Result of FASTA (ccds) for
pF1KF0141
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KF0141, 1319 aa
1>>>pF1KF0141 1319 - 1319 aa - 1319 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.4624+/-0.00114; mu= -18.8050+/- 0.068
mean_var=477.0849+/-97.293, 0's: 0 Z-trim(115.0): 36 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.058719
statistics sampled from 15514 (15541) to 15514 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.756), E-opt: 0.2 (0.477), width: 16
Scan time: 6.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44750.1 PHLDB1 gene_id:23187|Hs108|chr11 (1319) 8663 749.3 1.6e-215
CCDS8401.1 PHLDB1 gene_id:23187|Hs108|chr11 (1377) 5996 523.4 1.7e-147
CCDS2962.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3 (1210) 1419 135.6 7.8e-31
CCDS46885.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3 (1237) 1419 135.6 8e-31
CCDS46886.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3 (1253) 1366 131.1 1.8e-29
CCDS12621.2 PHLDB3 gene_id:653583|Hs108|chr19 ( 640) 699 74.5 1e-12
>>CCDS44750.1 PHLDB1 gene_id:23187|Hs108|chr11 (1319 aa)
initn: 8663 init1: 8663 opt: 8663 Z-score: 3983.0 bits: 749.3 E(32554): 1.6e-215
Smith-Waterman score: 8663; 100.0% identity (100.0% similar) in 1319 aa overlap (1-1319:1-1319)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MDALNRNQIGPGCQTQTMVQKGPLDLIETGKGLKVQTDKPHLVSLGSGRLSTAITLLPLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDALNRNQIGPGCQTQTMVQKGPLDLIETGKGLKVQTDKPHLVSLGSGRLSTAITLLPLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 EGRTVIGSAARDISLQGPGLAPEHCYIENLRGTLTLYPCGNACTIDGLPVRQPTRLTQGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EGRTVIGSAARDISLQGPGLAPEHCYIENLRGTLTLYPCGNACTIDGLPVRQPTRLTQGC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 MLCLGQSTFLRFNHPAEAKWMKSMIPAGGRAPGPPYSPVPAESESLVNGNHTPQTATRGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MLCLGQSTFLRFNHPAEAKWMKSMIPAGGRAPGPPYSPVPAESESLVNGNHTPQTATRGP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 SACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPAATSPLSPMANGGRYLLSPPTSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPAATSPLSPMANGGRYLLSPPTSPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 AMSVGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASHSPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQPPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AMSVGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASHSPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQPPQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 SRPSGARSESPRLSRKGGHERPPSPGLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SRPSGARSESPRLSRKGGHERPPSPGLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 ISLSEYPASGALSQPTSIPGSPKFQPPVPAPRNKIGTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ISLSEYPASGALSQPTSIPGSPKFQPPVPAPRNKIGTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 SRQLVGRTFSDGLATRTLQPPESPRLGRRGLDSMRELPPLSPSLSRRALSPLPTRTTPDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SRQLVGRTFSDGLATRTLQPPESPRLGRRGLDSMRELPPLSPSLSRRALSPLPTRTTPDP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 KLNREVAESPRPRRWAAHGASPEDFSLTLGARGRRTRSPSPTLGESLAPHKGSFSGRLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KLNREVAESPRPRRWAAHGASPEDFSLTLGARGRRTRSPSPTLGESLAPHKGSFSGRLSP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 AYSLGSLTGASPCQSPCVQRKLSSGDLRVPVTRERKNSITEISDNEDDLLEYHRRQRQER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AYSLGSLTGASPCQSPCVQRKLSSGDLRVPVTRERKNSITEISDNEDDLLEYHRRQRQER
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KF0 LREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADGGPEAGELPSIGEATAALALAGRRPSRGLAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADGGPEAGELPSIGEATAALALAGRRPSRGLAGA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KF0 SGRSSEEPGVATQRLWESMERSDEENLKEECSSTESTQQEHEDAPSTKLQGEVLALEEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGRSSEEPGVATQRLWESMERSDEENLKEECSSTESTQQEHEDAPSTKLQGEVLALEEER
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KF0 AQVLGHVEQLKVRVKELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AQVLGHVEQLKVRVKELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KF0 VALETGIQKERDKEAEALETETKLFEDLEFQQLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VALETGIQKERDKEAEALETETKLFEDLEFQQLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KF0 IAKRKERLAILDSQAGQIRAQAVQESERLARDKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IAKRKERLAILDSQAGQIRAQAVQESERLARDKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KF0 RPFPKTTSTLKEVYRSKMDGEATSPLPRTRSGPLPSSSGSSSSSSQLSVATLGRSPSPKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RPFPKTTSTLKEVYRSKMDGEATSPLPRTRSGPLPSSSGSSSSSSQLSVATLGRSPSPKS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KF0 ALLTQNGTGSLPRNLAATLQDIETKRQLALQQKGQQVIEEQRRRLAELKQKAAAEAQCQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ALLTQNGTGSLPRNLAATLQDIETKRQLALQQKGQQVIEEQRRRLAELKQKAAAEAQCQW
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KF0 DALHGAAPFPAGPSGFPPLMHHSILHHLPAGRERGEEGEHAYDTLSLESSDSMETSISTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DALHGAAPFPAGPSGFPPLMHHSILHHLPAGRERGEEGEHAYDTLSLESSDSMETSISTG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KF0 GNSACSPDNMSSASGLDMGKIEEMEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GNSACSPDNMSSASGLDMGKIEEMEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KF0 EQVERRLQSESARRQQLVEKEVKMREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EQVERRLQSESARRQQLVEKEVKMREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KF0 TCLHVVLSSKVCRGYLVKMGGKIKSWKKRWFVFDRLKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TCLHVVLSSKVCRGYLVKMGGKIKSWKKRWFVFDRLKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAI
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310
pF1KF0 EEVYYDHLRSAAKSPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EEVYYDHLRSAAKSPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
1270 1280 1290 1300 1310
>>CCDS8401.1 PHLDB1 gene_id:23187|Hs108|chr11 (1377 aa)
initn: 6290 init1: 5987 opt: 5996 Z-score: 2761.7 bits: 523.4 E(32554): 1.7e-147
Smith-Waterman score: 8353; 95.7% identity (95.7% similar) in 1351 aa overlap (1-1293:1-1351)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MDALNRNQIGPGCQTQTMVQKGPLDLIETGKGLKVQTDKPHLVSLGSGRLSTAITLLPLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MDALNRNQIGPGCQTQTMVQKGPLDLIETGKGLKVQTDKPHLVSLGSGRLSTAITLLPLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 EGRTVIGSAARDISLQGPGLAPEHCYIENLRGTLTLYPCGNACTIDGLPVRQPTRLTQGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 EGRTVIGSAARDISLQGPGLAPEHCYIENLRGTLTLYPCGNACTIDGLPVRQPTRLTQGC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 MLCLGQSTFLRFNHPAEAKWMKSMIPAGGRAPGPPYSPVPAESESLVNGNHTPQTATRGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MLCLGQSTFLRFNHPAEAKWMKSMIPAGGRAPGPPYSPVPAESESLVNGNHTPQTATRGP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 SACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPAATSPLSPMANGGRYLLSPPTSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPAATSPLSPMANGGRYLLSPPTSPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 AMSVGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASHSPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQPPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 AMSVGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASHSPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQPPQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 SRPSGARSESPRLSRKGGHERPPSPGLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SRPSGARSESPRLSRKGGHERPPSPGLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 ISLSEYPASGALSQPTSIPGSPKFQPPVPAPRNKIGTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 ISLSEYPASGALSQPTSIPGSPKFQPPVPAPRNKIGTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 SRQLVGRTFSDGLATRTLQPPESPRLGRRGLDSMRELPPLSPSLSRRALSPLPTRTTPDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SRQLVGRTFSDGLATRTLQPPESPRLGRRGLDSMRELPPLSPSLSRRALSPLPTRTTPDP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 KLNREVAESPRPRRWAAHGASPEDFSLTLGARGRRTRSPSPTLGESLAPHKGSFSGRLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 KLNREVAESPRPRRWAAHGASPEDFSLTLGARGRRTRSPSPTLGESLAPHKGSFSGRLSP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 AYSLGSLTGASPCQSPCVQRKLSSGDLRVPVTRERKNSITEISDNEDDLLEYHRRQRQER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 AYSLGSLTGASPCQSPCVQRKLSSGDLRVPVTRERKNSITEISDNEDDLLEYHRRQRQER
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KF0 LREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADGGPEAGELPSIGEATAALALAGRRPSRGLAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 LREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADGGPEAGELPSIGEATAALALAGRRPSRGLAGA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KF0 SGRSSEEPGVATQRLWESMERSDEENLKEECSSTESTQQEHEDAPSTKLQGEVLALEEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SGRSSEEPGVATQRLWESMERSDEENLKEECSSTESTQQEHEDAPSTKLQGEVLALEEER
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KF0 AQVLGHVEQLKVRVKELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 AQVLGHVEQLKVRVKELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KF0 VALETGIQKERDKEAEALETETKLFEDLEFQQLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 VALETGIQKERDKEAEALETETKLFEDLEFQQLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KF0 IAKRKERLAILDSQAGQIRAQAVQESERLARDKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 IAKRKERLAILDSQAGQIRAQAVQESERLARDKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGG
850 860 870 880 890 900
910
pF1KF0 RPFPKTTSTLKE-----------------------------------------------V
:::::::::::: :
CCDS84 RPFPKTTSTLKEMEKLLLPAVDLEQWYQELMAGLGTGPAAASPHSSPPPLPAKASRQLQV
910 920 930 940 950 960
920 930 940 950 960 970
pF1KF0 YRSKMDGEATSPLPRTRSGPLPSSSGSSSSSSQLSVATLGRSPSPKSALLTQNGTGSLPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 YRSKMDGEATSPLPRTRSGPLPSSSGSSSSSSQLSVATLGRSPSPKSALLTQNGTGSLPR
970 980 990 1000 1010 1020
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KF0 NLAATLQDIETKRQLALQQKGQQVIEEQRRRLAELKQKAAAEAQCQWDALHGAAPFPAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NLAATLQDIETKRQLALQQKGQQVIEEQRRRLAELKQKAAAEAQCQWDALHGAAPFPAGP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KF0 SGFPPLMHHSILHHLPAGRERGEEGEHAYDTLSLESSDSMETSISTGGNSACSPDNMSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SGFPPLMHHSILHHLPAGRERGEEGEHAYDTLSLESSDSMETSISTGGNSACSPDNMSSA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KF0 SGLDMGKIEEMEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SGLDMGKIEEMEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESAR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KF0 RQQLVEKEVKMREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 RQQLVEKEVKMREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KF0 GYLVKMGGKIKSWKKRWFVFDRLKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 GYLVKMGGKIKSWKKRWFVFDRLKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1280 1290 1300 1310
pF1KF0 -----------SPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
::::::::::::::::::::
CCDS84 KRFFRFTMVTESPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
1330 1340 1350 1360 1370
>>CCDS2962.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3 (1210 aa)
initn: 2275 init1: 1268 opt: 1419 Z-score: 667.0 bits: 135.6 E(32554): 7.8e-31
Smith-Waterman score: 2236; 39.8% identity (62.1% similar) in 1265 aa overlap (188-1318:22-1209)
160 170 180 190 200 210
pF1KF0 PVPAESESLVNGNHTPQTATRGPSACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPA
:.: :.:.: :..:.:: : ::
CCDS29 MEEHSYIQKELDLQNGSLEEDSVVHSVENDSQNMMESL---SP----KK--
10 20 30 40
220 230 240 250 260 270
pF1KF0 ATSPLSPMANG---GRYL-LSPPTSPGAMS---VGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASH
.: : ::: : :: :: :. :. : .:.: . .::... .. :: .
CCDS29 YSSSLRFKANGDYSGSYLTLSQPV-PAKRSPSPLGTSVR-SSPSLAKIQ-----GS-KQF
50 60 70 80 90
280 290 300 310 320
pF1KF0 SPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQP----PQSRPSGARSESP-RLSRKGGHERPPSP
: .: . . . : .: ... :. : .. .: :: :::.: . . :
CCDS29 SYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSGYPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSS-
100 110 120 130 140 150
330 340 350 360 370 380
pF1KF0 GLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVV-AISLSEY-PASGALSQPTSIPGSPK
: :. . :.:.:. :. : . . :::. : . : .:.:.:::
CCDS29 --RHKSHDNVYSLGGLEGRKAS-----GSLLAMWNGSSLSDAGPPPISRSGAASMPSSPK
160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KF0 FQPPVPAPRNKI-GTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSPSRQLVGRTFSD-GLATRTLQPP
: . .: .: .: .. .:: . . :. . ..: : .:.:
CCDS29 -----QARKMSIQDSLALQPKLTRHKELASENINLRT--RKYSSSSLSHMGAYSRSL---
210 220 230 240 250
450 460 470 480 490
pF1KF0 ESPRLGRRGLDSMREL--PPLSPSLSRRALSPLPTRTTP------DPKLN-REVAESPRP
::: : ... : :: . ::. . : . : : :: .. . :
CCDS29 --PRLYRATENQLTPLSLPPRN-SLGNSKRTKLGEKDLPHSVIDNDNYLNFSSLSSGALP
260 270 280 290 300 310
500 510 520 530 540
pF1KF0 RRWAAHGASPE-DFSLTLGARGRRTRS---PSPTLGESLAPHKGSFSGRLSPAYSLGSLT
. .: ..: . .:.. : : .:. : . : ..:. : .:..:: :.
CCDS29 YKTSASEGNPYVSSTLSVPASPRVARKMLLASTSSCASDDFDQASYVGT-NPSHSL--LA
320 330 340 350 360 370
550 560 570 580 590
pF1KF0 GASPCQSPCVQRKLSSG-------DLRV---------PVTRERKNSITEISDNEDDLLEY
: : . ..:..: : ::. :. ::::.::. :: ..:::..:
CCDS29 GESD-RVFATRRNFSCGSVEFDEADLESLRQASGTPQPALRERKSSISSIS-GRDDLMDY
380 390 400 410 420
600 610 620 630 640
pF1KF0 HRRQRQERLREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADG----GPEAGELPSIGEATAALAL
:::::.::::::::::::::::::::.:::::.. :. : . .. .:.. : :
CCDS29 HRRQREERLREQEMERLERQRLETILSLCAEYTKPDSRLSTGTTVEDVQKINKELEKLQL
430 440 450 460 470 480
650 660 670 680
pF1KF0 AGRR----------------------PSRGLAGASGRSSEEPGVATQRLWESMER-SDEE
. .. :. ::. .. :. . : : .. : ::
CCDS29 SDEESVFEEALMSPDTRYRCHRKDSLPDADLASCGSLSQSSASFFTPRSTRNDELLSDLT
490 500 510 520 530 540
690 700 710 720 730
pF1KF0 NLKEECSST------ESTQ-----QEHEDAPSTKLQGEVLALEEERAQVLGHVEQLKVRV
::: ::. . : . . :. :.:: : .:...:.:: ..
CCDS29 RTPPPPSSTFPKASSESSYLSILPKTPEGISEEQRSQELAAMEETRIVILNNLEELKQKI
550 560 570 580 590 600
740 750 760 770 780 790
pF1KF0 KELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKLVALETGIQKERDKE
:....:..:: :: .:: :::.::...: . :.::.. .:.:..:.. :: .: :. :.
CCDS29 KDINDQMDESFRELDMECALLDGEQKSETTELMKEKEILDHLNRKIAELEKNIVGEKTKD
610 620 630 640 650 660
800 810 820 830 840 850
pF1KF0 AEALETETKLFEDLEFQQLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRSIAKRKERLAILDSQ
:. :..:.: ::::::::::.:::..::.: : ::: :: :.:..:::... : .:
CCDS29 ADLLDVESKHFEDLEFQQLEHESRLDEEKENLTQQLLREVAEYQRNIVSRKEKISALKKQ
670 680 690 700 710 720
860 870 880 890 900 910
pF1KF0 AGQIRAQAVQESERLARDKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGGRPFPKTTSTLKEVY
:..: :: .:.......:: ...::.:::.: ::..: ::.::. :: . .:::: :
CCDS29 ANHIVQQAQREQDHFVKEKNNLIMMLQREKENLCNLEKKYSSLSGGKGFPVNPNTLKEGY
730 740 750 760 770 780
920 930
pF1KF0 RS----------------------KMDGEATSPL-------PRTR---------------
: :. :: : :...
CCDS29 ISVNEINEPCGNSTNLSPSTQFPADADAVATEPATAVLASQPQSKEHFRSLEERKKQHKE
790 800 810 820 830 840
940 950 960 970 980
pF1KF0 ----SGPLPSSSGSSSSSSQLSVATLGRSPSPKSAL-LTQ-NGTGS-LPRNLAATLQDIE
: :: .. .:: : ..: ::.::: .::. : : : :. :: :: .::: .: :
CCDS29 GLYLSDTLPRKKTTSSISPHFSSATMGRSITPKAHLPLGQSNSCGSVLPPSLAAMAKDSE
850 860 870 880 890 900
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KF0 TKRQLALQQKGQQVIEEQRRRLAELKQKAAAEAQCQWDALHGAAPFPAGPSGFPPLMHHS
..:.: . ..: . : .:. .:. ...:.:.. ...: .: ::
CCDS29 SRRML--RGYNHQQMSEGHRQKSEFYNRTASESNVYLNSFH-----------YPD---HS
910 920 930 940 950
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KF0 ILHHLPAGRERGEEGEHAYDTLSLESSDSMETSISTGGNSACSPDNMSSASGLDMGKIEE
..:.:::::.:::::::::: ::::::.:::: ....:::
CCDS29 Y-------------KDQAFDTLSLDSSDSMETSIS-----ACSPDNISSASTSNIARIEE
960 970 980 990
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KF0 MEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESARRQQLVEKEVK
::..::.:::::.::.:::::::: ...:::::.:::: .:.::: :...::.:.:::::
CCDS29 MERLLKQAHAEKTRLLESREREMEAKKRALEEEKRRREILEKRLQEETSQRQKLIEKEVK
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KF0 MREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCRGYLVKMGGKI
.::.: .::::::::::.:::::::..:.:..::..::: :: .. :.:::.:.::::::
CCDS29 IRERQRAQARPLTRYLPVRKEDFDLRSHVETAGHNIDTCYHVSITEKTCRGFLIKMGGKI
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KF0 KSWKKRWFVFDRLKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAKSPNPALTFCV
:.:::::::::: :::.:::.::::::::::::::::::::::::..: ::::: ::: :
CCDS29 KTWKKRWFVFDRNKRTFSYYADKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLKNANKSPNPLLTFSV
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1290 1300 1310
pF1KF0 KTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
:::::.::::::: ::::::::::::::::::.:.
CCDS29 KTHDRIYYMVAPSPEAMRIWMDVIVTGAEGYTHFLL
1180 1190 1200 1210
>>CCDS46885.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3 (1237 aa)
initn: 2275 init1: 1268 opt: 1419 Z-score: 666.9 bits: 135.6 E(32554): 8e-31
Smith-Waterman score: 2236; 39.8% identity (62.1% similar) in 1265 aa overlap (188-1318:49-1236)
160 170 180 190 200 210
pF1KF0 PVPAESESLVNGNHTPQTATRGPSACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPA
:.: :.:.: :..:.:: : ::
CCDS46 VQHFDSSKIMEEHSYIQKELDLQNGSLEEDSVVHSVENDSQNMMESL---SP----KK--
20 30 40 50 60
220 230 240 250 260 270
pF1KF0 ATSPLSPMANG---GRYL-LSPPTSPGAMS---VGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASH
.: : ::: : :: :: :. :. : .:.: . .::... .. :: .
CCDS46 YSSSLRFKANGDYSGSYLTLSQPV-PAKRSPSPLGTSVR-SSPSLAKIQ-----GS-KQF
70 80 90 100 110 120
280 290 300 310 320
pF1KF0 SPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQP----PQSRPSGARSESP-RLSRKGGHERPPSP
: .: . . . : .: ... :. : .. .: :: :::.: . . :
CCDS46 SYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSGYPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSS-
130 140 150 160 170 180
330 340 350 360 370 380
pF1KF0 GLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVV-AISLSEY-PASGALSQPTSIPGSPK
: :. . :.:.:. :. : . . :::. : . : .:.:.:::
CCDS46 --RHKSHDNVYSLGGLEGRKAS-----GSLLAMWNGSSLSDAGPPPISRSGAASMPSSPK
190 200 210 220 230
390 400 410 420 430 440
pF1KF0 FQPPVPAPRNKI-GTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSPSRQLVGRTFSD-GLATRTLQPP
: . .: .: .: .. .:: . . :. . ..: : .:.:
CCDS46 -----QARKMSIQDSLALQPKLTRHKELASENINLRT--RKYSSSSLSHMGAYSRSL---
240 250 260 270 280
450 460 470 480 490
pF1KF0 ESPRLGRRGLDSMREL--PPLSPSLSRRALSPLPTRTTP------DPKLN-REVAESPRP
::: : ... : :: . ::. . : . : : :: .. . :
CCDS46 --PRLYRATENQLTPLSLPPRN-SLGNSKRTKLGEKDLPHSVIDNDNYLNFSSLSSGALP
290 300 310 320 330 340
500 510 520 530 540
pF1KF0 RRWAAHGASPE-DFSLTLGARGRRTRS---PSPTLGESLAPHKGSFSGRLSPAYSLGSLT
. .: ..: . .:.. : : .:. : . : ..:. : .:..:: :.
CCDS46 YKTSASEGNPYVSSTLSVPASPRVARKMLLASTSSCASDDFDQASYVGT-NPSHSL--LA
350 360 370 380 390
550 560 570 580 590
pF1KF0 GASPCQSPCVQRKLSSG-------DLRV---------PVTRERKNSITEISDNEDDLLEY
: : . ..:..: : ::. :. ::::.::. :: ..:::..:
CCDS46 GESD-RVFATRRNFSCGSVEFDEADLESLRQASGTPQPALRERKSSISSIS-GRDDLMDY
400 410 420 430 440 450
600 610 620 630 640
pF1KF0 HRRQRQERLREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADG----GPEAGELPSIGEATAALAL
:::::.::::::::::::::::::::.:::::.. :. : . .. .:.. : :
CCDS46 HRRQREERLREQEMERLERQRLETILSLCAEYTKPDSRLSTGTTVEDVQKINKELEKLQL
460 470 480 490 500 510
650 660 670 680
pF1KF0 AGRR----------------------PSRGLAGASGRSSEEPGVATQRLWESMER-SDEE
. .. :. ::. .. :. . : : .. : ::
CCDS46 SDEESVFEEALMSPDTRYRCHRKDSLPDADLASCGSLSQSSASFFTPRSTRNDELLSDLT
520 530 540 550 560 570
690 700 710 720 730
pF1KF0 NLKEECSST------ESTQ-----QEHEDAPSTKLQGEVLALEEERAQVLGHVEQLKVRV
::: ::. . : . . :. :.:: : .:...:.:: ..
CCDS46 RTPPPPSSTFPKASSESSYLSILPKTPEGISEEQRSQELAAMEETRIVILNNLEELKQKI
580 590 600 610 620 630
740 750 760 770 780 790
pF1KF0 KELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKLVALETGIQKERDKE
:....:..:: :: .:: :::.::...: . :.::.. .:.:..:.. :: .: :. :.
CCDS46 KDINDQMDESFRELDMECALLDGEQKSETTELMKEKEILDHLNRKIAELEKNIVGEKTKD
640 650 660 670 680 690
800 810 820 830 840 850
pF1KF0 AEALETETKLFEDLEFQQLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRSIAKRKERLAILDSQ
:. :..:.: ::::::::::.:::..::.: : ::: :: :.:..:::... : .:
CCDS46 ADLLDVESKHFEDLEFQQLEHESRLDEEKENLTQQLLREVAEYQRNIVSRKEKISALKKQ
700 710 720 730 740 750
860 870 880 890 900 910
pF1KF0 AGQIRAQAVQESERLARDKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGGRPFPKTTSTLKEVY
:..: :: .:.......:: ...::.:::.: ::..: ::.::. :: . .:::: :
CCDS46 ANHIVQQAQREQDHFVKEKNNLIMMLQREKENLCNLEKKYSSLSGGKGFPVNPNTLKEGY
760 770 780 790 800 810
920 930
pF1KF0 RS----------------------KMDGEATSPL-------PRTR---------------
: :. :: : :...
CCDS46 ISVNEINEPCGNSTNLSPSTQFPADADAVATEPATAVLASQPQSKEHFRSLEERKKQHKE
820 830 840 850 860 870
940 950 960 970 980
pF1KF0 ----SGPLPSSSGSSSSSSQLSVATLGRSPSPKSAL-LTQ-NGTGS-LPRNLAATLQDIE
: :: .. .:: : ..: ::.::: .::. : : : :. :: :: .::: .: :
CCDS46 GLYLSDTLPRKKTTSSISPHFSSATMGRSITPKAHLPLGQSNSCGSVLPPSLAAMAKDSE
880 890 900 910 920 930
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KF0 TKRQLALQQKGQQVIEEQRRRLAELKQKAAAEAQCQWDALHGAAPFPAGPSGFPPLMHHS
..:.: . ..: . : .:. .:. ...:.:.. ...: .: ::
CCDS46 SRRML--RGYNHQQMSEGHRQKSEFYNRTASESNVYLNSFH-----------YPD---HS
940 950 960 970
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KF0 ILHHLPAGRERGEEGEHAYDTLSLESSDSMETSISTGGNSACSPDNMSSASGLDMGKIEE
..:.:::::.:::::::::: ::::::.:::: ....:::
CCDS46 Y-------------KDQAFDTLSLDSSDSMETSIS-----ACSPDNISSASTSNIARIEE
980 990 1000 1010 1020
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KF0 MEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESARRQQLVEKEVK
::..::.:::::.::.:::::::: ...:::::.:::: .:.::: :...::.:.:::::
CCDS46 MERLLKQAHAEKTRLLESREREMEAKKRALEEEKRRREILEKRLQEETSQRQKLIEKEVK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KF0 MREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCRGYLVKMGGKI
.::.: .::::::::::.:::::::..:.:..::..::: :: .. :.:::.:.::::::
CCDS46 IRERQRAQARPLTRYLPVRKEDFDLRSHVETAGHNIDTCYHVSITEKTCRGFLIKMGGKI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KF0 KSWKKRWFVFDRLKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAKSPNPALTFCV
:.:::::::::: :::.:::.::::::::::::::::::::::::..: ::::: ::: :
CCDS46 KTWKKRWFVFDRNKRTFSYYADKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLKNANKSPNPLLTFSV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1290 1300 1310
pF1KF0 KTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
:::::.::::::: ::::::::::::::::::.:.
CCDS46 KTHDRIYYMVAPSPEAMRIWMDVIVTGAEGYTHFLL
1210 1220 1230
>>CCDS46886.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3 (1253 aa)
initn: 2102 init1: 1268 opt: 1366 Z-score: 642.5 bits: 131.1 E(32554): 1.8e-29
Smith-Waterman score: 2144; 38.5% identity (60.1% similar) in 1308 aa overlap (188-1318:22-1252)
160 170 180 190 200 210
pF1KF0 PVPAESESLVNGNHTPQTATRGPSACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPA
:.: :.:.: :..:.:: : ::
CCDS46 MEEHSYIQKELDLQNGSLEEDSVVHSVENDSQNMMESL---SP----KK--
10 20 30 40
220 230 240 250 260 270
pF1KF0 ATSPLSPMANG---GRYL-LSPPTSPGAMS---VGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASH
.: : ::: : :: :: :. :. : .:.: . .::... .. :: .
CCDS46 YSSSLRFKANGDYSGSYLTLSQPV-PAKRSPSPLGTSVR-SSPSLAKIQ-----GS-KQF
50 60 70 80 90
280 290 300 310 320
pF1KF0 SPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQP----PQSRPSGARSESP-RLSRKGGHERPPSP
: .: . . . : .: ... :. : .. .: :: :::.: . . :
CCDS46 SYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSGYPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSS-
100 110 120 130 140 150
330 340 350 360 370 380
pF1KF0 GLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVV-AISLSEY-PASGALSQPTSIPGSPK
: :. . :.:.:. :. : . . :::. : . : .:.:.:::
CCDS46 --RHKSHDNVYSLGGLEGRKAS-----GSLLAMWNGSSLSDAGPPPISRSGAASMPSSPK
160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KF0 FQPPVPAPRNKI-GTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSPSRQLVGRTFSD-GLATRTLQPP
: . .: .: .: .. .:: . . :. . ..: : .:.:
CCDS46 -----QARKMSIQDSLALQPKLTRHKELASENINLRT--RKYSSSSLSHMGAYSRSL---
210 220 230 240 250
450 460 470 480 490
pF1KF0 ESPRLGRRGLDSMREL--PPLSPSLSRRALSPLPTRTTP------DPKLN-REVAESPRP
::: : ... : :: . ::. . : . : : :: .. . :
CCDS46 --PRLYRATENQLTPLSLPPRN-SLGNSKRTKLGEKDLPHSVIDNDNYLNFSSLSSGALP
260 270 280 290 300 310
500 510 520 530 540
pF1KF0 RRWAAHGASPE-DFSLTLGARGRRTRS---PSPTLGESLAPHKGSFSGRLSPAYSLGSLT
. .: ..: . .:.. : : .:. : . : ..:. : .:..:: :.
CCDS46 YKTSASEGNPYVSSTLSVPASPRVARKMLLASTSSCASDDFDQASYVGT-NPSHSL--LA
320 330 340 350 360 370
550 560 570 580 590
pF1KF0 GASPCQSPCVQRKLSSG-------DLRV---------PVTRERKNSITEISDNEDDLLEY
: : . ..:..: : ::. :. ::::.::. :: ..:::..:
CCDS46 GESD-RVFATRRNFSCGSVEFDEADLESLRQASGTPQPALRERKSSISSIS-GRDDLMDY
380 390 400 410 420
600 610 620 630 640
pF1KF0 HRRQRQERLREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADG----GPEAGELPSIGEATAALAL
:::::.::::::::::::::::::::.:::::.. :. : . .. .:.. : :
CCDS46 HRRQREERLREQEMERLERQRLETILSLCAEYTKPDSRLSTGTTVEDVQKINKELEKLQL
430 440 450 460 470 480
650 660 670 680
pF1KF0 AGRR----------------------PSRGLAGASGRSSEEPGVATQRLWESMER-SDEE
. .. :. ::. .. :. . : : .. : ::
CCDS46 SDEESVFEEALMSPDTRYRCHRKDSLPDADLASCGSLSQSSASFFTPRSTRNDELLSDLT
490 500 510 520 530 540
690 700 710 720 730
pF1KF0 NLKEECSST------ESTQ-----QEHEDAPSTKLQGEVLALEEERAQVLGHVEQLKVRV
::: ::. . : . . :. :.:: : .:...:.:: ..
CCDS46 RTPPPPSSTFPKASSESSYLSILPKTPEGISEEQRSQELAAMEETRIVILNNLEELKQKI
550 560 570 580 590 600
740 750 760 770 780 790
pF1KF0 KELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKLVALETGIQKERDKE
:....:..:: :: .:: :::.::...: . :.::.. .:.:..:.. :: .: :. ::
CCDS46 KDINDQMDESFRELDMECALLDGEQKSETTELMKEKEILDHLNRKIAELEKNIVGEKTKE
610 620 630 640 650 660
800 810
pF1KF0 -------------------------------------------AEALETETKLFEDLEFQ
:. :..:.: :::::::
CCDS46 KVKLDAEREKLERLQELYSEQKTQLDNCPESMREQLQQQLKRDADLLDVESKHFEDLEFQ
670 680 690 700 710 720
820 830 840 850 860 870
pF1KF0 QLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRSIAKRKERLAILDSQAGQIRAQAVQESERLAR
:::.:::..::.: : ::: :: :.:..:::... : .::..: :: .:......
CCDS46 QLEHESRLDEEKENLTQQLLREVAEYQRNIVSRKEKISALKKQANHIVQQAQREQDHFVK
730 740 750 760 770 780
880 890 900 910
pF1KF0 DKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGGRPFPKTTSTLKEVYRS---------------
.:: ...::.:::.: ::..: ::.::. :: . .:::: : :
CCDS46 EKNNLIMMLQREKENLCNLEKKYSSLSGGKGFPVNPNTLKEGYISVNEINEPCGNSTNLS
790 800 810 820 830 840
920 930 940
pF1KF0 -------KMDGEATSPL-------PRTR-------------------SGPLPSSSGSSSS
:. :: : :... : :: .. .::
CCDS46 PSTQFPADADAVATEPATAVLASQPQSKEHFRSLEERKKQHKEGLYLSDTLPRKKTTSSI
850 860 870 880 890 900
950 960 970 980 990 1000
pF1KF0 SSQLSVATLGRSPSPKSAL-LTQ-NGTGS-LPRNLAATLQDIETKRQLALQQKGQQVIEE
: ..: ::.::: .::. : : : :. :: :: .::: .: :..:.: . ..: . :
CCDS46 SPHFSSATMGRSITPKAHLPLGQSNSCGSVLPPSLAAMAKDSESRRML--RGYNHQQMSE
910 920 930 940 950 960
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KF0 QRRRLAELKQKAAAEAQCQWDALHGAAPFPAGPSGFPPLMHHSILHHLPAGRERGEEGEH
.:. .:. ...:.:.. ...: .: :: ..
CCDS46 GHRQKSEFYNRTASESNVYLNSFH-----------YPD---HSY-------------KDQ
970 980 990
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KF0 AYDTLSLESSDSMETSISTGGNSACSPDNMSSASGLDMGKIEEMEKMLKEAHAEKNRLME
:.:::::.:::::::::: ::::::.:::: ....:::::..::.:::::.::.:
CCDS46 AFDTLSLDSSDSMETSIS-----ACSPDNISSASTSNIARIEEMERLLKQAHAEKTRLLE
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KF0 SREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESARRQQLVEKEVKMREKQFSQARPLTRYLP
::::::: ...:::::.:::: .:.::: :...::.:.:::::.::.: .::::::::::
CCDS46 SREREMEAKKRALEEEKRRREILEKRLQEETSQRQKLIEKEVKIRERQRAQARPLTRYLP
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KF0 IRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCRGYLVKMGGKIKSWKKRWFVFDRLKRTL
.:::::::..:.:..::..::: :: .. :.:::.:.:::::::.:::::::::: :::.
CCDS46 VRKEDFDLRSHVETAGHNIDTCYHVSITEKTCRGFLIKMGGKIKTWKKRWFVFDRNKRTF
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KF0 SYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAKSPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAM
:::.::::::::::::::::::::::::..: ::::: ::: ::::::.::::::: :::
CCDS46 SYYADKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLKNANKSPNPLLTFSVKTHDRIYYMVAPSPEAM
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1310
pF1KF0 RIWMDVIVTGAEGYTQFMN
:::::::::::::::.:.
CCDS46 RIWMDVIVTGAEGYTHFLL
1240 1250
>>CCDS12621.2 PHLDB3 gene_id:653583|Hs108|chr19 (640 aa)
initn: 937 init1: 638 opt: 699 Z-score: 341.6 bits: 74.5 E(32554): 1e-12
Smith-Waterman score: 840; 33.2% identity (53.1% similar) in 742 aa overlap (590-1312:21-635)
560 570 580 590 600 610
pF1KF0 RKLSSGDLRVPVTRERKNSITEISDNEDDLLEYHRRQRQERLREQEM-ERLERQRLETIL
.: . . . :. :::: : : . .
CCDS12 MGTRSSPEEGTPPPLVPECDVEVQPQGHPEESREQEASEVLAEPSSRGGA
10 20 30 40 50
620 630 640 650 660 670
pF1KF0 NLCAEYSRADGGPEAGELPSIGEATAALALAGRRP--SRGLAGASGRSSEEPGVATQRLW
. :: .. : . . ::: .:.:. : . . :. : . . : :.:
CCDS12 EQQAEEEEVGEGSSTESSRDAPEATPPIAMAATPPASTSSREGVRGAARRLQG---QQL-
60 70 80 90 100
680 690 700 710 720 730
pF1KF0 ESMERSD--EENLKEECSSTESTQQEHEDAPST---KLQGEVLALEEERAQVLGHVEQLK
:.. : :. .:: . . . : : . .: :: .: ..:. :. .::
CCDS12 EALTRVALMEQRVKELQRQRKELRIEMEVEVALLRGELAGERVAARREEEQLRELLEQQA
110 120 130 140 150 160
740 750 760 770 780 790
pF1KF0 VRVKELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAER-ALLQKEQKAVDQLQEKLVALETGIQKE
. .. .:: .. :. .:: :.: :. : : : ... :: .:.:. :.:.
CCDS12 ASEQRGRQQREQEQRRLSQERDRLEGLRQRLRKAQGQLDSQPEDQ-RERLLQ---GVQEM
170 180 190 200 210 220
800 810 820 830 840
pF1KF0 RDKEAEALETETKLFEDLEFQQLERESRVEEE-RELAGQGLLRSKA-ELLRSIAKRKE--
: : :.. . .::::::::::::: ::: :. : . :. :: :.:....
CCDS12 R----EQLDVAQRAYEDLEFQQLERESRQEEEDRDSPGPQVPDPKVQELQASMAQHRRGA
230 240 250 260 270
850 860 870 880 890 900
pF1KF0 ---RLAILDSQAGQIRAQAVQESERLARDKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGGRPF
:. .:. : .. : . ::. :.: :. .:: :..:. .: :: . : : :
CCDS12 LQHRIRVLEEQLKSLGEQMAAESRGLSRKKEEALQALSQERSRL--LELNCLQGTPGGDF
280 290 300 310 320 330
910 920 930 940 950 960
pF1KF0 PKTTSTL-KEVYRSKMDGEATSPLPRTRSGPLPSSSGSSSSSSQLSVATLGRSPSPKSAL
. . .: : .. .: : . . . . :... .:: .:: . : ....
CCDS12 SEPNPALTKLLFTQKTDRQLL-----VLQDAVAHSAATPTSSCLFSVHS-----SLQGSI
340 350 360 370 380
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KF0 LTQNGTGSLPRNLAATLQDIETKRQLALQQKGQQVIEEQRRRLAELKQKAAAEAQCQWDA
: :::::: :: .:.:. : :. .: .
CCDS12 GLQR-TGSLPR-----------KRGERGSQRGSP------RPLSF---------HCTESL
390 400 410
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KF0 LHGAAPFPAGPSGFPPLMHHSILHHLPAGRERGEEGEHAYDTLSLESSDSMETSISTGGN
.: : .: :: ::. . : :: ::
CCDS12 EASALPPAVGDSGRYPLY-----QLLNCGR----------------------------GN
420 430 440
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KF0 S--ACSPDNMSSASGLDMGKIEEMEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRR
: : :: : .::..:..: ::..::...::
CCDS12 SCGAIHPD------------IAHMERLLQQAMAERERLLKARE-----------------
450 460 470
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KF0 EQVERRLQSESARRQQLVEKEVKMREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVD
..: .. :. . : : : . .::. :.:. ::. .
CCDS12 -GTRRGTEGSSGPAVPAITA-------------PPTPPHPPGPRILDLRQHLEGWGHNPE
480 490 500 510 520
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KF0 TCLHVVLSSKVCRGYLVKMGGKIKSWKKRWFVFDRLKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAI
.: :: .:. ::: ::::::.::.:.:::: ::: : :.::.::.:::::::::::::
CCDS12 NCPHVQVSGCCCRGPLVKMGGRIKTWRKRWFCFDRQARRLAYYADKEETKLKGVIYFQAI
530 540 550 560 570 580
1270 1280 1290 1300 1310
pF1KF0 EEVYYDHLRSAAKSPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
::::::::: : ::::: :::::::..::.:::::: ::::::::::::.:.
CCDS12 EEVYYDHLRCAFKSPNPRLTFCVKTYERLFYMVAPSPEAMRIWMDVIVTAADENHAP
590 600 610 620 630 640
1319 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 06:35:40 2016 done: Sat Nov 5 06:35:41 2016
Total Scan time: 6.750 Total Display time: 0.370
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]