Result of FASTA (ccds) for
pF1KF0188
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KF0188, 1277 aa
1>>>pF1KF0188 1277 - 1277 aa - 1277 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8696+/-0.0011; mu= 2.6280+/- 0.066
mean_var=279.6539+/-56.426, 0's: 0 Z-trim(112.5): 97 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.076694
statistics sampled from 13164 (13261) to 13164 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.731), E-opt: 0.2 (0.407), width: 16
Scan time: 5.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53857.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 (1277) 8684 975.5 0
CCDS9305.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 652) 4446 506.4 1e-142
CCDS66517.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 574) 3793 434.1 5.1e-121
CCDS66518.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 596) 3793 434.1 5.3e-121
CCDS73553.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 512) 2644 306.9 8.8e-83
CCDS2165.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2 ( 690) 2352 274.7 5.9e-73
CCDS42754.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2 ( 670) 2225 260.6 9.7e-69
CCDS35315.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 516) 2163 253.7 9.3e-67
CCDS83477.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 495) 2084 244.9 3.8e-64
CCDS55430.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 463) 1847 218.7 2.9e-56
CCDS55429.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 414) 1808 214.3 5.2e-55
CCDS6201.1 PREX2 gene_id:80243|Hs108|chr8 (1606) 651 86.8 5e-16
CCDS13410.1 PREX1 gene_id:57580|Hs108|chr20 (1659) 602 81.4 2.2e-14
>>CCDS53857.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 (1277 aa)
initn: 8684 init1: 8684 opt: 8684 Z-score: 5206.1 bits: 975.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8684; 100.0% identity (100.0% similar) in 1277 aa overlap (1-1277:1-1277)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MTQAAVRPWAPCLENMTTAPNGLGPGPAAPCAGSDLKDAKMVTSLACGNGVCGCSPGGDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MTQAAVRPWAPCLENMTTAPNGLGPGPAAPCAGSDLKDAKMVTSLACGNGVCGCSPGGDT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 DTQEAKLSPAKLVRLFSTSRKRTGAHPERPHSMVLVGNSSTWNTLASFRKMGSFKKLKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DTQEAKLSPAKLVRLFSTSRKRTGAHPERPHSMVLVGNSSTWNTLASFRKMGSFKKLKSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 VLKGIQSREGSNACSKGEASEHGLGKSIPNGAVPGAQASRGSPLAPGPACGALRPAEWGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VLKGIQSREGSNACSKGEASEHGLGKSIPNGAVPGAQASRGSPLAPGPACGALRPAEWGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 LDGSDLEDTDDAFQRSTHRSRSLRRAYGLGRICLLDAPQNHATPTIATGQVPAVCEILVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LDGSDLEDTDDAFQRSTHRSRSLRRAYGLGRICLLDAPQNHATPTIATGQVPAVCEILVR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 DPENNSMGYRRSKSTDNLAFLKKSSFKRKSTSNLADLRTAHDARVPQRTLSSSSTDSQKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DPENNSMGYRRSKSTDNLAFLKKSSFKRKSTSNLADLRTAHDARVPQRTLSSSSTDSQKL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 GSGRTKRWRSPIRAKDFDRVFKLVSNVTEAAWRRESPRSGAPSPGEASLRLQAHSRLHDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GSGRTKRWRSPIRAKDFDRVFKLVSNVTEAAWRRESPRSGAPSPGEASLRLQAHSRLHDD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 YSRRVSRSTEQDSRRGGAVMHGTTATCTVAPGFGSATSKGPHLDADTAVFPLETKSSWAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YSRRVSRSTEQDSRRGGAVMHGTTATCTVAPGFGSATSKGPHLDADTAVFPLETKSSWAV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 ESDSSCTCSSLPSPIVQDVLSKDSCDPNAGSQLTFDPEQPPTPLRPTTPKPQSPQSPQSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ESDSSCTCSSLPSPIVQDVLSKDSCDPNAGSQLTFDPEQPPTPLRPTTPKPQSPQSPQSP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 GAGSASCHSNHSALSANSEESEGRAEEPAQREPGPVSLQDPLEATHGDEGSKDLLVNIGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GAGSASCHSNHSALSANSEESEGRAEEPAQREPGPVSLQDPLEATHGDEGSKDLLVNIGV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 AAGPEEKEKEEVVPDGPWRRSSSQDEERTEAQRTPKRRWGSGRRPRPRPFSDYGQLASRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AAGPEEKEKEEVVPDGPWRRSSSQDEERTEAQRTPKRRWGSGRRPRPRPFSDYGQLASRS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KF0 LSIPEDSVAADPQKEDRVDEDPQASMTSASPEDQNAPVGCPKGARRRRPISVIGGVSLYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LSIPEDSVAADPQKEDRVDEDPQASMTSASPEDQNAPVGCPKGARRRRPISVIGGVSLYG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KF0 TNQTEELDNLLTQPASRPPMPAHQVPPYKAVSARFRPFTFSQSTPIGLDRVGRRRQMRAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TNQTEELDNLLTQPASRPPMPAHQVPPYKAVSARFRPFTFSQSTPIGLDRVGRRRQMRAS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KF0 NVSSDGGTEPSALVDDNGSEEDFSYEDLCQASPRYLQPGGEQLAINELISDGNVVCAEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NVSSDGGTEPSALVDDNGSEEDFSYEDLCQASPRYLQPGGEQLAINELISDGNVVCAEAL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KF0 WDHVTMDDQELGFKAGDVIQVLEASNKDWWWGRSEDKEAWFPASFVRLRVNQEELSENSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 WDHVTMDDQELGFKAGDVIQVLEASNKDWWWGRSEDKEAWFPASFVRLRVNQEELSENSS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KF0 STPSEEQDEEASQSRHRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 STPSEEQDEEASQSRHRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KF0 MFTVAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MFTVAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYC
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KF0 NNHPGACLELANLMKQGKYRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NNHPGACLELANLMKQGKYRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KF0 YTTQEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLINERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YTTQEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLINERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KF0 LIHSGELTKITKQGKSQQRTFFLFDHQLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LIHSGELTKITKQGKSQQRTFFLFDHQLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KF0 RDKDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RDKDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KF0 NQKKLAMLNAQKAGHGKSKGYNRCPVAPPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NQKKLAMLNAQKAGHGKSKGYNRCPVAPPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270
pF1KF0 KSSLFWHTFNRLTPFRK
:::::::::::::::::
CCDS53 KSSLFWHTFNRLTPFRK
1270
>>CCDS9305.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 (652 aa)
initn: 4446 init1: 4446 opt: 4446 Z-score: 2675.8 bits: 506.4 E(32554): 1e-142
Smith-Waterman score: 4446; 100.0% identity (100.0% similar) in 652 aa overlap (626-1277:1-652)
600 610 620 630 640 650
pF1KF0 LASRSLSIPEDSVAADPQKEDRVDEDPQASMTSASPEDQNAPVGCPKGARRRRPISVIGG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MTSASPEDQNAPVGCPKGARRRRPISVIGG
10 20 30
660 670 680 690 700 710
pF1KF0 VSLYGTNQTEELDNLLTQPASRPPMPAHQVPPYKAVSARFRPFTFSQSTPIGLDRVGRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 VSLYGTNQTEELDNLLTQPASRPPMPAHQVPPYKAVSARFRPFTFSQSTPIGLDRVGRRR
40 50 60 70 80 90
720 730 740 750 760 770
pF1KF0 QMRASNVSSDGGTEPSALVDDNGSEEDFSYEDLCQASPRYLQPGGEQLAINELISDGNVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 QMRASNVSSDGGTEPSALVDDNGSEEDFSYEDLCQASPRYLQPGGEQLAINELISDGNVV
100 110 120 130 140 150
780 790 800 810 820 830
pF1KF0 CAEALWDHVTMDDQELGFKAGDVIQVLEASNKDWWWGRSEDKEAWFPASFVRLRVNQEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 CAEALWDHVTMDDQELGFKAGDVIQVLEASNKDWWWGRSEDKEAWFPASFVRLRVNQEEL
160 170 180 190 200 210
840 850 860 870 880 890
pF1KF0 SENSSSTPSEEQDEEASQSRHRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 SENSSSTPSEEQDEEASQSRHRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQC
220 230 240 250 260 270
900 910 920 930 940 950
pF1KF0 RKHTGMFTVAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 RKHTGMFTVAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAI
280 290 300 310 320 330
960 970 980 990 1000 1010
pF1KF0 YSEYCNNHPGACLELANLMKQGKYRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 YSEYCNNHPGACLELANLMKQGKYRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQL
340 350 360 370 380 390
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KF0 AELLKYTTQEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLINERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 AELLKYTTQEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLINERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDIL
400 410 420 430 440 450
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KF0 DRSSELIHSGELTKITKQGKSQQRTFFLFDHQLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 DRSSELIHSGELTKITKQGKSQQRTFFLFDHQLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELV
460 470 480 490 500 510
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KF0 DLGDGRDKDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 DLGDGRDKDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMG
520 530 540 550 560 570
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KF0 MEISENQKKLAMLNAQKAGHGKSKGYNRCPVAPPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MEISENQKKLAMLNAQKAGHGKSKGYNRCPVAPPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGL
580 590 600 610 620 630
1260 1270
pF1KF0 AEPKRKSSLFWHTFNRLTPFRK
::::::::::::::::::::::
CCDS93 AEPKRKSSLFWHTFNRLTPFRK
640 650
>>CCDS66517.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 (574 aa)
initn: 3793 init1: 3793 opt: 3793 Z-score: 2286.1 bits: 434.1 E(32554): 5.1e-121
Smith-Waterman score: 3793; 100.0% identity (100.0% similar) in 556 aa overlap (722-1277:19-574)
700 710 720 730 740 750
pF1KF0 SARFRPFTFSQSTPIGLDRVGRRRQMRASNVSSDGGTEPSALVDDNGSEEDFSYEDLCQA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MVARGEIARFWSLESLHLVSSDGGTEPSALVDDNGSEEDFSYEDLCQA
10 20 30 40
760 770 780 790 800 810
pF1KF0 SPRYLQPGGEQLAINELISDGNVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGDVIQVLEASNKDWWW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SPRYLQPGGEQLAINELISDGNVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGDVIQVLEASNKDWWW
50 60 70 80 90 100
820 830 840 850 860 870
pF1KF0 GRSEDKEAWFPASFVRLRVNQEELSENSSSTPSEEQDEEASQSRHRHCENKQQMRTNVIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GRSEDKEAWFPASFVRLRVNQEELSENSSSTPSEEQDEEASQSRHRHCENKQQMRTNVIR
110 120 130 140 150 160
880 890 900 910 920 930
pF1KF0 EIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDLEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDLEKQ
170 180 190 200 210 220
940 950 960 970 980 990
pF1KF0 YNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMKQGKYRHFFEACRLLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 YNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMKQGKYRHFFEACRLLQQ
230 240 250 260 270 280
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KF0 MIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLINERKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLINERKR
290 300 310 320 330 340
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KF0 KLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQGKSQQRTFFLFDHQLVSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQGKSQQRTFFLFDHQLVSC
350 360 370 380 390 400
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KF0 KKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQ
410 420 430 440 450 460
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KF0 EDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQKKLAMLNAQKAGHGKSKGYNRCPVAPPHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQKKLAMLNAQKAGHGKSKGYNRCPVAPPHQ
470 480 490 500 510 520
1240 1250 1260 1270
pF1KF0 GLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHTFNRLTPFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHTFNRLTPFRK
530 540 550 560 570
>>CCDS66518.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 (596 aa)
initn: 3793 init1: 3793 opt: 3793 Z-score: 2285.9 bits: 434.1 E(32554): 5.3e-121
Smith-Waterman score: 3793; 100.0% identity (100.0% similar) in 556 aa overlap (722-1277:41-596)
700 710 720 730 740 750
pF1KF0 SARFRPFTFSQSTPIGLDRVGRRRQMRASNVSSDGGTEPSALVDDNGSEEDFSYEDLCQA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KKQRKKLDQGLILKKEKYRKEKKCASLSFEVSSDGGTEPSALVDDNGSEEDFSYEDLCQA
20 30 40 50 60 70
760 770 780 790 800 810
pF1KF0 SPRYLQPGGEQLAINELISDGNVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGDVIQVLEASNKDWWW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SPRYLQPGGEQLAINELISDGNVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGDVIQVLEASNKDWWW
80 90 100 110 120 130
820 830 840 850 860 870
pF1KF0 GRSEDKEAWFPASFVRLRVNQEELSENSSSTPSEEQDEEASQSRHRHCENKQQMRTNVIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GRSEDKEAWFPASFVRLRVNQEELSENSSSTPSEEQDEEASQSRHRHCENKQQMRTNVIR
140 150 160 170 180 190
880 890 900 910 920 930
pF1KF0 EIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDLEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDLEKQ
200 210 220 230 240 250
940 950 960 970 980 990
pF1KF0 YNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMKQGKYRHFFEACRLLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 YNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMKQGKYRHFFEACRLLQQ
260 270 280 290 300 310
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KF0 MIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLINERKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLINERKR
320 330 340 350 360 370
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KF0 KLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQGKSQQRTFFLFDHQLVSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQGKSQQRTFFLFDHQLVSC
380 390 400 410 420 430
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KF0 KKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQ
440 450 460 470 480 490
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KF0 EDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQKKLAMLNAQKAGHGKSKGYNRCPVAPPHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQKKLAMLNAQKAGHGKSKGYNRCPVAPPHQ
500 510 520 530 540 550
1240 1250 1260 1270
pF1KF0 GLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHTFNRLTPFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHTFNRLTPFRK
560 570 580 590
>>CCDS73553.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 (512 aa)
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::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MVARGEIARFWSLESLHLVSSDGGTEPSALVDDNGSEEDFSYEDLCQA
10 20 30 40
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pF1KF0 SPRYLQPGGEQLAINELISDGNVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGDVIQVLEASNKDWWW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SPRYLQPGGEQLAINELISDGNVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGDVIQVLEASNKDWWW
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820 830 840 850 860 870
pF1KF0 GRSEDKEAWFPASFVRLRVNQEELSENSSSTPSEEQDEEASQSRHRHCENKQQMRTNVIR
::::::::::::::::
CCDS73 GRSEDKEAWFPASFVR--------------------------------------------
110 120
880 890 900 910 920 930
pF1KF0 EIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDLEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ------------------GYIRQCRKHTGMFTVAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDLEKQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMKQGKYRHFFEACRLLQQ
170 180 190 200 210 220
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KF0 MIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLINERKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLINERKR
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1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KF0 KLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQGKSQQRTFFLFDHQLVSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQGKSQQRTFFLFDHQLVSC
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pF1KF0 KKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQ
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pF1KF0 EDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQKKLAMLNAQKAGHGKSKGYNRCPVAPPHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQKKLAMLNAQKAGHGKSKGYNRCPVAPPHQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHTFNRLTPFRK
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: .:::.: ::...: .. .. . :
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pF1KF0 GGTEPSALVDDNGSEEDFSYEDLCQASPRYLQPGG--EQLAINELISDGNVVCAEALWDH
:. . .. .:. :::::. :.:: ..: .: .::: ::::::::::::.::::::::::
CCDS21 GALDTAVCADEVGSEEDL-YDDLHSSSHHYSHPGGGGEQLAINELISDGSVVCAEALWDH
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pF1KF0 VTMDDQELGFKAGDVIQVLEASNKDWWWGRSEDKEAWFPASFVRLRVNQEELSENSSSTP
::::::::::::::::.:..:.:..::::: : :.:::::::::::::.: .....
CCDS21 VTMDDQELGFKAGDVIEVMDATNREWWWGRVADGEGWFPASFVRLRVNQDEPADDDAPLA
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850 860 870 880 890 900
pF1KF0 SEEQDEEASQSRHRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFT
.. :... . .:.::::::: ::..::: ::::::::::::.:::::.. ::.
CCDS21 GNSGAEDGGAEAQS---SKDQMRTNVINEILSTERDYIKHLRDICEGYVRQCRKRADMFS
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pF1KF0 VAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNH
:: ::::::::::. :. :.: ::...:.:.:::::.:.:::..: : :::::::::
CCDS21 EEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKALEQRFNRERPHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNH
330 340 350 360 370 380
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pF1KF0 PGACLELANLMKQGKYRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTT
:.::.::. : : .:: .:::::::::.::::..:::::::::::::::::::::::::
CCDS21 PNACVELSRLTKLSKYVYFFEACRLLQKMIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTH
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1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KF0 QEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLINERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIH
.: :.....:: .:::::: :::::::.::.:::::.:: :: ::: :.: ::::::.
CCDS21 PQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKRRLENIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIY
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1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KF0 SGELTKITK-QGKSQQRTFFLFDHQLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRD
:::::..:. :.::::: ::::::::. :::::::::.:::::::::: .:.::: ::.:
CCDS21 SGELTRVTQPQAKSQQRMFFLFDHQLIYCKKDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKD
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1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KF0 KDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQ
.: ..:.::::.: .: . .:.:..: :.: :::.: : ::..:: :.: :. :.: :
CCDS21 RDLHVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRKPEQKQRWLKAFAREREQVQLDQETGFSITELQ
570 580 590 600 610 620
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KF0 KKLAMLNAQKAG-HGKSKGYNR-CPVAPPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKR
.: :::::.: :: :. .: : .. .:.: ..:.. :::::. ::::.:
CCDS21 RKQAMLNASKQQVTGKPKAVGRPCYLT---------RQKHPALPSNRPQQQVLVLAEPRR
630 640 650 660 670
1270
pF1KF0 KSSLFWHTFNRLTPFRK
: : :::...::.::::
CCDS21 KPSTFWHSISRLAPFRK
680 690
>>CCDS42754.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2 (670 aa)
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Smith-Waterman score: 2225; 60.5% identity (81.1% similar) in 562 aa overlap (696-1251:118-668)
670 680 690 700 710 720
pF1KF0 ELDNLLTQPASRPPMPAHQVPPYKAVSARFRPFTFSQSTPIGLDRVGRRRQMRASNVSSD
: .:::.: ::...: .. .. . :
CCDS42 RLHIGAVHKDGVKCWRKTIITSPESLNLPRRSHPLSQSAPTGLNHMGWPEHTPGTAMP-D
90 100 110 120 130 140
730 740 750 760 770 780
pF1KF0 GGTEPSALVDDNGSEEDFSYEDLCQASPRYLQPGG--EQLAINELISDGNVVCAEALWDH
:. . .. .:. :::::. :.:: ..: .: .::: ::::::::::::.::::::::::
CCDS42 GALDTAVCADEVGSEEDL-YDDLHSSSHHYSHPGGGGEQLAINELISDGSVVCAEALWDH
150 160 170 180 190 200
790 800 810 820 830 840
pF1KF0 VTMDDQELGFKAGDVIQVLEASNKDWWWGRSEDKEAWFPASFVRLRVNQEELSENSSSTP
::::::::::::::::.:..:.:..::::: : :.:::::::::::::.: .....
CCDS42 VTMDDQELGFKAGDVIEVMDATNREWWWGRVADGEGWFPASFVRLRVNQDEPADDDAPLA
210 220 230 240 250 260
850 860 870 880 890 900
pF1KF0 SEEQDEEASQSRHRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFT
.. :... . .:.::::::: ::..::: ::::::::::::.:::::.. ::.
CCDS42 GNSGAEDGGAEAQ---SSKDQMRTNVINEILSTERDYIKHLRDICEGYVRQCRKRADMFS
270 280 290 300 310 320
910 920 930 940 950 960
pF1KF0 VAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNH
:: ::::::::::. :. :.: ::...:.:.:::::.:.:::..: : :::::::::
CCDS42 EEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKALEQRFNRERPHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNH
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pF1KF0 PGACLELANLMKQGKYRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTT
:.::.::. : : .:: .:::::::::.::::..:::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PNACVELSRLTKLSKYVYFFEACRLLQKMIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTH
390 400 410 420 430 440
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KF0 QEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLINERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIH
.: :.....:: .:::::: :::::::.::.:::::.:: :: ::: :.: ::::::.
CCDS42 PQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKRRLENIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIY
450 460 470 480 490 500
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pF1KF0 SGELTKITK-QGKSQQRTFFLFDHQLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRD
:::::..:. :.::::: ::::::::. :::::::::.:::::::::: .:.::: ::.:
CCDS42 SGELTRVTQPQAKSQQRMFFLFDHQLIYCKKDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKD
510 520 530 540 550 560
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KF0 KDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQ
.: ..:.::::.: .: . .:.:..: :.: :::.: : ::..:: :.: :. :.: :
CCDS42 RDLHVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRKPEQKQRWLKAFAREREQVQLDQETGFSITELQ
570 580 590 600 610 620
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pF1KF0 KKLAMLNAQKAG-HGKSKGYNRCPVAPPHQ--GLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPK
.: :::::.: :: :: : .::: . : .: .: : ::.:
CCDS42 RKQAMLNASKQQVTGKPKG--RRTAAPPPRLPGPYPAD----IIPFSEPQSQAS
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pF1KF0 RKSSLFWHTFNRLTPFRK
>>CCDS35315.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX (516 aa)
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pF1KF0 GSEEDFSYEDLCQASPRYLQPGGEQLAINELISDGNVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGD
::. ..: :::.:::::: ..::.:::::
CCDS35 MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGD
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pF1KF0 VIQVLEASNKDWWWGRSEDKEAWFPASFVRLRVNQE-ELSENSSSTPSEEQDEEAS-QSR
::.::.:::::::::. .:.:.::::::::: :::: :. :. :.. . . : ...
CCDS35 VIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPASFVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCL
40 50 60 70 80 90
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pF1KF0 HRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLATIFGNIE
: .:..:::.::: :::.::: :::::.::::::..::::. ::. :: .::::::
CCDS35 GRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIE
100 110 120 130 140 150
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pF1KF0 DIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMK
:::.:: :..:::::::...::::::: :::..:.:: ::::::::: ::.::..:::
CCDS35 DIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMK
160 170 180 190 200 210
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pF1KF0 QGKYRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAA
...:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:.:: . ::
CCDS35 DSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAA
220 230 240 250 260 270
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pF1KF0 YEAMKNVACLINERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQ-G
.:.::. ::::::.::.:::::.::.:.. ::: ::::::::::..::.. : . :
CCDS35 LAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYG
280 290 300 310 320 330
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KF0 KSQQRTFFLFDHQLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKNAFK
..:::.:::::::.: :::::.:::.::::::.:::..:.::. :::: : :.:.:::::
CCDS35 RNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFK
340 350 360 370 380 390
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pF1KF0 LVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQKKLAMLNAQKAG
: .. :.:..:: ::: :.: :::.: .::. ::::...:.:::::::. : ....:.
CCDS35 LHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKV-
400 410 420 430 440 450
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pF1KF0 HGKSKGYNRC----PVAPPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHTFN
:.:: : : :: : :... . .: .. :.::: ..::::..: ::..:.
CCDS35 -PKQKGVNSARSVPPSYPPPQ--DPLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFS
460 470 480 490 500
pF1KF0 RLTPFRK
:::::.:
CCDS35 RLTPFKK
510
>>CCDS83477.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX (495 aa)
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760 770 780 790 800 810
pF1KF0 LQPGGEQLAINELISDGNVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGDVIQVLEASNKDWWWGRSE
: ..::.:::::::.::.:::::::::. .
CCDS83 MANRELAFKAGDVIKVLDASNKDWWWGQID
10 20 30
820 830 840 850 860 870
pF1KF0 DKEAWFPASFVRLRVNQE-ELSENSSSTPSEEQDEEAS-QSRHRHCENKQQMRTNVIREI
:.:.::::::::: :::: :. :. :.. . . : ... : .:..:::.::: ::
CCDS83 DEEGWFPASFVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEI
40 50 60 70 80 90
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pF1KF0 MDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDLEKQYN
:.::: :::::.::::::..::::. ::. :: .:::::::::.:: :..:::::::
CCDS83 MSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYN
100 110 120 130 140 150
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pF1KF0 KEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMKQGKYRHFFEACRLLQQMI
...::::::: :::..:.:: ::::::::: ::.::..:::...:.:::::::::::::
CCDS83 NDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMI
160 170 180 190 200 210
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KF0 DIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLINERKRKL
:::::::::::::::::::::::::::::.:.:.:: . :: .:.::. ::::::.:
CCDS83 DIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRL
220 230 240 250 260 270
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KF0 ESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQ-GKSQQRTFFLFDHQLVSCK
:.:::::.::.:.. ::: ::::::::::..::.. : . :..:::.:::::::.: ::
CCDS83 ENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCK
280 290 300 310 320 330
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KF0 KDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQE
:::.:::.::::::.:::..:.::. :::: : :.:.:::::: .. :.:..:: ::: :
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