Result of FASTA (omim) for
pF1KF0316
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KF0316, 640 aa
1>>>pF1KF0316 640 - 640 aa - 640 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0859+/-0.000669; mu= -6.8454+/- 0.041
mean_var=422.2610+/-87.814, 0's: 0 Z-trim(115.2): 40 B-trim: 776 in 1/54
Lambda= 0.062414
statistics sampled from 25429 (25469) to 25429 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.299), width: 16
Scan time: 11.980
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_443173 (OMIM: 612466) guanylate-binding protein ( 640) 4115 385.9 2.3e-106
NP_997281 (OMIM: 612468) guanylate-binding protein ( 638) 3183 302.0 4.3e-81
NP_940862 (OMIM: 612467) guanylate-binding protein ( 633) 2911 277.5 1e-73
XP_011539137 (OMIM: 612467) PREDICTED: guanylate-b ( 633) 2911 277.5 1e-73
NP_001307186 (OMIM: 612467) guanylate-binding prot ( 503) 2193 212.7 2.5e-54
NP_002044 (OMIM: 600411) guanylate-binding protein ( 592) 2162 210.0 1.9e-53
NP_060754 (OMIM: 600413) guanylate-binding protein ( 595) 2130 207.1 1.4e-52
NP_004111 (OMIM: 600412) guanylate-binding protein ( 591) 2122 206.4 2.3e-52
NP_001127958 (OMIM: 611467) guanylate-binding prot ( 586) 1963 192.1 4.7e-48
NP_443174 (OMIM: 611467) guanylate-binding protein ( 586) 1963 192.1 4.7e-48
XP_011539535 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 516) 1794 176.8 1.7e-43
NP_001306108 (OMIM: 600413) guanylate-binding prot ( 516) 1794 176.8 1.7e-43
XP_005270800 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 516) 1794 176.8 1.7e-43
XP_006710637 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 568) 1563 156.1 3.2e-37
NP_001306110 (OMIM: 600413) guanylate-binding prot ( 544) 1540 154.0 1.3e-36
XP_016856502 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 461) 1464 147.1 1.3e-34
NP_001306109 (OMIM: 600413) guanylate-binding prot ( 461) 1464 147.1 1.3e-34
XP_011539536 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 514) 953 101.1 1e-20
XP_016856503 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 380) 913 97.4 1e-19
>>NP_443173 (OMIM: 612466) guanylate-binding protein 4 [ (640 aa)
initn: 4115 init1: 4115 opt: 4115 Z-score: 2030.4 bits: 385.9 E(85289): 2.3e-106
Smith-Waterman score: 4115; 99.1% identity (99.8% similar) in 640 aa overlap (1-640:1-640)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MGERTLHAAVPTPGYPESESIMMAPICLVENQEEQLTVNSKALEILDKISQPVVVVAIVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 MGERTLHAAVPTPGYPESESIMMAPICLVENQEEQLTVNSKALEILDKISQPVVVVAIVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 LYRTGKSYLMNRLAGKRNGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHLSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 LYRTGKSYLMNRLAGKRNGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHLSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 KSNPKNDSWIFALAVLLSSSFVYNSVSTINHQALEQLHYVTELAELIRAKSCPRPDEAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 KSNPKNDSWIFALAVLLSSSFVYNSVSTINHQALEQLHYVTELAELIRAKSCPRPDEAED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 SSEFASFFPDFIWTVRDFTLELKLDGNPITEDEYLENALKLIPGKNPKIQNSNMPRECIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 SSEFASFFPDFIWTVRDFTLELKLDGNPITEDEYLENALKLIPGKNPKIQNSNMPRECIR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 HFFRKRKCFVFDRPTNDKQYLNHMDEVPEENLERHFLMQSDNFCSYIFTHAKTKTLREGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 HFFRKRKCFVFDRPTNDKQYLNHMDEVPEENLERHFLMQSDNFCSYIFTHAKTKTLREGI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 IVTGKRLGTLVVTYVDAINSGAVPCLENAVTALAQLENPAAVQRAADHYSQQMAQQLRLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 IVTGKRLGTLVVTYVDAINSGAVPCLENAVTALAQLENPAAVQRAADHYSQQMAQQLRLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 TDTLQELLDVHAACEREAIAVFMEHSFKDENHEFQKKLVDTIEKKKGDFVLQNEEASAKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 TDTLQELLDVHAACEREAIAVFMEHSFKDENHEFQKKLVDTIEKKKGDFVLQNEEASAKY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 CQAELKRLSEHLTESILRGIFSVPGGHNLYLEEKKQVEWDYKLVPRKGVKANEVLQNFLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 CQAELKRLSEHLTESILRGIFSVPGGHNLYLEEKKQVEWDYKLVPRKGVKANEVLQNFLQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 SQVVVEESILQSDKALTAGEKAIAAERAMKEAAEKEQELLREKQKEQQQMMEAQERSFQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 SQVVVEESILQSDKALTAGEKAIAAERAMKEAAEKEQELLREKQKEQQQMMEAQERSFQE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 NIAQLKKKMERERENLLREHERLLKHKLKVQEEMLKEEFQKKSEQLNKEINQLKEKIEST
.::..::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 YMAQMEKKLEEERENLLREHERLLKHKLKVQEEMLKEEFQKKSEQLNKEINQLKEKIEST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KF0 KNEQLRLLKILDMASNIMIVTLPGASKLLGVGTKYLGSRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 KNEQLRLLKILDMASNIMIVTLPGASKLLGVGTKYLGSRI
610 620 630 640
>>NP_997281 (OMIM: 612468) guanylate-binding protein 7 [ (638 aa)
initn: 3310 init1: 3098 opt: 3183 Z-score: 1576.9 bits: 302.0 E(85289): 4.3e-81
Smith-Waterman score: 3183; 78.8% identity (92.8% similar) in 622 aa overlap (18-638:3-624)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MGERTLHAAVPTPGYPESESIMMAPICLVENQEEQLTVNSKALEILDKISQPVVVVAIVG
:: : .:.::.:: . .:.:::.:::::. :.::::::::::
NP_997 MASEIHMPGPVCLTENTKGHLVVNSEALEILSAITQPVVVVAIVG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 LYRTGKSYLMNRLAGKRNGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHLSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
:::::::::::.:::: .::::: ::.::::::::::::: :::::::.:::::::::.:
NP_997 LYRTGKSYLMNKLAGKNKGFPLGCTVKSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLILLDTEGLGDME
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 KSNPKNDSWIFALAVLLSSSFVYNSVSTINHQALEQLHYVTELAELIRAKSCPRPDEAED
::.::.:::::::::::::::::::..::::::::::::::::.:::::::::::::.::
NP_997 KSDPKSDSWIFALAVLLSSSFVYNSMGTINHQALEQLHYVTELTELIRAKSCPRPDEVED
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 SSEFASFFPDFIWTVRDFTLELKLDGNPITEDEYLENALKLIPGKNPKIQNSNMPRECIR
::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::: ::::.::::: ::: ::
NP_997 SSEFVSFFPDFIWTVRDFTLELKLDGHPITEDEYLENALKLISGKNPQIQNSNKPREWIR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 HFFRKRKCFVFDRPTNDKQYLNHMDEVPEENLERHFLMQSDNFCSYIFTHAKTKTLREGI
::: :.:::::::: :::. : :..:: :..:. .: :::.:::::::::::::::::::
NP_997 HFFPKQKCFVFDRPINDKKLLLHVEEVREDQLDSNFQMQSENFCSYIFTHAKTKTLREGI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 IVTGKRLGTLVVTYVDAINSGAVPCLENAVTALAQLENPAAVQRAADHYSQQMAQQLRLP
.:::.::: :: ::.:::::::.::::::...::: :: :::::::.:::::::::.:.:
NP_997 LVTGNRLGMLVETYLDAINSGATPCLENAMAVLAQCENSAAVQRAANHYSQQMAQQVRFP
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 TDTLQELLDVHAACEREAIAVFMEHSFKDENHEFQKKLVDTIEKKKGDFVLQNEEASAKY
::::::::::::.:::::::::::.::::...:::::::::.:::: :::::::::::::
NP_997 TDTLQELLDVHAVCEREAIAVFMEYSFKDKSQEFQKKLVDTMEKKKEDFVLQNEEASAKY
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 CQAELKRLSEHLTESILRGIFSVPGGHNLYLEEKKQVEWDYKLVPRKGVKANEVLQNFLQ
:::::::::: ::::: :: : ::::::.::: ::..: :: :::::::::.::::.:::
NP_997 CQAELKRLSELLTESISRGTFFVPGGHNIYLEAKKKIEQDYTLVPRKGVKADEVLQSFLQ
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 SQVVVEESILQSDKALTAGEKAIAAERAMKEAAEKEQELLREKQKEQQQMMEAQERSFQE
::::.::::::::::::::::::::..: ::::::::::::.::::::::::::::::::
NP_997 SQVVIEESILQSDKALTAGEKAIAAKQAKKEAAEKEQELLRQKQKEQQQMMEAQERSFQE
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 NIAQLKKKMERERENLLREHERLLKHKLKVQEEMLKEEFQKKSEQLNKEINQLKEKIEST
::::::::::::::: .:: ...:.::.:: ::.: : :.. :.::.:::.:::.::..
NP_997 NIAQLKKKMERERENYMRELRKMLSHKMKVLEELLTEGFKEIFESLNEEINRLKEQIEAA
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640
pF1KF0 KNEQLRLL-KILDMASNIMIVTLPGASKLLGVGTKYLGSRI
.::. .. .:::.:..:.:..::::.::. .: : :.:
NP_997 ENEEPSVFSQILDVAGSIFIAALPGAAKLVDLGMKILSSLCNRLRNPGKKIIS
590 600 610 620 630
>>NP_940862 (OMIM: 612467) guanylate-binding protein 6 i (633 aa)
initn: 2910 init1: 2878 opt: 2911 Z-score: 1444.6 bits: 277.5 E(85289): 1e-73
Smith-Waterman score: 2911; 71.1% identity (89.9% similar) in 623 aa overlap (17-638:2-624)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MGERTLHAAVPTPGYPESESIMMAPICLVENQEEQLTVNSKALEILDKISQPVVVVAIVG
:: :.::.:::::..::: ::..:..::.:::::::::::::
NP_940 MESGPKMLAPVCLVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 LYRTGKSYLMNRLAGKRNGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHLSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
:::::::::::.:::. .:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
NP_940 LYRTGKSYLMNHLAGQNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 KSNPKNDSWIFALAVLLSSSFVYNSVSTINHQALEQLHYVTELAELIRAKSCPRPDEAED
:..:::::::::::::: :.:::::.:::::::::::::::::.:::.::: :::: .::
NP_940 KGDPKNDSWIFALAVLLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVED
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 SSEFASFFPDFIWTVRDFTLELKLDGNPITEDEYLENALKLIPGKNPKIQNSNMPRECIR
:.::.::::::.::::::::::::.:.::::::::::::::: :.::..:.::.::::::
NP_940 STEFVSFFPDFLWTVRDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 HFFRKRKCFVFDRPTNDKQYLNHMDEVPEENLERHFLMQSDNFCSYIFTHAKTKTLREGI
.:: ::::::::::::::. : ....: :..:. .: :.. :::::::::.::::::::
NP_940 RFFPKRKCFVFDRPTNDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 IVTGKRLGTLVVTYVDAINSGAVPCLENAVTALAQLENPAAVQRAADHYSQQMAQQLRLP
:::.:::::.::::.:::::::::::::: .::: :: ::::::::.:::::::...::
NP_940 TVTGNRLGTLAVTYVEAINSGAVPCLENAVITLAQRENSAAVQRAADYYSQQMAQRVKLP
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 TDTLQELLDVHAACEREAIAVFMEHSFKDENHEFQKKLVDTIEKKKGDFVLQNEEASAKY
:::::::::.::::::::::.::::::::::.:::::...: .:::::.:::::.:..:
NP_940 TDTLQELLDMHAACEREAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQY
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 CQAELKRLSEHLTESILRGIFSVPGGHNLYLEEKKQVEWDYKLVPRKGVKANEVLQNFLQ
:::.:..::. : ::: : :::::::.::.: :...: :: ::::::::.::.: ::.
NP_940 CQAKLNELSKGLMESISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLE
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 SQVVVEESILQSDKALTAGEKAIAAERAMKEAAEKEQELLREKQKEQQQMMEAQERSFQE
::.:.:::::::::::: :::.:..:: :::::::::::..: .::::.::::..: .:
NP_940 SQMVIEESILQSDKALTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQDKSRKE
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 NIAQLKKKMERERENLLREHERLLKHKLKVQEEMLKEEFQKKSEQLNKEINQLKEKIEST
::::::.:.. :::.::::. .:.: :::.. :.: :.:: :..: ::.:.:. :..:
NP_940 NIAQLKEKLQMEREHLLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTT
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640
pF1KF0 KNEQLRLL-KILDMASNIMIVTLPGASKLLGVGTKYLGSRI
::.. . . :: .. . . : . .::.: :.: ..:
NP_940 KNDDTPWIARTLDNLADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
590 600 610 620 630
>>XP_011539137 (OMIM: 612467) PREDICTED: guanylate-bindi (633 aa)
initn: 2910 init1: 2878 opt: 2911 Z-score: 1444.6 bits: 277.5 E(85289): 1e-73
Smith-Waterman score: 2911; 71.1% identity (89.9% similar) in 623 aa overlap (17-638:2-624)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MGERTLHAAVPTPGYPESESIMMAPICLVENQEEQLTVNSKALEILDKISQPVVVVAIVG
:: :.::.:::::..::: ::..:..::.:::::::::::::
XP_011 MESGPKMLAPVCLVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 LYRTGKSYLMNRLAGKRNGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHLSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
:::::::::::.:::. .:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
XP_011 LYRTGKSYLMNHLAGQNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 KSNPKNDSWIFALAVLLSSSFVYNSVSTINHQALEQLHYVTELAELIRAKSCPRPDEAED
:..:::::::::::::: :.:::::.:::::::::::::::::.:::.::: :::: .::
XP_011 KGDPKNDSWIFALAVLLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVED
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 SSEFASFFPDFIWTVRDFTLELKLDGNPITEDEYLENALKLIPGKNPKIQNSNMPRECIR
:.::.::::::.::::::::::::.:.::::::::::::::: :.::..:.::.::::::
XP_011 STEFVSFFPDFLWTVRDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 HFFRKRKCFVFDRPTNDKQYLNHMDEVPEENLERHFLMQSDNFCSYIFTHAKTKTLREGI
.:: ::::::::::::::. : ....: :..:. .: :.. :::::::::.::::::::
XP_011 RFFPKRKCFVFDRPTNDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 IVTGKRLGTLVVTYVDAINSGAVPCLENAVTALAQLENPAAVQRAADHYSQQMAQQLRLP
:::.:::::.::::.:::::::::::::: .::: :: ::::::::.:::::::...::
XP_011 TVTGNRLGTLAVTYVEAINSGAVPCLENAVITLAQRENSAAVQRAADYYSQQMAQRVKLP
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 TDTLQELLDVHAACEREAIAVFMEHSFKDENHEFQKKLVDTIEKKKGDFVLQNEEASAKY
:::::::::.::::::::::.::::::::::.:::::...: .:::::.:::::.:..:
XP_011 TDTLQELLDMHAACEREAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQY
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 CQAELKRLSEHLTESILRGIFSVPGGHNLYLEEKKQVEWDYKLVPRKGVKANEVLQNFLQ
:::.:..::. : ::: : :::::::.::.: :...: :: ::::::::.::.: ::.
XP_011 CQAKLNELSKGLMESISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLE
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 SQVVVEESILQSDKALTAGEKAIAAERAMKEAAEKEQELLREKQKEQQQMMEAQERSFQE
::.:.:::::::::::: :::.:..:: :::::::::::..: .::::.::::..: .:
XP_011 SQMVIEESILQSDKALTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQDKSRKE
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 NIAQLKKKMERERENLLREHERLLKHKLKVQEEMLKEEFQKKSEQLNKEINQLKEKIEST
::::::.:.. :::.::::. .:.: :::.. :.: :.:: :..: ::.:.:. :..:
XP_011 NIAQLKEKLQMEREHLLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTT
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640
pF1KF0 KNEQLRLL-KILDMASNIMIVTLPGASKLLGVGTKYLGSRI
::.. . . :: .. . . : . .::.: :.: ..:
XP_011 KNDDTPWIARTLDNLADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
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>>NP_001307186 (OMIM: 612467) guanylate-binding protein (503 aa)
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120 130 140 150 160 170
pF1KF0 LGDVEKSNPKNDSWIFALAVLLSSSFVYNSVSTINHQALEQLHYVTELAELIRAKSCPRP
.:::::::::::::::::.:::.::: :::
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: .:::.::.::::::.::::::::::::.:.::::::::::::::: :.::..:.::.:
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:::::.:: ::::::::::::::. : ....: :..:. .: :.. :::::::::.:::
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::::: :::.:::::.::::.:::::::::::::: .::: :: ::::::::.:::::::
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...:::::::::::.::::::::::.::::::::::.:::::...: .:::::.:::::
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:..:::.. . . :: .. . . : . .::.: :.: ..:
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>>NP_002044 (OMIM: 600411) guanylate-binding protein 1 [ (592 aa)
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:: : .:.::.:: . .: .: .::.::. :.::.:::::::
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NP_002 EDSADFVSFFPDFVWTLRDFSLDLEADGQPLTPDEYLTYSLKLKKGTSQKDETFNLPRLC
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pF1KF0 IRHFFRKRKCFVFDRPTNDKQYLNHMDEVPEENLERHFLMQSDNFCSYIFTHAKTKTLRE
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:: :.: :: .::.:::.::.:: .::.:::: ::::.:: ::::.: :: :::.:...
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:
NP_002 RRKACTIS
590
>>NP_060754 (OMIM: 600413) guanylate-binding protein 3 i (595 aa)
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:::::::::::.:::: .:: :::::.:.::::::::::: .::.::::::::::::::.
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:.. .::::::.:::::::..::::..:::.::..::.:::::.. ::.:: : .: ::
NP_060 KGDNQNDSWIFTLAVLLSSTLVYNSMGTINQQAMDQLYYVTELTHRIRSKSSPDENENED
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NP_060 SADFVSFFPDFVWTLRDFSLDLEADGQPLTPDEYLEYSLKLTQGTSQKDKNFNLPRLCIR
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NP_060 KFFPKKKCFVFDLPIHRRK-LAQLEKLQDEELDPEFVQQVADFCSYIFSNSKTKTLSGGI
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NP_060 KVNGPRLESLVLTYINAISRGDLPCMENAVLALAQIENSAAVQKAIAHYDQQMGQKVQLP
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NP_060 AETLQELLDLHRVSEREATEVYMKNSFKDVDHLFQKKLAAQLDKKRDDFCKQNQEASSDR
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NP_060 SKESVTDAILQTDQILTEKEKEIEVECVKAESAQASAKMVEEMQIKYQQMMEEKEKSYQE
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.. :: .:::::: .::.:.:. : ::. : ..:::. : .: ::..::..:.. ...
NP_060 HVKQLTEKMERERAQLLEEQEKTLTSKLQEQARVLKERCQGESTQLQNEIQKLQKTLKKK
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:: . . :::
NP_060 TKRYMSHKLKI
590
>>NP_004111 (OMIM: 600412) guanylate-binding protein 2 [ (591 aa)
initn: 2190 init1: 1080 opt: 2122 Z-score: 1061.0 bits: 206.4 E(85289): 2.3e-52
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:::::::::::.::::.::: :::::.:.::::::::::: .::.:::::::::::::.:
NP_004 LYRTGKSYLMNKLAGKKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIE
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:.. .:::::::::.::::.:::::..:::.::..::::::::.. :.:.: : . ..:
NP_004 KGDNENDSWIFALAILLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDD
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pF1KF0 SSEFASFFPDFIWTVRDFTLELKLDGNPITEDEYLENALKLIPGKNPKIQNSNMPRECIR
:..:.:::: :.::.:::::::..::.::: :.::: .::: : . : .. : :: :::
NP_004 SADFVSFFPAFVWTLRDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIR
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pF1KF0 HFFRKRKCFVFDRPTNDKQYLNHMDEVPEENLERHFLMQSDNFCSYIFTHAKTKTLREGI
.:: :::::::: :. :.:: :.... ::.:. :. : .:::::..:...::: ::
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NP_004 CMALLQDIFGPLEEDVKQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLE
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NP_004 SKEDVADALLQTDQSLSEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQE
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.. :: .::::.: .:. :.:. : ::. ::..::: :...:..:.:.: ... . .:
NP_004 HVKQLTEKMERDRAQLMAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSL
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pF1KF0 KNEQLRLLKILDMASNIMIVTLPGASKLLGVGTKYLGSRI
NP_004 EPICNIL
590
>>NP_001127958 (OMIM: 611467) guanylate-binding protein (586 aa)
initn: 1960 init1: 1027 opt: 1963 Z-score: 983.6 bits: 192.1 E(85289): 4.7e-48
Smith-Waterman score: 1963; 51.6% identity (79.6% similar) in 578 aa overlap (22-599:7-579)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MGERTLHAAVPTPGYPESESIMMAPICLVENQEEQLTVNSKALEILDKISQPVVVVAIVG
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pF1KF0 LYRTGKSYLMNRLAGKRNGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHLSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
:::::::::::.:::: .:: ..:::::.:::::.::::: . :::::::::::::::::
NP_001 LYRTGKSYLMNKLAGKNKGFSVASTVQSHTKGIWIWCVPHPNWPNHTLVLLDTEGLGDVE
50 60 70 80 90 100
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pF1KF0 KSNPKNDSWIFALAVLLSSSFVYNSVSTINHQALEQLHYVTELAELIRAKSCPRPDEAED
:.. ::: :::::.::::.::::.:. :.. :.. :: ::::..:..:.. : :..::
NP_001 KADNKNDIQIFALALLLSSTFVYNTVNKIDQGAIDLLHNVTELTDLLKARNSPDLDRVED
110 120 130 140 150 160
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pF1KF0 SSEFASFFPDFIWTVRDFTLELKLDGNPITEDEYLENALKLIPGKNPKIQNSNMPRECIR
.. ::::::..::.::: : :..::. .: ::::::.:. :.. ..:: :.:: ::.
NP_001 PADSASFFPDLVWTLRDFCLGLEIDGQLVTPDEYLENSLRPKQGSDQRVQNFNLPRLCIQ
170 180 190 200 210 220
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NP_001 KFFPKKKCFIFDLPAHQKK-LAQLETLPDDELEPEFVQQVTEFCSYIFSHSMTKTLPGGI
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.:::::::.: . ::::: :::..:::: .. :::.: .. :..:. .: :::. :
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:.: :: . : :.. .::.: ::::::.... .... : ::::..:.::::..:.
NP_001 CSALLKDIFGPLEEAVKQGIYSKPGGHNLFIQKTEELKAKYYREPRKGIQAEEVLQKYLK
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:. : ..:::.:.::: :: .. :: . : . : :....:::. .:: ::
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