Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0062
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0062, 492 aa
1>>>pF1KSDA0062 492 - 492 aa - 492 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4531+/-0.000887; mu= 17.3249+/- 0.053
mean_var=65.5860+/-12.854, 0's: 0 Z-trim(105.5): 27 B-trim: 41 in 1/49
Lambda= 0.158368
statistics sampled from 8423 (8447) to 8423 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 2.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47823.1 SLC39A14 gene_id:23516|Hs108|chr8 ( 492) 3263 754.5 5.9e-218
CCDS6030.1 SLC39A14 gene_id:23516|Hs108|chr8 ( 492) 3138 725.9 2.3e-209
CCDS47822.1 SLC39A14 gene_id:23516|Hs108|chr8 ( 481) 2952 683.4 1.4e-196
CCDS3656.1 SLC39A8 gene_id:64116|Hs108|chr4 ( 460) 1265 298.0 1.5e-80
CCDS47117.1 SLC39A8 gene_id:64116|Hs108|chr4 ( 444) 1175 277.4 2.2e-74
CCDS33353.1 SLC39A10 gene_id:57181|Hs108|chr2 ( 831) 563 137.7 4.6e-32
CCDS42428.1 SLC39A6 gene_id:25800|Hs108|chr18 ( 755) 545 133.6 7.4e-31
CCDS60494.1 SLC39A12 gene_id:221074|Hs108|chr10 ( 557) 481 118.9 1.4e-26
CCDS44362.1 SLC39A12 gene_id:221074|Hs108|chr10 ( 691) 481 118.9 1.7e-26
CCDS60493.1 SLC39A12 gene_id:221074|Hs108|chr10 ( 690) 480 118.7 2e-26
CCDS45854.1 SLC39A6 gene_id:25800|Hs108|chr18 ( 433) 472 116.8 4.8e-26
CCDS7124.1 SLC39A12 gene_id:221074|Hs108|chr10 ( 654) 466 115.5 1.8e-25
CCDS43782.1 SLC39A4 gene_id:55630|Hs108|chr8 ( 622) 460 114.1 4.4e-25
CCDS6424.1 SLC39A4 gene_id:55630|Hs108|chr8 ( 647) 460 114.1 4.5e-25
CCDS8912.2 SLC39A5 gene_id:283375|Hs108|chr12 ( 540) 373 94.2 3.7e-19
CCDS43453.1 SLC39A7 gene_id:7922|Hs108|chr6 ( 469) 305 78.7 1.6e-14
CCDS7934.1 SLC39A13 gene_id:91252|Hs108|chr11 ( 364) 286 74.3 2.6e-13
>>CCDS47823.1 SLC39A14 gene_id:23516|Hs108|chr8 (492 aa)
initn: 3263 init1: 3263 opt: 3263 Z-score: 4026.5 bits: 754.5 E(32554): 5.9e-218
Smith-Waterman score: 3263; 100.0% identity (100.0% similar) in 492 aa overlap (1-492:1-492)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKLLLLHPAFQSCLLLTLLGLWRTTPEAHASSLGAPAISAASFLQDLIHRYGEGDSLTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MKLLLLHPAFQSCLLLTLLGLWRTTPEAHASSLGAPAISAASFLQDLIHRYGEGDSLTLQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QLKALLNHLDVGVGRGNVTQHVQGHRNLSTCFSSGDLFTAHNFSEQSRIGSSELQEFCPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QLKALLNHLDVGVGRGNVTQHVQGHRNLSTCFSSGDLFTAHNFSEQSRIGSSELQEFCPT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ILQQLDSRACTSENQENEENEQTEEGRPSAVEVWGYGLLCVTVISLCSLLGASVVPFMKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ILQQLDSRACTSENQENEENEQTEEGRPSAVEVWGYGLLCVTVISLCSLLGASVVPFMKK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TFYKRLLLYFIALAIGTLYSNALFQLIPEAFGFNPLEDYYVSKSAVVFGGFYLFFFTEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TFYKRLLLYFIALAIGTLYSNALFQLIPEAFGFNPLEDYYVSKSAVVFGGFYLFFFTEKI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LKILLKQKNEHHHGHSHYASESLPSKKDQEEGVMEKLQNGDLDHMIPQHCSSELDGKAPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LKILLKQKNEHHHGHSHYASESLPSKKDQEEGVMEKLQNGDLDHMIPQHCSSELDGKAPM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VDEKVIVGSLSVQDLQASQSACYWLKGVRYSDIGTLAWMITLSDGLHNFIDGLAIGASFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VDEKVIVGSLSVQDLQASQSACYWLKGVRYSDIGTLAWMITLSDGLHNFIDGLAIGASFT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VSVFQGISTSVAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSIQQALFFNFLSACCCYLGLAFGILAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VSVFQGISTSVAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSIQQALFFNFLSACCCYLGLAFGILAG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SHFSANWIFALAGGMFLYISLADMFPEMNEVCQEDERKGSILIPFIIQNLGLLTGFTIMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SHFSANWIFALAGGMFLYISLADMFPEMNEVCQEDERKGSILIPFIIQNLGLLTGFTIMV
430 440 450 460 470 480
490
pF1KSD VLTMYSGQIQIG
::::::::::::
CCDS47 VLTMYSGQIQIG
490
>>CCDS6030.1 SLC39A14 gene_id:23516|Hs108|chr8 (492 aa)
initn: 3138 init1: 3138 opt: 3138 Z-score: 3872.2 bits: 725.9 E(32554): 2.3e-209
Smith-Waterman score: 3138; 95.9% identity (98.6% similar) in 492 aa overlap (1-492:1-492)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKLLLLHPAFQSCLLLTLLGLWRTTPEAHASSLGAPAISAASFLQDLIHRYGEGDSLTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MKLLLLHPAFQSCLLLTLLGLWRTTPEAHASSLGAPAISAASFLQDLIHRYGEGDSLTLQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QLKALLNHLDVGVGRGNVTQHVQGHRNLSTCFSSGDLFTAHNFSEQSRIGSSELQEFCPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QLKALLNHLDVGVGRGNVTQHVQGHRNLSTCFSSGDLFTAHNFSEQSRIGSSELQEFCPT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ILQQLDSRACTSENQENEENEQTEEGRPSAVEVWGYGLLCVTVISLCSLLGASVVPFMKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.: :..:.: ::::. :.: .:
CCDS60 ILQQLDSRACTSENQENEENEQTEEGRPSAVEVWGFGFLSVSLINLASLLGVLVLPCTEK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TFYKRLLLYFIALAIGTLYSNALFQLIPEAFGFNPLEDYYVSKSAVVFGGFYLFFFTEKI
.:..:.: :::::.:::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AFFSRVLTYFIALSIGTLLSNALFQLIPEAFGFNPLEDYYVSKSAVVFGGFYLFFFTEKI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LKILLKQKNEHHHGHSHYASESLPSKKDQEEGVMEKLQNGDLDHMIPQHCSSELDGKAPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LKILLKQKNEHHHGHSHYASESLPSKKDQEEGVMEKLQNGDLDHMIPQHCSSELDGKAPM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VDEKVIVGSLSVQDLQASQSACYWLKGVRYSDIGTLAWMITLSDGLHNFIDGLAIGASFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VDEKVIVGSLSVQDLQASQSACYWLKGVRYSDIGTLAWMITLSDGLHNFIDGLAIGASFT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VSVFQGISTSVAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSIQQALFFNFLSACCCYLGLAFGILAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VSVFQGISTSVAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSIQQALFFNFLSACCCYLGLAFGILAG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SHFSANWIFALAGGMFLYISLADMFPEMNEVCQEDERKGSILIPFIIQNLGLLTGFTIMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SHFSANWIFALAGGMFLYISLADMFPEMNEVCQEDERKGSILIPFIIQNLGLLTGFTIMV
430 440 450 460 470 480
490
pF1KSD VLTMYSGQIQIG
::::::::::::
CCDS60 VLTMYSGQIQIG
490
>>CCDS47822.1 SLC39A14 gene_id:23516|Hs108|chr8 (481 aa)
initn: 2950 init1: 2950 opt: 2952 Z-score: 3642.7 bits: 683.4 E(32554): 1.4e-196
Smith-Waterman score: 2952; 98.7% identity (99.1% similar) in 453 aa overlap (1-453:1-452)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKLLLLHPAFQSCLLLTLLGLWRTTPEAHASSLGAPAISAASFLQDLIHRYGEGDSLTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MKLLLLHPAFQSCLLLTLLGLWRTTPEAHASSLGAPAISAASFLQDLIHRYGEGDSLTLQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QLKALLNHLDVGVGRGNVTQHVQGHRNLSTCFSSGDLFTAHNFSEQSRIGSSELQEFCPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QLKALLNHLDVGVGRGNVTQHVQGHRNLSTCFSSGDLFTAHNFSEQSRIGSSELQEFCPT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ILQQLDSRACTSENQENEENEQTEEGRPSAVEVWGYGLLCVTVISLCSLLGASVVPFMKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ILQQLDSRACTSENQENEENEQTEEGRPSAVEVWGYGLLCVTVISLCSLLGASVVPFMKK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TFYKRLLLYFIALAIGTLYSNALFQLIPEAFGFNPLEDYYVSKSAVVFGGFYLFFFTEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TFYKRLLLYFIALAIGTLYSNALFQLIPEAFGFNPLEDYYVSKSAVVFGGFYLFFFTEKI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LKILLKQKNEHHHGHSHYASESLPSKKDQEEGVMEKLQNGDLDHMIPQHCSSELDGKAPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LKILLKQKNEHHHGHSHYASESLPSKKDQEEGVMEKLQNGDLDHMIPQHCSSELDGKAPM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VDEKVIVGSLSVQDLQASQSACYWLKGVRYSDIGTLAWMITLSDGLHNFIDGLAIGASFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VDEKVIVGSLSVQDLQASQSACYWLKGVRYSDIGTLAWMITLSDGLHNFIDGLAIGASFT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VSVFQGISTSVAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSIQQALFFNFLSACCCYLGLAFGILAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VSVFQGISTSVAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSIQQALFFNFLSACCCYLGLAFGILAG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SHFSANWIFALAGGMFLYISLADMFPEMNEVCQEDERKGSILIPFIIQNLGLLTGFTIMV
::::::::::::::::::::::::. :. : :
CCDS47 SHFSANWIFALAGGMFLYISLADMM-EFCSVAQAGVQWCHLSSLQPLPLGLKRLSCLSLP
430 440 450 460 470
490
pF1KSD VLTMYSGQIQIG
CCDS47 SN
480
>>CCDS3656.1 SLC39A8 gene_id:64116|Hs108|chr4 (460 aa)
initn: 1386 init1: 711 opt: 1265 Z-score: 1559.9 bits: 298.0 E(32554): 1.5e-80
Smith-Waterman score: 1417; 49.4% identity (77.0% similar) in 466 aa overlap (30-491:15-459)
10 20 30 40 50
pF1KSD MKLLLLHPAFQSCLLLTLLGLWRTTPEAHASSLGAPAISAA-SFLQDLIHRYGEGDSLTL
:..::. : . . .: .:.. .: . ::.
CCDS36 MAPGRAVAGLLLLAAAGLGGVAEGPGLAFSEDVLSVFGANLSLSA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD QQLKALLNHLDVGVGRGNVTQHVQGHRNLSTCFSSGDLFTAHNFSEQSRIGSSELQEFCP
::. ::... .. .: .: . : : : :... ..:. :.::. ..: ::... .::
CCDS36 AQLQHLLEQMGAA-SRVGVPEPGQLHFN--QCLTAEEIFSLHGFSNATQITSSKFSVICP
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD TILQQLDSRACTSENQENEENEQTEEGRPSAVEVWGYGLLCVTVISLCSLLGASVVPFMK
..::::. . : :.. .. ::: ::::::.: ::.:.: :::: ..:..:
CCDS36 AVLQQLNFHPC--------EDRPKHKTRPSHSEVWGYGFLSVTIINLASLLGLILTPLIK
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KTFYKRLLLYFIALAIGTLYSNALFQLIPEAFGFNPLEDYYVSKSAVVFGGFYLFFFTEK
:... ..: .:..::::::.:::.::::::::::.: : :: :...:::::::.:: :.
CCDS36 KSYFPKILTFFVGLAIGTLFSNAIFQLIPEAFGFDPKVDSYVEKAVAVFGGFYLLFFFER
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ILKILLKQKNEHHHGHSHYASESL-PSKKDQEEGVMEKLQNGDLDHMIPQHCSSELDGKA
.::.::: .. .::.:...... :..: .. .. . :: . : .: .:.
CCDS36 MLKMLLKTYGQ--NGHTHFGNDNFGPQEKTHQPKALPAI-NGVTCYANPA--VTEANGHI
220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PMVDEKVIVGSLSVQDLQASQSACYWLKGVRYSDIGTLAWMITLSDGLHNFIDGLAIGAS
. . .:. :.:: . :.: ::: . :.:::.:::::: :.:::::::::::::
CCDS36 HFDNVSVV----SLQDGKKEPSSCTCLKGPKLSEIGTIAWMITLCDALHNFIDGLAIGAS
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KSD FTVSVFQGISTSVAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSIQQALFFNFLSACCCYLGLAFGIL
:.:..::.:::.::::::::::::::::::::::: .:::.::::::: ::.:::::::
CCDS36 CTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSTRQALLFNFLSACSCYVGLAFGIL
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KSD AGSHFSANWIFALAGGMFLYISLADMFPEMNEVCQEDE--RKGSILIPFIIQNLGLLTGF
.:..:. : ::::::::::::::::::::::.. .: :: .. . :.::: :.::::
CCDS36 VGNNFAPNIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLREKVTGRKTDFTF-FMIQNAGMLTGF
390 400 410 420 430 440
480 490
pF1KSD TIMVVLTMYSGQIQIG
: ....:.:.:.:..
CCDS36 TAILLITLYAGEIELE
450 460
>>CCDS47117.1 SLC39A8 gene_id:64116|Hs108|chr4 (444 aa)
initn: 1300 init1: 711 opt: 1175 Z-score: 1449.0 bits: 277.4 E(32554): 2.2e-74
Smith-Waterman score: 1327; 50.1% identity (77.0% similar) in 427 aa overlap (30-454:15-421)
10 20 30 40 50
pF1KSD MKLLLLHPAFQSCLLLTLLGLWRTTPEAHASSLGAPAISAA-SFLQDLIHRYGEGDSLTL
:..::. : . . .: .:.. .: . ::.
CCDS47 MAPGRAVAGLLLLAAAGLGGVAEGPGLAFSEDVLSVFGANLSLSA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD QQLKALLNHLDVGVGRGNVTQHVQGHRNLSTCFSSGDLFTAHNFSEQSRIGSSELQEFCP
::. ::... .. .: .: . : : : :... ..:. :.::. ..: ::... .::
CCDS47 AQLQHLLEQMGAA-SRVGVPEPGQLHFN--QCLTAEEIFSLHGFSNATQITSSKFSVICP
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD TILQQLDSRACTSENQENEENEQTEEGRPSAVEVWGYGLLCVTVISLCSLLGASVVPFMK
..::::. . : :.. .. ::: ::::::.: ::.:.: :::: ..:..:
CCDS47 AVLQQLNFHPC--------EDRPKHKTRPSHSEVWGYGFLSVTIINLASLLGLILTPLIK
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KTFYKRLLLYFIALAIGTLYSNALFQLIPEAFGFNPLEDYYVSKSAVVFGGFYLFFFTEK
:... ..: .:..::::::.:::.::::::::::.: : :: :...:::::::.:: :.
CCDS47 KSYFPKILTFFVGLAIGTLFSNAIFQLIPEAFGFDPKVDSYVEKAVAVFGGFYLLFFFER
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ILKILLKQKNEHHHGHSHYASESL-PSKKDQEEGVMEKLQNGDLDHMIPQHCSSELDGKA
.::.::: .. .::.:...... :..: .. .. . :: . : .: .:.
CCDS47 MLKMLLKTYGQ--NGHTHFGNDNFGPQEKTHQPKALPAI-NGVTCYANPA--VTEANGHI
220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PMVDEKVIVGSLSVQDLQASQSACYWLKGVRYSDIGTLAWMITLSDGLHNFIDGLAIGAS
. . .:. :.:: . :.: ::: . :.:::.:::::: :.:::::::::::::
CCDS47 HFDNVSVV----SLQDGKKEPSSCTCLKGPKLSEIGTIAWMITLCDALHNFIDGLAIGAS
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KSD FTVSVFQGISTSVAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSIQQALFFNFLSACCCYLGLAFGIL
:.:..::.:::.::::::::::::::::::::::: .:::.::::::: ::.:::::::
CCDS47 CTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSTRQALLFNFLSACSCYVGLAFGIL
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KSD AGSHFSANWIFALAGGMFLYISLADMFPEMNEVCQEDERKGSILIPFIIQNLGLLTGFTI
.:..:. : ::::::::::::::::::::::.. .:
CCDS47 VGNNFAPNIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLREKIIKWATDDIKSQLHLLWIYTAR
390 400 410 420 430 440
480 490
pF1KSD MVVLTMYSGQIQIG
>>CCDS33353.1 SLC39A10 gene_id:57181|Hs108|chr2 (831 aa)
initn: 793 init1: 334 opt: 563 Z-score: 689.0 bits: 137.7 E(32554): 4.6e-32
Smith-Waterman score: 736; 31.2% identity (61.7% similar) in 491 aa overlap (91-489:337-825)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QLKALLNHLDVGVGRGNVTQHVQGHRNLSTCFSSGDLFTAHNFSEQSRIGSSELQEFCPT
:.. .:. .. . .: :... . .::.
CCDS33 HTRKREAPHVKNNAIISLRKDLNEDDHHHECLNVTQLLKYYGHGANSPISTDLFTYLCPA
310 320 330 340 350 360
130 140 150 160 170
pF1KSD ILQQLDSRACTS-------ENQENEENEQTEEGRPSAVEVWGYGLLCVTVISLCSLLGAS
.: :.::: : :. ....: :. .. .: :.. .::::: ::::.
CCDS33 LLYQIDSRLCIEHFDKLLVEDINKDKNLVPEDEANIGASAWICGIISITVISLLSLLGVI
370 380 390 400 410 420
180 190 200 210
pF1KSD VVPFMKKTFYKRLLLYFIALAIGTLYSNALFQLIPEAFGFNP------------------
.::.... .: :: ...:::.::. ..::..:.:.. : .
CCDS33 LVPIINQGCFKFLLTFLVALAVGTMSGDALLHLLPHSQGGHDHSHQHAHGHGHSHGHESN
430 440 450 460 470 480
220 230 240 250
pF1KSD --LEDY-YVSKSAVVFGGFYLFFFTEKILKIL-------------LKQKNEHHHGHSHYA
::.: : :. :..::.::.:. :. .... .::..:. . .
CCDS33 KFLEEYDAVLKGLVALGGIYLLFIIEHCIRMFKHYKQQRGKQKWFMKQNTEESTIGRKLS
490 500 510 520 530 540
260 270 280 290 300
pF1KSD SESLPSKKDQEEGVMEKLQNGDLDHMIPQHCSSE-----LDGK--AP------MVDEKVI
...: . :.. .. : . : : .. . .: :.:. .: . .::.:
CCDS33 DHKLNNTPDSDWLQLKPLAGTD-DSVVSEDRLNETELTDLEGQQESPPKNYLCIEEEKII
550 560 570 580 590 600
310 320 330
pF1KSD -------VGSLSVQDLQA---------------------------SQSACYWLKGVRYSD
. .. .::.: :.. :. . .. .
CCDS33 DHSHSDGLHTIHEHDLHAAAHNHHGENKTVLRKHNHQWHHKHSHHSHGPCHSGSDLKETG
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pF1KSD IGTLAWMITLSDGLHNFIDGLAIGASFTVSVFQGISTSVAILCEEFPHELGDFVILLNAG
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CCDS33 IANIAWMVIMGDGIHNFSDGLAIGAAFSAGLTGGISTSIAVFCHELPHELGDFAVLLKAG
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pF1KSD MSIQQALFFNFLSACCCYLGLAFGILAGSHFSAN---WIFALAGGMFLYISLADMFPEMN
:...::. .:.::: :.:. .: .: ... : ::::...:::::..:.::.:::
CCDS33 MTVKQAIVYNLLSAMMAYIGMLIGTAVG-QYANNITLWIFAVTAGMFLYVALVDMLPEML
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pF1KSD EVCQEDERKGSILI-PFIIQNLGLLTGFTIMVVLTMYSGQIQIG
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CCDS33 HGDGDNEEHGFCPVGQFILQNLGLLFGFAIMLVIALYEDKIVFDIQF
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..: . ::... :.:.:... : ....:.
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CCDS42 NYLCPAIINQIDARSCLIHT--SEKKAEIPPKTYSLQIAWVGGFIAISIISFLSLLGVIL
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CCDS42 VPLMNRVFFKFLLSFLVALAVGTLSGDAFLHLLPHSHASHHHSHSHEEPAMEMKRGPLFS
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: . . .:: ...::.:..:..:..: .. . :......... ...
CCDS42 HLSSQNIEESAYFDSTWKGLTALGGLYFMFLVEHVLTLIKQFKDKKKKNQKKPENDDDVE
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: . ..: ::... : : . :.: .:.. : : .:.:...
CCDS42 IKKQLSKYESQLSTNEEKVDTDDRTEGYLRADSQEPSH----FDSQQPAVLEEEEVMIAH
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:.. .. .. :. .. :
CCDS42 AHPQEVYNEYVPRGCKNKCHSHFHDTLGQSDDLIHHHHDYHHILHHHHHQNHHPHSHSQR
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:: : : :::::. ..:::::: :::::::.:: .. .:.:::::..:.:.::::
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CCDS42 GDFAVLLKAGMTVKQAVLYNALSAMLAYLGMATGIFIG-HYAENVSMWIFALTAGLFMYV
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.:.:: ::: :.. .. . . :..:: :.: :: ::...... .:
CCDS42 ALVDMVPEMLHNDASDHGCSRWGY---FFLQNAGMLLGFGIMLLISIFEHKIVFRINF
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. .: .. :.: : .. . . .. ::. : . :. :: ::
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pF1KSD ILIPFIIQNLGLLTGFTIMVVLTMYSGQIQIG
. :..::.::. :. ...:..: .:.:
CCDS60 M---FLLQNFGLILGWLSLLLLAIYEQNIKI
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CCDS44 M---FLLQNFGLILGWLSLLLLAIYEQNIKI
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230 240 250 260 270 280
pF1KSD GGFYLFFFTEKILKILLKQKNEH-------HHGHSHYASESLPSKKDQEEGVMEKLQNGD
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CCDS60 GGIHGFFLIEKCF-ILLVSPNDKGLSLVNGHVGHSHHLA--LNSELSDQAG------RG-
460 470 480 490 500
290 300 310 320 330 340
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CCDS60 -------KSASTIQLKSP---EDSQAAEMPIGSMTASNRKC--------KAISLLAIMIL
510 520 530 540
350 360 370 380 390 400
pF1KSD LSDGLHNFIDGLAIGASFTVSVFQGISTSVAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSIQQALFF
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CCDS60 VGDSLHNFADGLAIGAAFSSSSESGVTTTIAILCHEIPHEMGDFAVLLSSGLSMKTAILM
550 560 570 580 590 600
410 420 430 440 450 460
pF1KSD NFLSACCCYLGLAFGI-LAGSHFSANWIFALAGGMFLYISLADMFPEMNEVCQEDERKGS
::.:. ..:: .:. .... .:::....:::::.::..:.:::..: . .:
CCDS60 NFISSLTAFMGLYIGLSVSADPCVQDWIFTVTAGMFLYLSLVEMLPEMTHV--QTQRPWM
610 620 630 640 650 660
470 480 490
pF1KSD ILIPFIIQNLGLLTGFTIMVVLTMYSGQIQIG
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CCDS60 M---FLLQNFGLILGWLSLLLLAIYEQNIKI
670 680 690
492 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 23:40:35 2016 done: Wed Nov 2 23:40:35 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]