Result of FASTA (ccds) for pF1KF0068
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KF0068, 1191 aa
  1>>>pF1KF0068 1191 - 1191 aa - 1191 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6390+/-0.000878; mu= 12.7009+/- 0.053
 mean_var=154.0333+/-31.238, 0's: 0 Z-trim(111.8): 48  B-trim: 123 in 1/51
 Lambda= 0.103340
 statistics sampled from 12645 (12691) to 12645 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.39), width:  16
 Scan time:  6.460

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32466.1 PLEKHG4 gene_id:25894|Hs108|chr16      (1191) 8084 1217.9       0
CCDS45512.1 PLEKHG4 gene_id:25894|Hs108|chr16      (1110) 6740 1017.5       0
CCDS34124.1 PLEKHG4B gene_id:153478|Hs108|chr5     (1271) 1390 219.9 3.1e-56
CCDS32041.1 ARHGEF40 gene_id:55701|Hs108|chr14     (1519) 1180 188.7 9.5e-47
CCDS33467.1 KIAA1755 gene_id:85449|Hs108|chr20     (1200)  659 110.9 1.9e-23
CCDS3883.1 TRIO gene_id:7204|Hs108|chr5            (3097)  654 110.5 6.7e-23
CCDS3028.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3           (1289)  630 106.6   4e-22
CCDS82829.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3          (1654)  608 103.4 4.7e-21
CCDS3027.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3           (1663)  608 103.4 4.8e-21
CCDS81782.1 MCF2L gene_id:23263|Hs108|chr13        ( 984)  560 96.1 4.5e-19
CCDS9527.3 MCF2L gene_id:23263|Hs108|chr13         (1123)  560 96.1   5e-19
CCDS45070.2 MCF2L gene_id:23263|Hs108|chr13        (1125)  560 96.1   5e-19
CCDS8947.1 ARHGEF25 gene_id:115557|Hs108|chr12     ( 580)  507 88.0 7.1e-17
CCDS44931.1 ARHGEF25 gene_id:115557|Hs108|chr12    ( 619)  507 88.1 7.5e-17
CCDS55515.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX           ( 860)  507 88.2 9.7e-17
CCDS14667.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX           ( 925)  507 88.2   1e-16
CCDS48175.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX           ( 985)  507 88.2 1.1e-16
CCDS55514.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX           ( 821)  464 81.7 7.9e-15
CCDS55516.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX           ( 941)  464 81.8 8.8e-15
CCDS55517.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX           (1001)  464 81.8 9.3e-15


>>CCDS32466.1 PLEKHG4 gene_id:25894|Hs108|chr16           (1191 aa)
 initn: 8084 init1: 8084 opt: 8084  Z-score: 6517.1  bits: 1217.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8084; 100.0% identity (100.0% similar) in 1191 aa overlap (1-1191:1-1191)

               10        20        30        40        50        60
pF1KF0 MERPLENGDESPDSQGHATDWRFAVCSFRDAWEEEEPASQMHVKDPGPPRPPAGATQDEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MERPLENGDESPDSQGHATDWRFAVCSFRDAWEEEEPASQMHVKDPGPPRPPAGATQDEE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KF0 LQGSPLSRKFQLPPAADESGDAQRGTVESSSVLSEGPGPSGVESLLCPMSSHLSLAQGES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LQGSPLSRKFQLPPAADESGDAQRGTVESSSVLSEGPGPSGVESLLCPMSSHLSLAQGES
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KF0 DTPGVGLVGDPGPSRAMPSGLSPGALDSDPVGLGDPLSEISKLLEAAPSGSGLPKPADCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DTPGVGLVGDPGPSRAMPSGLSPGALDSDPVGLGDPLSEISKLLEAAPSGSGLPKPADCL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KF0 LAQDLCWELLASGMATLPGTRDVQGRAVLLLCAHSPAWLQSECSSQELIRLLLYLRSIPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LAQDLCWELLASGMATLPGTRDVQGRAVLLLCAHSPAWLQSECSSQELIRLLLYLRSIPR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KF0 PEVQALGLTVLVDARICAPSSSLFSGLSQLQEAAPGAVYQVLLVGSTLLKEVPSGLQLEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PEVQALGLTVLVDARICAPSSSLFSGLSQLQEAAPGAVYQVLLVGSTLLKEVPSGLQLEQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KF0 LPSQSLLTHIPTAGLPTSLGGGLPYCHQAWLDFRRRLEALLQNCQAACALLQGAIESVKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LPSQSLLTHIPTAGLPTSLGGGLPYCHQAWLDFRRRLEALLQNCQAACALLQGAIESVKA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KF0 VPQPMEPGEVGQLLQQTEVLMQQVLDSPWLAWLQCQGGRELTWLKQEVPEVTLSPDYRTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPQPMEPGEVGQLLQQTEVLMQQVLDSPWLAWLQCQGGRELTWLKQEVPEVTLSPDYRTA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KF0 MDKADELYDRVDGLLHQLTLQSNQRIQALELVQTLEARESGLHQIEVWLQQVGWPALEEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDKADELYDRVDGLLHQLTLQSNQRIQALELVQTLEARESGLHQIEVWLQQVGWPALEEA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KF0 GEPSLDMLLQAQGSFQELYQVAQEQVRQGEKFLQPLTGWEAAELDPPGARFLALRAQLTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GEPSLDMLLQAQGSFQELYQVAQEQVRQGEKFLQPLTGWEAAELDPPGARFLALRAQLTE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KF0 FSRALAQRCQRLADAERLFQLFREALTWAEEGQRVLAELEQERPGVVLQQLQLHWTRHPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FSRALAQRCQRLADAERLFQLFREALTWAEEGQRVLAELEQERPGVVLQQLQLHWTRHPD
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KF0 LPPAHFRKMWALATGLGSEAIRQECRWAWARCQDTWLALDQKLEASLKLPPVGSTASLCV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LPPAHFRKMWALATGLGSEAIRQECRWAWARCQDTWLALDQKLEASLKLPPVGSTASLCV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KF0 SQVPAAPAHPPLRKAYSFDRNLGQSLSEPACHCHHAATIAACRRPEAGGGALPQASPTVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SQVPAAPAHPPLRKAYSFDRNLGQSLSEPACHCHHAATIAACRRPEAGGGALPQASPTVP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KF0 PPGSSDPRSLNRLQLVLAEMVATEREYVRALEYTMENYFPELDRPDVPQGLRGQRAHLFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PPGSSDPRSLNRLQLVLAEMVATEREYVRALEYTMENYFPELDRPDVPQGLRGQRAHLFG
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KF0 NLEKLRDFHCHFFLRELEACTRHPPRVAYAFLRHRVQFGMYALYSKNKPRSDALMSSYGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NLEKLRDFHCHFFLRELEACTRHPPRVAYAFLRHRVQFGMYALYSKNKPRSDALMSSYGH
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KF0 TFFKDKQQALGDHLDLASYLLKPIQRMGKYALLLQELARACGGPTQELSALREAQSLVHF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TFFKDKQQALGDHLDLASYLLKPIQRMGKYALLLQELARACGGPTQELSALREAQSLVHF
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KF0 QLRHGNDLLAMDAIQGCDVNLKEQGQLVRQDEFVVRTGRHKSVRRIFLFEELLLFSKPRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QLRHGNDLLAMDAIQGCDVNLKEQGQLVRQDEFVVRTGRHKSVRRIFLFEELLLFSKPRH
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KF0 GPTGVDTFAYKRSFKMADLGLTECCGNSNLRFEIWFRRRKARDTFVLQASSLAIKQAWTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GPTGVDTFAYKRSFKMADLGLTECCGNSNLRFEIWFRRRKARDTFVLQASSLAIKQAWTA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KF0 DISHLLWRQAVHNKEVRMAEMVSMGVGNKAFRDIAPSEEAINDRTVNYVLKCREVRSRAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DISHLLWRQAVHNKEVRMAEMVSMGVGNKAFRDIAPSEEAINDRTVNYVLKCREVRSRAS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KF0 IAVAPFDHDSLYLGASNSLPGDPASCSVLGSLNLHLYRDPALLGLRCPLYPSFPEEAALE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IAVAPFDHDSLYLGASNSLPGDPASCSVLGSLNLHLYRDPALLGLRCPLYPSFPEEAALE
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190 
pF1KF0 AEAELGGQPSLTAEDSEISSQCPSASGSSGSDSSCVSGQALGRGLEDLPCV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AEAELGGQPSLTAEDSEISSQCPSASGSSGSDSSCVSGQALGRGLEDLPCV
             1150      1160      1170      1180      1190 

>>CCDS45512.1 PLEKHG4 gene_id:25894|Hs108|chr16           (1110 aa)
 initn: 6716 init1: 6716 opt: 6740  Z-score: 5434.6  bits: 1017.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7355; 93.2% identity (93.2% similar) in 1191 aa overlap (1-1191:1-1110)

               10        20        30        40        50        60
pF1KF0 MERPLENGDESPDSQGHATDWRFAVCSFRDAWEEEEPASQMHVKDPGPPRPPAGATQDEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MERPLENGDESPDSQGHATDWRFAVCSFRDAWEEEEPASQMHVKDPGPPRPPAGATQDEE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KF0 LQGSPLSRKFQLPPAADESGDAQRGTVESSSVLSEGPGPSGVESLLCPMSSHLSLAQGES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  
CCDS45 LQGSPLSRKFQLPPAADESGDAQRGTVESSSVLSEGPGPSGVESLLCPMSSHLSLAQG--
               70        80        90       100       110          

              130       140       150       160       170       180
pF1KF0 DTPGVGLVGDPGPSRAMPSGLSPGALDSDPVGLGDPLSEISKLLEAAPSGSGLPKPADCL
                                                                   
CCDS45 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              190       200       210       220       230       240
pF1KF0 LAQDLCWELLASGMATLPGTRDVQGRAVLLLCAHSPAWLQSECSSQELIRLLLYLRSIPR
                          :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 -------------------TRDVQGRAVLLLCAHSPAWLQSECSSQELIRLLLYLRSIPR
                         120       130       140       150         

              250       260       270       280       290       300
pF1KF0 PEVQALGLTVLVDARICAPSSSLFSGLSQLQEAAPGAVYQVLLVGSTLLKEVPSGLQLEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PEVQALGLTVLVDARICAPSSSLFSGLSQLQEAAPGAVYQVLLVGSTLLKEVPSGLQLEQ
     160       170       180       190       200       210         

              310       320       330       340       350       360
pF1KF0 LPSQSLLTHIPTAGLPTSLGGGLPYCHQAWLDFRRRLEALLQNCQAACALLQGAIESVKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LPSQSLLTHIPTAGLPTSLGGGLPYCHQAWLDFRRRLEALLQNCQAACALLQGAIESVKA
     220       230       240       250       260       270         

              370       380       390       400       410       420
pF1KF0 VPQPMEPGEVGQLLQQTEVLMQQVLDSPWLAWLQCQGGRELTWLKQEVPEVTLSPDYRTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VPQPMEPGEVGQLLQQTEVLMQQVLDSPWLAWLQCQGGRELTWLKQEVPEVTLSPDYRTA
     280       290       300       310       320       330         

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pF1KF0 MDKADELYDRVDGLLHQLTLQSNQRIQALELVQTLEARESGLHQIEVWLQQVGWPALEEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MDKADELYDRVDGLLHQLTLQSNQRIQALELVQTLEARESGLHQIEVWLQQVGWPALEEA
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pF1KF0 GEPSLDMLLQAQGSFQELYQVAQEQVRQGEKFLQPLTGWEAAELDPPGARFLALRAQLTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GEPSLDMLLQAQGSFQELYQVAQEQVRQGEKFLQPLTGWEAAELDPPGARFLALRAQLTE
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pF1KF0 FSRALAQRCQRLADAERLFQLFREALTWAEEGQRVLAELEQERPGVVLQQLQLHWTRHPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FSRALAQRCQRLADAERLFQLFREALTWAEEGQRVLAELEQERPGVVLQQLQLHWTRHPD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LPPAHFRKMWALATGLGSEAIRQECRWAWARCQDTWLALDQKLEASLKLPPVGSTASLCV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SQVPAAPAHPPLRKAYSFDRNLGQSLSEPACHCHHAATIAACRRPEAGGGALPQASPTVP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PPGSSDPRSLNRLQLVLAEMVATEREYVRALEYTMENYFPELDRPDVPQGLRGQRAHLFG
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pF1KF0 NLEKLRDFHCHFFLRELEACTRHPPRVAYAFLRHRVQFGMYALYSKNKPRSDALMSSYGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NLEKLRDFHCHFFLRELEACTRHPPRVAYAFLRHRVQFGMYALYSKNKPRSDALMSSYGH
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pF1KF0 TFFKDKQQALGDHLDLASYLLKPIQRMGKYALLLQELARACGGPTQELSALREAQSLVHF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TFFKDKQQALGDHLDLASYLLKPIQRMGKYALLLQELARACGGPTQELSALREAQSLVHF
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pF1KF0 QLRHGNDLLAMDAIQGCDVNLKEQGQLVRQDEFVVRTGRHKSVRRIFLFEELLLFSKPRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QLRHGNDLLAMDAIQGCDVNLKEQGQLVRQDEFVVRTGRHKSVRRIFLFEELLLFSKPRH
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pF1KF0 GPTGVDTFAYKRSFKMADLGLTECCGNSNLRFEIWFRRRKARDTFVLQASSLAIKQAWTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GPTGVDTFAYKRSFKMADLGLTECCGNSNLRFEIWFRRRKARDTFVLQASSLAIKQAWTA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DISHLLWRQAVHNKEVRMAEMVSMGVGNKAFRDIAPSEEAINDRTVNYVLKCREVRSRAS
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pF1KF0 IAVAPFDHDSLYLGASNSLPGDPASCSVLGSLNLHLYRDPALLGLRCPLYPSFPEEAALE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IAVAPFDHDSLYLGASNSLPGDPASCSVLGSLNLHLYRDPALLGLRCPLYPSFPEEAALE
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pF1KF0 AEAELGGQPSLTAEDSEISSQCPSASGSSGSDSSCVSGQALGRGLEDLPCV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AEAELGGQPSLTAEDSEISSQCPSASGSSGSDSSCVSGQALGRGLEDLPCV
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>>CCDS34124.1 PLEKHG4B gene_id:153478|Hs108|chr5          (1271 aa)
 initn: 2012 init1: 668 opt: 1390  Z-score: 1123.1  bits: 219.9 E(32554): 3.1e-56
Smith-Waterman score: 2011; 36.3% identity (59.2% similar) in 1223 aa overlap (62-1151:53-1256)

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pF1KF0 WEEEEPASQMHVKDPGPPRPPAGATQDEELQGSPLSRKFQLPPAADESGDAQRGTVESSS
                                     : .:  .: .  :.    : : :   . : 
CCDS34 SSLTGASRDLGTGAVASGTQEETSGPRGDPQQTPSLEKERHTPSRTGPGAAGRTLPRRSR
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pF1KF0 VLSEGPGPS-GVESLLCPMSSHLSLAQ------GES-DTPGVGLVGDPGPSRAMPSGLSP
          ..:  : :...  :  : : . ..      :..  ::.   :  :: ..      : 
CCDS34 SWERAPRSSRGAQAAACHTSHHSAGSRPGGHLGGQAVGTPNCVPVEGPGCTKEEDVLASS
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pF1KF0 GALDSD--------PVGLGD-PLSEISKLLEAAPSGSG-LPK--PADCLLAQDLCWELLA
       . ...:        : : .: :  .     :. : :.: .:.  : . :   :.  ::: 
CCDS34 ACVSTDGGSLHCHNPSGPSDVPARQPHPEQEGWPPGTGDFPSQVPKQVL---DVSQELLQ
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pF1KF0 SGMATLPGTRDVQGRAVLLLCAHSPAWLQSECSSQELIRLLLYLRSIPRPEVQALGLTVL
       ::..::::::: .::::. . ..:  : . . :  :: :::::..:::: ::. :::.::
CCDS34 SGVVTLPGTRDRHGRAVVQVRTRSLLWTREHSSCAELTRLLLYFHSIPRKEVRDLGLVVL
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pF1KF0 VDARICAPSSSLFSGLSQLQEAAPGAVYQVLLV---GSTLLKEVPSGLQLEQLPS-QSLL
       ::::    . .. ..:: ::. .   ....::.    :..  .  . .: : . : ... 
CCDS34 VDARRSPAAPAVSQALSGLQNNTSPIIHSILLLVDKESAFRPDKDAIIQCEVVSSLKAVH
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pF1KF0 THIPTAGLPTSLGGGLPYCHQAWLDFRRRLEALLQNCQAACALLQGAIESVKAVPQPMEP
         . .  : ..: :..:: :  :. ::.::: .  ::. :  .::... :...   :   
CCDS34 KFVDSCQLTADLDGSFPYSHGDWICFRQRLEHFAANCEEAIIFLQNSFCSLNTHRTPRTA
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       370       380       390       400       410       420       
pF1KF0 GEVGQLLQQTEVLMQQVLDSPWLAWLQCQGGRELTWLKQEVPEVTLSPDYRTAMDKADEL
        ::..:..: :..:. ::..: :. :. .::  :. :..:  :.  . : : ... :  :
CCDS34 QEVAELIDQHETMMKLVLEDPLLVSLRLEGGTVLARLRRE--ELG-TEDSRDTLEAATSL
     380       390       400       410         420        430      

       430       440       450       460       470       480       
pF1KF0 YDRVDGLLHQLTLQSNQRIQALELVQTLEARESGLHQIEVWLQQVGWPALEEAGEPSLDM
       :::::  .:.:.: ::.:.: :: .. : .   :  :      : :    .:  . . .:
CCDS34 YDRVDEEVHRLVLTSNNRLQQLEHLRELASLLEGNDQQSC---QKGLQLAKENPQRTEEM
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pF1KF0 LLQAQGSFQELYQVAQEQVRQGE--------KFLQPLTGWEAAELDP-------------
       . . . ... .  :.: . :.::        .. . ...:  . :::             
CCDS34 VQDFRRGLSAV--VSQAECREGELARWTRSSELCETVSSW-MGPLDPEACPSSPVAECLR
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pF1KF0 --------------PGARFLALRAQLTEFSRALAQRCQRLADAERLFQLFREALTWAEEG
                     :::   .:. .      :  :         ::   ..:::. :   
CCDS34 SCHQEATSVAAEAFPGAGVAVLKPHALGKPWASQQDLWLQYPQTRLR--LEEALSEAAPD
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            580       590          600        610          620     
pF1KF0 QRVLAELEQERPGVVLQQLQLHWTRH---PDLPPAHFRK-MWALA---TGLGSEAIRQEC
          :  : :  :    .. :    ::   :..: .      :  :   .:: ..:.   :
CCDS34 PS-LPPLAQSPPK--HERAQEAMRRHQKPPSFPSTDSGGGAWEPAQPLSGLPGRAL--LC
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pF1KF0 RWAWARCQDTWLALDQKLEASLKLPPVGST------ASLCVSQ----VPAAP-AHPP---
              .    :: . :     :: .:.:      .: : :.    . . :  ::    
CCDS34 GQDGETLRPGLCALWDPLSLLRGLPGAGATTAHLEDSSACSSEPTQTLASRPRKHPQKKM
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pF1KF0 LRKAYSFDRNLGQSLSEPACHCHHAA----------TIAACRR-P---EAGGGALPQA--
       ..:. ::.    .:  . .:.  :..          :.:. .. :   .: .  . :.  
CCDS34 IKKTQSFEIPQPDSGPRDSCQPDHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARSPPVTQSRS
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pF1KF0 --SPTVPPPGSSDPRSL---NRLQLVLAEMVATEREYVRALEYTMENYFPELDRPDVPQG
         ::.   :.  : :.    .::. ..:::.::::::.: : :...:::::..: :.:::
CCDS34 LSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSRLRHIMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEMERMDLPQG
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pF1KF0 LRGQRAHLFGNLEKLRDFHCHFFLRELEACTRHPPRVAYAFLRHRVQFGMYALYSKNKPR
       :::..  .:::::::.::: . :::::: : . :  :. .::::. :::::..::::::.
CCDS34 LRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKNKPQ
           850       860       870       880       890       900   

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pF1KF0 SDALMSSYGHTFFKDKQQALGDHLDLASYLLKPIQRMGKYALLLQELAR--ACG-GPTQE
       ::::.::.:..::::::. :::..:::::::.:.::..:::::::.: .  .:: .  ::
CCDS34 SDALLSSHGNAFFKDKQRELGDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEASCGLAQGQE
           910       920       930       940       950       960   

       890       900       910       920       930       940       
pF1KF0 LSALREAQSLVHFQLRHGNDLLAMDAIQGCDVNLKEQGQLVRQDEFVVRTGRHKSVRRIF
       :. :: :. .: :::::::::::::::.::::::::::::  .:::.:  ::.: .:..:
CCDS34 LGELRAAEVVVCFQLRHGNDLLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIVCCGRKKYLRHVF
           970       980       990      1000      1010      1020   

       950       960       970       980       990       1000      
pF1KF0 LFEELLLFSKPRHGPTGVDTFAYKRSFKMADLGLTECCGNSNLRFEIWFRRR-KARDTFV
       :::.:.:::: ..   . :.. ::.::: :..:.::  :.:.:::::::::: :..::..
CCDS34 LFEDLILFSKTQKVEGSHDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWFRRRRKSQDTYI
          1030      1040      1050      1060      1070      1080   

       1010      1020      1030      1040      1050                
pF1KF0 LQASSLAIKQAWTADISHLLWRQAVHNKEVRMAEMVSMGVGNKAFRDIAP----------
       :::::  .:.:::  :...:::::....:.:. ::.:::.::. : :. :          
CCDS34 LQASSAEVKSAWTDVIGRILWRQALKSRELRIQEMASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDCAVI
          1090      1100      1110      1120      1130      1140   

       1060           1070      1080            1090      1100     
pF1KF0 SEEA-----INDRTVNYVLKCREVRSRASIAV------APFDHDSLYLGASNSLPGDPAS
       :..:     ..::. . ..:  : . :.: ::      ::: .    .. :..  ..  :
CCDS34 SDRAPKCAVMSDRVPDSIVKGTESQMRGSTAVSSSDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSSSQS
          1150      1160      1170      1180      1190      1200   

        1110      1120      1130             1140      1150        
pF1KF0 CSVLGSLNLHLYRDPALLGLRCPLYPSFP-------EEAALEAEAELGGQPSLTAEDSEI
        :.::::.: .  .::  ::  : .  .        ::   : : : : : ..       
CCDS34 SSILGSLGLLVSSSPAHPGLWSPAHSPWSSDIRACVEEDEPEPELETGTQAAVCEGAPAV
          1210      1220      1230      1240      1250      1260   

     1160      1170      1180      1190 
pF1KF0 SSQCPSASGSSGSDSSCVSGQALGRGLEDLPCV
                                        
CCDS34 LLSRTRQA                         
          1270                          

>>CCDS32041.1 ARHGEF40 gene_id:55701|Hs108|chr14          (1519 aa)
 initn: 1054 init1: 627 opt: 1180  Z-score: 952.8  bits: 188.7 E(32554): 9.5e-47
Smith-Waterman score: 1452; 32.5% identity (57.0% similar) in 1138 aa overlap (46-1108:369-1444)

          20        30        40        50         60         70   
pF1KF0 GHATDWRFAVCSFRDAWEEEEPASQMHVKDPGPPRPPA-GATQDEELQG-SPLSRKFQLP
                                     :: ::  . :  . ..  : . :::  .  
CCDS32 EAVGEASGSCPLRPGELRGGGGGGQGAEGPPGTPRRTGKGNRRKKRAAGRGALSRGGDSA
      340       350       360       370       380       390        

            80        90       100       110         120       130 
pF1KF0 PAADESGDAQRGTVESSSVLSEGPGPSGVESLLCPMSSHLSLAQG--ESDTPGVGLVGDP
       : .   :: . .. . .  :.. :.::  .   : . ..   ..:  ::.   .  .:. 
CCDS32 PLS--PGDKEDASHQEA--LGNLPSPSEHKLPECHLVKEEYEGSGKPESEPKELKTAGEK
      400         410         420       430       440       450    

             140        150                  160        170        
pF1KF0 GPSRAMPSGLSP-GALDSDPVGLG-----------DPLSEI-SKLLEAAPSGSGLPKPAD
        :. .   : .  :: . .  : :            :::.  .  ::..  :.:   : .
CCDS32 EPQLSEACGPTEEGAGERELEGPGLLCMAGHTGPEGPLSDTPTPPLETVQEGKGDNIPEE
          460       470       480       490       500       510    

      180            190       200       210       220       230   
pF1KF0 CLLAQ-----DLCWELLASGMATLPGTRDVQGRAVLLLCAHSPAWLQSECSSQELIRLLL
        : ..     :. :.:.:::.  : :  : .:::.: .    :   .   : . :   : 
CCDS32 ALAVSVSDHPDVAWDLMASGFLILTGGVDQSGRALLTITPPCPPE-EPPPSRDTLNTTLH
          520       530       540       550        560       570   

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pF1KF0 YLRSIPRPEVQALGLTVLVDARICAP-SSSLFSGLSQLQEAAPGAVYQVLLVGSTLLKEV
       ::.:. ::..:.:::.::.: :   :   .:. .:::::...   . : ::.   .  ..
CCDS32 YLHSLLRPDLQTLGLSVLLDLRQAPPLPPALIPALSQLQDSGDPPLVQRLLI--LIHDDL
           580       590       600       610       620         630 

               300       310        320       330       340        
pF1KF0 PS---GLQLEQLPSQSLLTHIPTAG-LPTSLGGGLPYCHQAWLDFRRRLEALLQNCQAAC
       :.   :.:  .. :.. : ..     :   :::      . :.......  : . ::.. 
CCDS32 PTELCGFQGAEVLSENDLKRVAKPEELQWELGGHRDPSPSHWVEIHQEVVRLCRLCQGVL
             640       650       660       670       680       690 

      350       360       370       380       390       400        
pF1KF0 ALLQGAIESVKAVPQPMEPGEVGQLLQQTEVLMQQVLDSPWLAWLQCQGGRELTWLKQEV
       . .. ::: .... .: :   ::  . .    .:.:: .: :. :: .::  :  :..  
CCDS32 GSVRQAIEELEGAAEPEEEEAVG--MPKP---LQKVLADPRLTALQRDGGAILMRLRS--
             700       710            720       730       740      

      410       420       430       440       450       460        
pF1KF0 PEVTLSPDYRTAMDKADELYDRVDGLLHQLTLQSNQRIQALELVQTLEARESGLHQIEVW
            .:. .   .    ::..::  .:::.  :: ..:  :  : :.     :.:.  :
CCDS32 -----TPSSKLEGQGPATLYQEVDEAIHQLVRLSNLHVQQQEQRQCLRR----LQQVLQW
               750       760       770       780           790     

      470       480         490       500       510       520      
pF1KF0 LQQVGWPALEEAGEP--SLDMLLQAQGSFQELYQVAQEQVRQGEKFLQPLTGWEAAELDP
       :.  :   :   . :  .:. : ...  :. .   .::.. :... :       : : . 
CCDS32 LSGPGEEQLASFAMPGDTLSALQETELRFRAFSAEVQERLAQAREAL-------ALEENA
         800       810       820       830       840               

        530       540       550       560       570       580      
pF1KF0 PGARFLALRAQLTEFSRALAQRCQRLADAERLFQLFREALTWAEEGQRVLAELEQERPG-
        . . : .      : . : :  . :  : :: ..:..:  :..::   .:.:    :: 
CCDS32 TSQKVLDI------FEQRLEQVESGLHRALRLQRFFQQAHEWVDEG---FARLAGAGPGR
      850             860       870       880          890         

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pF1KF0 -VVLQQLQLHWTRHPDLPPAHFRKMWALATGLGSEAIRQECRWAWARCQDTWLALDQKL-
        .::  : :.  : :.   . :..: :::  ::: :  .:     ::::.    ..:.. 
CCDS32 EAVLAALALR--RAPEPSAGTFQEMRALALDLGSPAALREWGRCQARCQELERRIQQHVG
     900         910       920       930       940       950       

                             650         660          670       680
pF1KF0 -EASLKL-----------------P--PVGSTASLCVSQVPA---APAHPPLRKAYSFDR
        ::: .                  :  :  : .:: . . :.   ::.:  :       .
CCDS32 EEASPRGYRRRRADGASSGGAQWGPRSPSPSLSSLLLPSSPGPRPAPSHCSLAPCGEDYE
       960       970       980       990      1000      1010       

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pF1KF0 NLGQSLSEPACHCHHAATIA-------------ACRRPEA---GGGALPQASPTVPPPGS
       . :  :.  :      :..              .:   :    : .  :..   :  :  
CCDS32 EEGPELAPEAEGRPPRAVLIRGLEVTSTEVVDRTCSPREHVLLGRARGPDGPWGVGTPRM
      1020      1030      1040      1050      1060      1070       

          730       740       750       760       770       780    
pF1KF0 SDPRSLNRLQLVLAEMVATEREYVRALEYTMENYFPELDRPDVPQGLRGQRAHLFGNLEK
          ::..  : ...:..: :..:: .:   .    :::    .:. :::  :  ..  :.
CCDS32 ERKRSISAQQRLVSELIACEQDYVATLSEPVPPPGPEL----TPE-LRGTWAAALSARER
      1080      1090      1100      1110           1120      1130  

          790       800       810       820       830       840    
pF1KF0 LRDFHCHFFLRELEACTRHPPRVAYAFLRHRVQFGMYALYSKNKPRSDALMSSYGHTFFK
       ::.::   :::::..:. :: :..  ::::  ::..:: : :.. . .  ... .  . :
CCDS32 LRSFHRTHFLRELQGCATHPLRIGACFLRHGDQFSLYAQYVKHRHKLENGLAALS-PLSK
           1140      1150      1160      1170      1180       1190 

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pF1KF0 DKQQALGDHLDLASYLLKPIQRMGKYALLLQELARACGGP--TQELSALREAQSLVHFQL
        ...: : .:  :  : .:.... .:. ::.:: :  .::  ..:  ::  : .:.. : 
CCDS32 GSMEA-GPYLPRA--LQQPLEQLTRYGRLLEELLRE-AGPELSSECRALGAAVQLLREQE
             1200        1210      1220       1230      1240       

            910       920       930       940       950       960  
pF1KF0 RHGNDLLAMDAIQGCDVNLKEQGQLVRQDEFVVRTGRHKSVRRIFLFEELLLFSKPRHGP
        .: ::::..:..::...:::::::...: :.:  ::.: .:..::::.:::::: . ::
CCDS32 ARGRDLLAVEAVRGCEIDLKEQGQLLHRDPFTVICGRKKCLRHVFLFEHLLLFSKLK-GP
      1250      1260      1270      1280      1290      1300       

             970       980       990      1000      1010      1020 
pF1KF0 TG-VDTFAYKRSFKMADLGLTECCGNSNLRFEIWFRRRKARDTFVLQASSLAIKQAWTAD
        :  . :.::..:: ::.::::  :.:.: ::.:::::.::....:::.:  ::  ::..
CCDS32 EGGSEMFVYKQAFKTADMGLTENIGDSGLCFELWFRRRRAREAYTLQATSPEIKLKWTSS
       1310      1320      1330      1340      1350      1360      

            1030      1040      1050      1060      1070      1080 
pF1KF0 ISHLLWRQAVHNKEVRMAEMVSMGVGNKAFRDIAPSEEAINDRTVNYVLKCREVRSRASI
       :..::::::.::::.:. .:::::.::: : ::    .:...::.. .:  : .:.:::.
CCDS32 IAQLLWRQAAHNKELRVQQMVSMGIGNKPFLDI----KALGERTLSALLTGRAARTRASV
       1370      1380      1390          1400      1410      1420  

            1090      1100       1110      1120      1130      1140
pF1KF0 AVAPFDHDSLYLGASNSLPG-DPASCSVLGSLNLHLYRDPALLGLRCPLYPSFPEEAALE
       ::. :.:      :. :::: .:..::.                                
CCDS32 AVSSFEH------AGPSLPGLSPGACSLPARVEEEAWDLDVKQISLAPETLDSSGDVSPG
                 1430      1440      1450      1460      1470      

>>CCDS33467.1 KIAA1755 gene_id:85449|Hs108|chr20          (1200 aa)
 initn: 615 init1: 345 opt: 659  Z-score: 534.5  bits: 110.9 E(32554): 1.9e-23
Smith-Waterman score: 709; 29.2% identity (54.2% similar) in 709 aa overlap (37-687:407-1081)

         10        20        30        40             50           
pF1KF0 NGDESPDSQGHATDWRFAVCSFRDAWEEEEPASQMHVKDPGP-----PR--P--PAGATQ
                                     : ...... :::     ::  :  ::.:..
CCDS33 LEDALDCASGLRAGVSQEPAASKMQGPLGNPENMVQLR-PGPRQASSPRLSPASPAAAAS
        380       390       400       410        420       430     

        60        70             80                        90      
pF1KF0 DEELQGSPLSRKFQLP-----PAADESGDAQ----------RG------TVESSSVLSEG
       . ... .   :. .::     :. . :.             ::      : :..:.  .:
CCDS33 ETKIEVKTKERNGRLPKPMPCPSRNTSSPEPPTPGLKFSFLRGQRQPSVTPEKASLQHNG
         440       450       460       470       480       490     

        100       110       120       130       140       150      
pF1KF0 PGPSGVESLLCPMSSHLSLAQGESDTPGVGLVGDPGPSRAMPSGLSPGALDSDPVGLGDP
       :      ..:: . :            :.  .   ::. : :: :.        .. :.:
CCDS33 PW-----KVLCSLYSPKPNRAKSLGKAGTTQTKTSGPATA-PSPLTEEKAALPEASAGSP
              500       510       520       530        540         

        160       170       180       190       200       210      
pF1KF0 LSEISKLLEAAPSGSGLPKPADCLLAQDLCWELLASGMATLPGTRDVQGRAVLLLCAHSP
         : .  ::  : :   :.:        :  ... : .: ::: ::  :: .::. .   
CCDS33 --ERGPTLEEEPPG---PEPR----IGALGVKVFRSRIACLPGGRDRAGRPLLLVSTTEG
       550       560              570       580       590       600

        220       230       240       250       260       270      
pF1KF0 AWLQSECSSQELIRLLLYLRSIPRPEVQALGLTVLVDARICAPSSSLFSGLSQLQEAAPG
       ::    :. .:. .:: :: .::::: .: ::.::.:::   :. .: :.:.  :  .:.
CCDS33 AWEAPWCTVSEVTKLLSYLCTIPRPEDKAKGLAVLIDARRQPPQPGLVSALQATQAQVPA
              610       620       630       640       650       660

        280           290       300        310       320       330 
pF1KF0 AVYQVLLVG----STLLKEVPSGLQLEQLPSQSLLTH-IPTAGLPTSLGGGLPYCHQAWL
       ..  .:..:    .  :. .:. .:.: : : . :.: .  . ::. : : .::::  :.
CCDS33 SIRAILFLGEKEAALQLQTLPD-VQVEVLTSLKALSHHVDPSQLPAVLEGPFPYCHTEWV
              670       680        690       700       710         

             340       350       360       370       380       390 
pF1KF0 DFRRRLEALLQNCQAACALLQGAIESVKAVPQPMEPGEVGQLLQQTEVLMQQVLDSPWLA
        : ..:. .: . . : .:::..::  . .  :    :. . :.... ::. :: .: : 
CCDS33 HFFQKLDPFLADLHQASSLLQASIEEFEKADPPGGMQEATRCLSKSKELMEAVLRDPGLL
     720       730       740       750       760       770         

             400       410       420       430       440       450 
pF1KF0 WLQCQGGRELTWLKQEVPEVTLSPDYRTAMDKADELYDRVDGLLHQLTLQSNQRIQALEL
        :: .::  :. :.... .. .::: :. .  :  ::. ::  :: :.  ::. .  :::
CCDS33 GLQREGGATLARLQHDASRLDFSPDVRSHLAAATALYSLVDEQLHVLVTASNSLLGKLEL
     780       790       800       810       820       830         

             460       470         480       490       500         
pF1KF0 VQTLEARESGLHQIEVWLQQVGWPALEE--AGEPSLDMLLQAQGSFQELYQVAQEQVRQG
          :   :...::.  :..: :   :.     . ::. . .:.. :....  :  : :.:
CCDS33 RVRLGRLEAAIHQVSDWMEQEGRRCLQSLTPKDGSLETVEKAHAEFENFFLQAAAQYRRG
     840       850       860       870       880       890         

     510            520           530           540       550      
pF1KF0 EKFLQPL-----TGWEAAELD----PPGARFL----ALRAQLTEFSRALAQRCQRLADAE
        .. .       :.  :.: .    :  : :     :..:.::.:  : :.: :: .: :
CCDS33 LELSKQAAQLGATARGAGEAERAEFPELAAFASTQRAFQAELTHFYMA-AER-QR-TDLE
     900       910       920       930       940        950        

        560         570        580         590          600        
pF1KF0 RLFQLFR--EALTWAE-EGQRVLAELEQERPGVVL--QQLQLHWTRH---PDLPPAHFRK
        :..: :  . .:: . . : ..:.:. .. . :   .: .::   .    ..:  ..  
CCDS33 TLLHLHRFCKRMTWFHMDCQDLMAQLRLDKTSRVSPGDQRRLHRYLQRLASEFPAEKLAA
        960       970       980       990      1000      1010      

      610       620       630       640       650       660        
pF1KF0 MWALATGLGSEAIRQECRWAWARCQDTWLALDQKLEASLKLPPVGSTASLCVSQVPAAPA
       .   ...:.  .. ::  :  :: .   . .   :: .:       : : :  ..::: .
CCDS33 VGLQVASLSRAGLGQEL-WEEARIRHEEIRM--LLEKAL-------THSSC-PEAPAAHS
       1020      1030       1040        1050              1060     

      670       680       690       700       710       720        
pF1KF0 HPPLRKAYSFDRNLGQSLSEPACHCHHAATIAACRRPEAGGGALPQASPTVPPPGSSDPR
         : :.. .     ::..:                                         
CCDS33 ARPERRGVA---AKGQGVSVEVTSKGRWDQPPLDSLGMDHLPKSYWPPGPPRGEQNRTFQ
        1070         1080      1090      1100      1110      1120  

>>CCDS3883.1 TRIO gene_id:7204|Hs108|chr5                 (3097 aa)
 initn: 897 init1: 507 opt: 654  Z-score: 524.6  bits: 110.5 E(32554): 6.7e-23
Smith-Waterman score: 654; 35.9% identity (66.0% similar) in 309 aa overlap (729-1029:1966-2273)

      700       710       720       730       740       750        
pF1KF0 IAACRRPEAGGGALPQASPTVPPPGSSDPRSLNRLQLVLAEMVATEREYVRALEYTMENY
                                     ::.: . :: :.: :::.::: : :..:.:
CCDS38 DSSSPSFNPSDNSLLSSSSPIDEMEERKSSSLKRRHYVLQELVETERDYVRDLGYVVEGY
        1940      1950      1960      1970      1980      1990     

      760       770       780       790       800       810        
pF1KF0 FPELDRPDVPQGLRGQRAHLFGNLEKLRDFHCHFFLRELEACTRHPPRVAYAFLRHRVQF
       .  . .  ::. ..:.   .:::.... :.:  ::: ::: : . : ...  :..:. ..
CCDS38 MALMKEDGVPDDMKGKDKIVFGNIHQIYDWHRDFFLGELEKCLEDPEKLGSLFVKHERRL
        2000      2010      2020      2030      2040      2050     

      820       830       840       850       860       870        
pF1KF0 GMYALYSKNKPRSDALMSSYGHTFFKDKQQALGDHLDLASYLLKPIQRMGKYALLLQELA
        ::  : .:::.:. ..: :  :::.: .: :: .:.:.. :.::.::. :: :::... 
CCDS38 HMYIAYCQNKPKSEHIVSEYIDTFFEDLKQRLGHRLQLTDLLIKPVQRIMKYQLLLKDFL
        2060      2070      2080      2090      2100      2110     

      880       890       900       910       920       930        
pF1KF0 RACGGPTQELSALREAQSLVHFQLRHGNDLLAMDAIQGCDVNLKEQGQLVRQDEFVVRTG
       .     . . : :..:  .. .  :. ::.. .  .:: : ..  ::.:. :: :.: : 
CCDS38 KYSKKASLDTSELERAVEVMCIVPRRCNDMMNVGRLQGFDGKIVAQGKLLLQDTFLV-TD
        2120      2130      2140      2150      2160      2170     

      940             950       960         970       980       990
pF1KF0 RHKSV------RRIFLFEELLLFSKPRHGPTGVDT--FAYKRSFKMADLGLTECCGNSNL
       .  ..      :::::::....::.:     : .   : .: :.:.. : : :   :.  
CCDS38 QDAGLLPRCRERRIFLFEQIVIFSEPLDKKKGFSMPGFLFKNSIKVSCLCLEENVENDPC
         2180      2190      2200      2210      2220      2230    

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KF0 RFEIWFRRRKARDTFVLQASSLAIKQAWTADISHLLWRQAVHNKEVRMAEMVSMGVGNKA
       .: .  :   . .::.:..:: ...:.:  .:...:  :                     
CCDS38 KFALTSRTGDVVETFILHSSSPSVRQTWIHEINQILENQRNFLNALTSPIEYQRNHSGGG
         2240      2250      2260      2270      2280      2290    

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KF0 FRDIAPSEEAINDRTVNYVLKCREVRSRASIAVAPFDHDSLYLGASNSLPGDPASCSVLG
                                                                   
CCDS38 GGGGSGGSGGGGGSGGGGAPSGGSGHSGGPSSCGGAPSTSRSRPSRIPQPVRHHPPVLVS
         2300      2310      2320      2330      2340      2350    

>--
 initn: 496 init1: 277 opt: 591  Z-score: 473.8  bits: 101.1 E(32554): 4.5e-20
Smith-Waterman score: 591; 32.8% identity (62.8% similar) in 317 aa overlap (728-1034:1288-1598)

       700       710       720       730       740       750       
pF1KF0 TIAACRRPEAGGGALPQASPTVPPPGSSDPRSLNRLQLVLAEMVATEREYVRALEYTMEN
                                     .:  : ....::.. ::. ::: :.  :..
CCDS38 SLQLDIIPASIPGSEVKLRDAAHELNEEKRKSARRKEFIMAELIQTEKAYVRDLRECMDT
      1260      1270      1280      1290      1300      1310       

       760         770       780       790       800       810     
pF1KF0 YFPELDR--PDVPQGLRGQRAHLFGNLEKLRDFHCHFFLRELEACTRHPPRVAYAFLRHR
       :. :.     ..: :. ...  .:::.... .:: ..::.:::   . :  :.. :.   
CCDS38 YLWEMTSGVEEIPPGIVNKELIIFGNMQEIYEFHNNIFLKELEKYEQLPEDVGHCFVTWA
      1320      1330      1340      1350      1360      1370       

         820       830       840       850       860       870     
pF1KF0 VQFGMYALYSKNKPRSDALMSSYGHTFFKDKQQALGDHLDLASYLLKPIQRMGKYALLLQ
        .: ::. : :::: :  :.  .. ..: . ::  :   ...:::.::.::. :: :::.
CCDS38 DKFQMYVTYCKNKPDSTQLILEHAGSYFDEIQQRHGLANSISSYLIKPVQRITKYQLLLK
      1380      1390      1400      1410      1420      1430       

         880       890       900       910       920       930     
pF1KF0 ELARACGGPTQELSALREAQSLVHFQLRHGNDLLAMDAIQGCDVNLKEQGQLVRQDEF--
       ::   :     :..   :..  :    ...:: . .. ..: : :.. ::.:. :. :  
CCDS38 ELLTCCEEGKGEIKDGLEVMLSVP---KRANDAMHLSMLEGFDENIESQGELILQESFQV
      1440      1450      1460         1470      1480      1490    

                940       950       960       970       980        
pF1KF0 -----VVRTGRHKSVRRIFLFEELLLFSKPRHGPTGVDTFAYKRSFKMADLGLTECCGNS
            ..: ::.   :..::::  :.:::  .  .: . . :: ..  ..::.::   ..
CCDS38 WDPKTLIRKGRE---RHLFLFEMSLVFSKEVKDSSGRSKYLYKSKLFTSELGVTEHVEGD
         1500         1510      1520      1530      1540      1550 

      990      1000       1010      1020      1030      1040       
pF1KF0 NLRFEIWFRRRKARDT-FVLQASSLAIKQAWTADISHLLWRQAVHNKEVRMAEMVSMGVG
         .: .:  :  . :. .::.:::.  :: :   : ... ....: :             
CCDS38 PCKFALWVGRTPTSDNKIVLKASSIENKQDWIKHIREVIQERTIHLKGALKEPIHIPKTA
            1560      1570      1580      1590      1600      1610 

      1050      1060      1070      1080      1090      1100       
pF1KF0 NKAFRDIAPSEEAINDRTVNYVLKCREVRSRASIAVAPFDHDSLYLGASNSLPGDPASCS
                                                                   
CCDS38 PATRQKGRRDGEDLDSQGDGSSQPDTISIASRTSQNTLDSDKLSGGCELTVVIHDFTACN
            1620      1630      1640      1650      1660      1670 

>>CCDS3028.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3                (1289 aa)
 initn: 586 init1: 291 opt: 630  Z-score: 510.6  bits: 106.6 E(32554): 4e-22
Smith-Waterman score: 630; 33.3% identity (64.9% similar) in 333 aa overlap (704-1029:202-531)

           680       690       700       710       720         730 
pF1KF0 KAYSFDRNLGQSLSEPACHCHHAATIAACRRPEAGGGALPQASPTVP--PPGSSDPRSLN
                                     .  ::     .: :: :  :   .  ..: 
CCDS30 VPTAADLVNAIEKLVKNKLSLEGSSYRGSLKDPAGCLNEGMAPPTPPKNPEEEQKAKALR
             180       190       200       210       220       230 

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pF1KF0 RLQLVLAEMVATEREYVRALEYTMENYFPELDRPDVPQGLRGQRAHLFGNLEKLRDFHCH
         ..:: :.: ::..::. :  ..:... ....  ::. .::.   .:::.... :.:  
CCDS30 GRMFVLNELVQTEKDYVKDLGIVVEGFMKRIEEKGVPEDMRGKDKIVFGNIHQIYDWHKD
             240       250       260       270       280       290 

             800       810       820       830       840       850 
pF1KF0 FFLRELEACTRHPPRVAYAFLRHRVQFGMYALYSKNKPRSDALMSSYGHTFFKDKQQALG
       ::: ::: : ..  :.:  :..:. .. .:. : .:::::. ... :  ..:.. .: ..
CCDS30 FFLAELEKCIQEQDRLAQLFIKHERKLHIYVWYCQNKPRSEYIVAEYD-AYFEEVKQEIN
             300       310       320       330        340       350

             860       870       880       890       900       910 
pF1KF0 DHLDLASYLLKPIQRMGKYALLLQELARACGGPTQELSALREAQSLVHFQLRHGNDLLAM
       ..: :...:.:::::. :: :::... :       : : ...:  :. .  .. ::.. .
CCDS30 QRLTLSDFLIKPIQRITKYQLLLKDFLRYSEKAGLECSDIEKAVELMCLVPKRCNDMMNL
              360       370       380       390       400       410

             920       930          940         950       960      
pF1KF0 DAIQGCDVNLKEQGQLVRQDEFVV---RTGRHKSV--RRIFLFEELLLFSKPRHGPTGVD
         .:: . .:  ::.:..:: : :    .: .. .  ::.::::....::.  .  . . 
CCDS30 GRLQGFEGTLTAQGKLLQQDTFYVIELDAGMQSRTKERRVFLFEQIVIFSELLRKGSLTP
              420       430       440       450       460       470

        970       980       990      1000      1010      1020      
pF1KF0 TFAYKRSFKMADLGLTECCGNSNLRFEIWFRRRKARDTFVLQASSLAIKQAWTADISHLL
        . .:::.::  : : :   :.  .: .  :. . :   ::::..  :.:::. ::...:
CCDS30 GYMFKRSIKMNYLVLEENVDNDPCKFALMNRETSER--VVLQAANADIQQAWVQDINQVL
              480       490       500         510       520        

       1030      1040      1050      1060      1070      1080      
pF1KF0 WRQAVHNKEVRMAEMVSMGVGNKAFRDIAPSEEAINDRTVNYVLKCREVRSRASIAVAPF
         :                                                         
CCDS30 ETQRDFLNALQSPIEYQRKERSTAVMRSQPARLPQASPRPYSSVPAGSEKPPKGSSYNPP
      530       540       550       560       570       580        

>>CCDS82829.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3               (1654 aa)
 initn: 532 init1: 292 opt: 608  Z-score: 491.4  bits: 103.4 E(32554): 4.7e-21
Smith-Waterman score: 608; 31.3% identity (59.6% similar) in 396 aa overlap (728-1108:1268-1654)

       700       710       720       730       740       750       
pF1KF0 TIAACRRPEAGGGALPQASPTVPPPGSSDPRSLNRLQLVLAEMVATEREYVRALEYTMEN
                                     .:  . ....::.. ::. ::: :.  .:.
CCDS82 DLELDIIPASLSDREVKLRDANHEVNEEKRKSARKKEFIMAELLQTEKAYVRDLHECLET
      1240      1250      1260      1270      1280      1290       

       760         770       780       790       800       810     
pF1KF0 YFPELDR--PDVPQGLRGQRAHLFGNLEKLRDFHCHFFLRELEACTRHPPRVAYAFLRHR
       :. :.     ..: :. ...  .:::.... ::: ..::.:::   . :  :.. :.   
CCDS82 YLWEMTSGVEEIPPGILNKEHIIFGNIQEIYDFHNNIFLKELEKYEQLPEDVGHCFVTWA
      1300      1310      1320      1330      1340      1350       

         820       830       840       850       860       870     
pF1KF0 VQFGMYALYSKNKPRSDALMSSYGHTFFKDKQQALGDHLDLASYLLKPIQRMGKYALLLQ
        .: ::. : :::: :. :.  .. ::: . ::  :   ...:::.::.::. :: :::.
CCDS82 DKFQMYVTYCKNKPDSNQLILEHAGTFFDEIQQRHGLANSISSYLIKPVQRITKYQLLLK
      1360      1370      1380      1390      1400      1410       

         880       890       900       910       920       930     
pF1KF0 ELARACGGPTQELSALREAQSLVHFQLRHGNDLLAMDAIQGCDVNLKEQGQLVRQDEF--
       ::   :     ::.   :..  :    ...:: . .. ..: : ::  ::.:. :: :  
CCDS82 ELLTCCEEGKGELKDGLEVMLSVP---KKANDAMHVSMLEGFDENLDVQGELILQDAFQV
      1420      1430      1440         1450      1460      1470    

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pF1KF0 -----VVRTGRHKSVRRIFLFEELLLFSKPRHGPTGVDTFAYKRSFKMADLGLTECCGNS
            ..: ::.   :..::::  :.:::  .  .:   ..:: ..  ..::.::   ..
CCDS82 WDPKSLIRKGRE---RHLFLFEISLVFSKEIKDSSGHTKYVYKNKLLTSELGVTEHVEGD
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pF1KF0 NLRFEIWFRRRKARDT-FVLQASSLAIKQAWTADISHLLWRQAVHNKEVRMAEMVSMGVG
         .: .:  :  . :.  ::.::..  :: :  .: ... .. .: : . . : ...   
CCDS82 PCKFALWSGRTPSSDNKTVLKASNIETKQEWIKNIREVIQERIIHLKGA-LKEPLQLPKT
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pF1KF0 -----NKAFRDIAPSEEAINDRTVNYVLKCREVRSRASIAVAPFDHDSLYLGASNSLPGD
            :.. :: . . .. .: . .       . ::.:  ..  :.:.  .   .  :::
CCDS82 PAKQRNNSKRDGVEDIDSQGDGSSQP--DTISIASRTSQNTVDSDKDGNLVPRWHLGPGD
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pF1KF0 PASCSVLGSLNLHLYRDPALLGLRCPLYPSFPEEAALEAEAELGGQPSLTAEDSEISSQC
       : :  :                                                      
CCDS82 PFSTYV                                                      
     1650                                                          

>>CCDS3027.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3                (1663 aa)
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pF1KF0 TIAACRRPEAGGGALPQASPTVPPPGSSDPRSLNRLQLVLAEMVATEREYVRALEYTMEN
                                     .:  . ....::.. ::. ::: :.  .:.
CCDS30 DLELDIIPASLSDREVKLRDANHEVNEEKRKSARKKEFIMAELLQTEKAYVRDLHECLET
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pF1KF0 YFPELDR--PDVPQGLRGQRAHLFGNLEKLRDFHCHFFLRELEACTRHPPRVAYAFLRHR
       :. :.     ..: :. ...  .:::.... ::: ..::.:::   . :  :.. :.   
CCDS30 YLWEMTSGVEEIPPGILNKEHIIFGNIQEIYDFHNNIFLKELEKYEQLPEDVGHCFVTWA
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pF1KF0 VQFGMYALYSKNKPRSDALMSSYGHTFFKDKQQALGDHLDLASYLLKPIQRMGKYALLLQ
        .: ::. : :::: :. :.  .. ::: . ::  :   ...:::.::.::. :: :::.
CCDS30 DKFQMYVTYCKNKPDSNQLILEHAGTFFDEIQQRHGLANSISSYLIKPVQRITKYQLLLK
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pF1KF0 ELARACGGPTQELSALREAQSLVHFQLRHGNDLLAMDAIQGCDVNLKEQGQLVRQDEF--
       ::   :     ::.   :..  :    ...:: . .. ..: : ::  ::.:. :: :  
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pF1KF0 -----VVRTGRHKSVRRIFLFEELLLFSKPRHGPTGVDTFAYKRSFKMADLGLTECCGNS
            ..: ::.   :..::::  :.:::  .  .:   ..:: ..  ..::.::   ..
CCDS30 WDPKSLIRKGRE---RHLFLFEISLVFSKEIKDSSGHTKYVYKNKLLTSELGVTEHVEGD
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pF1KF0 NLRFEIWFRRRKARDT-FVLQASSLAIKQAWTADISHLLWRQAVHNKEVRMAEMVSMGVG
         .: .:  :  . :.  ::.::..  :: :  .: ... .. .: : . . : ...   
CCDS30 PCKFALWSGRTPSSDNKTVLKASNIETKQEWIKNIREVIQERIIHLKGA-LKEPLQLPKT
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pF1KF0 -----NKAFRDIAPSEEAINDRTVNYVLKCREVRSRASIAVAPFDHDSLYLGASNSLPGD
            :.. :: . . .. .: . .       . ::.:  ..  :.:.  .   .  :::
CCDS30 PAKQRNNSKRDGVEDIDSQGDGSSQP--DTISIASRTSQNTVDSDKDGNLVPRWHLGPGD
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pF1KF0 PASCSVLGSLNLHLYRDPALLGLRCPLYPSFPEEAALEAEAELGGQPSLTAEDSEISSQC
       : :  :                                                      
CCDS30 PFSTYV                                                      
      1660                                                         

>>CCDS81782.1 MCF2L gene_id:23263|Hs108|chr13             (984 aa)
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pF1KF0 PGALDSDPVGLGDPLSEISKLLEAAPSGSGLPKPADCLLAQD---LC----WELLASGMA
                                     :   :: .. ::   ::     . : . .:
CCDS81            MTVRRLSLLCRDLWALWLLLKAGADEIMHQDIVPLCAADIQDQLKKRFA
                          10        20        30        40         

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pF1KF0 TLPGTRDVQGRAVLLLCAHSPAWLQSECSSQELIRLLLYLRSIPRPEVQALGLTVLVDAR
        : : :  .:  :. .  . ::.  ::  ..:.  .. :: :::  .  ..:. ...: :
CCDS81 YLSGGRGQDGSPVITFPDY-PAF--SEIPDKEFQNVMTYLTSIPSLQDAGIGFILVIDRR
      50        60         70          80        90       100      

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pF1KF0 ----------ICAPSSSLFSGLSQLQEAAPGAVYQVLLVGSTL------LK-EVPSGLQL
                 .   ..:. ..:. .    : . .:  :   ..      .: .::  ..:
CCDS81 RDKWTSVKASVLRIAASFPANLQLVLVLRPTGFFQRTLSDIAFKFNRDDFKMKVPV-IML
        110       120       130       140       150       160      

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pF1KF0 EQLPSQSLLTHIPTAGLPTSLGGGLPYCHQAWLDFRRRLEALLQNCQAACALLQGAIESV
        ..:.  :  .:  . :  .::: : :::. ::  :  .:..    . .  .::.    .
CCDS81 SSVPD--LHGYIDKSQLTEDLGGTLDYCHSRWLCQRTAIESFALMVKQTAQMLQSFGTEL
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pF1KF0 KAVPQPMEPGEVGQLLQQTEVLMQQVLDSPWLAWLQCQGGRE-LTWLKQEVPEVTLSPDY
         .  : .   ....:       ... ..  ::  . ..  : :  :. :  : ... : 
CCDS81 AETELPNDVQSTSSVLCAHTEKKDKAKEDLRLALKEGHSVLESLRELQAEGSEPSVNQDQ
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pF1KF0 RTAMDKADELYDRVDGLLHQLTLQSNQRIQALELVQTLEARESGLHQIEVWLQQVGWP--
          .  ...:  ...     .     .. : ::    :.  :.:...... :. ..    
CCDS81 LDNQATVQRLLAQLNETEAAFDEFWAKHQQKLEQCLQLRHFEQGFREVKAILDAASQKIA
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       .. . :.    .. ::.  .::.:   :: :..:      . : : .   .:    .   
CCDS81 TFTDIGNSLAHVEHLLRDLASFEEKSGVAVERARALSLDGEQLIGNKHYAVDSIRPKCQE
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       ::    .::  .:.:   :. . .: . .. .. : .::  .::       : . :.  .
CCDS81 LRHLCDQFSAEIARRRGLLSKSLELHRRLETSMKWCDEGIYLLASQPVDKCQSQDGAEAA
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       ::...       .    ..  ..    .. .. . .. : .. . : .   . .. .:::
CCDS81 LQEIEKFLETGAENKIQELNAIYKEYESILNQDLMEHVRKVFQK-QASMEEVFHRRQASL
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pF1KF0 KLPPVGSTASLCVSQVPAAPAHPPLRKAYSFDRNLGQSLSEPACHCHHAATIAACRRPEA
       :   ...  .  :.  :.::    : :.   . .. .. :: .     :   .  :: ..
CCDS81 K--KLAARQTRPVQ--PVAPRPEALAKSPCPSPGIRRG-SENSSSEGGALRRGPYRRAKS
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pF1KF0 GGGALPQASPTVPPPGSS--DPRSLNRLQL-VLAEMVATEREYVRALEYTMENYFPELDR
             . : .    ::.  . .::  :.  :..:.. ::: ::. :  ..:.:  :.: 
CCDS81 ------EMSESRQGRGSAGEEEESLAILRRHVMSELLDTERAYVEELLCVLEGYAAEMDN
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pF1KF0 PDVPQ----GLRGQRAHLFGNLEKLRDFHCHFFLRELEACTRHPPRVAYAFLRHRVQFGM
       : . .    ::....  ::::.:..  :: ..::::::  :  :  :.  ::..  .: .
CCDS81 PLMAHLLSTGLHNKKDVLFGNMEEIYHFHNRIFLRELENYTDCPELVGRCFLERMEDFQI
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       :  : .:::::..:  . .   ::.. :. :  .:.: ::::::.::. :: :::.:.  
CCDS81 YEKYCQNKPRSESLWRQCSDCPFFQECQRKLDHKLSLDSYLLKPVQRITKYQLLLKEMLK
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pF1KF0 -ARACGGPTQELSALREAQSLVHFQLRHGNDLLAMDAIQGCDVNLKEQGQLVRQDEFVVR
        .: : :  .    :.:: : .   :.  :: . . :: : : :: . :.:. :  : : 
CCDS81 YSRNCEGAED----LQEALSSILGILKAVNDSMHLIAITGYDGNLGDLGKLLMQGSFSVW
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pF1KF0 TGR---HKSV----------RRIFLFEELLLFSKPRH----GPTGVDTFAYKRSFKMADL
       : .   : .:          :..:: :. .:: : :.    :   . ...::.:..:: .
CCDS81 TDHKRGHTKVKELARFKPMQRHLFLHEKAVLFCKKREENGEGYEKAPSYSYKQSLNMAAV
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pF1KF0 GLTECCGNSNLRFEIWFRRRKARDTFVLQASSLAIKQAWTADISHLLWRQAVHNKEVRMA
       :.::   ..  .::::.  :.  .....:: .  :: ::. .: ..:  :          
CCDS81 GITENVKGDAKKFEIWYNARE--EVYIVQAPTPEIKAAWVNEIRKVLTSQLQACREASQH
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CCDS81 RALEQSQSLPLPAPTSTSPSRGNSRNIKKLEERKTDPLSLEGYVSSAPLTKPPEKGKEP 
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18511270 residues in 32554 library sequences
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