Result of FASTA (ccds) for
pF1KF0120
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KF0120, 1154 aa
1>>>pF1KF0120 1154 - 1154 aa - 1154 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0928+/-0.00132; mu= 5.3356+/- 0.077
mean_var=312.8303+/-66.234, 0's: 0 Z-trim(107.2): 87 B-trim: 79 in 1/52
Lambda= 0.072514
statistics sampled from 9371 (9423) to 9371 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16
Scan time: 5.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5336.2 CARD11 gene_id:84433|Hs108|chr7 (1154) 7611 811.9 0
CCDS6997.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 ( 536) 898 109.3 2.6e-23
CCDS48057.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 ( 492) 885 107.9 6.2e-23
CCDS13948.1 CARD10 gene_id:29775|Hs108|chr22 (1032) 855 105.1 9e-22
CCDS58605.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17 ( 740) 636 82.0 5.7e-15
CCDS11768.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17 (1004) 636 82.2 6.9e-15
>>CCDS5336.2 CARD11 gene_id:84433|Hs108|chr7 (1154 aa)
initn: 7611 init1: 7611 opt: 7611 Z-score: 4323.6 bits: 811.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7611; 100.0% identity (100.0% similar) in 1154 aa overlap (1-1154:1-1154)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MPGGGPEMDDYMETLKDEEDALWENVECNRHMLSRYINPAKLTPYLRQCKVIDEQDEDEV
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CCDS53 MPGGGPEMDDYMETLKDEEDALWENVECNRHMLSRYINPAKLTPYLRQCKVIDEQDEDEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 LNAPMLPSKINRAGRLLDILHTKGQRGYVVFLESLEFYYPELYKLVTGKEPTRRFSTIVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LNAPMLPSKINRAGRLLDILHTKGQRGYVVFLESLEFYYPELYKLVTGKEPTRRFSTIVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 EEGHEGLTHFLMNEVIKLQQQMKAKDLQRCELLARLRQLEDEKKQMTLTRVELLTFQERY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EEGHEGLTHFLMNEVIKLQQQMKAKDLQRCELLARLRQLEDEKKQMTLTRVELLTFQERY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 YKMKEERDSYNDELVKVKDDNYNLAMRYAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKHRLNKME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YKMKEERDSYNDELVKVKDDNYNLAMRYAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKHRLNKME
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 EECKLERNQSLKLKNDIENRPKKEQVLELERENEMLKTKNQELQSIIQAGKRSLPDSDKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EECKLERNQSLKLKNDIENRPKKEQVLELERENEMLKTKNQELQSIIQAGKRSLPDSDKA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 ILDILEHDRKEALEDRQELVNRIYNLQEEARQAEELRDKYLEEKEDLELKCSTLGKDCEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ILDILEHDRKEALEDRQELVNRIYNLQEEARQAEELRDKYLEEKEDLELKCSTLGKDCEM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 YKHRMNTVMLQLEEVERERDQAFHSRDEAQTQYSQCLIEKDKYRKQIRELEEKNDEMRIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YKHRMNTVMLQLEEVERERDQAFHSRDEAQTQYSQCLIEKDKYRKQIRELEEKNDEMRIE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 MVRREACIVNLESKLRRLSKDSNNLDQSLPRNLPVTIISQDFGDASPRTNGQEADDSSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MVRREACIVNLESKLRRLSKDSNNLDQSLPRNLPVTIISQDFGDASPRTNGQEADDSSTS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 EESPEDSKYFLPYHPPQRRMNLKGIQLQRAKSPISLKRTSDFQAKGHEEEGTDASPSSCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EESPEDSKYFLPYHPPQRRMNLKGIQLQRAKSPISLKRTSDFQAKGHEEEGTDASPSSCG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 SLPITNSFTKMQPPRSRSSIMSITAEPPGNDSIVRRYKEDAPHRSTVEEDNDSGGFDALD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SLPITNSFTKMQPPRSRSSIMSITAEPPGNDSIVRRYKEDAPHRSTVEEDNDSGGFDALD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KF0 LDDDSHERYSFGPSSIHSSSSSHQSEGLDAYDLEQVNLMFRKFSLERPFRPSVTSVGHVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LDDDSHERYSFGPSSIHSSSSSHQSEGLDAYDLEQVNLMFRKFSLERPFRPSVTSVGHVR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KF0 GPGPSVQHTTLNGDSLTSQLTLLGGNARGSFVHSVKPGSLAEKAGLREGHQLLLLEGCIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GPGPSVQHTTLNGDSLTSQLTLLGGNARGSFVHSVKPGSLAEKAGLREGHQLLLLEGCIR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KF0 GERQSVPLDTCTKEEAHWTIQRCSGPVTLHYKVNHEGYRKLVKDMEDGLITSGDSFYIRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GERQSVPLDTCTKEEAHWTIQRCSGPVTLHYKVNHEGYRKLVKDMEDGLITSGDSFYIRL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KF0 NLNISSQLDACTMSLKCDDVVHVRDTMYQDRHEWLCARVDPFTDHDLDMGTIPSYSRAQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NLNISSQLDACTMSLKCDDVVHVRDTMYQDRHEWLCARVDPFTDHDLDMGTIPSYSRAQQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KF0 LLLVKLQRLMHRGSREEVDGTHHTLRALRNTLQPEEALSTSDPRVSPRLSRASFLFGQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LLLVKLQRLMHRGSREEVDGTHHTLRALRNTLQPEEALSTSDPRVSPRLSRASFLFGQLL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KF0 QFVSRSENKYKRMNSNERVRIISGSPLGSLARSSLDATKLLTEKQEELDPESELGKNLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QFVSRSENKYKRMNSNERVRIISGSPLGSLARSSLDATKLLTEKQEELDPESELGKNLSL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KF0 IPYSLVRAFYCERRRPVLFTPTVLAKTLVQRLLNSGGAMEFTICKSDIVTRDEFLRRQKT
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CCDS53 IPYSLVRAFYCERRRPVLFTPTVLAKTLVQRLLNSGGAMEFTICKSDIVTRDEFLRRQKT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KF0 ETIIYSREKNPNAFECIAPANIEAVAAKNKHCLLEAGIGCTRDLIKSNIYPIVLFIRVCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ETIIYSREKNPNAFECIAPANIEAVAAKNKHCLLEAGIGCTRDLIKSNIYPIVLFIRVCE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KF0 KNIKRFRKLLPRPETEEEFLRVCRLKEKELEALPCLYATVEPDMWGSVEELLRVVKDKIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KNIKRFRKLLPRPETEEEFLRVCRLKEKELEALPCLYATVEPDMWGSVEELLRVVKDKIG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150
pF1KF0 EEQRKTIWVDEDQL
::::::::::::::
CCDS53 EEQRKTIWVDEDQL
1150
>>CCDS6997.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 (536 aa)
initn: 1228 init1: 414 opt: 898 Z-score: 532.1 bits: 109.3 E(32554): 2.6e-23
Smith-Waterman score: 1249; 39.9% identity (69.7% similar) in 547 aa overlap (8-538:1-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MPGGGPEMDDYMETLKDEEDALWENVECNRHMLSRYINPAKLTPYLRQCKVIDEQDEDEV
:.:: ...: : .: : :. :.:...:::::::::.. .::..:
CCDS69 MSDY-----ENDDECWSVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 LNAPMLPSKINRAGRLLDILHTKGQRGYVVFLESLEFYYPELYKLVTGKEPTRRFSTIVV
:. : : . ..: :::::. :..:::.::::::.:::.::: ::::::.: :: :.
CCDS69 LSDPNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIID
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 EEGHEGLTHFLMNEVIKLQQQMKAKDLQRCELLARLRQLEDEKKQMTLTRVELLTFQERY
:. :::..::.::.:::.... .: : : . .: :.. . : :::
CCDS69 ASGESGLTQLLMTEVMKLQKKVQ-------DLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 YKMKEERDSYNDELVKVKDDNYNLAMRYAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKHRLNKME
..::: .. . :: . :..::.:::: :. ::::. :.::.:::::::::::: : : :
CCDS69 QRLKEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAE
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 EECKLERNQSLKLKNDIENRPKKEQVLELERENEMLKTKNQELQSIIQAGKRSLPDSDKA
..::.::...:::.. .:.::..: . ::..:. .:... :::.. .: :: : ..
CCDS69 DDCKVERKHTLKLRHAMEQRPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKL---DRSSP
230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 ILDILEHDRKEALEDRQELVNRIYNLQEEARQAEELRDKYLEEKEDLELKCSTLGKDCEM
...::.: ..::.:.:: .: :..:... ::.: : . .:::: .::.: .: :: .:
CCDS69 YIQVLEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKM
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 YKHRMNTVMLQLEEVERERDQAFHSRDEAQTQYSQCLIEKDKYRKQIRELEEKNDEMRIE
:: :.....::.::: :::::. .:.: ..:... : ::: :::.::: :: ::....
CCDS69 YKDRIEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQ
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470
pF1KF0 MVRREACIVNLESKLRRLSKD----SNNLDQSLPRNLPVTIISQDFGDASPRTNGQEADD
. . :: .. .:..::: . . :..:... :: . ::. :.. .: :
CCDS69 VFQCEAQLLAVEGRLRRQQLETLVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGG
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KF0 SSTSE-----------ESPEDSKYFLPYHPPQRRMNLKGIQLQRAKSPISLKRTSDFQAK
.: .. ..:.:. : ..: :: ... . .:.. . .
CCDS69 GSPKQPFAALHQEQVLRNPHDAGLSSGEPPEKERRRLKE-SFENYRRKRALRKMQKGWRQ
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KF0 GHEE-EGTDASPSSCGSLPITNSFTKMQPPRSRSSIMSITAEPPGNDSIVRRYKEDAPHR
:.:. :.: .: ..
CCDS69 GEEDRENTTGSDNTDTEGS
520 530
>>CCDS48057.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 (492 aa)
initn: 1228 init1: 414 opt: 885 Z-score: 525.2 bits: 107.9 E(32554): 6.2e-23
Smith-Waterman score: 1242; 43.1% identity (72.8% similar) in 478 aa overlap (8-481:1-463)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MPGGGPEMDDYMETLKDEEDALWENVECNRHMLSRYINPAKLTPYLRQCKVIDEQDEDEV
:.:: ...: : .: : :. :.:...:::::::::.. .::..:
CCDS48 MSDY-----ENDDECWSVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 LNAPMLPSKINRAGRLLDILHTKGQRGYVVFLESLEFYYPELYKLVTGKEPTRRFSTIVV
:. : : . ..: :::::. :..:::.::::::.:::.::: ::::::.: :: :.
CCDS48 LSDPNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIID
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 EEGHEGLTHFLMNEVIKLQQQMKAKDLQRCELLARLRQLEDEKKQMTLTRVELLTFQERY
:. :::..::.::.:::.... .: : : . .: :.. . : :::
CCDS48 ASGESGLTQLLMTEVMKLQKKVQ-------DLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 YKMKEERDSYNDELVKVKDDNYNLAMRYAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKHRLNKME
..::: .. . :: . :..::.:::: :. ::::. :.::.:::::::::::: : : :
CCDS48 QRLKEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAE
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 EECKLERNQSLKLKNDIENRPKKEQVLELERENEMLKTKNQELQSIIQAGKRSLPDSDKA
..::.::...:::.. .:.::..: . ::..:. .:... :::.. .: :: : ..
CCDS48 DDCKVERKHTLKLRHAMEQRPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKL---DRSSP
230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 ILDILEHDRKEALEDRQELVNRIYNLQEEARQAEELRDKYLEEKEDLELKCSTLGKDCEM
...::.: ..::.:.:: .: :..:... ::.: : . .:::: .::.: .: :: .:
CCDS48 YIQVLEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKM
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 YKHRMNTVMLQLEEVERERDQAFHSRDEAQTQYSQCLIEKDKYRKQIRELEEKNDEMRIE
:: :.....::.::: :::::. .:.: ..:... : ::: :::.::: :: ::....
CCDS48 YKDRIEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQ
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470
pF1KF0 MVRREACIVNLESKLRRLSKD----SNNLDQSLPRNLPVTIISQDFGDASPRTNGQEADD
. . :: .. .:..::: . . :..:... :: . ::. :.. .: :
CCDS48 VFQCEAQLLAVEGRLRRQQLETLVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGG
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KF0 SSTSEESPEDSKYFLPYHPPQRRMNLKGIQLQRAKSPISLKRTSDFQAKGHEEEGTDASP
.: ..
CCDS48 GSPKQPFAALHQEQVLRNPHDAGPAGLPGIGAVC
460 470 480 490
>>CCDS13948.1 CARD10 gene_id:29775|Hs108|chr22 (1032 aa)
initn: 1989 init1: 829 opt: 855 Z-score: 504.4 bits: 105.1 E(32554): 9e-22
Smith-Waterman score: 1877; 36.6% identity (59.0% similar) in 1154 aa overlap (18-1150:23-1019)
10 20 30 40 50
pF1KF0 MPGGGPEMDDYMETLKDEEDALWENVECNRHMLSRYINPAKLTPYLRQCKVIDEQ
::::::: .: :: :.: .::::::::::::.:::::
CCDS13 MPGRAEAGEAEEEAGAGSGSEAEEDALWERIEGVRHRLARALNPAKLTPYLRQCRVIDEQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KF0 DEDEVLNAPMLPSKINRAGRLLDILHTKGQRGYVVFLESLEFYYPELYKLVTGKEPTRRF
::.:::.. .: ..::.:::.:::. .:.::: .:::.::::::: . :.::.::..:
CCDS13 DEEEVLSTYRFPCRVNRTGRLMDILRCRGKRGYEAFLEALEFYYPEHFTLLTGQEPAQRC
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KF0 STIVVEEGHEGLTHFLMNEVIKLQQQMKAKDLQRCELL-ARLRQLEDEKKQMTLTRVELL
: :. ::: ::::.:::.:: .:.. :.. ::: . : :: : ::.:. . .
CCDS13 SMILDEEGPEGLTQFLMTEVRRLREARKSQ-LQREQQLQARGRVLEEERAGLEQRLRDQQ
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KF0 TFQERYYKMKEERDSYNDELVKVKDDNYNLAMRYAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKH
::: ...:. .. . ::...::.:: .::: :::::::: ::.::::::: .::::
CCDS13 QAQERCQRLREDWEAGSLELLRLKDENYMIAMRLAQLSEEKNSAVLRSRDLQLAVDQLKL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KF0 RLNKMEEECKLERNQSLKLKNDIENRPKKEQ---------VLELERENEMLKTKNQELQS
.....:::: : : . :.. .::. : ::. ::. : .. .:::
CCDS13 KVSRLEEECALLRRARGPPPGAEEKEKEKEKEKEPDNVDLVSELRAENQRLTASLRELQE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KF0 IIQ--AGKRSLPDSDKAILDILEHDRKEALEDRQELVNRIYNLQEEARQAEELRDKYLEE
.: :.. . : :.. .::::::: .:: ..:::: .... .: : . ::::::.::.:
CCDS13 GLQQEASRPGAPGSERILLDILEHDWREAQDSRQELCQKLHAVQGELQWAEELRDQYLQE
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KF0 KEDLELKCSTLGKDCEMYKHRMNTVMLQLEEVERERDQAFHSRDEAQTQYSQCLIEKDKY
:::.:: :: :::..::::: ::. ::::.:.:::::..:::. : :::: :::::.:
CCDS13 MEDLRLKHRTLQKDCDLYKHRMATVLAQLEEIEKERDQAIQSRDRIQLQYSQSLIEKDQY
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KF0 RKQIRELEEKNDEMRIEMVRREACIVNLESKLRRLSKDSNNLDQSLPRNLPVTIISQDFG
:::.: :: . ::. .. :. . :: .:.: .. .. :
CCDS13 RKQVRGLEAERDELLTTLTSLEGTKALLEVQLQR-AQGGTCL------------------
420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KF0 DASPRTNGQEADDSSTSEESPEDSKYFLPYHPPQRRMNLKGIQLQRAKSPISLKRTSDFQ
.: :: : : .: . : : ::.. .
CCDS13 ---------KACASSHSLCSNLSSTWSLSEFP----------------SPLG-----GPE
470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KF0 AKGHEEEGTDASPSSCGSLPITNSFTKMQPPRSRSSIMSITAEPPGNDSIVRRYKED--A
: : : .. ..: .: :.: .. .: ::. . ::. ::.:: .:. :
CCDS13 ATG--EAAVMGGPEPHNSEEATDSEKEI----NRLSILPF---PPSAGSILRRQREEDPA
500 510 520 530 540
590 600 610 620 630
pF1KF0 PHRSTVEEDNDSGGFDALDLDDDSHERYSFGPSSIHSSSSS---HQSEGLDAYDLEQVNL
: . . .: : .: . .: : :: ::.: . ::: : .:
CCDS13 PPKRSFSSMSDITGSVTL-------KPWSPGLSSSSSSDSVWPLGKPEGLLARG---CGL
550 560 570 580 590
640 650 660 670 680 690
pF1KF0 MFRKFSLERPFRPSVTSVGHVRGPGPSVQHTTLNGDSLTSQLTLLGGNARGSFVHSVKPG
: :.: . :.. . :: :. :. . :.. : :. :. : :
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.... .. : ... :::: ::.. . : .. .: ...... :. :. :.::.:
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pF1KF0 ARVDPFTDHDLDMGTIPSYSRAQQLLLVKLQRLMHRGSREEVDGTHHTLRALRNTLQPEE
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: .: : .:: : :: . ...:.. .:.:. : .: :
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CCDS58 NYSR
740
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CCDS11 MGELCRRDSALTALDEETLWEMMESHRHRIVRCICPSRLTPYLRQAKVLCQLDEEEV
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CCDS11 LHSPRLTNSAMRAGHLLDLLKTRGKNGAIAFLESLKFHNPDVYTLVTGLQPDVDFSNFSG
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CCDS11 LMETSKLTECLAGAIGSLQEELNQEKGQKEVLLRRCQQLQ-EHLGLAETRAEGLHQLEAD
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CCDS11 HSRMKREVSAHFHEVLRLKDEMLSLSLHYSNALQEKELAASRCRSLQEELYLLKQELQRA
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pF1KF0 -MEEECKLE-RNQSLKLKNDIENRPKKEQVLELERENEMLKTKNQELQSIIQAGKRSLPD
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CCDS11 NMVSSCELELQEQSLRTASDQESGDE-----ELNR----LKEENEKLRSL----TFSLAE
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CCDS11 KD-----ILEQSLDEARGSRQELVERIHSLRERAVAAERQREQYWEEKEQTLLQFQKSKM
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CCDS11 LR--------------TQLRQL--------QAEP----------------PGVLKQEA--
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CCDS11 VDYEASEPLFKAVLEDTTLEEAVGLLRRVDGFCCLSVKVNTDGYKRLLQDLEAKVATSGD
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CCDS11 LSCVRQAIADEQKKVVWTEQSPR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]