FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA0137, 766 aa 1>>>pF1KSDA0137 766 - 766 aa - 766 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3594+/-0.00106; mu= 3.2549+/- 0.063 mean_var=375.4414+/-86.119, 0's: 0 Z-trim(112.0): 317 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.066192 statistics sampled from 12468 (12845) to 12468 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.723), E-opt: 0.2 (0.395), width: 16 Scan time: 3.220 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2241.1 TLK1 gene_id:9874|Hs108|chr2 ( 766) 5105 502.6 9.7e-142 CCDS46447.1 TLK1 gene_id:9874|Hs108|chr2 ( 718) 4784 471.9 1.6e-132 CCDS46448.1 TLK1 gene_id:9874|Hs108|chr2 ( 670) 4392 434.4 2.8e-121 CCDS45753.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17 ( 718) 2411 245.3 2.6e-64 CCDS62283.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17 ( 772) 2298 234.5 4.8e-61 CCDS82182.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17 ( 601) 2287 233.4 8.5e-61 CCDS11633.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17 ( 750) 2287 233.5 9.8e-61 >>CCDS2241.1 TLK1 gene_id:9874|Hs108|chr2 (766 aa) initn: 5105 init1: 5105 opt: 5105 Z-score: 2658.2 bits: 502.6 E(32554): 9.7e-142 Smith-Waterman score: 5105; 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73.4% identity (85.3% similar) in 741 aa overlap (49-762:2-715) 20 30 40 50 60 70 pF1KSD LSTSPTPGSAAAARSLLNHTPPSGRPREGAMDELHSLDPRRQELLEARFTGVASGSTGST :.::::::::::::::::::::. CCDS45 MMEELHSLDPRRQELLEARFTGVGV------ 10 20 80 90 100 110 120 130 pF1KSD GSCSVGAKASTNNESSNHSFGSLGSLSDKESETPEKKQSESSRGRKRKAENQNESSQGKS .:. :.::::.:. :.::::::: :::::::... :.:::::: :.::::. CCDS45 ------SKGPLNSESSNQSLCSVGSLSDKEVETPEKKQNDQ-RNRKRKAE-PYETSQGKG 30 40 50 60 70 140 150 160 170 pF1KSD IGGRGHKISDYFEYQ------GGNGSSPVRG------IP---------PAIRSPQNSHSH :::::::::: . : .::. .. .: : . . : .. CCDS45 TP-RGHKISDYFERRVEQPLYGLDGSAAKEATEEQSALPTLMSVMLAKPRLDTEQLAQRG 80 90 100 110 120 130 180 190 200 210 220 230 pF1KSD ST---PSSSVRPNSPSPTALAFGDHPIVQPKQLSF--KIIQTDLTMLKLAALESNKIQDL . :.. :::: :. . .: . ::.:. . :.:::. :..:::..: .:: CCDS45 AGLCFTFVSAQQNSPSSTGSGNTEHSCSSQKQISIQHRQTQSDLTIEKISALENSKNSDL 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KSD EKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKLLEKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREK ::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:..:::::::::: :::.. :.: CCDS45 EKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKMLEKYKERLNRCVTMSKKLLIEKSKQEKMACRDK 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KSD SMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGFAFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPP :::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::: .:.:::.::::::.::::::: CCDS45 SMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGYAFQNLIKQQERINSQREEIERQRKMLAKRKPP 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KSD TANNSQAPSTNSEPKQRKNKAVNGAENDPFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKK . . ::: ...: ::::.:. :::::. :::::::::::::::::::::: CCDS45 AMG--QAPPATNEQKQRKSKT-NGAENET---------LTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKK 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 470 pF1KSD EEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYK ::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::: CCDS45 EEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRIHNEDNSQFKDHPTLNDRYLLLHLLGRGGFSEVYK 370 380 390 400 410 420 480 490 500 510 520 530 pF1KSD AFDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTD :::: ::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 AFDLTEQRYVAVKIHQLNKNWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTD 430 440 450 460 470 480 540 550 560 570 580 590 pF1KSD TFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNI .:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::::: CCDS45 SFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIIMQIVNALKYLNEIKPPIIHYDLKPGNI 490 500 510 520 530 540 600 610 620 630 640 650 pF1KSD LLVDGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSYG-VDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKI :::.:::::::::::::::::::::::. ::::.:::::::::::::::::::::::::: CCDS45 LLVNGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSYNSVDGMELTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKI 550 560 570 580 590 600 660 670 680 690 700 710 pF1KSD SNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFI :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::. :::::: CCDS45 SNKVDVWSVGVIFYQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPPKPVVTPEAKAFI 610 620 630 640 650 660 720 730 740 750 760 pF1KSD RRCLAYRKEDRFDVHQLANDPYLLPHMRRSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY :::::::::::.::.::: :::::::.:.: :... :..... ..: CCDS45 RRCLAYRKEDRIDVQQLACDPYLLPHIRKSVSTSSPAGAAIASTSGASNNSSSN 670 680 690 700 710 >>CCDS62283.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17 (772 aa) initn: 3342 init1: 1487 opt: 2298 Z-score: 1209.4 bits: 234.5 E(32554): 4.8e-61 Smith-Waterman score: 3448; 70.7% identity (81.8% similar) in 786 aa overlap (49-762:2-769) 20 30 40 50 60 70 pF1KSD LSTSPTPGSAAAARSLLNHTPPSGRPREGAMDELHSLDPRRQELLEARFTGVASGSTGST :.::::::::::::::::::::. CCDS62 MMEELHSLDPRRQELLEARFTGVGV------ 10 20 80 90 100 110 120 130 pF1KSD GSCSVGAKASTNNESSNHSFGSLGSLSDKESETPEKKQSESSRGRKRKAENQNESSQGKS .:. :.::::.:. :.::::::: :::::::... :.:::::: :.::::. CCDS62 ------SKGPLNSESSNQSLCSVGSLSDKEVETPEKKQNDQ-RNRKRKAE-PYETSQGKG 30 40 50 60 70 140 150 160 170 180 pF1KSD IGGRGHKISDYFEYQGGN--GSSPVRGIPPAIRS-PQNSHSHSTPSSSVRP--------- ::::::::::. ::. :.:: :..::. :: ::.: :. : .: CCDS62 TP-RGHKISDYFEFAGGSAPGTSPGRSVPPVARSSPQHSLSNPLPRRVEQPLYGLDGSAA 80 90 100 110 120 130 190 200 pF1KSD --------------------------------------------NSPSPTALAFGDHPIV :::: :. . .: CCDS62 KEATEEQSALPTLMSVMLAKPRLDTEQLAQRGAGLCFTFVSAQQNSPSSTGSGNTEHSCS 140 150 160 170 180 190 210 220 230 240 250 260 pF1KSD QPKQLSF--KIIQTDLTMLKLAALESNKIQDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKLL . ::.:. . :.:::. :..:::..: .::::::::::::::::::::::::::::.: CCDS62 SQKQISIQHRQTQSDLTIEKISALENSKNSDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKML 200 210 220 230 240 250 270 280 290 300 310 320 pF1KSD EKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGF ::::::::.:..:::::::::: :::.. :.::::::::::::::::::::::::::::. CCDS62 EKYKERLNRCVTMSKKLLIEKSKQEKMACRDKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGY 260 270 280 290 300 310 330 340 350 360 370 380 pF1KSD AFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAPSTNSEPKQRKNKAVNGAEND :::::.:::: .:.:::.::::::.:::::::. . ::: ...: ::::.:. :::::. CCDS62 AFQNLIKQQERINSQREEIERQRKMLAKRKPPAMG--QAPPATNEQKQRKSKT-NGAENE 320 330 340 350 360 370 390 400 410 420 pF1KSD -PF-----VRPNLPQL-------LTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERV : .. . : : ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS62 TPSSGNTELKDTAPALGAHSLLRLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERV 380 390 400 410 420 430 430 440 450 460 470 480 pF1KSD RNLHIRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQRYAAVKIH :::::::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: ::::.::::: CCDS62 RNLHIRELKRIHNEDNSQFKDHPTLNDRYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLTEQRYVAVKIH 440 450 460 470 480 490 490 500 510 520 530 540 pF1KSD QLNKSWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEYCEGNDLD ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::: CCDS62 QLNKNWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDSFCTVLEYCEGNDLD 500 510 520 530 540 550 550 560 570 580 590 600 pF1KSD FYLKQHKLMSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTACGEIKITD :::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::::::::.::::::::::: CCDS62 FYLKQHKLMSEKEARSIIMQIVNALKYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVNGTACGEIKITD 560 570 580 590 600 610 610 620 630 640 650 660 pF1KSD FGLSKIMDDDSYG-VDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFFQ ::::::::::::. ::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: CCDS62 FGLSKIMDDDSYNSVDGMELTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFYQ 620 630 640 650 660 670 670 680 690 700 710 720 pF1KSD CLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYRKEDRFDVH :::::::::::::::::::::::::::::::: ::::. :::::::::::::::::.::. 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CCDS82 MSVMLAKPRLDTEQLAQRGAGLCFTFVSAQQNSPSSTGSGNTEHSCSSQKQISIQHR 10 20 30 40 50 220 230 240 250 260 270 pF1KSD IIQTDLTMLKLAALESNKIQDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKLLEKYKERLNKC :.:::. :..:::..: .::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.: CCDS82 QTQSDLTIEKISALENSKNSDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKMLEKYKERLNRC 60 70 80 90 100 110 280 290 300 310 320 330 pF1KSD ISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGFAFQNLVKQQE ..:::::::::: :::.. :.::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::: CCDS82 VTMSKKLLIEKSKQEKMACRDKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGYAFQNLIKQQE 120 130 140 150 160 170 340 350 360 370 380 390 pF1KSD WVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAPSTNSEPKQRKNKAVNGAENDPFVRPNLPQL .:.:::.::::::.:::::::. .::: ...: ::::.:. :::::. 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CCDS11 ------SKGPLNSESSNQSLCSVGSLSDKEVETPEKKQNDQ-RNRKRKAE-PYETSQGKG 30 40 50 60 70 140 150 160 170 180 pF1KSD IGGRGHKISDYFEYQGGN--GSSPVRGIPPAIRS-PQNSHSHSTPSSSVRP--------- ::::::::::. ::. :.:: :..::. :: ::.: :. : .: CCDS11 TP-RGHKISDYFEFAGGSAPGTSPGRSVPPVARSSPQHSLSNPLPRRVEQPLYGLDGSAA 80 90 100 110 120 130 190 200 pF1KSD --------------------------------------------NSPSPTALAFGDHPIV :::: :. . .: CCDS11 KEATEEQSALPTLMSVMLAKPRLDTEQLAQRGAGLCFTFVSAQQNSPSSTGSGNTEHSCS 140 150 160 170 180 190 210 220 230 240 250 260 pF1KSD QPKQLSF--KIIQTDLTMLKLAALESNKIQDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKLL . ::.:. . :.:::. :..:::..: .::::::::::::::::::::::::::::.: CCDS11 SQKQISIQHRQTQSDLTIEKISALENSKNSDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKML 200 210 220 230 240 250 270 280 290 300 310 320 pF1KSD EKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGF ::::::::.:..:::::::::: :::.. :.::::::::::::::::::::::::::::. CCDS11 EKYKERLNRCVTMSKKLLIEKSKQEKMACRDKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGY 260 270 280 290 300 310 330 340 350 360 370 380 pF1KSD AFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAPSTNSEPKQRKNKAVNGAEND :::::.:::: .:.:::.::::::.:::::::. . ::: ...: ::::.:. :::::. CCDS11 AFQNLIKQQERINSQREEIERQRKMLAKRKPPAMG--QAPPATNEQKQRKSKT-NGAENE 320 330 340 350 360 370 390 400 410 420 430 440 pF1KSD PFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRINN ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: CCDS11 T---------LTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRIHN 380 390 400 410 420 450 460 470 480 490 500 pF1KSD EDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKKEN :::::::::::::.:::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::.:::::::: CCDS11 EDNSQFKDHPTLNDRYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLTEQRYVAVKIHQLNKNWRDEKKEN 430 440 450 460 470 480 510 520 530 540 550 560 pF1KSD YHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKE ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 YHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDSFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKE 490 500 510 520 530 540 570 580 590 600 610 620 pF1KSD ARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSYG ::::.:::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::. 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