Result of FASTA (omim) for
pF1KF0137
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KF0137, 1508 aa
1>>>pF1KF0137 1508 - 1508 aa - 1508 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3220+/-0.000436; mu= 19.9142+/- 0.027
mean_var=180.6741+/-38.436, 0's: 0 Z-trim(115.3): 99 B-trim: 1176 in 1/55
Lambda= 0.095417
statistics sampled from 25591 (25743) to 25591 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.302), width: 16
Scan time: 19.850
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_056280 (OMIM: 607005) gem-associated protein 5 (1508) 10267 1427.9 0
NP_001239085 (OMIM: 607005) gem-associated protein (1507) 10249 1425.4 0
XP_016863186 (OMIM: 609005) PREDICTED: WD repeat-c ( 982) 251 48.9 0.00024
XP_005262782 (OMIM: 609005) PREDICTED: WD repeat-c (1216) 251 49.0 0.00028
NP_851782 (OMIM: 609005) WD repeat-containing prot (1283) 251 49.0 0.00029
XP_011529884 (OMIM: 609005) PREDICTED: WD repeat-c (1290) 251 49.0 0.00029
XP_016863179 (OMIM: 609005) PREDICTED: WD repeat-c (1307) 251 49.0 0.00029
XP_016863178 (OMIM: 609005) PREDICTED: WD repeat-c (1307) 251 49.0 0.00029
XP_016863177 (OMIM: 609005) PREDICTED: WD repeat-c (1314) 251 49.0 0.00029
XP_016863175 (OMIM: 609005) PREDICTED: WD repeat-c (1314) 251 49.0 0.00029
XP_016863176 (OMIM: 609005) PREDICTED: WD repeat-c (1314) 251 49.0 0.00029
NP_733828 (OMIM: 609005) WD repeat-containing prot (1322) 251 49.0 0.00029
>>NP_056280 (OMIM: 607005) gem-associated protein 5 isof (1508 aa)
initn: 10267 init1: 10267 opt: 10267 Z-score: 7648.4 bits: 1427.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10267; 99.9% identity (100.0% similar) in 1508 aa overlap (1-1508:1-1508)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MGQEPRTLPPSPNWYCARCSDAVPGGLFGFAARTSVFLVRVGPGAGESPGTPPFRVIGEL
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NP_056 MGQEPRTLPPSPNWYCARCSDAVPGGLFGFAARTSVFLVRVGPGAGESPGTPPFRVIGEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 VGHTERVSGFTFSHHPGQYNLCATSSDDGTVKIWDVETKTVVTEHALHQHTISTLHWSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 VGHTERVSGFTFSHHPGQYNLCATSSDDGTVKIWDVETKTVVTEHALHQHTISTLHWSPR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 VKDLIVSGDEKGVVFCYWFNRNDSQHLFIEPRTIFCLTCSPHHEDLVAIGYKDGIVVIID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 VKDLIVSGDEKGVVFCYWFNRNDSQHLFIEPRTIFCLTCSPHHEDLVAIGYKDGIVVIID
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 ISKKGEVIHRLRGHDDEIHSIAWCPLPGEDCLSINQEETSEEAEITNGNAVAQAPVTKGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ISKKGEVIHRLRGHDDEIHSIAWCPLPGEDCLSINQEETSEEAEITNGNAVAQAPVTKGC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 YLATGSKDQTIRIWSCSRGRGVMILKLPFLKRRGGGIDPTVKERLWLTLHWPSNQPTQLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 YLATGSKDQTIRIWSCSRGRGVMILKLPFLKRRGGGIDPTVKERLWLTLHWPSNQPTQLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 SSCFGGELLQWDLTQSWRRKYTLFSASSEGQNHSRIVFNLCPLQTEDDKQLLLSTSMDRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SSCFGGELLQWDLTQSWRRKYTLFSASSEGQNHSRIVFNLCPLQTEDDKQLLLSTSMDRD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 VKCWDIATLECSWTLPSLGGFAYSLAFSSVDIGSLAIGVGDGMIRVWNTLSIKNNYDVKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 VKCWDIATLECSWTLPSLGGFAYSLAFSSVDIGSLAIGVGDGMIRVWNTLSIKNNYDVKN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 FWQGVKSKVTALCWHPTKEGCLAFGTDDGKVGLYDTYSNKPPQISSTYHKKTVYTLAWGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 FWQGVKSKVTALCWHPTKEGCLAFGTDDGKVGLYDTYSNKPPQISSTYHKKTVYTLAWGP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 PVPPMSLGGEGDRPSLALYSCGGEGIVLQHNPWKLSGEAFDINKLIRDTNSIKYKLPVHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PVPPMSLGGEGDRPSLALYSCGGEGIVLQHNPWKLSGEAFDINKLIRDTNSIKYKLPVHT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 EISWKADGKIMALGNEDGSIEIFQIPNLKLICTIQQHHKLVNTISWHHEHGSQPELSYLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EISWKADGKIMALGNEDGSIEIFQIPNLKLICTIQQHHKLVNTISWHHEHGSQPELSYLM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KF0 ASGSNNAVIYVHNLKTVIESSPESPVTITEPYRTLSGHTAKITSVAWSPHHDGRLVSASY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ASGSNNAVIYVHNLKTVIESSPESPVTITEPYRTLSGHTAKITSVAWSPHHDGRLVSASY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KF0 DGTAQVWDALREEPLCNFRGHQGRLLCVAWSPLDPDCIYSGADDFCVHKWLTSMQDHSRP
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 DGTAQVWDALREEPLCNFRGHRGRLLCVAWSPLDPDCIYSGADDFCVHKWLTSMQDHSRP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KF0 PQGKKSIELEKKRLSQPKAKPKKKKKPTLRTPVKLESIDGNEEESMKENSGPVENGVSDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PQGKKSIELEKKRLSQPKAKPKKKKKPTLRTPVKLESIDGNEEESMKENSGPVENGVSDQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KF0 EGEEQAREPELPCGLAPAVSREPVICTPVSSGFEKSKVTINNKVILLKKEPPKEKPETLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EGEEQAREPELPCGLAPAVSREPVICTPVSSGFEKSKVTINNKVILLKKEPPKEKPETLI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KF0 KKRKARSLLPLSTSLDHRSKEELHQDCLVLATAKHSRELNEDVSADVEERFHLGLFTDRA
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NP_056 KKRKARSLLPLSTSLDHRSKEELHQDCLVLATAKHSRELNEDVSADVEERFHLGLFTDRA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KF0 TLYRMIDIEGKGHLENGHPELFHQLMLWKGDLKGVLQTAAERGELTDNLVAMAPAAGYHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 TLYRMIDIEGKGHLENGHPELFHQLMLWKGDLKGVLQTAAERGELTDNLVAMAPAAGYHV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KF0 WLWAVEAFAKQLCFQDQYVKAASHLLSIHKVYEAVELLKSNHFYREAIAIAKARLRPEDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 WLWAVEAFAKQLCFQDQYVKAASHLLSIHKVYEAVELLKSNHFYREAIAIAKARLRPEDP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KF0 VLKDLYLSWGTVLERDGHYAVAAKCYLGATCAYDAAKVLAKKGDAASLRTAAELAAIVGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 VLKDLYLSWGTVLERDGHYAVAAKCYLGATCAYDAAKVLAKKGDAASLRTAAELAAIVGE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KF0 DELSASLALRCAQELLLANNWVGAQEALQLHESLQGQRLVFCLLELLSRHLEEKQLSEGK
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NP_056 DELSASLALRCAQELLLANNWVGAQEALQLHESLQGQRLVFCLLELLSRHLEEKQLSEGK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KF0 SSSSYHTWNTGTEGPFVERVTAVWKSIFSLDTPEQYQEAFQKLQNIKYPSATNNTPAKQL
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NP_056 SSSSYHTWNTGTEGPFVERVTAVWKSIFSLDTPEQYQEAFQKLQNIKYPSATNNTPAKQL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KF0 LLHICHDLTLAVLSQQMASWDEAVQALLRAVVRSYDSGSFTIMQEVYSAFLPDGCDHLRD
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NP_056 LLHICHDLTLAVLSQQMASWDEAVQALLRAVVRSYDSGSFTIMQEVYSAFLPDGCDHLRD
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KF0 KLGDHQSPATPAFKSLEAFFLYGRLYEFWWSLSRPCPNSSVWVRAGHRTLSVEPSQQLDT
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NP_056 KLGDHQSPATPAFKSLEAFFLYGRLYEFWWSLSRPCPNSSVWVRAGHRTLSVEPSQQLDT
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KF0 ASTEETDPETSQPEPNRPSELDLRLTEEGERMLSTFKELFSEKHASLQNSQRTVAEVQET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ASTEETDPETSQPEPNRPSELDLRLTEEGERMLSTFKELFSEKHASLQNSQRTVAEVQET
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KF0 LAEMIRQHQKSQLCKSTANGPDKNEPEVEAEQPLCSSQSQCKEEKNEPLSLPELTKRLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LAEMIRQHQKSQLCKSTANGPDKNEPEVEAEQPLCSSQSQCKEEKNEPLSLPELTKRLTE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KF0 ANQRMAKFPESIKAWPFPDVLECCLVLLLIRSHFPGCLAQEMQQQAQELLQKYGNTKTYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ANQRMAKFPESIKAWPFPDVLECCLVLLLIRSHFPGCLAQEMQQQAQELLQKYGNTKTYR
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KF0 RHCQTFCM
::::::::
NP_056 RHCQTFCM
>>NP_001239085 (OMIM: 607005) gem-associated protein 5 i (1507 aa)
initn: 8709 init1: 8709 opt: 10249 Z-score: 7635.0 bits: 1425.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10249; 99.9% identity (99.9% similar) in 1508 aa overlap (1-1508:1-1507)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MGQEPRTLPPSPNWYCARCSDAVPGGLFGFAARTSVFLVRVGPGAGESPGTPPFRVIGEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGQEPRTLPPSPNWYCARCSDAVPGGLFGFAARTSVFLVRVGPGAGESPGTPPFRVIGEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 VGHTERVSGFTFSHHPGQYNLCATSSDDGTVKIWDVETKTVVTEHALHQHTISTLHWSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGHTERVSGFTFSHHPGQYNLCATSSDDGTVKIWDVETKTVVTEHALHQHTISTLHWSPR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 VKDLIVSGDEKGVVFCYWFNRNDSQHLFIEPRTIFCLTCSPHHEDLVAIGYKDGIVVIID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VKDLIVSGDEKGVVFCYWFNRNDSQHLFIEPRTIFCLTCSPHHEDLVAIGYKDGIVVIID
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 ISKKGEVIHRLRGHDDEIHSIAWCPLPGEDCLSINQEETSEEAEITNGNAVAQAPVTKGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
NP_001 ISKKGEVIHRLRGHDDEIHSIAWCPLPGEDCLSINQEETSE-AEITNGNAVAQAPVTKGC
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 YLATGSKDQTIRIWSCSRGRGVMILKLPFLKRRGGGIDPTVKERLWLTLHWPSNQPTQLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLATGSKDQTIRIWSCSRGRGVMILKLPFLKRRGGGIDPTVKERLWLTLHWPSNQPTQLV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 SSCFGGELLQWDLTQSWRRKYTLFSASSEGQNHSRIVFNLCPLQTEDDKQLLLSTSMDRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSCFGGELLQWDLTQSWRRKYTLFSASSEGQNHSRIVFNLCPLQTEDDKQLLLSTSMDRD
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 VKCWDIATLECSWTLPSLGGFAYSLAFSSVDIGSLAIGVGDGMIRVWNTLSIKNNYDVKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VKCWDIATLECSWTLPSLGGFAYSLAFSSVDIGSLAIGVGDGMIRVWNTLSIKNNYDVKN
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 FWQGVKSKVTALCWHPTKEGCLAFGTDDGKVGLYDTYSNKPPQISSTYHKKTVYTLAWGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FWQGVKSKVTALCWHPTKEGCLAFGTDDGKVGLYDTYSNKPPQISSTYHKKTVYTLAWGP
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 PVPPMSLGGEGDRPSLALYSCGGEGIVLQHNPWKLSGEAFDINKLIRDTNSIKYKLPVHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVPPMSLGGEGDRPSLALYSCGGEGIVLQHNPWKLSGEAFDINKLIRDTNSIKYKLPVHT
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 EISWKADGKIMALGNEDGSIEIFQIPNLKLICTIQQHHKLVNTISWHHEHGSQPELSYLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EISWKADGKIMALGNEDGSIEIFQIPNLKLICTIQQHHKLVNTISWHHEHGSQPELSYLM
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KF0 ASGSNNAVIYVHNLKTVIESSPESPVTITEPYRTLSGHTAKITSVAWSPHHDGRLVSASY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASGSNNAVIYVHNLKTVIESSPESPVTITEPYRTLSGHTAKITSVAWSPHHDGRLVSASY
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KF0 DGTAQVWDALREEPLCNFRGHQGRLLCVAWSPLDPDCIYSGADDFCVHKWLTSMQDHSRP
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGTAQVWDALREEPLCNFRGHRGRLLCVAWSPLDPDCIYSGADDFCVHKWLTSMQDHSRP
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KF0 PQGKKSIELEKKRLSQPKAKPKKKKKPTLRTPVKLESIDGNEEESMKENSGPVENGVSDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PQGKKSIELEKKRLSQPKAKPKKKKKPTLRTPVKLESIDGNEEESMKENSGPVENGVSDQ
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KF0 EGEEQAREPELPCGLAPAVSREPVICTPVSSGFEKSKVTINNKVILLKKEPPKEKPETLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGEEQAREPELPCGLAPAVSREPVICTPVSSGFEKSKVTINNKVILLKKEPPKEKPETLI
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KF0 KKRKARSLLPLSTSLDHRSKEELHQDCLVLATAKHSRELNEDVSADVEERFHLGLFTDRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KKRKARSLLPLSTSLDHRSKEELHQDCLVLATAKHSRELNEDVSADVEERFHLGLFTDRA
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KF0 TLYRMIDIEGKGHLENGHPELFHQLMLWKGDLKGVLQTAAERGELTDNLVAMAPAAGYHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLYRMIDIEGKGHLENGHPELFHQLMLWKGDLKGVLQTAAERGELTDNLVAMAPAAGYHV
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KF0 WLWAVEAFAKQLCFQDQYVKAASHLLSIHKVYEAVELLKSNHFYREAIAIAKARLRPEDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WLWAVEAFAKQLCFQDQYVKAASHLLSIHKVYEAVELLKSNHFYREAIAIAKARLRPEDP
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KF0 VLKDLYLSWGTVLERDGHYAVAAKCYLGATCAYDAAKVLAKKGDAASLRTAAELAAIVGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLKDLYLSWGTVLERDGHYAVAAKCYLGATCAYDAAKVLAKKGDAASLRTAAELAAIVGE
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KF0 DELSASLALRCAQELLLANNWVGAQEALQLHESLQGQRLVFCLLELLSRHLEEKQLSEGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DELSASLALRCAQELLLANNWVGAQEALQLHESLQGQRLVFCLLELLSRHLEEKQLSEGK
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KF0 SSSSYHTWNTGTEGPFVERVTAVWKSIFSLDTPEQYQEAFQKLQNIKYPSATNNTPAKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSSSYHTWNTGTEGPFVERVTAVWKSIFSLDTPEQYQEAFQKLQNIKYPSATNNTPAKQL
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KF0 LLHICHDLTLAVLSQQMASWDEAVQALLRAVVRSYDSGSFTIMQEVYSAFLPDGCDHLRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLHICHDLTLAVLSQQMASWDEAVQALLRAVVRSYDSGSFTIMQEVYSAFLPDGCDHLRD
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KF0 KLGDHQSPATPAFKSLEAFFLYGRLYEFWWSLSRPCPNSSVWVRAGHRTLSVEPSQQLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLGDHQSPATPAFKSLEAFFLYGRLYEFWWSLSRPCPNSSVWVRAGHRTLSVEPSQQLDT
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KF0 ASTEETDPETSQPEPNRPSELDLRLTEEGERMLSTFKELFSEKHASLQNSQRTVAEVQET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASTEETDPETSQPEPNRPSELDLRLTEEGERMLSTFKELFSEKHASLQNSQRTVAEVQET
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KF0 LAEMIRQHQKSQLCKSTANGPDKNEPEVEAEQPLCSSQSQCKEEKNEPLSLPELTKRLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAEMIRQHQKSQLCKSTANGPDKNEPEVEAEQPLCSSQSQCKEEKNEPLSLPELTKRLTE
1380 1390 1400 1410 1420 1430
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NP_001 ANQRMAKFPESIKAWPFPDVLECCLVLLLIRSHFPGCLAQEMQQQAQELLQKYGNTKTYR
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NP_001 RHCQTFCM
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:.. :..:. :: . :. ..:.. : :: : :.: . .. : ::
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... . :. . : :: . : ...::::::. : ::: ..: : :.: :::
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...:: .. . . :: . . . :. : . ::. :. .. : : .. :
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..:. :: . . .. :.. :..: :: . : :.: :..: :. .:
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:: ... .:. : . :::: .. : .: :. .....::. :.
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. .: :. . : :. . .. ::. :. . . .::. : ::
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NP_851 VDSESLSCITTFNLPSAAASVQCLAWVPSAPGMFITGDSQVGVLRIWNVSRTTPIDNLK-
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NP_851 SEAVPPPTLTQNQA---FSLPPGHA-------VCCFLDGGVGLYDMGAKK--WDFLRDLG
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.. :. : . :: . :: :.::. .. : : .. . .: : :
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NP_851 IATCSSDG--------------FCIIRTI--------------------DGKVL------
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. .. : . : .:..: ..:.: ... . :. . :
NP_851 ---HKYKHPAAVFGCDWSQNNK------------------DMIATGCEDTNVRVYYVAT-
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pF1KF0 IESSPESPVTITEPYRTLSGHTAKITSVAWSPHHDGRLVSASYDGTAQVWDALREEPLCN
:: .: ...::::::. : ::: ..: : :.: :::...:: .. .
NP_851 --SSD-------QPLKVFSGHTAKVFHVKWSPLREGILCSGSDDGTVRIWDYTQDACINI
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pF1KF0 FRGHQGRLLCVAWSPLDPDCIYSGADDFCVHKWLT-------SMQDHSRPPQGKKSIELE
. :: . . . :. : . ::. :. .. : : .. ::. :
NP_851 LNGHTAPVRGLMWNTEIPYLLISGSWDYTIKVWDTREGTCVDTVYDHGADVYG-------
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pF1KF0 KKRLSQPKAKPKKKKKPTLRTPVKLESIDGNEEESMKENSGPVE-NGVSDQEGEEQAREP
:. ..: . . . :.: : . ::. : ..:. :: .
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. .. :.. :..: :: . : :.: :..: :. .: :: . . .
NP_851 DY--AIEPGTP--PLLCGKVSRDIRQEIEKLTANSQVKKLRWFSECLSPPGGSDNLWNLV
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NP_851 AVIKGQDDSLLP-----QNYCKGIMHLKHLIKFRTSEAQELTT-VKMS---KFGGGIGVP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]