Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0046
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0046, 869 aa
1>>>pF1KSDA0046 869 - 869 aa - 869 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0203+/-0.00106; mu= 22.9368+/- 0.064
mean_var=76.5291+/-15.140, 0's: 0 Z-trim(104.7): 35 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.146609
statistics sampled from 7995 (8024) to 7995 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 3.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS138.1 CLCN6 gene_id:1185|Hs108|chr1 ( 869) 5804 1238.0 0
CCDS57972.1 CLCN6 gene_id:1185|Hs108|chr1 ( 847) 5287 1128.6 0
CCDS45378.1 CLCN7 gene_id:1186|Hs108|chr16 ( 781) 1146 252.7 1.9e-66
CCDS32361.1 CLCN7 gene_id:1186|Hs108|chr16 ( 805) 1146 252.7 1.9e-66
CCDS5881.1 CLCN1 gene_id:1180|Hs108|chr7 ( 988) 339 82.1 5.4e-15
CCDS54692.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3 ( 869) 305 74.9 7.2e-13
CCDS54691.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3 ( 881) 305 74.9 7.3e-13
CCDS3263.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3 ( 898) 305 74.9 7.4e-13
CCDS54690.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3 ( 854) 296 72.9 2.7e-12
>>CCDS138.1 CLCN6 gene_id:1185|Hs108|chr1 (869 aa)
initn: 5804 init1: 5804 opt: 5804 Z-score: 6630.5 bits: 1238.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5804; 99.9% identity (99.9% similar) in 869 aa overlap (1-869:1-869)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD YLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEEC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRD
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LCKVLGVLFSVAGGLFVEKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GSWGSFQLPGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GSWGSFQLPGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD YRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD GISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD TVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KSSILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KSSILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD YPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAED
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD YPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNA
790 800 810 820 830 840
850 860
pF1KSD VGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
850 860
>>CCDS57972.1 CLCN6 gene_id:1185|Hs108|chr1 (847 aa)
initn: 5287 init1: 5287 opt: 5287 Z-score: 6039.6 bits: 1128.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5598; 97.4% identity (97.4% similar) in 869 aa overlap (1-869:1-847)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYE-----------
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD YLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEEC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 -----------KGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEEC
50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 SQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRD
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LCKVLGVLFSVAGGLFVEKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRD
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQF
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GSWGSFQLPGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GSWGSFQLPGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAK
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD YRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 YRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTED
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTY
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD GISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISL
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KSD TVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 TVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLR
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 ASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFK
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KSSILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KSSILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNL
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KSD YPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 YPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAED
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KSD YPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 YPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNA
760 770 780 790 800 810
850 860
pF1KSD VGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
820 830 840
>>CCDS45378.1 CLCN7 gene_id:1186|Hs108|chr16 (781 aa)
initn: 1701 init1: 704 opt: 1146 Z-score: 1306.5 bits: 252.7 E(32554): 1.9e-66
Smith-Waterman score: 1890; 41.4% identity (65.9% similar) in 828 aa overlap (40-861:62-771)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD CCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDPYLEVLETMD
.: : ::::::: :. .:: . ..
CCDS45 GGTPLLNGAGPGAARQDMDPPHPFPKEIPHNEKLLSLKYESLDYDNSENQLFLEEERRIN
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEECSQKGCLALS
. : : .:.. ::. ::::. :.:. :. .. ::. :.. .... ..:: :..:
CCDS45 HTAFRTVEIKRWVICALIGILTGLVACFIDIVVENLAGLKYRVIKGNIDKFTEKGGLSFS
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LLELLGFNLTFVFLASLLV-LIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTLLCKVLGVL
:: .: .::...:..: .:::::::::::..::.:::::.: .:::.::. :: ::.
CCDS45 LLLWATLNAAFVLVGSVIVAFIEPVAAGSGIPQIKCFLNGVKIPHVVRLKTLVIKVSGVI
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRDFVSAGAAA
.::.::: :::::::::::::..::. : .: ::.. : ::: : .:::::::::::
CCDS45 LSVVGGLAVGKEGPMIHSGSVIAAGISQGRSTSLKRDFKIFEYFRRDTEKRDFVSAGAAA
220 230 240 250 260 270
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQFGSWGSFQL
::.::::::.::.:::::::.::::: :::...: :: .:::::: : : :. ...
CCDS45 GVSAAFGAPVGGVLFSLEEGASFWNQFLTWRIFFASMISTFTLNFVLS-IYHGNMWDLSS
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAKYRMRNVHP
:::.:::.: ::.: . : .. :..:::.::.:::.:: :: :. .:.: .:
CCDS45 PGLINFGRF---DSEKMAY--TIHEIPVFIAMGVVGGVLGAVFNALNYWLTMFRIRYIH-
340 350 360 370 380
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTF
.: : .:.:..::. ::..:.:: . .:. . : :. :. ::.
CCDS45 RPCL-QVIEAVLVAAVTATVAFVLIYSSRDCQPL----QGGSMSYPLQL-----------
390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD FCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQD-GTFSPVTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSG
:: . ::.::. ::: :.....:::. :...:.::.:: ..::.:::::::..: .:
CCDS45 FCADGEYNSMAAAFFNTPEKSVVSLFHDPPGSYNPLTLGLFTLVYFFLACWTYGLTVSAG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYS--GTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILI
.:.:::: :::.::: . : ::. . :.. : .::.:::: :::.::::.:::::..
CCDS45 VFIPSLLIGAAWGRLFGISL-SYLTGAAIWADPGKYALMGAAAQLGGIVRMTLSLTVIMM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLRASDIM
:.:...:::.:::..::.:: .:: : .:.::.:. :..::.:.::. : .: : ..:
CCDS45 EATSNVTYGFPIMLVLMTAKIVGDVFIEGLYDMHIQLQSVPFLHWEAPVTSHSLTAREVM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTV--HHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSS
.: . . .. .:..: :. :..::::
CCDS45 STPVTCLRRREKVGVIVDVLSDTASNHNGFPVV---------------------------
610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KSD ILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNLYPD
:: . .::. ::
CCDS45 ----------------------------EHADDTQPAR----LQ----------------
650
730 740 750 760 770 780
pF1KSD QSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAEDYPR
::::::::..:: . : .:. . : :: .. . :::
CCDS45 -------------------GLILRSQLIVLLKHKVFVERSNLGLVQRRLRLKDFRDAYPR
660 670 680 690
790 800 810 820 830 840
pF1KSD YPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNAVGE
.: :... .. . . .:.. .:::::.:: .. . .::.:::..::::: ::. ..
CCDS45 FPPIQSIHVSQDERECTMDLSEFMNPSPYTVPQEASLPRVFKLFRALGLRHLVVVDNRNQ
700 710 720 730 740 750
850 860
pF1KSD IVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
.::..::..:. : :
CCDS45 VVGLVTRKDLARYRLGKRGLEELSLAQT
760 770 780
>>CCDS32361.1 CLCN7 gene_id:1186|Hs108|chr16 (805 aa)
initn: 1701 init1: 704 opt: 1146 Z-score: 1306.3 bits: 252.7 E(32554): 1.9e-66
Smith-Waterman score: 1890; 41.4% identity (65.9% similar) in 828 aa overlap (40-861:86-795)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD CCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDPYLEVLETMD
.: : ::::::: :. .:: . ..
CCDS32 VGHMSSVELDDELLDPDMDPPHPFPKEIPHNEKLLSLKYESLDYDNSENQLFLEEERRIN
60 70 80 90 100 110
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEECSQKGCLALS
. : : .:.. ::. ::::. :.:. :. .. ::. :.. .... ..:: :..:
CCDS32 HTAFRTVEIKRWVICALIGILTGLVACFIDIVVENLAGLKYRVIKGNIDKFTEKGGLSFS
120 130 140 150 160 170
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LLELLGFNLTFVFLASLLV-LIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTLLCKVLGVL
:: .: .::...:..: .:::::::::::..::.:::::.: .:::.::. :: ::.
CCDS32 LLLWATLNAAFVLVGSVIVAFIEPVAAGSGIPQIKCFLNGVKIPHVVRLKTLVIKVSGVI
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRDFVSAGAAA
.::.::: :::::::::::::..::. : .: ::.. : ::: : .:::::::::::
CCDS32 LSVVGGLAVGKEGPMIHSGSVIAAGISQGRSTSLKRDFKIFEYFRRDTEKRDFVSAGAAA
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQFGSWGSFQL
::.::::::.::.:::::::.::::: :::...: :: .:::::: : : :. ...
CCDS32 GVSAAFGAPVGGVLFSLEEGASFWNQFLTWRIFFASMISTFTLNFVLS-IYHGNMWDLSS
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAKYRMRNVHP
:::.:::.: ::.: . : .. :..:::.::.:::.:: :: :. .:.: .:
CCDS32 PGLINFGRF---DSEKMAY--TIHEIPVFIAMGVVGGVLGAVFNALNYWLTMFRIRYIH-
360 370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTF
.: : .:.:..::. ::..:.:: . .:. . : :. :. ::.
CCDS32 RPCL-QVIEAVLVAAVTATVAFVLIYSSRDCQPL----QGGSMSYPLQL-----------
410 420 430 440 450
430 440 450 460 470 480
pF1KSD FCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQD-GTFSPVTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSG
:: . ::.::. ::: :.....:::. :...:.::.:: ..::.:::::::..: .:
CCDS32 FCADGEYNSMAAAFFNTPEKSVVSLFHDPPGSYNPLTLGLFTLVYFFLACWTYGLTVSAG
460 470 480 490 500 510
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYS--GTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILI
.:.:::: :::.::: . : ::. . :.. : .::.:::: :::.::::.:::::..
CCDS32 VFIPSLLIGAAWGRLFGISL-SYLTGAAIWADPGKYALMGAAAQLGGIVRMTLSLTVIMM
520 530 540 550 560 570
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLRASDIM
:.:...:::.:::..::.:: .:: : .:.::.:. :..::.:.::. : .: : ..:
CCDS32 EATSNVTYGFPIMLVLMTAKIVGDVFIEGLYDMHIQLQSVPFLHWEAPVTSHSLTAREVM
580 590 600 610 620 630
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTV--HHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSS
.: . . .. .:..: :. :..::::
CCDS32 STPVTCLRRREKVGVIVDVLSDTASNHNGFPVV---------------------------
640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD ILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNLYPD
:: . .::. ::
CCDS32 ----------------------------EHADDTQPAR----LQ----------------
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::::::::..:: . : .:. . : :: .. . :::
CCDS32 -------------------GLILRSQLIVLLKHKVFVERSNLGLVQRRLRLKDFRDAYPR
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.: :... .. . . .:.. .:::::.:: .. . .::.:::..::::: ::. ..
CCDS32 FPPIQSIHVSQDERECTMDLSEFMNPSPYTVPQEASLPRVFKLFRALGLRHLVVVDNRNQ
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850 860
pF1KSD IVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
.::..::..:. : :
CCDS32 VVGLVTRKDLARYRLGKRGLEELSLAQT
780 790 800
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: :.. : . : :. .: :.: .
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50 60 70 80 90 100
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:.: : : .: : . . . .. : :: . . . .:. .::. .:.
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.. . :.. .: .. : :..: . : :.......:. :: : :.:::
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:::.: : :: . . ..... ::... ....:. ::::::..: .:. .: : .:.
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220 230 240 250 260 270
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:. .. ::. :: ....: :.::. ::.:.::.:::.: :... :
CCDS58 SVFCGV--YEQPYYYSD-----ILTVGCAVGVGCCFGTPLGGVLFSIEVTSTYFAVRNYW
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280 290 300 310 320 330
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. .: .:::. :: .. :.. .. . :. . : : .: :
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:. .. . .. ... : :. .: :.. .......:. .... .:
CCDS58 PPGMGQFMAGELMPREA--ISTLFDNNTWVKHAGDPESL--GQSAVWIHPRVNVVIIIF-
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::::. : .. . . .: : :.: .. ::::::::.... . :
CCDS58 -----------LFFVMKFWMSIVATTMPIPCGGFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGI
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.: : .:.::::: : :.: :.: .:: .: :..:.. ::.::....:. .
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.. .. ..:: . .. .: : :. .. . . ::: .. .: : ..
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:.::. ...:.: . .:.. . ... . .: . . .: : : :
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pF1KSD EQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLL-QQMLERRYTPYPNLYPDQSPSE
. : .... . : .. : .: . : ::: .. : . .:. :: :
CCDS58 KARLAGEGLPGAPPGR-----PESFAFVDEDEDEDLSGKSELPPSLALHPSTTAPLSPEE
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. : .: . :..: : :: :. ......: . . :
CCDS58 PNGPLPGHKQQPEAPEPAGQRPSIFQSLLHCLLGRA---RPTKKKTTQDSTDLV----DN
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pF1KSD PRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNAV
.:. . :. . : . .. ::: . .: . .. .:: .:: :: :...
CCDS58 MSPEEIEAWEQEQLSQPVCFD-SCCIDQSPFQLVEQTTLHKTHTLFSLLGL-HLAYVTSM
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850 860
pF1KSD GEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
:.. :. :. : :: .. : ..
CCDS58 GKLRGV-----LALEELQKAIEGHTKSGVQLRPPLASFRNTTSTRKSTGAPPSSAENWNL
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: .:. ....:. :.::. :.:::::.:::.: :.:. :. .: .:::
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. .:: .. :. . : .:. : : ..: :.:.:. .:. :
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: : ::..... ::. . ... :.: ::.:. ....: .... :. :
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. . .. : ... . : .: . .:: .. ..
CCDS54 ETLVTLFDNRTW------VRQGLVEELEPPST-----SQAWNPPRANVF-----------
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.::..:... : .. . : :: : :.: .. ::::::::.. . ... : :
CCDS54 LTLVIFILMKFWMSALATTIPVPCGAFMPVFVIGAAFGRLVGESMAAWFPDGIHTDSSTY
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: : .:..:::: :.:.: :.: .::..: :..:.. ::.:.....:. ... .. .
CCDS54 RIVPGGYAVVGAAA-LAGAVTHTVSTAVIVFELTGQIAHILPVMIAVILANAVAQSLQPS
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.:: . .. .: : : . .. ..:. ::: .. ::. .. :: ..:.
CCDS54 LYDSIIRIKKLPYLPELGWGRHQQY-RVRVEDIMVRDV----PHVALSCTFRDLRLALHR
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pF1KSD AFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSSILTRAGEQ---RKRSQSMKSYPSSELRN
. .: .... . . ....:.... : : .: : :. ...
CCDS54 T-------KGRMLALVESPESMILLGSIERSQVVALLGAQLSPARRRQHMQERRATQTSP
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pF1KSD MCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNLYPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRS
. :.
CCDS54 LSDQEGPPTPEASVCFQVNTEDSAFPAARGETHKPLKPALKRGPSVTRNLGESPTGSAES
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CCDS54 --AQQWMSRGLNTSIL-LQYLAWVTYPVVLITFSAGFTQILAPQAVGSGIPEMKTILRGV
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pF1KSD KVPGIVRLRTLLCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNF
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CCDS54 VLKEYLTLKTFIAKVIGLTCALGSGMPLGKEGPFVHIASMCAALLSKFLSL------FGG
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: .:. ....:. :.::. :.:::::.:::.: :.:. :. .: .:::
CCDS54 IYENESRNT-EMLAAACAVGVGCCFAAPIGGVLFSIEVTSTFFAVRNYWRGFF---AATF
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. .:: .. :. . : .:. : : ..: :.:.:. .:. :
CCDS54 SAFIFRV---LAVWNRDEETITALFKTRFRL---DFPFDL---QELPAFAVIGIASGFGG
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pF1KSD ATFNCLNKRLAKYRMRNVHPKPKLV---RVLESLLVSLVTTVVVF---VASMVLGECRQM
: : ::..... ::. . ... :.: ::.:. ....: .... :. :
CCDS54 ALFVYLNRKIVQV-MRKQKTINRFLMRKRLLFPALVTLLISTLTFPPGFGQFMAGQLSQK
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. . .. . : . . .. : .: . .:: .. ..
CCDS54 ETLVTLFDN--RTWVRQGLVEELE----PPST-----SQAWNPPRANVF-----------
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pF1KSD VTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFA
.::..:... : .. . : :: : :.: . : . ... . .: : .:
CCDS54 LTLVIFILMKFWMSALATTIPVPCGAFMPVF---------VIDGIHTDSSTYRIVPGGYA
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..:::: :.:.: :.: .::..: :..:.. ::.:.....:. ... .. ..:: . .
CCDS54 VVGAAA-LAGAVTHTVSTAVIVFELTGQIAHILPVMIAVILANAVAQSLQPSLYDSIIRI
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pF1KSD RGVPLLE---WETEVEMDKLRASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTEN
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CCDS54 KKLPYLPELGWGRH-QQYRVRVEDIMVRDV----PHVALSCTFRDLRLALHRT-------
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pF1KSD RGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSSILTRAGEQ---RKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIAS
.: .... . . ....:.... : : .: : :. ... . :.
CCDS54 KGRMLALVESPESMILLGSIERSQVVALLGAQLSPARRRQHMQERRATQTSPLSDQ----
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pF1KSD EEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPN--------LYP--DQSPSEDWTMEERFRPLTFH-GLI
: : : . ... . . .: : : ..:: .. : . :.
CCDS54 EGPPTPEASVCFQVNTEDSAFPAARGETHKPLKPALKRGPSVTRNLGESPTGSAESAGIA
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pF1KSD LRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAEDYPRYPDIHDLDLT-LLNPRMIVDVT
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CCDS54 LRSLF--------CGSPPPEAASEKLESCEKRKLKRVRISLASDADLEGEMSPEEILEWE
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pF1KSD ------PY------MNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNAVGEIVGIITRHN
: ..:.:: . : . .. ..: .:. : :...:...::.: ..
CCDS54 EQQLDEPVNFSDCKIDPAPFQLVERTSLHKTHTIFSLLGVDH-AYVTSIGRLIGIVTLKE
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860
pF1KSD LTYEFLQARLRQHYQTI
:
CCDS54 LRKAIEGSVTAQGVKVRPPLASFRDSATSSSDTETTEVHALWGPHSRHGLPREGSPSDSD
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:. . .:. .::. .:. . :
CCDS32 LLEYGRSRCARCRVCSVRCHKFLVSRVGEDWIFLVLLGLLMALVSWVMDYAIAACLQ---
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pF1KSD GVVQTSVEECSQKGCLALSLLELLGFNLTFV-FLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGV
.: . . . . : :. : . . .... : :.. .. : :.::::::.: : ::
CCDS32 --AQQWMSRGLNTSIL-LQYLAWVTYPVVLITFSAGFTQILAPQAVGSGIPEMKTILRGV
120 130 140 150 160 170
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