
       :    :.:.    ::.  ..:::..:..:.. . .    ..: :::::.:::::::.::.
CCDS13 STLAWQAEEPPEDDAN--IIEKILASKTVQEVHPGEPPFDLELFYVKYRNFSYLHCKWAT
        280       290         300       310       320       330    

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pF1KE9 IEDLEKDKRIQQKIKRFKAKQGQNKFL-SEIEDELFNPDYVEVDRIMDFARSTD-DRGEP
       .:.:::: :: ::::::. ::.: : . .: ...::::::::::::.. :.. : . :: 
CCDS13 MEELEKDPRIAQKIKRFRNKQAQMKHIFTEPDEDLFNPDYVEVDRILEVAHTKDAETGEE
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pF1KE9 VTHYLVKWCSLPYEDSTWERRQDIDQAKIEEFEKLMSREPETERVERPPADDWKKSESSR
       ::::::::::::::.:::: ..:.: ::..:::.:.   :: ..:::: .:.:.: :.::
CCDS13 VTHYLVKWCSLPYEESTWELEEDVDPAKVKEFESLQVL-PEIKHVERPASDSWQKLEKSR
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pF1KE9 EYKNNNKLREYQLEGVNWLLFNWYNMRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEIYLKGIHGPFL
       ::::.:.::::::::.::::::::: .:::::::::::::::::::: ::.:.:::::::
CCDS13 EYKNSNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSITFLSEIFLRGIHGPFL
           460       470       480       490       500       510   

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pF1KE9 VIAPLSTIPNWEREFRTWTELNVVVYHGSQASRRTIQLYEMYFKDPQGRVIKGSYKFHAI
       .::::::: :::::::::::.:..:::::: ::. :: ::: ..: ::  ..: .:::..
CCDS13 IIAPLSTITNWEREFRTWTEMNAIVYHGSQISRQMIQQYEMVYRDAQGNPLSGVFKFHVV
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pF1KE9 ITTFEMILTDCPELRNIPWRCVVIDEAHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNT
       ::::::::.:::::..: : ::.:::::::::::::::::::.: ::::::::::::::.
CCDS13 ITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCKLLEGLKLMALEHKVLLTGTPLQNS
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pF1KE9 VEELFSLLHFLEPSRFPSETTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAP
       ::::::::.:::::.:::::.:..:::::::::::.:::.:::::::::::.::::::::
CCDS13 VEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGDLKTEEQVKKLQSILKPMMLRRLKDDVEKNLAP
           640       650       660       670       680       690   

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE9 KEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFTFLSKGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLING
       :.::::::::::::::::::::::::.::.::..: :.:::.::::::::::::::::::
CCDS13 KQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLTKGANQHNMPNLINTMMELRKCCNHPYLING
           700       710       720       730       740       750   

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pF1KE9 AEEKILEEFKETHNAESPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLD
       :::::::.:..::. ..::::::::::::::::::::::::: ::::.::::::::::::
CCDS13 AEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLD
           760       770       780       790       800       810   

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pF1KE9 ILEDYLIQRRYPYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADT
       ::::::::::: :::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADT
           820       830       840       850       860       870   

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE9 CIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQ
       :::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQ
           880       890       900       910       920       930   

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pF1KE9 SMSGRENATNGVQQLSKKEIEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTHTITI
       ... :...::::::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS13 DIN-RKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILQRRTHTITI
            940       950       960       970       980       990  

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE9 ESEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNNLVIDTPRVRK
       .::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::: .: : ...:::: :::::
CCDS13 QSEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRK
           1000      1010      1020      1030      1040      1050  

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE9 QTRLYSAVKEDELMEFSDLESDSEEKPCAKPRRPQDKSQGYARSECFRVEKNLLVYGWGR
       ::. :.. .::::::::.:.:::.:.: .. :: .::.. : :.::::::::::..::::
CCDS13 QTKHYNSFEEDELMEFSELDSDSDERP-TRSRRLNDKARRYLRAECFRVEKNLLIFGWGR
           1060      1070       1080      1090      1100      1110 

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE9 WTDILSHGRYKRQLTEQDVETICRTILVYCLNHYKGDENIKSFIWDLITPTADGQTRALV
       : :::.:::.: .:.:.:.: :::..::::..::::::.::::::.::::: :::...: 
CCDS13 WKDILTHGRFKWHLNEKDMEMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIWELITPTKDGQAQTLQ
            1120      1130      1140      1150      1160      1170 

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KE9 NHSGLSAPVPRGRKGKKVKAQSTQPVVQDADWLASCNPDALFQEDSYKKHLKHHCNKVLL
       :::::::::::::::::.: :   : ..::::::.:::......:.::::::.:::::::
CCDS13 NHSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLHDDGYKKHLKQHCNKVLL
            1180      1190      1200      1210      1220      1230 

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KE9 RVRMLYYLRQEVIGDQADKILEGADSSEADVWIPEPFHAEVPADWWDKEADKSLLIGVFK
       ::::::::. :..:. :.: .::. . : :: .:.  . :.:.:::: ::::::::::::
CCDS13 RVRMLYYLKAEILGEAAEKAFEGSPARELDVPLPDIDYMEIPVDWWDAEADKSLLIGVFK
            1240      1250      1260      1270      1280      1290 

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pF1KE9 HGYEKYNSMRADPALCFLERVGMPDAKAIAAEQRGTDMLADGGDGGEFDREDE-DPEYKP
       ::::.::.:::::::::::.::::: :...:::  ::  .:  . :. :.::. . .   
CCDS13 HGYERYNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVTDGTSDIPERGNTDKEDNAEDKVDG
            1300      1310      1320      1330      1340      1350 

    1860      1870      1880      1890      1900      1910         
pF1KE9 TRTPFKDEIDEFANSPSEDKEESMEIHATGKHSESNAELGQLYWPNTSTLTTRLRRLITA
        .   ..  :   .  :: :..:       . ......  .  :: .:.::.:::::.:.
CCDS13 LQKQTESSSDGGDGVFSEKKDDS-------RAAQDGSDPDKSPWPVSSALTARLRRLVTV
            1360      1370             1380      1390      1400    

    1920      1930      1940      1950      1960      1970         
pF1KE9 YQRSYKRQQMRQEALMKTDRRRRRPREEVRALEAEREAIISEKRQKWTRREEADFYRVVS
       :::  ...  : : :   ..     .:  :   .: . : .: ...:::::.:::::.::
CCDS13 YQRCNRKELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRT-SEMDLINKEAQKRWTRREQADFYRTVS
         1410      1420      1430       1440      1450      1460   

    1980      1990      2000      2010      2020      2030         
pF1KE9 TFGVIFDPVKQQFDWNQFRAFARLDKKSDESLEKYFSCFVAMCRRVCRMPVKPDDEPPDL
       .:::..:  :. :::.::: ..:::::::::::.::  :::::: :::.:.  :  ::: 
CCDS13 SFGVVYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFYSFVAMCRNVCRLPTWKDGGPPDT
          1470      1480      1490      1500      1510      1520   

    2040      2050      2060      2070      2080      2090         
pF1KE9 SSIIEPITEERASRTLYRIELLRKIREQVLHHPQLGERLKLCQPSLDLPEWWECGRHDRD
       .  .::::::::.:::::::::::.:::::. ::: :::.::.::: :: :::::.::::
CCDS13 TIYVEPITEERAARTLYRIELLRKVREQVLKCPQLHERLQLCRPSLYLPVWWECGKHDRD
          1530      1540      1550      1560      1570      1580   

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pF1KE9 LLVGAAKHGVSRTDYHILNDPELSFLDAHKNFAQNRGAGNTSSLN---------------
       ::.:.::::..::: .:.:::.::::::..:.::.. .:. .  :               
CCDS13 LLIGTAKHGLNRTDCYIMNDPQLSFLDAYRNYAQHKRSGTQAPGNLCCLYQTNSKLYESL
          1590      1600      1610      1620      1630      1640   

                        2150             2160                2170  
pF1KE9 ---------------PLAVGFVQT-------PPVISSAHI----------QDERVLEQA-
                      :  .  :..       : :     :          .:: .: .. 
CCDS13 TYSQMSRTSESLENEPENLVRVESRDDHLSLPDVTCENFISKVQDVISINHDESLLPESL
          1650      1660      1670      1680      1690      1700   

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pF1KE9 ----EGK---VEEP----ENPAAKEK---------------CE-GKEEEEETDG------
            ::    .::    :.:... .               :. :  : : ..:      
CCDS13 ESMMYGKKVLSQEPSSFQESPSTNTESRKDVITISISKDGNCQSGGPEAEIASGPTFMGS
          1710      1720      1730      1740      1750      1760   

                 2200             2210      2220                   
pF1KE9 ------------SGKE-----SKQE--CEAEASSVKNELKGVEV----------GADTG-
                   .::.     ::.   : .::..  ...  .:.          : ..: 
CCDS13 LEAGGVAQANIKNGKHLLMSISKEGELCCSEAGQRPENIGQLEAKCLASPSLNPGNESGF
          1770      1780      1790      1800      1810      1820   

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pF1KE9 --------------------------SKSISEK-------GSEEDEEEKLEDDDKSEE--
                                 .::.  :       ..::.:::. :... .    
CCDS13 VDMCSLSVCDSKRNLSSDQQLIDLLENKSLESKLILSQNHSDEEEEEEENEEENLAMAVG
          1830      1840      1850      1860      1870      1880   

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pF1KE9 -SSQPEA-------GAVSRGKN--F-DEESNASMSTAR----------------------
        . .::.         .:: ::  : :: ...:. .:                       
CCDS13 MGERPEVLHLTEPTTNISREKNQGFQDETKKGSLEVANQTPGLQRAFPAPAACQCHCKHM
          1890      1900      1910      1920      1930      1940   

                                                                   
pF1KE9 ------------------------------------------------------------
                                                                   
CCDS13 ERWMHGLENDEFEIEKPKAYIPDLFKSKTNTIAMEGEPTAIPSQPFKVKHELLKEPWKES
          1950      1960      1970      1980      1990      2000   

                                                  2290             
pF1KE9 ----------------------------DETRDGF---------YMED----------GD
                                   :  :::          : :.          ::
CCDS13 AEGQNVFPTYPLEGSELKSEDMDFENKDDYDRDGNCHSQDYPGKYSEEESKSSTSGITGD
          2010      2020      2030      2040      2050      2060   

                    2300       2310      2320      2330      2340  
pF1KE9 ----------PSVAQLLHERT-FAFSFWPKDRVMINRLDNICEAVLKGKWPVNRRQMFDF
                 :..::::.:.: ..:: ::::::.::::::::..::::::: .  :... 
CCDS13 IGDELQEARAPTIAQLLQEKTLYSFSEWPKDRVIINRLDNICHVVLKGKWPSS--QQYEP
          2070      2080      2090      2100      2110        2120 

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pF1KE9 QGLIPGYTPTTVDSPLQKRSFAELSMVGQASISGSEDITTSPQLSKEDALNLSVPRQRRR
       .: .:  ::. ..:  .. :..:      :  : :.  . . :. ::. :     .....
CCDS13 SGTLP--TPVLTSSAGSRTSLSEPE---AAEHSFSNGAALAAQIHKESFLAPVFTKDEQK
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pF1KE9 RRRKIEIEAERAAKRRNLMEMVAQLRESQVVSENGQ--EKVVDLSKASREATSSTSNFSS
       .::  :.:.:: :: :.: .. :   .. ..  ::   :...::: .:. . ..:: :  
CCDS13 HRRPYEFEVERDAKARGLEQFSATHGHTPIIL-NGWHGESAMDLSCSSEGSPGATSPFPV
       2180      2190      2200       2210      2220      2230     

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pF1KE9 LSSKFILPNVSTPVSDAFKTQME-LLQAGLSRTPTRHLLNGSLVDGEPPMKRRRGRRKNV
        .:   .  .:. .. :.  ..  .::::: .  : ...::::   .   .:::::::.:
CCDS13 SASTPKIGAISS-LQGALGMDLSGILQAGLIHPVTGQIVNGSLRRDDAATRRRRGRRKHV
        2240       2250      2260      2270      2280      2290    

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pF1KE9 EG-LDLLFMSHKRTSLSAEDAEVTKAFEEDIETPPTRNIPSPGQLDPDTRIPVINLEDGT
       :: .::.:.  :. .:.:   :: .  .    :  : .  .::   : :  :      ..
CCDS13 EGGMDLIFL--KEQTLQAGILEVHE--DPGQATLSTTHPEGPG---PATSAPEPATAASS
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pF1KE9 RLVGEDAPKNKDLVEWLKLHPTYTVDMPSYVPKNADVLFSSFQKPKQKRHRCRNPNKLDI
       .  .: .  .:.:..::. .  :....:..   .:.  ::.  ::::.: ::..:.:::.
CCDS13 Q--AEKSIPSKSLLDWLRQQADYSLEVPGF---GAN--FSD--KPKQRRPRCKEPGKLDV
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pF1KE9 NTLTGEERVPVVNKRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEENPEFAVAPDWTDIVKQSGFVPES
       ..:.::::::.. :. : .                                   ::.::.
CCDS13 SSLSGEERVPAIPKEPGLR-----------------------------------GFLPEN
     2400      2410                                         2420   

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pF1KE9 MFDRLLTGPVVRGEGASRRGRRPKSEIARAAAAAAAVASTSGINPLLVNSLFAGMDLTSL
        :.. :. :..:  :  ::::::.::. .: . .:   : ::..::..:.:.:::::..:
CCDS13 KFNHTLAEPILRDTGPRRRGRRPRSELLKAPSIVA--DSPSGMGPLFMNGLIAGMDLVGL
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pF1KE9 QNLQNLQSLQLAGLMGFPPGLATAATAGGDAKNPAAVLPLMLPGMAGLPNVFGLGGLLNN
       ::..:. .. :.::.::: :.::  : : ..:.  ..::.::                  
CCDS13 QNMRNMPGIPLTGLVGFPAGFATMPT-GEEVKSTLSMLPMMLPGMAAVPQMFGVGGLLSP
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pF1KE9 PLSAATGNTTTASSQGEPEDSTSKGEEKGNENEDENKDSEKSTDAVSAADSANGSVGAAT
                                                                   
CCDS13 PMATTCTSTAPASLSSTTKSGTAVTEKTAEDKPSSHDVKTDTLAEDKPGPGPFSDQSEPA
             2550      2560      2570      2580      2590      2600

>>CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16              (2897 aa)
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       :.:: ::..: .:.:.:.: ::::.. .. . .::. . ... .   :  :.  ::.: .
CCDS76 MTDP-MMDFF-DDANLFGETLEGLSDDAFVQPGPVS-LVDELNLGAEFEPLHIDSLNHVQ
                 10        20        30         40        50       

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pF1KE9 TNQNQTKLTHFDHYNQYEQQKMHLMDQPNRMMSNTPGNGLASPHSQYHTPPV-PQVPHGG
        . .. :.: :.. ::... :.: ..:      ..:.. . :::::..  :. ::     
CCDS76 GTPTHQKMTDFEQLNQFDSIKFHHVNQS----FGSPAEHVLSPHSQFNCSPIHPQ-----
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         .   :..: ..         :.: ::: . :. . .:  .:..::             
CCDS76 --NQPNGLFPDVS---------DGSPMWGHQTATTISNQNGSPFHQQ-------------
        110                120       130       140                 

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           :: . :.:  :..:. ::..    .:. :      ::  .... ::..:.:.. :.
CCDS76 ----GHSHSMHQNKSFVAHHDFALFQANEQQTQCTSLRSQQNRNNLNPGQNSLSQSKNFM
              150       160       170       180       190       200

       230         240       250         260       270       280   
pF1KE9 ATSGPG--HLSHVPQQSPSMAPSLRHSVQQFHH--HPSTALHGESVAHSPRFSPNPPQQG
        .:::   ...: ::.. .   .   :.::: .  .::. .:  : .:         :.:
CCDS76 NVSGPHRVNVNHPPQMTNASNSQQSISMQQFSQTSNPSAHFHKCS-SH---------QEG
              210       220       230       240                 250

           290       300       310       320       330       340   
pF1KE9 AVRPQTLNFSSRSQTVPSPTINNSGQYSRYPYSNLNQGLVNNTGMNQNLGLTNNTPMNQS
              ::.. : .. : ...:: :.: . :: .... .. ... :. ..  ..  ::.
CCDS76 -------NFNGPSPNMTSCSVSNSQQFSSH-YS-FSSNHISPNSLLQSSAVLASNHTNQT
                     260       270         280       290       300 

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pF1KE9 VPRYPNAVGFPSNSG-QGLMHQQPIHPSGSLNQMNTQTMHPSQPQGTYASPPPMSPMKAM
       .  . .. .:  . : .    :. ..:. :::. : : .: :.:::.: :   .::.. :
CCDS76 LSDFTGSNSFSPHRGIKQESTQHILNPNTSLNSNNFQILHSSHPQGNY-SNSKLSPVH-M
             310       320       330       340        350          

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       . :               :.. :.  .: : . .:   ....  ..:.  .  .:..:: 
CCDS76 NFPD--------------PVDSGT--QMGHFN-DHVETNGFSSLEENLLHQVESQTEPFT
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pF1KE9 GMSSAPRELTGHMRPNGCPGVGLGDPQAIQERLIP--GQQHPGQQPSFQQLPTCPPLQPH
       :..  :..:                   .:: :.:   ..  ::. : . :      :  
CCDS76 GLD--PEDL-------------------LQEGLLPHFDESTFGQDNSSHILDHDLDRQF-
                                 410       420       430       440 

              530       540       550       560       570       580
pF1KE9 PGLHHQSSPPHPHHQPWAQLHPSPQNTPQKVPVHQHSPSEPFLEKPVPDMTQVSGPNAQL
           :  . :    :   : .    ..  .   : :. ..  :..  :.  . .: ..  
CCDS76 --TSHLVTRPSDMAQTQLQSQARSWHSSFSNHQHLHDRNHLCLQRQPPSSKKSDGSGTYT
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pF1KE9 VKSDDYLPSIEQQPQQKK-----KKKKNNHIVAEDPSKG--FGKDDFPGGVDNQELNRNS
         ..  .  . .. :.::     :..: :.:..:  .:.   :. ..:  .. ...   :
CCDS76 KLQNTQVRVMSEKKQRKKVESESKQEKANRIISEAIAKAKERGERNIPRVMSPENFPTAS
      500       510       520       530       540       550        

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pF1KE9 LDGSQEEKKKKKRSKAKKDPKEPKEPKEKKEPKEPKTPKAPKIPKEPKEKKAKTATPKPK
       ..:..:.: .. .::                            ::.   ::.::      
CCDS76 VEGKEEKKGRRMKSK----------------------------PKDKDSKKTKTC-----
      560       570                                   580          

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pF1KE9 SSKKSSNKKPDSEASALKKKVNKGKTEGS-ENSDLDKTPPPSPPPEEDEDPGVQKRRSSR
        :: . . :  .   .: :: .: :.:.: : :: .. :  .    .:.:   :::::.:
CCDS76 -SKLKEKTKIGKLIITLGKK-QKRKNESSDEISDAEQMPQHT---LKDQDS--QKRRSNR
          590       600        610       620          630          

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pF1KE9 QVKRKRYTEDLEFKISDEEADDADAAGRDS-PSNTSQSEQ---QESVDAEGPVVEKIMSS
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CCDS76 QIKRKKYAEDIEGKQSEEEVKGSMKIKKNSAPLPGEQPLQLFVENPSEEDAAIVDKILSS
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pF1KE9 RSVKKQKESGEEVEIEEFYVKYKNFSYLHCQWASIEDLEKDKRIQQKIKRFKAKQGQN-K
       :.:::.   :  .. :::.:::::.:::::.::. :.: ::::::::::::: .:.:  .
CCDS76 RTVKKEISPGVMIDTEEFFVKYKNYSYLHCEWATEEQLLKDKRIQQKIKRFKLRQAQRAH
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       :....:.: ::::::::::... .   : : :::: .:::::::::::::::: ..:.: 
CCDS76 FFADMEEEPFNPDYVEVDRVLEVSFCEDKDTGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDL
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       :::::::.:.. .:.:.:..:::.. ::: ..::.:::.:.::::::::.::::::::: 
CCDS76 AKIEEFEQLQASRPDTRRLDRPPSNIWKKIDQSRDYKNGNQLREYQLEGLNWLLFNWYNR
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       :::::::::::::::::::::::: : ::.::::.::::::: ::::::::::..:::::
CCDS76 RNCILADEMGLGKTIQSITFLYEILLTGIRGPFLIIAPLSTIANWEREFRTWTDINVVVY
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       :::  ::. :: :::::.: :::.:.:.:.:.::::::::::  : ::  : ::::.:::
CCDS76 HGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYRFQAIITTFEMILGGCGELNAIEWRCVIIDE
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CCDS76 AHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPLRFPSESTFMQEF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNF
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       .:::::.::.:::::.::::::::::::::::.::::::: ::..:.:  . ::.:::::
CCDS76 SFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKGAEEKILGEFRDTYNPAASDFHLQAMI
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       :.:::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::..:: ::::::::::::::
CCDS76 QSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIHKRYLYERIDGRVRGNLRQ
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS76 AAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQN
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pF1KE9 KSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRENATNGVQQLSKKEIEDLLRK
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CCDS76 KAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSGRESNVGGIQQLSKKEIEDLLRR
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       :::::.:.:::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS76 GAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITIESEGRGSTFAKASFVASGNRTDISLD
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pF1KE9 DPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNNLVIDTPRVRKQTRLYSAVKEDELMEFSDLESDSEEK
       :::::::::::::.::.:..:::.:::::::.::::: .::.: ::: :.:. ::...::
CCDS76 DPNFWQKWAKKAEIDIEAISGRNSLVIDTPRIRKQTRPFSATK-DELAELSEAESEGDEK
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pF1KE9 PCAKPRRPQDKSQGYARSECFRVEKNLLVYGWGRWTDILSHGRYKRQLTEQDVETICRTI
       :  : ::: :.:.::.:.::::::::::::::::: .::::::.::::.:.::: :::..
CCDS76 P--KLRRPCDRSNGYGRTECFRVEKNLLVYGWGRWREILSHGRFKRQLNEHDVEIICRAL
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pF1KE9 LVYCLNHYKGDENIKSFIWDLITPTADGQTRALVNHSGLSAPVPRGRKGKKVKAQSTQPV
       :.::: ::.:::.::.::::::::: ::::: : :: ::::::::::::::::.:...  
CCDS76 LAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTRELQNHLGLSAPVPRGRKGKKVKTQTSSFD
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pF1KE9 VQDADWLASCNPDALFQEDSYKKHLKHHCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQADKILEGADS
       .: :.:: . ::. :.:...::::.:::::::::::::::::.:::::.. .:...:.:.
CCDS76 IQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHIKHHCNKVLLRVRMLYYLKQEVIGNECQKVFDGVDA
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pF1KE9 SEADVWIPEPFHAEVPADWWDKEADKSLLIGVFKHGYEKYNSMRADPALCFLERVGMPDA
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CCDS76 SDIDVWVPEPDHSEVPAEWWDFDADKSLLIGVFKHGYEKYNTIRADPALCFLERVGKPDE
        1660      1670      1680      1690      1700      1710     

       1830      1840      1850      1860      1870      1880      
pF1KE9 KAIAAEQRGTDMLADGGDGGEFDREDEDPEYKPTRTPFKDEIDEFANSPSEDKEESMEIH
       ::.:::::..:.. ::        . :::::::. . :::.:.. ..::..     .   
CCDS76 KAVAAEQRANDYM-DG--------DVEDPEYKPAPAIFKDDIEDDVSSPGD----LVIAD
        1720       1730              1740      1750          1760  

       1890      1900      1910      1920      1930       1940     
pF1KE9 ATGKHSESNAELGQLYWPNTSTLTTRLRRLITAYQRSYKRQQMRQ-EALMKTDRRRRRPR
       . :.  :..    ..:::. :.::::::::::::::. : .:..: .  ...     .: 
CCDS76 GDGQLMEGD----KVYWPTQSALTTRLRRLITAYQRTNKNRQIQQIQPTFSVPTSVMQPI
           1770          1780      1790      1800      1810        

        1950      1960      1970      1980      1990      2000     
pF1KE9 EEVRALEAEREAIISEKRQKWTRREEADFYRVVSTFGVIFDPVKQQFDWNQFRAFARLDK
        :  .:. .  : : :..:.::::::::::::::::::.::: . ::::..:::.::: :
CCDS76 YEEATLNPKMAAKI-ERQQRWTRREEADFYRVVSTFGVVFDPDRGQFDWTKFRAMARLHK
     1820      1830       1840      1850      1860      1870       

        2010      2020      2030      2040      2050      2060     
pF1KE9 KSDESLEKYFSCFVAMCRRVCRMPVKPDDEPPDLSSIIEPITEERASRTLYRIELLRKIR
       :.:.:::::.  :..:::::::.: : .   :..  .:.:::::::::::::::::::.:
CCDS76 KTDDSLEKYLYAFMSMCRRVCRLPSKEELVDPNI--FIQPITEERASRTLYRIELLRKVR
      1880      1890      1900      1910        1920      1930     

        2070      2080      2090      2100      2110      2120     
pF1KE9 EQVLHHPQLGERLKLCQPSLDLPEWWECGRHDRDLLVGAAKHGVSRTDYHILNDPELSFL
       ::.:.:::: ::::::.:. ::: ::::: ::::::.::::::::::::::: ::::::.
CCDS76 EQALRHPQLFERLKLCHPNPDLPVWWECGPHDRDLLIGAAKHGVSRTDYHILRDPELSFM
        1940      1950      1960      1970      1980      1990     

        2130      2140                          2150      2160     
pF1KE9 DAHKNFAQNRGAGNTSSL------------NPL--------AVGFVQTPPVISSAHIQDE
        :..:..:.. : . .:             .::        : :..     ..: ....:
CCDS76 AAQRNYSQSKMAHSRTSTPLLQQYQVALSASPLTSLPRLLDAKGIILEEMKVKSENLKEE
        2000      2010      2020      2030      2040      2050     

                      2170                                     2180
pF1KE9 --------------RVLEQAE-------------------GKVE----------EP--EN
                     :.: ..:                   :: :          ::   :
CCDS76 PQSSEEESMSSVETRTLIKSEPVSPKNGVLPQATGDQKSGGKCETDRRMVAARTEPLTPN
        2060      2070      2080      2090      2100      2110     

                2190      2200      2210      2220      2230       
pF1KE9 PAAKE---KCEGKEEEEETDGSGKESKQECEAEASSVKNELKGVEVGADTGSKS----IS
       ::.:.   . .:.:   ..:.....:.   .. .:: ..  .  . :....:.:     :
CCDS76 PASKKPRVHKRGSESSSDSDSDSERSSCSSRSSSSSSSSSCSHSRSGSSSSSSSSCSSAS
        2120      2130      2140      2150      2160      2170     

          2240      2250      2260           2270      2280        
pF1KE9 EKGSEEDEEEKLEDDDKSEESSQPEAGAVSRG-----KNFDEESNASMSTARDETRDGFY
        ..:      .  ....::::.. :  : .:      : .:::: ::.::..:::.:.: 
CCDS76 SSSSSSTSSSSSSSSSSSEESDSDEEEAQKRESTTHMKAYDEESVASLSTTQDETQDSFQ
        2180      2190      2200      2210      2220      2230     

     2290      2300       2310      2320      2330      2340       
pF1KE9 MEDGDPSVAQLLHE-RTFAFSFWPKDRVMINRLDNICEAVLKGKWPVNRRQMFDFQGLIP
       :..: :  : .:.    .: :.::::::::::::.::..:::::::  ::. .: . .  
CCDS76 MNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMINRLDSICQTVLKGKWPSARRS-YDANTVAS
        2240      2250      2260      2270      2280       2290    

      2350      2360      2370      2380      2390      2400       
pF1KE9 GYTPTTVDSPLQKRSFAELSMVGQASISGSEDITTSPQLSKEDALNLSVPRQRRRRRRKI
        ::   .:::     ... :.    . . .:.   : :.::       : .. :...  .
CCDS76 FYTTKLLDSPGAATEYSDPSVPTPPGAGVKEEHDQSTQMSK-------VKKHVREKEFTV
         2300      2310      2320      2330             2340       

      2410      2420      2430          2440      2450      2460   
pF1KE9 EIEAERAAKRRNLMEMVAQLRESQVVSENG----QEKVVDLSKASREATSSTSNFSSLSS
       .:. : . :     . .:: :  .  .:.:    :. .. : . .  . .:  ::     
CCDS76 KIKDEGGLKLTFQKQGLAQKRPFD--GEDGALGQQQYLTRLRELQSASETSLVNF-----
      2350      2360      2370        2380      2390      2400     

          2470      2480      2490      2500      2510      2520   
pF1KE9 KFILPNVSTPVSDAFKTQMELLQAGLSRTPTRHLLNGSLVDGEPPMKRRRGRRKNVEGLD
           :. : :::            : :  ::    :: ..:..: .:.::::::::::.:
CCDS76 ----PK-SIPVS------------GTSIQPTLGA-NGVILDNQPIVKKRRGRRKNVEGVD
                              2410       2420      2430      2440  

          2530          2540      2550      2560      2570         
pF1KE9 LLFMSHKR----TSLSAEDAEVTKAFEEDIETPPTRNIPSPGQLDPDTRIPVINLEDGTR
       ..:.....    .::.  ..... ...  .     ..::     : .. .:::::.::::
CCDS76 IFFFNRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYTQPQGIP-----DTESPVPVINLKDGTR
           2450      2460      2470      2480           2490       

    2580      2590      2600      2610      2620      2630         
pF1KE9 LVGEDAPKNKDLVEWLKLHPTYTVDMPSYVPKNADVLFSSFQKPKQKRHRCRNPNKLDIN
       :.:.:::: ::: .::: :: :. :. ...:.    .     .:::::::::::::::.:
CCDS76 LAGDDAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPR----MQLHEGRPKQKRHRCRNPNKLDVN
      2500      2510      2520          2530      2540      2550   

    2640      2650      2660      2670      2680      2690         
pF1KE9 TLTGEERVPVVNKRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEENPEFAVAPDWTDIVKQSGFVPESM
       .::::::: ..:.::..:.:::.:::.::: :.:.:: :..:::.: :.::::::.::::
CCDS76 SLTGEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGVAPEWGDVVKQSGFLPESM
          2560      2570      2580      2590      2600      2610   

    2700      2710      2720      2730       2740      2750        
pF1KE9 FDRLLTGPVVRGEGASRRGRRPKSEIARAAAAAAAVASTS-GINPLLVNSLFAGMDLTSL
       ..:.::::::: : .::::::::: ::.:.:::::...:: . ::::.:.:. :.:::.:
CCDS76 YERILTGPVVR-EEVSRRGRRPKSGIAKATAAAAAASATSVSGNPLLANGLLPGVDLTTL
          2620       2630      2640      2650      2660      2670  

         2760       2770      2780      2790      2800      2810   
pF1KE9 Q----NLQNLQSLQL-AGLMGFPPGLATAATAGGDAKNPAAVLPLMLPGMAGLPNVFGLG
       :    :::::::::. :::::.: :: .    ::.::: ::..:..: :::::::..:.:
CCDS76 QALQQNLQNLQSLQVTAGLMGMPTGLPS----GGEAKNMAAMFPMLLSGMAGLPNLLGMG
           2680      2690      2700          2710      2720        

          2820      2830      2840      2850      2860      2870   
pF1KE9 GLLNNPLSAATGNTTTASSQGEPEDSTSKGEEKGNENEDENKDSEKSTDAVSAADSANGS
       :::..:  ..: .   ..:. : : .: . : ...::  ::        .::.. :....
CCDS76 GLLTKPTESGTEDKKGSDSK-ESEGKTERTESQSSENGGEN--------SVSSSPSTSST
     2730      2740       2750      2760              2770         

          2880      2890      2900      2910      2920      2930   
pF1KE9 VGAATAPAGLPSNPLAFNPFLLSTMAPGLFYPSMFLPPGLGGLTLPGFPALAGLQNAVGS
       ..  :: :   .::::.::.:::..    .::.:.: :::. : .: .      :. . .
CCDS76 AALNTAAA---ANPLALNPLLLSNI----LYPGMLLTPGLN-LHIPTLS-----QSNTFD
    2780         2790      2800          2810       2820           

          2940      2950      2960        2970       2980      2990
pF1KE9 SEEKAADKAEGGPFKDGETLEGSDAEESLDK--TAESSLLEDEIAQG-EELDSLDGGDEI
        ..: .: . .   .  :  : :  ... ::  :  : : :.   .: :. :. .:.:  
CCDS76 VQNKNSDLGSSKSVEVKE--EDSRIKDQEDKGGTEPSPLNENSTDEGSEKADASSGSDST
       2830      2840        2850      2860      2870      2880    

                    
pF1KE9 ENNENDE      
        .. .:       
CCDS76 SSSSEDSDSSNED
         2890       

>>CCDS83299.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8               (948 aa)
 initn: 4325 init1: 4183 opt: 4183  Z-score: 1858.6  bits: 356.9 E(32554): 3.3e-97
Smith-Waterman score: 4183; 100.0% identity (100.0% similar) in 572 aa overlap (1-572:1-572)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE9 MADPGMMSLFGEDGNIFSEGLEGLGECGYPENPVNPMGQQMPIDQGFASLQPSLHHPSTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MADPGMMSLFGEDGNIFSEGLEGLGECGYPENPVNPMGQQMPIDQGFASLQPSLHHPSTN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 QNQTKLTHFDHYNQYEQQKMHLMDQPNRMMSNTPGNGLASPHSQYHTPPVPQVPHGGSGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QNQTKLTHFDHYNQYEQQKMHLMDQPNRMMSNTPGNGLASPHSQYHTPPVPQVPHGGSGG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE9 GQMGVYPGMQNERHGQSFVDSSSMWGPRAVQVPDQIRAPYQQQQPQPQPPQPAPSGPPAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GQMGVYPGMQNERHGQSFVDSSSMWGPRAVQVPDQIRAPYQQQQPQPQPPQPAPSGPPAQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE9 GHPQHMQQMGSYMARGDFSMQQHGQPQQRMSQFSQGQEGLNQGNPFIATSGPGHLSHVPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GHPQHMQQMGSYMARGDFSMQQHGQPQQRMSQFSQGQEGLNQGNPFIATSGPGHLSHVPQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE9 QSPSMAPSLRHSVQQFHHHPSTALHGESVAHSPRFSPNPPQQGAVRPQTLNFSSRSQTVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QSPSMAPSLRHSVQQFHHHPSTALHGESVAHSPRFSPNPPQQGAVRPQTLNFSSRSQTVP
              250       260       270       280       290       300

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pF1KE9 SPTINNSGQYSRYPYSNLNQGLVNNTGMNQNLGLTNNTPMNQSVPRYPNAVGFPSNSGQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SPTINNSGQYSRYPYSNLNQGLVNNTGMNQNLGLTNNTPMNQSVPRYPNAVGFPSNSGQG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE9 LMHQQPIHPSGSLNQMNTQTMHPSQPQGTYASPPPMSPMKAMSNPAGTPPPQVRPGSAGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LMHQQPIHPSGSLNQMNTQTMHPSQPQGTYASPPPMSPMKAMSNPAGTPPPQVRPGSAGI
              370       380       390       400       410       420

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pF1KE9 PMEVGSYPNMPHPQPSHQPPGAMGIGQRNMGPRNMQQSRPFIGMSSAPRELTGHMRPNGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PMEVGSYPNMPHPQPSHQPPGAMGIGQRNMGPRNMQQSRPFIGMSSAPRELTGHMRPNGC
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE9 PGVGLGDPQAIQERLIPGQQHPGQQPSFQQLPTCPPLQPHPGLHHQSSPPHPHHQPWAQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PGVGLGDPQAIQERLIPGQQHPGQQPSFQQLPTCPPLQPHPGLHHQSSPPHPHHQPWAQL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE9 HPSPQNTPQKVPVHQHSPSEPFLEKPVPDMTQVSGPNAQLVKSDDYLPSIEQQPQQKKKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::                            
CCDS83 HPSPQNTPQKVPVHQHSPSEPFLEKPVPDMTQKPKQKRHRCRNPNKLDINTLTGEERVPV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE9 KKNNHIVAEDPSKGFGKDDFPGGVDNQELNRNSLDGSQEEKKKKKRSKAKKDPKEPKEPK
                                                                   
CCDS83 VNKRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEENPEFAVAPDWTDIVKQSGFVPESMFDRLLTGPVV
              610       620       630       640       650       660

>--
 initn: 2461 init1: 2461 opt: 2461  Z-score: 1101.6  bits: 216.9 E(32554): 4.9e-55
Smith-Waterman score: 2461; 100.0% identity (100.0% similar) in 376 aa overlap (2622-2997:573-948)

            2600      2610      2620      2630      2640      2650 
pF1KE9 VEWLKLHPTYTVDMPSYVPKNADVLFSSFQKPKQKRHRCRNPNKLDINTLTGEERVPVVN
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SPQNTPQKVPVHQHSPSEPFLEKPVPDMTQKPKQKRHRCRNPNKLDINTLTGEERVPVVN
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            2660      2670      2680      2690      2700      2710 
pF1KE9 KRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEENPEFAVAPDWTDIVKQSGFVPESMFDRLLTGPVVRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEENPEFAVAPDWTDIVKQSGFVPESMFDRLLTGPVVRG
            610       620       630       640       650       660  

            2720      2730      2740      2750      2760      2770 
pF1KE9 EGASRRGRRPKSEIARAAAAAAAVASTSGINPLLVNSLFAGMDLTSLQNLQNLQSLQLAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EGASRRGRRPKSEIARAAAAAAAVASTSGINPLLVNSLFAGMDLTSLQNLQNLQSLQLAG
            670       680       690       700       710       720  

            2780      2790      2800      2810      2820      2830 
pF1KE9 LMGFPPGLATAATAGGDAKNPAAVLPLMLPGMAGLPNVFGLGGLLNNPLSAATGNTTTAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LMGFPPGLATAATAGGDAKNPAAVLPLMLPGMAGLPNVFGLGGLLNNPLSAATGNTTTAS
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            2840      2850      2860      2870      2880      2890 
pF1KE9 SQGEPEDSTSKGEEKGNENEDENKDSEKSTDAVSAADSANGSVGAATAPAGLPSNPLAFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SQGEPEDSTSKGEEKGNENEDENKDSEKSTDAVSAADSANGSVGAATAPAGLPSNPLAFN
            790       800       810       820       830       840  

            2900      2910      2920      2930      2940      2950 
pF1KE9 PFLLSTMAPGLFYPSMFLPPGLGGLTLPGFPALAGLQNAVGSSEEKAADKAEGGPFKDGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PFLLSTMAPGLFYPSMFLPPGLGGLTLPGFPALAGLQNAVGSSEEKAADKAEGGPFKDGE
            850       860       870       880       890       900  

            2960      2970      2980      2990       
pF1KE9 TLEGSDAEESLDKTAESSLLEDEIAQGEELDSLDGGDEIENNENDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TLEGSDAEESLDKTAESSLLEDEIAQGEELDSLDGGDEIENNENDE
            910       920       930       940        

>>CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12               (1905 aa)
 initn: 1696 init1: 630 opt: 1655  Z-score: 742.9  bits: 151.5 E(32554): 4.7e-35
Smith-Waterman score: 1834; 38.1% identity (63.9% similar) in 969 aa overlap (825-1686:535-1481)

          800       810       820       830       840       850    
pF1KE9 VDAEGPVVEKIMSSRSVKKQKESGEEVEIEEFYVKYKNFSYLHCQWASIEDLEKDKRI--
                                     .:.::....:: ::.:.:  .::   ..  
CCDS76 QPPSPTPVPRPPDADPNTPSPKPLEGRPERQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMF
          510       520       530       540       550       560    

                             860       870           880       890 
pF1KE9 ---QQKI--------------KRFKAKQGQNKFLSEIEDELF----NPDYVEVDRIMDFA
          :.:               .. . .....  ..:.:....    .:... . ::..  
CCDS76 RNYQRKNDMDEPPSGDFGGDEEKSRKRKNKDPKFAEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILN--
          570       580       590       600       610       620    

             900       910       920           930            940  
pF1KE9 RSTDDRGEPVTHYLVKWCSLPYEDSTWERR----QDIDQAKIEEFE--KLMSRE---P--
       .:.: .:.  .:::.:: .:::....:: .    :: :  :   ..  .::  :   :  
CCDS76 HSVDKKGH--VHYLIKWRDLPYDQASWESEDVEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGRPGK
            630         640       650       660       670       680

                       950       960         970       980         
pF1KE9 -----ETERVERPP----ADDWKKSESSREYKN--NNKLREYQLEGVNWLLFNWYNMRNC
            . ...::::    .:   : : . :: .  .. :. ::.::.::: :.: .  . 
CCDS76 KLKKVKLRKLERPPETPTVDPTVKYERQPEYLDATGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDT
              690       700       710       720       730       740

     990      1000      1010       1020      1030       1040       
pF1KE9 ILADEMGLGKTIQSITFLYEIYLKG-IHGPFLVIAPLSTIPNWEREFRTWT-ELNVVVYH
       :::::::::::.:. .::: .: .:  .::::: :::::: ::::::. :. .. ::.: 
CCDS76 ILADEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHSKGPFLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDMYVVTYV
              750       760       770       780       790       800

      1050      1060             1070       1080      1090         
pF1KE9 GSQASRRTIQLYEMYFKD-------PQGRVIK-GSYKFHAIITTFEMILTDCPELRNIPW
       :.. ::  :.  :. :.:         .:. : .: :::...:..:.:  :   : .: :
CCDS76 GDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKEASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDW
              810       820       830       840       850       860

    1100      1110      1120      1130      1140      1150         
pF1KE9 RCVVIDEAHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSRFPSE
        :...:::::::: . :... :. ..:.::.:::::::::..:::: ::.:: : :: . 
CCDS76 ACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNL
              870       880       890       900       910       920

    1160      1170      1180      1190      1200      1210         
pF1KE9 TTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETIIEVELTNIQKKYYR
         :..::.:.  :.:..::. .: : :::::: :: ::.  : : :..:::. .:::::.
CCDS76 EGFLEEFADIAKEDQIKKLHDMLGPHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYK
              930       940       950       960       970       980

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pF1KE9 AILEKNFTFLS-KGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEEFKETHNAESP
        :: .::  :. .:::  :  .:::..:.:.::::::::.  :    .:  :  ..    
CCDS76 YILTRNFEALNARGGG--NQVSLLNVVMDLKKCCNHPYLFPVA---AMEAPKMPNGM---
              990        1000      1010      1020         1030     

     1280      1290      1300      1310      1320      1330        
pF1KE9 DFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYPYERIDG
        .. .:.:.:.:::.:..:.: .:: :::::::::::.. ::.:::.: .. : ::::::
CCDS76 -YDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDG
            1040      1050      1060      1070      1080      1090 

     1340      1350      1360      1370      1380      1390        
pF1KE9 RVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQA
        . ::.:: :::::. : ...: ::: ::::::::::..::: ::.::::::.::.:: .
CCDS76 GITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFS
            1100      1110      1120      1130      1140      1150 

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pF1KE9 RCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRENATNGVQQLSKK
       : :::::.:.: :::..:: : :... . :. :. : . :..   : ....     .::.
CCDS76 RAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVRPGLGSKTGS-----MSKQ
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pF1KE9 EIEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDID-----------QILLRRTHTITIESEGKG-
       :..:.:. :.   . ::  .:.   .:  :           . :: :..  : ..: .: 
CCDS76 ELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGM
       1210      1220      1230      1240      1250      1260      

           1510          1520              1530      1540      1550
pF1KE9 ----STFAKASFVAS----GNRTDISLD--------DPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNN
           :.:  :..:.     :.. ..  .        ::..:.:  ..   . .   .:: 
CCDS76 NEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARN-
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pF1KE9 LVIDTPRVRKQTRLYSAVKEDELME--FSDLESD----SEE------KPCAKPRRPQDKS
        .    :.:::.   .. .::.  .   :: .::    :::      .    ::::. :.
CCDS76 -LGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKG
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pF1KE9 QGYARSECF-----RVEKNLLVYGWG-RWTDILSHGRYKRQLTEQDVET---ICRTILVY
           ... .     ::  :. : :.. :    . .. ..  .  ::. :   . : .   
CCDS76 LRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGK
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pF1KE9 CLNHYKGDENIKSFIWDLITPTADG-QTRAL-VNHSGLSAPVPRGRKGKKVKAQSTQPVV
         ...:.   .. :.  :  : ::: .: :  : . :::                     
CCDS76 SEKEFKA--YVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEF
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      1710      1720      1730      1740      1750      1760       
pF1KE9 QDADWLASCNPDALFQEDSYKKHLKHHCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQADKILEGADSS
                                                                   
CCDS76 EHVNGRWSMPELAEVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPVPPAEDGIKIEEN
           1510      1520      1530      1540      1550      1560  

>>CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12                (1912 aa)
 initn: 1813 init1: 630 opt: 1655  Z-score: 742.9  bits: 151.5 E(32554): 4.7e-35
Smith-Waterman score: 1834; 38.1% identity (63.9% similar) in 969 aa overlap (825-1686:542-1488)

          800       810       820       830       840       850    
pF1KE9 VDAEGPVVEKIMSSRSVKKQKESGEEVEIEEFYVKYKNFSYLHCQWASIEDLEKDKRI--
                                     .:.::....:: ::.:.:  .::   ..  
CCDS85 QPPSPTPVPRPPDADPNTPSPKPLEGRPERQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMF
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                             860       870           880       890 
pF1KE9 ---QQKI--------------KRFKAKQGQNKFLSEIEDELF----NPDYVEVDRIMDFA
          :.:               .. . .....  ..:.:....    .:... . ::..  
CCDS85 RNYQRKNDMDEPPSGDFGGDEEKSRKRKNKDPKFAEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILN--
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             900       910       920           930            940  
pF1KE9 RSTDDRGEPVTHYLVKWCSLPYEDSTWERR----QDIDQAKIEEFE--KLMSRE---P--
       .:.: .:.  .:::.:: .:::....:: .    :: :  :   ..  .::  :   :  
CCDS85 HSVDKKGH--VHYLIKWRDLPYDQASWESEDVEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGRPGK
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pF1KE9 -----ETERVERPP----ADDWKKSESSREYKN--NNKLREYQLEGVNWLLFNWYNMRNC
            . ...::::    .:   : : . :: .  .. :. ::.::.::: :.: .  . 
CCDS85 KLKKVKLRKLERPPETPTVDPTVKYERQPEYLDATGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDT
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     990      1000      1010       1020      1030       1040       
pF1KE9 ILADEMGLGKTIQSITFLYEIYLKG-IHGPFLVIAPLSTIPNWEREFRTWT-ELNVVVYH
       :::::::::::.:. .::: .: .:  .::::: :::::: ::::::. :. .. ::.: 
CCDS85 ILADEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHSKGPFLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDMYVVTYV
       750       760       770       780       790       800       

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pF1KE9 GSQASRRTIQLYEMYFKD-------PQGRVIK-GSYKFHAIITTFEMILTDCPELRNIPW
       :.. ::  :.  :. :.:         .:. : .: :::...:..:.:  :   : .: :
CCDS85 GDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKEASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDW
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pF1KE9 RCVVIDEAHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSRFPSE
        :...:::::::: . :... :. ..:.::.:::::::::..:::: ::.:: : :: . 
CCDS85 ACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNL
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pF1KE9 TTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETIIEVELTNIQKKYYR
         :..::.:.  :.:..::. .: : :::::: :: ::.  : : :..:::. .:::::.
CCDS85 EGFLEEFADIAKEDQIKKLHDMLGPHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYK
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pF1KE9 AILEKNFTFLS-KGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEEFKETHNAESP
        :: .::  :. .:::  :  .:::..:.:.::::::::.  :    .:  :  ..    
CCDS85 YILTRNFEALNARGGG--NQVSLLNVVMDLKKCCNHPYLFPVA---AMEAPKMPNGM---
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pF1KE9 DFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYPYERIDG
        .. .:.:.:.:::.:..:.: .:: :::::::::::.. ::.:::.: .. : ::::::
CCDS85 -YDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDG
     1040      1050      1060      1070      1080      1090        

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pF1KE9 RVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQA
        . ::.:: :::::. : ...: ::: ::::::::::..::: ::.::::::.::.:: .
CCDS85 GITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFS
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pF1KE9 RCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRENATNGVQQLSKK
       : :::::.:.: :::..:: : :... . :. :. : . :..   : ....     .::.
CCDS85 RAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVRPGLGSKTGS-----MSKQ
     1160      1170      1180      1190      1200           1210   

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pF1KE9 EIEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDID-----------QILLRRTHTITIESEGKG-
       :..:.:. :.   . ::  .:.   .:  :           . :: :..  : ..: .: 
CCDS85 ELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGM
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pF1KE9 ----STFAKASFVAS----GNRTDISLD--------DPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNN
           :.:  :..:.     :.. ..  .        ::..:.:  ..   . .   .:: 
CCDS85 NEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARN-
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pF1KE9 LVIDTPRVRKQTRLYSAVKEDELME--FSDLESD----SEE------KPCAKPRRPQDKS
        .    :.:::.   .. .::.  .   :: .::    :::      .    ::::. :.
CCDS85 -LGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKG
            1340      1350      1360      1370      1380      1390 

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pF1KE9 QGYARSECF-----RVEKNLLVYGWG-RWTDILSHGRYKRQLTEQDVET---ICRTILVY
           ... .     ::  :. : :.. :    . .. ..  .  ::. :   . : .   
CCDS85 LRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGK
            1400      1410      1420      1430      1440      1450 

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pF1KE9 CLNHYKGDENIKSFIWDLITPTADG-QTRAL-VNHSGLSAPVPRGRKGKKVKAQSTQPVV
         ...:.   .. :.  :  : ::: .: :  : . :::                     
CCDS85 SEKEFKA--YVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEF
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pF1KE9 QDADWLASCNPDALFQEDSYKKHLKHHCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQADKILEGADSS
                                                                   
CCDS85 EHVNGRWSMPELAEVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPVPPAEDGIKIEEN
    1510      1520      1530      1540      1550      1560         

>>CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17               (1966 aa)
 initn: 1664 init1: 610 opt: 1633  Z-score: 733.0  bits: 149.7 E(32554): 1.7e-34
Smith-Waterman score: 1809; 38.4% identity (62.4% similar) in 963 aa overlap (825-1686:549-1484)

          800       810       820       830       840              
pF1KE9 VDAEGPVVEKIMSSRSVKKQKESGEEVEIEEFYVKYKNFSYLHCQWASIEDLE-----KD
                                     ::.::. ..:: ::.::.  .::       
CCDS32 EPPVAVPAPQQADGNPDVPPPRPLQGRSEREFFVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMY
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     850                       860       870           880         
pF1KE9 KRIQQKIK----------------RFKAKQGQNKFLSEIEDELF----NPDYVEVDRIMD
       .  :.:                  .   .. ..   .:.:.. .    .:... : ::..
CCDS32 RNYQRKNDMDEPPPLDYGSGEDDGKSDKRKVKDPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIIN
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CCDS32 --HSVDKKGN--YHYLVKWRDLPYDQSTWEE----DEMNIPEYEEHKQSYWRHRELIMGE
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       .:   :  .          ::.    :   : :.. ..   ... :. :::::.::: :.
CCDS32 DPAQPRKYKKKKKELQGDGPPSSPTNDPTVKYETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFS
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       . ::.: :.. ::  :.  :. :.:   .  : ..:        ::...:..:.:  :  
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       : :: .   :..::.:.. :.:..::. .: : :::::: :: ::.  : : :..:::. 
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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