Result of FASTA (omim) for
pF1KF0293
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KF0293, 1018 aa
1>>>pF1KF0293 1018 - 1018 aa - 1018 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6849+/-0.000407; mu= 25.1724+/- 0.025
mean_var=67.6769+/-13.941, 0's: 0 Z-trim(110.4): 203 B-trim: 829 in 1/51
Lambda= 0.155903
statistics sampled from 18505 (18708) to 18505 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16
Scan time: 10.530
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_149043 (OMIM: 600642) unconventional myosin-Ig (1018) 6843 1549.2 0
XP_016867992 (OMIM: 600642) PREDICTED: unconventio ( 903) 6075 1376.4 0
XP_016867993 (OMIM: 600642) PREDICTED: unconventio ( 780) 5250 1190.8 0
NP_056009 (OMIM: 606539) unconventional myosin-Id (1006) 3012 687.5 9.6e-197
XP_016880174 (OMIM: 606539) PREDICTED: unconventio ( 955) 2896 661.4 6.6e-189
NP_001290208 (OMIM: 606539) unconventional myosin- ( 961) 2896 661.4 6.6e-189
NP_001290209 (OMIM: 606539) unconventional myosin- ( 436) 1360 315.6 3.7e-85
NP_203693 (OMIM: 606538) unconventional myosin-Ic (1028) 1353 314.4 2.1e-84
NP_001074419 (OMIM: 606538) unconventional myosin- (1044) 1353 314.4 2.1e-84
NP_001074248 (OMIM: 606538) unconventional myosin- (1063) 1353 314.4 2.1e-84
XP_016859647 (OMIM: 606537) PREDICTED: unconventio (1015) 1349 313.5 3.8e-84
NP_036355 (OMIM: 606537) unconventional myosin-Ib (1078) 1349 313.5 4e-84
NP_001317167 (OMIM: 606537) unconventional myosin- (1107) 1349 313.5 4.1e-84
NP_001317166 (OMIM: 606537) unconventional myosin- (1107) 1349 313.5 4.1e-84
XP_005246629 (OMIM: 606537) PREDICTED: unconventio (1136) 1349 313.5 4.2e-84
NP_001123630 (OMIM: 606537) unconventional myosin- (1136) 1349 313.5 4.2e-84
NP_001155291 (OMIM: 606537) unconventional myosin- (1136) 1349 313.5 4.2e-84
XP_016880165 (OMIM: 160742) PREDICTED: myosin-4 is (1939) 1275 297.1 6.3e-79
NP_060003 (OMIM: 160742) myosin-4 [Homo sapiens] (1939) 1275 297.1 6.3e-79
NP_001093582 (OMIM: 160740,605637) myosin-2 [Homo (1941) 1269 295.7 1.6e-78
NP_060004 (OMIM: 160740,605637) myosin-2 [Homo sap (1941) 1269 295.7 1.6e-78
XP_016880164 (OMIM: 160730) PREDICTED: myosin-1 is (1939) 1257 293.0 1e-77
NP_005954 (OMIM: 160730) myosin-1 [Homo sapiens] (1939) 1257 293.0 1e-77
NP_001094891 (OMIM: 614636) unconventional myosin- (1022) 1131 264.4 2.2e-69
XP_016874696 (OMIM: 614636) PREDICTED: unconventio (1027) 1131 264.4 2.2e-69
NP_008832 (OMIM: 604875) unconventional myosin-IXa (2548) 1097 257.1 8.7e-67
XP_011519924 (OMIM: 604875) PREDICTED: unconventio (2566) 1097 257.1 8.7e-67
XP_016877718 (OMIM: 604875) PREDICTED: unconventio (2566) 1097 257.1 8.7e-67
XP_011519923 (OMIM: 604875) PREDICTED: unconventio (2598) 1097 257.1 8.8e-67
XP_006720602 (OMIM: 604875) PREDICTED: unconventio (2619) 1097 257.1 8.8e-67
XP_011519920 (OMIM: 604875) PREDICTED: unconventio (2620) 1097 257.2 8.9e-67
XP_011519919 (OMIM: 604875) PREDICTED: unconventio (2637) 1097 257.2 8.9e-67
XP_011519915 (OMIM: 604875) PREDICTED: unconventio (2638) 1097 257.2 8.9e-67
XP_011519918 (OMIM: 604875) PREDICTED: unconventio (2638) 1097 257.2 8.9e-67
XP_011519917 (OMIM: 604875) PREDICTED: unconventio (2638) 1097 257.2 8.9e-67
XP_011519916 (OMIM: 604875) PREDICTED: unconventio (2638) 1097 257.2 8.9e-67
XP_011508960 (OMIM: 610040) PREDICTED: myosin-IIIb (1050) 1055 247.3 3.2e-64
XP_011508959 (OMIM: 610040) PREDICTED: myosin-IIIb (1050) 1055 247.3 3.2e-64
XP_011508958 (OMIM: 610040) PREDICTED: myosin-IIIb (1155) 1055 247.4 3.4e-64
XP_016878739 (OMIM: 132900,160745) PREDICTED: myos (1945) 1057 248.0 3.6e-64
NP_001035202 (OMIM: 132900,160745) myosin-11 isofo (1945) 1057 248.0 3.6e-64
NP_001035203 (OMIM: 132900,160745) myosin-11 isofo (1979) 1057 248.0 3.7e-64
NP_001077084 (OMIM: 610040) myosin-IIIb isoform 1 (1314) 1055 247.4 3.7e-64
XP_011508957 (OMIM: 610040) PREDICTED: myosin-IIIb (1323) 1055 247.4 3.7e-64
NP_620482 (OMIM: 610040) myosin-IIIb isoform 2 [Ho (1341) 1055 247.4 3.8e-64
XP_006712362 (OMIM: 610040) PREDICTED: myosin-IIIb (1350) 1055 247.4 3.8e-64
XP_011508956 (OMIM: 610040) PREDICTED: myosin-IIIb (1386) 1055 247.5 3.9e-64
XP_011520804 (OMIM: 132900,160745) PREDICTED: myos (1929) 1040 244.2 5.1e-63
NP_074035 (OMIM: 132900,160745) myosin-11 isoform (1938) 1040 244.2 5.1e-63
NP_002465 (OMIM: 132900,160745) myosin-11 isoform (1972) 1040 244.2 5.2e-63
>>NP_149043 (OMIM: 600642) unconventional myosin-Ig [Hom (1018 aa)
initn: 6843 init1: 6843 opt: 6843 Z-score: 8309.9 bits: 1549.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6843; 99.8% identity (99.9% similar) in 1018 aa overlap (1-1018:1-1018)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MEDEEGPEYGKPDFVLLDQVTMEDFMRNLQLRFEKGRIYTYIGEVLVSVNPYQELPLYGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 MEDEEGPEYGKPDFVLLDQVTMEDFMRNLQLRFEKGRIYTYIGEVLVSVNPYQELPLYGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 EAIARYQGRELYERPPHLYAVANAAYKAMKHRSRDTCIVISGESGAGKTEASKHIMQYIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 EAIARYQGRELYERPPHLYAVANAAYKAMKHRSRDTCIVISGESGAGKTEASKHIMQYIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 AVTNPSQRAEVERVKDVLLKSTCVLEAFGNARTNRNHNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 AVTNPSQRAEVERVKDVLLKSTCVLEAFGNARTNRNHNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 IHSYLLEKSRVLKQHVGERNFHAFYQLLRGSEDKQLHELHLERNPAVYNFTHQGAGLNMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 IHSYLLEKSRVLKQHVGERNFHAFYQLLRGSEDKQLHELHLERNPAVYNFTHQGAGLNMT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 VHSALDSDEQSHQAVTEAMRVIGFSPEEVESVHRILAAILHLGNIEFVETEEGGLQKEGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 VHSALDSDEQSHQAVTEAMRVIGFSPEEVESVHRILAAILHLGNIEFVETEEGGLQKEGL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 AVAEEALVDHVAELTATPRDLVLRSLLARTVASGGRELIEKGHTAAEASYARDACAKAVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 AVAEEALVDHVAELTATPRDLVLRSLLARTVASGGRELIEKGHTAAEASYARDACAKAVY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 QRLFEWVVNRINSVMEPRGRDPRRDGKDTVIGVLDIYGFEVFPVNSFEQFCINYCNEKLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 QRLFEWVVNRINSVMEPRGRDPRRDGKDTVIGVLDIYGFEVFPVNSFEQFCINYCNEKLQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 QLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSVEYFNNATIVDLVERPHRGILAVLDEACSSAGTITD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 QLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSVEYFNNATIVDLVERPHRGILAVLDEACSSAGTITD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 RIFLQTLDTHHRHHLHYTSRQLCPTDKTMEFGRDFRIKHYAGDVTYSVEGFIDKNRDFLF
:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 RIFLQTLDMHHRHHLHYTSRQLCPTDKTMEFGRDFRIKHYAGDVTYSVEGFIDKNRDFLF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 QDFKRLLYNSTDPTLRAMWPDGQQDITEVTKRPLTAGTLFKNSMVALVENLASKEPFYVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 QDFKRLLYNSTDPTLRAMWPDGQQDITEVTKRPLTAGTLFKNSMVALVENLASKEPFYVR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KF0 CIKPNEDKVAGKLDENHCRHQVAYLGLLENVRVRRAGFASRQPYSRFLLRYKMTCEYTWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 CIKPNEDKVAGKLDENHCRHQVAYLGLLENVRVRRAGFASRQPYSRFLLRYKMTCEYTWP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KF0 NHLLGSDKAAVSALLEQHGLQGDVAFGHSKLFIRSPRTLVTLEQSRARLIPIIVLLLQKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 NHLLGSDKAAVSALLEQHGLQGDVAFGHSKLFIRSPRTLVTLEQSRARLIPIIVLLLQKA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KF0 WRGTLARWRCRRLRAIYTIMRWFRRHKVRAHLAELQRRFQAARQPPLYGRDLVWPLPPAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 WRGTLARWRCRRLRAIYTIMRWFRRHKVRAHLAELQRRFQAARQPPLYGRDLVWPLPPAV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KF0 LQPFQDTCHALFCRWRARQLVKNIPPSDMPQIKAKVAAMGALQGLRQDWGCRRAWARDYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 LQPFQDTCHALFCRWRARQLVKNIPPSDMPQIKAKVAAMGALQGLRQDWGCRRAWARDYL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KF0 SSATDNPTASSLFAQRLKTLRDKDGFGAVLFSSHVRKVNRFHKIRNRALLLTDQHLYKLD
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 SSATDNPTASSLFAQRLKTLQDKDGFGAVLFSSHVRKVNRFHKIRNRALLLTDQHLYKLD
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KF0 PDRQYRVMRAVPLEAVTGLSVTSGGDQLVVLHARGQDDLVVCLHRSRPPLDNRVGELVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 PDRQYRVMRAVPLEAVTGLSVTSGGDQLVVLHARGQDDLVVCLHRSRPPLDNRVGELVGV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KF0 LAAHCQGEGRTLEVRVSDCIPLSHRGVRRLISVEPRPEQPEPDFRCARGSFTLLWPSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 LAAHCQGEGRTLEVRVSDCIPLSHRGVRRLISVEPRPEQPEPDFRCARGSFTLLWPSR
970 980 990 1000 1010
>>XP_016867992 (OMIM: 600642) PREDICTED: unconventional (903 aa)
initn: 6075 init1: 6075 opt: 6075 Z-score: 7377.1 bits: 1376.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6075; 99.8% identity (99.9% similar) in 903 aa overlap (116-1018:1-903)
90 100 110 120 130 140
pF1KF0 YKAMKHRSRDTCIVISGESGAGKTEASKHIMQYIAAVTNPSQRAEVERVKDVLLKSTCVL
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MQYIAAVTNPSQRAEVERVKDVLLKSTCVL
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KF0 EAFGNARTNRNHNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGHIHSYLLEKSRVLKQHVGERNFHAFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EAFGNARTNRNHNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGHIHSYLLEKSRVLKQHVGERNFHAFY
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KF0 QLLRGSEDKQLHELHLERNPAVYNFTHQGAGLNMTVHSALDSDEQSHQAVTEAMRVIGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QLLRGSEDKQLHELHLERNPAVYNFTHQGAGLNMTVHSALDSDEQSHQAVTEAMRVIGFS
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KF0 PEEVESVHRILAAILHLGNIEFVETEEGGLQKEGLAVAEEALVDHVAELTATPRDLVLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PEEVESVHRILAAILHLGNIEFVETEEGGLQKEGLAVAEEALVDHVAELTATPRDLVLRS
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KF0 LLARTVASGGRELIEKGHTAAEASYARDACAKAVYQRLFEWVVNRINSVMEPRGRDPRRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLARTVASGGRELIEKGHTAAEASYARDACAKAVYQRLFEWVVNRINSVMEPRGRDPRRD
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KF0 GKDTVIGVLDIYGFEVFPVNSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GKDTVIGVLDIYGFEVFPVNSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSV
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490 500
pF1KF0 EYFNNATIVDLVERPHRGILAVLDEACSSAGTITDRIFLQTLDTHHRHHLHYTSRQLCPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
XP_016 EYFNNATIVDLVERPHRGILAVLDEACSSAGTITDRIFLQTLDMHHRHHLHYTSRQLCPT
340 350 360 370 380 390
510 520 530 540 550 560
pF1KF0 DKTMEFGRDFRIKHYAGDVTYSVEGFIDKNRDFLFQDFKRLLYNSTDPTLRAMWPDGQQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DKTMEFGRDFRIKHYAGDVTYSVEGFIDKNRDFLFQDFKRLLYNSTDPTLRAMWPDGQQD
400 410 420 430 440 450
570 580 590 600 610 620
pF1KF0 ITEVTKRPLTAGTLFKNSMVALVENLASKEPFYVRCIKPNEDKVAGKLDENHCRHQVAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ITEVTKRPLTAGTLFKNSMVALVENLASKEPFYVRCIKPNEDKVAGKLDENHCRHQVAYL
460 470 480 490 500 510
630 640 650 660 670 680
pF1KF0 GLLENVRVRRAGFASRQPYSRFLLRYKMTCEYTWPNHLLGSDKAAVSALLEQHGLQGDVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLLENVRVRRAGFASRQPYSRFLLRYKMTCEYTWPNHLLGSDKAAVSALLEQHGLQGDVA
520 530 540 550 560 570
690 700 710 720 730 740
pF1KF0 FGHSKLFIRSPRTLVTLEQSRARLIPIIVLLLQKAWRGTLARWRCRRLRAIYTIMRWFRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FGHSKLFIRSPRTLVTLEQSRARLIPIIVLLLQKAWRGTLARWRCRRLRAIYTIMRWFRR
580 590 600 610 620 630
750 760 770 780 790 800
pF1KF0 HKVRAHLAELQRRFQAARQPPLYGRDLVWPLPPAVLQPFQDTCHALFCRWRARQLVKNIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HKVRAHLAELQRRFQAARQPPLYGRDLVWPLPPAVLQPFQDTCHALFCRWRARQLVKNIP
640 650 660 670 680 690
810 820 830 840 850 860
pF1KF0 PSDMPQIKAKVAAMGALQGLRQDWGCRRAWARDYLSSATDNPTASSLFAQRLKTLRDKDG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
XP_016 PSDMPQIKAKVAAMGALQGLRQDWGCRRAWARDYLSSATDNPTASSLFAQRLKTLQDKDG
700 710 720 730 740 750
870 880 890 900 910 920
pF1KF0 FGAVLFSSHVRKVNRFHKIRNRALLLTDQHLYKLDPDRQYRVMRAVPLEAVTGLSVTSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FGAVLFSSHVRKVNRFHKIRNRALLLTDQHLYKLDPDRQYRVMRAVPLEAVTGLSVTSGG
760 770 780 790 800 810
930 940 950 960 970 980
pF1KF0 DQLVVLHARGQDDLVVCLHRSRPPLDNRVGELVGVLAAHCQGEGRTLEVRVSDCIPLSHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DQLVVLHARGQDDLVVCLHRSRPPLDNRVGELVGVLAAHCQGEGRTLEVRVSDCIPLSHR
820 830 840 850 860 870
990 1000 1010
pF1KF0 GVRRLISVEPRPEQPEPDFRCARGSFTLLWPSR
:::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GVRRLISVEPRPEQPEPDFRCARGSFTLLWPSR
880 890 900
>>XP_016867993 (OMIM: 600642) PREDICTED: unconventional (780 aa)
initn: 5250 init1: 5250 opt: 5250 Z-score: 6375.0 bits: 1190.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5250; 99.7% identity (99.9% similar) in 780 aa overlap (239-1018:1-780)
210 220 230 240 250 260
pF1KF0 RGSEDKQLHELHLERNPAVYNFTHQGAGLNMTVHSALDSDEQSHQAVTEAMRVIGFSPEE
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MTVHSALDSDEQSHQAVTEAMRVIGFSPEE
10 20 30
270 280 290 300 310 320
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_016 WRGTLARMRYKRTKAALTIIRYYRRYKVKSYIHEVARRFHGVKTMRDYGKHVKWPSPPKV
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XP_016 LVNHFKR
950
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pF1KF0 MEDEEGPEYGKPDFVLLDQVTMEDFMRNLQLRFEKGRIYTYIGEVLVSVNPYQELPLYGP
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NP_001 -----KVVSIIAELLSTKTDMVEKALLYRTVATG-RDIIDKQHTEQEASYGRDAFAKAIY
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NP_001 ERLFCWIVTRINDIIEVKNYDTTIHGKNTVIGVLDIYGFEIFDNNSFEQFCINYCNEKLQ
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 QLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSVEYFNNATIVDLVERPHRGILAVLDEACSSAGTITD
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NP_001 QLFIQLVLKQEQEEYQREGIPWKHIDYFNNQIIVDLVEQQHKGIIAILDDACMNVGKVTD
410 420 430 440 450 460
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pF1KF0 RIFLQTLDTHHRHHLHYTSRQLCPTDKTMEFGRDFRIKHYAGDVTYSVEGFIDKNRDFLF
..::..:... .: :..::.:: .:: .:: :::::.::::::.::: ::::::.: ::
NP_001 EMFLEALNSKLGKHAHFSSRKLCASDKILEFDRDFRIRHYAGDVVYSVIGFIDKNKDTLF
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 QDFKRLLYNSTDPTLRAMWPDGQQDITEVTKRPLTAGTLFKNSMVALVENLASKEPFYVR
::::::.:::..:.:. :::.:. .:::::::::::.:::::::.:::.:::::::.:::
NP_001 QDFKRLMYNSSNPVLKNMWPEGKLSITEVTKRPLTAATLFKNSMIALVDNLASKEPYYVR
530 540 550 560 570 580
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pF1KF0 CIKPNEDKVAGKLDENHCRHQVAYLGLLENVRVRRAGFASRQPYSRFLLRYKMTCEYTWP
:::::. : .:...::::: :::::::::::::::: :: : .:: :::: :.:::
NP_001 CIKPNDKKSPQIFDDERCRHQVEYLGLLENVRVRRAGFAFRQTYEKFLHRYKMISEFTWP
590 600 610 620 630 640
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pF1KF0 NHLLGSDKAAVSALLEQHGLQGDVAFGHSKLFIRSPRTLVTLEQSRARLIPIIVLLLQKA
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NP_001 NHDLPSDKEAVKKLIERCGFQDDVAYGKTKIFIRTPRTLFTLEELRAQMLIRIVLFLQKV
650 660 670 680 690 700
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pF1KF0 WRGTLARWRCRRLRAIYTIMRWFRRHKVRAHLAELQRRFQAARQPPLYGRDLVWPLPPAV
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NP_001 WRGTLARMRYKRTKAALTIIRYYRRYKVKSYIHEVARRFHGVKTMRDYGKHVKWPSPPKV
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pF1KF0 LQPFQDTCHALFCRWRARQLVKNIPPSDMPQIKAKVAAMGALQGLRQDWGCRRAWARDYL
:. :... ...: :::: ::.:.:: ::.::..:::::. :.: : : : .::: .::
NP_001 LRRFEEALQTIFNRWRASQLIKSIPASDLPQVRAKVAAVEMLKGQRADLGLQRAWEGNYL
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pF1KF0 SSATDNPTASSLFAQRLKTLRDKDGFGAVLFSSHVRKVNRFHKIRNRALLLTDQHLYKLD
.: :.: .:. :. . :. :: . :::: :::::::: :...::...::.::::.:
NP_001 ASKPDTPQTSGTFVPVANELKRKDKYMNVLFSCHVRKVNRFSKVEDRAIFVTDRHLYKMD
830 840 850 860 870 880
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pF1KF0 PDRQYRVMRAVPLEAVTGLSVTSGGDQLVVLHARGQDDLVVCLHRSRPPLDNRVGELVGV
: .::.::...:: .:::::..: :::::.:.. . ::.::: ..: ..:.::::::
NP_001 PTKQYKVMKTIPLYNLTGLSVSNGKDQLVVFHTKDNKDLIVCLFSKQPTHESRIGELVGV
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pF1KF0 LAAHCQGEGRTLEVRVSDCIPLSHRGVRRLISVEPRPEQPEPDFRCARGSFTLLWPSR
:. :
NP_001 LVNHFKRNHLLIL
950 960
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10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MEDEEGPEYGKPDFVLLDQVTMEDFMRNLQLRFEKGRIYTYIGEVLVSVNPYQELPLYGP
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NP_001 MAEQESLEFGKADFVLMDTVSMPEFMANLRLRFEKGRIYTFIGEVVVSVNPYKLLNIYGR
10 20 30 40 50 60
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pF1KF0 EAIARYQGRELYERPPHLYAVANAAYKAMKHRSRDTCIVISGESGAGKTEASKHIMQYIA
..: .:.:::::::::::.:.:.:::::::.::.:::::::::::::::::::.::::::
NP_001 DTIEQYKGRELYERPPHLFAIADAAYKAMKRRSKDTCIVISGESGAGKTEASKYIMQYIA
70 80 90 100 110 120
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pF1KF0 AVTNPSQRAEVERVKDVLLKSTCVLEAFGNARTNRNHNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGH
:.:::::::::::::..::::.:::::::::.:::: :::::::::::::::::::::::
NP_001 AITNPSQRAEVERVKNMLLKSNCVLEAFGNAKTNRNDNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGH
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pF1KF0 IHSYLLEKSRVLKQHVGERNFHAFYQLLRGSEDKQLHELHLERNPAVYNFTHQGAGLNMT
:..::::::::. :. :::.::.:::::.:. ...:. :::... . ::. : :: :. .
NP_001 INNYLLEKSRVIVQQPGERSFHSFYQLLQGGSEQMLRSLHLQKSLSSYNYIHVGAQLKSS
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pF1KF0 VHSALDSDEQSHQAVTEAMRVIGFSPEEVESVHRILAAILHLGNIEFVETEEGGLQKEGL
.. : ..:..::.::::.:::...:..::::::::::..:: . : ..:
NP_001 IN-----DAAEFRVVADAMKVIGFKPEEIQTVYKILAAILHLGNLKFVVDGDTPLIENG-
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pF1KF0 AVAEEALVDHVAELTATPRDLVLRSLLARTVASGGRELIEKGHTAAEASYARDACAKAVY
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NP_001 -----KVVSIIAELLSTKTDMVEKALLYRTVATG-RDIIDKQHTEQEASYGRDAFAKAIY
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NP_001 ERLFCWIVTRINDIIEVKNYDTTIHGKNTVIGVLDIYGFEIFDNNSFEQFCINYCNEKLQ
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pF1KF0 QLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSVEYFNNATIVDLVERPHRGILAVLDEACSSAGTITD
::::::.::::::::.:::: :. :
NP_001 QLFIQLVLKQEQEEYQREGIPWKHVGLL
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10 20 30 40 50
pF1KF0 MEDEEGPEYGKPDFVLLDQVTMED-FMRNLQLRFEKGRIYTYIGEVLVSVNPYQELPL
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NP_203 YSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQ
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pF1KF0 YIAAVTNPSQRAEVERVKDVLLKSTCVLEAFGNARTNRNHNSSRFGKYMDINFDFKGDPI
. : . .:. . :.: ::.:. ::::::::.: :: ::::::::::..::::: :.
NP_203 FYAETCPAPERGGA--VRDRLLQSNPVLEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPV
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pF1KF0 GGHIHSYLLEKSRVLKQHVGERNFHAFYQLLRGSEDKQLHELHLERNPAVYNFTHQGAGL
:::: :::::::::..:. :::::: :::::.:.:.. :..: ::::: : . .:
NP_203 GGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIFYQLLEGGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCA
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.. :... :... ..: .:. :: :. .:::.. :.:..::::::.:. .::.. :
NP_203 KV---SSIN-DKSDWKVVRKALTVIDFTEDEVEDLLSIVASVLHLGNIHFAANEESNAQ-
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pF1KF0 EGLAVAEEALVDHVAELTATPRDLVLRSLLARTVASGGRELIEKGHTAAEASYARDACAK
:. : . ....: .. . . ..: : . . :.::. . .:.::::: ::
NP_203 ----VTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIAKGEELLSPLNLE-QAAYARDALAK
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:::.: : :.:..:: . . . . ::.:.::::::::: :::::::::::::
NP_203 AVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLLDIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNE
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pF1KF0 KLQQLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSVEYFNNATIVDLVERPHRGILAVLDEACSSAGT
:::::::.: ::.:::::: :::.:. :.:::: : ::::. .::...::: : :
NP_203 KLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIICDLVEEKFKGIISILDEECLRPGE
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:: ::. :. .:: :. ...: .:: .::. ::::.::::: ::.:::
NP_203 ATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRGEFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNN
470 480 490 500 510 520
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:.::...:. . .: .: . . ...... ::: :..: :: :.. ::: : ::::
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530 540 550 560 570 580
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pF1KF0 FYVRCIKPNEDKVAGKLDENHCRHQVAYLGLLENVRVRRAGFASRQPYSRFLLRYKMTCE
::::::::. : :..:: :::: :::::::.:::::::: :. : :: ::: :
NP_203 AYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAYRRKYEAFLQRYKSLCP
590 600 610 620 630 640
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pF1KF0 YTWPNHLLGSDKAAVSALLEQHGLQGD-VAFGHSKLFIRSPRTLVT----LEQSRARLIP
:::. : . .:..:... : . . .:..:.::: :.:: . :: : :
NP_203 ETWPT-WAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFATEDALEVRRQSLAT
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pF1KF0 II-------------------VLLLQKAWRGTLARWRC-RRLRAIYTIMRWFR----RHK
: .. .:. :::::.: . .: : :: : .: ::
NP_203 KIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQTIRRLIRGFVLRHA
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750 760 770 780 790 800
pF1KF0 VRA-----HLAELQRRF--QAARQPPLYGRDLVWPLPPAVLQPFQDTCHALFCRWRARQL
: : ... : . :: : : :: :: .:. .. . : . . .
NP_203 PRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPQNVLDTSWPTPPPALREASELLRELCIKNMVWKY
770 780 790 800 810 820
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pF1KF0 VKNIPPSDMPQIKAKVAAMGALQGLRQDWGCRRAWARDYLSSATDNPTASSLFAQRLKTL
..: : :.. :..: ..: .... .. : ..:. . : : :
NP_203 CRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYP--QSVPRLFISTRLGTDEISPRVLQAL---
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pF1KF0 RDKDGFGAVLFSSHVRKVNRF-HKIRNRALLLTDQHLYKLDPDRQYRVMRAVPLEAVTGL
: . .. : : .: .: :.: :::: . . .. . .: . . .::.
NP_203 ----GSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVE---DAKVKQRIDYANLTGI
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pF1KF0 SVTSGGDQLVVLHARGQDDLVVCLHRSRPPLDNRVGELVGVLAAHCQGEGRTLEVRVSDC
::.: .:.: :::.. :.
NP_203 SVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQGSITFAG
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10 20 30 40
pF1KF0 MEDEEGPEYGKPDFVLLDQVTMED-FMRNLQLRFEKGRIYTY
: :::::.. : : :..::. ::... ::::
NP_001 MRYRASALGSDGVRVTMESALTARDRVGVQDFVLLENFTSEAAFIENLRRRFRENLIYTY
10 20 30 40 50 60
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pF1KF0 IGEVLVSVNPYQELPLYGPEAIARYQGRELYERPPHLYAVANAAYKAMKHRSRDTCIVIS
:: ::::::::..: .:. . . ::.: .:: ::::.:::...:.:.. . :: ..::
NP_001 IGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYRALRTERRDQAVMIS
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pF1KF0 GESGAGKTEASKHIMQYIAAVTNPSQRAEVERVKDVLLKSTCVLEAFGNARTNRNHNSSR
::::::::::.:...:. : . .:. . :.: ::.:. ::::::::.: :: ::::
NP_001 GESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGA--VRDRLLQSNPVLEAFGNAKTLRNDNSSR
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pF1KF0 FGKYMDINFDFKGDPIGGHIHSYLLEKSRVLKQHVGERNFHAFYQLLRGSEDKQLHELHL
::::::..::::: :.:::: :::::::::..:. :::::: :::::.:.:.. :..: :
NP_001 FGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIFYQLLEGGEEETLRRLGL
180 190 200 210 220 230
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pF1KF0 ERNPAVYNFTHQGAGLNMTVHSALDSDEQSHQAVTEAMRVIGFSPEEVESVHRILAAILH
:::: : . .: .. :... :... ..: .:. :: :. .:::.. :.:..::
NP_001 ERNPQSYLYLVKGQCAKV---SSIN-DKSDWKVVRKALTVIDFTEDEVEDLLSIVASVLH
240 250 260 270 280 290
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pF1KF0 LGNIEFVETEEGGLQKEGLAVAEEALVDHVAELTATPRDLVLRSLLARTVASGGRELIEK
::::.:. .::.. : :. : . ....: .. . . ..: : . . :.::.
NP_001 LGNIHFAANEESNAQ-----VTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIAKGEELLSP
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. .:.::::: :::::.: : :.:..:: . . . . ::.:.::::::::
NP_001 LNLE-QAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLLDIYGFEV
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pF1KF0 FPVNSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSVEYFNNATIVDLVERPH
: ::::::::::::::::::::.: ::.:::::: :::.:. :.:::: : ::::.
NP_001 FQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIICDLVEEKF
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pF1KF0 RGILAVLDEACSSAGTITDRIFLQTLDTHHRHHLHYTSRQLCPTDKTMEFGR-DFRIKHY
.::...::: : : :: ::. :. .:: :. ...: .:: .::. ::
NP_001 KGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRGEFRLLHY
470 480 490 500 510 520
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pF1KF0 AGDVTYSVEGFIDKNRDFLFQDFKRLLYNSTDPTLRAMWPDGQQDITEVTKRPLTAGTLF
::.::::: ::.::: :.::...:. . .: .: . . ...... ::: :..: :
NP_001 AGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFD--RSELSD-KKRPETVATQF
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: :.. ::: : :::: ::::::::. : :..:: :::: :::::::.::::::::
NP_001 KMSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAY
590 600 610 620 630 640
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pF1KF0 RQPYSRFLLRYKMTCEYTWPNHLLGSDKAAVSALLEQHGLQGD-VAFGHSKLFIRSPRTL
:. : :: ::: : :::. : . .:..:... : . . .:..:.::: :.::
NP_001 RRKYEAFLQRYKSLCPETWPT-WAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTL
650 660 670 680 690 700
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pF1KF0 VT----LEQSRARLIPII-------------------VLLLQKAWRGTLARWRC-RRLRA
. :: : : : .. .:. :::::.: . .: :
NP_001 FATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWA
710 720 730 740 750 760
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pF1KF0 IYTIMRWFR----RHKVRA-----HLAELQRRF--QAARQPPLYGRDLVWPLPPAVLQPF
:: : .: :: : : ... : . :: : : :: :: .:.
NP_001 AQTIRRLIRGFVLRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPQNVLDTSWPTPPPALREA
770 780 790 800 810 820
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pF1KF0 QDTCHALFCRWRARQLVKNIPPSDMPQIKAKVAAMGALQGLRQDWGCRRAWARDYLSSAT
.. . : . . . ..: : :.. :..: ..: .... .. : ..:.
NP_001 SELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYP--QSVPRLFISTRL
830 840 850 860 870 880
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pF1KF0 DNPTASSLFAQRLKTLRDKDGFGAVLFSSHVRKVNRF-HKIRNRALLLTDQHLYKLDPDR
. : : : : . .. : : .: .: :.: :::: . . ..
NP_001 GTDEISPRVLQAL-------GSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVE---
890 900 910 920 930
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pF1KF0 QYRVMRAVPLEAVTGLSVTSGGDQLVVLHARGQDDLVVCLHRSRPPLDNRVGELVGVLAA
. .: . . .::.::.: .:.: :::.. :.
NP_001 DAKVKQRIDYANLTGISVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSAN
940 950 960 970 980 990
970 980 990 1000 1010
pF1KF0 HCQGEGRTLEVRVSDCIPLSHRGVRRLISVEPRPEQPEPDFRCARGSFTLLWPSR
NP_001 RVNSININQGSITFAGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]