Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0043
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0043, 726 aa
1>>>pF1KSDA0043 726 - 726 aa - 726 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.0588+/-0.00101; mu= -7.5857+/- 0.061
mean_var=403.5197+/-85.135, 0's: 0 Z-trim(117.0): 44 B-trim: 935 in 2/54
Lambda= 0.063847
statistics sampled from 17653 (17696) to 17653 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.801), E-opt: 0.2 (0.544), width: 16
Scan time: 3.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6980.1 BRD3 gene_id:8019|Hs108|chr9 ( 726) 4780 454.4 2.8e-127
CCDS56421.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6 ( 754) 1971 195.7 2.2e-49
CCDS4762.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6 ( 801) 1971 195.7 2.3e-49
CCDS56420.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6 ( 836) 1971 195.7 2.4e-49
CCDS82307.1 BRD4 gene_id:23476|Hs108|chr19 ( 794) 1742 174.6 5.2e-43
CCDS12328.1 BRD4 gene_id:23476|Hs108|chr19 (1362) 1747 175.2 5.7e-43
CCDS46004.1 BRD4 gene_id:23476|Hs108|chr19 ( 722) 1739 174.3 5.9e-43
CCDS55616.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1 ( 874) 953 101.9 4.2e-21
CCDS55615.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1 ( 901) 953 102.0 4.3e-21
CCDS72820.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1 ( 951) 735 81.9 5e-15
CCDS735.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1 ( 947) 722 80.7 1.1e-14
>>CCDS6980.1 BRD3 gene_id:8019|Hs108|chr9 (726 aa)
initn: 4780 init1: 4780 opt: 4780 Z-score: 2398.5 bits: 454.4 E(32554): 2.8e-127
Smith-Waterman score: 4780; 100.0% identity (100.0% similar) in 726 aa overlap (1-726:1-726)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSTATTVAPAGIPATPGPVNPPPPEVSNPSKPGRKTNQLQYMQNVVVKTLWKHQFAWPFY
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CCDS69 MSTATTVAPAGIPATPGPVNPPPPEVSNPSKPGRKTNQLQYMQNVVVKTLWKHQFAWPFY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QPVDAIKLNLPDYHKIIKNPMDMGTIKKRLENNYYWSASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QPVDAIKLNLPDYHKIIKNPMDMGTIKKRLENNYYWSASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DIVLMAQALEKIFLQKVAQMPQEEVELLPPAPKGKGRKPAAGAQSAGTQQVAAVSSVSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 DIVLMAQALEKIFLQKVAQMPQEEVELLPPAPKGKGRKPAAGAQSAGTQQVAAVSSVSPA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TPFQSVPPTVSQTPVIAATPVPTITANVTSVPVPPAAAPPPPATPIVPVVPPTPPVVKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 TPFQSVPPTVSQTPVIAATPVPTITANVTSVPVPPAAAPPPPATPIVPVVPPTPPVVKKK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GVKRKADTTTPTTSAITASRSESPPPLSDPKQAKVVARRESGGRPIKPPKKDLEDGEVPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 GVKRKADTTTPTTSAITASRSESPPPLSDPKQAKVVARRESGGRPIKPPKKDLEDGEVPQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD HAGKKGKLSEHLRYCDSILREMLSKKHAAYAWPFYKPVDAEALELHDYHDIIKHPMDLST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 HAGKKGKLSEHLRYCDSILREMLSKKHAAYAWPFYKPVDAEALELHDYHDIIKHPMDLST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VKRKMDGREYPDAQGFAADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMPDEPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 VKRKMDGREYPDAQGFAADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMPDEPV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EAPALPAPAAPMVSKGAESSRSSEESSSDSGSSDSEEERATRLAELQEQLKAVHEQLAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 EAPALPAPAAPMVSKGAESSRSSEESSSDSGSSDSEEERATRLAELQEQLKAVHEQLAAL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SQAPVNKPKKKKEKKEKEKKKKDKEKEKEKHKVKAEEEKKAKVAPPAKQAQQKKAPAKKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 SQAPVNKPKKKKEKKEKEKKKKDKEKEKEKHKVKAEEEKKAKVAPPAKQAQQKKAPAKKA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD NSTTTAGRQLKKGGKQASASYDSEEEEEGLPMSYDEKRQLSLDINRLPGEKLGRVVHIIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 NSTTTAGRQLKKGGKQASASYDSEEEEEGLPMSYDEKRQLSLDINRLPGEKLGRVVHIIQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SREPSLRDSNPDEIEIDFETLKPTTLRELERYVKSCLQKKQRKPFSASGKKQAAKSKEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 SREPSLRDSNPDEIEIDFETLKPTTLRELERYVKSCLQKKQRKPFSASGKKQAAKSKEEL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD AQEKKKELEKRLQDVSGQLSSSKKPARKEKPGSAPSGGPSRLSSSSSSESGSSSSSGSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 AQEKKKELEKRLQDVSGQLSSSKKPARKEKPGSAPSGGPSRLSSSSSSESGSSSSSGSSS
670 680 690 700 710 720
pF1KSD DSSDSE
::::::
CCDS69 DSSDSE
>>CCDS56421.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6 (754 aa)
initn: 2642 init1: 961 opt: 1971 Z-score: 999.9 bits: 195.7 E(32554): 2.2e-49
Smith-Waterman score: 2903; 63.5% identity (79.2% similar) in 761 aa overlap (10-723:2-749)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSTATTVAPAGIPATP-GPVNPPPPEVSNPSKPGRKTNQLQYMQNVVVKTLWKHQFAWPF
:..:: :.::::::::::.:::: ::::::...::.:.::::::::::
CCDS56 MASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD YQPVDAIKLNLPDYHKIIKNPMDMGTIKKRLENNYYWSASECMQDFNTMFTNCYIYNKPT
:::::.::.:::::::::.::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS56 RQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD DDIVLMAQALEKIFLQKVAQMPQEEVELLPPAPKGKGRKPAAGAQSAGT----QQVAAVS
::::::::.::::::::::.::::: ::. ::.. .: : : :. .:: :::
CCDS56 DDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQELVVTIPKNSHKKGAKLAALQGSVTSAHQVPAVS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD SVSPATPFQSVPPTVSQTPVIAATPVPTITANVTSVPVPPAAAPPPPATPIVPVVPPTPP
::: : . . :: . : . : :. : : :. . : : ..::. :
CCDS56 SVSH-TALYTPPPEIPTT--VLNIPHPS----VISSPLLKSLHSAGPPLLAVTAAPPAQP
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VVKKKGVKRKADTTTPTTSAITASRSESPPPLS-DPKQAKVVARRESGGRPIKPPKKDLE
..::::::::::::::: .:: : : . :: : .:: :.. :. .:::::::.:::
CCDS56 LAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPASPPGSLEPKAARLPPMRRESGRPIKPPRKDLP
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD DGEVPQHAGKKGKLSEHLRYCDSILREMLSKKHAAYAWPFYKPVDAEALELHDYHDIIKH
:.. ....:::::::.:..:..::.:.:::::::::::::::::: :: ::::::::::
CCDS56 DSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKH
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PMDLSTVKRKMDGREYPDAQGFAADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAK
:::::::::::..:.: ::: ::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:.::
CCDS56 PMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAK
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450
pF1KSD MPDEPVEAPALPAPAA--PMVSKGAESSRSSEESSSDSGS------------------SD
:::::.: ::. .: : ..:.. : :::::::.:.: ::
CCDS56 MPDEPLEPGPLPVSTAMPPGLAKSSSES-SSEESSSESSSEEEEEEDEEDEEEEESESSD
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KSD SEEERATRLAELQEQLKAVHEQLAALSQAPVNKPKKKKEKKEKEKKKKDKEKEKEKHKVK
:::::: :::::::::.:::::::::::.:..:::.:.:::::.::.: ::.. ..
CCDS56 SEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKREKKEKKKKRK---AEKHRGRAG
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560
pF1KSD AEEEKKAKVAP-PAKQAQQKKAPAKKANSTTT----------AGRQL-KKGGKQASAS--
:.:. :. :: : . ..::: .. ..:.. .: .: ::. : : .
CCDS56 ADEDDKGPRAPRPPQPKKSKKASGSGGGSAALGPSGFGPSGGSGTKLPKKATKTAPPALP
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610
pF1KSD --YDSEEEEEGLPMSYDEKRQLSLDINRLPGEKLGRVVHIIQSREPSLRDSNPDEIEIDF
::::::::. :::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::::.::::::
CCDS56 TGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLRDSNPEEIEIDF
590 600 610 620 630 640
620 630 640 650 660 670
pF1KSD ETLKPTTLRELERYVKSCLQKKQRKPFSASGKKQAAKSKEELAQEKKKELEKRLQDVSGQ
:::::.::::::::: :::.:: :::.. :: ..:.::::: :::.::::::::::::
CCDS56 ETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTI--KKPVGKTKEELALEKKRELEKRLQDVSGQ
650 660 670 680 690
680 690 700 710 720
pF1KSD LSSSKKPARK--EKP--GSAPSGGPSRLS-SSSSSESGSSSSSGSSSDSSDSE
:.:.::: .: :: .:: . . :::: :::::.:.:::::.::::.:
CCDS56 LNSTKKPPKKANEKTESSSAQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSDSDSG
700 710 720 730 740 750
>>CCDS4762.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6 (801 aa)
initn: 2642 init1: 961 opt: 1971 Z-score: 999.6 bits: 195.7 E(32554): 2.3e-49
Smith-Waterman score: 2903; 63.5% identity (79.2% similar) in 761 aa overlap (10-723:49-796)
10 20 30
pF1KSD MSTATTVAPAGIPATP-GPVNPPPPEVSNPSKPGRKTNQ
:..:: :.::::::::::.:::: :::
CCDS47 LLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQ
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KSD LQYMQNVVVKTLWKHQFAWPFYQPVDAIKLNLPDYHKIIKNPMDMGTIKKRLENNYYWSA
:::...::.:.:::::::::: :::::.::.:::::::::.::::::::.::::::::.:
CCDS47 LQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAA
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KSD SECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQALEKIFLQKVAQMPQEEVELLPPAPKGKGRK
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::::: ::. ::.. .:
CCDS47 SECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQELVVTIPKNSHKK
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KSD PAAGAQSAGT----QQVAAVSSVSPATPFQSVPPTVSQTPVIAATPVPTITANVTSVPVP
: : :. .:: :::::: : . . :: . : . : :. : : :.
CCDS47 GAKLAALQGSVTSAHQVPAVSSVSH-TALYTPPPEIPTT--VLNIPHPS----VISSPLL
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KSD PAAAPPPPATPIVPVVPPTPPVVKKKGVKRKADTTTPTTSAITASRSESPPPLS-DPKQA
. : : ..::. :..::::::::::::::: .:: : : . :: : .:: :
CCDS47 KSLHSAGPPLLAVTAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPASPPGSLEPKAA
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KSD KVVARRESGGRPIKPPKKDLEDGEVPQHAGKKGKLSEHLRYCDSILREMLSKKHAAYAWP
.. :. .:::::::.::: :.. ....:::::::.:..:..::.:.:::::::::::
CCDS47 RLPPMRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWP
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KSD FYKPVDAEALELHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMDGREYPDAQGFAADVRLMFSNCYKYNPP
::::::: :: :::::::::::::::::::::..:.: ::: ::::::::::::::::::
CCDS47 FYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPP
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KSD DHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMPDEPVEAPALPAPAA--PMVSKGAESSRSSEESSSDSG
::.:::::::::::::.:.:::::::.: ::. .: : ..:.. : :::::::.:.
CCDS47 DHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTAMPPGLAKSSSES-SSEESSSESS
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490
pF1KSD S------------------SDSEEERATRLAELQEQLKAVHEQLAALSQAPVNKPKKKKE
: :::::::: :::::::::.:::::::::::.:..:::.:.:
CCDS47 SEEEEEEDEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKRE
500 510 520 530 540 550
500 510 520 530 540
pF1KSD KKEKEKKKKDKEKEKEKHKVKAEEEKKAKVAP-PAKQAQQKKAPAKKANSTTT-------
::::.::.: ::.. .. :.:. :. :: : . ..::: .. ..:..
CCDS47 KKEKKKKRK---AEKHRGRAGADEDDKGPRAPRPPQPKKSKKASGSGGGSAALGPSGFGP
560 570 580 590 600
550 560 570 580 590
pF1KSD ---AGRQL-KKGGKQASAS----YDSEEEEEGLPMSYDEKRQLSLDINRLPGEKLGRVVH
.: .: ::. : : . ::::::::. :::::::::::::::.:::::::::::
CCDS47 SGGSGTKLPKKATKTAPPALPTGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVH
610 620 630 640 650 660
600 610 620 630 640 650
pF1KSD IIQSREPSLRDSNPDEIEIDFETLKPTTLRELERYVKSCLQKKQRKPFSASGKKQAAKSK
:::.::::::::::.:::::::::::.::::::::: :::.:: :::.. :: ..:.:
CCDS47 IIQAREPSLRDSNPEEIEIDFETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTI--KKPVGKTK
670 680 690 700 710 720
660 670 680 690 700 710
pF1KSD EELAQEKKKELEKRLQDVSGQLSSSKKPARK--EKP--GSAPSGGPSRLS-SSSSSESGS
:::: :::.:::::::::::::.:.::: .: :: .:: . . :::: :::::.:.:
CCDS47 EELALEKKRELEKRLQDVSGQLNSTKKPPKKANEKTESSSAQQVAVSRLSASSSSSDSSS
730 740 750 760 770 780
720
pF1KSD SSSSGSSSDSSDSE
::::.::::.:
CCDS47 SSSSSSSSDTSDSDSG
790 800
>>CCDS56420.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6 (836 aa)
initn: 2880 init1: 940 opt: 1971 Z-score: 999.3 bits: 195.7 E(32554): 2.4e-49
Smith-Waterman score: 2760; 60.7% identity (75.4% similar) in 756 aa overlap (10-688:49-791)
10 20 30
pF1KSD MSTATTVAPAGIPATP-GPVNPPPPEVSNPSKPGRKTNQ
:..:: :.::::::::::.:::: :::
CCDS56 LLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQ
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KSD LQYMQNVVVKTLWKHQFAWPFYQPVDAIKLNLPDYHKIIKNPMDMGTIKKRLENNYYWSA
:::...::.:.:::::::::: :::::.::.:::::::::.::::::::.::::::::.:
CCDS56 LQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAA
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KSD SECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQALEKIFLQKVAQMPQEEVELLPPAPKGKGRK
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::::: ::. ::.. .:
CCDS56 SECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQELVVTIPKNSHKK
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KSD PAAGAQSAGT----QQVAAVSSVSPATPFQSVPPTVSQTPVIAATPVPTITANVTSVPVP
: : :. .:: :::::: : . . :: . : . : :. : : :.
CCDS56 GAKLAALQGSVTSAHQVPAVSSVSH-TALYTPPPEIPTT--VLNIPHPS----VISSPLL
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KSD PAAAPPPPATPIVPVVPPTPPVVKKKGVKRKADTTTPTTSAITASRSESPPPLS-DPKQA
. : : ..::. :..::::::::::::::: .:: : : . :: : .:: :
CCDS56 KSLHSAGPPLLAVTAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPASPPGSLEPKAA
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KSD KVVARRESGGRPIKPPKKDLEDGEVPQHAGKKGKLSEHLRYCDSILREMLSKKHAAYAWP
.. :. .:::::::.::: :.. ....:::::::.:..:..::.:.:::::::::::
CCDS56 RLPPMRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWP
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KSD FYKPVDAEALELHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMDGREYPDAQGFAADVRLMFSNCYKYNPP
::::::: :: :::::::::::::::::::::..:.: ::: ::::::::::::::::::
CCDS56 FYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPP
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KSD DHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMPDEPVEAPALPAPAA--PMVSKGAESSRSSEESSSDSG
::.:::::::::::::.:.:::::::.: ::. .: : ..:.. : :::::::.:.
CCDS56 DHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTAMPPGLAKSS-SESSSEESSSESS
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490
pF1KSD S------------------SDSEEERATRLAELQEQLKAVHEQLAALSQAPVNKPKKKKE
: :::::::: :::::::::.:::::::::::.:..:::.:.:
CCDS56 SEEEEEEDEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKRE
500 510 520 530 540 550
500 510 520 530
pF1KSD KKEKEKKKKDKEKEKEKHKVKAEEEKKAKVAP-PAKQAQQKKA----------------P
::::.::.: ::.. .. :.:. :. :: : . ..::: :
CCDS56 KKEKKKKRK---AEKHRGRAGADEDDKGPRAPRPPQPKKSKKASGSGGGSAALGPSGFGP
560 570 580 590 600
540 550 560
pF1KSD AKKANSTTTAGRQLKKGG--------------------------KQASAS--------YD
. ... :: : . : :.:. . ::
CCDS56 SGGSGTKLQAGVQWRDLGLLQPPLLGFKRFSCLSLPSSQDYRLPKKATKTAPPALPTGYD
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570 580 590 600 610 620
pF1KSD SEEEEEGLPMSYDEKRQLSLDINRLPGEKLGRVVHIIQSREPSLRDSNPDEIEIDFETLK
::::::. :::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::::.::::::::::
CCDS56 SEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLRDSNPEEIEIDFETLK
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630 640 650 660 670 680
pF1KSD PTTLRELERYVKSCLQKKQRKPFSASGKKQAAKSKEELAQEKKKELEKRLQDVSGQLSSS
:.::::::::: :::.:: :::.. :: ..:.::::: :::.:::::::::::::.:.
CCDS56 PSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTI--KKPVGKTKEELALEKKRELEKRLQDVSGQLNST
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690 700 710 720
pF1KSD KKPARKEKPGSAPSGGPSRLSSSSSSESGSSSSSGSSSDSSDSE
::: .:
CCDS56 KKPPKKANEKTESSSAQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSDSDSG
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10 20 30
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40 50 60 70 80 90
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pF1KSD WSASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQALEKIFLQKVAQMPQEEVELLPPAPKGK
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160 170 180 190 200
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:: . .:. . :.. : ....: : : : :: :. :: .:. :::
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210 220 230 240 250
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:.. : :::: ::: :: : :.. :: :: ::::::::::::::
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: . . :: : .:: .:. ::::. ::.::::::. :.. :: . :..:.::
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320 330 340 350 360 370
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.:. :..::.::..:::::::::::::::.::: :::: ::::::::.::.: :...:::
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380 390 400 410 420
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::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : .::
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430 440 450 460 470 480
pF1KSD LPAPAAPMVSKGAESSRSSEESSSDSGSSDSEEERATRLAELQEQLKAVHEQLAALSQAP
.: :. .. .. .: :. :.:::...::::::: :::::::::::::::::::::
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:::::: ::.::.: :::.:.:..:. ....::: :: : :: ....: .
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.: .. .:.::::.. ::::.::::::::::.::::::::::::::::::
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pF1KSD SLRDSNPDEIEIDFETLKPTTLRELERYVKSCLQKKQRKPFSASGKKQAAKSKEELAQEK
::..:::::::::::::::.::::::::: :::.:: ::: :: : .. :
CCDS82 SLKNSNPDEIEIDFETLKPSTLRELERYVTSCLRKK-RKP-------QAEKVDVIAGSSK
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670 680 690 700 710 720
pF1KSD KKELEKRLQDVSGQLSSSKKPARKEK---PGSAPSGGPSRLSSSSSSESGSSSSSGSSSD
: . . .. :.. ::: . . :. : :::
CCDS82 MKGFSSSESESSSESSSSDSEDSETAFCTSGDFVSPGPSPYHSHVQCGRFREMLRWFLVD
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pF1KSD SSDSE
CCDS82 VEQTAAGQPHRQSAAGPAITWAPAIAYPSPECARCCVGCS
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10 20 30
pF1KSD MSTATTVAPAGIPATPGPVNPPPPEVSNPSKPGRK
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CCDS12 MSAESGPGTRLRNLPVMGDGLETSQMSTTQAQAQPQ-PANAASTNPPPPETSNPNKPKRQ
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40 50 60 70 80 90
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CCDS12 WNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEETEIMIVQAKGR
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160 170 180 190 200
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:: . .:. . :.. : ....: : : : :: :. :: .:. :::
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CCDS12 ---TIDPIHEPPSLPPEPKTTKLGQRRESS-RPVKPPKKDVPDSQ--QHPAPEKSSKVSE
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320 330 340 350 360 370
pF1KSD HLRYCDSILREMLSKKHAAYAWPFYKPVDAEALELHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMDGREY
.:. :..::.::..:::::::::::::::.::: :::: ::::::::.::.: :...:::
CCDS12 QLKCCSGILKEMFAKKHAAYAWPFYKPVDVEALGLHDYCDIIKHPMDMSTIKSKLEAREY
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380 390 400 410 420
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.: :. .. .. .: :. :.:::...::::::: :::::::::::::::::::::
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:::::: ::.::.: :::.:.:..:. ....::: :: : :: ....: .
CCDS12 QNKPKKK----EKDKKEKKKEKHKRKEEVEENKKSKAKEPPPKKT---KKNNSSNSNVSK
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::..:::::::::::::::.::::::::: :::.:: ::: :: : .. :
CCDS12 SLKNSNPDEIEIDFETLKPSTLRELERYVTSCLRKK-RKP-------QAEKVDVIAGSSK
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pF1KSD KKELEKRLQDVSGQLSSSKKPARKEK--PGSAPSGGPSRLSSSSSSESGSSSSSGSSSDS
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CCDS12 MKGFSSSESESSSESSSSDSEDSETEMAPKSKKKGHPGREQKKHHHHHHQQMQQAPAPVP
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pF1KSD SDSE
CCDS12 QQPPPPPQQPPPPPPPQQQQQPPPPPPPPSMPQQAAPAMKSSPPPFIATQVPVLEPQLPG
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10 20 30
pF1KSD MSTATTVAPAGIPATPGPVNPPPPEVSNPSKPGRK
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CCDS46 MSAESGPGTRLRNLPVMGDGLETSQMSTTQAQAQPQ-PANAASTNPPPPETSNPNKPKRQ
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CCDS46 WNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEETEIMIVQAKGR
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160 170 180 190 200
pF1KSD GR-KPAAGAQSAGTQQVAAVSSVS--PATPF-QSVPPTVSQTP---------VIAATPVP
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CCDS46 GRGRKETGTAKPGVSTVPNTTQASTPPQTQTPQPNPPPVQATPHPFPAVTPDLIVQTPVM
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pF1KSD TITANV---TSVPVPPAAAPPP-PATPIV----PVVPPTP-PVVKKKGVKRKADTTTPTT
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CCDS46 TVVPPQPLQTPPPVPPQPQPPPAPAPQPVQSHPPIIAATPQPVKTKKGVKRKADTTTPTT
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260 270 280 290 300 310
pF1KSD SAITASRSESPPPLS-DPKQAKVVARRESGGRPIKPPKKDLEDGEVPQHAG--KKGKLSE
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CCDS46 ----IDPIHEPPSLPPEPKTTKLGQRRESS-RPVKPPKKDVPDSQ--QHPAPEKSSKVSE
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320 330 340 350 360 370
pF1KSD HLRYCDSILREMLSKKHAAYAWPFYKPVDAEALELHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMDGREY
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CCDS46 QLKCCSGILKEMFAKKHAAYAWPFYKPVDVEALGLHDYCDIIKHPMDMSTIKSKLEAREY
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pF1KSD PDAQGFAADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMPDEP------VEAPA
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CCDS46 RDAQEFGADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMPDEPEEPVVAVSSPA
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430 440 450 460 470 480
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CCDS46 VPPPTKVVAPPSSSDSSSDSSSDSDSSTDDSEEERAQRLAELQEQLKAVHEQLAALSQPQ
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pF1KSD VNKPKKKKEKKEKEKKKKDKEKEKEKHKVKAEEEKKAKVAPPAKQAQQKKAPAKKANSTT
:::::: ::.::.: :::.:.:..:. ....::: :: : :: ....: .
CCDS46 QNKPKKK----EKDKKEKKKEKHKRKEEVEENKKSKAKEPPPKKT---KKNNSSNSNVSK
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pF1KSD TAGRQLKKGGKQASASYDSEEEEEGLPMSYDEKRQLSLDINRLPGEKLGRVVHIIQSREP
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CCDS46 KEPAPMKS---KPPPTYESEEEDKCKPMSYEEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQSREP
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610 620 630 640 650 660
pF1KSD SLRDSNPDEIEIDFETLKPTTLRELERYVKSCLQKKQRKPFSASGKKQAAKSKEELAQEK
::..:::::::::::::::.::::::::: :::.:: ::: :: : .. :
CCDS46 SLKNSNPDEIEIDFETLKPSTLRELERYVTSCLRKK-RKP-------QAEKVDVIAGSSK
650 660 670 680 690
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pF1KSD KKELEKRLQDVSGQLSSSKKPARKEKPGSAPSGGPSRLSSSSSSESGSSSSSGSSSDSSD
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CCDS46 MKGFSSSESESSSESSSSDSEDSETGPA
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pF1KSD WKHQFAWPFYQPVDAIKLNLPDYHKIIKNPMDMGTIKKRLENNYYWSASECMQDFNTMFT
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CCDS55 MDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFS
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KSD NCYIYNKPTDDIVLMAQALEKIFLQKVAQMPQEEVELLPPAPKGKGRKPAAGAQSAGTQQ
:::.:::: ::::::::::::.:.::..:::::: . . : . .: ::::
CCDS55 NCYLYNKPGDDIVLMAQALEKLFMQKLSQMPQEEQVV---GVKERIKK--------GTQQ
40 50 60 70
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pF1KSD VAAVSSVSPATPFQSVPPTVSQTPVIAATPVPTITANVTSVPVPPAAAPPPPATPIVPVV
::::.. . :.... :. .:.. : .. : .. . :
CCDS55 NIAVSSAKEKS-----SPSATEK-VFKQQEIPSV--------FPKTSISPLNVVQGASVN
80 90 100 110 120
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pF1KSD PPTPPVVK-KKGVKRKADTTTPTTSAITASRSESPPPLSDPKQAKVVARRESGGRPIKP-
. ... ::::::::::::.:::. :: :: : ... : :: :::
CCDS55 SSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPATSAVKAS-SEFSPTFTE----KSVALP-----PIKEN
130 140 150 160 170
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pF1KSD -PKKDLEDGEVPQHAGKKGKLSEHLRYCDSILREMLSKKHAAYAWPFYKPVDAEALELHD
::. : :.. .. : :..:.::.:. ::.:::.::: .::::::.:::..:: ::.
CCDS55 MPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFYNPVDVNALGLHN
180 190 200 210 220 230
350 360 370 380 390 400
pF1KSD YHDIIKHPMDLSTVKRKMDGREYPDAQGFAADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDV
:.:..:.::::.:.:.:::..:: :: ::::::::: :::::::::::::.::: ::::
CCDS55 YYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEVVTMARMLQDV
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD FEMRFAKMPDEPVEAPALPAPAAPMV-SKGAESSRSSEESSSDSGSSDSEEERATRLAEL
:: .:.:.: ::::. : . .. . : :.. .: :: ..:.:::.::. :::.:
CCDS55 FETHFSKIPIEPVESMPLCYIKTDITETTGRENT--NEASSEGNSSDDSEDERVKRLAKL
300 310 320 330 340 350
470 480 490 500 510 520
pF1KSD QEQLKAVHEQLAALSQAPVNKPKKKKEKKEKEKKKKDKEKEKEKHKVKAEEEKKAKVAPP
::::::::.:: .:::.: : .:::::..:::::. ::. .:. :
CCDS55 QEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKE---------KVNNSNEN------P
360 370 380 390
530 540 550 560 570 580
pF1KSD AKQAQQKKAPAKKANSTTTAGRQLKKGGKQASASYDSEEEEEGLPMSYDEKRQLSLDINR
:. .: . :. :. : :: . ::.:... ::.:::::::::.::.
CCDS55 RKMCEQMRLKEKSK-------RNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINK
400 410 420 430 440 450
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LPGEKLGRVVHIIQSREPSLRDSNPDEIEIDFETLKPTTLRELERYVKSCLQKKQRKPFS
:::.:::::::::::::::: .:::::::::::::: .::::::.::..::.:. :: .
CCDS55 LPGDKLGRVVHIIQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPPA
460 470 480 490 500 510
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:. ::::: ..::.:::::: ::..::.: :. ....: :..: . ::::
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520 530 540 550 560
710 720
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::::::: ::::. :::::::::
CCDS55 SSSSSSSSSESESSSSDLSSSDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECIPPEG
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.. :.... :. .:.. : .. : .. . : . ...
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:.:.:.:::..:: :: ::::::::: :::::::::::::.::: :::::: .:.:.:
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::::. : . .. . : :.. .: :: ..:.:::.::. :::.:::::::::.:
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: .:::.: : .:::::..:::::. ::. .:. : :. .: .
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:::::::::: .:::::::::::::: .::::::.::..::.:. :: :. :
CCDS55 HIIQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKP----PAKKIMMS
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pF1KSD SGSSSSSGSSSDSSDSE
: ::::. :::::::::
CCDS55 SESSSSDLSSSDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECIPPEGRTGVTQIGYC
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600 610 620 630 640 650
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726 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]