Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0067
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0067, 1291 aa
1>>>pF1KSDA0067 1291 - 1291 aa - 1291 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2866+/-0.0011; mu= -2.8220+/- 0.067
mean_var=332.0561+/-67.168, 0's: 0 Z-trim(113.5): 24 B-trim: 587 in 1/55
Lambda= 0.070383
statistics sampled from 14128 (14148) to 14128 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.737), E-opt: 0.2 (0.435), width: 16
Scan time: 4.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44217.1 SETDB1 gene_id:9869|Hs108|chr1 (1291) 8782 906.5 0
CCDS972.1 SETDB1 gene_id:9869|Hs108|chr1 (1290) 8763 904.6 0
CCDS58026.1 SETDB1 gene_id:9869|Hs108|chr1 ( 397) 2495 267.8 4.1e-71
CCDS53868.1 SETDB2 gene_id:83852|Hs108|chr13 ( 707) 857 101.6 7.6e-21
CCDS9417.1 SETDB2 gene_id:83852|Hs108|chr13 ( 719) 857 101.6 7.7e-21
>>CCDS44217.1 SETDB1 gene_id:9869|Hs108|chr1 (1291 aa)
initn: 8782 init1: 8782 opt: 8782 Z-score: 4833.0 bits: 906.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8782; 100.0% identity (100.0% similar) in 1291 aa overlap (1-1291:1-1291)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSLPGCIGLDAATATVESEEIAELQQAVVEELGISMEELRHFIDEELEKMDCVQQRKKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MSSLPGCIGLDAATATVESEEIAELQQAVVEELGISMEELRHFIDEELEKMDCVQQRKKQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LAELETWVIQKESEVAHVDQLFDDASRAVTNCESLVKDFYSKLGLQYRDSSSEDESSRPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LAELETWVIQKESEVAHVDQLFDDASRAVTNCESLVKDFYSKLGLQYRDSSSEDESSRPT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EIIEIPDEDDDVLSIDSGDAGSRTPKDQKLREAMAALRKSAQDVQKFMDAVNKKSSSQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EIIEIPDEDDDVLSIDSGDAGSRTPKDQKLREAMAALRKSAQDVQKFMDAVNKKSSSQDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD HKGTLSQMSGELSKDGDLIVSMRILGKKRTKTWHKGTLIAIQTVGPGKKYKVKFDNKGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HKGTLSQMSGELSKDGDLIVSMRILGKKRTKTWHKGTLIAIQTVGPGKKYKVKFDNKGKS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LLSGNHIAYDYHPPADKLYVGSRVVAKYKDGNQVWLYAGIVAETPNVKNKLRFLIFFDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LLSGNHIAYDYHPPADKLYVGSRVVAKYKDGNQVWLYAGIVAETPNVKNKLRFLIFFDDG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YASYVTQSELYPICRPLKKTWEDIEDISCRDFIEEYVTAYPNRPMVLLKSGQLIKTEWEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YASYVTQSELYPICRPLKKTWEDIEDISCRDFIEEYVTAYPNRPMVLLKSGQLIKTEWEG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TWWKSRVEEVDGSLVRILFLDDKRCEWIYRGSTRLEPMFSMKTSSASALEKKQGQLRTRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TWWKSRVEEVDGSLVRILFLDDKRCEWIYRGSTRLEPMFSMKTSSASALEKKQGQLRTRP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD NMGAVRSKGPVVQYTQDLTGTGTQFKPVEPPQPTAPPAPPFPPAPPLSPQAGDSDLESQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NMGAVRSKGPVVQYTQDLTGTGTQFKPVEPPQPTAPPAPPFPPAPPLSPQAGDSDLESQL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD AQSRKQVAKKSTSFRPGSVGSGHSSPTSPALSENVSGGKPGINQTYRSPLGSTASAPAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AQSRKQVAKKSTSFRPGSVGSGHSSPTSPALSENVSGGKPGINQTYRSPLGSTASAPAPS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ALPAPPAPPVFHGMLERAPAEPSYRAPMEKLFYLPHVCSYTCLSRVRPMRNEQYRGKNPL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LVPLLYDFRRMTARRRVNRKMGFHVIYKTPCGLCLRTMQEIERYLFETGCDFLFLEMFCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LVPLLYDFRRMTARRRVNRKMGFHVIYKTPCGLCLRTMQEIERYLFETGCDFLFLEMFCL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD DPYVLVDRKFQPYKPFYYILDITYGKEDVPLSCVNEIDTTPPPQVAYSKERIPGKGVFIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DPYVLVDRKFQPYKPFYYILDITYGKEDVPLSCVNEIDTTPPPQVAYSKERIPGKGVFIN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD TGPEFLVGCDCKDGCRDKSKCACHQLTIQATACTPGGQINPNSGYQYKRLEECLPTGVYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TGPEFLVGCDCKDGCRDKSKCACHQLTIQATACTPGGQINPNSGYQYKRLEECLPTGVYE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD CNKRCKCDPNMCTNRLVQHGLQVRLQLFKTQNKGWGIRCLDDIAKGSFVCIYAGKILTDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CNKRCKCDPNMCTNRLVQHGLQVRLQLFKTQNKGWGIRCLDDIAKGSFVCIYAGKILTDD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD FADKEGLEMGDEYFANLDHIESVENFKEGYESDAPCSSDSSGVDLKDQEDGNSGTEDPEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FADKEGLEMGDEYFANLDHIESVENFKEGYESDAPCSSDSSGVDLKDQEDGNSGTEDPEE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD SNDDSSDDNFCKDEDFSTSSVWRSYATRRQTRGQKENGLSETTSKDSHPPDLGPPHIPVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SNDDSSDDNFCKDEDFSTSSVWRSYATRRQTRGQKENGLSETTSKDSHPPDLGPPHIPVP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD PSIPVGGCNPPSSEETPKNKVASWLSCNSVSEGGFADSDSHSSFKTNEGGEGRAGGSRME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PSIPVGGCNPPSSEETPKNKVASWLSCNSVSEGGFADSDSHSSFKTNEGGEGRAGGSRME
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD AEKASTSGLGIKDEGDIKQAKKEDTDDRNKMSVVTESSRNYGYNPSPVKPEGLRRPPSKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AEKASTSGLGIKDEGDIKQAKKEDTDDRNKMSVVTESSRNYGYNPSPVKPEGLRRPPSKT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SMHQSRRLMASAQSNPDDVLTLSSSTESEGESGTSRKPTAGQTSATAVDSDDIQTISSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SMHQSRRLMASAQSNPDDVLTLSSSTESEGESGTSRKPTAGQTSATAVDSDDIQTISSGS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD EGDDFEDKKNMTGPMKRQVAVKSTRGFALKSTHGIAIKSTNMASVDKGESAPVRKNTRQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EGDDFEDKKNMTGPMKRQVAVKSTRGFALKSTHGIAIKSTNMASVDKGESAPVRKNTRQF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD YDGEESCYIIDAKLEGNLGRYLNHSCSPNLFVQNVFVDTHDLRFPWVAFFASKRIRAGTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YDGEESCYIIDAKLEGNLGRYLNHSCSPNLFVQNVFVDTHDLRFPWVAFFASKRIRAGTE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290
pF1KSD LTWDYNYEVGSVEGKELLCCCGAIECRGRLL
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LTWDYNYEVGSVEGKELLCCCGAIECRGRLL
1270 1280 1290
>>CCDS972.1 SETDB1 gene_id:9869|Hs108|chr1 (1290 aa)
initn: 8510 init1: 8510 opt: 8763 Z-score: 4822.6 bits: 904.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8763; 99.9% identity (99.9% similar) in 1291 aa overlap (1-1291:1-1290)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSLPGCIGLDAATATVESEEIAELQQAVVEELGISMEELRHFIDEELEKMDCVQQRKKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MSSLPGCIGLDAATATVESEEIAELQQAVVEELGISMEELRHFIDEELEKMDCVQQRKKQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LAELETWVIQKESEVAHVDQLFDDASRAVTNCESLVKDFYSKLGLQYRDSSSEDESSRPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LAELETWVIQKESEVAHVDQLFDDASRAVTNCESLVKDFYSKLGLQYRDSSSEDESSRPT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EIIEIPDEDDDVLSIDSGDAGSRTPKDQKLREAMAALRKSAQDVQKFMDAVNKKSSSQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EIIEIPDEDDDVLSIDSGDAGSRTPKDQKLREAMAALRKSAQDVQKFMDAVNKKSSSQDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD HKGTLSQMSGELSKDGDLIVSMRILGKKRTKTWHKGTLIAIQTVGPGKKYKVKFDNKGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 HKGTLSQMSGELSKDGDLIVSMRILGKKRTKTWHKGTLIAIQTVGPGKKYKVKFDNKGKS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LLSGNHIAYDYHPPADKLYVGSRVVAKYKDGNQVWLYAGIVAETPNVKNKLRFLIFFDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LLSGNHIAYDYHPPADKLYVGSRVVAKYKDGNQVWLYAGIVAETPNVKNKLRFLIFFDDG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YASYVTQSELYPICRPLKKTWEDIEDISCRDFIEEYVTAYPNRPMVLLKSGQLIKTEWEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 YASYVTQSELYPICRPLKKTWEDIEDISCRDFIEEYVTAYPNRPMVLLKSGQLIKTEWEG
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370 380 390 400 410 420
pF1KSD TWWKSRVEEVDGSLVRILFLDDKRCEWIYRGSTRLEPMFSMKTSSASALEKKQGQLRTRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 TWWKSRVEEVDGSLVRILFLDDKRCEWIYRGSTRLEPMFSMKTSSASALEKKQGQLRTRP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD NMGAVRSKGPVVQYTQDLTGTGTQFKPVEPPQPTAPPAPPFPPAPPLSPQAGDSDLESQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 NMGAVRSKGPVVQYTQDLTGTGTQFKPVEPPQPTAPPAPPFPPAPPLSPQAGDSDLESQL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 AQSRKQVAKKSTSFRPGSVGSGHSSPTSPALSENVSGGKPGINQTYRSPLGSTASAPAPS
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pF1KSD ALPAPPAPPVFHGMLERAPAEPSYRAPMEKLFYLPHVCSYTCLSRVRPMRNEQYRGKNPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 ALPAPPAPPVFHGMLERAPAEPSYRAPMEKLFYLPHVCSYTCLSRVRPMRNEQYRGKNPL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LVPLLYDFRRMTARRRVNRKMGFHVIYKTPCGLCLRTMQEIERYLFETGCDFLFLEMFCL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DPYVLVDRKFQPYKPFYYILDITYGKEDVPLSCVNEIDTTPPPQVAYSKERIPGKGVFIN
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pF1KSD TGPEFLVGCDCKDGCRDKSKCACHQLTIQATACTPGGQINPNSGYQYKRLEECLPTGVYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 TGPEFLVGCDCKDGCRDKSKCACHQLTIQATACTPGGQINPNSGYQYKRLEECLPTGVYE
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790 800 810 820 830 840
pF1KSD CNKRCKCDPNMCTNRLVQHGLQVRLQLFKTQNKGWGIRCLDDIAKGSFVCIYAGKILTDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 CNKRCKCDPNMCTNRLVQHGLQVRLQLFKTQNKGWGIRCLDDIAKGSFVCIYAGKILTDD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD FADKEGLEMGDEYFANLDHIESVENFKEGYESDAPCSSDSSGVDLKDQEDGNSGTEDPEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 FADKEGLEMGDEYFANLDHIESVENFKEGYESDAPCSSDSSGVDLKDQEDGNSGTEDPEE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD SNDDSSDDNFCKDEDFSTSSVWRSYATRRQTRGQKENGLSETTSKDSHPPDLGPPHIPVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SNDDSSDDNFCKDEDFSTSSVWRSYATRRQTRGQKENGLSETTSKDSHPPDLGPPHIPVP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD PSIPVGGCNPPSSEETPKNKVASWLSCNSVSEGGFADSDSHSSFKTNEGGEGRAGGSRME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 PSIPVGGCNPPSSEETPKNKVASWLSCNSVSEGGFADSDSHSSFKTNEGGEGRAGGSRME
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD AEKASTSGLGIKDEGDIKQAKKEDTDDRNKMSVVTESSRNYGYNPSPVKPEGLRRPPSKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 AEKASTSGLGIKDEGDIKQAKKEDTDDRNKMSVVTESSRNYGYNPSPVKPEGLRRPPSKT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SMHQSRRLMASAQSNPDDVLTLSSSTESEGESGTSRKPTAGQTSATAVDSDDIQTISSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SMHQSRRLMASAQSNPDDVLTLSSSTESEGESGTSRKPTAGQTSATAVDSDDIQTISSGS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD EGDDFEDKKNMTGPMKRQVAVKSTRGFALKSTHGIAIKSTNMASVDKGESAPVRKNTRQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EGDDFEDKKNMTGPMKRQVAVKSTRGFALKSTHGIAIKSTNMASVDKGESAPVRKNTRQF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD YDGEESCYIIDAKLEGNLGRYLNHSCSPNLFVQNVFVDTHDLRFPWVAFFASKRIRAGTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS97 YDGEESCYIIDAKLEGNLGRYLNHSCSPNLFVQNVFVDTHDLRFPWVAFFASK-IRAGTE
1210 1220 1230 1240 1250
1270 1280 1290
pF1KSD LTWDYNYEVGSVEGKELLCCCGAIECRGRLL
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LTWDYNYEVGSVEGKELLCCCGAIECRGRLL
1260 1270 1280 1290
>>CCDS58026.1 SETDB1 gene_id:9869|Hs108|chr1 (397 aa)
initn: 2495 init1: 2495 opt: 2495 Z-score: 1390.2 bits: 267.8 E(32554): 4.1e-71
Smith-Waterman score: 2495; 100.0% identity (100.0% similar) in 380 aa overlap (1-380:1-380)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSLPGCIGLDAATATVESEEIAELQQAVVEELGISMEELRHFIDEELEKMDCVQQRKKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSSLPGCIGLDAATATVESEEIAELQQAVVEELGISMEELRHFIDEELEKMDCVQQRKKQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LAELETWVIQKESEVAHVDQLFDDASRAVTNCESLVKDFYSKLGLQYRDSSSEDESSRPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LAELETWVIQKESEVAHVDQLFDDASRAVTNCESLVKDFYSKLGLQYRDSSSEDESSRPT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EIIEIPDEDDDVLSIDSGDAGSRTPKDQKLREAMAALRKSAQDVQKFMDAVNKKSSSQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EIIEIPDEDDDVLSIDSGDAGSRTPKDQKLREAMAALRKSAQDVQKFMDAVNKKSSSQDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD HKGTLSQMSGELSKDGDLIVSMRILGKKRTKTWHKGTLIAIQTVGPGKKYKVKFDNKGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HKGTLSQMSGELSKDGDLIVSMRILGKKRTKTWHKGTLIAIQTVGPGKKYKVKFDNKGKS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LLSGNHIAYDYHPPADKLYVGSRVVAKYKDGNQVWLYAGIVAETPNVKNKLRFLIFFDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLSGNHIAYDYHPPADKLYVGSRVVAKYKDGNQVWLYAGIVAETPNVKNKLRFLIFFDDG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YASYVTQSELYPICRPLKKTWEDIEDISCRDFIEEYVTAYPNRPMVLLKSGQLIKTEWEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YASYVTQSELYPICRPLKKTWEDIEDISCRDFIEEYVTAYPNRPMVLLKSGQLIKTEWEG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TWWKSRVEEVDGSLVRILFLDDKRCEWIYRGSTRLEPMFSMKTSSASALEKKQGQLRTRP
::::::::::::::::::::
CCDS58 TWWKSRVEEVDGSLVRILFLVLFFSTILEAEVGGGGT
370 380 390
>>CCDS53868.1 SETDB2 gene_id:83852|Hs108|chr13 (707 aa)
initn: 1181 init1: 764 opt: 857 Z-score: 487.7 bits: 101.6 E(32554): 7.6e-21
Smith-Waterman score: 1038; 31.4% identity (55.3% similar) in 722 aa overlap (571-1291:128-707)
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ALPAPPAPPVFHGMLERAPAEPSYRAPMEKLFYLPHVCSYTCLSRVRPMRNEQYRGKNPL
: : : :: .:: .. :. . .:.:::
CCDS53 DCTFLTTENKEILSLEDKVVDFREKDSSSNLSYQSHDCSGACLMKM-PL---NLKGENPL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]