Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0098
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0098, 541 aa
1>>>pF1KSDA0098 541 - 541 aa - 541 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6988+/-0.00117; mu= 16.7102+/- 0.070
mean_var=71.4342+/-14.771, 0's: 0 Z-trim(101.8): 37 B-trim: 97 in 2/47
Lambda= 0.151747
statistics sampled from 6620 (6652) to 6620 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.56), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16
Scan time: 2.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3877.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 541) 3482 772.1 0
CCDS82988.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 520) 3256 722.6 2.8e-208
CCDS77996.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 503) 3236 718.2 5.6e-207
CCDS82990.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 448) 2785 619.4 2.7e-177
CCDS82989.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 486) 2785 619.5 2.9e-177
CCDS33206.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 539) 1177 267.4 2.9e-71
CCDS1140.2 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 545) 1046 238.8 1.3e-62
CCDS58711.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 509) 957 219.3 8.8e-57
CCDS8991.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 535) 938 215.1 1.6e-55
CCDS46336.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 543) 895 205.7 1.1e-52
CCDS30888.1 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 507) 892 205.0 1.7e-52
CCDS55843.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 488) 884 203.3 5.5e-52
CCDS5523.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 531) 858 197.6 3.1e-50
CCDS32617.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 530) 852 196.3 7.6e-50
CCDS5269.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 556) 842 194.1 3.6e-49
CCDS68181.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 529) 835 192.6 1e-48
CCDS33528.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 548) 835 192.6 1e-48
CCDS54367.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 499) 806 186.2 7.7e-47
CCDS68180.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 475) 693 161.5 2.1e-39
CCDS54366.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 456) 638 149.4 8.4e-36
CCDS54105.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 485) 617 144.8 2.2e-34
CCDS34640.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 486) 612 143.7 4.6e-34
CCDS43522.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 401) 496 118.3 1.7e-26
CCDS42696.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 339) 465 111.5 1.6e-24
CCDS54106.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 493) 362 89.0 1.4e-17
CCDS13738.1 CCT8L2 gene_id:150160|Hs108|chr22 ( 557) 359 88.4 2.4e-17
>>CCDS3877.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (541 aa)
initn: 3482 init1: 3482 opt: 3482 Z-score: 4120.0 bits: 772.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3482; 100.0% identity (100.0% similar) in 541 aa overlap (1-541:1-541)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 MASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 MVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 EQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CHRQMAEIAVNAVLTVADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 CHRQMAEIAVNAVLTVADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 KKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 ICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 EISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 GGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRAR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 QVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESE
490 500 510 520 530 540
pF1KSD E
:
CCDS38 E
>>CCDS82988.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (520 aa)
initn: 3256 init1: 3256 opt: 3256 Z-score: 3852.8 bits: 722.6 E(32554): 2.8e-208
Smith-Waterman score: 3256; 100.0% identity (100.0% similar) in 506 aa overlap (36-541:15-520)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD TLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MNSSLGPTIEKLSVSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKD
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLD
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AEIAVNAVLTVADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AEIAVNAVLTVADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVED
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWG
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQEISFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQEISFG
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAA
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQVKEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQVKEM
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE
470 480 490 500 510 520
>>CCDS77996.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (503 aa)
initn: 3236 init1: 3236 opt: 3236 Z-score: 3829.4 bits: 718.2 E(32554): 5.6e-207
Smith-Waterman score: 3236; 100.0% identity (100.0% similar) in 503 aa overlap (39-541:1-503)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD FDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMAEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMAEI
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AVNAVLTVADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AVNAVLTVADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKI
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWGFDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWGFDD
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQEISFGTTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQEISFGTTK
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEIS
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD CALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQVKEMNPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 CALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQVKEMNPA
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE
460 470 480 490 500
>>CCDS82990.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (448 aa)
initn: 2782 init1: 2782 opt: 2785 Z-score: 3296.6 bits: 619.4 E(32554): 2.7e-177
Smith-Waterman score: 2785; 99.1% identity (99.3% similar) in 436 aa overlap (106-541:13-448)
80 90 100 110 120 130
pF1KSD TILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIAD
. : :::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MAAKAVANTMRTSLGPNVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIAD
10 20 30 40
140 150 160 170 180 190
pF1KSD GYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMAEIAVNAVLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMAEIAVNAVLT
50 60 70 80 90 100
200 210 220 230 240 250
pF1KSD VADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPF
110 120 130 140 150 160
260 270 280 290 300 310
pF1KSD EPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWGFDDEANHLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWGFDDEANHLLL
170 180 190 200 210 220
320 330 340 350 360 370
pF1KSD QNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQEISFGTTKDKMLVIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQEISFGTTKDKMLVIE
230 240 250 260 270 280
380 390 400 410 420 430
pF1KSD QCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQ
290 300 310 320 330 340
440 450 460 470 480 490
pF1KSD EADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQVKEMNPALGIDCLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQVKEMNPALGIDCLH
350 360 370 380 390 400
500 510 520 530 540
pF1KSD KGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE
410 420 430 440
>>CCDS82989.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (486 aa)
initn: 2782 init1: 2782 opt: 2785 Z-score: 3296.0 bits: 619.5 E(32554): 2.9e-177
Smith-Waterman score: 3012; 89.8% identity (89.8% similar) in 541 aa overlap (1-541:1-486)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPN-----
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEA
::::::::::
CCDS82 --------------------------------------------------VLAGALLEEA
60
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNS
70 80 90 100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CHRQMAEIAVNAVLTVADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CHRQMAEIAVNAVLTVADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMP
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLA
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQ
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVY
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRAR
370 380 390 400 410 420
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESE
430 440 450 460 470 480
pF1KSD E
:
CCDS82 E
>>CCDS33206.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 (539 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KSD MASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPN
:. : :: .:.:. ... :.: ::::::...::::::.
CCDS33 MPENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRF-----SNISAAKAVADAIRTSLGPK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD GLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGA
:.:::. : ::::.::::::::..:.: : :...:::::.:: : :::::.::..::.
CCDS33 GMDKMIQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGS
::. .::..:::: :......: . .:: : .: :...: : :...: :.:.:
CCDS33 LLDSCTKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRP--VELSDRETLLNSATTSLNS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
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:::.. .. ..::::. : : .::.. ::. :.:: ..: .:..:... .
CCDS33 KVVSQYSSLLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKE
:. . . :: :::... . :: ... :.. .. . . :. . ....:::.
CCDS33 SNSGITR-VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KSD TGANLAICQWG-----FDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELT
:: :. . : . ..: : :.: . .. ... . .::.: . : . : .....:
CCDS33 TGCNVLLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFT
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD AEKLGFAGLVQEISFGTTKDKMLVIEQCKN-SRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCV
:. :: : :..:.... . :.: : : . ...::: .::.::..::::.::.::::::
CCDS33 ADMLGSAELAEEVNLNGS-GKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCV
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD IRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGM
:: :.. .. :::: :: :: ... . .:.: .::::::.:::: .:.::.:.
CCDS33 IRCLVKKRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGL
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD NPIQTMTEVRARQVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMIL
:::.:.::.: :... . : ::. . : ... .. :.. :. . . ..:::. :: ::
CCDS33 NPISTVTELRNRHAQGEKTA-GINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSIL
480 490 500 510 520 530
530 540
pF1KSD KIDDIRKPGESEE
::::.
CCDS33 KIDDVVNTR
>>CCDS1140.2 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 (545 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKM
:: :... :. : : : .. ...: :::..:. .:: :::... ::
CCDS11 MMGHRPVLVLS-QNTK-RESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEA
..: : ...:::: .:: ..:.: :: :.:.:..::.:.:::::.:..::: .: :
CCDS11 LLDPMGGIVMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNS
:..:.. .:: . ..:..: : : ::: . :::.:.. ... .... .:...
CCDS11 EHFLEQQMHPTVVISAYRKALDDMISTLKKIS--IPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KSD CHRQMAEIAVNAVLTVADME--RRDVDFE-LIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHP
.::..:: : : :...:.. .:: :: .::. ...::...:: .::
CCDS11 WSSLACNIALDAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHP
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD QMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGA
.: . ... .:..: .: : ... ...: ::. . ..:.: .... ..: .
CCDS11 RMRRYIKNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKP
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD NLAICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGF-A
...: . :..: :.: :.. :. :.: : . . :: : :.::: : :: . .: :
CCDS11 DVVITEKGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD GLVQEISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDN
::.. ..: . . : .::. .: ::..::..: :. :..:.:.::. : ::.. :
CCDS11 GLLEIKKIGD--EYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDP
350 360 370 380 390 400
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pF1KSD RVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTE
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CCDS11 QLVPGGGASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTS
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KSD VRARQVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDI---
.::....: . :.. :::. . : : : : . :.. . ..:.::::
CCDS11 LRAKHTQENCETWGVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSG
470 480 490 500 510 520
540
pF1KSD -RKPGESEE
.: :...
CCDS11 HKKKGDDQSRQGGAPDAGQE
530 540
>>CCDS58711.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 (509 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KSD MASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPN
:. : :: .:.:. ... :.: ::::::...::::::.
CCDS58 MPENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRF-----SNISAAKAVADAIRTSLGPK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD GLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGA
:.:::.: ::::.:: : :::::.::..::.
CCDS58 GMDKMLV------------------------------ELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGS
60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGS
::. .::..:::: :......: . .:: : .: :...: : :...: :.:.:
CCDS58 LLDSCTKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRP--VELSDRETLLNSATTSLNS
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KVVNSCHRQMAEIAVNAVLTVAD-MERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDF
:::.. .. ..::::. : : .::.. ::. :.:: ..: .:..:... .
CCDS58 KVVSQYSSLLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKV
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKE
:. . . :: :::... . :: ... :.. .. . . :. . ....:::.
CCDS58 SNSGITR-VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKK
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340
pF1KSD TGANLAICQWG-----FDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELT
:: :. . : . ..: : :.: . .. ... . .::.: . : . : .....:
CCDS58 TGCNVLLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFT
270 280 290 300 310 320
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pF1KSD AEKLGFAGLVQEISFGTTKDKMLVIEQCKN-SRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCV
:. :: : :..:.... . :.: : : . ...::: .::.::..::::.::.::::::
CCDS58 ADMLGSAELAEEVNLNGS-GKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCV
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KSD IRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGM
:: :.. .. :::: :: :: ... . .:.: .::::::.:::: .:.::.:.
CCDS58 IRCLVKKRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGL
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KSD NPIQTMTEVRARQVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMIL
:::.:.::.: :... . : ::. . : ... .. :.. :. . . ..:::. :: ::
CCDS58 NPISTVTELRNRHAQGEKTA-GINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSIL
450 460 470 480 490 500
530 540
pF1KSD KIDDIRKPGESEE
::::.
CCDS58 KIDDVVNTR
>>CCDS8991.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 (535 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD TLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVD--
. ...: :... ....:::.:.::....
CCDS89 MASLSLAPVNIFKAGADEERAETARLTSFIGAIAIGDLVKSTLGPKGMDKILLSSG
10 20 30 40 50
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pF1KSD KDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQL
.:... :::::::::. . ::. ::..:..:. ::::.:::::.:.:::. ::.:::.:
CCDS89 RDASLMVTNDGATILKNIGVDNPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAESL
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD LDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHL-DKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCH
. . ::: : :...:...: : : .. : ..: . :.. : :::.::... .
CCDS89 IAKKIHPQTIIAGWREATKAAREALLSSAVDHGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RQMAEIAVNAVLTVADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKK
.....::.::: . . . ..: :.. :.:: : :. : .: ..:: .. : ::.
CCDS89 DHFTKLAVEAVLRL----KGSGNLEAIHIIKKLGGSLADSYLDEGFLLDKKIGVNQ-PKR
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD VEDAKIAILTCPFEPPKPKT-KHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAI
.:.::: : . .. : : .. : :. ... ::::..: ...: . : : :
CCDS89 IENAKILIANTGMDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD CQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQE
. . . ..:. .. :.. . .: .:..:::.:. :.. ::: :..:
CCDS89 NRQLIYNYPEQLFGAAGVMAIEHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYG
. .: .::.. . ..: :: .::....:..::.:::::::::. . ..:.:.:::
CCDS89 VMIG--EDKLIHFSGVALGEACTIVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYG
360 370 380 390 400
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pF1KSD GGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQ
:: .:. : ::.: :.. : : ::...: ::...: ...:.:.. . ....:: .
CCDS89 GGCSEMLMAHAVTQLANRTPGKEAVAMESYAKALRMLPTIIADNAGYDSADLVAQLRAAH
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pF1KSD VKEMNPALGIDCLHKGT-NDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESE
.: : . :.: ...:: .:: . :.. :.: . :.. ...::..:.: :
CCDS89 -SEGNTTAGLD-MREGTIGDMAILGITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRK
470 480 490 500 510 520
pF1KSD E
CCDS89 RVPDHHPC
530
>>CCDS46336.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 (543 aa)
initn: 785 init1: 366 opt: 895 Z-score: 1059.1 bits: 205.7 E(32554): 1.1e-52
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKM
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CCDS46 MMPTPVILLKEGTDSSQ--GIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEA
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CCDS46 IVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQV
50 60 70 80 90 100
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pF1KSD EQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVL-VD-IKDTEPLIQTAKTTLGSKVV
. ...:.:: : ... :...:.... .:. .: .: ... . : . : :.:.::..
CCDS46 KPYVEEGLHPQIIIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLI
110 120 130 140 150 160
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pF1KSD NSCHRQMAEIAVNAVLTVADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHP-
.. . .:...:.::. . :. .....: .. :: :::..:. :: : ::.
CCDS46 SQQKAFFAKMVVDAVMMLDDL----LQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD --QMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKET
..::: .. :::.:. .: : . .. : .::::.:. : . . . ...:...
CCDS46 FEMQPKKYHNPKIALLNVELELKAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHS
230 240 250 260 270 280
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pF1KSD GANLAICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGF
::.... . . : :.. . . .. . : ... .: :: : . :.:. ::
CCDS46 GAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGR
290 300 310 320 330 340
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pF1KSD AGLVQEISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRD
. .: ..: . .... : .... :...::: ....::..::::::. ..: :..
CCDS46 CQVFEETQIGGERYNFFT--GCPKAKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKN
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KSD NRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMT
. :: :::: :. . . . . : .: . :.: :::.:: : .:.:.. . ..
CCDS46 DSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILN
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KSD EVRARQVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDD-IR
..:::... . :.: .. : . : : . . . .. :.. . .:...:. :.
CCDS46 KLRARHAQG-GTWYGVDINNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIK
470 480 490 500 510 520
540
pF1KSD KPGESEE
.:
CCDS46 NPRSTVDAPTAAGRGRGRGRPH
530 540
541 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 23:58:13 2016 done: Wed Nov 2 23:58:14 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]