Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0017
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0017, 1217 aa
1>>>pF1KSDA0017 1217 - 1217 aa - 1217 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0014+/-0.000497; mu= 23.7311+/- 0.031
mean_var=59.7589+/-12.019, 0's: 0 Z-trim(107.3): 49 B-trim: 248 in 2/50
Lambda= 0.165910
statistics sampled from 15359 (15368) to 15359 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.523), E-opt: 0.2 (0.18), width: 16
Scan time: 13.150
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_036558 (OMIM: 605592) splicing factor 3B subuni (1217) 8032 1932.1 0
NP_001914 (OMIM: 600045) DNA damage-binding protei (1140) 367 97.4 5.5e-19
XP_011515299 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage an (1365) 157 47.2 0.00086
XP_011515300 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage an (1365) 157 47.2 0.00086
XP_006716612 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage an (1365) 157 47.2 0.00086
XP_011515301 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage an (1365) 157 47.2 0.00086
XP_006716611 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage an (1440) 157 47.2 0.0009
NP_037423 (OMIM: 606027) cleavage and polyadenylat (1443) 157 47.2 0.0009
XP_006716613 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage an ( 785) 152 45.9 0.0012
>>NP_036558 (OMIM: 605592) splicing factor 3B subunit 3 (1217 aa)
initn: 8032 init1: 8032 opt: 8032 Z-score: 10376.9 bits: 1932.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8032; 100.0% identity (100.0% similar) in 1217 aa overlap (1-1217:1-1217)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MFLYNLTLQRATGISFAIHGNFSGTKQQEIVVSRGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MFLYNLTLQRATGISFAIHGNFSGTKQQEIVVSRGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVFG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VIRSLMAFRLTGGTKDYIVVGSDSGRIVILEYQPSKNMFEKIHQETFGKSGCRRIVPGQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 VIRSLMAFRLTGGTKDYIVVGSDSGRIVILEYQPSKNMFEKIHQETFGKSGCRRIVPGQF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LAVDPKGRAVMISAIEKQKLVYILNRDAAARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGVDVGFENP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LAVDPKGRAVMISAIEKQKLVYILNRDAAARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGVDVGFENP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD MFACLEMDYEEADNDPTGEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKYSEPLEEHGNFLITVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MFACLEMDYEEADNDPTGEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKYSEPLEEHGNFLITVPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GSDGPSGVLICSENYITYKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 GSDGPSGVLICSENYITYKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FLAQTEQGDIFKITLETDEDMVTEIRLKYFDTVPVAAAMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 FLAQTEQGDIFKITLETDEDMVTEIRLKYFDTVPVAAAMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD IAHLGDDDEEPEFSSAMPLEEGDTFFFQPRPLKNLVLVDELDSLSPILFCQIADLANEDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 IAHLGDDDEEPEFSSAMPLEEGDTFFFQPRPLKNLVLVDELDSLSPILFCQIADLANEDT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PQLYVACGRGPRSSLRVLRHGLEVSEMAVSELPGNPNAVWTVRRHIEDEFDAYIIVSFVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 PQLYVACGRGPRSSLRVLRHGLEVSEMAVSELPGNPNAVWTVRRHIEDEFDAYIIVSFVN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ATLVLSIGETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDALVQVYPDGIRHIRADKRVNEWKTPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 ATLVLSIGETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDALVQVYPDGIRHIRADKRVNEWKTPG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD KKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADVVCMSLANVPPGEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 KKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADVVCMSLANVPPGEQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD RSRFLAVGLVDNTVRIISLDPSDCLQPLSMQALPAQPESLCIVEMGGTEKQDELGERGSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 RSRFLAVGLVDNTVRIISLDPSDCLQPLSMQALPAQPESLCIVEMGGTEKQDELGERGSI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD GFLYLNIGLQNGVLLRTVLDPVTGDLSDTRTRYLGSRPVKLFRVRMQGQEAVLAMSSRSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 GFLYLNIGLQNGVLLRTVLDPVTGDLSDTRTRYLGSRPVKLFRVRMQGQEAVLAMSSRSW
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD LSYSYQSRFHLTPLSYETLEFASGFASEQCPEGIVAISTNTLRILALEKLGAVFNQVAFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LSYSYQSRFHLTPLSYETLEFASGFASEQCPEGIVAISTNTLRILALEKLGAVFNQVAFP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LQYTPRKFVIHPESNNLIIIETDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEAAGEDERELAAEMAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LQYTPRKFVIHPESNNLIIIETDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEAAGEDERELAAEMAA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD AFLNENLPESIFGAPKAGNGQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQNEAAFSVAVCRFSNTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 AFLNENLPESIFGAPKAGNGQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQNEAAFSVAVCRFSNTG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD EDWYVLVGVAKDLILNPRSVAGGFVYTYKLVNNGEKLEFLHKTPVEEVPAAIAPFQGRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 EDWYVLVGVAKDLILNPRSVAGGFVYTYKLVNNGEKLEFLHKTPVEEVPAAIAPFQGRVL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD IGVGKLLRVYDLGKKKLLRKCENKHIANYISGIQTIGHRVIVSDVQESFIWVRYKRNENQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 IGVGKLLRVYDLGKKKLLRKCENKHIANYISGIQTIGHRVIVSDVQESFIWVRYKRNENQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD LIIFADDTYPRWVTTASLLDYDTVAGADKFGNICVVRLPPNTNDEVDEDPTGNKALWDRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LIIFADDTYPRWVTTASLLDYDTVAGADKFGNICVVRLPPNTNDEVDEDPTGNKALWDRG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD LLNGASQKAEVIMNYHVGETVLSLQKTTLIPGGSESLVYTTLSGGIGILVPFTSHEDHDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LLNGASQKAEVIMNYHVGETVLSLQKTTLIPGGSESLVYTTLSGGIGILVPFTSHEDHDF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD FQHVEMHLRSEHPPLCGRDHLSFRSYYFPVKNVIDGDLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 FQHVEMHLRSEHPPLCGRDHLSFRSYYFPVKNVIDGDLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRT
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210
pF1KSD PPEVSKKLEDIRTRYAF
:::::::::::::::::
NP_036 PPEVSKKLEDIRTRYAF
1210
>>NP_001914 (OMIM: 600045) DNA damage-binding protein 1 (1140 aa)
initn: 376 init1: 160 opt: 367 Z-score: 461.9 bits: 97.4 E(85289): 5.5e-19
Smith-Waterman score: 871; 23.5% identity (54.5% similar) in 1217 aa overlap (4-1197:5-1112)
10 20 30 40 50
pF1KSD MFLYNLTLQRATGISFAIHGNFSGTKQQEIVVSRGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVF
: .: :. :... . :.:..... ....... ::. . .. . : ..
NP_001 MSYNYVVTAQKPTAVNGCVTGHFTSAEDLNLLIAKNTRLEIYVVTAEG--LRPVKEVGMY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD GVIRSLMAFRLTGGTKDYIVVGSDSGRIVILEYQPSK---NMFEKIHQETFGKSGCRRIV
: : . :: : .:: . . . . ::::. : ... . : .. . : :
NP_001 GKIAVMELFRPKGESKDLLFILTAKYNACILEYKQSGESIDIITRAHGNVQDRIG-RPSE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD PGQFLAVDPKGRAVMISAIEKQKLVYILNRDAAARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGVDVG
: . .::. : . . . : :.:: .. :.: . ::. ::
NP_001 TGIIGIIDPECRMIGLRLYDGLFKVIPLDRD-------NKELKAFNIRLEELHVI--DVK
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KSD FENPMFACLEMDYEEADNDPTGEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKYSEPLEEHGNFLI
: ...: . .:: :. . . . .: :.. : . .: .: .....:
NP_001 F---LYGCQAPTICFVYQDPQGRHVKTYEVSLREKEFNKGPWK-----QENVEAEASMVI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TVPGGSDGPSGVLICSENYITYKNFGDQP-DIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKT
.:: . .:..: ... :::.: ::. : :: .. . .::
NP_001 AVP---EPFGGAIIIGQESITYHN-GDKYLAIAPPIIKQST----------IVCHNRVDP
230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KSD KSMFFFLAQTEQGDIFKITLETDEDM---VT--EIRLKYFDTVPVAAAMCVLKTGFLFVA
.. ..:.. : : .: . :: .:.: :: ..:.. . . .: . : .: .::.
NP_001 NGSRYLLGDME-GRLFMLLLEKEEQMDGTVTLKDLRVELLGETSIAECLTYLDNGVVFVG
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SEFGNHYLYQIAHLGDDDEEPEFSSAMPLEEGDTFFFQPRPLKNLVLVDELDSLSPILFC
:..:. : .. :..:. . :: .:: .:.::.
NP_001 SRLGDSQLVKLNV--DSNEQGSYVVAM-----ETF----------------TNLGPIVDM
330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KSD QIADLANEDTPQLYVACGRGPRSSLRVLRHGLEVSEMAVSELPGNPNAVWTVRRHIEDEF
..:: . :: . : ..:::..:.:. . : : .::: ...: .: . :
NP_001 CVVDLERQGQGQLVTCSGAFKEGSLRIIRNGIGIHEHASIDLPGI-KGLWPLRSDPNRET
370 380 390 400 410 420
480 490 500 510 520
pF1KSD DAYIIVSFVNATLVLSI-GETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDALVQVYPDGIRHIRA
: ...:::. : :: . :: :::. ::. :. :. .. . :.:. ..: .
NP_001 DDTLVLSFVGQTRVLMLNGEEVEETELMGFVDDQQTFFCGNVAHQQLIQITSASVRLVSQ
430 440 450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KSD DKR--VNEWKTPGKKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADV
. . :.::: : :.: . :. :::.:. : : :... :. .: . .. :: .:
NP_001 EPKALVSEWKEPQAKNISVASCNSSQVVVAV-GRALYYLQIHPQ-ELRQISHT-EMEHEV
490 500 510 520 530
590 600 610 620 630 640
pF1KSD VCMSLANVPPGEQRSRFLAVGL-VDNTVRIISLDPSDCLQPLSMQALPAQPESLCIVEMG
.:.... . .. : . :.:: .: ..::..: :: : : . :.:. .. .
NP_001 ACLDITPLGDSNGLSPLCAIGLWTDISARILKL-PSFELLHKEMLGGEIIPRSILMTTFE
540 550 560 570 580 590
650 660 670 680 690 700
pF1KSD GTEKQDELGERGSIGFLYLNIGLQNGVLLRTVLDPVTGDLSDTRTRYLGSRPVKLFRVRM
... :: .: .:.:. :. :: ::: . ::..:. : :
NP_001 SSH--------------YLLCALGDGALFYFGLNIETGLLSDRKKVTLGTQPTVLRTFRS
600 610 620 630 640
710 720 730 740 750 760
pF1KSD QGQEAVLAMSSRSWLSYSYQSRFHLTPLSYETLEFASGFASEQCPEGIVAISTNTLRILA
. :.: :.: . :: . .. .. .. . ... . :. :.... ...:: : .
NP_001 LSTTNVFACSDRPTVIYSSNHKLVFSNVNLKEVNYMCPLNSDGYPDSLALANNSTLTIGT
650 660 670 680 690 700
770 780 790 800 810 820
pF1KSD LEKLGAVFNQVAFPLQYTPRKFVIHPESNNLIIIETDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEA
.... . ... :: .:::. . :. . .. . ..: . . . .
NP_001 IDEIQKLHIRTV-PLYESPRKICYQEVSQCFGVLSSR-------IEVQDTSGGTTALRPS
710 720 730 740 750
830 840 850 860 870 880
pF1KSD AGEDERELAAEMAAAFLNENLP-ESIFGAPKAGNGQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQN
:. . .. . : . . : :. :: .. . ... ..: :. ::
NP_001 ASTQALSSSVSSSKLFSSSTAPHETSFGEEVEVHN-----LLIIDQHTFEVLHAHQFLQN
760 770 780 790 800 810
890 900 910 920 930 940
pF1KSD EAAFSVAVCRFSNTGEDWYVLVGVAKDLILNPRSVAG--GFVYTYKLVNNGEKLEFLHKT
: :.:.. :.... . : .::.: .. :. . : . ... ..: ::. . .
NP_001 EYALSLVSCKLGKD-PNTYFIVGTA---MVYPEEAEPKQGRIVVFQY-SDG-KLQTVAEK
820 830 840 850 860
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD PVEEVPAAIAPFQGRVLIGVGKLLRVYDLGKKKLLRKCENKHIANYIS-GIQTIGHRVIV
:. . ... :.:..: .... .:.:. .: :: : .: : .. ..: : ..:
NP_001 EVKGAVYSMVEFNGKLLASINSTVRLYEWTTEKELRT-ECNHYNNIMALYLKTKGDFILV
870 880 890 900 910 920
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD SDVQESFIWVRYKRNENQLIIFADDTYPRWVTTASLLDYDTVAGADKFGNICVVRLPPNT
.:...: . . :: :... .: : : :.... .:: :. ::.. :. : . ..
NP_001 GDLMRSVLLLAYKPMEGNFEEIARDFNPNWMSAVEILDDDNFLGAENAFNLFVCQ--KDS
930 940 950 960 970 980
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD NDEVDEDPTGNKALWDRGLLNGASQKAEVIMNYHVGETVL-SLQKTTLIPGGSESLVYTT
.::. . : . ::.. .: . . : :. .: .:. :: ... :
NP_001 AATTDEE---RQHLQEVGLFH----LGEFVNVFCHGSLVMQNLGETSTPTQGS--VLFGT
990 1000 1010 1020 1030
1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD LSGGIGILVPFTSHEDHDFFQHVEMHLRSEHPPLCGRDHLSFRSYYF-----PVKNVIDG
..: :: :: :. .... .. .: . . .: .::.. :. . :::
NP_001 VNGMIG-LVTSLSESWYNLLLDMQNRLNKVIKSVGKIEHSFWRSFHTERKTEPATGFIDG
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1180 1190 1200 1210
pF1KSD DLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRTPPEVSKKLEDIRTRYAF
:: :.: .. :...: .:
NP_001 DLIESFLDISRPKMQEVVANLQYDDGSGMKREATADDLIKVVEELTRIH
1100 1110 1120 1130 1140
>>XP_011515299 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage and po (1365 aa)
initn: 113 init1: 70 opt: 157 Z-score: 189.1 bits: 47.2 E(85289): 0.00086
Smith-Waterman score: 188; 19.8% identity (52.9% similar) in 501 aa overlap (717-1201:871-1348)
690 700 710 720 730 740
pF1KSD SDTRTRYLGSRPVKLFRVRMQGQEAVLAMSSRSWLSYSYQSRFHLTPLSYE-TLEFASGF
: :: . .. ..: :.. . .. . :
XP_011 EEGAGARGRVARFRYFEDIYGYSGVFICGPSPHWLLVTGRGALRLHPMAIDGPVDSFAPF
850 860 870 880 890 900
750 760 770 780 790 800
pF1KSD ASEQCPEGIVAISTN-TLRILALE---KLGAVFNQVAFPLQYTPRKFVIHPESNNLIIIE
. .::.:.. .. . ::: .: . : . .::. : . . : ::. . .
XP_011 HNVNCPRGFLYFNRQGELRISVLPAYLSYDAPWPVRKIPLRCTAHYVAYHVESK-VYAVA
910 920 930 940 950
810 820 830 840 850
pF1KSD TDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEAAGEDERELAAEMAAAFLNENLPESIFGAPKAGN--
:. : : .. : . :. :. .::: . .. : .. : : . :.:
XP_011 TSTN--TPCARIPR-MTGEEKEFETIERDERYIHPQQEAFSIQLISPVSWEAIPNARIEL
960 970 980 990 1000 1010
860 870 880 890 900 910
pF1KSD GQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQNEAAFSVAVCRFSNTGEDWYVLVGVAKDLILNPRS
.: : :. .. . . :. .. .: .. . . .. .:. . ... .:
XP_011 QEWEHVT-CMKTVSLRSEETVSGLKGYVAAGTCLMQGEEVTCRGRILIMDVIEVVPEP--
1020 1030 1040 1050 1060 1070
920 930 940 950 960 970
pF1KSD VAGGFVYTYKLVNNGEKLEFLHKTPVEEVPAAIAPFQGRVLIGVGKLLRVYDLGKKKLLR
: . :. :: . : :: .:. .:... ..:. . ...: . . :
XP_011 --GQPLTKNKFKVLYEKEQ---KGPV----TALCHCNGHLVSAIGQKIFLWSL-RASELT
1080 1090 1100 1110 1120
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD KCENKHIANYISGIQTIGHRVIVSDVQESFIWVRYKRNENQLIIFADDTYPRWVTTASLL
:: . .. . ....::..:. .::... . : . . :. : : .....
XP_011 GMAFIDTQLYIHQMISVKNFILAADVMKSISLLRYQEESKTLSLVSRDAKPLEVYSVDFM
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD DYDTVAG---ADKFGNICVVRLPPNTNDEVDEDPTGNKALWDRGLLNGASQKAEVIMNYH
.. : .:. :. : : :. :. : . : . :: .....
XP_011 VDNAQLGFLVSDRDRNLMVYMYLP----EAKESFGGMRLLRRADFHVGA--HVNTFWRTP
1190 1200 1210 1220 1230
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD VGETVLSLQKTTLIPGGSESLVYTTLSGGIGILVPFT--SHEDHDFFQHVEMHLRSEHPP
.. .:.: ... ... ..::.::::.:.:. ... ..:.. . .:
XP_011 CRGATEGLSKKSVVWENKHITWFATLDGGIGLLLPMQEKTYRRLLMLQNALTTMLPHHAG
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KSD LCGRD----HLSFRSYYFPVKNVIDGDLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRTPPEVSKKLED
: : :.. :. :.::.::.: ... . ......... ::
XP_011 LNPRAFRMLHVDRRTLQNAVRNVLDGELLNRYLYLSTMERSELAKKIGTTPDIILDDLLE
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD IRTRYAF
XP_011 TDRVTAHF
1360
>--
initn: 158 init1: 70 opt: 157 Z-score: 189.1 bits: 47.2 E(85289): 0.00086
Smith-Waterman score: 253; 21.2% identity (51.1% similar) in 599 aa overlap (64-566:2-590)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD RGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVFGVIRSLMAFRLTGGTKDYIVVGSDSGRIVILEYQ
:. . .:.:. .: .... .... ..::.
XP_011 MSMASVQLAGAKRDALLLSFKDAKLSVVEYD
10 20 30
100 110 120 130 140
pF1KSD PS----KNMFEKIHQETFGKSGCRRIVPGQFLAVDPKGRAVMISAIEKQKLVYILNRDAA
:. :.. . .: ..: . : . ::: :: . . . . .: . :..
XP_011 PGTHDLKTLSLHYFEEPELRDGFVQNVHTPRVRVDPDGRCAAMLVYGTRLVVLPFRRESL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190
pF1KSD ARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGVDVGFENPMFACLEMDYEEADNDPT------------
:. . :..... : ... : . ... .. ..... .. .::
XP_011 AEEHEGLVGEGQRSSFLPSYIIDVRA-LDEKLLNIIDLQFLHGYYEPTLLILFEPNQTWP
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KSD GEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKY-----SEPLEEHGNFLITVPGGSDGPSGVLICS
:..:. :.: .. ..:.... :. : :.. . . : : ::.. .
XP_011 GRVAVR-QDTCSIVAISLNITQKVHPVIWSLTSLPFDCTQALAVPKPIG-----GVVVFA
160 170 180 190 200
260 270 280 290 300
pF1KSD ENYITYKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFF----FLAQTEQG
: . : : . : . : : . : . ... :. .. . . :
XP_011 VNSLLYLNQSVPPYGVALNSLTTGTTAFPLRTQEGVRITLDCAQATFISYDKMVISLKGG
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DIFKITLETDEDMVTEIRLKYFDTVPVAA---AMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQ-----
.:. .:: :: . .: .:: . ... .: ... :.::..:..:: : .
XP_011 EIYVLTLITDG--MRSVRAFHFDKAAASVLTTSMVTMEPGYLFLGSRLGNSLLLKYTEKL
270 280 290 300 310 320
370 380 390
pF1KSD -------IAHLGDDDEEPE----------FSSA---MPLEEGDTF-FFQPRPLKNLVLV-
. . .: .: : .:.: .: .: : . . . .. :.
XP_011 QEPPASAVREAADKEEPPSKKKRVDATAGWSAAGKSVPQDEVDEIEVYGSEAQSGTQLAT
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440
pF1KSD ---DELDSLSPILFCQIA----------DLANEDTPQL-YVAC-GRGPRSSLRVLRHGLE
. ::. : : : .. : :.: :.: :.: ..: ::.....
XP_011 YSFEVCDSILNIGPCANAAVGEPAFLSEEFQNSPEPDLEIVVCSGHGKNGALSVLQKSIR
390 400 410 420 430 440
450 460 470
pF1KSD VSEMAVSELPGNPNAVWTV----RRHIED---------------EFD------AYIIVSF
. ... :::: . .::: :.. :: : : ...:.:
XP_011 PQVVTTFELPGCYD-MWTVIAPVRKEEEDNPKGEGTEQEPSTTPEADDDGRRHGFLILSR
450 460 470 480 490 500
480 490 500 510 520 530
pF1KSD VNATLVLSIGETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDA-LVQVYPDGIRHIRADKRVNEWK
..:..:. :. . :. ::: ::. . .::. .::: : ::: ... ....
XP_011 EDSTMILQTGQEIMELDTSGFATQGPTVFAGNIGDNRYIVQVSPLGIRLLEGVNQLHFIP
510 520 530 540 550 560
540 550 560 570 580 590
pF1KSD TPGKKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADVVCMSLANVPP
. ::.::: . ::: . :....:
XP_011 VDLGAPIVQCAVADPYVVIMSAEGHVTMFLLKSDSYGGRHHRLALHKPPLHHQSKVITLC
570 580 590 600 610 620
>>XP_011515300 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage and po (1365 aa)
initn: 113 init1: 70 opt: 157 Z-score: 189.1 bits: 47.2 E(85289): 0.00086
Smith-Waterman score: 188; 19.8% identity (52.9% similar) in 501 aa overlap (717-1201:871-1348)
690 700 710 720 730 740
pF1KSD SDTRTRYLGSRPVKLFRVRMQGQEAVLAMSSRSWLSYSYQSRFHLTPLSYE-TLEFASGF
: :: . .. ..: :.. . .. . :
XP_011 EEGAGARGRVARFRYFEDIYGYSGVFICGPSPHWLLVTGRGALRLHPMAIDGPVDSFAPF
850 860 870 880 890 900
750 760 770 780 790 800
pF1KSD ASEQCPEGIVAISTN-TLRILALE---KLGAVFNQVAFPLQYTPRKFVIHPESNNLIIIE
. .::.:.. .. . ::: .: . : . .::. : . . : ::. . .
XP_011 HNVNCPRGFLYFNRQGELRISVLPAYLSYDAPWPVRKIPLRCTAHYVAYHVESK-VYAVA
910 920 930 940 950
810 820 830 840 850
pF1KSD TDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEAAGEDERELAAEMAAAFLNENLPESIFGAPKAGN--
:. : : .. : . :. :. .::: . .. : .. : : . :.:
XP_011 TSTN--TPCARIPR-MTGEEKEFETIERDERYIHPQQEAFSIQLISPVSWEAIPNARIEL
960 970 980 990 1000 1010
860 870 880 890 900 910
pF1KSD GQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQNEAAFSVAVCRFSNTGEDWYVLVGVAKDLILNPRS
.: : :. .. . . :. .. .: .. . . .. .:. . ... .:
XP_011 QEWEHVT-CMKTVSLRSEETVSGLKGYVAAGTCLMQGEEVTCRGRILIMDVIEVVPEP--
1020 1030 1040 1050 1060 1070
920 930 940 950 960 970
pF1KSD VAGGFVYTYKLVNNGEKLEFLHKTPVEEVPAAIAPFQGRVLIGVGKLLRVYDLGKKKLLR
: . :. :: . : :: .:. .:... ..:. . ...: . . :
XP_011 --GQPLTKNKFKVLYEKEQ---KGPV----TALCHCNGHLVSAIGQKIFLWSL-RASELT
1080 1090 1100 1110 1120
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD KCENKHIANYISGIQTIGHRVIVSDVQESFIWVRYKRNENQLIIFADDTYPRWVTTASLL
:: . .. . ....::..:. .::... . : . . :. : : .....
XP_011 GMAFIDTQLYIHQMISVKNFILAADVMKSISLLRYQEESKTLSLVSRDAKPLEVYSVDFM
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD DYDTVAG---ADKFGNICVVRLPPNTNDEVDEDPTGNKALWDRGLLNGASQKAEVIMNYH
.. : .:. :. : : :. :. : . : . :: .....
XP_011 VDNAQLGFLVSDRDRNLMVYMYLP----EAKESFGGMRLLRRADFHVGA--HVNTFWRTP
1190 1200 1210 1220 1230
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD VGETVLSLQKTTLIPGGSESLVYTTLSGGIGILVPFT--SHEDHDFFQHVEMHLRSEHPP
.. .:.: ... ... ..::.::::.:.:. ... ..:.. . .:
XP_011 CRGATEGLSKKSVVWENKHITWFATLDGGIGLLLPMQEKTYRRLLMLQNALTTMLPHHAG
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KSD LCGRD----HLSFRSYYFPVKNVIDGDLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRTPPEVSKKLED
: : :.. :. :.::.::.: ... . ......... ::
XP_011 LNPRAFRMLHVDRRTLQNAVRNVLDGELLNRYLYLSTMERSELAKKIGTTPDIILDDLLE
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD IRTRYAF
XP_011 TDRVTAHF
1360
>--
initn: 158 init1: 70 opt: 157 Z-score: 189.1 bits: 47.2 E(85289): 0.00086
Smith-Waterman score: 253; 21.2% identity (51.1% similar) in 599 aa overlap (64-566:2-590)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD RGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVFGVIRSLMAFRLTGGTKDYIVVGSDSGRIVILEYQ
:. . .:.:. .: .... .... ..::.
XP_011 MSMASVQLAGAKRDALLLSFKDAKLSVVEYD
10 20 30
100 110 120 130 140
pF1KSD PS----KNMFEKIHQETFGKSGCRRIVPGQFLAVDPKGRAVMISAIEKQKLVYILNRDAA
:. :.. . .: ..: . : . ::: :: . . . . .: . :..
XP_011 PGTHDLKTLSLHYFEEPELRDGFVQNVHTPRVRVDPDGRCAAMLVYGTRLVVLPFRRESL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190
pF1KSD ARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGVDVGFENPMFACLEMDYEEADNDPT------------
:. . :..... : ... : . ... .. ..... .. .::
XP_011 AEEHEGLVGEGQRSSFLPSYIIDVRA-LDEKLLNIIDLQFLHGYYEPTLLILFEPNQTWP
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KSD GEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKY-----SEPLEEHGNFLITVPGGSDGPSGVLICS
:..:. :.: .. ..:.... :. : :.. . . : : ::.. .
XP_011 GRVAVR-QDTCSIVAISLNITQKVHPVIWSLTSLPFDCTQALAVPKPIG-----GVVVFA
160 170 180 190 200
260 270 280 290 300
pF1KSD ENYITYKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFF----FLAQTEQG
: . : : . : . : : . : . ... :. .. . . :
XP_011 VNSLLYLNQSVPPYGVALNSLTTGTTAFPLRTQEGVRITLDCAQATFISYDKMVISLKGG
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DIFKITLETDEDMVTEIRLKYFDTVPVAA---AMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQ-----
.:. .:: :: . .: .:: . ... .: ... :.::..:..:: : .
XP_011 EIYVLTLITDG--MRSVRAFHFDKAAASVLTTSMVTMEPGYLFLGSRLGNSLLLKYTEKL
270 280 290 300 310 320
370 380 390
pF1KSD -------IAHLGDDDEEPE----------FSSA---MPLEEGDTF-FFQPRPLKNLVLV-
. . .: .: : .:.: .: .: : . . . .. :.
XP_011 QEPPASAVREAADKEEPPSKKKRVDATAGWSAAGKSVPQDEVDEIEVYGSEAQSGTQLAT
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440
pF1KSD ---DELDSLSPILFCQIA----------DLANEDTPQL-YVAC-GRGPRSSLRVLRHGLE
. ::. : : : .. : :.: :.: :.: ..: ::.....
XP_011 YSFEVCDSILNIGPCANAAVGEPAFLSEEFQNSPEPDLEIVVCSGHGKNGALSVLQKSIR
390 400 410 420 430 440
450 460 470
pF1KSD VSEMAVSELPGNPNAVWTV----RRHIED---------------EFD------AYIIVSF
. ... :::: . .::: :.. :: : : ...:.:
XP_011 PQVVTTFELPGCYD-MWTVIAPVRKEEEDNPKGEGTEQEPSTTPEADDDGRRHGFLILSR
450 460 470 480 490 500
480 490 500 510 520 530
pF1KSD VNATLVLSIGETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDA-LVQVYPDGIRHIRADKRVNEWK
..:..:. :. . :. ::: ::. . .::. .::: : ::: ... ....
XP_011 EDSTMILQTGQEIMELDTSGFATQGPTVFAGNIGDNRYIVQVSPLGIRLLEGVNQLHFIP
510 520 530 540 550 560
540 550 560 570 580 590
pF1KSD TPGKKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADVVCMSLANVPP
. ::.::: . ::: . :....:
XP_011 VDLGAPIVQCAVADPYVVIMSAEGHVTMFLLKSDSYGGRHHRLALHKPPLHHQSKVITLC
570 580 590 600 610 620
>>XP_006716612 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage and po (1365 aa)
initn: 113 init1: 70 opt: 157 Z-score: 189.1 bits: 47.2 E(85289): 0.00086
Smith-Waterman score: 188; 19.8% identity (52.9% similar) in 501 aa overlap (717-1201:871-1348)
690 700 710 720 730 740
pF1KSD SDTRTRYLGSRPVKLFRVRMQGQEAVLAMSSRSWLSYSYQSRFHLTPLSYE-TLEFASGF
: :: . .. ..: :.. . .. . :
XP_006 EEGAGARGRVARFRYFEDIYGYSGVFICGPSPHWLLVTGRGALRLHPMAIDGPVDSFAPF
850 860 870 880 890 900
750 760 770 780 790 800
pF1KSD ASEQCPEGIVAISTN-TLRILALE---KLGAVFNQVAFPLQYTPRKFVIHPESNNLIIIE
. .::.:.. .. . ::: .: . : . .::. : . . : ::. . .
XP_006 HNVNCPRGFLYFNRQGELRISVLPAYLSYDAPWPVRKIPLRCTAHYVAYHVESK-VYAVA
910 920 930 940 950
810 820 830 840 850
pF1KSD TDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEAAGEDERELAAEMAAAFLNENLPESIFGAPKAGN--
:. : : .. : . :. :. .::: . .. : .. : : . :.:
XP_006 TSTN--TPCARIPR-MTGEEKEFETIERDERYIHPQQEAFSIQLISPVSWEAIPNARIEL
960 970 980 990 1000 1010
860 870 880 890 900 910
pF1KSD GQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQNEAAFSVAVCRFSNTGEDWYVLVGVAKDLILNPRS
.: : :. .. . . :. .. .: .. . . .. .:. . ... .:
XP_006 QEWEHVT-CMKTVSLRSEETVSGLKGYVAAGTCLMQGEEVTCRGRILIMDVIEVVPEP--
1020 1030 1040 1050 1060 1070
920 930 940 950 960 970
pF1KSD VAGGFVYTYKLVNNGEKLEFLHKTPVEEVPAAIAPFQGRVLIGVGKLLRVYDLGKKKLLR
: . :. :: . : :: .:. .:... ..:. . ...: . . :
XP_006 --GQPLTKNKFKVLYEKEQ---KGPV----TALCHCNGHLVSAIGQKIFLWSL-RASELT
1080 1090 1100 1110 1120
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD KCENKHIANYISGIQTIGHRVIVSDVQESFIWVRYKRNENQLIIFADDTYPRWVTTASLL
:: . .. . ....::..:. .::... . : . . :. : : .....
XP_006 GMAFIDTQLYIHQMISVKNFILAADVMKSISLLRYQEESKTLSLVSRDAKPLEVYSVDFM
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD DYDTVAG---ADKFGNICVVRLPPNTNDEVDEDPTGNKALWDRGLLNGASQKAEVIMNYH
.. : .:. :. : : :. :. : . : . :: .....
XP_006 VDNAQLGFLVSDRDRNLMVYMYLP----EAKESFGGMRLLRRADFHVGA--HVNTFWRTP
1190 1200 1210 1220 1230
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD VGETVLSLQKTTLIPGGSESLVYTTLSGGIGILVPFT--SHEDHDFFQHVEMHLRSEHPP
.. .:.: ... ... ..::.::::.:.:. ... ..:.. . .:
XP_006 CRGATEGLSKKSVVWENKHITWFATLDGGIGLLLPMQEKTYRRLLMLQNALTTMLPHHAG
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KSD LCGRD----HLSFRSYYFPVKNVIDGDLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRTPPEVSKKLED
: : :.. :. :.::.::.: ... . ......... ::
XP_006 LNPRAFRMLHVDRRTLQNAVRNVLDGELLNRYLYLSTMERSELAKKIGTTPDIILDDLLE
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD IRTRYAF
XP_006 TDRVTAHF
1360
>--
initn: 158 init1: 70 opt: 157 Z-score: 189.1 bits: 47.2 E(85289): 0.00086
Smith-Waterman score: 253; 21.2% identity (51.1% similar) in 599 aa overlap (64-566:2-590)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD RGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVFGVIRSLMAFRLTGGTKDYIVVGSDSGRIVILEYQ
:. . .:.:. .: .... .... ..::.
XP_006 MSMASVQLAGAKRDALLLSFKDAKLSVVEYD
10 20 30
100 110 120 130 140
pF1KSD PS----KNMFEKIHQETFGKSGCRRIVPGQFLAVDPKGRAVMISAIEKQKLVYILNRDAA
:. :.. . .: ..: . : . ::: :: . . . . .: . :..
XP_006 PGTHDLKTLSLHYFEEPELRDGFVQNVHTPRVRVDPDGRCAAMLVYGTRLVVLPFRRESL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190
pF1KSD ARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGVDVGFENPMFACLEMDYEEADNDPT------------
:. . :..... : ... : . ... .. ..... .. .::
XP_006 AEEHEGLVGEGQRSSFLPSYIIDVRA-LDEKLLNIIDLQFLHGYYEPTLLILFEPNQTWP
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KSD GEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKY-----SEPLEEHGNFLITVPGGSDGPSGVLICS
:..:. :.: .. ..:.... :. : :.. . . : : ::.. .
XP_006 GRVAVR-QDTCSIVAISLNITQKVHPVIWSLTSLPFDCTQALAVPKPIG-----GVVVFA
160 170 180 190 200
260 270 280 290 300
pF1KSD ENYITYKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFF----FLAQTEQG
: . : : . : . : : . : . ... :. .. . . :
XP_006 VNSLLYLNQSVPPYGVALNSLTTGTTAFPLRTQEGVRITLDCAQATFISYDKMVISLKGG
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DIFKITLETDEDMVTEIRLKYFDTVPVAA---AMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQ-----
.:. .:: :: . .: .:: . ... .: ... :.::..:..:: : .
XP_006 EIYVLTLITDG--MRSVRAFHFDKAAASVLTTSMVTMEPGYLFLGSRLGNSLLLKYTEKL
270 280 290 300 310 320
370 380 390
pF1KSD -------IAHLGDDDEEPE----------FSSA---MPLEEGDTF-FFQPRPLKNLVLV-
. . .: .: : .:.: .: .: : . . . .. :.
XP_006 QEPPASAVREAADKEEPPSKKKRVDATAGWSAAGKSVPQDEVDEIEVYGSEAQSGTQLAT
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440
pF1KSD ---DELDSLSPILFCQIA----------DLANEDTPQL-YVAC-GRGPRSSLRVLRHGLE
. ::. : : : .. : :.: :.: :.: ..: ::.....
XP_006 YSFEVCDSILNIGPCANAAVGEPAFLSEEFQNSPEPDLEIVVCSGHGKNGALSVLQKSIR
390 400 410 420 430 440
450 460 470
pF1KSD VSEMAVSELPGNPNAVWTV----RRHIED---------------EFD------AYIIVSF
. ... :::: . .::: :.. :: : : ...:.:
XP_006 PQVVTTFELPGCYD-MWTVIAPVRKEEEDNPKGEGTEQEPSTTPEADDDGRRHGFLILSR
450 460 470 480 490 500
480 490 500 510 520 530
pF1KSD VNATLVLSIGETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDA-LVQVYPDGIRHIRADKRVNEWK
..:..:. :. . :. ::: ::. . .::. .::: : ::: ... ....
XP_006 EDSTMILQTGQEIMELDTSGFATQGPTVFAGNIGDNRYIVQVSPLGIRLLEGVNQLHFIP
510 520 530 540 550 560
540 550 560 570 580 590
pF1KSD TPGKKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADVVCMSLANVPP
. ::.::: . ::: . :....:
XP_006 VDLGAPIVQCAVADPYVVIMSAEGHVTMFLLKSDSYGGRHHRLALHKPPLHHQSKVITLC
570 580 590 600 610 620
>>XP_011515301 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage and po (1365 aa)
initn: 113 init1: 70 opt: 157 Z-score: 189.1 bits: 47.2 E(85289): 0.00086
Smith-Waterman score: 188; 19.8% identity (52.9% similar) in 501 aa overlap (717-1201:871-1348)
690 700 710 720 730 740
pF1KSD SDTRTRYLGSRPVKLFRVRMQGQEAVLAMSSRSWLSYSYQSRFHLTPLSYE-TLEFASGF
: :: . .. ..: :.. . .. . :
XP_011 EEGAGARGRVARFRYFEDIYGYSGVFICGPSPHWLLVTGRGALRLHPMAIDGPVDSFAPF
850 860 870 880 890 900
750 760 770 780 790 800
pF1KSD ASEQCPEGIVAISTN-TLRILALE---KLGAVFNQVAFPLQYTPRKFVIHPESNNLIIIE
. .::.:.. .. . ::: .: . : . .::. : . . : ::. . .
XP_011 HNVNCPRGFLYFNRQGELRISVLPAYLSYDAPWPVRKIPLRCTAHYVAYHVESK-VYAVA
910 920 930 940 950
810 820 830 840 850
pF1KSD TDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEAAGEDERELAAEMAAAFLNENLPESIFGAPKAGN--
:. : : .. : . :. :. .::: . .. : .. : : . :.:
XP_011 TSTN--TPCARIPR-MTGEEKEFETIERDERYIHPQQEAFSIQLISPVSWEAIPNARIEL
960 970 980 990 1000 1010
860 870 880 890 900 910
pF1KSD GQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQNEAAFSVAVCRFSNTGEDWYVLVGVAKDLILNPRS
.: : :. .. . . :. .. .: .. . . .. .:. . ... .:
XP_011 QEWEHVT-CMKTVSLRSEETVSGLKGYVAAGTCLMQGEEVTCRGRILIMDVIEVVPEP--
1020 1030 1040 1050 1060 1070
920 930 940 950 960 970
pF1KSD VAGGFVYTYKLVNNGEKLEFLHKTPVEEVPAAIAPFQGRVLIGVGKLLRVYDLGKKKLLR
: . :. :: . : :: .:. .:... ..:. . ...: . . :
XP_011 --GQPLTKNKFKVLYEKEQ---KGPV----TALCHCNGHLVSAIGQKIFLWSL-RASELT
1080 1090 1100 1110 1120
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD KCENKHIANYISGIQTIGHRVIVSDVQESFIWVRYKRNENQLIIFADDTYPRWVTTASLL
:: . .. . ....::..:. .::... . : . . :. : : .....
XP_011 GMAFIDTQLYIHQMISVKNFILAADVMKSISLLRYQEESKTLSLVSRDAKPLEVYSVDFM
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD DYDTVAG---ADKFGNICVVRLPPNTNDEVDEDPTGNKALWDRGLLNGASQKAEVIMNYH
.. : .:. :. : : :. :. : . : . :: .....
XP_011 VDNAQLGFLVSDRDRNLMVYMYLP----EAKESFGGMRLLRRADFHVGA--HVNTFWRTP
1190 1200 1210 1220 1230
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD VGETVLSLQKTTLIPGGSESLVYTTLSGGIGILVPFT--SHEDHDFFQHVEMHLRSEHPP
.. .:.: ... ... ..::.::::.:.:. ... ..:.. . .:
XP_011 CRGATEGLSKKSVVWENKHITWFATLDGGIGLLLPMQEKTYRRLLMLQNALTTMLPHHAG
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KSD LCGRD----HLSFRSYYFPVKNVIDGDLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRTPPEVSKKLED
: : :.. :. :.::.::.: ... . ......... ::
XP_011 LNPRAFRMLHVDRRTLQNAVRNVLDGELLNRYLYLSTMERSELAKKIGTTPDIILDDLLE
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD IRTRYAF
XP_011 TDRVTAHF
1360
>--
initn: 158 init1: 70 opt: 157 Z-score: 189.1 bits: 47.2 E(85289): 0.00086
Smith-Waterman score: 253; 21.2% identity (51.1% similar) in 599 aa overlap (64-566:2-590)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD RGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVFGVIRSLMAFRLTGGTKDYIVVGSDSGRIVILEYQ
:. . .:.:. .: .... .... ..::.
XP_011 MSMASVQLAGAKRDALLLSFKDAKLSVVEYD
10 20 30
100 110 120 130 140
pF1KSD PS----KNMFEKIHQETFGKSGCRRIVPGQFLAVDPKGRAVMISAIEKQKLVYILNRDAA
:. :.. . .: ..: . : . ::: :: . . . . .: . :..
XP_011 PGTHDLKTLSLHYFEEPELRDGFVQNVHTPRVRVDPDGRCAAMLVYGTRLVVLPFRRESL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190
pF1KSD ARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGVDVGFENPMFACLEMDYEEADNDPT------------
:. . :..... : ... : . ... .. ..... .. .::
XP_011 AEEHEGLVGEGQRSSFLPSYIIDVRA-LDEKLLNIIDLQFLHGYYEPTLLILFEPNQTWP
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KSD GEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKY-----SEPLEEHGNFLITVPGGSDGPSGVLICS
:..:. :.: .. ..:.... :. : :.. . . : : ::.. .
XP_011 GRVAVR-QDTCSIVAISLNITQKVHPVIWSLTSLPFDCTQALAVPKPIG-----GVVVFA
160 170 180 190 200
260 270 280 290 300
pF1KSD ENYITYKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFF----FLAQTEQG
: . : : . : . : : . : . ... :. .. . . :
XP_011 VNSLLYLNQSVPPYGVALNSLTTGTTAFPLRTQEGVRITLDCAQATFISYDKMVISLKGG
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DIFKITLETDEDMVTEIRLKYFDTVPVAA---AMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQ-----
.:. .:: :: . .: .:: . ... .: ... :.::..:..:: : .
XP_011 EIYVLTLITDG--MRSVRAFHFDKAAASVLTTSMVTMEPGYLFLGSRLGNSLLLKYTEKL
270 280 290 300 310 320
370 380 390
pF1KSD -------IAHLGDDDEEPE----------FSSA---MPLEEGDTF-FFQPRPLKNLVLV-
. . .: .: : .:.: .: .: : . . . .. :.
XP_011 QEPPASAVREAADKEEPPSKKKRVDATAGWSAAGKSVPQDEVDEIEVYGSEAQSGTQLAT
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440
pF1KSD ---DELDSLSPILFCQIA----------DLANEDTPQL-YVAC-GRGPRSSLRVLRHGLE
. ::. : : : .. : :.: :.: :.: ..: ::.....
XP_011 YSFEVCDSILNIGPCANAAVGEPAFLSEEFQNSPEPDLEIVVCSGHGKNGALSVLQKSIR
390 400 410 420 430 440
450 460 470
pF1KSD VSEMAVSELPGNPNAVWTV----RRHIED---------------EFD------AYIIVSF
. ... :::: . .::: :.. :: : : ...:.:
XP_011 PQVVTTFELPGCYD-MWTVIAPVRKEEEDNPKGEGTEQEPSTTPEADDDGRRHGFLILSR
450 460 470 480 490 500
480 490 500 510 520 530
pF1KSD VNATLVLSIGETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDA-LVQVYPDGIRHIRADKRVNEWK
..:..:. :. . :. ::: ::. . .::. .::: : ::: ... ....
XP_011 EDSTMILQTGQEIMELDTSGFATQGPTVFAGNIGDNRYIVQVSPLGIRLLEGVNQLHFIP
510 520 530 540 550 560
540 550 560 570 580 590
pF1KSD TPGKKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADVVCMSLANVPP
. ::.::: . ::: . :....:
XP_011 VDLGAPIVQCAVADPYVVIMSAEGHVTMFLLKSDSYGGRHHRLALHKPPLHHQSKVITLC
570 580 590 600 610 620
>>XP_006716611 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage and po (1440 aa)
initn: 113 init1: 70 opt: 157 Z-score: 188.7 bits: 47.2 E(85289): 0.0009
Smith-Waterman score: 268; 21.4% identity (51.2% similar) in 604 aa overlap (59-566:75-668)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD EIVVSRGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVFGVIRSLMAFRLTGGTKDYIVVGSDSGRIV
:: . :. . .:.:. .: .... ....
XP_006 RDAEALTKNDRSTEGKAHREKLELAASFSFFGNVMSMASVQLAGAKRDALLLSFKDAKLS
50 60 70 80 90 100
90 100 110 120 130 140
pF1KSD ILEYQPS----KNMFEKIHQETFGKSGCRRIVPGQFLAVDPKGRAVMISAIEKQKLVYIL
..::.:. :.. . .: ..: . : . ::: :: . . . . .: .
XP_006 VVEYDPGTHDLKTLSLHYFEEPELRDGFVQNVHTPRVRVDPDGRCAAMLVYGTRLVVLPF
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190
pF1KSD NRDAAARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGVDVGFENPMFACLEMDYEEADNDPT-------
:.. :. . :..... : ... : . ... .. ..... .. .::
XP_006 RRESLAEEHEGLVGEGQRSSFLPSYIIDVRA-LDEKLLNIIDLQFLHGYYEPTLLILFEP
170 180 190 200 210 220
200 210 220 230 240
pF1KSD -----GEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKY-----SEPLEEHGNFLITVPGGSDGPSG
:..:. :.: .. ..:.... :. : :.. . . : : :
XP_006 NQTWPGRVAVR-QDTCSIVAISLNITQKVHPVIWSLTSLPFDCTQALAVPKPIG-----G
230 240 250 260 270
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VLICSENYITYKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFF----FLA
:.. . : . : : . : . : : . : . ... :. ..
XP_006 VVVFAVNSLLYLNQSVPPYGVALNSLTTGTTAFPLRTQEGVRITLDCAQATFISYDKMVI
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QTEQGDIFKITLETDEDMVTEIRLKYFDTVPVAA---AMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQ
. . :.:. .:: :: . .: .:: . ... .: ... :.::..:..:: : .
XP_006 SLKGGEIYVLTLITDG--MRSVRAFHFDKAAASVLTTSMVTMEPGYLFLGSRLGNSLLLK
340 350 360 370 380 390
370 380 390
pF1KSD ------------IAHLGDDDEEPE----------FSSA---MPLEEGDTF-FFQPRPLKN
. . .: .: : .:.: .: .: : . . . ..
XP_006 YTEKLQEPPASAVREAADKEEPPSKKKRVDATAGWSAAGKSVPQDEVDEIEVYGSEAQSG
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430
pF1KSD LVLV----DELDSLSPILFCQIA----------DLANEDTPQL-YVAC-GRGPRSSLRVL
:. . ::. : : : .. : :.: :.: :.: ..: ::
XP_006 TQLATYSFEVCDSILNIGPCANAAVGEPAFLSEEFQNSPEPDLEIVVCSGHGKNGALSVL
460 470 480 490 500 510
440 450 460 470
pF1KSD RHGLEVSEMAVSELPGNPNAVWTV----RRHIED---------------EFD------AY
..... . ... :::: . .::: :.. :: : : ..
XP_006 QKSIRPQVVTTFELPGCYD-MWTVIAPVRKEEEDNPKGEGTEQEPSTTPEADDDGRRHGF
520 530 540 550 560 570
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IIVSFVNATLVLSIGETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDA-LVQVYPDGIRHIRADKR
.:.: ..:..:. :. . :. ::: ::. . .::. .::: : ::: ... ..
XP_006 LILSREDSTMILQTGQEIMELDTSGFATQGPTVFAGNIGDNRYIVQVSPLGIRLLEGVNQ
580 590 600 610 620 630
540 550 560 570 580 590
pF1KSD VNEWKTPGKKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADVVCMSL
.. . ::.::: . ::: . :....:
XP_006 LHFIPVDLGAPIVQCAVADPYVVIMSAEGHVTMFLLKSDSYGGRHHRLALHKPPLHHQSK
640 650 660 670 680 690
600 610 620 630 640 650
pF1KSD ANVPPGEQRSRFLAVGLVDNTVRIISLDPSDCLQPLSMQALPAQPESLCIVEMGGTEKQD
XP_006 VITLCLYRDLSGMFTTESRLGGARDELGGRSGPEAEGLGSETSPTVDDEEEMLYGDSGSL
700 710 720 730 740 750
>>NP_037423 (OMIM: 606027) cleavage and polyadenylation (1443 aa)
initn: 113 init1: 70 opt: 157 Z-score: 188.7 bits: 47.2 E(85289): 0.0009
Smith-Waterman score: 188; 19.8% identity (52.9% similar) in 501 aa overlap (717-1201:949-1426)
690 700 710 720 730 740
pF1KSD SDTRTRYLGSRPVKLFRVRMQGQEAVLAMSSRSWLSYSYQSRFHLTPLSYE-TLEFASGF
: :: . .. ..: :.. . .. . :
NP_037 EEGAGARGRVARFRYFEDIYGYSGVFICGPSPHWLLVTGRGALRLHPMAIDGPVDSFAPF
920 930 940 950 960 970
750 760 770 780 790 800
pF1KSD ASEQCPEGIVAISTN-TLRILALE---KLGAVFNQVAFPLQYTPRKFVIHPESNNLIIIE
. .::.:.. .. . ::: .: . : . .::. : . . : ::. . .
NP_037 HNVNCPRGFLYFNRQGELRISVLPAYLSYDAPWPVRKIPLRCTAHYVAYHVESK-VYAVA
980 990 1000 1010 1020 1030
810 820 830 840 850
pF1KSD TDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEAAGEDERELAAEMAAAFLNENLPESIFGAPKAGN--
:. : : .. : . :. :. .::: . .. : .. : : . :.:
NP_037 TSTN--TPCARIPR-MTGEEKEFETIERDERYIHPQQEAFSIQLISPVSWEAIPNARIEL
1040 1050 1060 1070 1080 1090
860 870 880 890 900 910
pF1KSD GQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQNEAAFSVAVCRFSNTGEDWYVLVGVAKDLILNPRS
.: : :. .. . . :. .. .: .. . . .. .:. . ... .:
NP_037 QEWEHVT-CMKTVSLRSEETVSGLKGYVAAGTCLMQGEEVTCRGRILIMDVIEVVPEP--
1100 1110 1120 1130 1140 1150
920 930 940 950 960 970
pF1KSD VAGGFVYTYKLVNNGEKLEFLHKTPVEEVPAAIAPFQGRVLIGVGKLLRVYDLGKKKLLR
: . :. :: . : :: .:. .:... ..:. . ...: . . :
NP_037 --GQPLTKNKFKVLYEKEQ---KGPV----TALCHCNGHLVSAIGQKIFLWSL-RASELT
1160 1170 1180 1190 1200
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD KCENKHIANYISGIQTIGHRVIVSDVQESFIWVRYKRNENQLIIFADDTYPRWVTTASLL
:: . .. . ....::..:. .::... . : . . :. : : .....
NP_037 GMAFIDTQLYIHQMISVKNFILAADVMKSISLLRYQEESKTLSLVSRDAKPLEVYSVDFM
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD DYDTVAG---ADKFGNICVVRLPPNTNDEVDEDPTGNKALWDRGLLNGASQKAEVIMNYH
.. : .:. :. : : :. :. : . : . :: .....
NP_037 VDNAQLGFLVSDRDRNLMVYMYLP----EAKESFGGMRLLRRADFHVGA--HVNTFWRTP
1270 1280 1290 1300 1310
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD VGETVLSLQKTTLIPGGSESLVYTTLSGGIGILVPFT--SHEDHDFFQHVEMHLRSEHPP
.. .:.: ... ... ..::.::::.:.:. ... ..:.. . .:
NP_037 CRGATEGLSKKSVVWENKHITWFATLDGGIGLLLPMQEKTYRRLLMLQNALTTMLPHHAG
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KSD LCGRD----HLSFRSYYFPVKNVIDGDLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRTPPEVSKKLED
: : :.. :. :.::.::.: ... . ......... ::
NP_037 LNPRAFRMLHVDRRTLQNAVRNVLDGELLNRYLYLSTMERSELAKKIGTTPDIILDDLLE
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD IRTRYAF
NP_037 TDRVTAHF
1440
>--
initn: 186 init1: 70 opt: 157 Z-score: 188.7 bits: 47.2 E(85289): 0.0009
Smith-Waterman score: 268; 21.4% identity (51.2% similar) in 604 aa overlap (59-566:75-668)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD EIVVSRGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVFGVIRSLMAFRLTGGTKDYIVVGSDSGRIV
:: . :. . .:.:. .: .... ....
NP_037 RDAEALTKNDRSTEGKAHREKLELAASFSFFGNVMSMASVQLAGAKRDALLLSFKDAKLS
50 60 70 80 90 100
90 100 110 120 130 140
pF1KSD ILEYQPS----KNMFEKIHQETFGKSGCRRIVPGQFLAVDPKGRAVMISAIEKQKLVYIL
..::.:. :.. . .: ..: . : . ::: :: . . . . .: .
NP_037 VVEYDPGTHDLKTLSLHYFEEPELRDGFVQNVHTPRVRVDPDGRCAAMLVYGTRLVVLPF
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190
pF1KSD NRDAAARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGVDVGFENPMFACLEMDYEEADNDPT-------
:.. :. . :..... : ... : . ... .. ..... .. .::
NP_037 RRESLAEEHEGLVGEGQRSSFLPSYIIDVRA-LDEKLLNIIDLQFLHGYYEPTLLILFEP
170 180 190 200 210 220
200 210 220 230 240
pF1KSD -----GEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKY-----SEPLEEHGNFLITVPGGSDGPSG
:..:. :.: .. ..:.... :. : :.. . . : : :
NP_037 NQTWPGRVAVR-QDTCSIVAISLNITQKVHPVIWSLTSLPFDCTQALAVPKPIG-----G
230 240 250 260 270
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VLICSENYITYKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFF----FLA
:.. . : . : : . : . : : . : . ... :. ..
NP_037 VVVFAVNSLLYLNQSVPPYGVALNSLTTGTTAFPLRTQEGVRITLDCAQATFISYDKMVI
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QTEQGDIFKITLETDEDMVTEIRLKYFDTVPVAA---AMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQ
. . :.:. .:: :: . .: .:: . ... .: ... :.::..:..:: : .
NP_037 SLKGGEIYVLTLITDG--MRSVRAFHFDKAAASVLTTSMVTMEPGYLFLGSRLGNSLLLK
340 350 360 370 380 390
370 380 390
pF1KSD ------------IAHLGDDDEEPE----------FSSA---MPLEEGDTF-FFQPRPLKN
. . .: .: : .:.: .: .: : . . . ..
NP_037 YTEKLQEPPASAVREAADKEEPPSKKKRVDATAGWSAAGKSVPQDEVDEIEVYGSEAQSG
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430
pF1KSD LVLV----DELDSLSPILFCQIA----------DLANEDTPQL-YVAC-GRGPRSSLRVL
:. . ::. : : : .. : :.: :.: :.: ..: ::
NP_037 TQLATYSFEVCDSILNIGPCANAAVGEPAFLSEEFQNSPEPDLEIVVCSGHGKNGALSVL
460 470 480 490 500 510
440 450 460 470
pF1KSD RHGLEVSEMAVSELPGNPNAVWTV----RRHIED---------------EFD------AY
..... . ... :::: . .::: :.. :: : : ..
NP_037 QKSIRPQVVTTFELPGCYD-MWTVIAPVRKEEEDNPKGEGTEQEPSTTPEADDDGRRHGF
520 530 540 550 560 570
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IIVSFVNATLVLSIGETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDA-LVQVYPDGIRHIRADKR
.:.: ..:..:. :. . :. ::: ::. . .::. .::: : ::: ... ..
NP_037 LILSREDSTMILQTGQEIMELDTSGFATQGPTVFAGNIGDNRYIVQVSPLGIRLLEGVNQ
580 590 600 610 620 630
540 550 560 570 580 590
pF1KSD VNEWKTPGKKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADVVCMSL
.. . ::.::: . ::: . :....:
NP_037 LHFIPVDLGAPIVQCAVADPYVVIMSAEGHVTMFLLKSDSYGGRHHRLALHKPPLHHQSK
640 650 660 670 680 690
600 610 620 630 640 650
pF1KSD ANVPPGEQRSRFLAVGLVDNTVRIISLDPSDCLQPLSMQALPAQPESLCIVEMGGTEKQD
NP_037 VITLCLYRDLSGMFTTESRLGGARDELGGRSGPEAEGLGSETSPTVDDEEEMLYGDSGSL
700 710 720 730 740 750
>>XP_006716613 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage and po (785 aa)
initn: 109 init1: 66 opt: 152 Z-score: 186.2 bits: 45.9 E(85289): 0.0012
Smith-Waterman score: 188; 19.8% identity (52.9% similar) in 501 aa overlap (717-1201:291-768)
690 700 710 720 730 740
pF1KSD SDTRTRYLGSRPVKLFRVRMQGQEAVLAMSSRSWLSYSYQSRFHLTPLSYE-TLEFASGF
: :: . .. ..: :.. . .. . :
XP_006 EEGAGARGRVARFRYFEDIYGYSGVFICGPSPHWLLVTGRGALRLHPMAIDGPVDSFAPF
270 280 290 300 310 320
750 760 770 780 790 800
pF1KSD ASEQCPEGIVAISTN-TLRILALE---KLGAVFNQVAFPLQYTPRKFVIHPESNNLIIIE
. .::.:.. .. . ::: .: . : . .::. : . . : ::. . .
XP_006 HNVNCPRGFLYFNRQGELRISVLPAYLSYDAPWPVRKIPLRCTAHYVAYHVESK-VYAVA
330 340 350 360 370
810 820 830 840 850
pF1KSD TDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEAAGEDERELAAEMAAAFLNENLPESIFGAPKAGN--
:. : : .. : . :. :. .::: . .. : .. : : . :.:
XP_006 TSTN--TPCARIPR-MTGEEKEFETIERDERYIHPQQEAFSIQLISPVSWEAIPNARIEL
380 390 400 410 420 430
860 870 880 890 900 910
pF1KSD GQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQNEAAFSVAVCRFSNTGEDWYVLVGVAKDLILNPRS
.: : :. .. . . :. .. .: .. . . .. .:. . ... .:
XP_006 QEWEHVT-CMKTVSLRSEETVSGLKGYVAAGTCLMQGEEVTCRGRILIMDVIEVVPEP--
440 450 460 470 480 490
920 930 940 950 960 970
pF1KSD VAGGFVYTYKLVNNGEKLEFLHKTPVEEVPAAIAPFQGRVLIGVGKLLRVYDLGKKKLLR
: . :. :: . : :: .:. .:... ..:. . ...: . . :
XP_006 --GQPLTKNKFKVLYEKEQ---KGPV----TALCHCNGHLVSAIGQKIFLWSL-RASELT
500 510 520 530 540
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD KCENKHIANYISGIQTIGHRVIVSDVQESFIWVRYKRNENQLIIFADDTYPRWVTTASLL
:: . .. . ....::..:. .::... . : . . :. : : .....
XP_006 GMAFIDTQLYIHQMISVKNFILAADVMKSISLLRYQEESKTLSLVSRDAKPLEVYSVDFM
550 560 570 580 590 600
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD DYDTVAG---ADKFGNICVVRLPPNTNDEVDEDPTGNKALWDRGLLNGASQKAEVIMNYH
.. : .:. :. : : :. :. : . : . :: .....
XP_006 VDNAQLGFLVSDRDRNLMVYMYLP----EAKESFGGMRLLRRADFHVGA--HVNTFWRTP
610 620 630 640 650
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD VGETVLSLQKTTLIPGGSESLVYTTLSGGIGILVPFT--SHEDHDFFQHVEMHLRSEHPP
.. .:.: ... ... ..::.::::.:.:. ... ..:.. . .:
XP_006 CRGATEGLSKKSVVWENKHITWFATLDGGIGLLLPMQEKTYRRLLMLQNALTTMLPHHAG
660 670 680 690 700 710
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KSD LCGRD----HLSFRSYYFPVKNVIDGDLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRTPPEVSKKLED
: : :.. :. :.::.::.: ... . ......... ::
XP_006 LNPRAFRMLHVDRRTLQNAVRNVLDGELLNRYLYLSTMERSELAKKIGTTPDIILDDLLE
720 730 740 750 760 770
pF1KSD IRTRYAF
XP_006 TDRVTAHF
780
1217 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 23:20:47 2016 done: Wed Nov 2 23:20:49 2016
Total Scan time: 13.150 Total Display time: 0.410
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]