Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0046
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0046, 869 aa
1>>>pF1KSDA0046 869 - 869 aa - 869 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7883+/-0.000461; mu= 24.2564+/- 0.029
mean_var=72.4019+/-14.703, 0's: 0 Z-trim(110.9): 50 B-trim: 245 in 1/50
Lambda= 0.150730
statistics sampled from 19304 (19354) to 19304 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16
Scan time: 7.910
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001277 (OMIM: 602726) chloride transport protei ( 869) 5815 1274.7 0
NP_001243888 (OMIM: 602726) chloride transport pro ( 847) 5298 1162.3 0
XP_011520656 (OMIM: 166600,602727,611490) PREDICTE ( 747) 1146 259.3 4.8e-68
NP_001107803 (OMIM: 166600,602727,611490) H(+)/Cl( ( 781) 1146 259.3 4.9e-68
NP_001278 (OMIM: 166600,602727,611490) H(+)/Cl(-) ( 805) 1146 259.4 5e-68
NP_000074 (OMIM: 118425,160800,255700) chloride ch ( 988) 357 87.9 2.6e-16
XP_011510703 (OMIM: 600570,607628,615651) PREDICTE ( 835) 305 76.5 5.8e-13
XP_006713552 (OMIM: 600570,607628,615651) PREDICTE ( 863) 305 76.5 6e-13
NP_001164560 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride ( 869) 305 76.5 6e-13
NP_001164558 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride ( 881) 305 76.5 6.1e-13
NP_004357 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride ch ( 898) 305 76.5 6.2e-13
NP_001164559 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride ( 854) 296 74.5 2.3e-12
XP_006713553 (OMIM: 600570,607628,615651) PREDICTE ( 512) 261 66.7 3.1e-10
XP_011514084 (OMIM: 118425,160800,255700) PREDICTE ( 570) 242 62.6 5.9e-09
XP_016867229 (OMIM: 118425,160800,255700) PREDICTE ( 838) 242 62.8 7.8e-09
XP_016867228 (OMIM: 118425,160800,255700) PREDICTE ( 846) 242 62.8 7.9e-09
NP_001230301 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange tr ( 791) 240 62.3 1e-08
NP_001159417 (OMIM: 602023,607364,613090) chloride ( 517) 219 57.6 1.8e-07
NP_000076 (OMIM: 602023,607364,613090) chloride ch ( 687) 219 57.7 2.2e-07
NP_001244068 (OMIM: 602024,613090) chloride channe ( 644) 218 57.5 2.4e-07
NP_001036169 (OMIM: 602024,613090) chloride channe ( 686) 218 57.5 2.5e-07
NP_004061 (OMIM: 602024,613090) chloride channel p ( 687) 218 57.5 2.5e-07
NP_001230303 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange tr ( 791) 213 56.5 5.9e-07
NP_001820 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange trans ( 818) 213 56.5 6.1e-07
XP_011529888 (OMIM: 600580) PREDICTED: H(+)/Cl(-) ( 831) 213 56.5 6.1e-07
XP_005262783 (OMIM: 600580) PREDICTED: H(+)/Cl(-) ( 839) 213 56.5 6.2e-07
NP_776297 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange trans ( 866) 213 56.5 6.3e-07
NP_000075 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31046 ( 746) 203 54.3 2.6e-06
NP_001269092 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 766) 203 54.3 2.6e-06
NP_001121371 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 816) 203 54.3 2.7e-06
NP_001121370 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 816) 203 54.3 2.7e-06
XP_016884746 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 820) 203 54.3 2.7e-06
XP_016884747 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 820) 203 54.3 2.7e-06
NP_001243873 (OMIM: 300114,302910) H(+)/Cl(-) exch ( 666) 200 53.6 3.7e-06
NP_001821 (OMIM: 300114,302910) H(+)/Cl(-) exchang ( 760) 200 53.6 4.1e-06
>>NP_001277 (OMIM: 602726) chloride transport protein 6 (869 aa)
initn: 5815 init1: 5815 opt: 5815 Z-score: 6829.0 bits: 1274.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5815; 100.0% identity (100.0% similar) in 869 aa overlap (1-869:1-869)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD YLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEEC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GSWGSFQLPGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSWGSFQLPGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD YRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD GISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD TVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KSSILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSSILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD YPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAED
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD YPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNA
790 800 810 820 830 840
850 860
pF1KSD VGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
850 860
>>NP_001243888 (OMIM: 602726) chloride transport protein (847 aa)
initn: 5298 init1: 5298 opt: 5298 Z-score: 6221.5 bits: 1162.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5609; 97.5% identity (97.5% similar) in 869 aa overlap (1-869:1-847)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYE-----------
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD YLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEEC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -----------KGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEEC
50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRD
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQF
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GSWGSFQLPGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSWGSFQLPGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAK
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD YRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTED
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTY
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD GISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISL
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KSD TVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLR
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFK
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KSSILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSSILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNL
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KSD YPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAED
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KSD YPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNA
760 770 780 790 800 810
850 860
pF1KSD VGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
820 830 840
>>XP_011520656 (OMIM: 166600,602727,611490) PREDICTED: H (747 aa)
initn: 1701 init1: 704 opt: 1146 Z-score: 1342.6 bits: 259.3 E(85289): 4.8e-68
Smith-Waterman score: 1890; 41.4% identity (65.9% similar) in 828 aa overlap (40-861:28-737)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD CCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDPYLEVLETMD
.: : ::::::: :. .:: . ..
XP_011 MSSVELDDELLDPDMDPPHPFPKEIPHNEKLLSLKYESLDYDNSENQLFLEEERRIN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEECSQKGCLALS
. : : .:.. ::. ::::. :.:. :. .. ::. :.. .... ..:: :..:
XP_011 HTAFRTVEIKRWVICALIGILTGLVACFIDIVVENLAGLKYRVIKGNIDKFTEKGGLSFS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LLELLGFNLTFVFLASLLV-LIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTLLCKVLGVL
:: .: .::...:..: .:::::::::::..::.:::::.: .:::.::. :: ::.
XP_011 LLLWATLNAAFVLVGSVIVAFIEPVAAGSGIPQIKCFLNGVKIPHVVRLKTLVIKVSGVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRDFVSAGAAA
.::.::: :::::::::::::..::. : .: ::.. : ::: : .:::::::::::
XP_011 LSVVGGLAVGKEGPMIHSGSVIAAGISQGRSTSLKRDFKIFEYFRRDTEKRDFVSAGAAA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQFGSWGSFQL
::.::::::.::.:::::::.::::: :::...: :: .:::::: : : :. ...
XP_011 GVSAAFGAPVGGVLFSLEEGASFWNQFLTWRIFFASMISTFTLNFVLS-IYHGNMWDLSS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAKYRMRNVHP
:::.:::.: ::.: . : .. :..:::.::.:::.:: :: :. .:.: .:
XP_011 PGLINFGRF---DSEKMAY--TIHEIPVFIAMGVVGGVLGAVFNALNYWLTMFRIRYIH-
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTF
.: : .:.:..::. ::..:.:: . .:. . : :. :. ::.
XP_011 RPCL-QVIEAVLVAAVTATVAFVLIYSSRDCQPL----QGGSMSYPLQL-----------
360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD FCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQD-GTFSPVTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSG
:: . ::.::. ::: :.....:::. :...:.::.:: ..::.:::::::..: .:
XP_011 FCADGEYNSMAAAFFNTPEKSVVSLFHDPPGSYNPLTLGLFTLVYFFLACWTYGLTVSAG
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYS--GTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILI
.:.:::: :::.::: . : ::. . :.. : .::.:::: :::.::::.:::::..
XP_011 VFIPSLLIGAAWGRLFGISL-SYLTGAAIWADPGKYALMGAAAQLGGIVRMTLSLTVIMM
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLRASDIM
:.:...:::.:::..::.:: .:: : .:.::.:. :..::.:.::. : .: : ..:
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520 530 540 550 560 570
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pF1KSD EPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTV--HHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSS
.: . . .. .:..: :. :..::::
XP_011 STPVTCLRRREKVGVIVDVLSDTASNHNGFPVV---------------------------
580 590 600
670 680 690 700 710 720
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:: . .::. ::
XP_011 ----------------------------EHADDTQPAR----LQ----------------
610
730 740 750 760 770 780
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::::::::..:: . : .:. . : :: .. . :::
XP_011 -------------------GLILRSQLIVLLKHKVFVERSNLGLVQRRLRLKDFRDAYPR
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.: :... .. . . .:.. .:::::.:: .. . .::.:::..::::: ::. ..
XP_011 FPPIQSIHVSQDERECTMDLSEFMNPSPYTVPQEASLPRVFKLFRALGLRHLVVVDNRNQ
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850 860
pF1KSD IVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
.::..::..:. : :
XP_011 VVGLVTRKDLARYRLGKRGLEELSLAQT
720 730 740
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD CCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDPYLEVLETMD
.: : ::::::: :. .:: . ..
NP_001 GGTPLLNGAGPGAARQDMDPPHPFPKEIPHNEKLLSLKYESLDYDNSENQLFLEEERRIN
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70 80 90 100 110 120
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. : : .:.. ::. ::::. :.:. :. .. ::. :.. .... ..:: :..:
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130 140 150 160 170 180
pF1KSD LLELLGFNLTFVFLASLLV-LIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTLLCKVLGVL
:: .: .::...:..: .:::::::::::..::.:::::.: .:::.::. :: ::.
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190 200 210 220 230 240
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.::.::: :::::::::::::..::. : .: ::.. : ::: : .:::::::::::
NP_001 LSVVGGLAVGKEGPMIHSGSVIAAGISQGRSTSLKRDFKIFEYFRRDTEKRDFVSAGAAA
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250 260 270 280 290 300
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::.::::::.::.:::::::.::::: :::...: :: .:::::: : : :. ...
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310 320 330 340 350 360
pF1KSD PGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAKYRMRNVHP
:::.:::.: ::.: . : .. :..:::.::.:::.:: :: :. .:.: .:
NP_001 PGLINFGRF---DSEKMAY--TIHEIPVFIAMGVVGGVLGAVFNALNYWLTMFRIRYIH-
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.: : .:.:..::. ::..:.:: . .:. . : :. :. ::.
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:: . ::.::. ::: :.....:::. :...:.::.:: ..::.:::::::..: .:
NP_001 FCADGEYNSMAAAFFNTPEKSVVSLFHDPPGSYNPLTLGLFTLVYFFLACWTYGLTVSAG
430 440 450 460 470 480
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pF1KSD LFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYS--GTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILI
.:.:::: :::.::: . : ::. . :.. : .::.:::: :::.::::.:::::..
NP_001 VFIPSLLIGAAWGRLFGISL-SYLTGAAIWADPGKYALMGAAAQLGGIVRMTLSLTVIMM
490 500 510 520 530 540
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pF1KSD ESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLRASDIM
:.:...:::.:::..::.:: .:: : .:.::.:. :..::.:.::. : .: : ..:
NP_001 EATSNVTYGFPIMLVLMTAKIVGDVFIEGLYDMHIQLQSVPFLHWEAPVTSHSLTAREVM
550 560 570 580 590 600
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pF1KSD EPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTV--HHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSS
.: . . .. .:..: :. :..::::
NP_001 STPVTCLRRREKVGVIVDVLSDTASNHNGFPVV---------------------------
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pF1KSD ILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNLYPD
:: . .::. ::
NP_001 ----------------------------EHADDTQPAR----LQ----------------
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pF1KSD QSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAEDYPR
::::::::..:: . : .:. . : :: .. . :::
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pF1KSD YPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNAVGE
.: :... .. . . .:.. .:::::.:: .. . .::.:::..::::: ::. ..
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pF1KSD IVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
.::..::..:. : :
NP_001 VVGLVTRKDLARYRLGKRGLEELSLAQT
760 770 780
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD CCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDPYLEVLETMD
.: : ::::::: :. .:: . ..
NP_001 VGHMSSVELDDELLDPDMDPPHPFPKEIPHNEKLLSLKYESLDYDNSENQLFLEEERRIN
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70 80 90 100 110 120
pF1KSD NKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEECSQKGCLALS
. : : .:.. ::. ::::. :.:. :. .. ::. :.. .... ..:: :..:
NP_001 HTAFRTVEIKRWVICALIGILTGLVACFIDIVVENLAGLKYRVIKGNIDKFTEKGGLSFS
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130 140 150 160 170 180
pF1KSD LLELLGFNLTFVFLASLLV-LIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTLLCKVLGVL
:: .: .::...:..: .:::::::::::..::.:::::.: .:::.::. :: ::.
NP_001 LLLWATLNAAFVLVGSVIVAFIEPVAAGSGIPQIKCFLNGVKIPHVVRLKTLVIKVSGVI
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190 200 210 220 230 240
pF1KSD FSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRDFVSAGAAA
.::.::: :::::::::::::..::. : .: ::.. : ::: : .:::::::::::
NP_001 LSVVGGLAVGKEGPMIHSGSVIAAGISQGRSTSLKRDFKIFEYFRRDTEKRDFVSAGAAA
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250 260 270 280 290 300
pF1KSD GVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQFGSWGSFQL
::.::::::.::.:::::::.::::: :::...: :: .:::::: : : :. ...
NP_001 GVSAAFGAPVGGVLFSLEEGASFWNQFLTWRIFFASMISTFTLNFVLS-IYHGNMWDLSS
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAKYRMRNVHP
:::.:::.: ::.: . : .. :..:::.::.:::.:: :: :. .:.: .:
NP_001 PGLINFGRF---DSEKMAY--TIHEIPVFIAMGVVGGVLGAVFNALNYWLTMFRIRYIH-
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370 380 390 400 410 420
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.: : .:.:..::. ::..:.:: . .:. . : :. :. ::.
NP_001 RPCL-QVIEAVLVAAVTATVAFVLIYSSRDCQPL----QGGSMSYPLQL-----------
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430 440 450 460 470 480
pF1KSD FCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQD-GTFSPVTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSG
:: . ::.::. ::: :.....:::. :...:.::.:: ..::.:::::::..: .:
NP_001 FCADGEYNSMAAAFFNTPEKSVVSLFHDPPGSYNPLTLGLFTLVYFFLACWTYGLTVSAG
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pF1KSD LFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYS--GTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILI
.:.:::: :::.::: . : ::. . :.. : .::.:::: :::.::::.:::::..
NP_001 VFIPSLLIGAAWGRLFGISL-SYLTGAAIWADPGKYALMGAAAQLGGIVRMTLSLTVIMM
520 530 540 550 560 570
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLRASDIM
:.:...:::.:::..::.:: .:: : .:.::.:. :..::.:.::. : .: : ..:
NP_001 EATSNVTYGFPIMLVLMTAKIVGDVFIEGLYDMHIQLQSVPFLHWEAPVTSHSLTAREVM
580 590 600 610 620 630
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTV--HHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSS
.: . . .. .:..: :. :..::::
NP_001 STPVTCLRRREKVGVIVDVLSDTASNHNGFPVV---------------------------
640 650 660
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pF1KSD ILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNLYPD
:: . .::. ::
NP_001 ----------------------------EHADDTQPAR----LQ----------------
670
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pF1KSD QSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAEDYPR
::::::::..:: . : .:. . : :: .. . :::
NP_001 -------------------GLILRSQLIVLLKHKVFVERSNLGLVQRRLRLKDFRDAYPR
680 690 700 710
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pF1KSD YPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNAVGE
.: :... .. . . .:.. .:::::.:: .. . .::.:::..::::: ::. ..
NP_001 FPPIQSIHVSQDERECTMDLSEFMNPSPYTVPQEASLPRVFKLFRALGLRHLVVVDNRNQ
720 730 740 750 760 770
850 860
pF1KSD IVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
.::..::..:. : :
NP_001 VVGLVTRKDLARYRLGKRGLEELSLAQT
780 790 800
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pF1KSD MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQE-----EEDEIL
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:.: : : .: : . . . .. : :: . :. . .:. .::. .:.
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.. . :.. .: .. : :..: . : :.......:. :: : :.:::
NP_000 VSAKSLQAYKWSYAQ-------MQPSLPLQFLVWVTFPLVLILFSALFCHLISPQAVGSG
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pF1KSD IPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTLLCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQ
:::.: : :: . . ..... ::... ....:. ::::::..: .:. .: : .:.
NP_000 IPEMKTILRGVVLKEYLTMKAFVAKVVALTAGLGSGIPVGKEGPFVHIASICAAVLSKFM
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pF1KSD SISLRKIQFNFPYFRSDRDKRDFVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTW
:. .. ::. :: ....: :.::. ::.:.::.:::.: :... :
NP_000 SVFCGV--YEQPYYYSD-----ILTVGCAVGVGCCFGTPLGGVLFSIEVTSTYFAVRNYW
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280 290 300 310 320 330
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. .: .:::. :: .. :.. .. . :. . : : .: :
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...:. :::::.: :.... : .:. . : . : . . : .:.:: ::...
NP_000 AAIGICCGLLGAVFVYLHRQV----MLGVRKHKALSQFLAKHRL-LYPGIVTFVIASFTF
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pF1KSD GECR-QMSSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFH
:. .. . .. ... : :. .: :.. .......:. .... .:
NP_000 PPGMGQFMAGELMPREA--ISTLFDNNTWVKHAGDPESL--GQSAVWIHPRVNVVIIIF-
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::::. : .. . . .: : :.: .. ::::::::.... . :
NP_000 -----------LFFVMKFWMSIVATTMPIPCGGFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGI
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pF1KSD -------HIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWT
.: : .:.::::: : :.: :.: .:: .: :..:.. ::.::....:. .
NP_000 LFDDIIYKILPGGYAVIGAAA-LTGAVSHTVSTAVICFELTGQIAHILPMMVAVILANMV
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pF1KSD GDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLE---WETEVEMDKLRASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSI
.. .. ..:: . .. .: : :. .. . . ::: .. .: : ..
NP_000 AQSLQPSLYDSIIQVKKLPYLPDLGWN-QLSKYTIFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTL
570 580 590 600 610 620
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pF1KSD LRTTVHHAFPVV----------TENRGNEKEFMKGN-----QLISNNIKFKKSSILTRAG
:.::. ...:.: . .:.. . ... . .: . . .: : : :
NP_000 LQTTTVKTLPLVDSKDSMILLGSVERSELQALLQRHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDG
630 640 650 660 670 680
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pF1KSD EQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLL-QQMLERRYTPYPNLYPDQSPSE
. : .... . : .. : .: . : ::: .. : . .:. :: :
NP_000 KARLAGEGLPGAPPGR-----PESFAFVDEDEDEDLSGKSELPPSLALHPSTTAPLSPEE
690 700 710 720 730 740
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pF1KSD D-------WTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAEDY
. : .: . :..: : :: :. ......: . . :
NP_000 PNGPLPGHKQQPEAPEPAGQRPSIFQSLLHCLLGRA---RPTKKKTTQDSTDLV----DN
750 760 770 780 790
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pF1KSD PRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNAV
.:. . :. . : . .. ::: . .: . .. .:: .:: :: :...
NP_000 MSPEEIEAWEQEQLSQPVCFD-SCCIDQSPFQLVEQTTLHKTHTLFSLLGL-HLAYVTSM
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850 860
pF1KSD GEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
:.. :. :. : :: .. : ..
NP_000 GKLRGV-----LALEELQKAIEGHTKSGVQLRPPLASFRNTTSTRKSTGAPPSSAENWNL
860 870 880 890 900
>>XP_011510703 (OMIM: 600570,607628,615651) PREDICTED: c (835 aa)
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pF1KSD LDYDRCINDPYLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKF
:. . .:. .::. .:. . :
XP_011 LLEYGRSRCARCRVCSVRCHKFLVSRVGEDWIFLVLLGLLMALVSWVMDYAIAACLQ---
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KSD GVVQTSVEECSQKGCLALSLLELLGFNLTFV-FLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGV
.: . . . . : :. : . . .... : :.. .. : :.::::::.: : ::
XP_011 --AQQWMSRGLNTSIL-LQYLAWVTYPVVLITFSAGFTQILAPQAVGSGIPEMKTILRGV
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD KVPGIVRLRTLLCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNF
. . :.:.. ::.:. ....:. .:::::..: .:. .: : .: :. :.
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: .:. ....:. :.::. :.:::::.:::.: :.:. :. .: .:::
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. .:: .. :. . : .:. : : ..: :.:.:. .:. :
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: : ::..... ::. . ... :.: ::.:. ....: .... :. :
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. . .. : ... . : .: . .:: .. ..
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.::..:... : .. . : :: : :.: .. ::::::::.. . ... : :
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: : .:..:::: :.:.: :.: .::..: :..:.. ::.:.....:. ... .. .
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. :.
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. . :.:.. ::.:. ....:. .:::::..: .:. .: : .: :. :.
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: . . .. ..: .:. : :...:...::.: ..:
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pF1KSD I
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NP_001 --AQQWMSRGLNTSIL-LQYLAWVTYPVVLITFSAGFTQILAPQAVGSGIPEMKTILRGV
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD KVPGIVRLRTLLCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNF
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NP_001 VLKEYLTLKTFIAKVIGLTCALGSGMPLGKEGPFVHIASMCAALLSKFLSL------FGG
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KSD PYFRSDRDKRDFVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATF
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NP_001 IYENESRNT-EMLAAACAVGVGCCFAAPIGGVLFSIEVTSTFFAVRNYWRGFF---AATF
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pF1KSD TLNFFRSGIQFGSWGSFQLPGLLNFG-EFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLG
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NP_001 SAFIFRV---LAVWNRDEETITALFKTRFRL---DFPFDL---QELPAFAVIGIASGFGG
290 300 310 320 330
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pF1KSD ATFNCLNKRLAKYRMRNVHPKPKLV---RVLESLLVSLVTTVVVF---VASMVLGECRQM
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NP_001 ALFVYLNRKIVQV-MRKQKTINRFLMRKRLLFPALVTLLISTLTFPPGFGQFMAGQLSQK
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NP_001 ETLVTLFDN--RTWVRQGLVEELE----PPST-----SQAWNPPRANVF-----------
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NP_001 LTLVIFILMKFWMSALATTIPVPCGAFMPVF---------VIDGIHTDSSTYRIVPGGYA
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pF1KSD LIGAAAFLGGVVRMTISLTVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGL
..:::: :.:.: :.: .::..: :..:.. ::.:.....:. ... .. ..:: . .
NP_001 VVGAAA-LAGAVTHTVSTAVIVFELTGQIAHILPVMIAVILANAVAQSLQPSLYDSIIRI
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pF1KSD RGVPLLE---WETEVEMDKLRASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTEN
. .: : : . .. ..:. ::: .. ::. .. :: ..:..
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pF1KSD RGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSSILTRAGEQ---RKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIAS
.: .... . . ....:.... : : .: : :. ... . :.
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: : : . ... . . .: : : ..:: .. : . :.
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: ..:.:: . : . .. ..: .:. : :...:...::.: ..
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860
pF1KSD LTYEFLQARLRQHYQTI
:
NP_001 LRKAIEGSVTAQGVKVRPPLASFRDSATSSSDTETTEVHALWGPHSRHGLPREGSPSDSD
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869 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 23:36:46 2016 done: Wed Nov 2 23:36:48 2016
Total Scan time: 7.910 Total Display time: 0.230
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]