Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0053
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0053, 638 aa
1>>>pF1KSDA0053 638 - 638 aa - 638 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9627+/-0.00109; mu= 3.5556+/- 0.066
mean_var=222.6607+/-44.171, 0's: 0 Z-trim(111.1): 137 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.085951
statistics sampled from 11991 (12129) to 11991 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16
Scan time: 4.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46312.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 ( 638) 4247 539.9 3.9e-153
CCDS54364.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 ( 639) 4235 538.4 1.1e-152
CCDS33214.2 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 ( 646) 4157 528.8 9.1e-150
CCDS54363.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 ( 606) 3228 413.5 4.1e-115
CCDS7227.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 698) 1351 180.8 5.3e-45
CCDS58081.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 704) 1346 180.2 8.2e-45
CCDS34025.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 ( 748) 1239 167.0 8.5e-41
CCDS58079.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 608) 1031 141.1 4.2e-33
CCDS58080.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 714) 955 131.7 3.3e-30
CCDS43246.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 ( 653) 952 131.3 4e-30
CCDS3611.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 ( 655) 860 119.9 1.1e-26
>>CCDS46312.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 (638 aa)
initn: 4247 init1: 4247 opt: 4247 Z-score: 2862.7 bits: 539.9 E(32554): 3.9e-153
Smith-Waterman score: 4247; 100.0% identity (100.0% similar) in 638 aa overlap (1-638:1-638)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLERPIKMGWLKKQRSIVKNWQQRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MSLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLERPIKMGWLKKQRSIVKNWQQRY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNRMGQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNRMGQD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNCAVNKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNCAVNKM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIPLSPPAQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIPLSPPAQK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD NDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPEDSSKVPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPEDSSKVPRE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAGEGHRRTMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAGEGHRRTMS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGDTLASPNSETGPGKKNSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGDTLASPNSETGPGKKNSGE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD EEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKEKKKSAALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKEKKKSAALE
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KSD ISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
610 620 630
>>CCDS54364.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 (639 aa)
initn: 4233 init1: 3226 opt: 4235 Z-score: 2854.6 bits: 538.4 E(32554): 1.1e-152
Smith-Waterman score: 4235; 99.8% identity (99.8% similar) in 639 aa overlap (1-638:1-639)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLERPIKMGWLKKQRSIVKNWQQRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLERPIKMGWLKKQRSIVKNWQQRY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNRMGQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNRMGQD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KSD SYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCG-VFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEF
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNCAVNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNCAVNK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD MSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIPLSPPAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIPLSPPAQ
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD KNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPEDSSKVPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPEDSSKVPR
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAGEGHRRTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAGEGHRRTM
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD SQDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGDTLASPNSETGPGKKNSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SQDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGDTLASPNSETGPGKKNSG
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD EEEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKEKKKSAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EEEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKEKKKSAAL
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630
pF1KSD EISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
610 620 630
>>CCDS33214.2 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 (646 aa)
initn: 4155 init1: 3226 opt: 4157 Z-score: 2802.3 bits: 528.8 E(32554): 9.1e-150
Smith-Waterman score: 4157; 99.8% identity (99.8% similar) in 627 aa overlap (13-638:20-646)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLERPIKMGWLKKQRSIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MSLKLPRNWDFNLKVEAAKIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLERPIKMGWLKKQRSIV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KNWQQRYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KNWQQRYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD QNRMGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCG-VFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QNRMGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPIL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD VEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD RDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQ
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PLSPPAQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PLSPPAQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPE
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD DSSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DSSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAG
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD EGHRRTMSQDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGDTLASPNSETG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EGHRRTMSQDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGDTLASPNSETG
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PGKKNSGEEEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PGKKNSGEEEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKE
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630
pF1KSD KKKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KKKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
610 620 630 640
>>CCDS54363.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 (606 aa)
initn: 3882 init1: 3226 opt: 3228 Z-score: 2180.1 bits: 413.5 E(32554): 4.1e-115
Smith-Waterman score: 3808; 93.8% identity (93.8% similar) in 626 aa overlap (13-638:20-606)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLERPIKMGWLKKQRSIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSLKLPRNWDFNLKVEAAKIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLERPIKMGWLKKQRSIV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KNWQQRYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KNWQQRYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIP----
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD QNRMGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILV
:::::::::::::::::::::::::
CCDS54 -----------------------------------VFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILV
120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KSD EKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLR
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KSD DLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQL
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KSD NCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIP
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LSPPAQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSPPAQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPED
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAGE
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KSD GHRRTMSQDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGDTLASPNSETGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GHRRTMSQDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGDTLASPNSETGP
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KSD GKKNSGEEEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GKKNSGEEEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKEK
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630
pF1KSD KKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
570 580 590 600
>>CCDS7227.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 (698 aa)
initn: 1544 init1: 837 opt: 1351 Z-score: 921.4 bits: 180.8 E(32554): 5.3e-45
Smith-Waterman score: 1521; 42.9% identity (65.4% similar) in 679 aa overlap (14-620:12-673)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLER-PI-KMGWLKKQRSIVKNWQQ
:::.:.. ::: . :. : : . :. : :::::::::.:::::
CCDS72 MLSPKIRQARRARSKSLVMGEQ--SRSPGRMPCPHRLGPVLKAGWLKKQRSIMKNWQQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNR--
:.::::..::.::::... :::: . : : . :. .::. :: .::: :.. . .
CCDS72 RWFVLRGDQLFYYKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPGGAGEREKV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD -MGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCG--VFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILV
. .. .:::::: .::.::. .::: .: : .:::::.::: .:.:.::.:.:.::
CCDS72 PANPEALLLMASSQRDMEDWVQAIRRVIWAPLGGGIFGQRLEETVHHERKYGPRLAPLLV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD EKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLR
:.:..:: :.: .:::.::.::: :::..:.:.:: ::.: :: :::::::::::::::
CCDS72 EQCVDFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD DLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQL
.:::::::...:: :: :.:: . ::... :: ::.: ::. ::.:: :::.:: :.:
CCDS72 ELPEPVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQA
240 250 260 270 280 290
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CCDS72 YSNVNKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLF--TAPVP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LSPPAQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPED
.: . .. . : ::: . : : :. . . :.: : :
CCDS72 EGPTSPRGGLQCA------VGWGSEEVTRDSQGEPGGPGLPAHRTSSLDGA----AVAVL
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: .: ::. . . :..::::. : : :... .:..:: .. :... :
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470 480 490 500 510
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.. .. .::::. : : :.. .. :: :::::::. .:: :. . : : :.. .:
CCDS72 NGLSSL-RGHRRASSGDRLKDSGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIPSVASMAWSGASSSESS
470 480 490 500 510 520
520 530
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: .:.: :.: :.: : .::
CCDS72 VGGSLSSCTACRASDSSARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSE
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540 550 560 570 580
pF1KSD EEEIDS-----------LQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEE
: :: :: .: ::: :. :. ::...: .:. . :. .. ::.::
CCDS72 PSEPDSPTREHARRSEALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEE
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590 600 610 620 630
pF1KSD LEKEKKKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
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CCDS72 LDQEKKKYIMLEIKLRNSERAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK
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CCDS58 NWQQRWFVLRGDQLFYYKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPGGAGE
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. . .. .:::::: .::.::. .::: .: : .:::::.::: .:.:.::.:.
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CCDS58 PLLVEQCVDFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLK
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CCDS58 LYLRELPEPVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLD
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pF1KSD EIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKS
:.: ::::::.:::::.: :..: .::::..::.:: .:..::..:: : :: .
CCDS58 EVQAYSNVNKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLF--T
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CCDS58 APVPEGPTSPRGGLQCA------VGWGSEEVTRDSQGEPGGPGLPAHRTSSLDGA----A
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: .: ::. . . :..::::. : : :... .:..:: .. :...
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: .. .. .::::. : : :.. .. :: :::::::. .:: :. . : : :.
CCDS58 NWLMNGLSSL-RGHRRASSGDRLKDSGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIPSVASMAWSGASS
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. .: : .:.: :.: :.: :
CCDS58 SESSVGGSLSSCTACRASDSSARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGA
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540 550 560 570 580
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.:: : :: :: .: ::: :. :. ::...: .:. . :. .. :
CCDS58 SNSEPSEPDSPTREHARRSEALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSR
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590 600 610 620 630
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CCDS58 LEEELDQEKKKYIMLEIKLRNSERAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAP
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CCDS58 K
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CCDS34 HTRWFVLKGDQLYYFKDEDETKPLGTIFLPGNKVSEHPCNEENPGKFLFEVVPGG-DRDR
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: ...::.::::.: .::.::: .::: : : .:::.:..:: ::...: .:.:.:
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CCDS34 VEQCVDFIRQRGLKEEGLFRLPGQANLVKELQDAFDCGEKPSFDSNTDVHTVASLLKLYL
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:.:::::.:...:: :: :..: . .: . .:: ::.. :: ::.::.:::::: :.:
CCDS34 RELPEPVIPYAKYEDFLSCAKLLSKEEEAGVKELAKQVKSLPVVNYNLLKYICRFLDEVQ
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.: :: :. : .: . : :: .:. : : ... .
CCDS34 QSKPQDGVSNNNEIQKKATMGQLQNKENNNTKDSPSRQCS--WDKSESPQRSSMNNGSPT
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: : :.:: ....: . :: . :. : . .. . .. ..::: :
CCDS34 ALSGSKTNSPKNSVHKLDVSRSPPLMVKKNPAFNKGSGIVTNGSFSSSNAEGLEKTQTTP
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pF1KSD N------RKCFL--TSAFQGANSS-----KMEIF-----------KNEFWSPSSEAKAGE
: :. : ... .:..: .: :. .: : :.. . .
CCDS34 NGSLQARRSSSLKVSGTKMGTHSVQNGTVRMGILNSDTLGNPTNVRNMSWLPNGYVTLRD
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.... .. .: : .: ::::::
CCDS34 NKQKEQAGELGQ---HNRLSTYDNVHQQFSMMNLDDKQSIDSATWSTSSCEISLPENSNS
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::.: ::. ::.:: :::.:: :.: ::::::.:::::.: :..: .::::..::.:
CCDS58 KQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQAYSNVNKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEG
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: .:..::..:: : :: . .: .: . .. . : ::: . : : :. .
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. :.: : : : .: ::. . . :..::::. : :
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:... .:..:: .: : .. : .. .. .::::. : : :.. .. :: :::::
CCDS58 SLSGSPKGGGSS-LEVPIISSGGNWLMNGLSSL-RGHRRASSGDRLKDSGSVQRLSTYDN
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pF1KSD VPS---LPGSPGEEASALS--SQACDSKGDTLAS--------------------------
::. .:: :. . : : :.. .: : .:.:
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:.: :.: : .:: : :: :: .: ::: :. :.
CCDS58 PSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEPDSPTREHARRSEALQGLVTELRAELCRQR
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pF1KSD QMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKEKKKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALE
::...: .:. . :. .. ::.:::..:::: :::.::: ::.:::.:.::. :
CCDS58 TEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQEKKKYIMLEIKLRNSERAREDAERRNQLLQ
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630
pF1KSD EEVKEFVKSMKEPKTEA
CCDS58 REMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK
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CCDS58 MLSPKIRQARRARSKSLVMGEQ--SRSPGRMPCPHRLGPVLKAGWLKKQRSIMKNWQQ
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pF1KSD RYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNR--
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CCDS58 RWFVLRGDQLFYYKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPGGAGEREKV
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pF1KSD -MGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRV------AGT------------PCGVFGQRLDET
. .. .:::::: .::.::. .::: .:: : :.:::::.::
CCDS58 PANPEALLLMASSQRDMEDWVQAIRRVIWAPLGGGTARRSHAHPLEPLPPGIFGQRLEET
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pF1KSD VAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDR
: .:.:.::.:.:.:::.:..:: :.: .:::.::.::: :::..:.:.:: ::.: ::
CCDS58 VHHERKYGPRLAPLLVEQCVDFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDS
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pF1KSD DTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDN
:::::::::::::::.:::::::...:: :: :.:: . ::... :: ::.: ::. :
CCDS58 TTDVHTVASLLKLYLRELPEPVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQAN
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pF1KSD YSLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTM
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CCDS58 YNLLRYICKFLDEVQAYSNVNKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTV
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pF1KSD MIRDHEVLFPKSKDIPLSPPAQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSD
.:: : :: . .: .: . .. . : ::: . : : :. . .
CCDS58 LIRKHSQLF--TAPVPEGPTSPRGGLQCA------VGWGSEEVTRDSQGEPGGPGLPAHR
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CCDS58 TSSLDGA----AVAVLSRTAPT-GPGS-RCSPGKKVQTLPSWKSSFRQPRSLSGSPKGGG
410 420 430 440 450 460
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pF1KSD SS-KMEIFKNEF-WSPSSEAKAGEGHRRTMSQD-LRQLSDSQRTSTYDNVPS---LPGSP
:: .. :... : .. .. .::::. : : :.. .. :: :::::::. .:: :
CCDS58 SSLEVPIISSGGNWLMNGLSSL-RGHRRASSGDRLKDSGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIP
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510 520
pF1KSD GEEASALS--SQACDSKGDTLAS--------------------------PNS--------
. . : : :.. .: : .:.: :.:
CCDS58 SVASMAWSGASSSESSVGGSLSSCTACRASDSSARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLD
530 540 550 560 570 580
530 540 550 560 570
pF1KSD ------ETGPGKKNSGEEEIDS-----------LQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLE
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CCDS58 LDHSMDEAGAGASNSEPSEPDSPTREHARRSEALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIE
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pF1KSD EPKTEA
CCDS58 SLTVGAKGARAPK
710
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